|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000079_pilon:46506..64862+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11042.3.p1 ID=MSTRG.11042.3.p1|Name=MSTRG.11042.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18357bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:46506..64862+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGTTGTTTTCTGTAGTCTGATATCGCAGTGCTGTTTCTAATATTattat
gtttttctattttacagAGACTAATtaattaaaacataaaagatgCTGTC
GACAGTCGCTCGAAACACGCGTCGTGCACTTTCAAAACAAGCTCTGCAAT
CAGTACAAGTGGCATCAAAACACACTTTACCAGCTCTAGATTATGAATAC
TCATCATTGCAACCAATCATCTCTGAAGAAATTATGACCCTTCATCACTC
TAAACATCATCAAACGTACGTCAATAATTTGAACGCCGCGGAAGAACAAT
TACAAGATGCTCTGTCTCAAGGTGAGGGATGTCATTTGATTCAACCTACA
GATTATAATTTTAACTATacacactctttttttataaatcggATCGAGGC
tcattatgcttagcaaaatcccatgtttgaaaatgtttaaaaatgcgTTA
TTTAGCGCAATTTAGTAAAAGGAATGAATAAGTAGCGGTGGTGTCATTTC
TGAGGTCGGGGGTCGTTctttgcctttttttcatttgtcgttctttttgt
cgttttcaatagttatttgtcgttctttttagatggtctggaaacgttag
tTGGACAGTCTCTTAAGATTTATTATTAAAATTCGATGGCCGACTTCTAA
AGATAAACTTAATAAATTGATTTGTGTCACCATTTATAGCTTTTTGAGCT
AAGATTGGGTTTCCTGACGGTCACTTTATTTCATAATTATAAACCAAACT
AGATAATCTAAGTAAGTATGTTTACGAATGAAGTCAACGGCGACCCGAAG
ATTTGCTTTTTCTTAAGCTGTCTACCTAAAGGTGGGAAGGAAATCTACAC
GCTCTAATTTGAACatatattattcgaatctttgaATGATCCGAATTAAA
ACATTGGTGCTCTGAGCTAAAAAATAGTGTACAATACTCTCCGTAATCCG
AACCTTTCTAGAATTCAAATGTGTTGATCCCTTTAAGATcggattagaga
gagtcaacgaTCTTGTACTTGATCTTTCATTGGTTGATAAGCGTCTCATT
TCTTCACTCAttatctctctctctctcgatgcggctgataatcgaagtat
cgattgacgcCAAATGAGTTAAGTAAAGCTGAAATTGCAGATGacgtaga
acgataaactcggtatacattATTTTTTCAGGCGACTTACCAAAAGTGAT
AGGACTTCAACCTGCACTTCGATTCAACGGAGGAGGACACATCAATCACA
CCATCTTCTGGACCAATCTCTCACCCAACGGTGGAGGCGAACCCAAAGGT
ATAGACACTTTTGATACATCATTGTGCTGGTCCAAATTGCTTAGCCCAAG
ATTGGGTTAAACTCTTATACTAACTTTATGCCTATGATTGAAACATGATG
GATTCATATATGGCTTAGCTCTGGCCTGTCTAGAGATGATGCTATTATAA
TCATAGTGTCAGCCCCCCAGAAATCTAAGAAGCACCTAGACCAGGTTAGG
GATTGGGGGCTAATATTTTGCAaatctttggggttacctattcattggGG
TACCTAGCTGTTTTGATCGAAGCTCTGGGGGCTGTGTATATTTtccatat
tgaatatttcaaaatatttaaaattattgaattttttaccccagcaccca
gtttcccatccaatttaGATTCTTAATTCTTTCCACgtcatcttttgcta
tatttttcaaatgtgattgttttgatttacagccgccatcttaATAGCAT
AATAACAAAGCTTTTTTCTCATGCGTGTGCGCTTCCCGCGCTAGCATAga
gaagataaaaccttatgatAAGAAAGAGCGTActtaactcaaagcaattt
ctcaatGGGCCTTAACTCGTtgggggcaccatgcttcaatgggggcacct
gaaaagtgggctgaaaccatgataATGCTTATGAGATAAACGAGAGAACC
TCTGTATAAGACGACTGAAGAAGAATTTCGCTCAATTTACGGTATAGGTA
TATATTTACAAggtaaataataaaaacaaatccatgatgagaagaataat
ttacaaaaattgagaaatgggaaaaaaatctgcgaagaaaaaacaaaatt
atttatataaaagttatgtacaaaaTCCTaggttaaatttttttgatttt
tatgagaATATTAAATATACGTTTGATAAAGAATATATAAAATGCGACGC
TACGGCTGATGAATGAAATCAGAGAAATTGATGACCGAAATATTTGGTTC
TGTATTCCTCTGCTTGTCGcctgaaaacgaaaaaaaagagGGTGATTAAA
ATGTTGTACGATGAGTTTGTGTCAAGTGCCAACAACAGAAGAATGTTTTC
ActtcaaaacattaaaaattagTTCCAGACAGATCTTTTTGTTGAAAGGA
TTGTCAATTTACTTGTCTTCATTACTTGAACACATTCCCGATTGACTTCT
