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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000079_pilon:36216..46301+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.11041.2.p1 ID=MSTRG.11041.2.p1|Name=MSTRG.11041.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10086bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:36216..46301+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATTCtctctattttctttttagatttctACTATTTAATATAACTAACAA
ACAAAATGAGTGATATTAAGAGAAATCTTGTAGTagcttttgttgatttt
ttgaaatcagaAATTCAAAGTGGCCAACTTGGAGAAGATGCAGCAGAAGG
ATTAGAAGGTATCTACATTCCTTTTGGAATTATCTTAGATTCTATAACCA
GGAAACAAGAGAGTCATAAAATGGAACTTATGGAATGTGTGGAAATGTGG
TGTGAATAAATGTAGAAAGGCCAGTCAACTAACTTTATAATGTTCCctat
aaaatataaacattaaGATATGTTAACAGAATGGCTACtcattttctttc
gaaagacCAGCGACCAGCATTATCATGCAGGGAAAGATATGTTTATTAAA
GACCTTTAATACACCTTAGATGGCCATCAAAATATCATAATATAGTTAAT
TTCGATGctgcaaaaatatttattacaaTATATCAAATATCAAAGAGTAG
AGCTTATTAATTGACTGTTCAAATATTGGACGTCAGTTGAtttagattgt
ttttttttttattaaaaaatttttagttGCTATGCAATGTTTGGAGAGCG
CTTACAGTATTGAAGGTATTACACCACCACATGGCACGAATTTGCTCAAT
ATTTATCAAGAAAATTGTTCGCCAGCTCCTCAAACCAATAAGGTACTGAA
GTTGACTATAAATTAAGATATTCAAGTGTGATTTTCTTTGCAATTGTCCc
atacttgaaatttttttttgtactcaatgttttagcttgaaattaataaa
aagaattgaagaatgTTAATATCATTGTCATTTAATTTCATTGTCATTTG
ATTTGACAATTATTTGGATTTGCACGTCAAGTATGACTGGTTGGTTCTCA
CTACTTTTTTGTGACATTTGGTaactaaaaaaatgaaagatcATCATATA
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tctttttatttaaaaaataaacaaagcatATCATGGAGCTCGATATTCTT
TGTTTAATTCTAGGGACcatctgaagaagaaaaaaggttagctgaagaag
aaaaactgaGAGGTAATCTTATTATCATAGAATAAATTTCCTGGTTTGCT
CCACAAAAGCTGTtgtaaaacactagatagatcttctattttttatataa
gatatctgtggtttcCCTGGACCGACATTTAGCAAATTCTGCTGGCTTTA
TTAGGCTGAAAATgcaagttttacttttttacagGAAATGGTTTAATGAA
AGAAGCAAATTATTCTGGGGCTGTTGATTGCTATACAAAGGCCATCAAAC
TCGACAGTAGAAATGCAATATATTACTGCAACAGGTTTGGACTGCAAATT
TCTCTTTTGAATTCCAATAAGCAATAATAAAAAGCTCCAGTTGAAGTTGG
GTCGACAAGAGAAAGAAGGAGTGCAATATTTGAAATTATAGTGCTCAAAG
TATaccaataaaaataacaaataacTAAAATTGTTTCACGTTATTTGAAT
ATAGTAATGTATACCAACACCATTCTGGTTTTTCTTAGTGCCAAAAGTGC
TCGATGATATGACAGAGATGTTTAAGTTATTAAGAATGAGGCTTTTAGAT
