MSTRG.11065.8.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11065.8.p1
Unique NameMSTRG.11065.8.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000079_pilon:374947..393168+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.11065.8.p1 ID=MSTRG.11065.8.p1|Name=MSTRG.11065.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18222bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:374947..393168+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:374947..393168+

>MSTRG.11065.8.p1 ID=MSTRG.11065.8.p1|Name=MSTRG.11065.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2286bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:374947..393168+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTACATCTGTTTGATTCAGACATCAAAACAAATGGTTGTTCAATCAAT
GGCATTTAGTTCAATCGAAGCCGCCCATCAGAAGGGTGAGGGCGGGAACA
TGATAAATGACATCCTTCAAAAGATACAACAAAGCAGCAAAGAAACTTGT
CTTTGGGGAAAACCCTGTCTTGAAGAGAAGCGAACGGATTGTAGCGAAGC
AGTTGATAAACAAACAGTGCTGAAAAATATCGAAGCCAAAGACAGTTTTC
ATTTTGATGACTTTTGGGAAGAATTAGCTTTACTTGATAACGAGGCTAGC
GTAGACGATGACGTCAACAATAATAATTTCATCGATCAAGGTTTTTCGAT
GTGTCTAGAGTCTAACGAGGAGTTACCAATAAAAACCGAAAAACGTCGAG
GAACGAGACTTGTTCGCCGACAATCTTCGGTAGATAGTGGAATCGTCGTC
CGCACACCGAGTGAAAGTTATCAAGATCGATTAGCGCTTGTCAAGTCCCG
AGTTAAACGATGCAAAACAACAGATAATGCCCTGTCTACATTACAAAGAT
CAAATTCGCTTCCTAACCTGAAGGATATAGACTTGAATAAATTCCAAACG
ATCAAATTTAAAGACTTTAAAGCAtacaaaaaagaacaacaagATAGTAA
AATAGCTGCTGAGTCAGCGAAAAAACATTCAGAAGCGAGAAAGAAACATA
AAGACTTATTCAGTATTCGAAATTACACTCGTGGAAAATACCGTAAAACA
AAACTCTCAGAATTGATCACCAGGAATAATACGTTCTCGATGGGTGAAGG
GCGTATGCCGCCACATAAATTGAATGGGCGTCCTCTATTCGAAGACTCGC
TTGAAGAGAACTATGTGTTATCGTTTGATATTGACTCTACAGATACGAAA
GGCGATACTTGTTTACATCACGCTTCCAGTATCGGCGACGTCGACACAGT
TCGATATCTCTTGAAAGAGGGCGGAAATGTGTGGcgtaaaaacaataaca
aactaCTCCCTATGGAGCTATCTCATGATTTTAAAACAGCAAAACTTTTA
TCCCATGCAACTATCTTTTACACGGAACCAGAAAAACAGAGACATGGTTG
TAATAATATTTCGTCGACCGTCAAATTAGCATTTGATTTGTAAATGTACA
TCTGTTTGATTCAGACATCAAAACAAATGGTTGTTCAATCAATGGCATTT
AGTTCAATCGAAGCCGCCCATCAGAAGGGTGAGGGCGGGAACATGATAAA
TGACATCCTTCAAAAGATACAACAAAGCAGCAAAGAAACTTGTCTTTGGG
GAAAACCCTGTCTTGAAGAGAAGCGAACGGATTGTAGCGAAGCAGTTGAT
AAACAAACAGTGCTGAAAAATATCGAAGCCAAAGACAGTTTTCATTTTGA
TGACTTTTGGGAAGAATTAGCTTTACTTGATAACGAGGCTAGCGTAGACG
ATGACGTCAACAATAATAATTTCATCGATCAAGGTTTTTCGATGTGTCTA
GAGTCTAACGAGGAGTTACCAATAAAAACCGAAAAACGTCGAGGAACGAG
ACTTGTTCGCCGACAATCTTCGGTAGATAGTGGAATCGTCGTCCGCACAC
CGAGTGAAAGTTATCAAGATCGATTAGCGCTTGTCAAGTCCCGAGTTAAA
CGATGCAAAACAACAGATAATGCCCTGTCTACATTACAAAGATCAAATTC
GCTTCCTAACCTGAAGGATATAGACTTGAATAAATTCCAAACGATCAAAT
TTAAAGACTTTAAAGCAtacaaaaaagaacaacaagATAGTAAAATAGCT
GCTGAGTCAGCGAAAAAACATTCAGAAGCGAGAAAGAAACATAAAGACTT
ATTCAGTATTCGAAATTACACTCGTGGAAAATACCGTAAAACAAAACTCT
CAGAATTGATCACCAGGAATAATACGTTCTCGATGGGTGAAGGGCGTATG
CCGCCACATAAATTGAATGGGCGTCCTCTATTCGAAGACTCGCTTGAAGA
GAACTATGTGTTATCGTTTGATATTGACTCTACAGATACGAAAGGCGATA
CTTGTTTACATCACGCTTCCAGTATCGGCGACGTCGACACAGTTCGATAT
CTCTTGAAAGAGGGCGGAAATGTGTGGcgtaaaaacaataacaaactaCT
CCCTATGGAGCTATCTCATGATTTTAAAACAGCAAAACTTTTATCCCATG
CAACTATCTTTTACACGGAACCAGAAAAACAGAGACATGGTTGTAATAAT
ATTTCGTCGACCGTCAAATTAGCATTTGATTTGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11065MSTRG.11065Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11065.8.p1.exon1MSTRG.11065.8.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11065.8.p1.exon2MSTRG.11065.8.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11065.8.p1MSTRG.11065.8.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000079_pilongenomesc0000079_pilon:374947..393168 +