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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000076_pilon:163065..184308+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10758.1.p1 ID=MSTRG.10758.1.p1|Name=MSTRG.10758.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21244bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:163065..184308+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TATGTCTGTTTAGTATcgtttcagaaaaaataaataaaaaatagtcaCAA
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GAATAGTCGGGAACCTTTTGAAGATACTGGTCAGCCATTTTTTAATGTCA
GTTTGGATTGTGATATAATGCTGACTTTTTACTGAAAGGTTGTCGTGTTC
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TTATCTGCGATTGTTCGTTTCAGCTCGATTGAAATGATAAGCTTCCGTTC
CCAACATATGATTAGAAAATCTGTCTctttatgcatttttttttgcacat
tTGTCAGGAAAATGAGTGAAGAAAGAACGACTGTGTTTTGGAGAATGTCA
TCTTTCAATGGTAGAAGCTGGTCATATAACCAGTGTTCCACCTTTTCACC
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TTGGTGTTTCTTCAATCATTTGCTTGATCTGCtttttgaggtttttcgga
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ACATCCTTGAACAAAAACTCCTATATCCAAAGTGGTTTGTGGCAGGGTCC
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TACTCTAGAGATTGAAAACATTGTTGCCTCGCCTGTCTCGGTGAGGTTTT
CTACTCTAGAGATTGAAAACATCGTTGCctcccctgtctcagtgagaTTT
TCTACTCTAGAGATTGAAAACATTGATGCCTCGCATCATTTCTGACTCCC
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GGTTTTCTATAGGCTGAAAGCATTGTTGactcccctgtctcagtgaggtT
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ATAGATTGATTGAAAACATTGTTGactcccctgtctcagtgaggttttct
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ACTCCCCTGTCTCAATGAGGTTTTCTAAAGATTGAAATCATTGTCGACTT
CCCTGTCTCAGTGAGGTTTTCTAGAGATTGAAAACATTGTTGACTCCTCT
GTCTCAGTGAAGTTTTCTAGAGATTGAAAACATTGTCGACTTCCCTGTCT
CAGTGAGGTTTTCTATAGATTGATTGAAAACATTGTTGactcccctgtct
cagtgaggtTTTCTATAGACTGAAAACATTGTCGACTTCCCTGTCTCAGT
GAGGTTTTCTAGAGATTGAAAACATTGTTGCCTTTCTTGTCTCAGTGAGG
TTTTCTTTAGACTGAAAGCATTGTTGactcccctgtctcagtgaggtTTT
CTATAGATTGATTGAAAACATTGTTGACTCTCCTGTCTCAGTGAGGTTTT
CTATAAATTGAAAACATTGTCGactcccctgtctcagtgaggtTTTCTAT
aaattgaaaacattgttgactcccctgtctcagtgaggtTTTCTATaaat
tgaaaacattgttgactcccctgtctcagtgaggtTTTCTATAGATTGAA
AACATTGTTGactcccctgtctcagtgaagTTTTCTAGAGATTGAAAACA
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TTGTTGACTCCCTGTCTCAGTGAGGTTTTCTATAGATTGAAAACATTGTT
GactcccctgtctcagtgaagTTTTCTAGAGATTGAAAACATTGTCGACT
TCACTGTCTCAGTGAGGTTTTCTATAGATTGATTGAAAACTTTGTTGCCT
CTCCTGTCTCTGTAAGGTTTTCTAGAGATTGAAAACATTGTGACTTCCCT
