MSTRG.10577.9.p3 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10577.9.p3
Unique NameMSTRG.10577.9.p3
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000073_pilon:1470961..1486529-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10577.9.p3 ID=MSTRG.10577.9.p3|Name=MSTRG.10577.9.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15569bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073_pilon:1470961..1486529- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATTCGTTGCACCTGCTATGTATATTATGAACCAATTTCTTTAATCATCAA TTTTGTATGAGAACCAGTCAGAGAAGACTCTTCCTTCCTTAAAAATCTTG TTTTCATCGACACCACCTTATGATCTACCATTCTAATTTTTGTTCAATTT CTTCTTCATTTTTCTCTCTCATGTCAATATTTTTATTTTATTGTCTTGTT CATTTGATTGTCGAATGTTTTATTATTTTGTTCATCACCTTAACTAAAGA GGATTGCTGCTCATAATTCCTGACAGTAAAGTCGCTCCTTTGTTTTGCCG GGGATGAAAACTACTTTAACTGCTTCTGGTCACCCTCTTTTCTCAGGAGA AGAGAAAACCTCAACGAATTACTTTTTCCATCCATTGTTTCTTCATTTTT TAATAATCGTATATCCCTCAGAACATAATAAAGCAGCTGGTCAAACCCAG AGACATCTTACAAATTTCAAAACAATGTAGCGTTGTTACAAATGGAGAAA GATTATTCCGTGATATACTATCAAGTCGTTTCATGTACATCTCATTAAAG AACAGTGTAGTATTTTCTTCTGATTAATACCTTGTCATGTTTCACCGTAT GTTATTAATGAGCTCTTCAAATACATAGTTAATTGACAGATAATTAAGTT GGTTAATTGATACCCATTGCTTTTGAATGAAGATCCCTTGTTGTGATATT ATGGGAACAAAATACGGTCAGGTGCAGGAAGTAGATCTCATTTAGATCAT ATTCTCTCGCATGGTCGGCTGGATGCAGTGCTCTATCTTCGATTGTTGTA CATACATAGTTTTCGTTCTGTTTGCATGAAGGATTCTTGTGTTGTGATAA CAGTCTTTCAATGATGGTGTGATTTGCATTTCATATTTATTTGCGATGAT AGCTTTCCCTTTGCCTATTTGAAATGTACTTTGTCAACAATAAGACTCAG GGGAATCTTTTCATTTATTGATATTAAGATTTTGGTTGGGGTTCTCTTGC TGTTGTCTGTTTGACTGGTGTACATTATGTAATGACACCCCGACGTGTGC TTAGTAAGAGGTACCTCACTGCGATTTTACTCTGTTAATAAGATTGTTTG GTACTCTAACGACCTATGATCTCTTTGGAATTTGCACTCTCAAACTGTGC TTTACAATGGAAGGATACTGTGAAATTTAAATTGATGACATTGAATTATT TTCTTCTGGTTCCTGATGTTTTTGTTCATTTCGTCATTTTTCTCAGATCT GTTTTTATTGTCACTTCAAACAATTTTGTCTCTCTAAACATCAGTTTTTA AAAACCTACTCGACACGGTTTTAAAAGCATACATCAGTCAGTTCACGAGA AAATCACAGAAGGTCAGTCCGGAAATTTTATGCTGAATTATTATCATCTG ACTTCCTTTTAATTTTTGTCTATTTCTCTTTAAAGCGAATAGATTACAAG CAGAATCCATAGACAAGCTATTTTGGAAACAGGTATGTTGATTTTTGTTC TTATAGATAGTACAACATGACATCCCGATATTTTGAAGTTGTCACGGATC ACTTCTAATTATATAGGAAAGTTGGTTTCTTTGAAAACTTTTGTCATAAG TCTTTTTCTTACAATCATTATCACTAAGACTTTGTGAAAAGTTAAAAAAA ATCTTTGGGTTAGTTTGTTGATGTATCAAAAGACAAGTGTAAAATGGATC AAGTTCCACAAATGAAATAAGAGATCGATCATTTCTCTTTAAGTAAAGAA AGCTCCAATCATAATCTGTCATTATAATCAAGAATATACTATTTTTTGCC GTCATCAAATAAGACTTATATCTCGATCAAAAGTATCAGTTTAAAAAGAA CAGATGTCATTCTACACTTTGTTTCTCTAGGCTGATTATCATAGTGGAAG