MSTRG.10782.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10782.1.p2
Unique NameMSTRG.10782.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000076_pilon:520989..575341-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10782.1.p2 ID=MSTRG.10782.1.p2|Name=MSTRG.10782.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=54353bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:520989..575341- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATAAAATGTGTTCAACACAAGCCAAAGCAGCTGGATATTTCGGATTGAAA TTCCACACCTTGATCTCAGATAATTATAATGATATCGCAAATATGATTCC ATTCCGAAGTCGTAAAAAACCAGTCGCTAATACCAGGGTATGTACCAATG AATAAATGATAATAGTTCCACATATAGATTTATTATCTTCTTGATTATCA TGTGGAAGCACTATATCAGGCAGGGATAACTTCAAATTAGCCTATCATCT CGGAATATCAGCTAATTAGCCTAGAATAAGCAAATTAGCCTATTTCATAT AGGCTAATTAGCTCATAATGAAGAAAAATTTGATTTTTGAGCCAAATACT AATAGTCGCATCTTTTTTTCATTAAAAACAAATCTTATATGTTTCAAAGA ATCTTCTCCACTTAAAAATCTTTTGTGTTCAGCTCCCAGAAAAGATGTAT TTTAAAAAAGCTAGTTGATGGGCTAAATAACTAATAATAGGCTAATTTTC TGATCTTAGTACCGTGTGCAAAAAAAAATATAATATTTTCCGCGAAAAAT GTCGAAGTTTTTATACTGCGCATGCCCGCGCATGCGCAGTTAGAAAAAAT TAAATATCTCCTATTCTGGAGCTGATTAAGGGATAATATTTGGAATATAC ATTAATTGAGTGATTAGAGATTAATCTGAGAATTTATAGAATGCGACTAT TAGTATTTGGCTCAAAAATCAAATTTTTCTTCATTATGAGCTAATTAGCC TATATGAAATGGGCTAATTTGCTTATTCTAGGCTAATTAGCTGACATTCC GAGATGATAGGCTAATTTGAAGTTATCCCTGCCTGTATATGTAATATACA CTCTTCTTTAGAATACTTTCGCTCTCTGTAATCAGTCAATCTCTTTCAGA TGAGATCTTATTATGCACTTTAGTTTTTTTCTTTCATTGTTGTCCATTCT TGCTTTAAACTTCCAATTTCAATTGAATATTTACCTGGCTAGGAAACCGA CTTTCAGACCAGGGAGATATTCAAATTATTTGAAGTTTAAAAGGAAATTT ATGAAGTCTTTTTACTTATTATCTTACAGGGTGAGCAGATTTTCGCACGC GCGGAAGATATCTACAAGAGTGATAATTACACTGCATTTAATCCAAACAT CCCAATCTATTCTTTCGACCAAAAAGATGTTCGCCAAGATCCTTCATGGT AAGATTCTGATGCTGTTTCTCTTTTGTGAAAAATATAGTAAATAGTTTCT AATGAATGAAAGCTCCAAAAAAAGAAAACAATTTAAAAATCATAGAAACA CGAACATCATTAAAATCAACGAATTCGAAATGCACCACTGTATCACACTT CTATTTTAACTTATTTTTTAGGCCGGTGAAGAAATTTTGGCACGGTTCAC ACGCTAACGGAAAACTCCACTCAACGAAAATGAATTGCCGCAACTGGCGT TCTGAGCAACCTTTCCATAAGGCCACCGCATCTTCCATTCTTACCTACAC TCCTGCATTGAATGAGTTAGATGTTCGCTGCGACCAAAAACTCATCGTCT TGTGCTTACAAGTAAGATGAGGTCAAGTCTCAGGTTAGATGACATCAATT CTCTTTAAAGGGAATCTAGTTGGGAATTTCAATGATGAAAAACACCGTGG TATGAGAGAAAGGCGTGGTCGATGAAATTCTATATATACCTGTCTTTAAT GTATAAAACGTGACCTTGAATAAGATAGTGGTAAAAATTTGGGTCTTACA CATCACTAGACTACGAAATGATAATTTATGATAAGCAATATTTTTTTAGA TAGTTTTATATCAGATAGAGCTTTTGTTGAAAATTTTATTCTAAATAATT TTATCATTGTCTTTGGCCTAATTTTTGGTGGTTAGAAAAATTCAGAACCA ATCGAGAACTAGTTTGAGTCCAAAATCTGAAAAATTTCCAGGACGGAGCT ACCAAAGAGAATCTATGGATTAGACTTTTTGTTATTTATATTTTATTTTC TCCTTGTGTACATATTTAATTATTTTTTTCAAAATAAAATAGTTTTTGGA AATAAAAAAATTATTTTCAAAAAAAGTAAGAAAGAAATTTAGAAATCTAG AAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000076_pilon:520989..575341-

