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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000079_pilon:179155..194820+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11050.2.p1 ID=MSTRG.11050.2.p1|Name=MSTRG.11050.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15666bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:179155..194820+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGAGCTAATAATAAATATTGATTTAGAAAGACATCAATATTAAGAGATGG
CTAGAATAAGTTATGCAACAGATTTTGAGAAATCAGTTCTCGTGAATAAT
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AAGGTataatttgttttcaatacaATATAGTGGGCTGAGAATGCTGTCAA
GAAATCCATGTATTAGCTCTGTCCACTGTAAAgaatatattttctaaaag
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GCTCAAAACCCTCAACTTATAAAGGTCCAGCACCAAGCACTCCACCATTC
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ATATACTTTTCGAATGAAATATACCCTGCTTGCCTTCTTATTTAGATCGC
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AAAAagtgttgtttttttctctctaaTTTAGACTTCGTTCCAACCACCTT
TCTTTTACCTGGTGATTACAACCTGTTCGTGGAAGAATTTCGGAAAAATC
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ATGTGTTTTATATTgtgaaaacaatagcaactcGCTGTAATCAACAGAAA
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tcttctttattcttcaatctttcaaaattttatttaatctttcagataat
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TCTGAAGTtgcccgaaggtaggggagggtgccactctttctccatGGATT
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TTGGATTCTGTCGTTTTTGCACAGTGAAATACAATGCAGATGTTAACGAA
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GTCATGTGAGGGACGATATACCGTATTCTAGAGTGTGAATGTTTTTCGAC
TCATGATATGAACCATTGTAAATGTCTTTTGACATTAAATCACGGACTGA
ACAGCTGTGAGAGTGACTGATTTTAcgtgatttttctattttaagtCAAA
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aggtttttaactACCATTTTCAGGAGAAATGTTCCTACAATCTGAAATTA
GCAAACCTCAAGTAGACATCGCTATTTCTAAAGAAGCTTTTTCAGGCATA
AGTTGAATGTTTCTCATTCATTGCATGGTAATcgcttttttatattattt
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ACGATTGTATCTAGAAGGGACTAGAGGTCACGAGGTAGTTTGTTGtattt
attttcatcaaaacataCAGCCGggtctctctaattcgattttcggGACC
AAGAATTATCTTCGAATTATATTGAAAGATTCTAATTACGGAGAGTTTTT
TGTGTCAATTTCCAGCTCAAGGACCAATATttcagttcgaattacaaaaa
gattcgaattatagagtgtcgaattagagagagttgactgtactGCTCTT
CTAGAGTGTTCAAGCCATTCATTATTTGCCGTGGACCAACGTCTGATGAA
TACGGAGCATCATGGTTTAATTCGCTAAAGAGATCAGTTGTATGTGCTCA
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aatgataaaaaaaaattttggtggcAAAAATACTAATTATTTTACTGAAC
GCAAGTGTAGTGAtgtaggttttattttttagcaattaAGATATTCGACC
GCCAGGTGATATTTAGATTTATAAAGTCTTGCAGGTCTTCGGTCGTTGAA
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CGGCCGCTGGAAAACCGCAAGTTTAAGTTTTGAAGGTCTTCAGCCGCTAG
