MSTRG.1077.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1077.1.p1
Unique NameMSTRG.1077.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:1845713..1868310+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1077.1.p1 ID=MSTRG.1077.1.p1|Name=MSTRG.1077.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=22598bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:1845713..1868310+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttttCTGACTCCTAAcggttttgacaaaaaatttagatttaccGAATG CGGAATGAatcaaatttcgcgaaaatgataaaatatacGATGAAAAAGGA TCAAAACTCACAAGACTAACGAAAATTGATCAAAGAAACATTAAATCAAC TCCAAGTGGTATTGAGATCGAGTCAAAATCAAGATGAATTTTCGAGATTT GTTTTCGACGCTATTGCTATTATTTGCATTTTGTTTCCGCCTTCAGGAAG CATCGAAATGCAAGCGCAGGGTAAGATTTCTTCTGGTATAAACTTCTCTC TGATATTACCTTGAGAGGATTAATTTTGtcaagaactaattttggtaaTG CGCCAAAATTACTGCCTCACTGAATAAATTATTCTCGCCAAAATTCACAG ATTTATAACCAAAATAACACAcccaatattttttctgaaacaacCATTTG Agatttaaggcttggggacacaagttttttttgcgttggtgcatagcaac atgctccatcccaccaacacaagaagaAAAGTGTgggtcccatggtttct ttttttgtgggGTGGAGACatgagaaagcgtttcaggttggtgggatgga gcatgttgcattgcaccagcgcgaaaaaaacttctcgtgccCTTTAAAGT AAATTAGTTTGCACCAATGTAAGAAATTTCGCCGCTCACAAAAATAAGTT GTCGTAAAATTTAATTATTCATGATTTTTACTCATCTCCAAAAAATTGTT CTTGCTAAaaattgagaacaagttaagaatattttaaggctgtGTGAACT CTaaaaccttaaaaccttttctaagaaaaaatggacaaaaaatactcaca aaatgatgaaatcaagaatgttaagaaaattatttAGGCTTAGTTCCGAA GGCTTcataaattttggattttcttaaaaagaatgtttaaaatacGTCCA TTATCattcgtttttttctttttcaggttcCAGAGAATAATCATGGCATT CAACCAATCACATTCATCAACCAAGGTGACTCTTCTTTTATTTTACTTTG CGAATTAAAGGAAAGCGCGAATTCGGGTTGATAAAATACCCTAGAAATGT AGCGGTCTTGACAAAATTCAGAGAGGCCTTTTGAAGTCTTAGATATTTTA AAGTCTAGCTTaaaaaaaTTCTCCGATGAATACATTGTGCCTTATATGAG AGAAATTTCTTTAAGAGTCTCCagtttcaagatttttgaaaaattacatc TTCGTTTTACCGAGTGATCGAACCCGtaaacatattttttaaaagCAGTT TTAAAAGCGATTTTAAGCTCAAGGCtgataccctgagtatcagaggttaa gttttcaaagaatatattaacctctgaagaccaataatagaaattttatc gcacatgtgtcaatctaatcactgtagaaagaatcaaagatgaagagcaa atactaccatattaatgtctatagcagactgtatcagtatgcagtttact atttacgaattccccagaaacctccaagtgtaattgaggtgagtttcttt cgaaaaaaatcttttacatgatccccgtatgtataacagtaattactaaa attttaattatggaaatgtcactttaattgaatcgaaataatagacagac tttatgtttatgtttatgtttatgtttatgatgacttttttaagttgtgt tttcaacgacgggaataaaaatatcaactttgaacttcatccaagatctt ggatggttgtcatggttacttttgtcttcgttgattgcgcgctgaataga atctcgattcgtcggcacagcgtcaatatatgattttgacctgtgctatt cacggtacAGGGCTGGAGTTTTCAAAAGCATCTAGTGCAATTTCAAACAT ATTTGATATTGCCACAGTATTTTATTACTGATTAGGACAAGTGCTATCTt TTGTCATAAATTAGCCATGGAGCATTCAAAAAGGctttgtggtatagtgg ttattaTCATTGACTCCCGCCTAGAAGGCCCGCTTTTGATGctcactacg attcacttggcaagcaAATGTGCTTTCACCCGGGTCAAACCATGTCATGC AAAGGGAATTGGGTACTATTACTCTAACACAAAAGTGTGGGTAGATTAGG CTGACATTGTGACGTGTAATATGGCACTCGTGAGCATCGTTCTCCCAGTG TTGTTATCGAGTGTCagggtatacgccatggcttggcagctcgcgtctgt caaaTCGCAAGGTTTTcagtagtaatattttttgttcccaagcaggtcct ctttcaaatgaaacaaaaaattttcgatttcgacatttatatgttgtgat atttttgtttggaacctttggataaatatctttcatttattGAGCCATAT TTGAGCTTctaactttcactttcattttcaagccccagcaaaagtgatga cgtcacatggggaccagcaaaatggtcaaaatttttctcaccactcgttt tttGTGATCCTATGGACCTAATTGAATATTTCCCCGCTATAAGGggaaat attagttaaaaaggcatttctcCGATCCTTGGCTATTTACGCCCTTTTTG CGCCCTTAATAACGCCCACGCCTCTCCTGATCGATTTGTGCAGCGAGGCG GAACTCTTGTCTATAGTGTAAAACCTTTAGTCAGGATTAATCAATGTGCG ATTTTTATTGAGGAAATTTAACTCACCATGTGGTGCATGTTCTGGACTGA TTTGGTTGTCAACTCGACTGAATTGGAAACTTTCTCTCTGGTTATTTTTC