TTTGTAGTAAGTATATATAGTCATAGTTTCATGCTGTATAAAATGTTGTG
TGTAATTTGGATGTATGTAACTAGGGTTTGGTTTATAAGTATTTTATCTT
CAATTTTCTAGAGGAGCTGCATATACAAAATTAGAGAAACATACACAAGC
AGTAGATGATTGCAAAGAAGCGATACGAATAGACCCTTCCTATGGGAAAG
CTTATGGTAGAATGGGGTATGTCATGATGTTAATACATAATAGttcttta
atttattttagtCTCAGGTCAACTATATTTGAAAtgcttttgtctctttt
gatGACAAACAATAAAACGTGTTGCCTGCAGGTGCATTCAAAGCTTTACC
TAAAGTTTCAAGACTTAAACTCTTGTCGTAGCAAGTCCTCTATCTTATTA
AGTTATACTGCATACCTCAGATTTTAAAGGAGTCTTTGGTTTTACCCAAA
CCTCCCTGAAGACATTTTTATCTAAATGTGACAGGGGCAAAACTCCAGGG
CAAAGTTccaggggggagggggggggggtttcagggggcaAGTTGTCTCT
GTCTCTTATTTTTCACTTATTCATAACAATTCATATGTTTTATAACTTCC
CATTCATCCTTTGTCTTTTCGTCTCACTCTTGGAGTTTCATTATGTTAcc
aactttaattttttttccaggttAGCACATCTTGCAAATAAAGAGTATCA
AAAATCAATAGATAGCTATGAACATGTAAGGGTTACagttaagagccatt
ttttttaagagtcttcagggtgtgatacctcaccctcttggattttgctg
aaatttagaccaaatgatctatcacacaagaaaataagaccctgaaaatt
tcaccttgatatctcaagtagttttgaagatacagcgtctcaaagatagg
ctactaagcgaaaattgacccctaaaaatcatgaactctggtggggagca
gattttgaaagccaatgaatttttattcaagtacattagaaagctgattt
acagtggatttcaagaactttttgtagggaatcagaaaaaatcaaattga
gtttccaaaattttccccgaaaatctctagcacctcctgtagagggcttc
aaactttgcgtaatctggcacttttagctggctgctgatggtccttggga
cttttttgaagtaaacttttgacctggtgggttttggccacaaaaataac
attttcaggatttccatctttgcgtaaccataaaaaatggccgaaaaaat
tgctattttggcagacctggagcaaaattcaagatggcgtatctttttaa
ggcaacaccaattttttttgaaattttcagcaaggcttccttagtaggtc
tagtttatagcctcaaaaaaatctcaatgggcttttgaagtctcttaaag
atatgatcgattgaaaatttgcttaacttcgttgttttctcgctcttaaa
atgctaaatcaggcccacttaagggctctaacaggataattttgtcaaaa
tattggttgatcttctctagccaactaatcattggcattagaggaacaac
tgaaaaagatttcaggttatttccatcaacagatgacattttatgacagt
ttctttatttttaagtacagaatatgtaaaaaaatgacacTGACATCTGG
cgtttcctaccattccagggcctatatttccagaaaaaaactcaaccttt
cacagtttggtgaatattaatcttaaatataagcaggttacttcaactta
atgggtttaacagtactcaattcctattcaaaaactttttagactcattc
agaaatcctactttgacaataatttgcgctttaccgcaaaattttcatga
ttagctttagactgtccaatatctctataaTAGTGTACACTAACAGtctt
acttgttgattcttaaataactaagcaacattactagggtgataatttat
gagatactgcaaacaatgctgtttaaatcttctggacaagaaatattgga
tagtctaaagctaatcacaacacttggacttagaaattttgcggtaaagc
gcaaattattgtcaaagtaggatttctgaatgagtctaaaaagtttttga