CACGTAGGTCTTCGACTGTTGACGGAGAAAAAATCTGCAGTGCGGACTAT
GTATGGAGTTAGTTTAGTCTGTCTCAGATTATGTCAAATTCTGGTTGAAT
GTTAAGAATTGATTTTAGGTCAGTTatatattttgaatgttttcttttgt
ttttaggtTACCAATAAATTGTTTGATGACATTCATTGGTTAATTGTGCA
TtctctaaagtctgtctcagtAAGAGATTTAATTGGGTAACTTTTCCgaa
taatctttaaaaacatATTATGTACTTttatcggattaattttcgggAGA
TTTAATGTCACAAGCCAAAAAAGACTTTTGAGATTTCGTGAATGAGTCaa
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TATTTTCGCTAGTGATGAGCTATCTCATGAGATTTGGTGTGTTTTATTTT
cgcaaaaaagacaaaaattcgcgaaaaataatCCCATTAAAAGTGAAGTC
tatctcaatataatttgcagcggagacaaaaacgACTGTAACTTTTGATC
GAATTcgatagcggttttgtgctcgtaaCAAGATAATATGGagtagaata
tttaaaaaaaaaaaaaaaaattaaaacatggaaaaaaaaggtgaaaaatg
aagaagaaatcaactttttgtagaataatgctatggccttcatttttata
tcagaaattctttaattttagaacgtcataaatgcgaaaaaaatttcaaa
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ttggactatatctttcgatggaataaatttctttgaaaaactttttcaca
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ataaCAATTGTTGAAGAAGttcattttctcagagactttttcattttccg
atccttttctgatcttttctttatgataatattccactccagattatttt
tttaacgagcacaaaaccgctatctaagTCGAATTACATCAAAAGTTTAA
GCCTTTTTTCTCTCCGCTGCAAGTTATATTGAAACCGACTTTAGTGACTT
ATTCACCAAACTAATCAACCCTTTTGCTAACAGGGATTGTGCTCAAATTT
GTAACGGTTAAAGTAACCTGCTCAAAATTATGAAGTCTGATATCATTGTT
GTGCTCACACACTAAAAACATCCGCTTGACGTCACTGGACCCTGGTAAAT
TATATCCCGATACGGTCCACTCTTTTGGCGTTATGTTTCATACCCCATTA
AAAACATTGCACCTATCATATTCAGATCCTCAACGATGAAATTAGCATTT
ATGACCTTGAAATCTCTTCTTTTCTTCCTTTGATAGGGTGTCATGGTAAA
TGACAGGCACTGCTACGAAGTTTATGGGTGAGCGAATCACGTCATTTCAG
GGGAAACCTCTAACTTTCAACATTGTCCCTTATCCAGCAGTAGGCTCTTT
GTGTCACATGCTTCATTGTTTATTGGCAACTACGAGTTCACGTGCAGAAT
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TCGGCAGACGTTTCTTGATGTAAAGTGTAAAGGTGTCTTTCGGTCGAAGA
ACAGCGTTAACTGCCAATCTTCTTCTATCAATTGCATCGATACGCCTTTT
CGCTTTATAAACAAAAACTGCCAGTCTGCGTTTGAAATGAGGTTTGGTTA
TTCCGATTCTGCAACTAATTCTACCCTcacaaagtttctttgtttctttt
gtatCAATAAAATGGAGCTTAATTCGTTTTTCTTTGCATTTCTACTATTC
TAATTTTACCTCTGTCTTATTCAGGTACGACATTATCATTGATGATTTTC
TGAAACCTTGGATTATTGAGGTaagtaattttttaaagattgaaaagttt
ttcaaggGAAACATGCCgtaatgtaaaaataattagTCGGGAGAAACTTT
TGTCGCCTTTGAGCATTTTCCTCGTTTTAcccaaccaaaatttcaaagtc
gTCATCTTTTCCCaagcaaatttacaattttgtcACTTCAAAccttaatt
ttttggaaaaatatttttttcctcaaaacttCGGAGGATGAGACTGATTT
TCCTTCTAGAATATTATTCAACTTTGAAAGAATTCTCCTCTCTACCCATT
TAAAGGTTAACGCTTCACCGTCGTTGTCAGCGACCACCTCAGCTGATCGA
ATCATGAAATTCTCTTTggttaatgacgtcatcaatattGTCGTTCCTCC
TGGTGAATTTCCTGAGTAAGTTCATTTGATTGGATCTTTTGATTGGTAGT
AATCTCAggcccgtaggaagcattttcatctTGAGGGGGCAAAGTGAGAA
ATTTCGcaatttaaggtgtctagattgctagaaaACTGCATCTAAttaaa
