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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000005_pilon:2225246..2232591- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1103.8.p1 ID=MSTRG.1103.8.p1|Name=MSTRG.1103.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7346bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2225246..2232591- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AAAAGACCGTCGTTGATGTTTGAGAAAATTCAACAGATACATACAGATCA
TATCAAACTCGCGAAGTTGTGAAAAAGAAGTCAAAAGCTTTCTCTTTTTT
TAATGAAGTTTCGTGGGAATGAAAAAGAGAAGGGATGCAATGGTCCAACA
ACATTGAACAAACAGTGAGAAGGGCGTCCTTTTTGAAAGAAGAAACGCCA
CGGGTGGTTATTGCTTTTCAATCTTTTTTAATGAAGAAGTTGAAGGAAAA
AGAATCAATCAGTTTATAAGTTTAGAAAAACTCACTTCATTTTCTATATA
TTGATTGCTTTGGAATGACATTGTTGAAGTTGAAAGAGAGAATTCTGTTG
GAATTGACCTTACGAAATTTTGGAATTTGTTGATCAGTCAAAAACTTATT
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AGCGTGAATAGCAGTATGATCGGAAGTTTGGATCAAATGTTTAAGGTGGA
GAAATTCGAACAAATTTACACAAATAACCGCAAAGAAGTTTTCCAAATGA
AGGAAGTCAAAGTTGGTGAATTATCGCAAAAATATGGGTCAGACTTACGC
GCGTTTTTACTGTCCCACATTAATGAACTCATGGAAATCAAGAGAACTTC
ACAATTTCTTGAACAGAAGTACACTTATGATCCCCTTTTGAAACCTTTTT
ATCAGTTTAACGATAAAGACCCGAATCCTGACCGCTTGGAGATCAGTTAT
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AAGGTTTAGATGAAGTATTCAGAAGAAATTACGAACGTAATCCAACGTTA
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ATCCAGAAATTATATTTCAAATGGTTGAGCATTTACAATTTTTTCTTTCC
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GAAGGTGGATTCCATATCAACATGGAACACAAATTTCTTTTGTCCTTTGC
GCAATTCATTTCCTTCTTACTAAGTTCTACAGTGAGAGTCGCACATTGAC
TGCAAAGTCAATAACCAAGATATGACTGCTGGCAATGATGATATACCAAA
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ATAAACTTAAAGACAGTTAGTGTGAATTTATATTCTGCGAACTCGTCATT
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TAGACTGTTTCAGCACATATTGTGACATAATAGACAAAATATTCTAGAAG
GTCTTTCTCATGAATTATATACAAACTACACAGATTTTATTCGTTGAAAA
AGATCGAAGAAGGTAGAAAAGGAATATTGATTTTTAAGATAGGACACCCT
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AAATAATTAGACACTTTAAATACATGTTACAGTGGAGTCTCAATAACTCG
AACACGTTCGGAGAACTAAAACTTGTTCGAGTTATACCGTTATACAATAT
TCGAGGTTGTTAGCAGAAGAGGCAGTAATATTTGTTCATGTAATGGAAAC