GTCTCAGTGAGGTTTTCTACTCTAGAGATTGAAAACAGTCTTGAATCCCC
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TCTATAGATTGATTGAAAACATTGTTGactcccctgtctcagtgaggtTT
TCTATAGATTGATTGAAACATTGTCGACTTCCCTGTCTCAGTGAGGTTGT
TCTGAGATTGAAAACATTGTTGACTCCCCTGTGTCTCAGTGAAGTTTTTT
AGAGATTGAAAACATTGTAACTCCCCTGTCTCACTGAGGTTTTCTAGAGA
TTGAAAACATTGTTGactcccctgtctcagtgagtTTTCTGTAGTTTGAA
ACTATTTCTGactcccctgtctcagtgaggtTGTTCTATAGATTGAAAAT
ATTGTTGACTCTCCTGGCTCAGTGAGGCTGTTCTGAGATTGAAAACATTT
GCATTCTTATCTTGAGAAAATCTATACATGTCGTAAGAATGTGTgtcagt
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TGTGAAATCAATAGATATCCAATCCCCAACATAATTGAATAGGCTTTGGA
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TTTGGACAAAtcaaatacaaaacaaagtACACCTTGGGAGCAAAAATCCC
TGGATATCAgggaaaaattgaaatgtaCTGGAATTGTACTTGATTAAGAA
AACTATATCCAAAGTTATCCTTGATTGTACTTAGCTTAGATTTTACAAGA
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ctcTTAAACATTTAGGGATAactctgtctcaatataatttgcagcggaga
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gctcgttgaaaaggtCATGTTCAAGTCATTCCGGCAAGTCATAAAGTGTA
GATAtaacataatataaaaagaaagcAGTTATATACGAATTAAGTAGGCT
ACGTCATAAAAAGTATATTTATATTGTTTTAAGGCAATGTcatatcttcc
tttttttcgagcgtaaaactcctagcGTAAGGCCTGAAAATCTGAAGCTG
CttttttttGACGTAATGATTTATGTAATTTTCGTCTCACAGAAATCGTG
ATTACTTTTGGAACGTGCATACTAATCAAGTATCATGGCGCCACCCAAAT
GACCCGAGGGCGGATATCACATACCCCGCCTGTTGGCAAAACGCAGGTTT
GATTTATTGCTTTAATAAAGTCGTTTGGTCGTTTGTGAGAACGCGACGGT
TTTTTGAATAATCAATTACTCCAGCAgaaattgatttgtcttttacaaca
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GGTATAATAACTCGACTTTTCTTTTAAACTAgaaccgtaagttggtctaa
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agaATAATATGAAACTCGGAATCGGGGattacaaaaagatttatcctccc
tcaccactaagcaaagaaaaataatttcaacctttttttatttttcagct
ctagaaaagggtgtcgaatttagaggagggatgtcgacattagaccaagt
tacagaACAAGGTTTCTGGTCTCCTCAGTAGCATGAGGGGCGCCCCTCCC
CctctatatcataaaaaagaatagATGGGGAGATGGAGGGACTACTAGAT
AACGAAGAATAAACCCCTTTCTCACTTCTCTCAACCCCTATCCCACTGGA
AATTATTATCCCCAGTTGAGAAATTATAGTCAATTTTTTGTCGCCacaga
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gatccccattgaatttttgtttttctgacgTGTTCTAGAGACTTAAACta
tcttgttcttataaatattttggtcatgGTTCTTataatagtttgttctt
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ACGGACGCATTGAGACATTCTGAAGAAACTCGAaccttgaaatcgaaagt
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cgttgtttcagcgttcatctaacgttatacggatgttgtgaacgttagat
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TTAATAGATGTTCTAGAGGCTCCCGAGTTATTTTTACCGAGTCAAAAAAC