AGACAGTCAGACAGCTTTAAAAGTGACTTTCAGGGATCtttttcctaagg acttttgaagttttttgatgcaatattttttattttttttatttttgtga ttaAGGAAGCATTGATCACCAACAGTGTGAGTAAACACGTAAACAACAGT GCTTGATCACTAAAGAGGTAcacggcaaaaatataaaccttgtctgcttg agcagattgatttacattctcgacgaagaggtcgataaaacaaaccttgt ctgcttgttgagcagattgattatttaaaaactattgtccgatatttcgt acacggcaaaaatataaaccttgtctgcttgaaCAGATTGATTTATATTC TCGACaaagaagtcgatagaaaaactattgtccgatatttcaggttgaca tatattcttgacaaagaggtcgatagaATAAAGCATCTCCTCTTTTGTGG ATTAGATTGGTGTCAAGAGATTCATATATCAACAAACTTCCACATaaata ctagcaagtagctgccGCTATGAATGCCcgccgatagcagatattagccc agaggaacttagccatgaagagagcaagggaatcataatcagactataaa ttggtgaaatgagtcttcataaaaagtgctcaatgttactagagctgttt aaagttaaaagaAACACGAGCCAatgcggttaaaattttctcagtaagat cccatacataacgaaagtaTCAATCTaaaaaaaaCCTGTTAAATCTACAC TTTCTGATACAAAGTGAcctaaattaaaaccattacaggtTTCGCAATAT GTTAAGAActtacttttgatacttttgatgggttctttgagtctctcaat catccaatttggaaatccgatgattcaccatttctctcacactgtttgaa tccgctctcctgtagggataataattcgggagcagtggttcgtccggcag tgtggaaagaaaaaggtcaagttgtcttttgaatttaatttttgtgcagT TTGTGATTTACGAATGTAGAAGGGAGAGAATTGAAAAGCTTAGGTCCTTC TTCAGATAGTGAGCCTCTCcaaatgtttttgtgtttagaATTTACTTCTT TAAGGTGGGCATTTCGTCCGAGTCTCTGGTTTTCGTAGCAGGTGATACCC CCCTTTGTCTCAGAGtggttgaaatttggagaaTATTTCTCTAAGATATA CCAAGTATAGATGATTTGATATCTTTCTCTACGTCTTTCCAGACTGTATA ATTtagagttttaagtttttcccaATAGTTCAGTTTTGTAAAGAGAATAT TCCATTTggaatgatttttgaagctgttcTAGTCGTTGCATTTGGTGTCT CTTGGATGGTGACCATAGCTGTGAACAGTAATCATGTGAGGGATTGCCAA TGTCTTCCATAGGGTAGGCATTACAGTAGGGTCCCTGTTTGAAAGTTCGA TATATCCATGAACTGATACCTTTGATCTTGTCGATTACATTTTCTATATG ATTGTCATATGTCATACCCACATCTAAAGTGATCCCAAGGTCTTTGACTG TAGTCTTGGTATCTATCACCTTTTGGGTATCAGAGAAGTATTTGGAGAGT TCTTTAAGTTCTTCATTTCTACCATAATTGAGATGTTCAAATTCAAGTCC ATTCAATTTCATGCTATTCAATCCAGTCCACTCATAGACTGCGTTCATGT CATCTTGGAGCTGAATGATATCAGcatggtttttgatttttttcattaga cgtgtatcatcagcaaatgatgataagaaagagtgtaatatctttttgtc aatgtcttgtaccgggtgcgccacaaaaaagtttctctctttaaaactaa ttttcttgaaatctaaaagttttaaaagaaccattcctatttcattggaa agaagaaagataaaattaaattttgatgggtcatttattgaattcgattc attagatcaaaagttatgctcaattgaatggaaaagttactttcggaaaa tgctcaaaaacgttaaaaattgacctatcaaattaaacataagcataatt acatgatatatcagtattttcgtttcagtcattaaaaatgataattagct gtctaaatgaccttttgttatattaaggcaggttgaatttcaatgaaagg aagaaaattcgtcaaaaaaggccaaatattttggtaaaattcataaaaat acatcaaatatgggtttcgaggtagatccagccttacatagactttatcc agtctagaaccaaaaaacggaggaaaatttcggtaaaactaaattaaatt gattttgatgaagattgtAAACTCTTTCGACCCTtcagcttcaaaatttt tgtattttgttactgaaaaatgctctgaaatcatgtaaaggctattgcaa ttgccaaattttaagtaaaaatttgataggtcgatttttaacgttttcga gcactttctgaaagtaacttttttattcaattgagcataacttttgatct aatgaatcgaatttaataaatgacccatcaaaatttaagtctatctacct tctttccaatgaaaaaggagtggttcttttaagatttttaaatttcaaga aaattagtttcaaagagagaaacttttttgtggcgcacccggtatcatTA TCAGAAACAGTAGCGGTCCAAGCACAGAACCTTGGGGAACACCAGAGATG ACTTCTGACCTTTCTGATAGTGTGTAGTCAACAGAGACTTGTTGCGTTCT ACCTGTTAGTTAAAGGATTTGATCCAAGCAAGCAGTTTGCCTTTGATGCC AttggttttaattttgttcAGAAGAATGGTATGGTCGACTCTGTCGAAAG CCTTGCTAAATTCAAGGTAGATCACGTCCACATTGTTGCCGTTTTCTATA TGGTGGATAAGTCGTTCTGTGTGAGAGAGAAGTTGGCTCAGGCAGGATCT ACCCAGATCTGGAAACCATGTTGGTTGCAATTAAAAAGATTGTTGTCTTC AAGATGTTTTTGTATCTTACTTCtgacattttttcgaaaatttttgagac attcgaagtTAAAGCGACTGGTCTATAGTTTTCTGTAAACCTTGATTGCC TTTTTGAAGATTGGTGTGATGTAGCTTGATTTCAGTAGATGGGGAGTTTT TGACTTTGTCTAGAATCTTTCGCCAGATAAGACAAAGAGGAGTTGCAGTT GTTGTCTGGCTTTTTGAGCAGGATGGCCGGGAAACCATCAGGTCCAGGGC