MSTRG.1074.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1074.1.p1
Unique NameMSTRG.1074.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000005_pilon:1796490..1825178-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1074.1.p1 ID=MSTRG.1074.1.p1|Name=MSTRG.1074.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=28689bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:1796490..1825178- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:1796490..1825178-

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CATAATAAGCTACACTCGTTCGATCGGCAACAAAGCATTGACAGTCAAAA
TACAAGCTGATCGTCAGCCACGTGTTTGGAAAGACGTTCTCGATCGAAAT
GACGGTTCCTATATTGTGCGCATGCGTTTCTATGAAACATATAAAAATGT
GGAAATCTCAGTAATGTATAATGGAAAACATGTTGCAAAATCACCATATA
AACTTAAAGATGGTTTTTCAACAAAGGCGTTGGATAGTGTTTCTCCTGGT
CATTTTAGGGCTGATCAGTCTTTGTCATGGCAAAAGAGAGCTCAGTCCAA
GTTTATCCATGGTTTATGGTCCTGGACTGAATCTAGAAGTGGTGCTTCCA
GTACGATATTTTTATGTACAAGCTGTTGACACAAAAGGCAAGAAGATCAT
ACAGAACTTTAAGAACTATCATCGCGGTACGTCCAAAGACCGAAAGTTCA
CGTTGAACAAGAACACATTGAGATGCCAGGCGAACAAGAAGGAAAATGTC
AATGTGATCGAAAGAAAAAGAAGAAGAAATCAAAGAAGAAATGGAAAAGC
GAAATGGCAAGAAAGATAGCAATGGCTGGCCAGACATACGCAAGAGATCA
TTTGATGACAGACCAATTGTTTTGTTATTCATTCACTCTCTTCAAGTACA
AATACCAGTTGAATATTGACGGTACAGTGGCTGCGTACCGATTCCCGTAT
TTATTGGCAGGTGATTCAGTAGTGTTTAAACAAGACTCACACTACTATGA
ACATTTCTACCATGATCTTCAGTCCATGGTTCATTACATACCTTTTAAAC
GCGATCTAAGTGATCTTGAAGAGAAAATCAAATGGGCGAAATCACATGAT
AAAGAGAGTATCTTTAGACATGTTATCAGTGCAAGGGAATACCGGACCGA
AATGGAAAGGTAAAATCGAGAAAGGTTTTTTCCGTGGTCGTGATAGTCGG
CAAGAGAGGTTGGATTTAACTGTGATGGGACGCGAAAAAACTGGTTTGTT
TGATGTTGGTATGACCAACTTCTTCTTCTTTGAATACGATGAGAAAAAGT
ACGGACCCAAGAACCAGCACGTATCTTTCTTCGATTTCTTTAAGGTAAAA
CTGCCTGATCTTGAATTCTTCTCCAACCTTGGTGACTGGCCGCTGAGCGA
ACGTAAAAAGCCACCAATTCCGATTTTATCATGGTGTGGGTCCGATGAGA
CTTTTGATATTGTCATGCCAACTTACGATTTGACCGAATCTGCACTCGAA
GCTCTTGGCAGGTCTATCGTAAATGTTATGGTCAACATGTTGGGTTCTCA
ATTTTCATGGATGCTTGGCTGTTCTCATTGATTCGTAAGGCTTATTATAT
CACGAACGATGCGATTGTCCAGAAAATGACGAGCAGAGATGGCTGTCTGA
AATGAAGTGTCCACAATCGTATGCACAGATATCACGTGATTTGTCACCAT
TCCCTCAAATCGACCTCACGAAGATGAAAGAAGACGCGATACGAGAGTTT
GGTACCCACCATGCTCTTTGTCATTACAGTGTCGTACATAATAAGCTACA
CTCGTTCGATCGGCAACAAAGCATTGACAGTCAAAATACAAGCTGATCGT
CAGCCACGTGTTTGGAAAGACGTTCTCGATCGAAATGACGGTTCCTATAT
TGTGCGCATGCGTTTCTATGAAACATATAAAAATGTGGAAATCTCAGTAA
