MSTRG.10583.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10583.3.p1
Unique NameMSTRG.10583.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000074_pilon:57901..67106+

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10583.3.p1 ID=MSTRG.10583.3.p1|Name=MSTRG.10583.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9206bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000074_pilon:57901..67106+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCGGGAAGAGATTTTCGCGCCGAAATATTTGTCCCGCGATGCACGAAAAG CGAACCGACACGTTTTGAAAGCAAAACACGAAAAAACCACAACTGAGTAC AtttttttGGCTGCTTTTTATCCGTATTCTATGTCCATCTCGTTGCATGC AGTGCTCAACATGGATGGTAATGTCAGATTTGCATCTGTTTGTTTAGCAC TTGTCATACTGCAAGCTGGGTTTGGAGCATATGGAGTTATTTACACTAAA CTTGCAAAAGGAACAGAAGTTGAACCTCTAATCTTTTGTTTCTATCGTGA TGGTGGATGTGCACCAGTTTTATTTTTGCTAtcatactttttggaaaaaa gacttTTGGTTCCTCAAGTAAGGTAAGAAAAAATCATAACTATTCTTTGA TTTTGTCACAACCATTTTGAAATCCTTCTAACTCTAAAGGTCGCTACACC GTAGAGCCGTAGGACCCTGCCGatgcaccggactgtccggtgtatttgtc tggTGGCAAAAaatatcctttcgctacaccggacgcaataagtccggtgt cagtccggtgttacATACAGGGAATTtgggacgccggacatttatgaaac aaaaaattacaaaacaccGGACgccaccggactggtcatgtccggtgttt tgattgtccggtggaaaaaaatatccttctccgacaccggacatccgact tccttaagtcgggtgttgagattgtccggtggtaaaaaaacttctcattt tacaccagactttcgcgtgtccggagTTCTTTAAGTCCGGtcccggtgcg tcggcagggtcctagaGTCGTTTGGATATCGACAtgcccagacgatctca atcaaacggaatcgccgatcgaaccagtcgaaccaaatcgaacgcaatcg accgattgaaattcaattgtcgaacgcaatcaaatctcaatcgaatatta ccacaattttcagattcgattgatattcgattgcgttcgtttgatgttcg attgcgttattgcgttcgatcgtcgattcattgtattgatagcaactcca gaagatttttcaaattttaatttttttttcaaaacctatcctatcttgta gagctttgaaaaagaaagaaaatgaggggtcataggcctccagaggataa gtggttgtaaagatattcaaattttagtgtcaaaaatttgactaaaaatg tccaaaaaaaggttaggaaaatagcttggaaaaattcgaaaaatgtgtca aaaaagaaaaaaaagacattttccaatcatgcttcttcaattttgcatat ctctttttctagcgtagctagagacctgaaatttggagggagaattcttt gatggtgttagaatattattatataaaaatatttgtatgtatatttatca aaataacaaaagatatatttttttgaaaaagaagacattgcattgttgtt tttttgtttttgaagaaaagtagcttggaaaaggTtTGAAATGAGTCAAA AAAGGTGGTAGGACCCATTTTCAAGGGGCCTCTGGAAATGGAGGAACAAA AACTTATGAGTAAAGAATAAGTTTTTCTGAAAGGAGAAACCCCAAATGAA AAGAAAATCCATTTCGGCAGAAATAAAAACTTtttttttgggacattccc