MSTRG.10761.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10761.1.p2
Unique NameMSTRG.10761.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000076_pilon:204128..230837-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10761.1.p2 ID=MSTRG.10761.1.p2|Name=MSTRG.10761.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=26710bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:204128..230837- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACTCGTTACGATGTAAGAACAAGTTAACTTTCCTCATTAATTATGAAAAT CTCGGATGTCCAATATCGCTATAGTATATGCTTTAAACTGCTTAAAAAGA GTTTTAAATTTCGTTTTACTAGTCCCAGATGGTTGAAGAACAAAAGAATC TTCCCACTAGTGTCTATTATCTTGAAATTACCAGTTTTTATTGCCTTATT GTTTTCTTTTTTCATTTGTTTTATAACAATAAAAAAGGTTCTAGTTTTGA TATGTAGCCTATCGTGATGAGTACTGTAGGTAGAGCTTTTACAGTTTTGG TATTGTGGAAGGAAAGCAAAATATCTATAAATTACATGAAAAAGAGCTTT GCTTTGGCTTCCGAGCTAGCAGAACAAACGATTCTCTTGGGAATATTATT AACCGTTTTTTAATTTCTCCAATACCTTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGG AGAAGTCACGAAATTTTGAGCAAGTGACGAATATTTTCCCCGACGAAAAT TTTCCCCGACGAAAATTTTCCCCGTCGAAGTTTTCCCCGATAAGGTACTC GAGAAACGAAATTTTGATCAATTTGAGACAAAAATTACATAACTCCGATC CCAGAATCACAATATTTCAGGCAGTCGTAATTTTGGGACTGACAAATTGA ATTTAACACTACTACAAACAATTTGCTCCTTTTGGTGATTACTGCTTGGT CCATTTGCGTATTTTCTGGAAAACGTTATTTTACTTTTTTTGAGCCTTTG CAGTCATTTGTAGACGTTTACCGGTTTTCATATTGGACAGTATTACATTT TTTGGGACAGAGAACTTCATCAAAGCCGTTAGACCATGGTTTCTGATGAA AGTGACGATGATTTAGTAGTTCGTAAGTTGATCAATCGTATACACGTTTT TTTTATAAGAACATTCAAATTTTCTGAAGCCCTTTGGATTTTCTTAACTT TTTGAGTTTTAGACTAAAAATTTTCATAACATGTTCTTATTCTCACCATT TGCCCGTCTTCCTTAGAAACCAGGTGTTTCAGACAAAGCCTTAAAATGCT CTTAACTTGTTCTTAATATTTTGGCTTTATCTTGTATAGCCTTATATGAA AGAAACGTGTAATCCGTTCACTATCTTATGGATGATGTTTTTTACAAATA CTCGATTCCATTGTTATTGATGGCTAAAGGTTTTGTTTTTAAATAAGAGT GATGTCGTTTGCTTACTCGTCAATTTTAATTCACAAGCTTTTACACATTG AATTGACACAGATGTGGAGCAAGATTGGTCGGAAAGAGGAAAATAAAAAC ATTTTTTGCTTATATCAGAACAATATAACAAAAGCAAGACACTGTGTTGA TATGAAATACGTGTCTGATATGAAACGGGAACAACTTATGTAAAAATAAA ACCTTTAAAAAGAAAAGATTTACACTTGAAAGTCGTCATCGAATCAGCCA ACTGAAAATGAACGGATCATAAGGCAGTTAAATAAACAAATGTAGTGTTT CCGGAATGCCGGTAAAGGGATAAAGCTCTCATGCGGCCGGCCGGAAAAAT TTTTTGTTGTTGCTATTTTTGATAACTTAAGATCATTGAAATAGGACTTT AAAGATAACTTTTATGTGCAAACAGTATGAAGTAAGCCCTGAATACTAAT GTATCAACTACTAACGAAAATATCTAACCAAACGACGTTTGATAGCTTGA