TCATCATGTGCCGTCATTTGGTTGTCTACATTTTGCTCGTTCTGGCTTCT CTCTACCGAAGCACACACTCAGCTGGTACTACACCTGGTATTAAAGAAGT CTTTATCGGAAGATGTTGGCAATATCAAAGCATCTCTGAACATAACAAAC TACCTGAATTAAAAGTGAACATAAACTGTACAAAATTATGGCTGGCTTTT TACGATTCGTTCGCTTTCAAAGATCCTTGTACTGTTGGGGTAGATGATTA CAAGACGTTCTTTGATATGTTACATACCTCTCGAAAAATCAAGAATGCTT TGTTTTGGTCTGGTTTGCATGACTTGGTAACTGACTTCACCTTCATAAAT GATGATTACATTGTACTGGAAGATACACTTACAGGGTAAGTTCTCCATAT GTACCATTTGAACATCACTTTCAAAGAAAGATTTATTTTGTTAAAAACTG TCCCTTCCCAATTAGCTCGTACAGCATCGCCCATTTTTCTGTTATTTTTT ATGTGAAACTTTCAGGTACCTGCTAAACAATCTTAACTGGTGCGGTGGAA CGGACGCAGATGGACTAAATTCAACATCTTGTTCGAAAACGTGCAACGTT ATGACACCTGCTTGGACATTGGCATCTTCAGAGGTACGAGGTATGTTTTT ACCATCGTAAACCTTTTCTTTGTAGTCTAAATAGAATAGTGCTCAGTACG ATTGGTACATGAAAAGGAAATTACGTCAAAAAGTTTTCAGCCAGTAAATT GTCTTCGGATTTTTTTAGACTCTGGATGTTCGCTTACATTGAAAACCGAC ATATTGTTAATTGGTTTTATTTTTATTAATCCTTTTTTCAGTTCGCTAAA CGATCAACTGAAACAGCCAAAGTTCTCTTGAACGCGACACGTGCTAACAA CAAAGACGCGTATGCTGATGGCAGGTTTGTCCGTTTTTCTTGTTCTTTAT CCGCAGAAATATTTGATTTTGCTTACTACCATCGCAACAGACAGTCTCTG ACCTCCTCAATCCTATTAACCCTGATTATCGGTTTCTACGTAGACAGCTC TATATGACGAGGCTTTTTGCCAAAGAGATTAAACTTTCATTATTTTTCAC TTTCGATTCTTGTTTCAGTTTCTTCCGAACCGTTGAAATGCCAGAACTGC AAGTGGATAAACTTGTTGTATATTTAGCTTCCAGTATTGGTAAAGAGGTC AGGTACGTATTCTTAATTTATTGAATTTTGACTTTCTTGGAATATATCCA GGAGTTGGTTGTAAAGGGAAGGGAAGGATTTTTAGAATTCTTTGTTTTGT CTCCATAGCATAGATATCATTACACTTTAATTATTGGAAAATTAGTTTTT GCTACCCACAAAAGGAAATTGACCTCTCATTAAAACCCTTCATGAACATT CAAAAAACAAATTATGAAAAGCCTTTATTTCTAAATTTTGCCATCTGTTG TAAGGTTATATAATGATCAGGCTTAATCAAATGACCAATCGACGTCAATT TCTGAATGAATTTTTGCGATGCTAAACTGCTTCCTGTTTTGTATATAATG TTAATTCAATTATTGAAAAAAATGAAAAAATCGATTTTATTAAGATTAAG CCTCTTTTGGCTTACGTTGTAAGGGGGAGGGCTTTGTGTTATTGCGAAAT CCTTAATCCCATGTTCGTTTGAGATTCTGTCGCTGAATCCTACAACTTCC TGTCTTCCAGAATAAAAAACAATACAACTTTTGAGGGTAGAACTGTTCAT TTTCTCTTCAATACTTGAAGTCACATCTTACAGTATATGACATAATAAAA GTTTGAATTCTTTCTCTCCAGGGAAAGATGTGCGGATTCGATTTCGATGG AAAATATACGGGCTGATGCGGAAGCTAAGAATATCCAAGTGGAATGTATT GATCAACCAAGGTAAATGTCTGACGAACCTCTTTCTTGAGTGTTGAAAGC AAATACCTTTCCTCAATTTAACACCCTCTCTAACCTTAAGTACTTTGAAA GGTGTTCCTTGGTAAATTTCATTCCATTACAAATATCATCTCTTGCTTTC TTAAAAAACTTTCATTCGAAAAGACTTCTATCTTTATTCTTTGGCCAGGA AATGTTAGTAATTAATAAAGAACATTTTCGACATTTTTTCACTTCTTTCC TTCTTCTGACTGCCCATACATCATGTCTTTAATCGCAGATTTCCTTGCCA AGATTTGCAACTTCTCAATCGAAATCTTTAATGTATTTATAGTTTTCAAA GCAACAAAAAAATTTCTATAGCACATAATAACACCGACTTTATTGATACT GAACTTCAGGAAGTCGGTTTTAACTATCACATTCACTTTCGATGGTTGTC CTACAAGAGCTTGTGAAAATCCTACTAAGTTTTTGAATATCTGTTAAGAT