MSTRG.10446.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10446.3.p1
Unique NameMSTRG.10446.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000072_pilon:1279414..1317823-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10446.3.p1 ID=MSTRG.10446.3.p1|Name=MSTRG.10446.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=38410bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:1279414..1317823- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCATAATCAGATATTTGCTATTCAAAAAACACACACATTTTTTCGTGTCA AAACCTTTGTCAGTGGTGAACTTTTGAGTTCTTCTTACTTTTTAAATTTT TTATTTGTCGTGTGATATCATGGATTTTGCTCAGGTATTTTTCTTTCTAC ATTATCGGTCAAAATATATCAAGAATTTTGGTTAATTACTCGTTTTTAGC ATTGTATATTTTTGGACCGTTCTTTTAACTTTTGAAAGTCTTAAGTGTTA TTAGACTTTTTGTCGCTCATGTATTATCATAGAATATATCAAAAATGTTC ATCAACTCAAAGTTATCTTTACAACGATTGATATCCTCTTCCCTTTCTAT TTTCAGATTATTCTACCGTTGTCATTTTTCTTCATCATTACTACACATGT CGAAAGTAAGTTGTCGCGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGCGCATGTTGAA AGTAAGTTGTCGCGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGTGCATGTCGAAAGTA AGTTGTCGCGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGCGCATGTTGAAAGTAAGTT GTCGCGCATGTCGAAAGTAAGTTGTGTGTTGTGTGTCGCGCAGTAAGGTT TGTCGCGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGCGTCGTGCATGTCGAAAAGTAA GTTGTCGGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGTGCATGTCGAAAGTAAGTTAA GTTGTCGCGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGTGCATGTCGAAAGTAAGTTG TCGCGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGTGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGC GCATGTCGAAAGTAAGTTGTCGCGCATGTCGAAAGTAAGTTGTCCGCGCA TGCGAAAGTAAGTTGTCGAAAGTAAGTGTTGTCGCATGTCGAAAGTAATG TCGTGATGTCGAAAGTAAGTTGTCGCGCATGTCGAAAGTAAGTAAGTTGT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000072_pilon:1279414..1317823-

>MSTRG.10446.3.p1 ID=MSTRG.10446.3.p1|Name=MSTRG.10446.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7497bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072_pilon:1279414..1317823- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACGACCGATATCCGAATCTTCTTGTGGGCTAACATGGAACAATTCTAACC
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CTCCAATTGTCTTTATTCACTGGACGATGGCGCTAAATGGATAGAAAGTT
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GAATGCGTTTGTTTACTTGGCTTCAACCGGCCACATGATGTATGATGAAC
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AACAGAAATCGTGGCTTATGTTTTGATGTTGAGTCGGGGACAGAGTACGT
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ACGAAAAAAGGCTTGATTGATGAATGCGTTTGTTTACTTGGCTTCAACCG
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AAAAATCACCGAATTGAAAGCGTTCATTCCCTCAGAAGATTCATTTTACG
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TAACATGGTTTCTATCACAAATCTGGACGACATGCAGCTAGCAGGAACAC
CCGAGGATACTGATTTCACCAGTATCAAAGCTTTCCCACAAGACATAATG
GACAAAATTTCCATGAAATCTATGCTGAAAATTTCCACTTCAAAAGGCCC
TACTTTGTTCGTTTGCACGCCTTCAAAAGATTTGTGGTCCAACTCCAATT
GTCTTTATTCACTGGACGATGGCGCTAAATGGATAGAAAGTTGGGCAACG
