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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000079_pilon:56372..75199+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11042.13.p1 ID=MSTRG.11042.13.p1|Name=MSTRG.11042.13.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18828bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:56372..75199+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACAAGCTCTGCAAACAGTGCAAGTTGCATCAAAACACACTTTACCAGCT
CTCGATTATGAATACTCGTCATTGGAACCAATCATCCCTGAAGAAATTAT
GACCCTTCATCATTCTAAACATCATCAAACGTACGTCAATAATTTGAACG
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GACTTCGTGACGAAACTTCTCCATCAATTCTTCTGTGTTCTCACGGCGTT
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GGTTTTATCCAAAGCCTCCTCGCTAATGGTGGAGTCCAATTTCCTCAACT
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GTTTATTTTGGTCACTTTGCTGTGAAAGAATCTGAACTGATGTGATTTCA
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CAACACGTTTCTCCATCTCTTTTACGCGACTTTGCTTCTTAGCGTAATGT
TGTTTTTCAGGCGCGTTAAAGCAGCTTTCCCACTCTCCCTTCTCTTGCTT
TTGATTCAAAAGGAAGGATCTCTCTTGAATCACCTGTTCAACGACATCCC
GCTCCTCTTGCCAAAGACCCAAGTCTTGGCACGGcaaaacaaaaaccttt
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GGTATTTTCCTATCGCGAAAGTAAGTCTTTATTGATCAATACGGCGAAAg
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AATTTTTACAGAAGTTGGTGAAtaacaaaaaatcgaaaaatagcTTCATT
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GTGATTTGTTAGCAGCGATCGTTCGTGATTTCGGATCATTTGCAAACATG
AAAGAACAATTGACGAATGCAACTGTTGCTGTTCAAGGCTCCGGTTGGGG
ATGGCTGGTAAGTGCTGGATAACTAGTTTTTGTGCGAAGAAGTCGCTTCG
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ATGTATCGCGTataatattaatatattttattggcccttttacgccggcc
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GAAAATCCCATTCAAAATTACTGATTTTCGTGTAAGGTCTTAGATATGGA
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TTAAGCAAAATGAGACTTAATTTTCCAGCTTTATTATCCttggctacgtc
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TTCTACTTcaagattttcattaaattcAACCTGTTCAATTCAAACTGGAC
CGATTGGGTCaattctttctgtaattcgaattagGCCCCCTTTGCTTAAA
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ACCAAAAGTGATATGACTTCAACCAGCACTTCGATTCAACGGAGGATTCC
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GCGAACCCGAAGGTAAAGACACTCCTTATATGTCGGCCAGATTTGTTATT
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CGAAAATCTATCCACTTAAGGTTATCTGAAACTAATTGTCCTATGATTTA
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GCCAATTGGACAATTAAAATTTCCCTTGAAGTTCTTCAGGGGAACTAAAA
ATGCAGAAGAGCTTTAAAATCCAACAAAGCCAAAATAAAAGTAGATACTA
GTAGAAAATAATGTTGTTGCAATCACTTACCGTCCGTTGCCTTCTCTGGC
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ACATCTCGAAGCGTTCATCACCATAGAAATGCAATAAATGAGTCAAAGCA
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CGCTTTGACGCACTCGATGGAACCGATTTCCATGGCCTAAATAGAAGAAA
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AATCTCCATTGAAAAACACAGCCCAAGCTCTCTGAAAAAATATACCAACG