agattattttcaaaatgatgcCATTAATACAAGATTTTTAAAGCTatcaa
ctttatttttttttgggggggggggtgccctACGGGTTGCTACGGGCCTG
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GGGTAAAAACACTCCGaaaaaaaCGTACGtgattatttgattttactgag
tttgcttttgatttttttgatttaattgattttattgatttcaaccttga
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AATATGTGCAAATTTattgtgtaaaatccattttcagtCTCGAACGAAAA
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tatttagaaaaacaaaagtaTTTTATCACGGATCAGAAAACATTTGATTA
TTATCTCAAAATGACTTCGGTGACCATTAGGGAAGCCAGACTCGCTACTT
TCACTGTTATATCACTTTTCGTAAGCCGAcgataatcgaagtatcgattg
atGTCAAGTGAGCTTAAAATGAAGTTCAAATATGCAGATGTAGAatgata
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tcatactTTCACAGTGTTAGGAGGGAGAAGATTCCAAAGAAAGAACACCT
TGGTAACTTCGATGTCCTGTAAGTTTGAAATACTATCCATCTTTTTTCCA
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TAAAATAACTGggttcatttcccatccaacaTGTATCTCTATCCTCTTCG
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TGGTCTCGATGGTTCAGGCTCCGATAGGAGTGGTAAAGGCAAGAGCAAGC
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TAAAAACCTAAAGCTATGCCTGTATGAATCATATCAACGTAATAATCAGA
TACTCTGTCTATGCCTTCTTAGCACCCTGCATATTGGATTTTTCCCCGGT
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AGAAGCCTTCACTTTTGTGTATAATACAGAACCCCAACTTAAAGAGACTT
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GGactgttttattgttttttttttattatataaagACAATGAGTATACAC
ATGTGAAATCTATCAATTGAGCACAAACCTTTGTTTTACAATGAGGAGTA
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TTCTCCTTATCCAAGAGACACCATGGTAAACAAAGGAACTATCaaggaca
aaagaaaaatattgttacAGGGCGACTAGCCATTAGTCCCTTAAAACAGT
TGTTGGAGACAAGTAAGCTTGATATGAAACAACACTTAAAACTGGACGAT
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ACCTAAAATCATGGTTGTTATGCCGAAAACAGGAGATATGATTAGTCTAA
GAACATTCCATCGATTGCATCCAAAGAATGGATCAGTCACACCTTTGTAC
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aaaaaggaCGACTTTTGAATGAGACTAAAGACTCTGAAGAATTTGACGTC
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TGGAGCTAAGCGAACCATCAAGAAGAATACCAAAAACGCCAAATCAGCTG
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GTTGGACCGAACACCAAGGATGGCAAAGGATCTGTTGAGAATGTTGGTAA
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GAGCAGAATCAAGCACACCCGGCAGACCCTGCAGTCAAGAAATCCCAACA
ACAACCAAGACAAAAGTTAGCACAGCCAACAGACCCTGTATCTTCGAAGA
AATCCCAACAACAGTACAACCAGAAGCTGGCAAAGTCTTCAGACTCTTGG
AAGAAATCTCAACAACAGGCGGGAAAGAGGCTAGAGAAAGAGAGCTATGG
AACACAGaaaaacagtcaaaacaaagaggTGAAAGAAAAACAGGGACCGA
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TTAGTGCAGCCACAATCAAGTCTtcaaaacagaaagaaagaagctccaaa
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AATTGATACCCATCCAAGTGCGGTGAAAGTTCAACAAAACATCAAGCAAC