ataggtcttattttcttgtgtgatagatcatttggtcaaaatttcatcaa
aatctaagagggtgaggtatcattctttattctgaagatttttaaaaaaa
atggctcttaaaattttaattctcattttacatAGTAGCGTAGAGTGATT
ATCTACTTACCCATGCTGGAGGCTGAGGTTTGATTACCACGAAGACACAA
AATGAGTTTTCCTTTGCAAATCTTTTCTTCTACTTTCAATAAACAGTGTT
ACCAGTTTCAATCACACTAAGAAATACAGGGATAAAATGCCAGCACTATG
ATGTACTCGTTTGATGTACAAGCAGTATTTGTCAAGGTCGACCATACAat
acaatttatttttttcgtgcGTCGTTAAGTACAGTTAAGTTGGCGCCAAG
CAAAAGTTTGAAGCAGAGTTTGACAATAATTATCCTAACCTAAGATAATA
AAAAGATACTGTGTTTGGAATTGGGATTCTTCTATTTATTGAATAGCTTT
CATCTCATCTCAACTTGTTAATCATATTAtcatattcttttttttctttt
aggcaCTAACTCTCGAACCAGAAAATGCATCATACAAAACTAATTTGAAT
TTAGCGAAAGATCAATTAAAAAGCCAACAGCCCTCACAACCAAGTAAATT
TTTCGTTATTGCTTTcttttagcttcttttcaacGGTGTATAAATTTCTA
CTGTAGTAAAAAAGGACGTtaagaaattgttaaaaaagtaaAGTTTCCAC
CTTAGTTTCCACCTACtttttagagttttttgagagtttttttgaGAGCA
ACCTATGATGTAGTCAATGATAAAATAATGAGGAGTACAACTAGTCAAAA
CATATGtgaaaacatataaaaatacttttgcctcggaaaaaatattttct
tttaagtaATCCGTAGGGGAAACTGTCAATGTCCAAAGATAGCTTAAATA
GACCTACCTTacagggctgtaacttttgatctaagaaatctgggatgagc
tggagtttttacaagatacttcactaattggtcatttaaagtgatagaga
tgactcgttctttagaaaaagtaataagattcttttattacatcttaacg
aaccaaccaaatcaaataagagcttgtaaaaacttcatcttGTCCCAGAA
ATCTGAGCACACTTTTGAAATCAGCAATTCTCAAATATTCTTGTGTcatg
tcataacttttgaaccaggagaaattttttttgaagatttaataTGAGGA
AtatgattatttgaaaatataagTCAGACCATAAACCCTCCTAAACTAAA
AGTTATTTAAGccaaattatttattttcagcACAAAGTAATCCACTGGCT
GGACTGGATATCAACTCATTACTATCAAATCCAGCTGTTATGAACATGGC
ACAAAATTTCATGACAAACCCAGCCATGCAGAACATGTAAGCTTTTATTT
TACAGACTTCTTATAATCAACATTTTGAAGAGCTTCCATTATTTGAAACT
CTTTAAAACCATTAAATAACATAATGTACATCTTAATTTATAAAATGATC
CtccaatatttctttttgataaatgtATGGGTATATACTGCAGCAGTTAA
AAAGCATGCAAAGTTTCATTATTCTGTGAGTGTAAATACCCTATAATACA
GGTATTTACAATGCCTGTCAAATCTTCTTAATTTTGTATTTCAACCAGGT
TTTCAAGCATGATGGGTGGTATGGGCGGTGGTATGCCGGGAATGCCAGGT
ATGCCGGGAATGCCAGGAGCTGGAAGTCTAccagaagaagatgaagaaac
tttaacaaatgaccgACAGCCCACAGAAGGACCAGCTCCACCAGAAGGAG
ATCCTGTAGCTGGAATGCCTGGTGGCTTTCCAGGAAACTTCCAAATGCCA
GCTGGATTGGACTTTGGCAATCTCATGAATGCGTATGTTATTTACTCTTG
ATTAAGATGTAATCTTGATTTGattctaaagaaaaaatcacgaaataggt
ttgcttgaaaattatttacaaatttttttaaacgtttAAAAATTGCTTGG