ACGGTCAACTTGATTTTCTTTATGATGAACCATATAGATGAACCCATAGT CGGCAGCCGGGTCAGAAAAATTATTTTTTCACCCGGCTGGTTTCTGGAAA CACTACAATTTTTCACCCTAGTGATGTTGTTAGGCAACGTTTTAACACTA CAATGGGTTCTTTGCGGGTACCACTCTCATAAAAAACTCTGATCAATTAT GACGGATACAGTCCTTGGTTTATAAAGGTCAGTGGATGTTACATGACTCT CATTCCATACTCTTTTAATGGATGTTACATATTCGTGAACATTGCCGTCC TGAGAGGAACTGCGTCTCCATCAACGATAAATGTATATTTTATACAACCA AACATACATTACTTTTACTACTACTTCTTTATAAACTAGTATTGCCCCAC ACAATGGTTTCATATGTTATCTTTTATATATAGAATCATCACAGTAGTCG GTTCGCGCATAAGCTTACAACCCGTACTATTGACCGCGTAATGATTTTGG ACCACCGAAAAATCGATACACTCGGCGACAATCGTTGTAAGAAGAAACTT ACAACTAACTAGTGAACTGCATAATGATTTTCAAATGTTTTGTTTTTCTT TTTATATAGAACCACCGAAGAATCGTTACGCTCGGCGACAGTCGGTGTGT GCAGAAGCTTACAACCCTGACGAGTCTGATGACGAAGATGAAAAATTGGT AAGAGAGCTGTTTTTGTTTTTTGTTCTACGTGTTCCCAACATTCTTATTT AAAATATGAAAATCTTCTCTGTTCCTCTTGGATCTCTTCCGTAGGAAGTT TGCGATTTCCGAAATACCGAATAATCTTGCCAAAATTTCCGAATTTTCGT AAAAGAATACTTGCAATTCCGATACCGATTTCTTTGGGTATTTTTCCTCG TTTTGACTAGTTTTTCATCAAACTTGATTTTTCATGTAAGAAGGGGGATA AAAACTTTATAATACCGAAATTTCGAAGCAAAAATTCATGGATTTCCGAT ACCGAAACAATCTCAGAATTCCGAAATACCGAAGGAATTTTGCCCGATTT TCGAAATTCCGAAGCAAAAAGGGTCGACTTCCGCAATTCTGAAATACTGT ACGCCCCCACTCTTCCGTGCTGTGTTGGACAAAGTTTTCAATATCCTTGC AATGAAATCAACCAACAGTTTTCGTATCGAATTATTTCGTATTCGAACTA TTCACCATTCAAGGTACCTTATCGGGGAAAATTTTTGTCGGGGAAAATAT TCGTCACTTGTCCAAAATTTCGTCACTTTTCCCCGACGAAGTTTTCCCCG ATAAGGTATTTCCCGCTCGAATCCCCGCTGAATTCAATGTTCCGTCCAAT TTAAAGATAGCCAAACTACCTGGCCTTTGACCCCGTGAAACAGTACTCTG GAAGTGTAATATCGCTAGGCTATCCACGTAAAATATCATGCGCTTCTATC AAAATTCGTCGTTCCTATGACTAAAGGTTAAATCTCAAAATAAGTACCTT AAAAAACTCAAAGTTTTACTGTGGTGGTCATCTTTGAGATTGAGATTCCC TTTTTTTTCATGTAGAGGAATATTCAATGTTTTCATATGAAAAAAGGCCA ATATCAAAGGCAGAGCAGAATTGCAAGATTTCCAATTTTCAAAGACACTG ATTTTGAGATTGAACCTTTAGTCATGTGGACGACTTAAATAATAATCTCT ATAAAATCTATTGTTTTTTTCTTTTTATTTTAGGTCGTGCATCCAAAATC GGACGTCCAACGTAAACGGTTGAACGAAGCTGTCGGAAATATCTTGTTAT TCAAAAATTTGGACAATGTAAGTGTGCTATCTCCCCTCTCCTTTTTGGAC CTACCTCCGGGTACCCCGGTGGAGGTCCTTTGAATTAACCCATGTCCGTT CGTCCGTCTGTTCGTTCGTCTGTTGCCAGCTTTTCTCGGGATTGGCTCAT TAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAATGATGCAAAATGGCAATGCCCAAAA TGTCCGATTTTCGGAAAAAAAATTTTTATCCCGGAAAAACTGTTTTTTTG GCACTTTCTCGAGATTTTATCATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCTCAAAG ATGCCCAGAGTCCGATTTTTGAGAAAAAAATTTTTCCGGCCAAAAATGCC GGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTCTGGATTTTAATTGGACTTTTTC CTTATAATTGGTTGTGCTTTCATTCAAAAAACATTAATAATAGCAATGCC CACCAACATGCATGTTCCAATTTTCAATGAAATTGATTTTTAAAGCCGGA ACTATTCAAAAATCGCCGGAACAACCTATTTTCGCCGGAAAGACAGTATT TCTTAAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTTATGAAATTTTGCACA CTGATGCAAAATTATAACACCTAAAATGTGACGGGGCCCGACTTTCGAAA AACATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCGGGAAAAACCGGTT TTTTTGACATTTTCTCGAATTTTCATCCTTATTTTTCTCTGATTTTTTGC AGAATGATGCGTATTCGCAATGCTCAAAACATGACCGAGTTCGATTTTTG AGAAAATGTTTTTTCCGGCCAAAAAAGCCGGAAATTTCCGTTTTTGCAGA TTTTCATTGGATTTTTTCGTTTCATGTCTTTGTTTTTTCAAACAAAAACA TCATTTATAAGAATGTCCACGATTAAGCATGGTTCAATTTTCAATGAAAC TAATTTTGGTACAGGAACTTTCTAAAAATCGCCAGAAAAGCCGAGAATCG CCGGATTCCATAAATTTCTCTAGTTGTTCTTGTATTATTTTGCATTTTCA TACTATTGTTCTCATTTTTCAATTGTCTTATTACATCAATCTTCCGGTAG GTCCATTCAGCATGTAGCTTGTTCCTTTTTTATTCCAGGCTAAGATAAAA GTAGATTTTGAGATCAAACTGGCTATTTAGCCAGGAATAGTCTGAACCCC CTATGTTGAGGAGGTGTAATAAAAAATCCAGAGTAATCAGTATAAGGGCC AAATTGAAAATTCCCGTTTCTGTCACGGAAGGAAATCAGAGCCTTTTTTG GTCTATTTTTGAAAAATGGTAAACTTAATGAAAATAGTATTAGTCCTGAA TCAAAGCCTTTATAGTACTACTACTTCCAAACCAAAATAAATTTCATAAA AGTTTTCCCTCGTTGAATAATTGAACTTTGAAGGTTCTGTCACGGAAGGA ACGCAGCAAAGAAATTAAAAAAGACAAAAGTATACTGATTCAGATTCCTG TGAATTTAAAGAGAATTTTAAATCCAAAATACCACCAGAAAAAACTTATG TCTATCTGCTTGTCATTGAAAAAAGAACTGAGTCAAAAAAAATAATTTCA ATGGCTACAGCACAGGCCTTTGCAACTGAGAAAGGTCAGTGTCACGGAAG GACACCGTCACGGAAGGAAAAAATTCCTATTTTTCAAAATCAGCAATAGC GTAAGAAATATTGACTGAAACTAGTGGAGTGACACATCATATCATGAATC ATAGCCATTTTTACTATTCAGTTCATTTCAAAACCTTGGAACTGTATTTT TATTGTTCAACCATAATGGTAGGAAATTTTACAGGAAGGATTTATTTTTT AAGCAAAAAACGTAAAAACGCGACCTTACAAGCGAGTGAGCTACTTCCAA ATGCTCTAATTAGCATATTTCCATGGTGCTGAAGCGATTTAGAGGGTTTA GAACCGGCTGGGAACAGTAGTTTTGCCAGAAAACCGGTTTTTAGGCCTCC AGAGCCGCCTGGGCTTACGCTGTAAGCTTACAGCGCTTTACTGGAGCCTT AGTTAAGCTTATTCTGAGCTCCATACAGGGCTGAGCTGGTTCCCAATGGT CCTAAACCTCGTGGGACACTCCCTTGCAATGGATTAGACCCATTGAAGTC CAGCAAAGGGGGCAGAACCGACGAATTTTCACTAAAATAGCTTTAAAACG CTTAAAAAGCTCTATTTAAGCATTTTTTAAGGCTTTTTTAAGCAAAAAAC GTAAAAACGCGACCTTACAAGCGAGTGAGCTACTTCCAAAGGCTCTAATT AGCACATTTCCATGGTGCTGAAGCGATTTAGAGGGTTTAGAACCGGCTGG GAACAGTAGTTTTGCCAGAAAACCGGTTTTTAGGCCTCCAGAGCCGCCTG GGCTTACGCTGTAAGCTTACAGCCCTGTACTTTAGCCTCAGTTAAGCTTA