AGAGTTTGAAGATAGGGTGTTGATTTCGTTTGCTAAATCAGCTTCTGTGA GGTCTATATCACATAGTTGAGAAGTGTTGTTGTCATTTTCATTCAGGTCG TATCTCTCCAATGGTGAGTAAAGACAGAACTGTATTGGTTCTGAAGTATG TTAGCCATACGTTTACTGTCATTTGTAAGTTAATTTGTTGACGGATCTAT TACGGGTCCAACCTTGGGTTTATGctttgaaaaactttgcataGGCATAG AAATATTTAGGattagatttaatttttgaagtagCCATCAAGTTCTTGCT TTTGTCTTTCATTTATGTGTGACTTTGAAGCTTGAGTTCAATATCGATAA GTTTCTGTGCGGTTTTTGTTCGTTCgatgctttttttttaattttgatct aTTACGCATTAAAACACGTCTGTCTCttggattttttataagaaatgttT TGGTTTTCGAGCTGGTACTTTGTTTGCTGAATAAACTGATAACACTTATC AAAGTTTTCGTATTGTTTCTCTGGGTCTGAGGTTGAGTGCAAAGTCTTAC GCCAGTCAATACATTGTAAATCTTTGTTTATGGCTTCCcaatttatgttt ttgttaagaaaattaaaattatcgaATTTgctgtttcaaagtttttttgt tttcaacctTTCTTGTTTCAGTAAAAGTCAATGTGTTAAATGTCTATTAA TGATGATCTGAATGGCTGTAGGAATAACATCATAATCAAATATCATTTCA TGATGTTTTGTCAATAGAAAGTCTAAATATTTCCATCCGAATGAGTTTTT TGTGAATGGATTGATTCAGGTTTAGGTGTATCATGAAATCTTGTAAAGCA TTTAAAAGTTGTTTATTGCAATTTTCAGTTGGGGTGTATCTGTCATTGAT TAAGGTATGAGGGATGTTTGAAATCACCGCAGATTACAATGTCTGGGGTG TATCTTGAAGTGATTCATTTTGTATTGTGAAGAAATCAATTGGATAAATT CTGGGCGTCCGATTTAGGAGTTTGTTTGTGGTTGCCTGTAAACAAGGCCA AGAACAATATTGAATTGTTTAGAGTAGAGTAAAAGGGCTCGTGACTCCAT TGAGATTCCAGTAGTGAGTGAAAGGGGCAACATCTTCACGAATGTATAAT GCACACCGCCACGTATCTACCATGTTTGGCTTTTGGTCGATTTCATCCTT TCTAAATTTCTATCCTTGTATCTCAAGCTCGTTTATTGTGATGTTTCGAC AACCAAGTTTCAGTTATACCTAAAAAGAGTGAAAAAGGGGCAACATCTTC ACGAATGTAAATGCAACACGCCACTGTATCTACCATGTTGGCTTTTGGCG ATTTCGCTAAAAATCTATATCCTTGATCTCAGCTCCTTTATTGTGATGTT TCGACAACCAAGTTTCAGTTATacctaaaatatttgttgtCAGTGTGTAA TGTCAGTAGGTATGAACTGATGACGGTTTTGTTTGTGGGCACAAGCCTTG GATATTAAGAATGAATATTTTGTTATTGGTGTAACGTTGGATATTGATGG TTCGGTATATGGTTTGTTcggttgaaattattttttggattGCATCAATG TTGTGGAAGGATTGGAGGAGGAATCTTAGTTGATTGGTTGATGATTTGGA AGTGAGGGGCTGTTCATTTTGTCTCGTATCAGTGACAGCATTTCGTTTCT GAAATTGTCCAATAGTTTCTGAAAATCCCCTGTTGAAGGTGTTCGGTGAG CTGATCTTTCTTTGTGTAGGGGGCTTGCGCTTGGTGCCTTTTACATGAAC AAAATTACAGTTGTCATTGAAGCACTGACTTATTTTGATTGATGATGAAC ACATTCTTGGATGGAAATGAGGGCATTTTGTTCCTGCGTTGCATCCTTTA GGGCTTTTTGTTGCCATGTCTCATCAGCTTCGGACAAGCTTTGGATGTTT GTACTGGCACCGTTTCCTTTAATACATGGTGTTGCATTTTCCCATTTTAT AAAAATGCAAATAAGTTCCTCGTTTCGTTATTTTGAAAAGGTTTTCTTTG GAGAAAACTCACTGCtttgaaaaattgttatttGTGAATTTGTTTCTGTG ATATTTCTGAGTAAGCATGATACTGTTTTGGATTTCCTTGAAATTATTTC GCATAAACTCAGTTCTCCTAGGTAGAATTCGCTGTCCTGTCTGTTGGTGA CCATATTTGGTGATAATGGTATATGCGGAAGAGTTCTTCTTGGTGAGGAC TACTAACATTTTGGTTAATATCTTTAATTGTATAGGAGATCGTCGTAATA GGGTTTCTTTTTGGTAATGGAGCCGGTGCGTTCAAGAATAGATTTTGTTT TAATTGCAGTGATTCTTCTTGGAACTTGGTTGGTGGTGAAGTTTCGTGAT AGCACTGGTTGAGGTTTGAGTTTGGAAAGTTGGCAATTTTCGTTGGCTTG ATGTGCCATATGTAACAGACACCTGGAATGTTGAATATGGGAAATCTCAA TTCTTTGTTTTCAGTCATTAAGTTCAACTTTTGATGGTCAATATAGCACT GTTTGTGAACCTCTTGGCCACACACAATACAGTTAATAAATGGTTGATGA TCGAGTTTGATTCTGTATGGTTCAGTGCAGATTTGACAaatgtcttcaaa ataatttttattttaggcaAAGCTTCTTGACAGCTTCATCTTTAAGTCGG ATGGTGTCGACAGGAGCTTTGGATAGAAAAGATAGAGTGTCCATAATAAC GTCCTTGTTGAACGACGATTTCAGAGAATTTATGTTTTCTTTCGTTGGAT TTTCGGGATTGTATGATCTGAGGCAATCTCTGATTTTAGGTGTTGAAGCC TGCTCTGCAAGTTCAGCGAGGGATGTTTTCCAGCCTTGAATCACGTCCGA AGAGACACCGTTAACTTCAGTAGATTTAGACATTTTAGGTAGTCTCCACA ACGGAAACCAGAGACTGGAGCACTTAACTGGTATATAATGAATGTAGTAG GAGTCAGTCTAAACCATAGAATTGCgaaaagatgaaaagttacctgATCA GCTGCACATGGGAATATCAGATTCACTGTCATGTGCAGCTGTTCCTCAGG ATTTGGCAAAATGCCTGGGTGACCAGCCACAGGACCCTTGTTGCTGACTT GGAAGTAAAAATATAAACGTATACCTCTATGATCCAGGGCTAACCTGGTG TGTTAAAGCAATGTGGTCTTTAGTAATCTTTTCTTGCAGAAAATTATGGT