>MSTRG.10782.1.p2 ID=MSTRG.10782.1.p2|Name=MSTRG.10782.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4734bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:520989..575341- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCCGGTGAAGAAATTTTGGCACGGTTCACACGCTAACGGAAAACTCCACT
CAACGAAAATGAATTGCCGCAACTGGCGTTCTGAGCAACCTTTCCATAAG
GCCACCGCATCTTCCATTCTTACCTACACTCCTGCATTGAATGAGTTAGA
TGTTCGCTGCGACCAAAAACTCATCGTCTTGTGCTTACAAGTAAGATGAG
GTGAGCAGATTTTCGCACGCGCGGAAGATATCTACAAGAGTGATAATTAC
ACTGCATTTAATCCAAACATCCCAATCTATTCTTTCGACCAAAAAGATGT
TCGCCAAGATCCTTCATGTTGATGTTAATCGCTTTGAACGAGCCTTATTC
TGGACGAATGGGAGGTTTAGCAAAGATTGATAAAATGTGTTCAACACAAG
CCAAAGCAGCTGGATATTTCGGATTGAAATTCCACACCTTGATCTCAGAT
AATTATAATGATATCGCAAATATGATTCCATTCCGAAGTCGTAAAAAACC
AGTCGCTAATACCAGGGATAAGAAGTTGATCAAAGAAACCTTGATTGTTC
CACAGCCTGGGATAATGGCAAAAAGACCTTACACCGAATCGAAATCAGGT
CTTCTTGGCAAACTGACCACGGATAGCAACGAGATTGCATCAGGTCCAAC
CGTGATCGAATTGACCAAGAAACAAATCACCGAACCCACTGATGTTATGG
AAGATATGTTCGGCGTTGGTTCTCTTGCATTTGTTATCAGTACAAATAAT
TTGTTCATCAAATCTCTCAAAGGTTGGATCAGCATCCCCGCCGGTGAAGA
AATTTTGGCACGGTTCACACGCTAACGGAAAACTCCACTCAACGAAAATG
AATTGCCGCAACTGGCGTTCTGAGCAACCTTTCCATAAGGCCACCGCATC
TTCCATTCTTACCTACACTCCTGCATTGAATGAGTTAGATGTTCGCTGCG
ACCAAAAACTCATCGTCTTGTGCTTACAAGTAAGATGAGGTGAGCAGATT
TTCGCACGCGCGGAAGATATCTACAAGAGTGATAATTACACTGCATTTAA
TCCAAACATCCCAATCTATTCTTTCGACCAAAAAGATGTTCGCCAAGATC
CTTCATGTTGATGTTAATCGCTTTGAACGAGCCTTATTCTGGACGAATGG
GAGGTTTAGCAAAGATTGATAAAATGTGTTCAACACAAGCCAAAGCAGCT
GGATATTTCGGATTGAAATTCCACACCTTGATCTCAGATAATTATAATGA
TATCGCAAATATGATTCCATTCCGAAGTCGTAAAAAACCAGTCGCTAATA
CCAGGGATAAGAAGTTGATCAAAGAAACCTTGATTGTTCCACAGCCTGGG
ATAATGGCAAAAAGACCTTACACCGAATCGAAATCAGGTCTTCTTGGCAA
ACTGACCACGGATAGCAACGAGATTGCATCAGGTCCAACCGTGATCGAAT
TGACCAAGAAACAAATCACCGAACCCACTGATGTTATGGAAGATATGTTC
GGCGTTGGTTCTCTTGCATTTGTTATCAGTACAAATAATTTGTTCATCAA
ATCTCTCAAAGGTTGGATCAGCATCCCCGCCGGTGAAGAAATTTTGGCAC
GGTTCACACGCTAACGGAAAACTCCACTCAACGAAAATGAATTGCCGCAA
CTGGCGTTCTGAGCAACCTTTCCATAAGGCCACCGCATCTTCCATTCTTA
CCTACACTCCTGCATTGAATGAGTTAGATGTTCGCTGCGACCAAAAACTC
ATCGTCTTGTGCTTACAAGTAAGATGAGGTGAGCAGATTTTCGCACGCGC
GGAAGATATCTACAAGAGTGATAATTACACTGCATTTAATCCAAACATCC
CAATCTATTCTTTCGACCAAAAAGATGTTCGCCAAGATCCTTCATGTTGA
TGTTAATCGCTTTGAACGAGCCTTATTCTGGACGAATGGGAGGTTTAGCA
AAGATTGATAAAATGTGTTCAACACAAGCCAAAGCAGCTGGATATTTCGG