ATCCGAGCTACGAAGATTCTACTGTATGTCGAAACTTCGCGAAACTTTCA
TTGCAACAATTCTACCACTGTCCTATGTTTTAGCACTTGTCTTTTTCCAC
GGTTAAAGAACAAAGGCACAGTATATAAAGAGAAATTTGATTTTTTATTA
CAGAACGATGTTTAGGAGTCAGGGTTTTCTGTTATAAAAATCGTTTATCA
CAATCAGTTTATTTATCTATTTATTTGAAAATATTAGAACGACATAAAAT
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CAGTACAAATGAAATATTTTATTTTCCCCTTCAAAATTTTCCTCCATGTT
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GAAATTGCAATGGTCTTTTTCTTTTTCCCATAAATTAGATTTGTTTTTTT
TGCGAGAAAGGTTTACTTGGTTGAAGAATGTTGTTTCTTACATTTTTGTA
AGGATGAGAACATTCCTTTTTAAGACTTAGTTTTTGCAATGAAGTATATA
ATTTTCAAAATTCTTTATAAAATATGAGGCGATATTTGTTTAGCATGAAA
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AACAAAAAATATTTATTAAAATAAAACAGAAAGATTTGTATGAAAAGAGG
AAAATGAAAATGGAAAAGTCTAGATTGCCAACAAAACAACTTTGATTTAG
TTGGTGGTGAACGTTTGGAAAAGATCGAATCCACCATCATGGAAAAACGT
TTGATAATCTTTCTGTATTGGATTTTGACAAGATTTACAGTGAATATGGA
ATGCAGTACTGAAGACCTTGTAAAGAACACCTTTCAAATCGTAAAACACC
ACGCATACCAAAATACTATACAAAATACATTAACGAAAGGGTTGGTGATA
GAACAGTCCATTGATTTGGAAAATATCAGTGTATCATTTGAAAGTGATTT
ACGCGCATTACTGATGCCACGAACCAATCTACTAAACAACATCAAATATA
AAGCTAGAGAGCTGATAGACAATTACAAATGTGACCCGGATATAGAAAAT
TTCAACTACTTCAACCGAAGATATCTACCTCCGAACCCTGTACAAATCCA
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AATGTTCGACTGAGATCTTTCAAGGGTCCAAAGTTGTTTTGAACATCGCC
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GCCAACTCTTTTGTGGCAGTTCTTTTGTAGCACAATAGGCACACATCGGG
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TATTAGGAATGGATATTTGCAAACGAGTCTCTCTGTTTTTTTTTGTATCT
GCTTCCTTACTCTTTGTCCAACATGTTTCTATTTTTAATGGCACGAATAA
ATCGATCCATTAAGCTTCACTGTGGAAATTAAAGCAATGACATTTCTTCT
TCATATCATCCAGGGGATTAGGTCTAATTATTTGAAGAGGGAATTATTGC
CAATATCGGGGATAAATTCATCAAAATTTACATCCACAAGTTTTCAGAGT
ACTGCACTCATCTTTTCATTGTCATGTTAATCTAATATACACATTAGTGC
CAATTTTATCCAATAATATCGATCGAAACAACAATAAAGTGAAAACGTGT
AAAGAAAGAAACCAAAGAGTTTGAAAACAATCATCTATTAATTAAACAGA
TAAATTGGGATTTGTTGCATTGGATCTTGAGGTCTGAAAACAAAACAACA
TTTTCATTTCTAAACATAAGGCGAAATACCATGAGTAAGGATCAAATGAA
TGTTATGTTACGAAGCACATTTAGAGAGAATAATCTAAAGAAAGTCTGTT
CACTAATACACAAATGAACCGTATCGTATTTTCTTTATTGATAGCTCGAA
CCGGAAGATCGATTTATACGACTGCAGACGTCGATTATGGTACAACCAAG
CCATCAATTCTCCCAAAGATGTGGTCATTCTAATGGACATGTCCGGATCA