TGTATAATGGAAAACATGTTGCAAAATCACCATATAAACTTAAAGATGGT
TTTTCAACAAAGGCGTTGGATAGTGTTTCTCCTGGTCATTTTAGGGCTGA
TCAGTCTTTGTCATGGCAAAAGAGAGCTCAGTCCAAGTTTATCCATGGTT
TATGGTCCTGGACTGAATCTAGAAGTGGTGCTTCCAGTACGATATTTTTA
TGTACAAGCTGTTGACACAAAAGGCAAGAAGATCATACAGAACTTTAAGA
ACTATCATCGCGGTACGTCCAAAGACCGAAAGTTCACGTTGAACAAGAAC
ACATTGAGATGCCAGGCGAACAAGAAGGAAAATGTCAATGTGATCGAAAG
AAAAAGAAGAAGAAATCAAAGAAGAAATGGAAAAGCGAAATGGCAAGAAA
GATAGCAATGGCTGGCCAGACATACGCAAGAGATCATTTGATGACAGACC
AATTGTTTTGTTATTCATTCACTCTCTTCAAGTACAAATACCAGTTGAAT
ATTGACGGTACAGTGGCTGCGTACCGATTCCCGTATTTATTGGCAGGTGA
TTCAGTAGTGTTTAAACAAGACTCACACTACTATGAACATTTCTACCATG
ATCTTCAGTCCATGGTTCATTACATACCTTTTAAACGCGATCTAAGTGAT
CTTGAAGAGAAAATCAAATGGGCGAAATCACATGATAAAGAGAGTATCTT
TAGACATGTTATCAGTGCAAGGGAATACCGGACCGAAATGGAAAGGTAAA
ATCGAGAAAGGTTTTTTCCGTGGTCGTGATAGTCGGCAAGAGAGGTTGGA
TTTAACTGTGATGGGACGCGAAAAAACTGGTTTGTTTGATGTTGGTATGA
CCAACTTCTTCTTCTTTGAATACGATGAGAAAAAGTACGGACCCAAGAAC
CAGCACGTATCTTTCTTCGATTTCTTTAAGGTAAAACTGCCTGATCTTGA
ATTCTTCTCCAACCTTGGTGACTGGCCGCTGAGCGAACGTAAAAAGCCAC
CAATTCCGATTTTATCATGGTGTGGGTCCGATGAGACTTTTGATATTGTC
ATGCCAACTTACGATTTGACCGAATCTGCACTCGAAGCTCTTGGCAGGTC
TATCGTAAATGTTATGGTCAACATGTTGGGTTCTCAATTTTCATGGATGC
TTGGCTGTTCTCATTGATTCGTAAGGCTTATTATATCACGAACGATGCGA
TTGTCCAGAAAATGACGAGCAGAGATGGCTGTCTGAAATGAAGTGTCCAC
AATCGTATGCACAGATATCACGTGATTTGTCACCATTCCCTCAAATCGAC
CTCACGAAGATGAAAGAAGACGCGATACGAGAGTTTGGTACCCACCATGC
TCTTTGTCATTACAGTGTCGTACATAATAAGCTACACTCGTTCGATCGGC
AACAAAGCATTGACAGTCAAAATACAAGCTGATCGTCAGCCACGTGTTTG
GAAAGACGTTCTCGATCGAAATGACGGTTCCTATATTGTGCGCATGCGTT
TCTATGAAACATATAAAAATGTGGAAATCTCAGTAATGTATAATGGAAAA
CATGTTGCAAAATCACCATATAAACTTAAAGATGGTTTTTCAACAAAGGC
GTTGGATAGTGTTTCTCCTGGTCATTTTAGGGCTGATCAGTCTTTGTCAT
GGCAAAAGAGAGCTCAGTCCAAGTTTATCCATGGTTTATGGTCCTGGACT
GAATCTAGAAGTGGTGCTTCCAGTACGATATTTTTATGTACAAGCTGTTG
ACACAAAAGGCAAGAAGATCATACAGAACTTTAAGAACTATCATCGCGGT
ACGTCCAAAGACCGAAAGTTCACGTTGAACAAGAACACATTGAGATGCCA
GGCGAACAAGAAGGAAAATGTCAATGTGATCGAAAGAAAAAGAAGAAGAA
ATCAAAGAAGAAATGGAAAAGCGAAATGGCAAGAAAGATAGCAATGGCTG
GCCAGACATACGCAAGAGATCATTTGATGACAGACCAATTGTTTTGTTAT
TCATTCACTCTCTTCAAGTACAAATACCAGTTGAATATTGACGGTACAGT
GGCTGCGTACCGATTCCCGTATTTATTGGCAGGTGATTCAGTAGTGTTTA
AACAAGACTCACACTACTATGAACATTTCTACCATGATCTTCAGTCCATG
GTTCATTACATACCTTTTAAACGCGATCTAAGTGATCTTGAAGAGAAAAT
