|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000076_pilon:1368856..1370958- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10829.5.p1 ID=MSTRG.10829.5.p1|Name=MSTRG.10829.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2103bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:1368856..1370958- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACATAAATTTATCTCCCTTCCCCTCTTATAAAGCAAATGTTTTTTTA
CAGGGCACTCGTCAACAGTAGTTGTACCATCCAGCTCCACTACTCAACCT
GTATCTACATCTCAGGCAGCTGTCCAATCATCCACTCCCGTTGTCCAATC
CTCGAGTCAACCTCCCGTTGTTGAGTCCTCAAGCCAAGCTCCTGTGGTCC
AATCCTCGAGCCAAGCTCCTGTTGTCCAATCCTCAAGCCAAGCTCCAGTT
GTCCAATCCTCGAGCCAAGCTCCTGTTATCCAATCCTCAAGCCAAGCTCC
AGCTGTCCAATCCTCGAGTCAAGCTCCTGTGGTTGAGTCCTCGAGTCAAG
CTGCACCACCGTTGTCTTCAACAGTTGAGCAACATGCCACTTCGTCAGCA
ATCGCTCCCTCACCGTCCTCTTCTGTATCAGCACCTATGAGTAGCGCTAT
CCCTTCAAGTGGTAAGTGTATTCTTACATGTGTTGAAAAATTATTGACCG
ATTTGTGGTAACAAAAAGGCGGCGATAATATTTATAAGAAAAATAGTCTC
TGCTAGATATCCTTCCAATAGGTATTGTAGCTTTATTATCACATTCATCT
TTAAGGAGACGGCCAATGGGCTCAATGGTCTGGTTTCACCACCTGCCAAT
TCCAAGGTGTCGCATGTGGTTGGGGTAAACAAAACAAAAGTCGGTCTTGC
TCCGACCCTGCTCCAGCTGGAGGTGCTCAATGTTTGAAAGTGGATGGATC
CATGAGGGGAATGGATGAAACGGTTGAAAGTGATTGTTATGTTGCTTGCC
CAGGTAGACGGTTTATTTGAAAATAAAGTATTACTATAGTCAATCTTTTC
TTTAAGTGGAATACGCTTTGTATCTCTAATTTCGGCTTAATCCAGCTTCG
ACAATGACTCATCGTTTTGTTGTTTTTCCATTAAAGATAATGTAGTGGAC
GGAGGATGGGGCGCGTGGAATATCCACACTAATTGCAGTAAAGAATGTGA
CGCTGGTATGCAAACTGTGAAACGCGAATGTAACTTCCCTTCTCCTTCCA
TCAATGGTGCTCATTGTCAAATGGAGAACGGTTCAATGGGTATGGTGGAA
ATGAAAGATGTGCCATGCAATACTCAACCATGTGGTAAGATATCACGTTA
TCATAAAGCAATGAAATCAATGGACAATATTCTCAAAAATAAATAACATA
AGTGCCAGGAAAAATTCAAAATTGTGTATGAATTCGATTTTCGAATTTAT
CATGTGGTCACCTGTGACTGAGTTAAAGCCTAGAGCTTTTAGTTGGACCA
TCTAATTGTACATTAGTACTTTCACAAAATCTTTTGAATATTCTAAAATA
TTGCTTTATCTTTATAGAACCACTTGATACTTTTGAAAGTTGGGGGCCAT
GGTCGCCTTGCACAAAGACATGTGGCTTCGGTGAAATGACACGAACAAGA
CAGTGTACAGGTATCTGCAGTGTGACCAAGGAAACAAGAGAATGCAGCTC
TGGATGTCGAACATACAAGTGCCCTGGTATGATTTCTTTAACTCATCTTG
AAACAGGTTCTGAAGGCCATTTCGTTCCTACTCCTGTGTTTTATTGTGCA
AAGATCTCCTTTTACAGGTTAGGGGCCGTCCATATAGTACGTACGCAAAA
ATGTTCCAAAAATTTGATACCCCCCCCCCTTGTACGCAGAGAACAATAGA
AATGATGTCATTTAAACAATAGATGTACGCTTTTGATAACCCCCCTCAAC
CCCCCTTCACTGTGTACGTACATGGATGGCCCCTAATGGTAAGAATAAAT
GACCGCGAAGGTTGATAAACTGATTGCTACTACTATTTTTATTTTGATGA