TTAACAATCAGGTCTAGTTAATTATAAGGGGAACACGTAAAAAATATTCT
ATTGAAATTTACTTGCTTAcacattttgtttgtttgagcCATCACGGAGG
TTTGAGGCTTCTGCAATGTCGCCTGGACCGTACTCGAAGTAATTTTGCAA
GAGGTTGTAAATCCTGAAAAACGAAGAGAACGGAAGATGACTTATAATCA
TTAGCTTTAGATTCAGAATGTCATCCAAACCTTGATTGCGCAATTTTTAT
GAATTCGGTTGGAATTCTATCACTCCTAGAATATACATCGAACTAAATCG
AAAACGGTAAAATGCCAACTACTTGGAAACAAATTCGACAATGAAATCTT
AATTGATGAATTAGATTCGATTTAATTTGATTTGGTCTGGTGTTCGTTTC
CTTTCGATTGCAATCGTGTGATAAATAATCGATTGTACGAAGATACTTAC
TTTGAGTCGGGTTGAGCATAATCGATGACAGTCTTATTGTCGAGATCTTC
GTAAAGAGGGTTCATCTGGTGAGCCATCAATAATTGAAGAATATCTGCTC
GTCCATCAATGACTGCAATATGAGCTGCGGTTCTATAAGTTGAAGTTGAA
AGAGTTAAAGCATGGGAATTGCGTATTGATACATTTATTCCATTTTGTCT
TTAAACGAATATGTCATAAGATATGAATTTGAATGTGAGCAATGTTATCT
TTTCCGCCACTTGGACATGAGATTTCCTCATGTAGGAGAGTTTCTTCCAA
CAAAACAAAGCAGATACTCGTAGAACATAATATGGTTGCAATCACTTACC
GACCGTTGCCTTCTCTGGCGTTCACATCAAGTCCTTGGTGCAACATGTAA
TCGATACACTTCAGAACTACAATGTGTTTATTGTTCATCAAAGCCATATG
TAGAAAGCTCATTTCGCCCAATCTGCTTTTCCCCTGtggagaaaattgaa
atttcaataagcCTACAATTTCATTTGatcaaaaatagctaaaatcgACG
AAATGGATCCAGTTTTTCATGCAGAAAATAAACAATGTTACTTTTAAGAG
AGTACAGTATTTTATCCCAAAATGCTTCTTGATGCTAAAAATACAAACTG
AAGATGTTGTTAAGATGCCTAGGTTCTAAGGCCTCTTAAAGGGAGATTGC
GGTGTATAGCTTACATTTATTCTTGGTGAGACGTCCCACAAAAGTTTGAA
CATTTCGAAGCGTTCATCACCATAGAAATGCAACAGATAAGTTAAAGGAT
CACGAGAATCTTGTGCCTTGATGCGTGTGTTAGCGCCTGCTTTGACCAAC
GCTTTGACACACTCGATGGAACCGATTTCCATGGCCTAAACGAGAGAAAG
TTCAACATATGTGTTAATATGTTTACTGTACactgtatatccagtgtatt
tTCGAGTTCGTGATGTTAACTGATGGTGCCAGAATCACCAAAAAGAGATT
TAATGATCAATTGAATCTCCATTGAAAAACACAGCTCAAAATCTCTGAAA
ACGAGTCACAAAATATACCAACGTAGGAGAATTTCCCTGATAGAATTACT
AATCtttattcataattttcacTAAAACAATAACCTGTCTTAAGAAAATC
TTGAAAGCTACCTAACACCGGTGACACCAGTCACTTACTTTATAGAGTGG
AGTTTTGCCATGGTAGTCTTGTTTGTTGACATCGATACCAGGACATCTCA
ATAAGATATTTAAAGTTTTAATGCATCCCCAAGAAGCGGCGAAGTGCAGT
GCGGTCCTGTTAAAGTGAAAAGAAACACATTGAAAGATATTGTCCCCATG
GATATAAAATCACCTCATTAGAGTGTAAATACGGAAAATAATGGATGACT
TGTTCATAAGTTTTGCTTTGAGAACAGTCCAAAATTAATATAGTCAACTC
TCTTaaacttctattatttgaatcattctgtaatttgaactaaaatattg
gtcccctttGGTTGAAAAAGTGGTtcaaattactctctgtaattcgagta
TTTCtccaatttgaagaaaaatcttAGGTCCcctgaagatcgaattagac
aGAGAGAAAGTCAACACACCAGGTGAGTAAACCTTTTGGCTTTGTTTTAT
AATCGTAGCACAAGGTTACTCTGCTTTGTATTTGAACCCTTCTAGCTTAC
TCGTCAAATGCTCAGAACTACCTTTCATATTTTACTTTAGTCCATTATTT
TACCTCTTTTGTGCGTCAACTCTGTTGattttctgttgaaatttctcttc
tttcaaCGCTTTACGTAATTTCTTCAATTTGCCTTTCCAGGCGAatctaa
aaatgtgaaaaagtaaaatgattAACAATGAATCCTTTAATCTTTGTGTC
CGAATTTGCTTTGAGCTGTCTGTACCTAAACCCGAACCCATATCTATGCC
GAAATTCTAAGGTTTGGCATAagtttttcttcagtttttttttacagTGA
TCGATACATATGTAGAGGGATGTCAGTAATTTTTAGTTACCTGAAGATTG
TCACCTGGCGAGGATAAGAAACGTTTCTTTTCTTCCTTACTAAGGTTTGG
CGTAGaaccttttttctcaaaagagaCGATATAAACACGGACTACGTACG
ATTGTAACTGTAACGGTGTAGACATTTTTTGTGTACAGAGCAGCAAAGCA
AAAATTTACGTTCAtcaacaaagttttttttgtctACCAtagtaaaaaga
aattaaaagaatgatTTGTCATTCAATAACGGACATACCTCAAAATAGCG
GAAAGTTCCTCCTCTTTTACTGTCCAATTAGGATAACTGCCTTCTTGAAT