CAAATGGGCGAAATCACATGATAAAGAGAGTATCTTTAGACATGTTATCA
GTGCAAGGGAATACCGGACCGAAATGGAAAGGTAAAATCGAGAAAGGTTT
TTTCCGTGGTCGTGATAGTCGGCAAGAGAGGTTGGATTTAACTGTGATGG
GACGCGAAAAAACTGGTTTGTTTGATGTTGGTATGACCAACTTCTTCTTC
TTTGAATACGATGAGAAAAAGTACGGACCCAAGAACCAGCACGTATCTTT
CTTCGATTTCTTTAAGGTAAAACTGCCTGATCTTGAATTCTTCTCCAACC
TTGGTGACTGGCCGCTGAGCGAACGTAAAAAGCCACCAATTCCGATTTTA
TCATGGTGTGGGTCCGATGAGACTTTTGATATTGTCATGCCAACTTACGA
TTTGACCGAATCTGCACTCGAAGCTCTTGGCAGGTCTATCGTAAATGTTA
TGGTCAACATGTTGGGTTCTCAATTTTCATGGATGCTTGGCTGTTCTCAT
TGATTCGTAAGGCTTATTATATCACGAACGATGCGATTGTCCAGAAAATG
ACGAGCAGAGATGGCTGTCTGAAATGAAGTGTCCACAATCGTATGCACAG
ATATCACGTGATTTGTCACCATTCCCTCAAATCGACCTCACGAAGATGAA
AGAAGACGCGATACGAGAGTTTGGTACCCACCATGCTCTTTGTCATTACA
GTGTCGTACATAATAAGCTACACTCGTTCGATCGGCAACAAAGCATTGAC
AGTCAAAATACAAGCTGATCGTCAGCCACGTGTTTGGAAAGACGTTCTCG
ATCGAAATGACGGTTCCTATATTGTGCGCATGCGTTTCTATGAAACATAT
AAAAATGTGGAAATCTCAGTAATGTATAATGGAAAACATGTTGCAAAATC
ACCATATAAACTTAAAGATGGTTTTTCAACAAAGGCGTTGGATAGTGTTT
CTCCTGGTCATTTTAGGGCTGATCAGTCTTTGTCATGGCAAAAGAGAGCT
CAGTCCAAGTTTATCCATGGTTTATGGTCCTGGACTGAATCTAGAAGTGG
TGCTTCCAGTACGATATTTTTATGTACAAGCTGTTGACACAAAAGGCAAG
AAGATCATACAGAACTTTAAGAACTATCATCGCGGTACGTCCAAAGACCG
AAAGTTCACGTTGAACAAGAACACATTGAGATGCCAGGCGAACAAGAAGG
AAAATGTCAATGTGATCGAAAGAAAAAGAAGAAGAAATCAAAGAAGAAAT
GGAAAAGCGAAATGGCAAGAAAGATAGCAATGGCTGGCCAGACATACGCA
AGAGATCATTTGATGACAGACCAATTGTTTTGTTATTCATTCACTCTCTT
CAAGTACAAATACCAGTTGAATATTGACGGTACAGTGGCTGCGTACCGAT
TCCCGTATTTATTGGCAGGTGATTCAGTAGTGTTTAAACAAGACTCACAC
TACTATGAACATTTCTACCATGATCTTCAGTCCATGGTTCATTACATACC
TTTTAAACGCGATCTAAGTGATCTTGAAGAGAAAATCAAATGGGCGAAAT
CACATGATAAAGAGAGTATCTTTAGACATGTTATCAGTGCAAGGGAATAC
CGGACCGAAATGGAAAGGTAAAATCGAGAAAGGTTTTTTCCGTGGTCGTG
ATAGTCGGCAAGAGAGGTTGGATTTAACTGTGATGGGACGCGAAAAAACT
GGTTTGTTTGATGTTGGTATGACCAACTTCTTCTTCTTTGAATACGATGA
GAAAAAGTACGGACCCAAGAACCAGCACGTATCTTTCTTCGATTTCTTTA
AGGTAAAACTGCCTGATCTTGAATTCTTCTCCAACCTTGGTGACTGGCCG
CTGAGCGAACGTAAAAAGCCACCAATTCCGATTTTATCATGGTGTGGGTC
CGATGAGACTTTTGATATTGTCATGCCAACTTACGATTTGACCGAATCTG
CACTCGAAGCTCTTGGCAGGTCTATCGTAAATGTTATGGTCAACATGTTG
GGTTCTCAATTTTCATGGATGCTTGGCTGTTCTCATTGATTCGTAAGGCT
TATTATATCACGAACGATGCGATTGTCCAGAAAATGACGAGCAGAGATGG
CTGTCTGAAATGAAGTGTCCACAATCGTATGCACAGATATCACGTGATTT
GTCACCATTCCCTCAAATCGACCTCACGAAGATGAAAGAAGACGCGATAC
GAGAGTTTGGTACCCACCATGCTCTTTGTCATTACAGTGTCGTACATAAT