atgcaaaagaagcaaaaaagtgaaaaaaactacatgaaaatgaaggaact aaaattagcgaatgtgatttttgaattcctcaccctttttctgataaaca aacaaagtttcagccttcaaatacattttcctccgtttccagacacattt gttcatcgatagttggaattttttttctcccgttggcaaacaattttcaa aatgttgcaaaacgttcagcgttttaccaatttgccgtctagcccgtgtc cacagtgttataccgctggaaagctaagatcacaggctttcatttagtaa aaaccggaacgcttttgcatacatagaaaaaaagttcgaagggttcaaag ttcacggaaaaatgaaacatttggtttgacgtcaacaaaagttgcatgac ttctggagtcgctagtattgacccccggattgttcatcgcataatttcta cgggaaatcgaaagtaatttcattcggcttgtgatgtttgagagcttgga ttggatgttgggaagctgcaagaataaagccagacgatctcaatcgaaca aaatcgacgatcgaaccagttgaacaacaatcgaaccaatcgaatattac ccagaattttgacgttcgattgagattcgattgcgttcgacaaattcata cattttcttctcccgccttggaaattttgaattttgtgaaaacttttgca ctcggaaatcctgtgtcatCCGCCCCCTTTTACAGACAAATTTTGGAATG GCCCAAATCATctgacaatcaaaccaatcgaactccTCGCCATTGTGCAT TGAACAGTTAAAGTTGAAGTAAAAAGTTTAATAAAAGCTTCAATTGTTCA ATCAAGTTTGATCATTTGATTCATTATCTAACTTGGACTTTTACtagggt ggggcgtcaaatgtcaaagtcagaaaattcaagtggtagtgtttttttat gaaaatttaacctattgtgaggcattctgcgcaatttttaaggtcagaag tccaaaattggccgaacccccttGGGGTACTGATTTGCACTACaggtAaa aaattggaaaaaatggcattttctGgccTtttcaggcctgtaaatatgtc aaaactattgcaaatcttatttttttcatttgctgtactaaactttatga agaaacaacaaaataatcgtattgggttgaaaattgtgctcattggagcc ctaaacgagccaattttgggtagcaaaatgctttttaaggccaattttgc aagttcaaaaactttaaactgattaaatcacatgtctgaaattttcagag atGgaaGTCTTCaataaagtctttaagcAaaatgcaaataaagtctttaa gcaaaaTttcaagTttttcacttttttcaaaaattcataatggcgtcttc aaaaatcgctttttagcaacaaaatatcatatttatcAaaaaatagcatt tttttaagGCAAGATTCTAAAACTGAGTTTTAAATGCtgactaaaTtttt ttttgcagtgatagtattctagagatactccagggaaatcaaaattatat GGGTTGGGGATGCGTCTATgctcgccattatggaaataaaatccctgcta agagccatttttcaggcaaaaacccaaatttgaactgAaAGAAATCTCTA AAATGACAATAGACATGGGCCCGAATTTTCTTGCAGTGTGTGATAGTATT CTGGAAATTCTGCAGGGAAATCAAAATCATATGGGTTTGGGATTTGGGTA TATCCACCATTTTGGAATGGAAATTCCTGCTAAAACGTAATATTTCAAGC AAAAATCCCATTTTTGACTTGAAAaaccttaaaaatggCGAtaaacatga acctaaaatctttttgcagtaatagccttctggaaatactccaggtaAAT CGAAATCCTTTGGGTTTAGGATAAGGGTATATCCaacattatggaattga aatatgtgctaAAACTGGTTAAAATGtaacgtttcaagcaaaaaccccat ttttgactaaaaactgctctaaaatggcaatagacatggacccaaatttc tttgaagtgaTAGTATTCTTTGAGTCTGggatttgtttacatccaccATT ATGGTAATGAAATCTCTGTTGAAATGCTACATATTTCCATCAGATACGTC