TATGTAAAATAAGTTTTGACTTATTTTACGTTCTTTCAACTCATTTTTCA
AAGAGAAATGGATAGAAATAATTTAATGGACCTTTTTTTGTAGATCCGTC
CGAATATCAATTTTACTGTGATTTCGAAGATAATATGTGTATCACCAAAT
TCCACAGTGAACCTACGAAATTTGTTGTCGGTAAAAGCACACCATCACCT
AACACTGGAGCTGACGCTGATGCTACATTCCCAACTGGTAACTTTAGATA
TTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000076_pilon:1368856..1370958- >MSTRG.10829.5.p1 ID=MSTRG.10829.5.p1|Name=MSTRG.10829.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3675bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:1368856..1370958- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATCCGTCCGAATATCAATTTTACTGTGATTTCGAAGATAATATGTGTATC
ACCAAATTCCACAGTGAACCTACGAAATTTGTTGTCGGTAAAAGCACACC
ATCACCTAACACTGGAGCTGACGCTGATGCTACATTCCCAACTGGTAACT
TTAGATATAACCACTTGATACTTTTGAAAGTTGGGGGCCATGGTCGCCTT
GCACAAAGACATGTGGCTTCGGTGAAATGACACGAACAAGACAGTGTACA
GGTATCTGCAGTGTGACCAAGGAAACAAGAGAATGCAGCTCTGGATGTCG
AACATACAAGTGCCCTGATAATGTAGTGGACGGAGGATGGGGCGCGTGGA
ATATCCACACTAATTGCAGTAAAGAATGTGACGCTGGTATGCAAACTGTG
AAACGCGAATGTAACTTCCCTTCTCCTTCCATCAATGGTGCTCATTGTCA
AATGGAGAACGGTTCAATGGGTATGGTGGAAATGAAAGATGTGCCATGCA
ATACTCAACCATGTGACGGCCAATGGGCTCAATGGTCTGGTTTCACCACC
TGCCAATTCCAAGGTGTCGCATGTGGTTGGGGTAAACAAAACAAAAGTCG
GTCTTGCTCCGACCCTGCTCCAGCTGGAGGTGCTCAATGTTTGAAAGTGG
ATGGATCCATGAGGGGAATGGATGAAACGGTTGAAAGTGATTGTTATGTT
GCTTGCCCAGATGAGTAGCGCTATCCCTTCAAGTGATCCGTCCGAATATC
AATTTTACTGTGATTTCGAAGATAATATGTGTATCACCAAATTCCACAGT
GAACCTACGAAATTTGTTGTCGGTAAAAGCACACCATCACCTAACACTGG
AGCTGACGCTGATGCTACATTCCCAACTGGTAACTTTAGATATAACCACT
TGATACTTTTGAAAGTTGGGGGCCATGGTCGCCTTGCACAAAGACATGTG
GCTTCGGTGAAATGACACGAACAAGACAGTGTACAGGTATCTGCAGTGTG
ACCAAGGAAACAAGAGAATGCAGCTCTGGATGTCGAACATACAAGTGCCC
TGATAATGTAGTGGACGGAGGATGGGGCGCGTGGAATATCCACACTAATT
GCAGTAAAGAATGTGACGCTGGTATGCAAACTGTGAAACGCGAATGTAAC
TTCCCTTCTCCTTCCATCAATGGTGCTCATTGTCAAATGGAGAACGGTTC
AATGGGTATGGTGGAAATGAAAGATGTGCCATGCAATACTCAACCATGTG
ACGGCCAATGGGCTCAATGGTCTGGTTTCACCACCTGCCAATTCCAAGGT
GTCGCATGTGGTTGGGGTAAACAAAACAAAAGTCGGTCTTGCTCCGACCC
TGCTCCAGCTGGAGGTGCTCAATGTTTGAAAGTGGATGGATCCATGAGGG
GAATGGATGAAACGGTTGAAAGTGATTGTTATGTTGCTTGCCCAGATGAG
TAGCGCTATCCCTTCAAGTGATCCGTCCGAATATCAATTTTACTGTGATT
TCGAAGATAATATGTGTATCACCAAATTCCACAGTGAACCTACGAAATTT
GTTGTCGGTAAAAGCACACCATCACCTAACACTGGAGCTGACGCTGATGC