CGCTTCCCACTCTGCTTAAAGCTTTCTTCTACTAAATAATTAAGCATCGC ACGTTGTTCAACCACTAAAAAAGCTGATTGGAAAGCAAACTTTAGTAGTA ATTCTCCTAACGCCTAAAATTGAAAGGGACATTAACGTTTAAGTCTACCT GGAAATTCTATGAAATGATTTCATGAGAAAATCACTGAGGGCCACATTTA ATCGGATTTGCATATCCAAAAATACCCATGCCACTCTCGCATACCTCTCA GATCAACATTTTAAAGCTAACTGCACTCAAATGCCCTTATCCTATCCACT TTCAGCCTGGTACTCAATGTTTATTGTTTGAAGTACCCAAAAGCCAAAGA ATGTGTCAACAAGGATAACTTTCGAAGCGATTCAAACGCCGATAAAGAAG AAGCTAGGTAAGCAGTAAACCTTTTACGGGATTGACTTCTAAGGGCCCTT GCATACATCATCAATTTAGTAATTGAAACCGCTCTCACTCCCAACTTGGA CTAGCTGCACATATTTGAAGTGTTTTTAAAGTGCCTGACTTGGACTGGTA TTCATATTACAACAATTAAAAGAGGAATTTCAAGAGTATTGTTAAACAAG TTTTGTCCTTGTTTAAACGTGTACCTCTTGACAATCCACGGAATTTAAAA GCAATCATTGATAATATGAAAGAATATATACCTTATTATGGTCCATTACA TGAATCTATCCCATTTTTGATCTCGCTTATCTATATGTCATGCAATTTCA TCATCTTATAAACGATTCAACTCAGGACATTGAAATTGGTGACCATCATT TTATCAATCACTCTCTTCGTTACCTTCCTGGGCTGTGTACTGTTGTTAGC CTTCCATCATCGTAAAACTATTCGCAAAAGAGCACTAAATCAGAAACATA ATAATAAGACCACAGAAATAACAATTCAAATGAACTTTTATCAAATGAAC CAAATGGAAAAACAATGTGGTTATAGTTTCATGTGGTGTTCATGACGCTG AGGTTATGCATGTCCTCCTCACAACCTGTGTCTTAACCTTCCCTAACCTC CATGCACCTTGTAGTTTACACTCGATTGTTCGAACCTACCCTGTCTGCCC TTTTTAGCATGTTCTGTTTGAAAATGATGTGAGATAGCGTTTCAAAGTCC CGTGCTAACTGGGAGAGGAAGAATCCCCTTCGCTATTTCTTTAATTTCAA TTTTTGAATCAACTCGCACTGGATTTTTTGAAGTTGAAAGATATTGATTT CGAAATCTGAAGCTAATGAAAGACTTTCCTTCCGTTTAATCATGCCCTTT ATTTCTCAACCCTTTCTGGGTAAAAACATGGTCTATGGGGCATGGGTGTC AACGTAATGACGAGTGCATGAATCGGGCTGTGAAGCCCTTTTTTTAATTG TTAATGCATTCATTTTCATTCATTGTTATGTATAGGAAGTGGATGATAGT TGGTATTGTGTTTTGCACACTGTTTGTTGTCTTCTCTCTCACTGCACTCA TTGCATGGATCCTCAAACATAAACAATCCAAACATCGAACTGCTGTCCAA ATGACCAAAAGTGGTGAAGTCATCGCTAACCCTCAAACCATTAACAACAA TGTCTAATTCCCTACCCCTAACTACTTACTCACACTCATAATATTCATTT TGGTGTAATTTTTATAATGATTTTGTATGGGAGGGTTTGATTTTTTACAA GGTTTTTTTATATTTTGATAATAAAATGGTGTTTGGTGTAAGTCTATCAA ATTATATTTTCATCCTTTCGAATTTCGAGTCGTTAGCTAATATCTTCCAT TCGTTCACTCAATATCGTGAACATCAGAAATTAGACAAATTTTTGCTTTA AAACATCGAGTTTAATGAAGCCAAAAAGTTGACTCCTGCACTTTTATTGT TGTTCAAAAAATGATGTCATTGTTGAGCTTATCAACAATCATCAAGCCTG ATAGCTTTCAAAAAGAGTCTTTTCCAAATATTGGTAAGGGAGGGAGAGAA AAAACAATCGGGGCTTGGTCAAGGAAGGCATATTGAATTAATTCCTAATC ATTAAACCCTGTGTGCATATTCAAAGTTAATTGAGTACTTATGATCGACT AACATAAACTTTTTGGGACTAATTTCTCACACAGGTTGTGGAAAACCGTT TGTTTGATTTTGGTAGCCGTGGTGGCTGTTCTAATCGTTTACATCACGAT CAGTCTCGTGCACCGTGCAGTGTGTTACAAACCGGGTGATTACAAATATT CACATAGCTGGTCTTTCTCAAAGAAACCCATGCTGCAGGACGATGAGGTA GAAAATAATAACGATATTGAACGTGTGGTGTGAGACCTGCTTTGTCATAA AAAGGAAAACTGCAACAGTATATTAACCTGAAGTTATGGTTAGTTTTTGG