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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000076_pilon:79668..90051+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10754.3.p2 ID=MSTRG.10754.3.p2|Name=MSTRG.10754.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10384bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:79668..90051+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tcttagaaaaaacaagtATAAAATAAAATGCTGTCTTATATTTGCATCCT
GGTGTTCTGCTTCGCTGCCGTTCGTTGCGACGTCCCGACAAACTGCTCCT
ACCCGGAGGTAGTAGGAAAATGGACATTTTATATCGGACAGTCAAATTTT
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CGTCCGCCCGTCGCGTTCTCATTTCCTCGAAAGTCAACGTTACGGAGACA
AATCAGATTACGTACAACGTCTTAACAATCACCAATTAACGTGGAGGGCG
GCTGCGTACCCACGCTTTGAAAATATGACCATTAGTGATATGATTCAATT
GGCGGGAGGGCGTAAAAATGTTCCAAATGTACGCCCAAGGTGAGTTTACA
GTTTTCACGTATTTATCAATCAGAATTGAAAAAATAGCATGGTGgacacc
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GTAGTTGCTATTCATTCGGTTCCATGGGTGCTCTAGAGGCTGGTGTTGCC
ATCGCAACCAACGGACGAATCAAACCTGTGTTTTCACCGCAATATATCGT
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AGGAATTTTAGTCTTtggaccgtagtgcagtggtagagcatccggttacg
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CAGCCGGTTTGGATATAGCCTATATTAGACGtattttttctacgcaatta
ccGTCTATTccattttgctatttttccgaATGTTTTAAGCCCGGGTTTTC
GGACTCTAAACTTCTTTTCCCTTCTTTCCGGGCTTTAAAAACTCAATGTT
CTTGTCGCACCAGGAAATCGGCGTCGCTGCCGTAAAAGCTAGCGTTTCCA
GACGTCGTCGAAGACGACTTTTCACAAAATATCATTTATTCCAACTGCTA
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GTAATGCTGtttttttCTCTATCTTGCAATTAATTTTGTGAtgtgttaag
aattttcaacaGGGGGATTTGACTTTTcctatttttaataaaatacacgt
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tttacagagaatttcagtctcaaagttccttatggagttccttactacat
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agtcccaataaaaggtacattattttcaaatccacttattctcagcctga
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ccttataaacgtgttccttataaaaaaaaaacgtgtaaggcaGAAAACTG
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AATCGCTCGCGAAAACCAAAACGCTACAAAAAAGGCTCCAGACACGGACG
GCTATTATTATATAGATATGTAAAGCTTGTAAGGAAAAAACTTGGCTTAA
CGACATTGAAACCAACAGagcttaaaaaatcaaattcttaGACCACCTTA
GAATTAGTGGaccattttaattattttttgcacaCTTTAGTAAATTTcgt
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CTGATTGCCGGGAAATTCGCACAAGACTATGGAGCCATTCTTGAACAGGA
GTATCCGTATATCGGAAAAGACGCATCGTGTCCGCAAGATTTTATTCCAT
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AATGAGGCGTTGATGAGAATGGCGTTACATAAAGTTGGACCTTTGGTGAT
TGGTTTCAACGTCACGAACGAGTTTTTTCAATACAAGAGTGGTATTTATA
CTCAACCAGGTATGCATGCCCTTTATTttctaccttatcggccaaaactt
agtcggccttgattttagtcggtcttaattattagtcggccctaatttta
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tttgggccatttctaaatttacaagcaaatggaaaataggagaaagctta
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tcaaaagtttatCATTTGCTTTTCTGCTCTTTCCCCTTATctctttttgt
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GGTTTTTCAGGTACAGTTgaatctctctctaattcgattttccagggacc
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GGGACCAAGTTTttctagttcgaattacagaaagattcgaattatagagg
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CATAACTTTTCCAAACTGACTTGATTTAAGGGGTTCTAAATGATATCAGA
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CTTTTATTCAATTATGATAAATGTGTAAAATTCATACTTTAAATAACTTG
GTAGTAAAGTCAAACTCGATTCTCTTGtgaatacacctttttccggttag
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AAGACGGTATGAAATACTGGACCGTCAAAAATTCATGGGGAACGGAATGG
GGTGAGGAAGGTTACTTTAGAATTCGTCGCGGTACGGATGAGCTGGCAAT
CGAGACTATGGCAGTATGGGCTGTTCCCTATGTTGGACACTAATTCATGT
