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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000077_pilon:995957..998499- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10910.1.p1 ID=MSTRG.10910.1.p1|Name=MSTRG.10910.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2543bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:995957..998499- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATAAAAAGCTGAAGTAATCGGGATACGAGAAAAAAACAAAACATCATCA
AATATATCTGACTTTTTCAAGATGGCGTTTGTATCTGTGGTTTCTTGTTT
GGACTCTATCTTTGAAAATTCAAACATTAAACTCAAAGCAAAACAAGTCG
AGGCTATAAGCAACATTTATTATGGAAGAGACACATTGTGTGTTTTCCCA
ACAGCATTTGGGAAGAGTTTAATCTATCAGTGCCTCCCAAAATTATTCAA
ATCAATGGACGATTCACTTTATGATAATCCAACAGTTATTGTGCTTTCAC
CGCTTGTTGCACTGATCACCAGCCAAGTTTACGAAGCTGGTAAATTGGAT
TACCTTGGACTGAATGCTTGTGCTCTTGATTTAAAAGAACACTCAAGAAT
AGTTGATGGAAAATTCAACCTGATTTTTGGCACACCAGAGTCCTGGTTGA
ACAACTCAAAATGGAGAGATTTTGTTTCGTCAAATTTCATGGTGAACAAT
TTGGCATGTATTGTGGTTGATGAAGTTCATAAAGTCAGCTGGTAATTTAA
TTTTTTAATCAAAATAATTCTTCCTTTATGATACTTTTGATATTTCAGAA
GACTTGTGGCTGCGTATATTGTTTTTTTTAAAGACTTAAGTTTAATTTAA
AGAGAGGAATGGAGAGATGTTTACTGTGCTGTTTTATCATCATCACATAG
TTTTGTTTTCATATGTAAAATTGTGAGCTAAGTGTTAAGTAAACATTTTT
TTATTATACGTACTGTTAAAAAATATATTTCGGCACAATTCACTTGTTCA
TTAAATTTTAAGAAGTTTTTTTTCTCGCACACATCCATATAATTTCTGTT
TAAGTAACAAAGATTTAATTTAAGTTTTTTTTGTTTTGTTCAGGGGTGAA
TCCACAAAAGGTTCAAAGGCCTTTCGAGAGACTTTCAGTCGGATCGGTGA
ATTACGTTCAACTTGCAGACAAAATGTCCCTGTTCTTGCTCTGAGTGCTA
CAATCGATTTGGACTTGACTCAGTTGGTTATTGGAAGTTGCAATTTGTCA
AAGTCGTTGAAAATTATATCAACATGCAGTGACCGTCCAAACATTTTCCT
TGAAGTTATCAAAGTTCCGAAACAAGAGAATGTTGAATGCCTCCATTGGA
TTCTCTCAATTTTAGCTAAAGATGTTCACGAATCACCCAAATTTGTTATC
TTCTGTAAATTTGTTGATACAGCTGGTATAGTATATCAACAACTGAGAAG
ATTTAAAAAAAAAGCAAGACCTGACCTTAATCCAAAAGACCTTATTGGCA
TATTCCACGCAGAAACCAGGAAGAAAAAGAAAAATATCGTCTTGGAATCT
TTAACAGAAGTGGTCTCGTTAAAAGTTATTGTTGCAACAAGTAGCTTGGG
GTGTGGGGTCAACATGAAAGATGTTCGGTACATTATTCATTATGGTCCTG
CATTCCATTTGGTTGATTACTGCCAACAGGTTGGTCGAGCAGGTAGAGAT
GGTAGCAGTAAGTGCCATGCTATTTTATACAGTTTTCCCCACCACGCCCA