AAGCTACACTCGTTCGATCGGCAACAAAGCATTGACAGTCAAAATACAAG
CTGATCGTCAGCCACGTGTTTGGAAAGACGTTCTCGATCGAAATGACGGT
TCCTATATTGTGCGCATGCGTTTCTATGAAACATATAAAAATGTGGAAAT
CTCAGTAATGTATAATGGAAAACATGTTGCAAAATCACCATATAAACTTA
AAGATGGTTTTTCAACAAAGGCGTTGGATAGTGTTTCTCCTGGTCATTTT
AGGGCTGATCAGTCTTTGTCATGGCAAAAGAGAGCTCAGTCCAAGTTTAT
CCATGGTTTATGGTCCTGGACTGAATCTAGAAGTGGTGCTTCCAGTACGA
TATTTTTATGTACAAGCTGTTGACACAAAAGGCAAGAAGATCATACAGAA
CTTTAAGAACTATCATCGCGGTACGTCCAAAGACCGAAAGTTCACGTTGA
ACAAGAACACATTGAGATGCCAGGCGAACAAGAAGGAAAATGTCAATGTG
ATCGAAAGAAAAAGAAGAAGAAATCAAAGAAGAAATGGAAAAGCGAAATG
GCAAGAAAGATAGCAATGGCTGGCCAGACATACGCAAGAGATCATTTGAT
GACAGACCAATTGTTTTGTTATTCATTCACTCTCTTCAAGTACAAATACC
AGTTGAATATTGACGGTACAGTGGCTGCGTACCGATTCCCGTATTTATTG
GCAGGTGATTCAGTAGTGTTTAAACAAGACTCACACTACTATGAACATTT
CTACCATGATCTTCAGTCCATGGTTCATTACATACCTTTTAAACGCGATC
TAAGTGATCTTGAAGAGAAAATCAAATGGGCGAAATCACATGATAAAGAG
AGTATCTTTAGACATGTTATCAGTGCAAGGGAATACCGGACCGAAATGGA
AAGGTAAAATCGAGAAAGGTTTTTTCCGTGGTCGTGATAGTCGGCAAGAG
AGGTTGGATTTAACTGTGATGGGACGCGAAAAAACTGGTTTGTTTGATGT
TGGTATGACCAACTTCTTCTTCTTTGAATACGATGAGAAAAAGTACGGAC
CCAAGAACCAGCACGTATCTTTCTTCGATTTCTTTAAGGTAAAACTGCCT
GATCTTGAATTCTTCTCCAACCTTGGTGACTGGCCGCTGAGCGAACGTAA
AAAGCCACCAATTCCGATTTTATCATGGTGTGGGTCCGATGAGACTTTTG
ATATTGTCATGCCAACTTACGATTTGACCGAATCTGCACTCGAAGCTCTT
GGCAGGTCTATCGTAAATGTTATGGTCAACATGTTGGGTTCTCAATTTTC
ATGGATGCTTGGCTGTTCTCATTGATTCGTAAGGCTTATTATATCACGAA
CGATGCGATTGTCCAGAAAATGACGAGCAGAGATGGCTGTCTGAAATGAA
GTGTCCACAATCGTATGCACAGATATCACGTGATTTGTCACCATTCCCTC
AAATCGACCTCACGAAGATGAAAGAAGACGCGATACGAGAGTTTGGTACC
CACCATGCTCTTTGTCATTACAGTGTCGTACATAATAAGCTACACTCGTT
CGATCGGCAACAAAGCATTGACAGTCAAAATACAAGCTGATCGTCAGCCA
CGTGTTTGGAAAGACGTTCTCGATCGAAATGACGGTTCCTATATTGTGCG
CATGCGTTTCTATGAAACATATAAAAATGTGGAAATCTCAGTAATGTATA
ATGGAAAACATGTTGCAAAATCACCATATAAACTTAAAGATGGTTTTTCA
ACAAAGGCGTTGGATAGTGTTTCTCCTGGTCATTTTAGGGCTGATCAGTC
TTTGTCATGGCAAAAGAGAGCTCAGTCCAAGTTTATCCATGGTTTATGGT
CCTGGACTGAATCTAGAAGTGGTGCTTCCAGTACGATATTTTTATGTACA
AGCTGTTGACACAAAAGGCAAGAAGATCATACAGAACTTTAAGAACTATC
ATCGCGGTACGTCCAAAGACCGAAAGTTCACGTTGAACAAGAACACATTG
AGATGCCAGGCGAACAAGAAGGAAAATGTCAATGTGATCGAAAGAAAAAG
AAGAAGAAATCAAAGAAGAAATGGAAAAGCGAAATGGCAAGAAAGATAGC
AATGGCTGGCCAGACATACGCAAGAGATCATTTGATGACAGACCAATTGT
TTTGTTATTCATTCACTCTCTTCAAGTACAAATACCAGTTGAATATTGAC