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AAAGTTTTAATGCATCCCCAAGAAGCAGCGTAATGTAGTGCGGTCCTGTT
AATGTGAAGAGAAACACATTGAAAAATATAGTCCCCATCGATGTAAAACC
ACCTCATTAGAGTGTAAATAAGGAAAATAATGGATGACTTGTTCAAATGT
TTTGGTTTCTCCGTGTGAGCATTCCCGGAAGGAAACGGCCCAAAACATAA
AAACCCTTCTAGTTTACTCGACAAATTCTTAGAACTATCTTTCATATTTT
AATCCATCATTTTACCTCTTTTGTGGATCAACTCTGTTGattttctgttg
aaatttctcttctttcaaCACTTTACGCAATTTCTTCAATTTGCCTTTCC
AGGCGAAtctaaaaaagtgaaaaagtaaaatgattGATCTTTATTCGTCT
TTGTGTTTAAATTTGCTTTGTTCTGTCTGTACCTATACCCGAACCCATAT
CTATATAAAAAATCTAAGGTTTGGCGTaagtttttcttcaatttttttta
cggTGTTCGATACATGTATAGAAATGCCAGTAATTTTGTTGCCTGAATAT
TGCCACCTggcagtagcagaataaaaaacgtgtcttATCTTCCTTACTAA
GGTTCGACGTATAATCTTTCTCAAAAGAAACAATATAAACACAGATTGTA
CGATTCTACTGTATTACAGTAAACGGTGTAGACTTTTTGTGTACAGAGCa
ccaaaaaagccaaaataaagTTCTTATTGTCTACCATAATAAATGAAAAT
CAACAGAATAATTTGTCATTCATAAACGGACATACCTCAAAATAGCGGAA
AGTTCCTCCTCTTTTACTGTCCAATTAGGATAACTGCCTTCTTGAATTTT
TCGTCGGACGCGCGGCTCTTCGACGTAACGTGGTGGTACGCCGTAATCAT
AAGCGTTATCGATCAAGAACTTGCAATACGCGTCTGCAGACATACGGTGA
CCGGCACCTTCGTCAATCGTCAGCGCGTTCGCGACTTCGTGACGAAATTT
CTCCATCAATTCTTCGGCGTTCTCACGGCGTTCATCTAACGTCATTGCGG
ACGCTTCGTAACGTCGATGTTTTGGGACCGGCATAATTGTCCGATTTCCA
ATGAATAGGCCGGTTTGTTTTTCGCGTTCGGCCTTCTTTTTCTCATGTTG
TCGCCTGAGATCAGTGTCAAACCTTTTGCTCAGGTTATAGAAAGCACTTT
TTCGTTCTTTGCCTGTTTTTTGTGGTACGTAGACCGTAGCCTCCTTGACG
GAAGCATTGACTTGCGCTAcagctttgtttactttgtcGTTGTATGTTTC
TGGATGGACATTATATTTGATTGGAAGCTGTGGCAAAACTTCTTTTCGCT
CACTCGCTTGATCTGTGAAACCAAAAAGTAACGCAAAATGTTTAGATTAT
TGACAGTGACCTTATTAGGAGACACTTTCAACGTTTCTCATTTAAGTTTA
GATTCCACTAAATTCTTTCTTTGAAACTTATAAATTGCGAAACTTTAGGA
Tatgttacatgttttttcttttataagcataacgtttataagcatatgca
ggctcggttttgggtacctaaacaatggctctattgtttgagaacaatat
aatgctaagcatattgcgagcctgatgtaggggcagacacttgcttataa
aaaaaaaacatgtatttgaaCAACACAATGAAAAAGTCTCCTCACCTTTA
TCATCTTTAGCAGATTTGGCAATTTCTCgtttctttttcaagatttcttg
aaatttatctAACGTCTTTTGGTCTTCCTCGTCCATCTCATGAAACAACT
TGCAACCGTTGCTCAATTCTCGATCCTTTACTGGTCCATTTTCATCTGAA
AGTCCATGTTCTCCGAGATAATCGTTAACAATCGCACGGTAATGCTTGAC
ACGTTCACCAGACAAAAGTCCTGGGTCCATGATATTTGTAATACGCTCAA
CTTCAGTCAAACTTCGACGAACGGAATCGAACTGCATGAAACGCGTCATG
GTTTTATCCAAAGCCTCCTCGCTAATGGTGGAGTCCAATTTTCTCAACTC
ATCCTTAAGCTCTGGAGTGCAGAGCTCCAAGCAATCTTTAAACACGACTC
TAGCTTTCCATTGAGCTTTAGCCTCCATTTCGACTTCTTTTAGATGTTTC
AATTCAACACTGACTTCTGATTGAACCTTGGGCATTCCGGACGACTCTGG
GTATTGCAAGGAAGATGTCTTCATTCGTTTCTCAGATGGAGTTGGTCGTA
AATTCAATGATGTGCTTGATACAACTTGCTTAGGTTCAAGGTCATTCATG
TATCTAGAGAATCTCATTTTATGATATGATGATACCAATGATGGTTCTTG
TGATATGTTTAAACATCCAAAGACAGTGGAGTTTGAGTACCTGGATAAAT
TTGACTTACTATCTGCCACGGCTCCGCTTGTTAGACAGTTCTCATAGAAA
TTAACGTTGGGTTTGATGCATTGCATTGATTTCCGTCGACCCCCGCTCAA
ATTGATGCGGTTCTCTCGCTCTGAAggaataaaaagaaacatggtcaggt
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CTTTACCAACCAACAGGGTTATGATAAAAAGACTTCAATGTTGACAATCG
ATGCCATGCCAAACCAAGATCCTCTACAATCGACCACCGGTAAGAAAAAT