ATTGAAATTCCACACCTTGATCTCAGATAATTATAATGATATCGCAAATA
TGATTCCATTCCGAAGTCGTAAAAAACCAGTCGCTAATACCAGGGATAAG
AAGTTGATCAAAGAAACCTTGATTGTTCCACAGCCTGGGATAATGGCAAA
AAGACCTTACACCGAATCGAAATCAGGTCTTCTTGGCAAACTGACCACGG
ATAGCAACGAGATTGCATCAGGTCCAACCGTGATCGAATTGACCAAGAAA
CAAATCACCGAACCCACTGATGTTATGGAAGATATGTTCGGCGTTGGTTC
TCTTGCATTTGTTATCAGTACAAATAATTTGTTCATCAAATCTCTCAAAG
GTTGGATCAGCATCCCCGCCGGTGAAGAAATTTTGGCACGGTTCACACGC
TAACGGAAAACTCCACTCAACGAAAATGAATTGCCGCAACTGGCGTTCTG
AGCAACCTTTCCATAAGGCCACCGCATCTTCCATTCTTACCTACACTCCT
GCATTGAATGAGTTAGATGTTCGCTGCGACCAAAAACTCATCGTCTTGTG
CTTACAAGTAAGATGAGGTGAGCAGATTTTCGCACGCGCGGAAGATATCT
ACAAGAGTGATAATTACACTGCATTTAATCCAAACATCCCAATCTATTCT
TTCGACCAAAAAGATGTTCGCCAAGATCCTTCATGTTGATGTTAATCGCT
TTGAACGAGCCTTATTCTGGACGAATGGGAGGTTTAGCAAAGATTGATAA
AATGTGTTCAACACAAGCCAAAGCAGCTGGATATTTCGGATTGAAATTCC
ACACCTTGATCTCAGATAATTATAATGATATCGCAAATATGATTCCATTC
CGAAGTCGTAAAAAACCAGTCGCTAATACCAGGGATAAGAAGTTGATCAA
AGAAACCTTGATTGTTCCACAGCCTGGGATAATGGCAAAAAGACCTTACA
CCGAATCGAAATCAGGTCTTCTTGGCAAACTGACCACGGATAGCAACGAG
ATTGCATCAGGTCCAACCGTGATCGAATTGACCAAGAAACAAATCACCGA
ACCCACTGATGTTATGGAAGATATGTTCGGCGTTGGTTCTCTTGCATTTG
TTATCAGTACAAATAATTTGTTCATCAAATCTCTCAAAGGTTGGATCAGC
ATCCCCGCCGGTGAAGAAATTTTGGCACGGTTCACACGCTAACGGAAAAC
TCCACTCAACGAAAATGAATTGCCGCAACTGGCGTTCTGAGCAACCTTTC
CATAAGGCCACCGCATCTTCCATTCTTACCTACACTCCTGCATTGAATGA
GTTAGATGTTCGCTGCGACCAAAAACTCATCGTCTTGTGCTTACAAGTAA
GATGAGGTGAGCAGATTTTCGCACGCGCGGAAGATATCTACAAGAGTGAT
AATTACACTGCATTTAATCCAAACATCCCAATCTATTCTTTCGACCAAAA
AGATGTTCGCCAAGATCCTTCATGTTGATGTTAATCGCTTTGAACGAGCC
TTATTCTGGACGAATGGGAGGTTTAGCAAAGATTGATAAAATGTGTTCAA
CACAAGCCAAAGCAGCTGGATATTTCGGATTGAAATTCCACACCTTGATC
TCAGATAATTATAATGATATCGCAAATATGATTCCATTCCGAAGTCGTAA
AAAACCAGTCGCTAATACCAGGGATAAGAAGTTGATCAAAGAAACCTTGA
TTGTTCCACAGCCTGGGATAATGGCAAAAAGACCTTACACCGAATCGAAA
TCAGGTCTTCTTGGCAAACTGACCACGGATAGCAACGAGATTGCATCAGG
TCCAACCGTGATCGAATTGACCAAGAAACAAATCACCGAACCCACTGATG
TTATGGAAGATATGTTCGGCGTTGGTTCTCTTGCATTTGTTATCAGTACA
AATAATTTGTTCATCAAATCTCTCAAAGGTTGGATCAGCATCCCCGCCGG
TGAAGAAATTTTGGCACGGTTCACACGCTAACGGAAAACTCCACTCAACG
AAAATGAATTGCCGCAACTGGCGTTCTGAGCAACCTTTCCATAAGGCCAC
CGCATCTTCCATTCTTACCTACACTCCTGCATTGAATGAGTTAGATGTTC
GCTGCGACCAAAAACTCATCGTCTTGTGCTTACAAGTAAGATGAGGTGAG
CAGATTTTCGCACGCGCGGAAGATATCTACAAGAGTGATAATTACACTGC
ATTTAATCCAAACATCCCAATCTATTCTTTCGACCAAAAAGATGTTCGCC
AAGATCCTTCATGTTGATGTTAATCGCTTTGAACGAGCCTTATTCTGGAC
GAATGGGAGGTTTAGCAAAGATTGATAAAATGTGTTCAACACAAGCCAAA
GCAGCTGGATATTTCGGATTGAAATTCCACACCTTGATCTCAGATAATTA
TAATGATATCGCAAATATGATTCCATTCCGAAGTCGTAAAAAACCAGTCG