ATGACTGGTGCTCATTTCAAAATCTCAAAACTAATCGTCCAATCACTGCT
CGATACTTTACAACAAGATGACTTTTTCAACGTTCTCTACTTCAACCAAG
CAACAGGCTTTCTTATCGATTGTTTAAATGACACACTAGCCCAAGCGACC
TCTTACAATAAGAATCAATTCAAACAAGCAGTAACCAGGCTACAATCACC
GAAATCAGTTGCCAATTTCCCTACAGCACTGAAGAAAGCTTTTCGCTTGA
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ATGTAATTGAACAAATTTTTAAAAGAAAGCAATCAAGGTATCCAAATGAC
TTTAACAATGATGAAACGATGAAAACCACAGCATGCCATAAGATTGCTAT
TACTTTTGCTATAATTCCAGATAATTCACGATATTCAAGTCGTAAAGTTT
TTTATAGAAACATCACGTTTTGCCAGTAATGGCAAATTTAAGCTAGAGAG
AAATTTGCCACTACTGACAAAAATAGTGGTGTTTGCCGTGGAAAACATAA
AACGAAATAAAAATCAGAGATGCCAAAATATTTAAAACAGAAAGATTTCA
AGTATTCTGTAATCCAGCAAGTGAAATTCTCTGTCCGCCACTCCTCATCT
TGTTTTAGTGTAATTCTAATGCCTAATTTTAATAGATATATTTTGCCTCT
ATTTTTTACCGCAGGTTTCGACACACCGAGCCACGTCTTCATCGAGCTGC
AACAAAGTCATCATGCTCATCTCAGACGGTATTGATTTTGATGAACACAC
ACATGAAATATTGGACGATGAGAATGCAGAGAAAGAAGTCGTTATCTTCT
CTTACATCGTTGGTCAGTCTACCGATGAAGGACGGGCGGAGATGAAAGAT
ATTGCATGTCAGAGTGGCGGTGAACATTATGATTTCCCAACCGTCGGTAA
GCTCGTTTCCTTTCATCTTGCGTATTGCAAGGAGTATATACTATCGTACC
AGAATTGAGCTTGATTCCTTTGCAAACGTGGCCCTTTTGATAATTTTGAA
TCTCAAATGCCCAATAAAGGCCTCAAACCGTTTATAAATTTATCAAAAAT
AAAGTTACAAAACCAAAAGTTTCTTATTTTGCATTACGTAGTCCGATTTT
AGTACAGATTTTTGCCTTATATACAGGAGTACAGTTTGCTAACTTCACAC
AATATATGTTGCTTCCTGGGTTTGTTTTTAACTAAAAATATCTCGTTAAT
TTAGTAAAAGAAAATGATTATGATTATGATCAAGTTACTCACTACGCATC
TCTTTTTTAACAGGCAATGTCTTAGACGGAGTGCTAAAGTACCAAAAACG
TTTAAGTCAACCGCTGGGCCAGAGTTTGGATGATCACGTGATTTTCACAC
CTTTATATCTCGATGGATCGGGGTTAGGGATGATGACCACTATATCCACA
GCTGTATTCAGCAACAAAAATGGTAGCGATACCCGAGAGCTGATTGGTGT
AGCTGGAATGGATATTGTTGTCTCGTTGCTACAACAACAATACCCTGTCC
AAAAGATGGGCGTTTTCGGACATGCTTTTGCGATCAACAATAATGGTTTG
TTTTTAATGCACCCCAAGTTTAAAGACCAGTCAGGTTATTTGCCTGACCC
AGCCACCGTTTATTTGGACGAAGTTGAATTTACTACCAATCCATCAAAAG
GGATCGAGTTAAAACGAGCTATGATCAACAACGAGACGGGATGTATGAGT
GCCGAAGCTGATTGGCTGTTTCCCAAGCATTCCAGTCAACGGGTGGTCCG
TTTAAACAATACCTATTGTTATCGACCAATGGAAAAGACTCCTTTCTTCG
CAGGTGTTTCTATGCCACAACAAAACGCTATACAGATGGTGGCTGATAAA
ACGAAAGCTCATTTATTCCGTCGATCAGGTATCAATGCGTTACATTCTGA
TGATCCGAATGTCATCATTGAAGTTGCTGAATGGTCTTTTTGTGACATTC
GAACGGAAGGTGAAAAGAAACAACCCGCTTCCATCAAGTATTATCCAACA
GCTGAAGACTTGTATCAGTACTTGAAAAACAATGATGAAGATCTAGACGA