ACCACAACTGGTCCAGTAGCGATTGATGTTAGCCAGAGATCCAATGAAAT ATATGGCcaatttttgttattatttgatTATCTTTGATATTGATCCAATT GATACAATACAACCAATACCAAAAAATGAACTTCGCACTTCTCTAGACGA AGAGTGCCAGGTTGATCGCAACCCTGTTTAGTGCTGTATTTATCGGATTT CACAGCATCTACCgttctttttgtactttttatcaatcttattcactaat tcttaatggagtgaatttttttatctgtatcTGTATCtgaactagaatga tatcaaagttaattttcttcaatcaacagataaaaatcacttttgaaaac ccaatcataagaatgtgtactgtgaaactgacagtgcttccctcccataa agaatacataatgcagattgaaggtgaattccaaaatgaaattgaataca gtttcagtcatttgatttgaaatttaaaaagtaagtaactttggactggt ggcataatgtagatataatttatttatatcaaaggttactgaaaattatc tgaaaaactttaacaatctttatacgtgtttctgcaaaaagttttcagtt agaataaaatttcttcatggttactaaagatatgaatttgatagttgctc tcaaaattggcagttgaatcagatacttttaataaaggtattaattttca gggattaaaaatttcccagatttcacagcctttgtttttatttacgaaag accataaaataaaatcctaagaaaatctgaaaaggggCCTTCAGCAAAAA TTAGTCACCATGAAAGTATTAAAACATAATCTAATCCGCcactgtacaca attttttctattgctGTAATCCACTTTCACTTCCCTGGCAAGCAAGAAAG CGGAGATTCTTCAACAAAATGACTGTTaatacataaaaataccaaaactt attttatcgctttttgaaaattacttaACCTTTAgacgccgagagacgta ccacgtacgtcatatatacaggccgagagacgtaccacgtacgttttgat actggggtcctttcaaagtttaataaaataaagaccagtttgaatttttc tattctgtaaaatttagcagacaggataggggtgaaggttcattcattca aaattttacgggtcctgcttttatacatctcgagatatcggaactcaatg tcggtgtatttttcaaatgtcaacaaaacatcgttttagtggtggacaga gggtgtttgatggatttttggactgaaaagtcatgtttatgtctggattt tcttggtttcagcatataaatatcattatatgagatagagaacctttatt ggCAGTTTCTATGTGGTTTGAAGGGGTTTTAGGGGGTATTTCCTGCCTAA AATGCCTATCTCTAGCTCCAACAACTCAGGGGGGCTGTTTTGCCTCAGTT TTTCCACTATTCtggtgttttattgcttgaatttacatgatagagagtct gttatgattattgtagtaattttacaggcttagggtaggtgcagggccaa ttttagagcaacgggaccacttaatttacctgttgtggccagagtgtcga ttttggtggaaaagtgtgcttcaccgaaacttagattctgagatgaaatg agcttcttcagccctgaaatttcacacaatggtggcttattacataaact aaaacaaaataatttttctgggaccaatctttaccttgtacccacttttt tcattcaatttgtcaaaaaaaagaaaaaaagtgaaaaaatcgtaaacatg gaatttttactgttttgatttaagtctgtgtagtcaggtttaaaagggtg atgaggcctctttttggtattatctgaaaaaatagatccttagcttttca aaatgggtttactttttacttaagctttagcggttcagattttatgacat tttccgcgaaacctccattttcatgaaaaaaacagcggcagcagcgcgcg ctgtttttaaaaacagcggtgtCTAAAGGTTAACGTGGGAAAACACGAAA ATAATTCCTTAttgcaaaaagcttaaattttgtgGATAGTGGATGCCCAA TCGTGAGTACAAATTAATGGTAGAATAAATTATTATGCAAAATTAATCAA TGTGAATGGCTGAagaattgccaaatttaaataatGCAAATTATGTCGGG CCTAATTAATTAAAATCCTGCATTAATTTGTCCTCGCATAGATTCATACT CTTAAGGTAATTCCTGCGAAATATAAATTGATCCAATTAAAGTAGTGCCA GACTTTGTATTTCAACAAGTGTGTTTGTTTCACTCCTATAAAAACAGATT CATTTTGTCTTCAATCCATaccaccgtcaacatggttgaaaacttttcac ttcacaggtaggtacaacattgtgtttgtattttacttgacgtctggttc taaaaagtcaaaaagtttgttcagttttgatttgagcaaagtatGCTCCT GTGTTCAACATCAACACATACAGTGTGCAGtggtggtattagtagagaga gtgttcgaatctgttcataatatgaggctgaaaatcttcggcgtacatAC TTATCGAAGTACCCTTCTGGCACAGCAGTgacataaacagcattttcaaa gttttctaaAGCTTCAAttcaatattggcgtaaagaattatttacaaaat agcatcaaatactccataatccattgtttttctgctttttttctgattct gtttacatttttctgctcgctgctCCCCATGCTCAACCATTTTTTGCTGT ATACACTGTGCTgcaaatgtccacgagaatgaatcagttcatgttagtca tagtataATCTCATTGGCATGTCTCGCTCACTAAACCTTCTGTAAGCTAC TCAATTTTGAtaccagtttttggcacgttttggcgcaaggcttactcttt gaaaaattactttggCGCATGCAATATCATCCATATAGGGTACTCTGTGG GTTTTGTCTTcccaccaaaaatttcaatttaatttccttcaaaatgaagt cactatataggtaaacaatatgaattaacggtcaatttcccttttgtcta tgcctttataatatcagtAGGGTTTCGGTAGAGCAGCGCATAACACTGTG TGTAAGACACTACTCTACTGTCTGTCATTACATTGAAGATGTCCATCGTC CATTCTGACAatcgtataaggtttgatccaatatcagtagtttgatagtg