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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000074_pilon:69513..79862+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10585.3.p2 ID=MSTRG.10585.3.p2|Name=MSTRG.10585.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10350bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000074_pilon:69513..79862+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTAATCTCTTTAGATAAACACACCATATAAATAAACATGGATGGTAACAG
GGCAAGCCGAGCAACCAAGATCGCTCGATTTGTAGCTGTTTTTATAGCTC
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TTGTAACAGGGCAAGCCGAGCAACCAAGATCGCTCGATTTGTAGCTGTTT
TTATAGCTCTCCTGGCTATCCAGATCGGATTTGGTTCATATGGTGTTATC
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TTATCGTGATGCTGGTTGTACACCTGTGTTGTTCTTAGCTGCTTATGTTG
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ttctgactgaactttaatttttgattttgattgcgctgagtccagtgaga
ctcatcttgaattttttcactttcgttttcaaaaattatatgaaaacaat
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gctaccacctcaaacAAAGCCAAAAAATGGAGCCTGTCAAATTGCACCTG
GCCACTTATCAGCActatccagtctatcaaaaagctataagtggccGATA
aaaccagatatcttatataaaacacagACCTACGGTGGATAGACAACATc
agttttttacatttttaacattTCCTCCTGTATCAGTCTTTAAAGCCAAA
TCCCacgttaaatcttttttttctcgtttttcagtgaatttctactgttt
ttcatcatgggattttttGGTATGTTTATCGGTCAATTCTCGTATATCCA
AGGAGTTGTTTTTACCACTCCTGATACTGCATCAATGTTTCAGTCCTTAG
TTCCAGTATTGGTCGTCATTATTGCTATCTTGGTGAGAAACGAACCGTTC
CCAAAGATTAGAACCAAAACTGGACTCGCTAAACTATTAGGAATTTTATT
TGCTACCGTTGGCGCCCTCGTAATGGCGTACGCCAAACAGAACGCCAAGA
ATAAATCAGATGCTGATAAGAATTTGACACCCCCAACATGGTATGGCTAT
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GCTTCAATCTATTACGCAGAAAAGCCAGGTGCTTTCGCTATAGAAAATCA
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ACAGCTACTTGGCCACTACAGGTGTTATTTTGTGCAATCATGTCTTATAT
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TACTCACGAAATAAACAACCTTCCTTAGAATGTCACGTAGAAGACGAGAA
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GTTGGAAAAGCTTATGATTCCTTTAGACAGCGGTTTTAATTTTCATACAA
AGCTCAGATAAAAATTAACCAATGAACGCGGTTAAAATAATGAATACTTT
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ACACAAAAAATCGCAATTAAATTTCCAACATCTTTTACACCTTTTGATCT
TGGTGACTTCATTAAACTCTATGCACCTAAAGTTACAAGGGAATGTACTC
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TACCTCCATGAAAAGTTTGAAAGCcccaagaaaaacttttttaaataacg
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CGTTTATTTCAATATCTAACAAGGGGTTAAAACCCACGATACAGAGGAAT
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GTTAAATGGGTACTCCTCCTGTGTGTTTTAAGAATGTCAATCATGAAGTG
GTCTGTGTGCTATTATGTTAGTAATTCAATCTGTGTTTACTCTATGTCGA
GAGAACACAAGCGACTTTTTATGTACCAATTGAAGTTAGCATTCTTGTTT
TGGTATTTTCGGTGATTTTTTGACAAACTGTGGATAGGTTTTGGATgatt
ctattcatgatatgtaccacTCGTACCACTGCAATTACTTTTCTGTTTTg