AAAATGTGACGAGGAGATGTTGTTAACTTTACTTCTATCAGCATCAGTGG
TCGCAAACTTCACCAGAGATCACTGGTCTGTTGAAGAGCTCACTCATAAC
AACATCACTGACGCTTATATTATCACCTCCTCCGGTTTCACCTACATCTT
ATCGACAGATGTCAACAATACTAAACGATTGGATCGAGACATCTTTGAAG
AGATTCGATTCACACATCCCGCATCATTCTACCAAAAAGAATTTCATAAT
CAGCTGACTTTCAGCGTCGACATCAAATCAGGAAAACCACAGAATCTCCA
TGATAAAGAGGTTTTCAATGACGAGGAGATTGGGAATATAGCGATTGGTA
AATCAGTTTACACGGGAGATGAAAATACGATGCTTGGAGTCGTCGGAATG
TCAGTCCGAGTGGATTTTATGAATCGAATCATGCACGAGGCTGCACAAAA
TATCACTGATTCTGATTGCAGTAAAAATTCGTCACAAAAATGTTACTTAA
TTGATGAAAATGGGTATATTGTTGCTACAAATAGACCAGTTAATCGGGTC
GGTTATTTTCTTGGTTGGTATGAAGGCCAACTCATCGAGGACATGGAAAA
AAGAGAAATTTTGGAAGTGCGAGAATACAACGATACACAAGCAGAATGTC
CACAACAATCGGATACTTCATCCTCCTCTCCAGCTAATATCTTGAAAACA
TTTTACTACACTGTCTTTCAGTTAGTATACAACGTGTTGGCACATACATT
AGCAATCACGTGGTGGATGTTGACTAGCCTACTGACCGTCAGTATGAACG
CTATTGGGGTTTCAGCGGCTAGTAGAAATGTCAGTTGTACCAAAACTATC
GAAATCTATTTACTTAAAAACAGAAGTATTGATACAGAGGGAGCTTTTAA
TTGCTCCTCTAATTGCAGTCAAAAATATATCATCCAAAGTATTCCAGATA
CTAACTTAGCTCAGGTCATAATAAATAACAATTGCCGTGGGGCTGACGAA
TGTCCATTATTTTCAAAAAACAATGAGCCGAAACGGACAAGGGATCTCAC
TGTATGTGAGCAGCCTCTTCGCTATCGAAGGGCTTTGTCAGTTTGTTATA
AATTGACTGGAGAAGACAAACGAGCGTGTTTTGATGTTAATGAGAACAAA
GAATCGAACATTATCATTTATCTTATCGTATTCATTTCCATCTGTTTTGC
AATCATTATAGCGATTAGTTTTAATATGTATTTTCGTAAATATTTTCATG
GCAGGTGTATGTAAGATATCTAAAGGATAATTCTTAATTCTTGTGCCAAT
TCTTAAAAAAATGGAAAGGGAATGCTGCTTTCCTTAAGCATTGGAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:2225246..2232591- >MSTRG.1103.8.p1 ID=MSTRG.1103.8.p1|Name=MSTRG.1103.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4470bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:2225246..2232591- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GCAATGTCTTAGACGGAGTGCTAAAGTACCAAAAACGTTTAAGTCAACCG CTGGGCCAGAGTTTGGATGATCACGTGATTTTCACACCTTTATATCTCGA TGGATCGGGGTTAGGGATGATGACCACTATATCCACAGCTGTATTCAGCA ACAAAAATGGTAGCGATACCCGAGAGCTGATTGGTGTAGCTGGAATGGAT ATTGTTGTCTCGTTGCTACAACAACAATACCCTGTCCAAAAGATGGGCGT TTTCGGACATGCTTTTGCGATCAACAATAATGGTTTGTTTTTAATGCACC CCAAGTTTAAAGACCAGTCAGGTTATTTGCCTGACCCAGCCACCGTTTAT TTGGACGAAGTTGAATTTACTACCAATCCATCAAAAGGGATCGAGTTAAA ACGAGCTATGATCAACAACGAGACGGGATGTATGAGTGCCGAAGCTGATT