ATTGACTAAATATTTTGTATGTTACATTAAACAAAGAATATGAATTTACT ATCCTTTaataaatttagaaatactagCCTTaaaagcttgccttaaaaaa tgctattttttgataaatatgatattttgttgctaaaaagcgatttttga agacgccattatgaatttttgaaaaaagtgaaaaacttgaaattaatttt gcttAGAAACTTTATTGAAGATAAATTGGCTTAAAATGGCTCGTTTAGGG CAGCAATGGGAAGAATTTTCAACCCAATacaattattttgttgtttcttc ataaagtttagtacaggaaatgaaaaaaataagatttgcaatagttttga catatttacaggcctgaaaaggtcagaaaatgccattttttccaattttt gcctgtagtgcaaatcagtacccccaggggggttcggccaattttggact tctgaccttaaaaatagcgcagaatgcctcacaataggttaaattttcat aaaaaaacactacattttgaattttttgactttgccccaaaaatgactgt tgacACCCTACCCTACTTAAttacatttgttttgaaattttgctgctttg gttggtcaggcatttgatggctaccatcaactgctctaacttgggacgat tggtcgaaacttGGAACTgttgaaattgatgaaaaactttaatctgtcaa tcatttttctcaagcgaagagtgcacaaagcaattttagctttactttat cattatccctttattttcattcctagaacttttgcaaaaaaaggaaaaat agaaaagttagaaaatagaaaagaaatattaaaatagaaaaattgctCTG TATTCACATACTGAGTTCGaaaaatcttctatgtggcgtttttttgctaa cttcaaaaaactgatttttgtcccgctttttggggactttagcttaagtg cttgtgtgcagcatagggtacaaagtccaaatatgcgttccCCGTAACTT TTGTATGAcaagttaggtctatactgacatactgtaagttggtctaatgt cgacatccctcttctaattatgacatccttctttagagataggaataatg ggAGGGTTGAAATCACggattaaaactaattttctttgcttaactAACAA TCAGAGAGGAATAAATCTTTTGTCAATCAGTGATTATGACCTTCCTATCA TTCCTATTATCTCTAAAGAACTATGTTGAAaatagaagagggatgtcgac attagaccaacctaCGGTATGGCGTATGGCAATCAGCGTGCAATGTTACG CAGCAGTAAAGTGTACAATTAGAGTGATTATTTGGCTGAGGGCTTGTGAA GCTTATGGTATGTCTGAACAGGTCCGGATAATGCCACAAGTTTAgcgcaa aatatttgaagtgTGATAATTGACATTCTATATTTCAAGTTCAGAAAATC AAGTAACACGGGTTTAGtctcagattttgaaaaaggaaaattttaaatcc aaaaaattggtaaaaagaagttacatatgaaaaagTTCCCCAGTTTTCTG GATTTTCGATCTAGAATATCAGGAAAATCagactttttgaaaacattttc ctaAATGGGAAAATTGGCAGCTACTGTAAATTGACAAACCCTGCTTGATT CTGTCACCCTGCtttttttAGATAGGAATACACAATTTTCCTTTATAAGa ttaagaaccagtaaatctcatccttgattttttgtaatttttacctaaat aaaaacttaaaatgggttGAAAACTGTTAAGAGccacatacactacacaa tatattgtcaggcaatatattgatgatatattgctgaatgtcgataatat attgaaaaggtgtccgcaatatattgtcagctcgatttgcaatattccaa caataaagggggattgtttacaaaaagaaaattcctttttataatagagt accagttgtttacttcgtacattacggtccgcaaaccatattgtcgaata ttgttcgtcaatatattgtgtagtctaagtagccctttatTAAAATTGTT AAATTTCTGACACCTGAGGCTTTTGATTGTtctaaatttgttcttaggtt