TTTTCGTCGGACGCGCGGCTCTTCGACGTAACGTGGTGGTACACCGTAAT
CATACGCGTTATCGATCAAGAACTTGCAATACGCATCTGCAGACATACGG
TGACCGGCACCTTCGTCAATCGTCAACGAGTTCGCGACTTCGTGACGAAA
TTTCTCCATCAATTCTTCTGCGTTCTCACGGCGCTCATCTAACGTCATTG
CGGACGCTTCGTAACGTCGATGTTTCGGAACAGGAACGATTGTCCGGTTT
CCAATAAATAGGCCGGTTTGTTTTTCGCGTTCGACCTTCTTTTTCTCATG
TTGTCGCCTGAGATCAGTGTCAAACCTTTTGCTCAGGTTATAGAAAACAC
TTTTTCGTTCTTTGCCTGTTTTTTGTGGTACGTAGACCGTAGCTCTCTTG
ACGGAAGCATTGACTTGCACTAcagctttgtttactttgtcGTTGTATGT
TTCTGGATGGACAGAATATTTGATTGGAAGCTGTGGCAAAACTTCTTTTC
GCTCACTCGCTTGATCTGTGAAACCAAAAAGTAACGCAAAATGTTTAGAT
TATTGACAGTGACCTTCTTAGGAGACCCTTTAAACATTTCTCATTTAAGT
TTAGATACcactaattttttctttgaaacttaTAAATTGCGGGGTATGTT
ATTTTAACAACACAATGAAAAGGTCTCATCACCTTTATTTTCCTTGGCAG
ATTTGGCAACTTCTCgtttctttttcaagatttcttgaaatttatccAAT
GTCTTCTTGTCTTCGTCGTCCATCTCATGAAACAACTTGCAACCGTTGCT
CGATTCTCGATCCTTTACTGGTACATGTTCATCTGAAAGTCCATGTTCTC
CGAGATAATCATTAACAATCGCACGGTAATGCTTGACACGTTCACCAGAC
AAAAGTCCTGGGTCCATGATATTTGTAACACGCTCAACTTCAGTCAAACT
TCGACGAACGGAATCGAACTGCATGAAACGCATCATGGTTTTATCCAAAG
CCTCCTCGCTAATGGTGGAGTCCAATTTCCTCAACTCATCCTTAAGCTCT
GGAGTGCACAGCTCTAAGCAATCTTTAAACACGACTCTGGCTTTCCACTG
AGCTTTAGCCTCCATTTCGACTTCTTTCAGATGTTTCAATTCAACATTGA
CTTCTGATTGAACCTCGGGCATTCCTGATGACTCAGGGTATTGCAAGGAA
GATGTCTTCATTCGTTTCTCAGATGGAGTTGGTCGTAAGTACAATGATGT
GTTTGATGCAACTTTCTTCGGTTCCAAGTCATTCATATATCTAGAGAATC
TCATTTTATGATTTGATGATACCAATGTTGGTTCTTGTGATATGTTTAAA
CATCCAAAGATAGTGGAGTTTGAGTATCTAGATAAATCTAGCTTACTATC
TGCCATGCCTCCACTTGCTAGACAGTTCTCATAGAAATTAACGTTGGGTT
TGATGCATTGCATGGATTTCCGTCGACCCCCGCTCAAATTGATGCAGTTC
TCACGCTCTGTGGAAATAATATTAAAGCATAATCAAGTTTATTTTGGTCA
CTTTGCTGTAAAGAATCTGAACTGATGTGATTTCAAAACGTCTGAGCCGT
CTTGTTCTCGACCCAGCGGAACTTCAATTCACGCTATCATGCAAATTATT
CGACAGCGTAAATGGATTTCATTCGAGAAAAATCGAAGAAATGCTCCTAT
TCACTTTTTTAAGGTTAATTAAACAACTTACCCATGATCTGCTCAACACG
TCTCTCCATTTCTTTTACGCGACTTTGCTTCTTCTCGTAATGTTGTTTTT
CAGGCGCGTTGACGCGGCTTACAGACTCTTCCTTCTCTCGCTTTTGATTC
AAAAGGAAGGATTTCTCTTGAATCTCCTGTTCAACGACATCCCGCTCCTC
TTGCCAAAGACCCAAGTCTTGGCACGGcaaaacaaaaacctttaaagaGT
TCCTCATTTTTGTGACAAACTgatggtttttattttgaaaaaactaaatt
ctCTGTTCCTGCAACAGAGTCTGGTTGATTTTTAATTGAATTGACTTCTT
TTAATccaattaaaatatatttcactATAAATCCAACTTCAAAAAgctct
tttcaaacttttacggCTTGGTAGGTTGGGTTTTCAAACGAAACTGAATT
GAATTCATAAAAGTGGCTTTCTTtatattatttgacgtcaataagttttt
gtgacgtcaatttttgatatgttatcaagtttcatcgaatttttgtattt
ttttctttttttttcgcgaaagtcTTTATGATCAATACAgcgaaaatctg
aaaataaatatttcttgaaaatagtTTCATCGGTTTCATAAAAGATGTTT
CAGGATAATTTTAGGATAAGAATTTTAAGcgatttcaataaattttgatt
cttaATCTCTTGCAGGTGATTTGTTAGCAGCGATCGTTCGTGATTTCGGA
TCATTTGCAAACATGAAAGAACAATTGACGAATGCAACTGTTGCTGTTCA
AGGCTCCGGTTGGGGATGGCTGGTAAGTGTTGGATAAATAGTTTTTGCGC
GAACAATTCTTCGCTTTTTTCGTTTTGTTATAAAATCACGTAAATTCAAA
CCCGTGAAGCACAATGTATCGCGTATAATATTGATATATcttattggccc
tttttacgccggccctaatttaacgtgGGCCCCTTTTACGCGGGCCCTTA
TTACACCACAgtctaattttgggcttaggccaattagggccgttaataac
gccaaaatttgtaaaaatggctacttatacttcaaattagtaaataatct