GGTACAGTGGCTGCGTACCGATTCCCGTATTTATTGGCAGGTGATTCAGT
AGTGTTTAAACAAGACTCACACTACTATGAACATTTCTACCATGATCTTC
AGTCCATGGTTCATTACATACCTTTTAAACGCGATCTAAGTGATCTTGAA
GAGAAAATCAAATGGGCGAAATCACATGATAAAGAGAGTATCTTTAGACA
TGTTATCAGTGCAAGGGAATACCGGACCGAAATGGAAAGGTAAAATCGAG
AAAGGTTTTTTCCGTGGTCGTGATAGTCGGCAAGAGAGGTTGGATTTAAC
TGTGATGGGACGCGAAAAAACTGGTTTGTTTGATGTTGGTATGACCAACT
TCTTCTTCTTTGAATACGATGAGAAAAAGTACGGACCCAAGAACCAGCAC
GTATCTTTCTTCGATTTCTTTAAGGTAAAACTGCCTGATCTTGAATTCTT
CTCCAACCTTGGTGACTGGCCGCTGAGCGAACGTAAAAAGCCACCAATTC
CGATTTTATCATGGTGTGGGTCCGATGAGACTTTTGATATTGTCATGCCA
ACTTACGATTTGACCGAATCTGCACTCGAAGCTCTTGGCAGGTCTATCGT
AAATGTTATGGTCAACATGTTGGGTTCTCAATTTTCATGGATGCTTGGCT
GTTCTCATTGATTCGTAAGGCTTATTATATCACGAACGATGCGATTGTCC
AGAAAATGACGAGCAGAGATGGCTGTCTGAAATGAAGTGTCCACAATCGT
ATGCACAGATATCACGTGATTTGTCACCATTCCCTCAAATCGACCTCACG
AAGATGAAAGAAGACGCGATACGAGAGTTTGGTACCCACCATGCTCTTTG
TCATTACAGTGTCGTACATAATAAGCTACACTCGTTCGATCGGCAACAAA
GCATTGACAGTCAAAATACAAGCTGATCGTCAGCCACGTGTTTGGAAAGA
CGTTCTCGATCGAAATGACGGTTCCTATATTGTGCGCATGCGTTTCTATG
AAACATATAAAAATGTGGAAATCTCAGTAATGTATAATGGAAAACATGTT
GCAAAATCACCATATAAACTTAAAGATGGTTTTTCAACAAAGGCGTTGGA
TAGTGTTTCTCCTGGTCATTTTAGGGCTGATCAGTCTTTGTCATGGCAAA
AGAGAGCTCAGTCCAAGTTTATCCATGGTTTATGGTCCTGGACTGAATCT
AGAAGTGGTGCTTCCAGTACGATATTTTTATGTACAAGCTGTTGACACAA
AAGGCAAGAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1074MSTRG.1074Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1074.1.p1.exon11MSTRG.1074.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon10MSTRG.1074.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon9MSTRG.1074.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon8MSTRG.1074.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon7MSTRG.1074.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon6MSTRG.1074.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon5MSTRG.1074.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon4MSTRG.1074.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon3MSTRG.1074.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon2MSTRG.1074.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1074.1.p1.exon1MSTRG.1074.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1074.1.p1MSTRG.1074.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000005_pilongenomesc0000005_pilon:1796490..1825178 -