GGCTGTTTCCCAAGCATTCCAGTCAACGGGTGGTCCGTTTAAACAATACC TATTGTTATCGACCAATGGAAAAGACTCCTTTCTTCGCAGGTGTTTCTAT GCCACAACAAAACGCTATACAGATGGTGGCTGATAAAACGAAAGCTCATT TATTCCGTCGATCAGGTATCAATGCGTTACATTCTGATGATCCGAATGTC ATCATTGAAGTTGCTGAATGGTCTTTTTGTGACATTCGAACGGAAGGTGA AAAGAAACAACCCGCTTCCATCAAGTATTATCCAACAGCTGAAGACTTGT ATCAGTACTTGAAAAACAATGATGAAGATCTAGACGAAAAATGTGACGAG GAGATGTTGTTAACTTTACTTCTATCAGCATCAGTGGTCGCAAACTTCAC CAGAGATCACTGGTCTGTTGAAGAGCTCACTCATAACAACATCACTGACG CTTATATTATCACCTCCTCCGGTTTCACCTACATCTTATCGACAGATGTC AACAATACTAAACGATTGGATCGAGACATCTTTGAAGAGATTCGATTCAC ACATCCCGCATCATTCTACCAAAAAGAATTTCATAATCAGCTGACTTTCA GCGTCGACATCAAATCAGGAAAACCACAGAATCTCCATGATAAAGAGGTT TTCAATGACGAGGAGATTGGGAATATAGCGATTGGTAAATCAGTTTACAC GGGAGATGAAAATACGATGCTTGGAGTCGTCGGAATGTCAGTCCGAGTGG ATTTTATGAATCGAATCATGCACGAGGCTGCACAAAATATCACTGATTCT GATTGCAGTAAAAATTCGTCACAAAAATGTTACTTAATTGATGAAAATGG GTATATTGTTGCTACAAATAGACCAGTTAATCGGGTCGGTTATTTTCTTG GTTGGTATGAAGGCCAACTCATCGAGGACATGGAAAAAAGAGAAATTTTG GAAGTGCGAGAATACAACGATACACAAGCAGAATGTCCACAACAATCGGA TACTTCATCCTCCTCTCCAGCTAATATCTTGAAAACATTTTACTACACTG TCTTTCAGTTAGTATACAACGTGTTGGCACATACATTAGCAATCACGTGG TGGATGTTGACTAGCCTACTGACCGTCAGTATGAACGCTATTGGGGTTTC AGCGGCTAGTAGAAATGTCAGTTGTACCAAAACTATCGAAATCTATTTAC TTAAAAACAGAAGTATTGATACAGAGGGAGCTTTTAATTGCTCCTCTAAT TGCAGTCAAAAATATATCATCCAAAGTATTCCAGATACTAACTTAGCTCA GGTCATAATAAATAACAATTGCCGTGGGGCTGACGAATGTCCATTATTTT CAAAAAACAATGAGCCGAAACGGACAAGGGATCTCACTGTATGTGAGCAG CCTCTTCGCTATCGAAGGGCTTTGTCAGTTTGTTATAAATTGACTGGAGA AGACAAACGAGCGTGTTTTGATGTTAATGAGAACAAAGAATCGAACATTA TCATTTATCTTATCGTATTCATTTCCATCTGTTTTGCAATCATTATAGCG ATTAGTTTTAATATGTATTTTCGTAAATATTTTCATGGCAGGTGTATGTA AATGCTCATCTCAGACGGTATTGATTTTGATGAACACACACATGAAATAT TGGACGATGAGAATGCAGAGAAAGAAGTCGTTATCTTCTCTTACATCGTT GGTCAGTCTACCGATGAAGGACGGGCGGAGATGAAAGATATTGCATGTCA GAGTGGCGGTGAACATTATGATTTCCCAACCGTCGGCAATGTCTTAGACG GAGTGCTAAAGTACCAAAAACGTTTAAGTCAACCGCTGGGCCAGAGTTTG GATGATCACGTGATTTTCACACCTTTATATCTCGATGGATCGGGGTTAGG GATGATGACCACTATATCCACAGCTGTATTCAGCAACAAAAATGGTAGCG ATACCCGAGAGCTGATTGGTGTAGCTGGAATGGATATTGTTGTCTCGTTG CTACAACAACAATACCCTGTCCAAAAGATGGGCGTTTTCGGACATGCTTT TGCGATCAACAATAATGGTTTGTTTTTAATGCACCCCAAGTTTAAAGACC