MSTRG.10718.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10718.2.p2
Unique NameMSTRG.10718.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000075_pilon:1003493..1019953-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10718.2.p2 ID=MSTRG.10718.2.p2|Name=MSTRG.10718.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16461bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000075_pilon:1003493..1019953- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTATCAGTTATTTTAGCCTATCAGCTAGTTTTTTTAAAATACATCTTTA ACTTTTGAGGGTCTGGTTATGGTTTGACTGTTTGTTCTGTACTTTATATC ATTTCACTTATATTTTTTATTCTCTCATCTATAAAAAATAGAAAAGAGAT CATTATCTCAAAATCGATGTTTTTTATAACCCATTCAAAGCGTCATCCTA CCTTGACCCACCCACCCACAAACGTCATATGACGTTATTTGAACTTAAAA TCGATTTGTGAGTGACCCCTATAAAGAGGTATAAAGAATCGCCAAAAGTA CATTGTGTTCTCTGAGATTTATTTGAAAACCGACTAAAGAACATCAAGAA CAAAAAAACAAAATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTTTTCATGTTTGT TGGACAACTTAAGGTAAGAAGGTGTAGTAAAGTATTTTGTTTTCAGATAA TGTTATTGCTTGGGGATTGGGTGGAAAGACCTTTTCCTTTATCTTTAACA ATTTTTTTTTGAAGTTTTTAATAGACCTTTTTTCAAAGAGGCCACCCCGT TGAATAATTACCTATGTAGTCCAGCAGAAAAACAATGATTAACCATGCAT AATTAATACAATATGCATGATACAGTAGTTATGCATGGCTCTATCATTGT TTTTATGGCTGGACTACATAATTATTCAACAGGACGTCCTCTTTGAAAAA AGGTCTATTAGAAAACTACACTAAAAATTCAAATTTCTCTCCAGGAGAGG CATATTTACCATAAGGACCCTGCCGACGCACCGGACTTAACGAACACCGG ATAAGCAAAAGTCCGGTGTAAAATGAGGATTTTTTTTACCACCGGACAAT TTCTACACCGGACTTAAGGAAGTCGGATGTCTGGTGTCAGAGAAGGATTT TTTTCCCACCGGAAAATCAAAACACCGGACATGACCAGTCCAGTGCGTCC 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AACTTTAAAAATATTAACAAACTTTCTCTCTATAGTGTCTTTCTCTATGT TTTGTTTTTTCACTTCCTGTATTTCGGTGAAATTAACATCAAAACATTCG AAAATGATTCGAATTGTCATTAAACAGTTAAATAATTCTTATTTGACAAC TTTTTGTGCTTTCAGGGGAAAAAGAAACCATTTCTGACAACAAGAAAGTA CAAAATATGGTATCTCGCTTTATACCAAACCCCTTTTTTAAATGTACGGT ACAATACGAAATATATTTTAGTTTTGAGCTGTAACGTTAATTTTTTCAGG AATACAATAAGCGAGAAACAGCTGAAGCTAAAATTGTGAAAGATTTGGAT CGTTTTGAAATGATCTTACAAGCTTTCGAATATGAAAAAGGTACTTTTGA AACTTAAAATTCGGAAATTGGTATTTTCTCATAAAATTACATCCTAAAAA CACTTGCATCGAAGTCTCAATATGAGGAGTGACCCCAATAATAAAATAAA ATCATTTTAAATGAATGTATTCATTAAAGTGTGATTTTATATATAAAGTG CAAGATGAATTGCTCGGCAATGTTTAGAAATAATGCGAGTGCTTTTCATG ATGTACTTCATGAGCAGTTTACTTGCTTTTATCATTGCAAAGCTAACAAT ATAAGTTATTGAAAATCTAAAATGTTGCAGGATATTTCTTAAAATAAAGT AGACCAAAACTATCGTCAATCTAAATGAAACTCTCGATGATACACGTTTT TTTATAAGAACATCCAAAATTTTTGAGTTTCTCATTTTCCCTATTTTTTA TTTATTTTTGTCCATTTCCCTAAGAGACTGGCTGTTTTTAAGTCCGCGAA GTCTGAAAATGTTCTTAACTTGTTCTAAACATTTTGGCTATCGAAGCCTT ATATTCTCATATAGTTTGTTATTATAAAGAAAATGTGTAGGCGAGAAAAA AGCGATTGTAAAAGTATTATTAATGATAATACCAAAATAATGGAAAATGT CAAAATAATGATGAAATAATTTTATCTTTTAGCGGAACAAAGACCTGGAG AGCTGGAAATTTTCTATAACAGTACAAAAGGTAAGAGTTGGTAGAGTTTA TATGTCCCTGGACCAAGATAATCAATCCATCCCAACCACAAATCTTTGAT