ttaaaagtTTCGGTAGTAAATTGTTGAAAATCCCATTCAAAATTACTGAT
TTTCGTGAGGTCTTAGATATGGATAATTTttgtcttcgaatcatacctaa
aatcctttaaattgaaaaaaaatgatagaaaattaacgccacttttaGGT
AAAGATTGCAAAATCTTGGCACTTATTACGCCACGTGCCCAAAAATATAG
CGCCAataaagggccggcgtaaaaagggccgataaggtaagtcTTTGAGA
ACGAGGTTTGCAattattttatgcattttcgaGAAGAGTGTATGAGTGTA
TTCGCAAAAATTGCTTTCCTTAAAAatggggggtgggggggggggtggag
gatataacaattttcagtgatatACCCctcggacaaagtgactttggCTC
CCCGtacaattttgatgattttcctACCACAtggacaaaatatcctccac
cccccatgtacggacattttctggaagagcccatttcgtCGGTTTTGTTA
TTAAATTACTAGTTTGGATATCTCTTTGTAACACTTCTTTCCTCGCCAAC
CGACAGGGTTATGATAAAAAGACTTCGATGTTAACAATCGATGCTATGGC
AAACCAAGACCCTCTACAATCGACAACCGGTAAGGAAAATGCATTATTAT
ATTTTACAGACATTCATAAATTTAAgtatttgtaaagttttaagCAAAAT
GAGACATCATTTTCCAGCTTTATTATCCttggctacgtcatatcttcctt
cgtttccagcgtaaaactcctactctagTAAGGCCTtaaagcctggagct
gtataTTATGTAGACTATTTTATCCCTGAAAattactgaaataaaaatta
tgatagAAAGTGATGCTAAAATTACTTTAAACAGCCCATTCAAGAAAATC
AATGACATTAAATTgttcatttgaagtaataaaaatgatgcatccttaag
aaaaagtaacaaaattttttattactggttaacgaccaacgaaatcaaat
aagagcttgtaaaaactccatctcgtcccccAGAGCCAGGCTACCCATCA
AAATAATATCATTCATTCCGTTTCTTTATTTCAGGACGTATCCCGTTGCT
TGGTATTGACGTTTGGGAACACGCTTATTACCTACAGTATAAGAACGTTC
GTCCTGATTACGTCAAAGCCATCTTCGATATTGTCAACTGGTCAAATGTC
TCTGAACGATACGAGAACGCTATGTGATTGTAGAGAAAGAACTTAAATTA
ATGTTTTCATTTCCTGGCTGGATTGAATGAGCAGGTCGAGGGTAatctct
tcaaaaaattttgaaaatccaggtctggatcaatttttgtaaaaaactaa
aTATGATGAATTTagctcttttttttaatttacgaattaaaatttcttca
ttagaaattttagaaagaatatatttttaacaaCTAGATATGTCACAATA
TATTTAGGTTACTCTCTCCCCACCCATTGTCTGAACaaatacaaatacaa
agaaatgcTGCATTGAATTATCTTTCAGATTACAATTCGGTTGAGACCTC
TATGCAAACTGTTTGTCTATCTATGACTTGTGACGTAGAGCAAGCCTCGT
CCCGTTTATGAAACAATGTTTTTGGTAACATGACTTATTATCATACTTTC
TTTTAGTTTATGCTATCTGGTCTTTATAGGGAAGTCTTTCTGATTCTGAT
ATTACTAATTTGTTGCTCTAATATATTAtaagatgtttttattttgtaaa
gacttaataatcaaaacataaaaatgctATCGACAGTTGCCCGAAACACG
CGTCGTGCACTTTCAAAACAAGCTCTGCAAACAGTGCAAGTTGCATCAAA
ACACACTTTACCAGCTCTCGATTATGAATACTCGTCATTGGAACCAATCA
TCCCTGAAGAAATTATGACCCTTCATCATTCTAAACATCATCAAACGTAC
GTCAATAATTTGAACGCCGCGGAAGAACAGCTACAAGATGCTCTGTCTCA
AGGTGATATGAGGAATGTCATTTAATCTAACTCACAGATTCTACTTcaag
attttcattaaattcAACCTGGACTGGACCGGTtgggtcaattttttctg
taattcgaattagGCCCCCTTTGCTTAAAAGTAGTATAAAAAATACTCTC
TATTCCAAATCTTTCTATTATGCAATAAAGTTTTGGTCCCTTTAAGATGG
AATTATAGAGATAGGTATTTAAATCATCTTTTACTTGAACTTTTTCATTG
GTTAATTGGCATCTTATTTCTTCAGGCCACTTACCAAAATTGATATGACT
TCAACCAGCACTTCGATTCAACGGAGGAGGCCACGTCAATCACACCATCT
TCTGGACCAATCTCTCACCCAACGGTGGAGGCGAACCCAAAGGTAAAGAC
ACTCCTTATATGTCGGCCAGATTGGTTATTCCGAGATTAGGTTCTTTAAA
TTCTAcctgattcgcgaaaataaTTCTACGCGAAAATCTATCCACTTAAG
GTGATCTGAAACTAACTGTCCTATGATTTAAAACGTGGTCGATTTATATA
TCTGGCCTATCCAAAGATAAAGGAGAAAAAATGGATATGAGACGAGTGAA
GaagaattttattaaatttacgGTATAGGTATATATTTACAAGGTaaata
attaagaaaaaaatccacgatgagaaaaataatttacaaacattgaaaaa
tgagaaaaaatctgcaaagaaaaaacaaaattatttataaaaaagctatt
acaaaatccaaggttaaaattttttgatttttatgaaaatattaaaaaaa