TGTCAGCCGGTCAATGAAGAAATTTGTCACGCAAAAAACAAGTGCCTCAG
ATCAACCCTATATACACCCTTTAATGAAAACTGCGAAAAAGTGGAACCAT
TGAACCCTGGCCATTCTTGTTGTTCGTTTTGTGCTTTAAGTTGTGACTGT
GATGGTGGTTGTGACTATACCTTGTTACCAAAAGTTGAAGAAATGGAAAT
TTGCAGTGAGAAAAAGGTTATCAGAAATGTCTCAGATGAAAGTAAAAATT
TGGTCCGTGAAATGTTAGTTGAATCGCATGAGCAACAGAGTTCACTACTT
CCTCTACTCACTCCTCCTGAACTGGTCACTGGTTTAAGTGAGACTGTGAT
TGAAAGTGTGGTGCAAAATCTACCTTACATTGACTCAGTTTCTTTCATCA
TTGGTGAATTAAAAGTTTTGAATCAACGTTGTGCCAAAGAAATTGCAATT
ATTGTAAAGGAAGCTTTTATCGATGAAGATGATGAGGAAACTGTTTTCCT
TGACTTGAATGATGATTGTTATGCTGAAGAAAATGATAATGAAACATCTG
CTATTGGTCAGAGTTTACCAACAACTGACTATGAATGTCTGTCTGAATAT
TCACTTAGTTCAGACAATTATAGTAGCTTAGAGGACAGTGACTATTAGCA
TTCATTTTATGATATTTTTATATTTTTTAATATTTTCTTACATTTTCACA
CTATTTATTATGTATATTTTTTAAATTATTTCACTTATTTACTTTGTTTA
CTTTAAGTAGATTAATTTTTGGATGGATTAAGTTTTGCAAACTCTGGCCA
TTTTTGTGAAGTTAAATCTTGTGAAATATTTAATTTCAGGATTTTTTGCA
AAATTAAGTTCACTCAAAAATTAATTGACTTTTTAAAAGTCTCAAAAAGC
TGGAAGTGCAAGTACTTTCAAAGATTTATAGAAATTTATTCATTTTGATT
TTTTTTAAAGATAGTCCACGTCCATAATGAAATTAAATATTAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000077_pilon:995957..998499- >MSTRG.10910.1.p1 ID=MSTRG.10910.1.p1|Name=MSTRG.10910.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2460bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:995957..998499- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGGTGAATCCACAAAAGGTTCAAAGGCCTTTCGAGAGACTTTCAGTCGGA
TCGGTGAATTACGTTCAACTTGCAGACAAAATGTCCCTGTTCTTGCTCTG
AGTGCTACAATCGATTTGGACTTGACTCAGTTGGTTATTGGAAGTTGCAA
TTTGTCAAAGTCGTTGAAAATTATATCAACATGCAGTGACCGTCCAAACA
TTTTCCTTGAAGTTATCAAAGTTCCGAAACAAGAGAATGTTGAATGCCTC
CATTGGATTCTCTCAATTTTAGCTAAAGATGTTCACGAATCACCCAAATT
TGTTATCTTCTGTAAATTTGTTGATACAGCTGGTATAGTATATCAACAAC
TGAGAAGATTTAAAAAAAAAGCAAGACCTGACCTTAATCCAAAAGACCTT
ATTGGCATATTCCACGCAGAAACCAGGAAGAAAAAGAAAAATATCGTCTT
GGAATCTTTAACAGAAGTGGTCTCGTTAAAAGTTATTGTTGCAACAAGTA
GCTTGGGGTGTGGGGTCAACATGAAAGATGTTCGGTACATTATTCATTAT
GGTCCTGCATTCCATTTGGTTGATTACTGCCAACAGGTTGGTCGAGCAGG
TAGAGATGGTAGCAGTAAGTGCCATGCTATTTTATACAGTTTTCCCCACC