ATTTattcagtagcaaacaatgtccctcaagtaactccagttgagcaact acgttaaaaagatattaaccaagcaaaaatgtTGTGTGCTGTTTGGTTTG TTGTTTGAGAAAGCTTAGCTGCGTGGACTGGCGGAAAGAGTTACATCGGA TCACCCAAAGtaccttcatgtttttattttattttcttatctctgatcct gtctttctcttttctgactgtctgagtttctgagtttctgagacttagtt tctcatttctgactgagttttcatacctgtcaatcatttgtccatcaatt tcgaccaacctAATTTTCGACCCGAgcgggattcgaaccaccaccaaaga aagaccttcagattcggaagccagcgctctatccattgagccatcgccgc acatcAAATCcacacaattcataacatattataccgaactggcaaaagac gggggtaatgttattataatatgggtaaaagtaccccttttttaaacctg actgaaattcgagccgttactagcaaccctgccgggcccaaggcgccgag tatgcacccggcacagtgacaagccgttactagcaaccctgaccctacct aactgttagttaatcaattccaaacaacaaaaccccgggaaaggtgacta tcagcgatccgtggataaaaaaataaaaaaatgaaaaataaaaaaatgaa ggtaacttatggtgatccgatataactctctcctggactggcagtgcaga cggaactttcgatttctcgctttcacaaatgctctgtgtaaaatgcacga aagttaaaaaaaatatcacgaaaaaaatcTGACGAAACATGAATCTGAAT ATTTTTCTCGCCCCCTCCCACTGTTCGTTTTCGTtcgctttttgatattt ttttatgacgctgagtccagtgaagtagactaggagcatttgacgaggtc atcattttggagaaaaaaaatatttaaaacccaaataacaaaaaagctac tcaaagttgaaaaatataattaagaatgaggaacaaacatcaataacaga ttttgaatccctttttttcaaataaaaacattacttcgttctttttttac ctggcaaaaacaacgaaaatttGGCGGACTTTTTTACAGTCCACctaggc aaaagcatattaccatatactaccgggccacttaatcgcgccatccagtc tataaaaaagctttaagtggaccccgggctagtcTGGACCTAATAATCGT AGTCGAAAAAATATGTTAGTTCCttactttcttatttttttacagaGGAA GACTTGAAGAGGGACAATTTGTTACACATATTCCCAGTCTTTTCAGCTGA ATGGATAGTTCAGTTCAAATTTCATTTAACAACGATCAACCCTGGTTGGT GTAATATCATATTAATGACAGCTCAACCAGACTCAATTCATATTAATTCT CCCAGATATGGTTATCGTGTTCCCTCTGTATATATCGACGCACGTAAGTC TAAGTTTACACTGTCGACTAAAAGACTAGATTCGTTTATAATCCATCATA Taatcatgatatgcaccactgcaatgacttcacgaaattatgcgactttt ctgtttttgttccacccaatacatCACTTTTTCTAATGTTTTAAAGTGAG TATtgggtgaaaaattttaaatactctcataagactctccagtggtgcat tcATATTATGAAtaaaggctggtctccactttcgcgagaaatgggcgaca gtttttttcttaaccttttttgcataaagaaaagattacgtcataaaaaa gtttcgcgcgaacaaaaaaaaaattgaaggaagttctacttttttcataa gttacatcaatttcgaccaatggaattgcttcatttttcaaccgaccaat gaccttataCAAAAACGTCAATTCGCTCATGCCAcacgaaagtggagacc agccCTAGTAGACCATCACTATCGCCAAAACAACGCTTTGCTctaatata cacgtttttttataagactggtgtttttccaattcatcatgaacattctt aacctttttggaaaaatattgttACGTTATCCTAAGGTTTAGATCCAAAC CCGTTTaaaatctagcatgtaatacatacctcaagcaaaaTTTTGGCAGT TTTGTAGAACCTTTTAGCATTGCTCGGAAATAATTGGTAATTTAAtggta aaatgctctaaaaaagACATTACTTcgcaaaacaatacgtcataaaaaat ctgacgttacaaagttacactacaatgcaatgccagggtattatctagcg ctatcagtaagcatcaaaaagctaatAATACTCAGAGAACGAGTTTGGGT ATTCTTATCATATTCTTAATTATTTGGCTGATTTCatatatattcttata aaaaaacgtgtacccagggggggaggggggtcagtactaaaatgtaaaaC ATACacgagtactaaaaggattttcgctaatttttgacatacccccacct atttttcgaaaatgttattttagtacacatgtactaaaattattttgagc aatttaacatagataccacccattttttgcccttttacggctttaaattt accaaaatggggtcattgttacaaacctagtcgaatttagtgcatcaatc tgcaaaataatataattttattactaaactgtgctgaactgtacataaaa atatttaaaaaaagggaaaaattctgaaagatttctgaagattttttcga aaattcctgaaaaaaaaaaatcaaactttttccaaaattgttaaaaaaat gctccattttggctgattttagaacaaaatagtaagatttttcaaaaatt tctttaagagaccaccctttttggtattttagtacacatggtactaaaat tatttttgagcttttttgcagtaccaccacgtcactaaatgtcatgatgt ctgagattttagtaccgacccccccccccctggtgtACCTCCTTCGTTAA TACTCATCACGTCAGCGGACAATTTATCTTTAATCTTTATCCTGGAACCA AGAGATACCCTTTTCCTGCTTCACgcaatttttcttatttatccAAAGTA AAATCCCCCTCAGCTCTGATAATTAGCTTACACCCAGAGCTAATTGACGC TAAATCATTGGATAATcgaactactttaatgggaatAAATTTAATGGGAC TTAGTTTCGCGGATGGTATTTTCGTGGTCTTTCTACTGCTAAACTATACT