CAGATTTTTTTTTTTATATTGGTATCCTAATGGCGGCACTACTCAATAGC GGTGAAAATGTATCGAGAGCGAAGGATCTACTTTTCCTAGAATACTTTTG ATGATGTAGCGCCGTTAGACGTTAATTTTTAACATTGCAATGGCTTCTTC TTGTGGGTACTAATTCCAAAAAAGACTGTGATCAAATATGTTGGATATAG CTTGGTCCAGGGATATAAAAAGGTCAGTGAATATACCCTAAATTGGCCCT TTGGAAGTATAAAATAAATTTTATATTAAGTAAACTTCCACTTTTAAAGT ATAAAATACGTTTTGATTATTTTATATATGGTACAAAAATTGGAGGATAA TTTTCCACTGGGGTTGATATTTTGGCCAAATTTTCCAGGGGAAGGGGTCC CAGTGGGTCTGTGAGAAGGGGGTGTCTTTCAGAACCCATCTTCTTGATAT ATCCGTTTTTTAGGAAAATTAATCCAATCCCCTCCTTCTTGGGTTTGTTG GAAAGTGACACCCTCTTTATAAGAAAGGGACATTCGATTATGAAGTTCAA TTGTAGATTGAGTTTTGTAAGTTTCAATAAAGGCTAAACTAGTCATAGTT TTCACTAAATGCCCCCACTGAAAGGTCATGTCATGCACTTATAAAGCTTT TAATGCTTTAAAGATTGAAGCATAAAAATAATCAGGAATAATTAATTGAA ATAATCAGGAATAATTGATTGATTGATTGATTGACTGTTTGATTGATTGA 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TCAAATGCATAGCATAGAACTTTTTCATGATGCAATCTTTTCTCCAAGCT GAAAGGATTGAAGCTATTAAGATGTTCGCAACACAGACAATGAAGAGACG TGCCTTCAGGAAGCTAGACTTTTTGAGTTTATAGCTATATACTTTCACTT TATAATGTTTCCATATGACTGTCTGTGTGCCTAGTCTAACCACCGTTAAA TGCCTTCAGGAAGGTCCCTCCTAACTTGGAAAGCCAGAATTGGAGCTATT TCACCAAACCACTGGAGTGTAAGTTATTACGTAGGCTATCACAACTGTAT GAAAAAGTCAAAGTTGAATGTGGTGCGCCTATAAAGTTAAACGAACGTAA ACAAACTTTTTTCAGGTTTTTAAAATAGATTTACCATACTGAACAAACAT TGAAAACACTCTAAGTGAGGTAAATCTATTTTGAAGACCAAAAAAAAAAA GTTTGTTTACATTGATTGACATTCAATTTTGGATTCATATGCGTACATTC TACTTTTTTGTACTTTGCTGGTATCTTGTTTTACCAAGTTAAGAAAGACC TTCCCGAGTTACGACCATATGATGGTCTTTAATAAAGCTCAAGAACCTCT ATAAACAATAAAGGTAGTTATTAATAAAATAACAGACAAAGATAAATTAC AGTTTGAACAAAAATATCAAATGTACATTTGAAAACTTGAGCAAATTTCT TTAAAGATTCCGGAAAAAGAATTGAAATCATTGCTGAAGTGAACTTCTGA CTAAATTACAGTATTTAGTATTCAGTTTCAAAGACAAGAAATAAAATTTG ACATACAAAACACTTTTTCCAGTCAATGAATCAGCTCATCATCATAACCA GTCTGCCATTTTGTTTGTTTTGATTTGCACGTAATATTGTAATTCGTGTT ATATCATACACTGTTATGATTTGCATTTATAACACTCGCTTCAGCTTTTC 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ATCTTTTCAATGGACTATTCTTTAGCCTTAAAGTTCGAAATTAAAACATA AAATGCGTAAATGGGTAAGATATGGTAACAAAGTCTAAAAATTTCAAAAG TTTTATAAACGGTAGGTCCTTGATAAGGTCCGAGGTATGGGGAGATTTAA TGATCTAAATTCTTTTTGGTAACCTACTCTACTGTAGTGTTATGTAATGA CCCCTTTCATCGGTTGTTACTATAACGAGGAACGAGAAGTAACGAAGTAG GTAACAAGAAGTAACGAGAAGTAACGAGTAGTACTCGTTAGTGCTTAAAT GAAAGTAACGAGTACCAAACCTAAGTAACGAGTACTTTAGTCAAGAAAAT GACGCTCCATTGTCTTGCTTTTGTCACCAGTTAATTTCAGGCACCTATAT CTCGTGATTGGCTTGTCCGTCATCATTTGGGCCCTTTTTGGTACTGGAAT CCGGACACCTATATCTCGTGATTGACCCCCAAAAAGGGCCCAATTGGTGA CAAAAGCAAGACAAAAGAGCGTCATTTTCTTGACTAAAGTACTCGTTACT TAGGTTTGGTACTCGTTACTTCCATTTAAGCACTCGTTACTTCTCGTTAG TCCTTGTTACCTACTTGCTACTTCTTGTTACTTCTCGTTACTTCTTGTTC CTCGTTATAGTAACAACCCCTTTCATCACCTATTGAGCCAATATTTTCTT TCGTTTCTATTTTTCTTTTTGTGATCACTGATTCATCAGTCGAGACAATT TTTAATAATCAGAAATTGATTATCAAAAAAGTAATGACATATAGAGTATG ACCCCTATTGATTTTGGTTTAGCCTCTTTTAATTAGGAGACCCCTAATGT TGAATTATGGGTAGGAGAGAAGGTGTAACTAAATCATTCAAAAATATTAT TTGATTTTAGATTTTCCATTCGTTTCGATTGACCTACAATACTAACAGAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000075_pilon:1003493..1019953-