TTCTGAGCTCCATACAGGGTTGAGCTGGTTCCCAATGGTTCTAAACCTCG TAGGACCCTCTCCTGCAATGCCAATGGATTAGACCCATTGAAGTCCAAGA TTTCTAAAAATAACAAGATATTTTTAATCCGTCACGGAAGGACAAGGTGA AAGTTTCACGGAAGGACAATAATTTCAGACCTTGTAAGTGAATATGAAGG AGGTTGCTTTGGAATGTAATTTCATTTTTTGTTAGGGGGTACCAATAGTT AGAACTTGCAATAATATCAAGAATAATGTACTTGCACAAAACTGGTGAAA AAACTTTTCGTCTTGAAATTGTCACGGAAGGAATTCGATATTTGAAAATA GTTTCTGCTTGCAGTACTTTTTTGTTGTTTGACTTATTTCAAAATGAATA AACCTATTAAACTAACTAGGGTATATACTTGTTTTAAAACAACATTTCAT TTTTGATTAATCATTATTTTTCAAAAGAAGGTCCATTATATTTTAACACT TGTCCTTCCGTGACAAACCTCACTAGTTGTGTTTTGATATAATCACCTGA TTACAGTCTAAAAGTGCGACTCGGTTGATTTAAAAGTTGAAATTGGAAAA TTTAAGGGTTATTTTTAAAAAAAATCACAGTTACTTATTTAATTTGTAAG ATTTTTGATTTTGTGTTTTGGTTGACCACTTTTCAATTTGGCCCATAACG AGGTTGAAAATCCAGGGTGGTCCAAAACAATGGGAGAAAAACATCCAAGG GGCTCCTGAAAAATTGAAAGAAAATCCTGGGGGTTCACCTTAAAAAAAAA AGACCTTCTCAATATAGAGGGTGCTTCATTGAAGCTGAAGATAACTGTTT TTTCTAGAAATCGTCAACTCATACTTTCGCGGTTGACTTTAGACTTGCTC CTATAGTTCTGGATTGAAACAGTCGATTTTACTTTTTGTTTGTTATACAG TATTGCTTTGGGTGATTTTATACAATATCTCTACCGTACTTTGCTAAAAC TCTCGAATACAGCTGAATACAGTCCAATTAGCCCAACAACTCACGAGACA CGGGTAAACAATATTTCACCAGATCTTCACAAAGTGAAATTATATTTTTG TTGGGAGCCTATCGAATAAAAGCGAGTTTTTTGAAATCGCACTCTGAGGA CTGTAAAGTGAATTGGAACAACCCGCAGTTCTGACCCGCAAAATGGAGGA CTGTAAAAGTGCTGCTTTACCGTTGTCCTCAGTCAGTCAGGATGTAGACA AATTAGAACCTTACCGTCTCTGTCGCTGAAAAACACACATACATAAACTC GGTATTTAAACGTTGAATTTGAGAGCGTTAATTGTAATTGAATAGTTTGA GAAGAACATTCAACACCACTGAACACCAGCTAGGTTATAATGCTACTGTA ATATCTCTTTCTTTATCTATCAGGAACAATTGAACAACGTATTAGATGCG ATGTTTGAACGTAAAACAACGGCCGACGAACATATTATCGACCAAGGAGA TGACGGCGACAATTTCTACGTCATTGATCGTGGAATCTTCGACATTTACG TCAAAATTGACGGGTCTGATAAAAAGGTTTGTATTTGTGGTGAAATATAA ATGTCGGTAAAACTCATTTGTCATCAAGTGATTTTTTCGTCACTTTCTAC CGACAAAATTTTTATTGTTAAGACAAACGAGCTAAACTAAGCTGGGTAGT CTACACAATTAGACAGCTCCAGGCTTTAAGGCCTTACTCTTGGTCTATAG GCACTGCTATAGGCGGCCACTAGTAGCCCCCACCGGGAATTGCTTATTTA ATAGGTTTAAACATAATAGACAACATTCACAAAAGATGTTTATTAATAGA GATTTTAAATAAAAGAATGTTTAAAACACAGCTGATTGGCTTAGGTTTCG AAACTCTCTATTGTTTCATTAAAACCTCAGTGCGCATGCGATTTATCTGG AGAATTTCAATATTCAAAACAAGAGCAGTGCTCGTAGCCCGAAGAGTAGG AGTTTTACGCTCGAAACGAAGCCTATAAGAAGGGTAGATCGACATCAGAC GAAGATATCTGTAATTACGGTTGTAGTACCTCAAATCTATAGGTGCAGTA GTGTTGTGGTTATTAATCTTAACAGCCGTCCACGGGGTAGGGGTTCGATT CCCACTCGGTGCTTTGATTTACTTGGCAAGTAAATGTACCTTCACCCGGG