GGctgttgaaatacgcattatcaGCTCTTCTTTTATACCAGTAATCATTT TAACCTTTAGgaccgtccacatagtacgtacgcactaaaatgtcgaaaat tacCCCCTCCCCcatgtacgcaagcatacgcaaatggctatacccctccc cccttagtgcgtacgtactatgtggaagGCCCCCTTTCCGTGCCCAGGAA GGGGGGAGggcaaaaaaaatgacaaaagttttTGAGGCGATGCAGTTGTT TTCGGcgggagaaaatgaaaaaaagtattttgagcAGCCGATGTCATGTA TATTTGTCCTCCTCAGTTGTTAGCCGCCAGGCCCAATGTCAAATATAGTG GACATGGGCCTGTCGAAAAATTTCCACAATGTCAAATATACTTGACATGG GAATTGAAAAGGTTAAAAGTAATTAtctgaaatttttggaaatttattta GAATAATTCTGTGGACTTATCCAAATTTCTGTTATTATGGGACTAAATTA ATTCATTCCTATTAAAGTCATTGAATATAAACCATGTTTTGAATAAtggt tttttgatttcttttaaagaaaataacagGTTTGAGATCTCAAACTCTGT CAGTGGAAGATCGCAGTACTCCTATTTTCATAATGGCTTGACACAGAAAA CAATCTATGAAATGGAGCTTCATCAACGATACAAGAGGGGAGGTGTTTAT AAATATTCGATAATCATAAACGGTGAAGAAGTCCACACGGCCGATAATAC GCAAGCTGAACAGTTTTATAATGTGAAAGTATGGGGTGCTACAGATTGGA TGAAAGCTTGTGTTGGCAAAATGAGTaattttaaaatcacacaattttga cttgtaatttcttttttgtttatttgcaacacctttttcatttttcattt tacacGGTACTATTCTAAcgaaccttaacttggctctgAGCCTGGAATCC CTTATTTTTCGAGAGAATTTCAGCCTTAAAAGTCCTTATCCAGTTCCTTG TTTacttagctgctaagtttggatttgcTTAGTATTTTTGTATTCTGTAT AAGTATAATTTCtgtatattttctctttttgacaCATTAAATGTCGTATT CAGCAACATTTtatcatctttttgtttacGTTATTGAAAAACTGTGAAAA GTGTCAAAGTTCAAGTTACTCTTAATGTTCCTTAAGTTGATTTCTTATTC tgagcctgagcagttccttagcCATTCCTTATgttttttaaactattttc agcctcgagctccttataaacgtgttccttatataaataaaaaacgtgtt acTAAAATTACAATTGTCTCTCGTTAATTCGAACTTAGGCTGCGCGCAtt cccagaatttattttgatagatcaaaatatatcagaggggatgcgtgcag tctaattcgaactcgaatggGGATTCTGCAACTGTCCTCAGGACCTTTGG GACCAAGAGGATATATGTAtatttggggtgtatttggtatattctcatct cgggacctcgggacctttgggACCAAGGGAGTACATGTATGTTGTGGGGG TGTACAGCATAATATCACGAATATAGAACtggttcggtaaaatacacaGG AAGAAATCTTTAGCCGACGTTTTAAAACTCTGCCACAGTCATCATCATCT GCCACAATGAAGtgtaagcccgaagggctacaatcgaatctccttggtag gatttgaagtgaacaaatcctaccaaagttgcgcagcCTAGCGCGGCCCG CTAGATATTTACACGAAtggcagattgaaactaaaatttaccgctaaatt tcgaaaaaaaatatcactcgaaaacaaaagaatacacctttcccgaattg tttggtatttttcgaaggtcttcaaactatattgaaaactatatatttgt aTTCCTCCTATAAAGGCAAGGACatgctgaaaatttcagctcaaaagctt ttttctatcattttttatgactgttttGTTCAcggtgaaaattaaaacat acagTCCGGCCTCGTTTCCATATAATTatattgtttataaagaaatttct aatGACAATAACTCCAGAAGCGGAagtgcttttttcataattttttttat ttgtttagttttgagacataaaattttatgaaactaaaaagaatcttcca aacattaaaacaaaaaagtcaaaaagcctaaataacaattcgggaaaggt gtactTAAGGCttgactttttcttgcctgagaaaggttagagattcgatt ctagcccttcgggcttatacttcattggtcggCCCAGCGAgggggggCgg ggcatccactaacggatttgtGCTCCTATTCATGGTTTTTTGTAACCATA AACAGCATAAACAAATAATACCAGGTGTAAATCAACCACCATATATCTTG AATCACCGACGATGATTTATAAAGAAAGTTATGGTGATGGTTTATATGAA ATTATTAACGAAGACCGTCACTAACCTTGAcagccgacggggacgtgcca ctggagtctgaaaagtggaccctgtcagatagaTATGAATGCTTGGTATA ATTTTGGGACCTTTTcgaattttcaccctgaaaagtaagaaaaattgaaa aaattaattataattttcacctgccctgaaaattgtccaaaataaccaaa agttcttttaacacaaaaaaCTATAACTATGTTATaagcgtagcgagata ccctgcaaaatttatgagggagtacagacgtttatgacatattgattatc ttttgataaaacaaagacaataattacagtgtagtgaaaaccgctctcat ccattaattttgcagggtatctcgctacgcctataaTATAGTTATAGTTT TTCCTGTTAAAAGGCATGGACAGTTCAGAAAATTTAATTCACTCAtctaa atgaaaataattgGGAATTCCACGGAATACTACATTAAATTGAGCGAGTT GAGGTAGATCAAATTTTGCGTGACATTTTTTCGCGAATTGAGAATTTAGA CATTTTATTTAGCGTGGATCAAATTTCGCGTGAAAATTTTCGCCAATCGA GTATTTTTATTTAGCGTGGAACCAATTCACAAATCGGCCTCTTTTTTAAC GTATTTTTCTGACTCCTAAcggttttgacaaaaatttagatttaccGAAT GCGGAAGGATCAAATTTCGCGAAAAGGAtaaaaaatatgacgaaaaAGGA TCAAAACTCGCAAGACTAACAGAAATTGTTCAACGCAACATTAACCATCA