cgtttgataaaaaaatatataaatatatagACACAACGGCTGATGAATGG
AATCAGAGAAATCTATGTCCGAAATATTTGGTTCGGTATGCTTCTGCTTG
TCGCCTGAAAACGTAAGAAAAGAAGGACCAACGATTAAAATATTATACAA
AAAGTCTAAGTCAAGtgccaaaaaaaaggaaaacgtcctccatttcaaaa
cttttgagttttgtctcagatacatttgctgttttacTGTATTGAAGGCA
TTGCCAGTTTAAGTTTACTTGTCCATCATCACATAGACACATTCTTGATT
GACCACTTAACCAATCAGGTCTAATTAATTAATAATGGAAACACAAAGAA
ATAAAGATTCTACTGAAATCTACTTGCTTACATGTTGTGTTTGTTTGAAC
CATCACGAAGGTTGGATGCTTCTGCAATGTCACCTGGACCATCCTCGAaa
taattttgcaaaaagttgtaaattctgaaaaacgaagaaaatgaagaaat
gagTTATCATCATTCGTTTTTGATTTATAATGTCATCCAAACATTAATCG
CGTAATTTTATCAATACAATATTCTAGCGATAAGTCAACACCATCTcggg
cctcgttttcaaatgaaatgatTACTTCAAACGACATTTACACATGTAAT
ATGTTTTCCCAAAAGaccgttttcaattttgatacagTACCGCAAACTCT
TGAAAACATCAATTATGTCTGACGACATTGAAGTATCCTGGCAACAAGTC
ATTGAGAACGAGGTTGGTAATTATTTAATCATTTTCGAGAAGAGGTGTAT
CCGATTGGAATTCGATAACTTGCTTGAACAAATACCGAAGAACAAAATCG
AAAACGGTAAAATGACAACTACTTCGAATCAAattcgacaatcaaatttt
aATTGATCAATTAGATTCGATTTAATTCGATTGGTCTGGTGTTCGTTTCT
TTTCGATTGCAATCGTGTGATAACGAATCGATTACACGGAGATGAACATA
ATCGATGACAGTCTTATTGTCGAGATCTTCGTAAAGAGGGTTCATCTGGT
GAGCCATCAATAATTGAAGAATATCTGCTCGTCCATCAATGACTGCAATG
TGAGCTGCGGTTCTATAAGTTGAAGTTGAAAAAGTTAAAGGATGGGAATT
GCATATTGATACATTTATTCCATTTTGTCATAAGACTTGAATTTGAATGT
TAACAATGTTATCTTTTTCGGCAATTGGATATGCGATTTCCTCAAAAGCC
CTGGAGAGCTATCAATATAGGAGATTATCTTCCAACTAAAGCCAAAACAA
AGCAGATATAAGTAGAAAATAATGTTGTTGCAATCACTTACCGCCCGTTG
CCTTCTCTGGCGTTCACATCGAGTCCTTGGTGCAACATGTAATCGATACA
CTTCAGAACAACGATGTGTTTATTGTTCATCAAAGCCATATGTAGAAAGC
TCATTTCGCCCAATCTGCTTTCAGTCTGTGAAGAAAATTGgatattgaaa
tttcaataagtTTCAAGTCAACATACTATTCCATTACATTAAAATAGCTA
AGATAAGAGCCTAGAAGACAAATTTTTCTGGAGTGTTATAAGCAGACTTT
GAACAATGTTAAGTGGAAGAAATTTGCCTCAATGCCTCTTGGTGATAAAC
ATGTATATCGAAGATGTCATTATGATTCAATCTAGAACCTAGGCCTCCCA
AAGGGAGGGTGCGTGCGGTGTATAACTTACGTTTGTTCTTAGTGAGACGT
CCCACAGAAGTTTGAACATCTCGAAGCGTTCATCACCATAGAAATGCAAT
AAATAAGTTAAAGCATCGCGAGAATCTTGTGCCTTGATACGTGTGTTAGC
GCCTGCTTTGATCAACGCTTTGACGCACTCGATGGAACCGACTTCCATGG
CCTAAACGAGAGAAAGTTCATCATATGTGTTAATATGGTCATTGTATAGT
GTATAGCCGGCACTCGAGAACACACTCGAtttttttATGTTAACTGGTGG
AGCCAGAATcaccgaaaagagtttacatgTTATACGATCAATTGAATCTC
CATTGAAAATACAGCTCAAAATCTCGGACAACGAATATGTCACAAAATTC
ACTGATGTAGAAGAATGTTCCTAGCTAATGGAATTGATCTTTATTCATAA
TTCtcactaaaaaaaaaacctgtcttaagaaaacctttaaagttaCTCGG
TTTTAACACCGTCAAACATAAATGACCAGTCACTTACTTTATAGAGTGGA
GTTTTGCCATGGTTGTCTTGCTTGTTGACATCGACACCAGGACATCTCAA
TAAGATATTTAAAGTTTTAATGCATCCCCAAGAAGCGGCGAAGTGCAGTG
CGGTCCTGTGAAAGTGAAGAGAGACACATTAAAAGATATAGTCCccatgg
atataaaattacctCAAATTAGAGTGCGAATACGATAAATGATGCTCAAA
AGCTTCTTCGTGTGAACAGTCCAAAATTAATACAGTCAACTCGCTTTagt
tcgaacttctattatttgaatctttctgtaatttgaactaaaatattgTT
CCCTTTTGGTTGAAAAGTAGTTTAatttactctctgtaattcgaatattt
ctccgatttgataacatttttggTCCACCGAAGATCGAATTAGACAGAGA
GAAAGTCAACCGTATTAACAATTTTTATCATCCTGGGACAAACCAGGCGA
GTAAACCTTTTGGCTTTGTTTTATAATTGTAGCATAAGACTACTCTGCTT
TGTATTTTAACCCTTCTAGCTTACTCATCAAATTCTTAGAACTATCTTTC
ATATTTTAGTCCATCATTTTACCTCTTTTGTGCGTCAACTCTGTTGATTT