>MSTRG.10718.2.p2 ID=MSTRG.10718.2.p2|Name=MSTRG.10718.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5427bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000075_pilon:1003493..1019953- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGCACCCATATCCAGGACGATTCGTAGGGAAGTTCTGTAGTGCCCAAGT
TATCAGTTGGGTTGAAAATTTATACCAAAGAAGAAAGGATTTCATCGAGC
AATCGACGGAACCAAAAGACGGAACAAAGACCTGGAGAGCTGGAAATTTT
CTATAACAGTACAAAAGGAATACAATAAGCGAGAAACAGCTGAAGCTAAA
ATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGAAATGATCTTACAAGCTTTCGAATA
TGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTGGACCTTTGGGAGGAAGCTATGCAC
AAAATCACAAAAAATATCCCGAAACAGGTGTATGAAGCTTGCTTTAGTTC
ATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGAGATATCACACCTTATTGTGGTGTT
GCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGAAAGGACAGAACAAAGAACTGGTTG
GACACATCATGATATCAAAAATGTTGAAAGTGTATCAGACCACATGTATC
GAATGTCCATGATGGCAATGCTTTTAGATGCTCCAGATATTGATAAAACT
AGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTTTTCATGTTTGTTGGACAACTT
AAGCTGCACCCATATCCAGGACGATTCGTAGGGAAGTTCTGTAGTGCCCA
AGTTATCAGTTGGGTTGAAAATTTATACCAAAGAAGAAAGGATTTCATCG
AGCAATCGACGGAACCAAAAGACGGAACAAAGACCTGGAGAGCTGGAAAT
TTTCTATAACAGTACAAAAGGAATACAATAAGCGAGAAACAGCTGAAGCT
AAAATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGAAATGATCTTACAAGCTTTCGA
ATATGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTGGACCTTTGGGAGGAAGCTATG
CACAAAATCACAAAAAATATCCCGAAACAGGTGTATGAAGCTTGCTTTAG
TTCATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGAGATATCACACCTTATTGTGGT
GTTGCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGAAAGGACAGAACAAAGAACTGG
TTGGACACATCATGATATCAAAAATGTTGAAAGTGTATCAGACCACATGT
ATCGAATGTCCATGATGGCAATGCTTTTAGATGCTCCAGATATTGATAAA
ACTAGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTTTTCATGTTTGTTGGACAA
CTTAAGCTGCACCCATATCCAGGACGATTCGTAGGGAAGTTCTGTAGTGC
CCAAGTTATCAGTTGGGTTGAAAATTTATACCAAAGAAGAAAGGATTTCA
TCGAGCAATCGACGGAACCAAAAGACGGAACAAAGACCTGGAGAGCTGGA
AATTTTCTATAACAGTACAAAAGGAATACAATAAGCGAGAAACAGCTGAA
GCTAAAATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGAAATGATCTTACAAGCTTT
CGAATATGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTGGACCTTTGGGAGGAAGCT
ATGCACAAAATCACAAAAAATATCCCGAAACAGGTGTATGAAGCTTGCTT
TAGTTCATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGAGATATCACACCTTATTGT
GGTGTTGCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGAAAGGACAGAACAAAGAAC
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AAAACTAGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTTTTCATGTTTGTTGGA
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TCATCGAGCAATCGACGGAACCAAAAGACGGAACAAAGACCTGGAGAGCT
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GAAGCTAAAATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGAAATGATCTTACAAGC
TTTCGAATATGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTGGACCTTTGGGAGGAA
GCTATGCACAAAATCACAAAAAATATCCCGAAACAGGTGTATGAAGCTTG
CTTTAGTTCATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGAGATATCACACCTTAT
TGTGGTGTTGCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGAAAGGACAGAACAAAG
AACTGGTTGGACACATCATGATATCAAAAATGTTGAAAGTGTATCAGACC
ACATGTATCGAATGTCCATGATGGCAATGCTTTTAGATGCTCCAGATATT
GATAAAACTAGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTTTTCATGTTTGTT
GGACAACTTAAGCTGCACCCATATCCAGGACGATTCGTAGGGAAGTTCTG
TAGTGCCCAAGTTATCAGTTGGGTTGAAAATTTATACCAAAGAAGAAAGG
ATTTCATCGAGCAATCGACGGAACCAAAAGACGGAACAAAGACCTGGAGA
GCTGGAAATTTTCTATAACAGTACAAAAGGAATACAATAAGCGAGAAACA
GCTGAAGCTAAAATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGAAATGATCTTACA
AGCTTTCGAATATGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTGGACCTTTGGGAG
GAAGCTATGCACAAAATCACAAAAAATATCCCGAAACAGGTGTATGAAGC
TTGCTTTAGTTCATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGAGATATCACACCT
TATTGTGGTGTTGCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGAAAGGACAGAACA
AAGAACTGGTTGGACACATCATGATATCAAAAATGTTGAAAGTGTATCAG
ACCACATGTATCGAATGTCCATGATGGCAATGCTTTTAGATGCTCCAGAT
ATTGATAAAACTAGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTTTTCATGTTT
GTTGGACAACTTAAGCTGCACCCATATCCAGGACGATTCGTAGGGAAGTT
CTGTAGTGCCCAAGTTATCAGTTGGGTTGAAAATTTATACCAAAGAAGAA
AGGATTTCATCGAGCAATCGACGGAACCAAAAGACGGAACAAAGACCTGG
AGAGCTGGAAATTTTCTATAACAGTACAAAAGGAATACAATAAGCGAGAA
ACAGCTGAAGCTAAAATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGAAATGATCTT
ACAAGCTTTCGAATATGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTGGACCTTTGG
GAGGAAGCTATGCACAAAATCACAAAAAATATCCCGAAACAGGTGTATGA
AGCTTGCTTTAGTTCATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGAGATATCACA
CCTTATTGTGGTGTTGCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGAAAGGACAGA
ACAAAGAACTGGTTGGACACATCATGATATCAAAAATGTTGAAAGTGTAT
CAGACCACATGTATCGAATGTCCATGATGGCAATGCTTTTAGATGCTCCA
GATATTGATAAAACTAGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTTTTCATG
TTTGTTGGACAACTTAAGCTGCACCCATATCCAGGACGATTCGTAGGGAA
GTTCTGTAGTGCCCAAGTTATCAGTTGGGTTGAAAATTTATACCAAAGAA
GAAAGGATTTCATCGAGCAATCGACGGAACCAAAAGACGGAACAAAGACC
TGGAGAGCTGGAAATTTTCTATAACAGTACAAAAGGAATACAATAAGCGA
GAAACAGCTGAAGCTAAAATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGAAATGAT
CTTACAAGCTTTCGAATATGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTGGACCTT
TGGGAGGAAGCTATGCACAAAATCACAAAAAATATCCCGAAACAGGTGTA
TGAAGCTTGCTTTAGTTCATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGAGATATC
ACACCTTATTGTGGTGTTGCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGAAAGGAC
AGAACAAAGAACTGGTTGGACACATCATGATATCAAAAATGTTGAAAGTG
TATCAGACCACATGTATCGAATGTCCATGATGGCAATGCTTTTAGATGCT
CCAGATATTGATAAAACTAGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTTTTC
ATGTTTGTTGGACAACTTAAGCTGCACCCATATCCAGGACGATTCGTAGG
GAAGTTCTGTAGTGCCCAAGTTATCAGTTGGGTTGAAAATTTATACCAAA
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CGAGAAACAGCTGAAGCTAAAATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGAAAT
GATCTTACAAGCTTTCGAATATGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTGGAC
CTTTGGGAGGAAGCTATGCACAAAATCACAAAAAATATCCCGAAACAGGT
GTATGAAGCTTGCTTTAGTTCATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGAGAT
ATCACACCTTATTGTGGTGTTGCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGAAAG
GACAGAACAAAGAACTGGTTGGACACATCATGATATCAAAAATGTTGAAA
GTGTATCAGACCACATGTATCGAATGTCCATGATGGCAATGCTTTTAGAT
GCTCCAGATATTGATAAAACTAGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAATTT
TTCATGTTTGTTGGACAACTTAAGCTGCACCCATATCCAGGACGATTCGT
AGGGAAGTTCTGTAGTGCCCAAGTTATCAGTTGGGTTGAAAATTTATACC
AAAGAAGAAAGGATTTCATCGAGCAATCGACGGAACCAAAAGACGGAACA
AAGACCTGGAGAGCTGGAAATTTTCTATAACAGTACAAAAGGAATACAAT
AAGCGAGAAACAGCTGAAGCTAAAATTGTGAAAGATTTGGATCGTTTTGA
AATGATCTTACAAGCTTTCGAATATGAAAAAGATTGCTGATGAGGTGTTG
GACCTTTGGGAGGAAGCTATGCACAAAATCACAAAAAATATCCCGAAACA
GGTGTATGAAGCTTGCTTTAGTTCATGATTTGGCTGAATGTATTGTTGGA
GATATCACACCTTATTGTGGTGTTGCACCTGAAGAGAAAGATCGAAGAGA
AAGGACAGAACAAAGAACTGGTTGGACACATCATGATATCAAAAATGTTG
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GATGCTCCAGATATTGATAAAACTAGATGGCTGCCAATAATGCAGTGGAA
TTTTTCATGTTTGTTGGACAACTTAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10718MSTRG.10718Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10718.2.p2MSTRG.10718.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10718.2.p2.exon9MSTRG.10718.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10718.2.p2.exon8MSTRG.10718.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10718.2.p2.exon7MSTRG.10718.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10718.2.p2.exon6MSTRG.10718.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10718.2.p2.exon5MSTRG.10718.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10718.2.p2.exon4MSTRG.10718.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10718.2.p2.exon3MSTRG.10718.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10718.2.p2.exon2MSTRG.10718.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10718.2.p2.exon1MSTRG.10718.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000075_pilongenomesc0000075_pilon:1003493..1019953 -