ttggccaattttcagcctcgtgttcttataaaactgttcttataaaaaac ttgtatttGCAAGATCAGTTTAGCTtattgaaaatacttttttatctttt ttggcttctaagcaaaaaaaagaagattgttTTGGTCAGTGATTCCATTC TGTAAAACAGTTGACAGTTAATAAGTTGACACTCAACCAAAGAGACCAAA GAGACATTGGAAAATTAATCACTCGTTCAATACCTACAATGTAGGGAAAT TTTAAATCACCCTGGTCAATTACATTAGGAGCGACTTTCATTCAACTTGA TATTTTGTTCAATAATATAATAActgtttgaaacaaaataaatagacaaa gatcaaagaatttaACCCACATGGCTTTCTTTATAACCAAAATTCGTTGC TTTTTTCTTCCTTAAAAACATTTAGTTTGTTtgattatattttcaaaaaa gcgcTGTGTTCATCGAATAAAATGATGGCTTCTATATattagaaaatata ttttcttttttcattcagGGAATTACCATTGCTTGTTTTCTTGGGCTTCA CTGGGATATTTTTATCACAATATTCTTATATTCTGGGATTAATTAACACA ACACCTGACACAGCATCCATGTTAGTTTTGTTAACTCCAATCGTGGTAAC TGTGTTTTCAATTATTCTGAAAATCGAGAGACAACCTCAATGTGATAGAA AAGGTTATGCGAAAATCTTTGGTATATTGACAGCAGTTGTGGGTGCTTCA ATCATGGCTGGACAACacagcaaaaataaaatatcaactGGATCAAGCTC ATTTGGGTTTTTGTGTATTTGTTTTCATATTGTCACAAAGTCTACATGGA TACTTGGACAGAAAAAGCTGGTGTACCAAAATACAAAATGCAGATGGCAG TCTTATCCAGTGAACTTGACAGCATGGTCCTATTTCTTTGGTGCCTGCTG GATGGGCATTTCTATACTCCTCAGTGTTAATAATACAGCTAAACTTTACA TCCAATCCAGAAATGTAATTATATGTCTGTTGTATGCAATATTTATACCC TCAGCGCTTTGTTACGGACTTCTTGCTTGGTGTAACAGACAAGTTGATCC ATCATTTGTGACGGCTTCATGGTgcttacatattttttttacagcTACCT TCTCATATTTTGTTCTTGGCGAAACGATGAACTTGAAAGAAATATTTGGT GGATTTTTAATTGTGGGTGCTTTGTTTATGGTCACGTGGTcaaattataa caacaataatggtagtaataatgaaattaacaaaactgaaaaacaataaa caaatgaaatgtGtttatatttatagaccgttttattttatacacttttt caaatcaatttttgtagcattatttaCACAATACATATTAATAGAAGgat cttttttgaatttaattaattttttatttgaatttatattcttaagggct acttagactacacaatatattgacgaacaatattcgacaatatggtttgc ggaccgtaatgtacgaagtaaacaactggtactctattataaaaaggaat tttctttctgtaaacaatccccctttattgttggaatattgcaaatcgag ctgacaatatattgcggacaccttttcaatatattgtcgacattcagcaa tatatcatcaatatattgcctgacaatatattgtgtagtgtatgtagccc tttaggGCCTTTTTTATAATGTGGGAAATAGAATATTGAATTTTGAGTAA ACAAAGAATATCTTTTTCTCCCTTGTTGTTTTGCTTCCATCTTACTTTCC AGAGTGGGCTTTTTGTGCCAAATAAGATGATCAACTGCAATCTGAGTAAC AACAGtttcgaaaagttttgaaaagttcaaactTTAGAAACTTAACAAGT TAATTTGCTTGTTTTAAATATCTGTTTTCTTGAAGCCTCTACTGCTTTCA ACTAGCATACAACTTTCAActatctctaattcgaacttagTCTTACTATA ATTTGAACCGTAACATTGGTCCCTATAGCAGcttaaatataattttagat attttaaataACCTCGTGATTCAATTGTAACACATGTTAGAATTGAATCA CGAGGTtatttaaaatatctaaaattatatttaagCTGCTATAGGGACCA