AGTCAGGTTATTTGCCTGACCCAGCCACCGTTTATTTGGACGAAGTTGAA TTTACTACCAATCCATCAAAAGGGATCGAGTTAAAACGAGCTATGATCAA CAACGAGACGGGATGTATGAGTGCCGAAGCTGATTGGCTGTTTCCCAAGC ATTCCAGTCAACGGGTGGTCCGTTTAAACAATACCTATTGTTATCGACCA ATGGAAAAGACTCCTTTCTTCGCAGGTGTTTCTATGCCACAACAAAACGC TATACAGATGGTGGCTGATAAAACGAAAGCTCATTTATTCCGTCGATCAG GTATCAATGCGTTACATTCTGATGATCCGAATGTCATCATTGAAGTTGCT GAATGGTCTTTTTGTGACATTCGAACGGAAGGTGAAAAGAAACAACCCGC TTCCATCAAGTATTATCCAACAGCTGAAGACTTGTATCAGTACTTGAAAA ACAATGATGAAGATCTAGACGAAAAATGTGACGAGGAGATGTTGTTAACT TTACTTCTATCAGCATCAGTGGTCGCAAACTTCACCAGAGATCACTGGTC TGTTGAAGAGCTCACTCATAACAACATCACTGACGCTTATATTATCACCT CCTCCGGTTTCACCTACATCTTATCGACAGATGTCAACAATACTAAACGA TTGGATCGAGACATCTTTGAAGAGATTCGATTCACACATCCCGCATCATT CTACCAAAAAGAATTTCATAATCAGCTGACTTTCAGCGTCGACATCAAAT CAGGAAAACCACAGAATCTCCATGATAAAGAGGTTTTCAATGACGAGGAG ATTGGGAATATAGCGATTGGTAAATCAGTTTACACGGGAGATGAAAATAC GATGCTTGGAGTCGTCGGAATGTCAGTCCGAGTGGATTTTATGAATCGAA TCATGCACGAGGCTGCACAAAATATCACTGATTCTGATTGCAGTAAAAAT TCGTCACAAAAATGTTACTTAATTGATGAAAATGGGTATATTGTTGCTAC AAATAGACCAGTTAATCGGGTCGGTTATTTTCTTGGTTGGTATGAAGGCC AACTCATCGAGGACATGGAAAAAAGAGAAATTTTGGAAGTGCGAGAATAC AACGATACACAAGCAGAATGTCCACAACAATCGGATACTTCATCCTCCTC TCCAGCTAATATCTTGAAAACATTTTACTACACTGTCTTTCAGTTAGTAT ACAACGTGTTGGCACATACATTAGCAATCACGTGGTGGATGTTGACTAGC CTACTGACCGTCAGTATGAACGCTATTGGGGTTTCAGCGGCTAGTAGAAA TGTCAGTTGTACCAAAACTATCGAAATCTATTTACTTAAAAACAGAAGTA TTGATACAGAGGGAGCTTTTAATTGCTCCTCTAATTGCAGTCAAAAATAT ATCATCCAAAGTATTCCAGATACTAACTTAGCTCAGGTCATAATAAATAA CAATTGCCGTGGGGCTGACGAATGTCCATTATTTTCAAAAAACAATGAGC CGAAACGGACAAGGGATCTCACTGTATGTGAGCAGCCTCTTCGCTATCGA AGGGCTTTGTCAGTTTGTTATAAATTGACTGGAGAAGACAAACGAGCGTG TTTTGATGTTAATGAGAACAAAGAATCGAACATTATCATTTATCTTATCG TATTCATTTCCATCTGTTTTGCAATCATTATAGCGATTAGTTTTAATATG TATTTTCGTAAATATTTTCATGGCAGGTGTATGTAAATGCTCATCTCAGA CGGTATTGATTTTGATGAACACACACATGAAATATTGGACGATGAGAATG CAGAGAAAGAAGTCGTTATCTTCTCTTACATCGTTGGTCAGTCTACCGAT GAAGGACGGGCGGAGATGAAAGATATTGCATGTCAGAGTGGCGGTGAACA TTATGATTTCCCAACCGTCG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000005_pilon | genome | sc0000005_pilon:2225246..2232591 - |
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