CCAATCCATGCCATTTGAGGGGAATTGGGTAGACAGAAACTCGAGAAGCC TGTTGGTGACTGTGCTAGGTATCGACTCCACAATACACCGTGGATAAGGC CTTGTTCCCCAGTGGCTCATGCCGGATCAACGCACATCATCCTAAAAACT GTGTGTCAGCTCTTGGTTCCTACGAGACAGACTCTTAGACCAGGGCATCC TCTGTAAGGAGAAACCAGTCAACATTTTAGTTTTCAACTTCTAATTAATT AAATATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCCACGGACCCAACAGCT GATTGGTTGAAAGTGACGTATTGACTGATTTTATGTCACTTACAACCAAT CAGCTTTTGGGACCGTGATGTAATGTTAGAAGACATTGCAATGGTGCATA TCATGAACTACTCCTGTTACCGTAGTAGAAACGTAGATGAACTCAATTTT CTCGGTTTCTCGACATTATATCTACTTTTCTCGTTTATAGGTCGGAGCAT ACAATAACTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000076_pilon:204128..230837-

>MSTRG.10761.1.p2 ID=MSTRG.10761.1.p2|Name=MSTRG.10761.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=636bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:204128..230837- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTAAATAAATGCCACGCGGCATCACCATAAGAGTTCAAGACAGCTCGAGG
AAAAGTCAGCCAATCCGAGGGTCCACCACATGGAAAGGCGTACCGCCATC
AAACGCCACGGGTGGTAAATTATTCAACGGGCGTTCATCAGATGTCTTGA
CAAAGAAACCAGCAGAAAAAGTAGTACAAATAGAGAATCCTTCAATTGAA
ATTCCAGAAATATGTCTTCCACCCGACGACGCCCCTGCGCCCTTGATCGT
GATCAAAGAACCACCCACTACCGCCCATCAAGAGAGCGAAAGTGAAAGTG
ACGATGATGAAGGGCTTGCTAAATAAATGCCACGCGGCATCACCATAAGA
GTTCAAGACAGCTCGAGGAAAAGTCAGCCAATCCGAGGGTCCACCACATG
GAAAGGCGTACCGCCATCAAACGCCACGGGTGGTAAATTATTCAACGGGC
GTTCATCAGATGTCTTGACAAAGAAACCAGCAGAAAAAGTAGTACAAATA
GAGAATCCTTCAATTGAAATTCCAGAAATATGTCTTCCACCCGACGACGC
CCCTGCGCCCTTGATCGTGATCAAAGAACCACCCACTACCGCCCATCAAG
AGAGCGAAAGTGAAAGTGACGATGATGAAGGGCTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10761MSTRG.10761Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10761.1.p2MSTRG.10761.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10761.1.p2.exon6MSTRG.10761.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10761.1.p2.exon5MSTRG.10761.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10761.1.p2.exon4MSTRG.10761.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10761.1.p2.exon3MSTRG.10761.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10761.1.p2.exon2MSTRG.10761.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10761.1.p2.exon1MSTRG.10761.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000076_pilongenomesc0000076_pilon:204128..230837 -