CTAATACCAGGGATAAGAAGTTGATCAAAGAAACCTTGATTGTTCCACAG
CCTGGGATAATGGCAAAAAGACCTTACACCGAATCGAAATCAGGTCTTCT
TGGCAAACTGACCACGGATAGCAACGAGATTGCATCAGGTCCAACCGTGA
TCGAATTGACCAAGAAACAAATCACCGAACCCACTGATGTTATGGAAGAT
ATGTTCGGCGTTGGTTCTCTTGCATTTGTTATCAGTACAAATAATTTGTT
CATCAAATCTCTCAAAGGTTGGATCAGCATCCCC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10782MSTRG.10782Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10782.1.p2.exon27MSTRG.10782.1.p2.exon27Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon26MSTRG.10782.1.p2.exon26Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon25MSTRG.10782.1.p2.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon24MSTRG.10782.1.p2.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon23MSTRG.10782.1.p2.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon22MSTRG.10782.1.p2.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon21MSTRG.10782.1.p2.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon20MSTRG.10782.1.p2.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon19MSTRG.10782.1.p2.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon18MSTRG.10782.1.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon17MSTRG.10782.1.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon16MSTRG.10782.1.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon15MSTRG.10782.1.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon14MSTRG.10782.1.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon13MSTRG.10782.1.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon12MSTRG.10782.1.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon11MSTRG.10782.1.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon10MSTRG.10782.1.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon9MSTRG.10782.1.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon8MSTRG.10782.1.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon7MSTRG.10782.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon6MSTRG.10782.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon5MSTRG.10782.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon4MSTRG.10782.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon3MSTRG.10782.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon2MSTRG.10782.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10782.1.p2.exon1MSTRG.10782.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10782.1.p2MSTRG.10782.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000076_pilongenomesc0000076_pilon:520989..575341 -