CGAGATGTGAAAAAAGCGACGTCATCTTTTGCAAATTCTTGATTTCATTT
GGTACATTCTATAACATAACTTGCAATTTGATAACTCGAttttttacctg
cttttaagtttttgttctccttttttAAATTGTGTTTGTCTTCTTAACCT
TAAGACTAacctttttccctttttttcgtTCAGGCACAAAAGCAGAGGGA
AAAGAACGCTCCTTAtcgaaaagggaaaaaaggtaCTCGTTCATTCGTCC
TATTAGTTCATTCATTCAGATAagtgtaaagagatggaaaacagcttctt
cttgaaaacaatggaaatttggCTCgtcatacagggtgtccggaaaaaaa
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ctaaatttgctaTGTGTTTATCAAAGTGTCTCTCTGTGTTATATTATTTG
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TACTGACTGTTGTAGAAACAATTATTGTGttgatttatattttcttacaa
TTTGTTAAACACACGTTACAACCTTCTATTCAGAATCATGTTTAAACTCG
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GTTAGTTTTGGTTGATGGATCTCGTTTcatagtatgaacccccccccttt
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CCTAGGTCCACTTTAATCTCGTCGATTTGTTCATATTTGCTAGTTCTATT
ATTTAGATTTGTAAAATATGCGTCAATTTTTCCCTTCCTAAAGGGAGCTG
AAAGAGGCGAGttcaagcaataaaatcagAGTACACGAAGCATGTAGGAA
AAAGATTATCGATAAGCGTAGTATCCCAGTCAACTCAGACAACCGACCTG
CAAAACGTTTAAGATCATCGTGTTCCGCCGAGCCAGTCTTTGATTGgaag
aaaaactgttttttgtgCAACAGAAAAGCCAACCCTAAATATTCAACTGT
CATAAAAGTGGAAACCCTACCTATTAAAAACCGCTTACTTGAATGTTCAC
GAGAGAGAGCCGATGACTGGGGAGCGAAGGTGCATGATCGTTTAAACTCT
TGCATTGACCTAGTTGCAGAGGAAGCTGTATACCACATCGTATGCATGAA
TGGTTTCCGTCTGATCAAATCCAACGGCGACAATAACGACACATTTTCAG
GTAGAAAACCCGACGCAATCCAAACTGTACACTCTTACTGAAATTTATGA
CAAGATGGTCGAGTTGAGTAATGGAACTGACTGCTACCATAGAAATTATT
CGAAAACGATTAACTAATGCAAAACTATAAAGATCATATATATTTCATTC
AAAGTGAAGGGCGAAGCGATATAATTGGTTTTAAACACATGAGCAAATTT
TTCATGGAAGAgttcatgaaaataaaataggGCCCATCTTCTGGTACAAA
GTGCTCTTATCAACCATATTACATGCAATTTAGTCGACGAAAACAAGTTG
GTTATTGAAGATCTCGAGTCATCGTATAAGAAGGCAATGGATGAAGGCTT
CACGAACGACAATCTTGTGACACTTAGTGAATCCAAGGCCATCAGAGATA
TGGAGGAGAGTATTGCAACGTTTTCAAACACAATGTCGGAAAAATCGCGA
ACTGCAAAGCTTTGGTTATCCTACATCAATTATATCAAAGTGGTAAAAGA
ATTCATCGTTGCTGAGAGAAGCTGTAATTGGCCAGTTGGCACCTTCATAT
CCAATCAATCATCAAGATGCAAAACCTATTCGCAGCTACTGGTCATCGAA
ACTATGCAAAGTGCTCACGAATCTGTCCAAGAGGTGGAGAGTTGGACATC
TTCTAATGGATGGCTTCAAGAACAGTTCGAGGCCGGACGACACGCAGTGA
GATGATCAAACAGATTTTGGGCTGGTATTTGGTCAGATTTGGTAATAGAC
AACAAATAAACTAAATTTAACTACCGTTAGTATTTTTACCCTGATGACGT
CAGAGGGAATATTCCATTTTACTCACATTCAgtacattttcaggattttc
cgtaggcaaaaaagttgttcagcttTCAATTtacgatcgattgatatata
ataCTTGTATATTTGGCAAACTTGAATTTCTAGGATTTTTgtcctgatga
cgtcattgacttTGTCCTTGATTTTACTCACATTCAgtacattttcagga
tttttcacAAGGTAAAAAGTTGTTCATCTTTCAATTTGCGATCAATTGAT