ACTCCAAGTGGTATTGAGATCGAGTCAAAATCAAGatgaattttcaagat ttgttTTCGACACTATTGCTGTTATTTGCATTTTGTTTCCGCCTTAAGGA AGCATCGAAATGCAAGCGCAAGGTAAGATTTCTTCTGGTATTAACTTCCC TCTGATATTACCTTGAGAGGATTAATTTTGtcaagaactaattttggtaa TGCGGCAAAATTACTGCCTCACTGAATAAATTATTCTCGCCAAAATTCAT AGATTTATATCCAAAATAACACgcaatattttttctgaaacaacCATTTG Agatttaaggcttggggacacaagtttttttcgcgttggtgcaatgcaac atactccatcccaccaacacaagaagaAAAGtgtgtgtcccatggtttct ttaaACGTGGGGTTGAGACatgagaaagcgtttcaggttggtgggatgga gcatgttgcattgcaccagcgcgaaaaaaaattttcgtgtCCCAAAGCCT TTACTGTAAATTACTTTTGCACCAATGTAAGAAATTGCGCCGCTCACAAA AATAAGTTGTCGTAAAATTTAATCATTCATGATTTTTACTCTCTCCAAAA AATTGTTCTtgctaaaaattaagaacaagttaagaatattttaaggcttt gtggactctaaaacaccctatttctaagtaaaattggacaaaaatgctca caaaatggtgaaatcaaaaatgttaagaaaattatttAAGCTTAGTTCCg aagttttgattttcttaaaaagaatgTATAAAATAGGTCCATTatcattc gttttttatttttcaggttcCAGAGAATAATCATGGCATTCAACCAATCA CATTCATCAACCAAGGtgattcttcttttattttaaagattttgcaaatt aaaaaaaagcgaaaatcggGTCAATAAAATACCCTAAAAATGTAATGGTC TTAACAAAATTCAGAAAAGCCTTGAAGTCTAAGATATTTTAAAGTCtagc ttaaaaaaaattctccgaTGAATATATTTTGCCTCACCGGATATGAGAGA AATTTCTTTAAGAGTCtccagtttcaaaattttgaaaaattattatatCT TCGTTTTACCGAGTGATCGAAcccataaacatttttttaaagctcAGGAC TGGAGTTTTCAAAAGCATAAAGCGCAATTTCTGACACCACCCATCGTGTC TAAGACAAGTGCTATCACTTGTCATAATTTAGCCATGGAACATTCAAAAA GTCGTAGTGGTTTAGTGGTGATCATCCTTGACTCCTGCCTCGGAGGCCCG AGTTCAATGCTCAACGTgtcactacgattcacttggcaagcgAATGTACT TTCACCCGGGTCAAACCATGCCATGCAAAGGGAATTGGGTACTGTTACTC TAATACAAaagtgtgggtagattagactGGCATTGTGACGTGTCGTATGG CACtcgtgagcatcgctctcccagtgttGTTATCGAGTGTCAGGatatac gccatggcttggcagctcgcaTCTGTCACTTCCGggtcaagtcgcagtgt ctgttACTCCCAAAggggtaggacccatcccgaatgcattcgaAGGGGTC ATGCCTAGCATCTCTATCTACATTTACGTACGCACTTTAGTTGAAACAAA AAGATGTGTACGTTGCTAACTACGTCACTTCATACCCTGTGTGTATTTAT ACCTAAAGACATACGTAGGTCATCTAATATTTCCAGCTCAAACCAAACAA CCCAAATAGATACATGTATGCATGCataatttatcgttctttaatCCGCT AGTGGTTAAACCAGCGTAAAGTACAAATAGGAATGCGCAGGGGTGATATC ACTTCTAAGATCAGGGGTTAAGATGGCAAAATATGTCGTcctttgtcgtt ctttttagatgagcTAGCTGGAAACGTTAGCTGAATAGTCTCTAACTTAA CAAGTTCTTTaagtaaaaattttcgaaatcgtTAATTACGTGAAAATTAT TCCTGTGTCTATTATAATAATCGTAGTCGAAAATTACGTTCACTTAATGT AATTCCttatatcttttattttttttacagagGACGATTTGAAAAGGGAC AATTTGTTGCACACATTCCAAGTCCTTTCAGCTGAATGGATAGTTCAGTT CAAATTTCATTTAACAACGATCAACCCTGGTTGGTGTAATATCATATTAA TGACAGCTCAACCAGACTCAATTCATATTAATTCTCCCAGATATGGTTAT CGTGCTCCCTCCGTATATATCGACGCACGTAAGTCTAAGTTTACACTGTG GACTATCGAAAGTCTAAGTTTACATTGTCTACTAAAAGACTGAAGTCGTT TATAATGGGctctcttccagaaaatgtccgtacatgggggggggtcactt tttcttgcctgagaaaggttagagattgaactctagcccttcgggcttta aactcaatggttgggTATTCTTATCATataattatttggctaatttcata tatattcttataaaaaaacgtttacctCCTTCGTTAATACTCATCACGTC AGCGGATAATCTTTATCCTGGAACCAAGAGATACCCTTTTCCTGCTTCgc gcaatttttctcatttatCCAAAGTGAAATCCCCCTCAGCTCTGATAATA AGCTTACACCCAGAGCTAATTGACGCTAAATCATTGGATAATcgaactac tttaatgggaatAAATTTAAtggtacttaatttcgcagatTGTATTTTCA TGGTCTTTCTACTGCTAAACTatactggttgttgaaatacgcattatcaG CTCTTCTTTGATACCAGTAATCATTTTAACCTTTGGgaccgtccacatag tacgtacgcactaaaatgccgaaaatcgagtaccccctccccccatgtac gcaagcgtacgcaaacgGCTAAACCCCTTCTCCCTTAgtgtgtacgtact atgtggacagcCCCCTTTCCGTGCCCAggggggggggatggcaaaaaaat tgacaaaagttttcgaggCGATGCAGTTGTTTTCGGcgggagaaaatgaa aaaaagtattttgagcAGCCGATGGCATGTATGTTTGTCCTCCTCAGTTG TTAGCCGCCAGGCCCAATGTCAAATATACTGGACATGGGCCTGTCGAAAA ATTTACACAATGTCAAATATACTTGACATGGGCATGGAAAAGGTTGAAAG TAATTAtctgaaatttttggaaatttatttaGAATAATTCTGTGGACTTA TCCAAATTTCTGTTATTATGGGACTAAATTAATTCATTCCTATTAAAGTC ATTGAATATAAACCATGTTTTGAATAAtggttttttgatttcttttaaag aaaataacagGTTTGAGATCTCAAACTCTGTCAGTGGAAGATCGCAGTAC TCCTATTTTCATAATGGCTTGACACAGAAAACAATCTATGAAATGGAGCT TCATCAACGATACAAGAGGGGAGGTGTTTATAAATATTCGATAATTATAA ACGGTGAAGAAGTCCACACGGCCGATAATACGCAAGCTGAACAATTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:1845713..1868310+