TCTGTTGAAACTTATCTTCCTTCAACACCTTACGTAATTTCTTCAATTTG
CCTTTCCAGGCGAATCTAAAAGTAGAATAGtagaaagattgaaaatgaat
ctTTATTCGTATTTgtgtttgaattttctttggTCTGTCTCTACCTGGAA
CCGACCCCACATCTATACAGAATTTCTAAGGTTTTGCGTAGAATCTTTCT
CAAAAGAGACAATATATAACAAAGATTGTATGATTGTACTGCTTTAAACG
GTGTGAATTTTTGTGTACAGAATAGCAAAGCCAAAATTGACTTTCATCAA
CGAAGtttttttGTCTACCAtagtaaaaagaaattaaaagaatgatTTGT
CATTCAATAACGGACATACCTCAAAATAGCGGAAAGTTCCTCCTCTTTTA
CTGTCCAATTAGGATAACTGCCTTCTTGAATTTTTCGTCGGACGCGCGGC
TCTTCGACGTAACGTGGTGGTACACCGTAATCATACGCGTTATCGATCAA
GAACTTGCAATACGCATCTGCAGACATACGGTGACCGGCACCTTCGTCAA
TCGTCAACGCGTTCGCGACTTCGTGACGAAACTTCTCCATCAATTCTTCT
GTGTTCTCACGGCGTTCATCTAACGTCATTGCGGACGCTTCGTAACGTCG
ATGTTTCGGAACCGGAACGATTGTCCGGTTTCCAATAAATAAGCCGGTTT
GTTTTTCGCGTTCGGTTTTCTTTTTCTCATGTTGTCGCCTGAGATCAGCG
TCAAACCTTTTGCTCAGGTTATAGAAAGCACTTTTTCGTTCTTTGCCTGT
TTTTTGTGGTACGTAGACCGTGGCTCTCTTGACGGAAGCATTGACTTGCG
CTACAGCTTTATTTACTTTGTCGTTGTATGTTTCTGGATGGACAGAATAT
TTGATTGGAAGCTGTGGCAAAACTTCTTTTCGCTCACTCGCTTGATCTGT
GAAACCAAAAAGTAACGCAAAATGTTTAGATTATTGACAGTGACCTTCTT
AGGAGACACTTTAAACGTTTCTCATTTAAGTTTAGATACcactaattttt
ctttgaaacttaaaaattgCGGGGTATGTTATTTTAACAACACAATGAAA
AGGTCTCCTCACCTTTATTTTGCTTGGCAGATTTGGCAGCTTCtcgtttc
tttttcaagttttcttgaaatttatctAACGTCTTTTGGTCTTCCTCGTC
CATCTCATGAAACAACTTGCAACCGTTGCTCAATTCTCGATCCTTTACTG
GTCCATGTTCATCTGAAAGTCCATGTCCTCCGAGATAATCGTTAACAATC
GCACGGTAATGCTTGACACGTTCACCAGACAAAAGTCCTGGGTCCATGAT
ATTTGTAATACGCTCAACTTCAGTCAAACTTCGGCGAACGGAATCGAACT
GCATGAAACGCATCATGGTTTTATCCAAAGCCTCCTCGCTAATGGTGGAG
TCCAATTTCCTCAACTCATCCTTAAGCTCTGGAGTGCACAGCTCCAAGCA
TTCTTTAAACACGACTCTGGCTTTCCATTGAGCTTTAGCCTCCATTTCGA
CTTCTTTTAGATGTTTCAATTCAACATTGACTTCTGATTGAACCTCGGGC
ATTCCTGATGACTCAGGGTATTGCAAGGAAGATGTCTTCATTCGTTTCTC
AGATGGAGTTGGTCGTAAGTACAATGATGTGCTTGGTGCAACTTTCTTAG
GTTCAAGGTCATTCATGTATCGAGAGAATCTCCTTTTATGATTTGATGAT
ACCAATGTTGGTTCTTGTGATATTTTTAAACATCCAAAGACAGTAGAGTT
TGAGGATCTAGATAAATTTGGCTTACTATCTGCCATGGCTCCACTTGTTA
GACAGTTCTCATAGAAATTAACGTTGGGTTTGATGCATTGCATGGATTTC
CGTCGACCCCCGCTCAAATTGATGCGGTTCTCACGCTCTGTGGAAATAAT
ATTAAAGCATAATCAAGTTTATTTTGGTCACTTTGCTGTGAAAGAATCTG
AACTGATGTGATTTCAAGACGTCTGAGCCGTCTTGTTCTCGACCCAACGG
AACTTGGGAAATCATGCAAATTATTCGACAGCGTAAATGGATTTCATTCG
AGAAAAATAGCTCCTATTCACTCCTAAGAAAAGCAAAGAAATTAAACAAC
TTACCCATGATTTGTTCAACACGTTTCTCCATCTCTTTTACGCGACTTTG
CTTCTTAGCGTAATGTTGTTTTTCAGGCGCGTTAAAGCAGCTTTCCCACT
CTCCCTTCTCTTGCTTTTGATTCAAAAGGAAGGATCTCTCTTGAATCACC
TGTTCAACGACATCCCGCTCCTCTTGCCAAAGACCCAAGTCTTGGCACGG
caaaacaaaaacctttaaagaGTTCCTCATTTTTATGACGAACTgatggt
ttttattttgaaaaatctaaattctcTGTTCCTGCAACAGAGTCTggttg
atttttgattgaattgacttcttttaatccaattaaaatatattgcacTA
TAAATCCAACTCAAAAAgctcttttcaaacttttacggCTTGATAGGTTG
GGTTTTCGAACGAAACTGGATTGAATTCATAAAAGTCGCATTCTTtatat
tatttgacgtcaataagtttttgtgacgtcaatttttgatatCTTAAATC
AATTTCATCGAATTTTGGTATTTTCCTATCGCGAAAGTAAGTCTTTATTG
ATCAATACGGCGAAAgtctaaaaaaaatatttcttgaaaatagttttata
aaagatatttcaggatgattttaagataagaattTTAAGCGatttcaata