ATATAAAGCTTGCATATTTGGACAActtgaattttgaccaaaatatgtGA
CAGTCATCATTGATTATGACGTTATAACTGGGGATGCCAAGGTGCTGAAG
GTGGAGGGTTTTAATGTGGGTTTCCTGACACCTTCCCTGaactctgtgca
aaatttcagctttatatcaatttttaaggTTATGACCTAATTCCCCTATa
ctaatataacaatagcaagacactgtcctgatatgaaatatgtgtctgat
atgaaacggaaacacttatctacaaacaaaacctttaacttttatttaat
tttttcagacgATGACACACTTGATCCTATGGATCCTGCTTCGTACTCTG
ATGTTGCTCGGTAAGTTGTTTTGAGCCATGTCTTTAAGCCAGGCTTTCTT
ATCGTAAACACGTGACAATCCGGGACGATATGAAACGAATCAATCCACAA
GCAATCTAAACTATCgctttttcgaatctttctgtgaATCGAACTAACTA
ACCTGTCCAGTCACGACGAAACCCTTTTAAAACTCACTTAACAATTTCCG
TCACCCCGTCATCTTTTAAAACACCATTTATAATCCGACTCTTTTTATTA
CAtgcattttcttttaaaagcttaacgtttataagcatatgctgGCTCAG
TTTTTTagctaaacaatggctctattttttgagaacgataagaatgctaa
gcataatgcgagcttgatataggggtagacacttgcttataaaaaacatg
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GCGCATCCCCATCTGAAATCATGTTGAGTAAATGTCAAAATTATTCCATG
GATTATAAATGTctagaaaaaaaagtaaaacaactaaaaaagaagcgcta
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TCTTATGGCACCAAAACCTTCTAAGCTTTGACATCATTTAGTCTTAGGAT
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CCATTgcgacttattttcgcggatgacaacCAAATCCGCAAGATCCGCAT
AATCcgagaaatttaatccccgcgaaaatcaATCCCTTTAAGGTACTTTG
AATAATTCCCCCTTTGTTCGTTTGTTTCAGTGGCTCATGGTCGAGTGGTT
TACGTGAAGACGCTGACGTCAAAACGGGAGTTGATACGACTGCAAACGGC
CCACTATTTCAACAACGACCCTACCCAAGTCCTGGAGATATTTTGAGACG
GAACCGGCAGCCGAAAAATAATGAAGATGACGACGATGAGAACTAAAGAA
AGATGCTGTCTCATGCtttatgtgatttttttgtACCTTCAAAAACCTAT
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tacgtTTAAATACATAAcactcttctgtgcttaattgtagggggagTAGA
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gaagttttttcacatttttggcaaaaattcatTATAAAGTGATTCTTTGT
GTTTAAAAAGTGATTCTTTgggttgaaaaaattgaaagttagAAAATAAC
CCCCCTCCTCCTACAATGGAGTACAAAAGAGTAGATCATGAAATAAATGA
CACTTCTTCtcacagctgaaaatattttcaaagattaAAGAATGAGCGAG
GGTGTTataaaaaatcgcaaaattaacAAGCGAGCAAGGCATCTTTTAGG
CACCTGCAAATAGTACTCGAACAACTATTGATATTGGACCAAGATCTTTC
CAATAAAGGGTCGGATTTTCCAAGATTACTCCAAGAATACTTCGTTATCA
CTTTTCGCACCCTTCCAATGGACCATCTCTTGAttagttttctt Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000076_pilon:163065..184308+ >MSTRG.10758.1.p1 ID=MSTRG.10758.1.p1|Name=MSTRG.10758.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5040bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:163065..184308+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACGTTACCGACCGCCTTGCAAGCCCGTTTAAAGAAGAGAGGCTTGGT
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AGTATCATGGCGCCACCCAAATGACCCGAGGGCGGATATCACATACCCCG