ATGTTAAGAGCTTCGAATGATATCTTTCTCTTTTCAGTGATCTTGGTTTG TTTGTGGCAATGGGTGGAATCGGTATGTTTGGTGGACAGCTCTTCTATAT TATCGGATTAATAAACACCACACCAGATACTGCATCCATGTTTCAACCTC TGACTGCTGTCCTATGCACTATTGTCGCTATTTtaatgaaagttgaaaaa gtacCGAAGCTGTCTGAACGCACTGGTTTGGCAAAAGTTGTTGGTATTTG TCTAGCAACTCTGGGTGCTTTGATAATGACTTATAGTAAAAACAGTAAAC ATTCTGATGTCTCGAAGGATGAAAAAAGTAAGATCGGAGAACCGAATTTA TTTGGGATTCTTTGTCTTCTTGGTAATATTACCACATCCTCAGTATGGGT TGTTATGCAgaagaaatatattttcaataatCCAGAATCGAGATGGCGTC AATTCCCAATAAACGTTACTGCATGGAGTTACTTCTTCGGTGCCTTATGG ATGGCTCTTGCTTCAACCTATTACATCAATGATCATGATAAATTCCATAT TAGATCAAAGAATGTATTATACTGTTTGATATATGCTATTTTCGTAACAT CAGCTTTATGTTACGGTCTTATAACATGGTGTAACATGCAGGTAAACGCT TCATTTGTGACCGCGTCATGGCCCTTGCAAGTTGTGTTTTGTTTGACATT ATCGTATATATTTCTTGGTGAAACATTGACAGTCGTTGAGGTGTTTAGTG GTTTGTTGATTATTTGTGCTTTGATGGCTGTCACGTGGTCTAATTATAAC GAGAGAAAGCCGAGAATAGTCAATGGAAAACTATTACGGTGAGATGAAAA TATGAATGAGAATGCTTCATCAAAAACGAGAAAACTCGAAGAGATAGAGA GGTGATAACTTCTCCAATTTCTCTACTATCCCAATTTTGTTTTGCAATTC AAAATTACATTTGCCCTCACCTTGAAAAGTAAAACTCTCCACAATTCGTA GACAGTTGTTGGTGCTCCTTAAAAatgtaatttatttatttatttattaa agaattacagtccaggcacacgagggcctctaaaccgatcttgtacaaaa aatcttttttaggtaCAGTTTGTCACGAGGACTTCCCCGCACCCTCCAAT TAAAGT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000074_pilon:57901..67106+

>MSTRG.10583.3.p1 ID=MSTRG.10583.3.p1|Name=MSTRG.10583.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2352bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000074_pilon:57901..67106+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGGGAAGAGATTTTCGCGCCGAAATATTTGTCCCGCGATGCACGAAAAGC
GAACCGACACGTTTTGAAAGCAAAACACGAAAAAACCACAACTGAGTACA
tttttttGGCTGCTTTTTATCCGTATTCTATGTCCATCTCGTTGCATGCA
GTGCTCAACATGGATGGTAATGTCAGATTTGCATCTGTTTGTTTAGCACT
TGTCATACTGCAAGCTGGGTTTGGAGCATATGGAGTTATTTACACTAAAC
TTGCAAAAGGAACAGAAGTTGAACCTCTAATCTTTTGTTTCTATCGTGAT
GGTGGATGTGCACCAGTTTTATTTTTGCTAtcatactttttggaaaaaag
acttTTGGTTCCTCAAGTAAGTGATCTTGGTTTGTTTGTGGCAATGGGTG
GAATCGGTATGTTTGGTGGACAGCTCTTCTATATTATCGGATTAATAAAC
ACCACACCAGATACTGCATCCATGTTTCAACCTCTGACTGCTGTCCTATG
CACTATTGTCGCTATTTtaatgaaagttgaaaaagtacCGAAGCTGTCTG
AACGCACTGGTTTGGCAAAAGTTGTTGGTATTTGTCTAGCAACTCTGGGT
GCTTTGATAATGACTTATAGTAAAAACAGTAAACATTCTGATGTCTCGAA