gattttgattgtAATCAATTTTTACAGAAGTTGGTGAAtaacaaaaaatc
gaaaaatagcTTCATTCCGATCTTGAATTCAAAAgtatttcattttattc
tcTTTATCTCTTGCAGGTGATTTGTTAGCAGCGATCGTTCGTGATTTCGG
ATCATTTGCAAACATGAAAGAACAATTGACGAATGCAACTGTTGCTGTTC
AAGGCTCCGGTTGGGGATGGCTGGTAAGTGCTGGATAACTAGTTTTTGTG
CGAAGAAGTCGCTTCGCTTTTTTCGTTTTGTTATAAATTCACGTAAATTC
AAACCCGTGAAGCACAATGTATCGCGTataatattaatatattttattgg
cccttttacgccggccctaatttaacgcgggccccttttacgccaaaatt
tgtaaaaatggctacttataCTTCAAATTCGtaaataatgtttaaaaaat
tcggTAGTAAATTGTTGAAAATCCCATTCAAAATTACTGATTTTCGTGTA
AGGTCTTAGATATGGATAATTTttgtcttcgaatcatacctaaaatcctt
taaattgaaaaataatgatagAAAATGAACGCcacttttaggtaaaaatt
gcaaaatcttggcaCTTATTACGCCACgtgcccaaaaataacgccaataa
agggccggcgtaaaaagggccgataaggtaagtcTTTGAGAACGAGGTTT
GCAattattttatgcattttcgagaagagtgtattcgcGAAAATTGCTTT
CCTTAAAAatggggggggtggaggatataacaattttcagtgatatACCC
ctcggacaaagtgacttttggctcCCCGtacaattttgatgattttccta
ccacctggacaatatatcctccaccccccatgtacggatattttctggaa
gagcccatttcgtCGGTTTTGTTATTAAAATATTAGTTTGGCCATCTCTT
TGTAACACTTCTTTCCTTGCCAACCGACAGGGTTATGATAAAAAGACTTC
GATGTTAACAATCGATGCCATGGCAAACCAAGACCCTCTACAATCGACCA
CTGGTAAGGAAATTGCATTAGTATCTTTTACAGACATTCATAAATTTTTT
AAGTATGTTTAAAGTTTTAAGCAAAATGAGACTTAATTTTCCAGCTTTAT
TATCCttggctacgtcatatcttccttcgtttccagcgtaaaactcctac
tcgagtaaggcctaaaagcctggagctgtataTTATGTAGACTATATTAT
CCCTGAAAattactgaaataaaaattatgatagAAAATGATgctaaaact
actttaaacaGGTCATTCAAGAAAATCAATGACATTAAATTAACCATTGT
TAACCCTTAGTGTCAAATCGCCACAGCCAGGATACCCATCAAAATAATAT
CATTCATTCCGTTTCTTTATTTCAGGACGTATCCCGTTGCTTGGTATTGA
CGTTTGGGAACACGCTTATTACCTACAGTATAAGAACGTTCGTCCGGATT
ACGTCAAAGCCATCTTCGATATTGTCAACTGGTCAAATGTATCTGAACGA
TACGAGAACGCTATGTGATTGTAGAGAAAGAACTTAAATTACTGTTTTCA
TTTCCTGGCTGGATTGAATGACCAGGTCAAGGGTAatctcttcaaaaaat
tttgaaaatccaggtctggatcaatttttgtaaaaaactaaatatgacga
atttaactttttttttaatttacgaattaaaatttcttcattagaaattt
tagaaagaatatatttttaacaaCTAGATATGTCAAAATATATTTCGGTT
ACTCTCTCCCCACCCATTGTCTGAACAAATACAAATACAAGGAAATGCTG
CATTGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:46506..64862+ >MSTRG.11042.3.p1 ID=MSTRG.11042.3.p1|Name=MSTRG.11042.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3345bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:46506..64862+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgCTGTCGACAGTCGCTCGAAACACGCGTCGTGCACTTTCAAAACAAGC
TCTGCAATCAGTACAAGTGGCATCAAAACACACTTTACCAGCTCTAGATT
ATGAATACTCATCATTGCAACCAATCATCTCTGAAGAAATTATGACCCTT
CATCACTCTAAACATCATCAAACGTACGTCAATAATTTGAACGCCGCGGA
AGAACAATTACAAGATGCTCTGTCTCAAGGCGACTTACCAAAAGTGATAG
GACTTCAACCTGCACTTCGATTCAACGGAGGAGGACACATCAATCACACC
ATCTTCTGGACCAATCTCTCACCCAACGGTGGAGGCGAACCCAAAGGTGA
TTTGTTAGCAGCGATCGTTCGTGATTTCGGATCATTTGCAAACATGAAAG
AACAATTGACGAATGCAACTGTTGCTGTTCAAGGCTCCGGTTGGGGATGG
CTGGGTTATGATAAAAAGACTTCGATGTTAACAATCGATGCCATGGCAAA
CCAAGACCCTCTACAATCGACCACTGGACGTATCCCGTTGCTTGGTATTG
ACGTTTGGGAACACGCTTATTACCTACAGTATAAGAACGTTCGTCCGGAT
TACGTCAAAGCCATCTTCGATATTGTCAACTGGTCAAATGTATCTGAACG