CCTGTTGGCAAAACGCAGAAGAGAAAGATAAAACGGACGCATTGAGACAT
TCTGAAGAAACTCGAaccttgaaatcgaaagtgaaagttggCAAGCATCC
TAGTTTGTTGAAAGCACAAAAGCAGAGGGAAAAGAACGCTCCTTAtcgaa
aagggaaaaaagacgATGACACACTTGATCCTATGGATCCTGCTTCGTAC
TCTGATGTTGCTCGTGGCTCATGGTCGAGTGGTTTACGTGAAGACGCTGA
CGTCAAAACGGGAGTTGATACGACTGCAAACGGCCCACTATTTCAACAAC
GACCCTACCCAAGTCCTGGAGATATTTTGAGACGGAACCGGCAGCCGAAA
AATAATGAAGATGACGACGATGAGAACTAAATGACGTTACCGACCGCCTT
GCAAGCCCGTTTAAAGAAGAGAGGCTTGGTTGTGAAAGaacagaATCCGG
AAGGAGGAGAACAAAGTGGAGGGCAACAAGCCAGGAAGAGTTACCGACAA
CAGCCGCTTCCACCAGGATGGTTCAAAGTCCCAGATCCTGAAACAAATCG
TGATTACTTTTGGAACGTGCATACTAATCAAGTATCATGGCGCCACCCAA
ATGACCCGAGGGCGGATATCACATACCCCGCCTGTTGGCAAAACGCAGAA
GAGAAAGATAAAACGGACGCATTGAGACATTCTGAAGAAACTCGAacctt
gaaatcgaaagtgaaagttggCAAGCATCCTAGTTTGTTGAAAGCACAAA
AGCAGAGGGAAAAGAACGCTCCTTAtcgaaaagggaaaaaagacgATGAC
ACACTTGATCCTATGGATCCTGCTTCGTACTCTGATGTTGCTCGTGGCTC
ATGGTCGAGTGGTTTACGTGAAGACGCTGACGTCAAAACGGGAGTTGATA
CGACTGCAAACGGCCCACTATTTCAACAACGACCCTACCCAAGTCCTGGA
GATATTTTGAGACGGAACCGGCAGCCGAAAAATAATGAAGATGACGACGA
TGAGAACTAAATGACGTTACCGACCGCCTTGCAAGCCCGTTTAAAGAAGA
GAGGCTTGGTTGTGAAAGaacagaATCCGGAAGGAGGAGAACAAAGTGGA
GGGCAACAAGCCAGGAAGAGTTACCGACAACAGCCGCTTCCACCAGGATG
GTTCAAAGTCCCAGATCCTGAAACAAATCGTGATTACTTTTGGAACGTGC
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ACATACCCCGCCTGTTGGCAAAACGCAGAAGAGAAAGATAAAACGGACGC
ATTGAGACATTCTGAAGAAACTCGAaccttgaaatcgaaagtgaaagttg
gCAAGCATCCTAGTTTGTTGAAAGCACAAAAGCAGAGGGAAAAGAACGCT
CCTTAtcgaaaagggaaaaaagacgATGACACACTTGATCCTATGGATCC
TGCTTCGTACTCTGATGTTGCTCGTGGCTCATGGTCGAGTGGTTTACGTG
AAGACGCTGACGTCAAAACGGGAGTTGATACGACTGCAAACGGCCCACTA
TTTCAACAACGACCCTACCCAAGTCCTGGAGATATTTTGAGACGGAACCG
GCAGCCGAAAAATAATGAAGATGACGACGATGAGAACTAAATGACGTTAC
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cagaATCCGGAAGGAGGAGAACAAAGTGGAGGGCAACAAGCCAGGAAGAG
TTACCGACAACAGCCGCTTCCACCAGGATGGTTCAAAGTCCCAGATCCTG
AAACAAATCGTGATTACTTTTGGAACGTGCATACTAATCAAGTATCATGG
CGCCACCCAAATGACCCGAGGGCGGATATCACATACCCCGCCTGTTGGCA
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CTCGAaccttgaaatcgaaagtgaaagttggCAAGCATCCTAGTTTGTTG
AAAGCACAAAAGCAGAGGGAAAAGAACGCTCCTTAtcgaaaagggaaaaa
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GGAGTTGATACGACTGCAAACGGCCCACTATTTCAACAACGACCCTACCC
AAGTCCTGGAGATATTTTGAGACGGAACCGGCAGCCGAAAAATAATGAAG
ATGACGACGATGAGAACTAAATGACGTTACCGACCGCCTTGCAAGCCCGT
TTAAAGAAGAGAGGCTTGGTTGTGAAAGaacagaATCCGGAAGGAGGAGA