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TTAAGCCCAGCTATATGACAATTaacagttttgaattttttttttatcaa
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CTTACTCTACGACtatcttatcggccaaaacttagtcggccctaagtgac
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ttttgacgaggtgactaaaattagggccggctaagttttggccgataagg
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TGTTTTTTGTACAAGGTTTATATATATTtctaaaactatttttcttcaaa
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GGACGGGGGGCTCGCAGATTCTATTTTCTATCAGCGGACACAGcgacctg
atttagcggccgaagacctgatttagcggccgaagacctgaattaaaggc
cgaagacctgaattgACGGTCGAGGGCTGTgtgcaaaatttatttcaatt
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tacttgtcaaaatttcaagtcaatagtaTTTTCCAATCACTAGATACAAT
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TGTACCGAAAtacgccaaaattaaaaaaagaattccaTGTCATGATTAAA
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AAATGTCATttactaccgtgaaaagcagaggtcaaaatcatatattgacg
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CCTATTGATCCatactctttttataagaaccagtaaattttgccCAGACt
ggttcttaattttttgaaattctcagaTTTATATatatgttcttacgatg
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TTTcaaaatcagtactttcttaGTAGTTTCtaaaatctgaggctcagact
GTTCTTAATTAGTTCCAGGTTTTGACCGATTTTCAagcttgtgttcttat
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ttacaagaatttttgtcattggattggtcgttaactattcaaacaaaaac
gtttattatatttttctaaagaacgcgtcatctctattatttcaaataac
caattatatgagcatcttgtaaaaacttcaatacAACTGAGAATTCTATC
CTCTTATTTTTCAGTGCCGACCGATTTATCTTTCAATCCGTTTGAAGTGA
ATAACCACGTTGTTGTAGTGGTCGGGTACGGAATGGAAGACGGAGTACGT
TACTGGATCGTCAAAAACTCTTGGGGAACGGAATGGGGTGAGGACGGCTA
CTTTAGAATACGACGCGGTACGGATGAGCTTTCGTTGGAAAGTATTGCGG
TGTGGACTAAACCTTTTCTTGGACACTAAAaatgatttagaattttttat
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tattcgagttagaaaagattcgaataacagagcaATTTGAAACACTTtac
agctgaggggaccaatattttagttcaaatcacagaaagattcgaatgat
atGTAGAAATTCAAGTTGACTGTAGTATTTTGATATAATCTTGATCTGTA
GATAAATTTGTCGTAGAGTTAAAATTACAGACAGGATAtttttccaacta
caaaagattttttgctctatttcaaaaagtatactaatattttagatttt
ttttactaAACATATTTTTGTATAAGGAATGTCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000076_pilon:79668..90051+ >MSTRG.10754.3.p2 ID=MSTRG.10754.3.p2|Name=MSTRG.10754.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=972bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000076_pilon:79668..90051+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTGTCTTATATTTGCATCCTGGTGTTCTGCTTCGCTGCCGTTCGTTG
CGACGTCCCGACAAACTGCTCCTACCCGGAGGTAGTAGGAAAATGGACAT
TTTATATCGGACAGTCAAATTTTACCACCGGTTATCAGTGTCCTCTAGAA
GGGAAAGTTGATCCTGTGGAGAAAATCCATTTGGAGTTGATGTTCCCTGA
TAAAGTAATGGATTCTGACGGTAGTATAGGAACTTGGACGATGGTATATA
ATCAAGGGTTTGACGTCAGCATTAAAGGGCGTCGTTTCTTCGCTTTTCTC
CAATACAAAGAAATCGTTAAAGATGTCATCGTCAGCATTTGTAATGTCAC
TTTCACTGGATGGGTTCGCGATGAATTAAATACACAACAACCCGTGTTCC
CTGTTCAAAATTGGGGCTGCTATTATGGTAAGAACAGTTATACCAATCTC
GTTcctgtgtatcccaggctttatttacgttactgaATGCTGTCTTATAT
TTGCATCCTGGTGTTCTGCTTCGCTGCCGTTCGTTGCGACGTCCCGACAA
ACTGCTCCTACCCGGAGGTAGTAGGAAAATGGACATTTTATATCGGACAG
TCAAATTTTACCACCGGTTATCAGTGTCCTCTAGAAGGGAAAGTTGATCC
TGTGGAGAAAATCCATTTGGAGTTGATGTTCCCTGATAAAGTAATGGATT
CTGACGGTAGTATAGGAACTTGGACGATGGTATATAATCAAGGGTTTGAC
GTCAGCATTAAAGGGCGTCGTTTCTTCGCTTTTCTCCAATACAAAGAAAT
CGTTAAAGATGTCATCGTCAGCATTTGTAATGTCACTTTCACTGGATGGG
TTCGCGATGAATTAAATACACAACAACCCGTGTTCCCTGTTCAAAATTGG
GGCTGCTATTATGGTAAGAACAGTTATACCAATCTCGTTcctgtgtatcc
caggctttatttacgttactga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000076_pilon | genome | sc0000076_pilon:79668..90051 + |
|