AATCTAAAAAAGTTTCGACGGCTAAACACACTGCAATCAAAGCACCAACT
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CAACATGTCTTCTACTGCTGCAATTAACAAAGTTGTGACAACTAAACCAA
TCCGGAAACTTGCATCTAAAACCTTGAAGTCGAGTTCACTTAAGAAGGTC
CAACAAAAGCCGAAAACTACGCTTCAAGCTCAACAAAAATTGCCAACCAT
GCTAAATCTCCATCCAATGCAACAAACTAACCAAACCTATCAGCAAAGTT
ACCAAACTTTACAACAATATTATCAACAGAATCAGCAGAATAcaaatcaa
acatatcaatCTTATGCAAAACAACCAACCAATCAGTATTACCAGCAGCA
ACAGCCTACATTGCAATACTACCAGCAAGGAGATCAGAAACTGattcaaa
attaccaaaaaccTGCTAATAAAACTAAGTTTAATCTTGAACCAAATATG
ACAGCATTTGCATTGACCAATTTGATGAAAGCTATCACCAACTCTAAGAA
CGGAACTAAGATTAACAACAGCACTTCAATGGATATTCTCTCTCTTCCTC
TTCAACAACCATTCGCCAACAATAAAGAAAACCAAGCTCTCATCAACCAG
TTTGCGAAGATGTATCGCCAAGGTTTACCACTCAACAAACGTCCTAAATC
TCCTGATAACTCTGCTCTAGAATCTGCTTACCAGGCGCAATATGCTAACC
AATACAATCAGTATCAAAGTAATCTCAATTATGCAGCATACGCAGCTAAC
CAACAACAACCATATCCTTCTTCAACAGAAAATACACCAGAATCACAGTA
TCCAGATCTGCAAGCATACACCAAACAATCCGACCCACTTTCTCAAGGAA
ACGAATACTCTCAATACGACGCCAACACTGTAAACGCGTATTCGACAACC
AACCAAGATTCTCCACAAACAGACGCATCAAACCAGCCACAGAATTATGA
TTCAAACATAGCTTCGACATTCACCACAAACGCCCAATCAACTTTATCTC
AAACACCACTCTCTGATCAATTCACCCAATCAAAATTAACTCAAAATGCA
GCATTTCCTACCCAAGATGGATCTATCACTAATGATTTCACCAAAACAGC
TGCATCAGTTATGGGTGAAGAAAAGGAGCTCACCAGCACTAATGCTGATC
AAACAGCACAAGAAGGTCCTGGTAACACTCCCGATAATAATGCTGCagat
cctacaatttcaacatCGGACGCTACCAGTCTTGTCAGTAATGGCCAAGA
TACAGCATTAACACCAGATGCTACCAACCAAGGTGCAGAATTCATAGAAA
AGACACCCTCGCAAGAAATCAGCGCGCCATATTCAACATTATCAGAGAAT
GTACCATTAGCTCCACAACAAGCTATCAACAATTATCCTGTCACTTTCTA
TCCTCAACAAACACAGGAGTACTCCGAATCTGCAGCCTTTTCCAGAACTC
GTGGTAAAAATGTAACCCAAAAAGAAAGCAAGCTGACGCACCAAGTCAGT
GCTGCAAACAGTGTCCAACACCTCACAAATAACGTTGACCAAGATGGTTT
CTTAATCTCCAATGACATCCGATATCCAAGCCCTGTGTTTCAAATGTCCT
CACAACAAACAGAGTTCCTACAAACTGCAAACAAAGCTATGGCTGATGTA
TTGCGCGCTAAATCATCTactgAaaatttcatcaaaaacatgaacaaaAA
CCAGAACAGTCAATGCTGCCATACGGCAAATACAGCACTGGCACAACAAC
ACAATACAGCACATTCTCAACAAACAGTCCGACCTCAATATAAAGTTGCT
GATCAAGTTGCAAGTATTTCTCAACCAAATACCAATGCAAACGTAGAAGT
AGTTCAAACTCCACAAGTCTCTGCTACCAACTATGCTTCAAATACCAATT
ACTATGATCCTCAGAAAGATTACGAACCGGCGGCGCTAGATGCGTATCTA
CAACCAAGTACCGCTAACTATTTCGATAAATATTTCTCACATAACGGTAT
CCCTGATCAGCGTCATCATGCCAAAGCGTACAGTTTCTTGCATTCTTTCT
TACGCCACGTCAAAAGTATTACGCACGATCCAGAGTTCTGGAAAACTCAG
CAACCCATCCAAGCTGTTACCCAAACAGCGTTTAAGAGGAACGAAATCAC
AGAACCTATCCTTGAAGGTCACGGCAACATTCGTGATCATGTTGCAGGAC
GTATTTTGAGTGAACCTAACTACATGCTTGGAGATGTAGGTGATGTCAAG
AAGCTTCTTCATGGATCTGGATTCAATACATTCAATGATGAAGATATGAA
ACTTCTCTTTGGCTCGCCAGCTGCCAAGAAATCAGAAACCAATGGAGATG
AAATTAGCAAGAAAACTGTAACTAAAGCGTCGAGAAATGGAGTCATCTTT
