MSTRG.1074.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1074.3.p1
Unique NameMSTRG.1074.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:1796540..1825178-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1074.3.p1 ID=MSTRG.1074.3.p1|Name=MSTRG.1074.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=28639bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:1796540..1825178- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:1796540..1825178-

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TAAGGCTTATTATATCACGAACGATGCGATTGTCCAGAAAATGACGAGCA
GAGATGGCTGTCTGAAATGAAGTGTCCACAATCGTATGCACAGATATCAC
GTGATTTGTCACCATTCCCTCAAATCGACCTCACGAAGATGAAAGAAGAC
GCGATACGAGAGTTTGGTACCCACCATGCTCTTTGTCATTACAGTGTCGT
ACATAATAAGCTACACTCGTTCGATCGGCAACAAAGCATTGACAGTCAAA
ATACAAGCTGATCGTCAGCCACGTGTTTGGAAAGACGTTCTCGATCGAAA
TGACGGTTCCTATATTGTGCGCATGCGTTTCTATGAAACATATAAAAATG
TGGAAATCTCAGTAATGTATAATGGAAAACATGTTGCAAAATCACCATAT
AAACTTAAAGATGGTTTTTCAACAAAGGCGTTGGATAGTGTTTCTCCTGG
TCATTTTAGGGCTGATCAGTCTTTGTCATGGCAAAAGAGAGCTCAGTCCA
AGTTTATCCATGGTTTATGGTCCTGGACTGAATCTAGAAGTGGTGCTTCC
AGTACGATATTTTTATGTACAAGCTGTTGACACAAAAGGCAAGAATACAA
ATACCAGTTGAATATTGACGGTACAGTGGCTGCGTACCGATTCCCGTATT
TATTGGCAGGTGATTCAGTAGTGTTTAAACAAGACTCACACTACTATGAA
CATTTCTACCATGATCTTCAGTCCATGGTTCATTACATACCTTTTAAACG
CGATCTAAGTGATCTTGAAGAGAAAATCAAATGGGCGAAATCACATGATA
AAGAGGTTAGCTTTTCTTGAAGTATCTTTAGACATGTTATCAGTGCAAGG
GAATACCGGACCGAAATGGAAAGGTAAAATCGAGAAAGGTTTTTTCCGTG
GTCGTGATAGTCGGCAAGAGAGGTTGGATTTAACTGTGATGGGACGCGAA
AAAACTGGTTTGTTTGATGTTGGTATGACCAACTTCTTCTTCTTTGAATA
CGATGAGAAAAAGTACGGACCCAAGAACCAGCACGTATCTTTCTTCGATT
TCTTTAAGGTAAAACTGCCTGATCTTGAATTCTTCTCCAACCTTGGTGAC
TGGCCGCTGAGCGAACGTAAAAAGCCACCAATTCCGATTTTATCATGGTG
TGGGTCCGATGAGACTTTTGATATTGTCATGCCAACTTACGATTTGACCG
AATCTGCACTCGAAGCTCTTGGCAGGTCTATCGTAAATGTTATGGTCAAC
ATGTTGGGTTCTCAATTTTCATGGATGCTTGGCTGTTCTCATTGATTCGT
AAGGCTTATTATATCACGAACGATGCGATTGTCCAGAAAATGACGAGCAG
AGATGGCTGTCTGAAATGAAGTGTCCACAATCGTATGCACAGATATCACG
TGATTTGTCACCATTCCCTCAAATCGACCTCACGAAGATGAAAGAAGACG
CGATACGAGAGTTTGGTACCCACCATGCTCTTTGTCATTACAGTGTCGTA
CATAATAAGCTACACTCGTTCGATCGGCAACAAAGCATTGACAGTCAAAA
TACAAGCTGATCGTCAGCCACGTGTTTGGAAAGACGTTCTCGATCGAAAT
GACGGTTCCTATATTGTGCGCATGCGTTTCTATGAAACATATAAAAATGT
GGAAATCTCAGTAATGTATAATGGAAAACATGTTGCAAAATCACCATATA
AACTTAAAGATGGTTTTTCAACAAAGGCGTTGGATAGTGTTTCTCCTGGT
CATTTTAGGGCTGATCAGTCTTTGTCATGGCAAAAGAGAGCTCAGTCCAA
GTTTATCCATGGTTTATGGTCCTGGACTGAATCTAGAAGTGGTGCTTCCA