>MSTRG.1077.1.p1 ID=MSTRG.1077.1.p1|Name=MSTRG.1077.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2124bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:1845713..1868310+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATTTTCGAGATTTGTTTTCGACGCTATTGCTATTATTTGCATTTTG
TTTCCGCCTTCAGGAAGCATCGAAATGCAAGCGCAGGgttcCAGAGAATA
ATCATGGCATTCAACCAATCACATTCATCAACCAAGagGACGATTTGAAA
AGGGACAATTTGTTGCACACATTCCAAGTCCTTTCAGCTGAATGGATAGT
TCAGTTCAAATTTCATTTAACAACGATCAACCCTGGTTGGTGTAATATCA
TATTAATGACAGCTCAACCAGACTCAATTCATATTAATTCTCCCAGATAT
GGTTATCGTGCTCCCTCCGTATATATCGACGCACaaaataacagGTTTGA
GATCTCAAACTCTGTCAGTGGAAGATCGCAGTACTCCTATTTTCATAATG
GCTTGACACAGAAAACAATCTATGAAATGGAGCTTCATCAACGATACAAG
AGGGGAGGTGTTTATAAATATTCGATAATTATAAACGGTGAAGAAGTCCA
CACGGCCGATAATACGCAAGCTGAACAATTTATGAATTTTCGAGATTTGT
TTTCGACGCTATTGCTATTATTTGCATTTTGTTTCCGCCTTCAGGAAGCA
TCGAAATGCAAGCGCAGGgttcCAGAGAATAATCATGGCATTCAACCAAT
CACATTCATCAACCAAGagGACGATTTGAAAAGGGACAATTTGTTGCACA
CATTCCAAGTCCTTTCAGCTGAATGGATAGTTCAGTTCAAATTTCATTTA
ACAACGATCAACCCTGGTTGGTGTAATATCATATTAATGACAGCTCAACC
AGACTCAATTCATATTAATTCTCCCAGATATGGTTATCGTGCTCCCTCCG
TATATATCGACGCACaaaataacagGTTTGAGATCTCAAACTCTGTCAGT
GGAAGATCGCAGTACTCCTATTTTCATAATGGCTTGACACAGAAAACAAT
CTATGAAATGGAGCTTCATCAACGATACAAGAGGGGAGGTGTTTATAAAT
ATTCGATAATTATAAACGGTGAAGAAGTCCACACGGCCGATAATACGCAA
GCTGAACAATTTATGAATTTTCGAGATTTGTTTTCGACGCTATTGCTATT
ATTTGCATTTTGTTTCCGCCTTCAGGAAGCATCGAAATGCAAGCGCAGGg
ttcCAGAGAATAATCATGGCATTCAACCAATCACATTCATCAACCAAGag
GACGATTTGAAAAGGGACAATTTGTTGCACACATTCCAAGTCCTTTCAGC
TGAATGGATAGTTCAGTTCAAATTTCATTTAACAACGATCAACCCTGGTT
GGTGTAATATCATATTAATGACAGCTCAACCAGACTCAATTCATATTAAT
TCTCCCAGATATGGTTATCGTGCTCCCTCCGTATATATCGACGCACaaaa
taacagGTTTGAGATCTCAAACTCTGTCAGTGGAAGATCGCAGTACTCCT
ATTTTCATAATGGCTTGACACAGAAAACAATCTATGAAATGGAGCTTCAT
CAACGATACAAGAGGGGAGGTGTTTATAAATATTCGATAATTATAAACGG
TGAAGAAGTCCACACGGCCGATAATACGCAAGCTGAACAATTTATGAATT
TTCGAGATTTGTTTTCGACGCTATTGCTATTATTTGCATTTTGTTTCCGC
CTTCAGGAAGCATCGAAATGCAAGCGCAGGgttcCAGAGAATAATCATGG
CATTCAACCAATCACATTCATCAACCAAGagGACGATTTGAAAAGGGACA
ATTTGTTGCACACATTCCAAGTCCTTTCAGCTGAATGGATAGTTCAGTTC
AAATTTCATTTAACAACGATCAACCCTGGTTGGTGTAATATCATATTAAT
GACAGCTCAACCAGACTCAATTCATATTAATTCTCCCAGATATGGTTATC
GTGCTCCCTCCGTATATATCGACGCACaaaataacagGTTTGAGATCTCA
AACTCTGTCAGTGGAAGATCGCAGTACTCCTATTTTCATAATGGCTTGAC
ACAGAAAACAATCTATGAAATGGAGCTTCATCAACGATACAAGAGGGGAG
GTGTTTATAAATATTCGATAATTATAAACGGTGAAGAAGTCCACACGGCC
GATAATACGCAAGCTGAACAATTT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1077MSTRG.1077Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1077.1.p1MSTRG.1077.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1077.1.p1.exon1MSTRG.1077.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1077.1.p1.exon2MSTRG.1077.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1077.1.p1.exon3MSTRG.1077.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1077.1.p1.exon4MSTRG.1077.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000005_pilongenomesc0000005_pilon:1845713..1868310 +