CAGGAGATGACAGGTGGAGGATGGAGGGTTCTACTTCGCGTCACTAAGCC CACCGCTGTATTCACCAGCCGTCAAAAGATATCTAAGAGAACAAGTGCTC TGTATTATATGACGGAACGAACACTTTACCAAGAGACATTCAAGTTATGC AATGTTAATTATAATTTGATTCACAATTTTTCTGACAAAAGAAGAAACTG TGCATAAAGATATTTTAAATATCCGGGATTTCAGTTTATTCAAGCTTCTT TAAAGTATTGTAAAATTAGATGTACGATTTATTAAGGTAGAAATATTAAT GAAGATTTATGCTTGAAAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000073_pilon:1470961..1486529-

>MSTRG.10577.9.p3 ID=MSTRG.10577.9.p3|Name=MSTRG.10577.9.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=930bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073_pilon:1470961..1486529- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTACCTACTAAACAATCTTAACTGGTGCGGTGGAACGGACGCAGATGGAC
TAAATTCAACATCTTGTTCCGAAAACGTGTAAATGTGTCGCGCTCATTTG
GTTGTCTACGTTTTGCTCCTTCTGGCTTCGCTCTACCGAAGCACACACTC
AGCTGGTACTACACCTGGTCTTAAAGAAGTCTTTATTGGAAGATGTTGGC
AATATCAAAGCATCTCTGAACATAACAAACTACCTGAGTTAAAAGTGAAC
ATAAACTGTACAAAATTATGGCTGGCTTTTTACGATTCGTTCGCTTTCAA
GGATCCTTGTACCGTTGGGGTAGATGATTACAAGACGTTCTTTTATATGT
TACATACCTCTCGAAAAATCAAGAATGCTTTGTTTTGGTCTGGTATGCAT
GACTTGGTAACTGACTTCACCTTCATAAATGACGATTACATTGTTATCGG
TGATACGCTTACAGGGTACCTACTAAACAATCTTAACTGGTGCGGTGGAA
CGGACGCAGATGGACTAAATTCAACATCTTGTTCCGAAAACGTGTAAATG
TGTCGCGCTCATTTGGTTGTCTACGTTTTGCTCCTTCTGGCTTCGCTCTA
CCGAAGCACACACTCAGCTGGTACTACACCTGGTCTTAAAGAAGTCTTTA
TTGGAAGATGTTGGCAATATCAAAGCATCTCTGAACATAACAAACTACCT
GAGTTAAAAGTGAACATAAACTGTACAAAATTATGGCTGGCTTTTTACGA
TTCGTTCGCTTTCAAGGATCCTTGTACCGTTGGGGTAGATGATTACAAGA
CGTTCTTTTATATGTTACATACCTCTCGAAAAATCAAGAATGCTTTGTTT
TGGTCTGGTATGCATGACTTGGTAACTGACTTCACCTTCATAAATGACGA
TTACATTGTTATCGGTGATACGCTTACAGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10577MSTRG.10577Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10577.9.p3MSTRG.10577.9.p3-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10577.9.p3.exon16MSTRG.10577.9.p3.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10577.9.p3.exon15MSTRG.10577.9.p3.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10577.9.p3.exon14MSTRG.10577.9.p3.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10577.9.p3.exon13MSTRG.10577.9.p3.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10577.9.p3.exon12MSTRG.10577.9.p3.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10577.9.p3.exon11MSTRG.10577.9.p3.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10577.9.p3.exon10MSTRG.10577.9.p3.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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