GTACGATATTTTTATGTACAAGCTGTTGACACAAAAGGCAAGAATACAAA
TACCAGTTGAATATTGACGGTACAGTGGCTGCGTACCGATTCCCGTATTT
ATTGGCAGGTGATTCAGTAGTGTTTAAACAAGACTCACACTACTATGAAC
ATTTCTACCATGATCTTCAGTCCATGGTTCATTACATACCTTTTAAACGC
GATCTAAGTGATCTTGAAGAGAAAATCAAATGGGCGAAATCACATGATAA
AGAGGTTAGCTTTTCTTGAAGTATCTTTAGACATGTTATCAGTGCAAGGG
AATACCGGACCGAAATGGAAAGGTAAAATCGAGAAAGGTTTTTTCCGTGG
TCGTGATAGTCGGCAAGAGAGGTTGGATTTAACTGTGATGGGACGCGAAA
AAACTGGTTTGTTTGATGTTGGTATGACCAACTTCTTCTTCTTTGAATAC
GATGAGAAAAAGTACGGACCCAAGAACCAGCACGTATCTTTCTTCGATTT
CTTTAAGGTAAAACTGCCTGATCTTGAATTCTTCTCCAACCTTGGTGACT
GGCCGCTGAGCGAACGTAAAAAGCCACCAATTCCGATTTTATCATGGTGT
GGGTCCGATGAGACTTTTGATATTGTCATGCCAACTTACGATTTGACCGA
ATCTGCACTCGAAGCTCTTGGCAGGTCTATCGTAAATGTTATGGTCAACA
TGTTGGGTTCTCAATTTTCATGGATGCTTGGCTGTTCTCATTGATTCGTA
AGGCTTATTATATCACGAACGATGCGATTGTCCAGAAAATGACGAGCAGA
GATGGCTGTCTGAAATGAAGTGTCCACAATCGTATGCACAGATATCACGT
GATTTGTCACCATTCCCTCAAATCGACCTCACGAAGATGAAAGAAGACGC
GATACGAGAGTTTGGTACCCACCATGCTCTTTGTCATTACAGTGTCGTAC
ATAATAAGCTACACTCGTTCGATCGGCAACAAAGCATTGACAGTCAAAAT
ACAAGCTGATCGTCAGCCACGTGTTTGGAAAGACGTTCTCGATCGAAATG
ACGGTTCCTATATTGTGCGCATGCGTTTCTATGAAACATATAAAAATGTG
GAAATCTCAGTAATGTATAATGGAAAACATGTTGCAAAATCACCATATAA
ACTTAAAGATGGTTTTTCAACAAAGGCGTTGGATAGTGTTTCTCCTGGTC
ATTTTAGGGCTGATCAGTCTTTGTCATGGCAAAAGAGAGCTCAGTCCAAG
TTTATCCATGGTTTATGGTCCTGGACTGAATCTAGAAGTGGTGCTTCCAG
TACGATATTTTTATGTACAAGCTGTTGACACAAAAGGCAAGAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1074MSTRG.1074Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1074.3.p1.exon11MSTRG.1074.3.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon10MSTRG.1074.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon9MSTRG.1074.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon8MSTRG.1074.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon7MSTRG.1074.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon6MSTRG.1074.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon5MSTRG.1074.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon4MSTRG.1074.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon3MSTRG.1074.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon2MSTRG.1074.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.3.p1.exon1MSTRG.1074.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1074.3.p1MSTRG.1074.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000005_pilongenomesc0000005_pilon:1796540..1825178 -