TACATAATTCTTACAAAGTCCAATATAGCAtcattcaatttttcgtttCT
TTAGTTCCCAACAAGTTGCTGCCCAGTTAAGAGAGCAAAATCCAGAATTA
GCTGAGTCACTTCGCGAACAGTTTCAACAAGGACAAGACCAAGATCCAAA
GAATCCCCCTCCTTCtgatgaaaataatcaaaaataaaattaaataaaat
ctttatataatgaaattattgaaattgaaaatgtctTTCAAATGGTGACA
GTTTGACAAATGAGACGAAGGAAACCTTTAAAATGGTGCATACCAGAGTT
TCTTCTTTAATGAAGACCCGATTCTCACTGCACGGTCAAGTTTACTGTTG
GTGGCTGATGGTGATGTTTTACATCAAATCCCTAGCGGTAGTTTAGTAAA
TAACCGTTCAATttcaagatcatctttcaaaaaagaaatacatAATGATA
CAATCTTTATCGGTATAGGCAGGGGATATCTAAACGATATGCCAATTTTT
AGTTTCTTAACTCTTTCAAAATGCTCTGATTGCAATATTGCTCGAATTTC
TTCCTCAGGTTTCTTAGCTGAgctgaaacttttttcaaatcaacCTAACC
CATGTGTCATAATATTAACTTCCTTATAAGTGAAATCATAGTCCGTATAT
AGAACCCTgctctggaagccttttgtttctttccattgtttcttacttga
acttgtgttgagaaaaatagtttgatcatgtgattaaatcttaaaccaat
cccaagaggagtacttggtaacgtgatcaaaaactgagcaaatcgatttt
accttttgatattaacaaaggaaaagctaacaaaaagttaaaacaataag
cttccagaccagtgttttttataaggactatggCGAAATTTAGTTTGTAG
aatgtatattttttatttcagttacATTTATATAGAATTATTTAGGCACC
TGTTTTCTAGATGcaaatatttttcatcattCTGGCTGCTTACTTTGGAT
GCCCACTTTGGCGTTTGGCAAGTCATTCTAAATAGATgcggaaaattctt
tttaatctGTTCTTTCACCGGTCGTGacttttatcatttatcatttttat
tttcctgAGAAccctttaaattattttaaggtGCGTTTGAACACGACTTA
CTTGCATAAGGAATCATCTCTTCAGAGttgagtttttcttttataatggC
GGAGTCATTTAACTTAGccaaaccttgaaaacctttaTGCTATATAAATG
AATTGAACTTAAGATTTTATTCAAAGCAGAGCTTATAAAATCTCACAATG
TCATATTAGGTTGTATGAACGTAGTAATAGGGTCTAGTAGTGACAGTTGT
TCGGTTTGAAGTTTTAATTTAAAGTTTAGCAATCTTGTAAGGAATCTTAC
GAGTCttatattcttcttttttcattacagagtaaaatagaaaaaattaa
ataaacaaacaaataaagaaTGCTACCTTGGATCCAGCCTTTTTTAAAGC
GACCACAGTCAATCATGAACATGTGCAGAGCTTGTTATTCATCAACAAAC
TTTCCAACAACATGCCCTGGTGCAAATTATTTCAAAGAAGGCGAAGAAAC
CCAGTTAAAACCCGATTCGGAATACCCGGATTGGTTGTGGACCCTGGGTG
GCCCTAAACGTGAATTCAAAGACATGTCACCCGAGGTTGATGggaaagca
tttttcaaaagagaacgaaaaatgaaaattcgagagcAGAATATGATtcg
taaacaaagaagattttaatgtgtttgaaaattctttttttgtggatgtt
gtatatttttcatatttttagatcctttttttataatttccatGTAACTA
CAAGAGCTATTACATTAAAAGTTTTGCCTCAAAGATTGCTTGCATTTTTA
CGGCTAGTATTGCATAAGTGTCTTCGATTTCAAAGAAGTTGCCTTTGGAT
AATTTTTTCATCGCTTATGAAATGTGGTTTAAATTGTTGAAGTTCTATGG
CTCTTATAATTATAGTGGTTCAACTCTCTGCACTCTGTAGGGAAACTCAA
CATCATTTTCTTCGCCAATTACTGATCATAAATTCAAACCTTTTTTATTG