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tttaggTAAAATGAGACTTAATTTTCTAGCTTTATTATCCCTGAAAATTA
CTGAAATAAAGATTATGATAGAAAAGGATgctaaaactactttaaacaGG
CCATTCAAGAAATTTCATGACATTAGATTAACCATTGTAAACCCTTAGTG
TCAAATCGCCAGAGCCCGGATGAGATGGAgcttttataagattttttaat
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CGTTTGGGAACACGCCTATTACCTACAGTATAAGAACGTTCGTCCGGATT
ACGTCAAAGCCATCTTCGATATTGTCAACTGGTCAAATGTATCTGAACGA
TACGAGAACGCTATGGGATAGTAGGAAAGACCTTATTATACTGTCTTCAT
TTTCTGTCATCTCgtggaaaatttctttaaaatccAGCGCTGACAGGCTG
AGAGCTATGATTGATTGgaactttttgtaaaaaactaaaTATGATGAAtt
taactcttttttttaatttacgaattaaaatttatttattagaaatttta
aaaagaatatatttttaacaaCTAGAAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:56372..75199+ >MSTRG.11042.13.p1 ID=MSTRG.11042.13.p1|Name=MSTRG.11042.13.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1704bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:56372..75199+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTTCAACCAGCACTTCGATTCAACGGAGGATTCCACGTCTAATCAC
ACCATCTTTCTGGACCAATCTCTCACCCAACGGTGGAGGCGAACCCGAAG
GTGATTTGTTAGCAGCAATCGTTCGTGATTTCGGATCATTTGCAAACATG
AAAGAACAATTGACAAATGCAACTGTTGCTTTTCAAGGCTCTGGTTGGGG
ATGGCTGGGTTATGATAAAAAGACTTCAATGTTGACAATCGATGCCATGC
CAAACCAAGATCCTCTACAATCGACCACCGgacgTATCCCGTTGCTTGGT
ATTGACGTTTGGGAACACGCCTATTACCTACAGTATAAGAACGTTCGTCC
GGATTACGTCAAAGCCATCTTCGATATTGTCAACTGGTCAAATGTATCTG
AACGATACGAGAACGCTATGGGATAGATGACTTCAACCAGCACTTCGATT
CAACGGAGGATTCCACGTCTAATCACACCATCTTTCTGGACCAATCTCTC
ACCCAACGGTGGAGGCGAACCCGAAGGTGATTTGTTAGCAGCAATCGTTC
GTGATTTCGGATCATTTGCAAACATGAAAGAACAATTGACAAATGCAACT
GTTGCTTTTCAAGGCTCTGGTTGGGGATGGCTGGGTTATGATAAAAAGAC
TTCAATGTTGACAATCGATGCCATGCCAAACCAAGATCCTCTACAATCGA
CCACCGgacgTATCCCGTTGCTTGGTATTGACGTTTGGGAACACGCCTAT
TACCTACAGTATAAGAACGTTCGTCCGGATTACGTCAAAGCCATCTTCGA
TATTGTCAACTGGTCAAATGTATCTGAACGATACGAGAACGCTATGGGAT
AGATGACTTCAACCAGCACTTCGATTCAACGGAGGATTCCACGTCTAATC
ACACCATCTTTCTGGACCAATCTCTCACCCAACGGTGGAGGCGAACCCGA
AGGTGATTTGTTAGCAGCAATCGTTCGTGATTTCGGATCATTTGCAAACA
TGAAAGAACAATTGACAAATGCAACTGTTGCTTTTCAAGGCTCTGGTTGG
GGATGGCTGGGTTATGATAAAAAGACTTCAATGTTGACAATCGATGCCAT
GCCAAACCAAGATCCTCTACAATCGACCACCGgacgTATCCCGTTGCTTG
GTATTGACGTTTGGGAACACGCCTATTACCTACAGTATAAGAACGTTCGT
CCGGATTACGTCAAAGCCATCTTCGATATTGTCAACTGGTCAAATGTATC
TGAACGATACGAGAACGCTATGGGATAGATGACTTCAACCAGCACTTCGA
TTCAACGGAGGATTCCACGTCTAATCACACCATCTTTCTGGACCAATCTC
TCACCCAACGGTGGAGGCGAACCCGAAGGTGATTTGTTAGCAGCAATCGT
TCGTGATTTCGGATCATTTGCAAACATGAAAGAACAATTGACAAATGCAA
CTGTTGCTTTTCAAGGCTCTGGTTGGGGATGGCTGGGTTATGATAAAAAG
ACTTCAATGTTGACAATCGATGCCATGCCAAACCAAGATCCTCTACAATC
GACCACCGgacgTATCCCGTTGCTTGGTATTGACGTTTGGGAACACGCCT
ATTACCTACAGTATAAGAACGTTCGTCCGGATTACGTCAAAGCCATCTTC
GATATTGTCAACTGGTCAAATGTATCTGAACGATACGAGAACGCTATGGG
ATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000079_pilon | genome | sc0000079_pilon:56372..75199 + |
|