ACAAAGTGGAGGGCAACAAGCCAGGAAGAGTTACCGACAACAGCCGCTTC
CACCAGGATGGTTCAAAGTCCCAGATCCTGAAACAAATCGTGATTACTTT
TGGAACGTGCATACTAATCAAGTATCATGGCGCCACCCAAATGACCCGAG
GGCGGATATCACATACCCCGCCTGTTGGCAAAACGCAGAAGAGAAAGATA
AAACGGACGCATTGAGACATTCTGAAGAAACTCGAaccttgaaatcgaaa
gtgaaagttggCAAGCATCCTAGTTTGTTGAAAGCACAAAAGCAGAGGGA
AAAGAACGCTCCTTAtcgaaaagggaaaaaagacgATGACACACTTGATC
CTATGGATCCTGCTTCGTACTCTGATGTTGCTCGTGGCTCATGGTCGAGT
GGTTTACGTGAAGACGCTGACGTCAAAACGGGAGTTGATACGACTGCAAA
CGGCCCACTATTTCAACAACGACCCTACCCAAGTCCTGGAGATATTTTGA
GACGGAACCGGCAGCCGAAAAATAATGAAGATGACGACGATGAGAACTAA
ATGACGTTACCGACCGCCTTGCAAGCCCGTTTAAAGAAGAGAGGCTTGGT
TGTGAAAGaacagaATCCGGAAGGAGGAGAACAAAGTGGAGGGCAACAAG
CCAGGAAGAGTTACCGACAACAGCCGCTTCCACCAGGATGGTTCAAAGTC
CCAGATCCTGAAACAAATCGTGATTACTTTTGGAACGTGCATACTAATCA
AGTATCATGGCGCCACCCAAATGACCCGAGGGCGGATATCACATACCCCG
CCTGTTGGCAAAACGCAGAAGAGAAAGATAAAACGGACGCATTGAGACAT
TCTGAAGAAACTCGAaccttgaaatcgaaagtgaaagttggCAAGCATCC
TAGTTTGTTGAAAGCACAAAAGCAGAGGGAAAAGAACGCTCCTTAtcgaa
aagggaaaaaagacgATGACACACTTGATCCTATGGATCCTGCTTCGTAC
TCTGATGTTGCTCGTGGCTCATGGTCGAGTGGTTTACGTGAAGACGCTGA
CGTCAAAACGGGAGTTGATACGACTGCAAACGGCCCACTATTTCAACAAC
GACCCTACCCAAGTCCTGGAGATATTTTGAGACGGAACCGGCAGCCGAAA
AATAATGAAGATGACGACGATGAGAACTAAATGACGTTACCGACCGCCTT
GCAAGCCCGTTTAAAGAAGAGAGGCTTGGTTGTGAAAGaacagaATCCGG
AAGGAGGAGAACAAAGTGGAGGGCAACAAGCCAGGAAGAGTTACCGACAA
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TGATTACTTTTGGAACGTGCATACTAATCAAGTATCATGGCGCCACCCAA
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gaaatcgaaagtgaaagttggCAAGCATCCTAGTTTGTTGAAAGCACAAA
AGCAGAGGGAAAAGAACGCTCCTTAtcgaaaagggaaaaaagacgATGAC
ACACTTGATCCTATGGATCCTGCTTCGTACTCTGATGTTGCTCGTGGCTC
ATGGTCGAGTGGTTTACGTGAAGACGCTGACGTCAAAACGGGAGTTGATA
CGACTGCAAACGGCCCACTATTTCAACAACGACCCTACCCAAGTCCTGGA
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TGAGAACTAAATGACGTTACCGACCGCCTTGCAAGCCCGTTTAAAGAAGA
GAGGCTTGGTTGTGAAAGaacagaATCCGGAAGGAGGAGAACAAAGTGGA
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ATTGAGACATTCTGAAGAAACTCGAaccttgaaatcgaaagtgaaagttg
gCAAGCATCCTAGTTTGTTGAAAGCACAAAAGCAGAGGGAAAAGAACGCT
CCTTAtcgaaaagggaaaaaagacgATGACACACTTGATCCTATGGATCC
TGCTTCGTACTCTGATGTTGCTCGTGGCTCATGGTCGAGTGGTTTACGTG
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TTTCAACAACGACCCTACCCAAGTCCTGGAGATATTTTGAGACGGAACCG
GCAGCCGAAAAATAATGAAGATGACGACGATGAGAACTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000076_pilon | genome | sc0000076_pilon:163065..184308 + |
|