TACATTCCCAACTGGTAACTTTAGATATAACCACTTGATACTTTTGAAAG
TTGGGGGCCATGGTCGCCTTGCACAAAGACATGTGGCTTCGGTGAAATGA
CACGAACAAGACAGTGTACAGGTATCTGCAGTGTGACCAAGGAAACAAGA
GAATGCAGCTCTGGATGTCGAACATACAAGTGCCCTGATAATGTAGTGGA
CGGAGGATGGGGCGCGTGGAATATCCACACTAATTGCAGTAAAGAATGTG
ACGCTGGTATGCAAACTGTGAAACGCGAATGTAACTTCCCTTCTCCTTCC
ATCAATGGTGCTCATTGTCAAATGGAGAACGGTTCAATGGGTATGGTGGA
AATGAAAGATGTGCCATGCAATACTCAACCATGTGACGGCCAATGGGCTC
AATGGTCTGGTTTCACCACCTGCCAATTCCAAGGTGTCGCATGTGGTTGG
GGTAAACAAAACAAAAGTCGGTCTTGCTCCGACCCTGCTCCAGCTGGAGG
TGCTCAATGTTTGAAAGTGGATGGATCCATGAGGGGAATGGATGAAACGG
TTGAAAGTGATTGTTATGTTGCTTGCCCAGATGAGTAGCGCTATCCCTTC
AAGTGATCCGTCCGAATATCAATTTTACTGTGATTTCGAAGATAATATGT
GTATCACCAAATTCCACAGTGAACCTACGAAATTTGTTGTCGGTAAAAGC
ACACCATCACCTAACACTGGAGCTGACGCTGATGCTACATTCCCAACTGG
TAACTTTAGATATAACCACTTGATACTTTTGAAAGTTGGGGGCCATGGTC
GCCTTGCACAAAGACATGTGGCTTCGGTGAAATGACACGAACAAGACAGT
GTACAGGTATCTGCAGTGTGACCAAGGAAACAAGAGAATGCAGCTCTGGA
TGTCGAACATACAAGTGCCCTGATAATGTAGTGGACGGAGGATGGGGCGC
GTGGAATATCCACACTAATTGCAGTAAAGAATGTGACGCTGGTATGCAAA
CTGTGAAACGCGAATGTAACTTCCCTTCTCCTTCCATCAATGGTGCTCAT
TGTCAAATGGAGAACGGTTCAATGGGTATGGTGGAAATGAAAGATGTGCC
ATGCAATACTCAACCATGTGACGGCCAATGGGCTCAATGGTCTGGTTTCA
CCACCTGCCAATTCCAAGGTGTCGCATGTGGTTGGGGTAAACAAAACAAA
AGTCGGTCTTGCTCCGACCCTGCTCCAGCTGGAGGTGCTCAATGTTTGAA
AGTGGATGGATCCATGAGGGGAATGGATGAAACGGTTGAAAGTGATTGTT
ATGTTGCTTGCCCAGATGAGTAGCGCTATCCCTTCAAGTGATCCGTCCGA
ATATCAATTTTACTGTGATTTCGAAGATAATATGTGTATCACCAAATTCC
ACAGTGAACCTACGAAATTTGTTGTCGGTAAAAGCACACCATCACCTAAC
ACTGGAGCTGACGCTGATGCTACATTCCCAACTGGTAACTTTAGATATAA
CCACTTGATACTTTTGAAAGTTGGGGGCCATGGTCGCCTTGCACAAAGAC
ATGTGGCTTCGGTGAAATGACACGAACAAGACAGTGTACAGGTATCTGCA
GTGTGACCAAGGAAACAAGAGAATGCAGCTCTGGATGTCGAACATACAAG
TGCCCTGATAATGTAGTGGACGGAGGATGGGGCGCGTGGAATATCCACAC
TAATTGCAGTAAAGAATGTGACGCTGGTATGCAAACTGTGAAACGCGAAT
GTAACTTCCCTTCTCCTTCCATCAATGGTGCTCATTGTCAAATGGAGAAC
GGTTCAATGGGTATGGTGGAAATGAAAGATGTGCCATGCAATACTCAACC
ATGTGACGGCCAATGGGCTCAATGGTCTGGTTTCACCACCTGCCAATTCC
AAGGTGTCGCATGTGGTTGGGGTAAACAAAACAAAAGTCGGTCTTGCTCC
GACCCTGCTCCAGCTGGAGGTGCTCAATGTTTGAAAGTGGATGGATCCAT
GAGGGGAATGGATGAAACGGTTGAAAGTGATTGTTATGTTGCTTGCCCAG
ATGAGTAGCGCTATCCCTTCAAGTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000076_pilon | genome | sc0000076_pilon:1368856..1370958 - |
|