GGATGAAAAAAGTAAGATCGGAGAACCGAATTTATTTGGGATTCTTTGTC
TTCTTGGTAATATTACCACATCCTCAGTATGGGTTGTTATGCAgaagaaa
tatattttcaataatCCAGAATCGAGATGGCGTCAATTCCCAATAAACGT
TACTGCATGGAGTTACTTCTTCGGTGCCTTATGGATGGCTCTTGCTTCAA
CCTATTACATCAATGATCATGATAAATTCCATATTAGATCAAAGAATGTA
TTATACTGTTTGATATATGCTATTTTCGTAACATCAGCTTTATGTTACGG
TCTTATAACATGGTGTAACATGCAGGTAAACGCTTCATTTGTGACCGCGT
CATGGCCCTTGCAAGTTGTGTTTTGTTTGACATTATCGTATATATTTCTT
GGTGAAACATTGACAGTCGTTGAGGTGTTTAGTGGTTTGTTGATTATTTG
TGCTTTGATGGCTGTCACGTGGTCTAATTATAACGAGAGAAAGCCGAGAA
TAGTCAATGGAAAACTATTACGGTGACGGGAAGAGATTTTCGCGCCGAAA
TATTTGTCCCGCGATGCACGAAAAGCGAACCGACACGTTTTGAAAGCAAA
ACACGAAAAAACCACAACTGAGTACAtttttttGGCTGCTTTTTATCCGT
ATTCTATGTCCATCTCGTTGCATGCAGTGCTCAACATGGATGGTAATGTC
AGATTTGCATCTGTTTGTTTAGCACTTGTCATACTGCAAGCTGGGTTTGG
AGCATATGGAGTTATTTACACTAAACTTGCAAAAGGAACAGAAGTTGAAC
CTCTAATCTTTTGTTTCTATCGTGATGGTGGATGTGCACCAGTTTTATTT
TTGCTAtcatactttttggaaaaaagacttTTGGTTCCTCAAGTAAGTGA
TCTTGGTTTGTTTGTGGCAATGGGTGGAATCGGTATGTTTGGTGGACAGC
TCTTCTATATTATCGGATTAATAAACACCACACCAGATACTGCATCCATG
TTTCAACCTCTGACTGCTGTCCTATGCACTATTGTCGCTATTTtaatgaa
agttgaaaaagtacCGAAGCTGTCTGAACGCACTGGTTTGGCAAAAGTTG
TTGGTATTTGTCTAGCAACTCTGGGTGCTTTGATAATGACTTATAGTAAA
AACAGTAAACATTCTGATGTCTCGAAGGATGAAAAAAGTAAGATCGGAGA
ACCGAATTTATTTGGGATTCTTTGTCTTCTTGGTAATATTACCACATCCT
CAGTATGGGTTGTTATGCAgaagaaatatattttcaataatCCAGAATCG
AGATGGCGTCAATTCCCAATAAACGTTACTGCATGGAGTTACTTCTTCGG
TGCCTTATGGATGGCTCTTGCTTCAACCTATTACATCAATGATCATGATA
AATTCCATATTAGATCAAAGAATGTATTATACTGTTTGATATATGCTATT
TTCGTAACATCAGCTTTATGTTACGGTCTTATAACATGGTGTAACATGCA
GGTAAACGCTTCATTTGTGACCGCGTCATGGCCCTTGCAAGTTGTGTTTT
GTTTGACATTATCGTATATATTTCTTGGTGAAACATTGACAGTCGTTGAG
GTGTTTAGTGGTTTGTTGATTATTTGTGCTTTGATGGCTGTCACGTGGTC
TAATTATAACGAGAGAAAGCCGAGAATAGTCAATGGAAAACTATTACGGT
GA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10583MSTRG.10583Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10583.3.p1.exon1MSTRG.10583.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10583.3.p1.exon2MSTRG.10583.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10583.3.p1MSTRG.10583.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000074_pilongenomesc0000074_pilon:57901..67106 +