GGTTATTTATTTTCAGTTAAATAAAAATGGAAGTCAAGATTGAAGATGAG
ATACAGAATGACCCATCACGTTTCAAAAAAGTCACAACCAAAAGGCTTGT
CTTTATCGAATACCCTGGGTTCATAAAGAATGTAGACAAAATGCTGGCAA
CCCTGGGTggtgaagaaaaaatttctgaaacttATCGGAGCGGTAAACAA
CGTCTTCAAATGACGTATCGACCTGAAGATTTAAATGCTCATAACGCATG
CGCCGATTTGCTACCATTTACTGGTTTATTATTAAAAGTACGGCGCCGAA
GAAAGAAAGGAACTGATGAATTCGAATACGAACAAGACATTGTAGGTATA
TCACGTGATCGTTATCGGTTTCAGACTCTCATGGACTATCAATATTTGAC
ACCTGAACCGCTATGGAATTATTTTAAATCAATTCATACTAGTGAGCTAG
GGAACACTGACTTTCCACCTTATTTTGCACCGCCTGTCTTCGCGAGACTC
GATTCCGCTGGAGTTTACCAATACAAACCGGATCTAGTTACCGGGATTAA
AACAGTTGCTAAAGCGCCGGAAATCGGTATTGATTCTATACGGAAGCGTC
GTCATACAGAGTCTATGGCTGCCCTTTATTCAAGTGCAGATGTGCCAAGT
AAACCTACAGAAAAAGCTTGTAccattattgaaaatttgaataaaggtCC
AGATGCGGATGCAATAAAACAACTCGAACTTATGTTTAACGAGAGACCGT
TATGGTCCAAGCTTGCAATATCATGTTTGGTGGATGTCACTCCTGAGCGA
TTGAAGAAAGTCTTACAGTATTTTGCTTATTACTGGTTAAGTGGACCTTG
GAGGACCCTTTGGTGTCGCATGGGCTACGACCCGAGAAAAGATCCGAAAG
CTAAACGTTATCAAATGGTTGAGTTTCGTTTGAGACGATCAAAAGAGAAT
AAGAAATGCTATAAGATGATGGTACCCGCTCGAAGATCCAATAAAGATTA
CTTAcctcgtaatttgagaaatattgTGTCCAGGGCACCGGCCTCAAAGT
CAGTCCTCGCCGCCTGTAATGAGCCAGAGAACAAAGAAGAAGGTGATAAA
GAACCGTATATTTTTCATCCAAATAAAATGATTCATTCGCGGAGTATGAT
GTTACAATTGTGTGATATTCACGATCCAGCTGTTCAGAAAATCATCGTTG
AGAATGACGGTATGGAAACCAGGTGCGATGAGAGAGAGGGATGGTTTCCA
CAAGGTACAATGGGACGGATCCGTAACGAGATGACGAAAACGGTTGACGC
CTATTTTGAGAGGCAATACGAgaaacaaaaatctgaaaatctcaGCAGTG
ATAAAACTGGTGGCGGTGAAGCAGGCGTTCATTCTGATGTACAGGGTGAA
GGAGGCGGTGTCAAAGAGGAAGAGAGGTTCCGTGAAGGAGCGCTTTACGA
CGAAGACATGTACGAACGAGACACGGAACCGCCCTCCTCCACACAGATGT
TAAGCTACACACAAATGTTACAAGGTGATGATGATTATAGTATGGATACT
GGCCAATTCTATGATGAAGAAGAATTTAATGTTTATGCTTGAGAATTGAA
AATCATAAATTCTCTTCGGATTTGATCACACCTTTTTTGCGCTAGATAAG
GGCCCTAAGTTTTATTAAGAGGATTAAGAGAATTTGGTTCGAATTTActg
tggagtctccataactcgaacacgcatggggaaacacaaatttgttcgag
ttaaggatatttcaaattatggagtaagatttataagcattgttaactaa
agggaccAAAACCtgtttcgagttaaagaggctCCACTGTATCTAATAGT
TCTATATATGATCTTTTCAACGCGATGACTTTAGACATATGATGCTTTGT
CTCTTGTTAAGTCGAACCCAAACTGTGTGTAGCTAGCATGTGACCATGAA
ATGTGACGCCCTCAGCAATCTTGTATTTTCATTAACTTTGTAAGTCACTA
TTATTGCTAGGATTTGAACCTAATTGTACACATATACAAAATACTCTATT