ATACGAGAACGCTATGTGAatgCTGTCGACAGTCGCTCGAAACACGCGTC
GTGCACTTTCAAAACAAGCTCTGCAATCAGTACAAGTGGCATCAAAACAC
ACTTTACCAGCTCTAGATTATGAATACTCATCATTGCAACCAATCATCTC
TGAAGAAATTATGACCCTTCATCACTCTAAACATCATCAAACGTACGTCA
ATAATTTGAACGCCGCGGAAGAACAATTACAAGATGCTCTGTCTCAAGGC
GACTTACCAAAAGTGATAGGACTTCAACCTGCACTTCGATTCAACGGAGG
AGGACACATCAATCACACCATCTTCTGGACCAATCTCTCACCCAACGGTG
GAGGCGAACCCAAAGGTGATTTGTTAGCAGCGATCGTTCGTGATTTCGGA
TCATTTGCAAACATGAAAGAACAATTGACGAATGCAACTGTTGCTGTTCA
AGGCTCCGGTTGGGGATGGCTGGGTTATGATAAAAAGACTTCGATGTTAA
CAATCGATGCCATGGCAAACCAAGACCCTCTACAATCGACCACTGGACGT
ATCCCGTTGCTTGGTATTGACGTTTGGGAACACGCTTATTACCTACAGTA
TAAGAACGTTCGTCCGGATTACGTCAAAGCCATCTTCGATATTGTCAACT
GGTCAAATGTATCTGAACGATACGAGAACGCTATGTGAatgCTGTCGACA
GTCGCTCGAAACACGCGTCGTGCACTTTCAAAACAAGCTCTGCAATCAGT
ACAAGTGGCATCAAAACACACTTTACCAGCTCTAGATTATGAATACTCAT
CATTGCAACCAATCATCTCTGAAGAAATTATGACCCTTCATCACTCTAAA
CATCATCAAACGTACGTCAATAATTTGAACGCCGCGGAAGAACAATTACA
AGATGCTCTGTCTCAAGGCGACTTACCAAAAGTGATAGGACTTCAACCTG
CACTTCGATTCAACGGAGGAGGACACATCAATCACACCATCTTCTGGACC
AATCTCTCACCCAACGGTGGAGGCGAACCCAAAGGTGATTTGTTAGCAGC
GATCGTTCGTGATTTCGGATCATTTGCAAACATGAAAGAACAATTGACGA
ATGCAACTGTTGCTGTTCAAGGCTCCGGTTGGGGATGGCTGGGTTATGAT
AAAAAGACTTCGATGTTAACAATCGATGCCATGGCAAACCAAGACCCTCT
ACAATCGACCACTGGACGTATCCCGTTGCTTGGTATTGACGTTTGGGAAC
ACGCTTATTACCTACAGTATAAGAACGTTCGTCCGGATTACGTCAAAGCC
ATCTTCGATATTGTCAACTGGTCAAATGTATCTGAACGATACGAGAACGC
TATGTGAatgCTGTCGACAGTCGCTCGAAACACGCGTCGTGCACTTTCAA
AACAAGCTCTGCAATCAGTACAAGTGGCATCAAAACACACTTTACCAGCT
CTAGATTATGAATACTCATCATTGCAACCAATCATCTCTGAAGAAATTAT
GACCCTTCATCACTCTAAACATCATCAAACGTACGTCAATAATTTGAACG
CCGCGGAAGAACAATTACAAGATGCTCTGTCTCAAGGCGACTTACCAAAA
GTGATAGGACTTCAACCTGCACTTCGATTCAACGGAGGAGGACACATCAA
TCACACCATCTTCTGGACCAATCTCTCACCCAACGGTGGAGGCGAACCCA
AAGGTGATTTGTTAGCAGCGATCGTTCGTGATTTCGGATCATTTGCAAAC
ATGAAAGAACAATTGACGAATGCAACTGTTGCTGTTCAAGGCTCCGGTTG
GGGATGGCTGGGTTATGATAAAAAGACTTCGATGTTAACAATCGATGCCA
TGGCAAACCAAGACCCTCTACAATCGACCACTGGACGTATCCCGTTGCTT
GGTATTGACGTTTGGGAACACGCTTATTACCTACAGTATAAGAACGTTCG
TCCGGATTACGTCAAAGCCATCTTCGATATTGTCAACTGGTCAAATGTAT
CTGAACGATACGAGAACGCTATGTGAatgCTGTCGACAGTCGCTCGAAAC
ACGCGTCGTGCACTTTCAAAACAAGCTCTGCAATCAGTACAAGTGGCATC
AAAACACACTTTACCAGCTCTAGATTATGAATACTCATCATTGCAACCAA
TCATCTCTGAAGAAATTATGACCCTTCATCACTCTAAACATCATCAAACG
TACGTCAATAATTTGAACGCCGCGGAAGAACAATTACAAGATGCTCTGTC
TCAAGGCGACTTACCAAAAGTGATAGGACTTCAACCTGCACTTCGATTCA
ACGGAGGAGGACACATCAATCACACCATCTTCTGGACCAATCTCTCACCC
AACGGTGGAGGCGAACCCAAAGGTGATTTGTTAGCAGCGATCGTTCGTGA
TTTCGGATCATTTGCAAACATGAAAGAACAATTGACGAATGCAACTGTTG
CTGTTCAAGGCTCCGGTTGGGGATGGCTGGGTTATGATAAAAAGACTTCG
ATGTTAACAATCGATGCCATGGCAAACCAAGACCCTCTACAATCGACCAC
TGGACGTATCCCGTTGCTTGGTATTGACGTTTGGGAACACGCTTATTACC
TACAGTATAAGAACGTTCGTCCGGATTACGTCAAAGCCATCTTCGATATT
GTCAACTGGTCAAATGTATCTGAACGATACGAGAACGCTATGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000079_pilon | genome | sc0000079_pilon:46506..64862 + |
|