TCCAAAACTAATGCTGCTAAGAAATCAGAATCTAAAACATCCATGACCAA
GATACCTAACACGAAATCAGCAACAAATCAAGCTGAGACTGCTGCATTAC
ACCACAAGCATCAGAAGAAGGACAAAATATTCACCACCAgagatgaaata
aaaattgacgAACCAGCTTTCCTCACACTTCTTCTCCCAGAAGATGATGA
AAGGGTATGTTAAGGTTTATGGTATTTCTGCAATTCTTTGTAAATAATAT
TGCAAACTCTTTAAGGCctgtctccactttcgcgcaacatgagcaaaaac
tttttgatgtttttgtaaggtcattggtcggttgaaaactgaagcaaatt
cattggtcgaaattgacgtaacggatgaaacgtagaaacttccttcaact
ttttttttgttttcgcgaaacttttttatgacgtaatcttttcttcaggc
aaaaaaaggttaagaaaaaaactgtcgcccatttcgcgcgaaagtggaga
cccgcctttattcagttttattttttgatctaACTAGATGTGACTTTTTC
GCTAACCGATTGGCTATCTTTTGCCTGAGGAATAAAATGGTTAATAGACA
AACTTAACATATTTTAAAAGGAATTTAAATTTATAGTAAAAGAAAGGCAG
TGTCGCAATATCACtattaaaatctttaaataaaaaaagctaacaAGTAA
ACAAACCTCGAAATCTCAGAATCTTatcttcaaaaaatgtcaaaacatgT
GAGATTGACCCACCAACAAATCATTCTGGTTTATTTCATAGATTTCAACT
CAAAGAGGAATGAAGAGATCAACCTCAGTTCACAGACGATCGAAAAATCC
ACAAGAGCGTCTTCACAAACCTACAAGATCGAAGattccaaagaaaacaa
aatcagTCGATTTAAAAGCTTTGGAGTTTAATGGCACTGAATGACCAATA
TACTCACTGGAACATTTCAAAGAATTGTAGAGATTTTTCAGTAGTAGAGA
GATAAGTTAGAGTACATCGTTTTATTATGGAATTGAAGAACGGCTTGTTT
TGAAAGTAACATCGATATTAAAGTATGTAAGACTTTGTTGAAAGATCACG
GTTTAGAACCGTCCTTCGATTTCAACGTTTTAGTGGGAATTTTTAAGAAT
CGTCTAGAAAATTATTGAATAATTGATGCTTAATGGTTTATAATGGAGTG
GATGTATGAAGACCTTAAAATATTACGAACGCAATACTATTTTGGACTCG
GCTTGGAGTTGAAACTGTTGATATGAAAAATACGTAGATGAAGAAATTTA
CCAATGATGGCCTTTTGTTTTGGTTcataaaaactattttctttaagaaa
aattaataaTTGTTGGATTTTATTTTCGTTTCATGGAAGCGTATTTATTT
GCgcgttttttattcaaattatcgAAATTAAACTGTGATGTTATATCTAA
TAAATTTTTAAGTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:179155..194820+ >MSTRG.11050.2.p1 ID=MSTRG.11050.2.p1|Name=MSTRG.11050.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=17472bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:179155..194820+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTAGAATAAGTTATGCAACAGATTTTGAGAAATCAGTTCTCGTGAA TAATTTTGAGAAGCGCGGATGGAATCATGTCAATCCTGAAGATGAGTGGC ATTTTTATTGgGCAAGTGTCGGTACTGTAAGACAAATTTTTAATATTGAG AATGGCTACAGACTCAATGAAAATCAGgttgtcaatcattttccaaatcA TTACGAGTTGACAAGGAAAGATTCCATGttgaagaatttgaaaagatatc gcaaagaattggaaaaagaAGGAAACCCTTTTGCTGAGAAAGATGACAAT GGAAAGTACACTTATCTTGACTTCGTTCCAACCACCTTTCTTTTACCTGG TGATTACAACCTGTTCGTGGAAGAATTTCGGAAAAATCCTTCATCAACAT GGATTATGAAACCTGCAGCCCGATcaCAAGGCGTCGGAATCTTTTTAATC AACCGTATTTCACAGATTAAAAAGTGGTCAAAGGATGGAAAATCTGGAAA TGTCCCTCACAGCAGTAAAGACTCGTATGTCATTTCACGGTATATCGATA ACCCTTTATTGATCGGTGGCAAGAAGTTCGATTTGAGATTATATGTGCTG GTGACATCTTACAGACCACTCAAATGTTACATGTATAAACTTGGATTCTG 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
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|