MSTRG.1081.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1081.2.p1
Unique NameMSTRG.1081.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:1974491..1989162+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1081.2.p1 ID=MSTRG.1081.2.p1|Name=MSTRG.1081.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14672bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:1974491..1989162+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atatcacaatttcttcttttttttcagatctagaaaacattattttactA CTTAGCAAACATGGTGACTATTGACCTCGGTTTCGATCGCATCAGATCAA AAGACTTCTGGAGAGCAATTTTCGCAGAGTTCTTTGGTTGCATTTTGTTC TTGTTATGCGTCACCAGCGTTGCACTTAGTTGGGGAAATACGAGTGGTAA CATCTCAGCTAACAATGTGGAAATTGGCATCGGTATTGGTCTGGCCATCG CCTCTCTTGCTCAAGCCGTCGGACATGTCAGTGGTGGTCACTTGAATCCT GCTGTTAGTCTTGGAATGATTGTTGGTGGTCGCATCAACGTTTTGCAAGG AATCCTTTACATTGTTGCTCAATCCATTGGCGGTAAGATTCATTTCTTCA CATGTATTTAACAACCTTTGCTAGACAGAGGCTCTTCAATATATCTAATT CACCAGAACCGATTTGACTACGAAATTATCGTTCTTCCAAAGTATCCTTG GATTTTCCGTGACAGAAAGCCTGAAGTGAAATGACTTCATGAAATAAATT CACCACTGGCAGTGATATATATAAGTGCTCTCTTTAAGGTATAACTCTTC AACCTAGCATCTAATGTATATCAAGTATGGGTTTCAATGAGAAAAAGCAA TTGCCATTAATTTCATAATCATTTAACTTGCAGCTATCATCGGATCAGCT TTGACTTATGCGTGCACACCTGAATCAAATCGTGAGGCACTTGGCGTGAC AGCAGTAAGAAAAGGACTTGCTGTGGAGCAAGGGTTCGGTTTGGAATTGC TTTTCACCTTCGTTCTCGTATTCTTCGTGTTCTCCATCACCGATGCTAAG AAGAAAACTGAGCCCTATGGAACCACTTTAGGAATTGGAATCGTCATTTT GGTTTGCCATGTCTGCTTGGTAAGTAAAAAGTTCCTCGTTTCACCATAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:1974491..1989162+

>MSTRG.1081.2.p1 ID=MSTRG.1081.2.p1|Name=MSTRG.1081.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3192bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:1974491..1989162+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACCAGCGTTGCACTTAGTTGGGGAAATACGAGTGGTAACATCTCAGCTAA
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AAGCCGTCGGACATGTCAGTGGTGGTCACTTGAATCCTGCTGTTAGTCTT
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ACCTGCTGTTGTTATGAACTCATGGCAAGACCACTGGatttacTGGATTG
GGCCACTTCTTGGAGGAGCACTTGCTGCCATCTTCTATAACTTCTTGTTT
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TCGTATTCTTCGTGTTCTCCATCACCGATGCTAAGAAGAAAACTGAGCCC
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CTTGATTCCCTTTACCGGGTGCGGTATCAATCCGACTCGATCTTTCGGAC
CTGCTGTTGTTATGAACTCATGGCAAGACCACTGGatttacTGGATTGGG
CCACTTCTTGGAGGAGCACTTGCTGCCATCTTCTATAACTTCTTGTTTTA
CGTTGAAGAAGAAACACCAGTCAAGTACGTTGTCAAAGATGCTCCTAACG
CTGCAGCACAAGACGGAGTCAAAACTGATGAAAACAATGTCTAGATGGTG
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GCGTTGCACTTAGTTGGGGAAATACGAGTGGTAACATCTCAGCTAACAAT
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GCTCAATCCATTGGCGCTATCATCGGATCAGCTTTGACTTATGCGTGCAC
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TGATTCCCTTTACCGGGTGCGGTATCAATCCGACTCGATCTTTCGGACCT
GCTGTTGTTATGAACTCATGGCAAGACCACTGGatttacTGGATTGGGCC
ACTTCTTGGAGGAGCACTTGCTGCCATCTTCTATAACTTCTTGTTTTACG
TTGAAGAAGAAACACCAGTCAAGTACGTTGTCAAAGATGCTCCTAACGCT
GCAGCACAAGACGGAGTCAAAACTGATGAAAACAATGTCTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1081MSTRG.1081Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1081.2.p1MSTRG.1081.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1081.2.p1.exon1MSTRG.1081.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1081.2.p1.exon2MSTRG.1081.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1081.2.p1.exon3MSTRG.1081.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1081.2.p1.exon4MSTRG.1081.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000005_pilongenomesc0000005_pilon:1974491..1989162 +