GTACACGGTTTGATGGTAGTCTGTTCCTTTCTTATCCTATTTTACAGTCT
GTTCCTGTAAAGAATCCTGCAtaattgtaacacgcatgcgttcTGTCTCT
TTTAACCATATgtagttattctttgtattattaaac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:36216..46301+ >MSTRG.11041.2.p1 ID=MSTRG.11041.2.p1|Name=MSTRG.11041.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:36216..46301+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGTCAAGATTGAAGATGAGATACAGAATGACCCATCACGTTTCAA
AAAAGTCACAACCAAAAGGCTTGTCTTTATCGAATACCCTGGGTTCATAA
AGAATGTAGACAAAATGCTGGCAACCCTGGGTggtgaagaaaaaatttct
gaaacttATCGGAGCGGTAAACAACGTCTTCAAATGACGTATCGACCTGA
AGATTTAAATGCTCATAACGCATGCGCCGATTTGCTACCATTTACTGGTT
TATTATTAAAAGTACGGCGCCGAAGAAAGAAAGGAACTGATGAATTCGAA
TACGAACAAGACATTGTAGGTATATCACGTGATCGTTATCGGTTTCAGAC
TCTCATGGACTATCAATATTTGACACCTGAACCGCTATGGAATTATTTTA
AATCAATTCATACTAGTGAGCTAGGGAACACTGACTTTCCACCTTATTTT
GCACCGCCTGTCTTCGCGAGACTCGATTCCGCTGGAGTTTACCAATACAA
ACCGGATCTAGTTACCGGGATTAAAACAGTTGCTAAAGCGCCGGAAATCG
GTATTGATTCTATACGGAAGCGTCGTCATACAGAGTCTATGGCTGCCCTT
TATTCAAGTGCAGATGTGCCAAGTAAACCTACAGAAAAAGCTTGTAccat
tattgaaaatttgaataaaggtCCAGATGCGGATGCAATAAAACAACTCG
AACTTATGTTTAACGAGAGACCGTTATGGTCCAAGCTTGCAATATCATGT
TTGGTGGATGTCACTCCTGAGCGATTGAAGAAAGTCTTACAGTATTTTGC
TTATTACTGGTTAAGTGGACCTTGGAGGACCCTTTGGTGTCGCATGGGCT
ACGACCCGAGAAAAGATCCGAAAGCTAAACGTTATCAAATGGTTGAGTTT
CGTTTGAGACGATCAAAAGAGAATAAGAAATGCTATAAGATGATGGTACC
CGCTCGAAGATCCAATAAAGATTACTTAcctcgtaatttgagaaatattg
TGTCCAGGGCACCGGCCTCAAAGTCAGTCCTCGCCGCCTGTAATGAGCCA
GAGAACAAAGAAGAAGGTGATAAAGAACCGTATATTTTTCATCCAAATAA
AATGATTCATTCGCGGAGTATGATGTTACAATTGTGTGATATTCACGATC
CAGCTGTTCAGAAAATCATCGTTGAGAATGACGGTATGGAAACCAGGTGC
GATGAGAGAGAGGGATGGTTTCCACAAGGTACAATGGGACGGATCCGTAA
CGAGATGACGAAAACGGTTGACGCCTATTTTGAGAGGCAATACGAgaaac
aaaaatctgaaaatctcaGCAGTGATAAAACTGGTGGCGGTGAAGCAGGC
GTTCATTCTGATGTACAGGGTGAAGGAGGCGGTGTCAAAGAGGAAGAGAG
GTTCCGTGAAGGAGCGCTTTACGACGAAGACATGTACGAACGAGACACGG
AACCGCCCTCCTCCACACAGATGTTAAGCTACACACAAATGTTACAAGGT
GATGATGATTATAGTATGGATACTGGCCAATTCTATGATGAAGAAGAATT
TAATGTTTATGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000079_pilon | genome | sc0000079_pilon:36216..46301 + |
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