ACGCCCATGTCAGCCGGTCAATGAAGAAATTTGTCACGCAAAAAACAAGT
GCCTCAGATCAACCCTATATACACCCTTTAATGAAAACTGCGAAAAAGTG
GAACCATTGAATGGCGTTTGTATCTGTGGTTTCTTGTTTGGACTCTATCT
TTGAAAATTCAAACATTAAACTCAAAGCAAAACAAGTCGAGGCTATAAGC
AACATTTATTATGGAAGAGACACATTGTGTGTTTTCCCAACAGCATTTGG
GAAGAGTTTAATCTATCAGTGCCTCCCAAAATTATTCAAATCAATGGACG
ATTCACTTTATGATAATCCAACAGTTATTGTGCTTTCACCGCTTGTTGCA
CTGATCACCAGCCAAGTTTACGAAGCTGGTAAATTGGATTACCTTGGACT
GAATGCTTGTGCTCTTGATTTAAAAGAACACTCAAGAATAGTTGATGGAA
AATTCAACCTGATTTTTGGCACACCAGAGTCCTGGTTGAACAACTCAAAA
TGGAGAGATTTTGTTTCGTCAAATTTCATGGTGAACAATTTGGCATGTAT
TGTGGTTGATGAAGTTCATAAAGTCAGCTGGGGTGAATCCACAAAAGGTT
CAAAGGCCTTTCGAGAGACTTTCAGTCGGATCGGTGAATTACGTTCAACT
TGCAGACAAAATGTCCCTGTTCTTGCTCTGAGTGCTACAATCGATTTGGA
CTTGACTCAGTTGGTTATTGGAAGTTGCAATTTGTCAAAGTCGTTGAAAA
TTATATCAACATGCAGTGACCGTCCAAACATTTTCCTTGAAGTTATCAAA
GTTCCGAAACAAGAGAATGTTGAATGCCTCCATTGGATTCTCTCAATTTT
AGCTAAAGATGTTCACGAATCACCCAAATTTGTTATCTTCTGTAAATTTG
TTGATACAGCTGGTATAGTATATCAACAACTGAGAAGATTTAAAAAAAAA
GCAAGACCTGACCTTAATCCAAAAGACCTTATTGGCATATTCCACGCAGA
AACCAGGAAGAAAAAGAAAAATATCGTCTTGGAATCTTTAACAGAAGTGG
TCTCGTTAAAAGTTATTGTTGCAACAAGTAGCTTGGGGTGTGGGGTCAAC
ATGAAAGATGTTCGGTACATTATTCATTATGGTCCTGCATTCCATTTGGT
TGATTACTGCCAACAGGTTGGTCGAGCAGGTAGAGATGGTAGCAGTAAGT
GCCATGCTATTTTATACAGTTTTCCCCACCACGCCCATGTCAGCCGGTCA
ATGAAGAAATTTGTCACGCAAAAAACAAGTGCCTCAGATCAACCCTATAT
ACACCCTTTAATGAAAACTGCGAAAAAGTGGAACCATTGAATGGCGTTTG
TATCTGTGGTTTCTTGTTTGGACTCTATCTTTGAAAATTCAAACATTAAA
CTCAAAGCAAAACAAGTCGAGGCTATAAGCAACATTTATTATGGAAGAGA
CACATTGTGTGTTTTCCCAACAGCATTTGGGAAGAGTTTAATCTATCAGT
GCCTCCCAAAATTATTCAAATCAATGGACGATTCACTTTATGATAATCCA
ACAGTTATTGTGCTTTCACCGCTTGTTGCACTGATCACCAGCCAAGTTTA
CGAAGCTGGTAAATTGGATTACCTTGGACTGAATGCTTGTGCTCTTGATT
TAAAAGAACACTCAAGAATAGTTGATGGAAAATTCAACCTGATTTTTGGC
ACACCAGAGTCCTGGTTGAACAACTCAAAATGGAGAGATTTTGTTTCGTC
AAATTTCATGGTGAACAATTTGGCATGTATTGTGGTTGATGAAGTTCATA
AAGTCAGCTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000077_pilon | genome | sc0000077_pilon:995957..998499 - |
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