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TATGATTCTTAATTATCTGGTTGGCAACATTGATCAGCATAACATCaaca
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AATATAGAATTAATATCAGAAGCAGAGGGACACGACCCTGGGTCCTACGC
CCTGCGTCTTACTTTCAACCCCTCAAAATTCCAGATAtttttttCGTTGT
CCACGTGCAGTGGAAAGACAGCATcagttttttacatttttacattttct
ccaTGTATCAATTAGTCTTTATTAAGCCAGAACCCCgtgttaaatctttt
ttttctcgtttttttagtgaatttctactgtttttcatcatgggattttt
tGGTATGTTTATCAATCAATTCTCATATATCCAAGGAGTTGTATTCACCA
CTCCTGATACTGCATCAATGTTCCAGGCCTTAATTCCAATATTGGTCGTC
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AACTGGACTGGCTAAACTCTTAGGGATTTTATTTGCTACCGTCGGCGCCC
TCGTAATGGCGTACGCCAAACAGAACGCCAAGAATAAATCAGATGCTGAT
AAAAATTTAACACCGCCAACATGGTATGGATATTTGTTTCTGGTTTCGAA
TATAACATGTTCAGCCGGCTGGATGGTTGTTCAGAAAAAGTTCATCTTCA
ATAGAATGGATTCTAGATTCCGCGAGTACCCTATAAACACTACAGCTTGG
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TGGTGTAATATGCAAGTGAATTCGTCATTTGTGGCAGCTACTTGGCCACT
ACAGGTGTTATTTTGTGCAATTTTATCTTATATCGTTCTTGGTGAAGTCA
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GCAGTGACTTGGTCAAGTTACACTGAACAAATGTACTCACATAAACAACC
TTCCTTAGAATGTCACGTAGAAGACGAGAACCCCTTGTTATATGCAGAAT
AGATtgtattaatttttaagttttatcgCTGTTGAAAAAGCTTATGATTC
CTTTAAAAATTAACCAATGAACGCGGTTAAAATAATTGATACTTTCTTGA
GATTTACGCTTTGGCatcgttttttttattaacatGTTTGATGCTGAAAA
CTATTCTCAATGTCAATTCGAAGCTGTGTGAAAAAATTAGCAATATCGTT
TATTTTCAAATCTAGTTAAAGCTAGGtttgaattaaatctttatttttat
ataattgtaatttgttttgaattgaattttaaaaatttttattatatatt
atgcatgattttttgcacaaagttgCATAACtgtaaaccctcgaatgtga
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000074_pilon:69513..79862+ >MSTRG.10585.3.p2 ID=MSTRG.10585.3.p2|Name=MSTRG.10585.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=756bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000074_pilon:69513..79862+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGGTTTGCTTCAATCTATTACGCAGAAAAGCCAGGTGCTTTCGCTAT
AGAAAATCATAATGTCATATTTTGTTTATTATATGCTGTCTTTATAACAT
CAGCTATGTGTTATATGCTTATAGCATGGTGTAATATGCAAGTGAATTCA
TCATTTGTGACAGCTACTTGGCCACTACAGGTGTTATTTTGTGCAATCAT
GTCTTATATCGTTCTTGGTGAAGTTATGGTTGCACTTCAAATTGTAGGTG
GACTAATGATTATTGGTGCATTGTTGGCAGTGACTTGGTCAAGTTACACT
GAACAAATGTACTCACATAAACAACCTTCCTTAGAATGTCACGTAGAAGA
CGAGAACCCCTTGTTATATGCAGAATAGATGGGGTTTGCTTCAATCTATT
ACGCAGAAAAGCCAGGTGCTTTCGCTATAGAAAATCATAATGTCATATTT
TGTTTATTATATGCTGTCTTTATAACATCAGCTATGTGTTATATGCTTAT
AGCATGGTGTAATATGCAAGTGAATTCATCATTTGTGACAGCTACTTGGC
CACTACAGGTGTTATTTTGTGCAATCATGTCTTATATCGTTCTTGGTGAA
GTTATGGTTGCACTTCAAATTGTAGGTGGACTAATGATTATTGGTGCATT
GTTGGCAGTGACTTGGTCAAGTTACACTGAACAAATGTACTCACATAAAC
AACCTTCCTTAGAATGTCACGTAGAAGACGAGAACCCCTTGTTATATGCA
GAATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000074_pilon | genome | sc0000074_pilon:69513..79862 + |
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