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AAAAAGAAGTTGGGCATGTATCCAACTCAGGAAGATTATCAAGGGAAAAC
ACAGTGTATGGAATACCCCAATAGCCCAACTTATATCACATTCGGTCCTG
TTACTACACCAAAGTCGACCGGCTTCTGCGGTGATAAACTCGCCTTTATT
CGAGAACCCAAACGAATCAAGAACAGAAATCGTGGCTTATGTTTTGATGT
TGAGTCGGGGACAGAGTACGTCAAAATCTCATCAAGATGTCGGGATTCTT
TTTATTTGGCGCCCGATGAACCCTTCCTCATCCACGCACAGTCCGGAAAG
GGGGTTCGTGTACACAAGTGGCATTCCAGACATCGCGTGGTCATCTCACA
AAAAGTCAATCGATACAACAAACGAAAAAAGGCTTGATTGATGAATGCGT
TTGTTTACTTGGCTTCAACCGGCCACATGATGTATGATGAACAAGCACAG
CCGCACAGCTTTATGGATGTCAATTACTGCAAAGTATCCACCCTTGGTTT
GTATCGCCAAGAAACGACCGATATCCGAATCTTCTTGTGGGCTAACATGG
AACAATTCTAACCATGACGCCAAAAATCACCGAATTGAAAGCGTTCATTC
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AAATATCACGTGGAAACCGGCCTTCTTCATTACGTCACTCTCACTGAATA
TCAAAGCAAATTATCTGACGTTAACATGGTTTCTATCACAAATCTGGACG
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GCTTTCCCACAAGACATAATGGACAAAATTTCCATGAAATCTATGCTGAA
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TGGATAGAAAGTTGGGCAACGAGCAGGTGAAACGAAACTCCAACTGGTGA
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CTTATATCACATTCGGTCCTGTTACTACACCAAAGTCGACCGGCTTCTGC
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TCGTGGCTTATGTTTTGATGTTGAGTCGGGGACAGAGTACGTCAAAATCT
CATCAAGATGTCGGGATTCTTTTTATTTGGCGCCCGATGAACCCTTCCTC
ATCCACGCACAGTCCGGAAAGGGGGTTCGTGTACACAAGTGGCATTCCAG
ACATCGCGTGGTCATCTCACAAAAAGTCAATCGATACAACAAACGAAAAA
AGGCTTGATTGATGAATGCGTTTGTTTACTTGGCTTCAACCGGCCACATG
ATGTATGATGAACAAGCACAGCCGCACAGCTTTATGGATGTCAATTACTG
CAAAGTATCCACCCTTGGTTTGTATCGCCAAGAAACGACCGATATCCGAA
TCTTCTTGTGGGCTAACATGGAACAATTCTAACCATGACGCCAAAAATCA
CCGAATTGAAAGCGTTCATTCCCTCAGAAGATTCATTTTACGGTTTGTGT
CATTCTGCAAAATACCATTGTAAATATCACGTGGAAACCGGCCTTCTTCA
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TTCCATGAAATCTATGCTGAAAATTTCCACTTCAAAAGGCCCTACTTTGT
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TCACTGGACGATGGCGCTAAATGGATAGAAAGTTGGGCAACGAGCAGGTG
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TTAACATACGTCTCCATCACGACTAACGGAAAAAGTGGTCAAAAAAAGAA
GTTGGGCATGTATCCAACTCAGGAAGATTATCAAGGGAAAACACAGTGTA
TGGAATACCCCAATAGCCCAACTTATATCACATTCGGTCCTGTTACTACA
CCAAAGTCGACCGGCTTCTGCGGTGATAAACTCGCCTTTATTCGAGAACC
CAAACGAATCAAGAACAGAAATCGTGGCTTATGTTTTGATGTTGAGTCGG
GGACAGAGTACGTCAAAATCTCATCAAGATGTCGGGATTCTTTTTATTTG
GCGCCCGATGAACCCTTCCTCATCCACGCACAGTCCGGAAAGGGGGTTCG
TGTACACAAGTGGCATTCCAGACATCGCGTGGTCATCTCACAAAAAGTCA
ATCGATACAACAAACGAAAAAAGGCTTGATTGATGAATGCGTTTGTTTAC
TTGGCTTCAACCGGCCACATGATGTATGATGAACAAGCACAGCCGCACAG
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CGTGGAAACCGGCCTTCTTCATTACGTCACTCTCACTGAATATCAAAGCA
AATTATCTGACGTTAACATGGTTTCTATCACAAATCTGGACGACATGCAG
CTAGCAGGAACACCCGAGGATACTGATTTCACCAGTATCAAAGCTTTCCC
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CTTCAAAAGGCCCTACTTTGTTCGTTTGCACGCCTTCAAAAGATTTGTGG
TCCAACTCCAATTGTCTTTATTCACTGGACGATGGCGCTAAATGGATAGA
AAGTTGGGCAACGAGCAGGTGAAACGAAACTCCAACTGGTGAACAACCAA
TCAGATGCCAAGATCTTCACCTTAACATACGTCTCCATCACGACTAACGG
AAAAAGTGGTCAAAAAAAGAAGTTGGGCATGTATCCAACTCAGGAAGATT
ATCAAGGGAAAACACAGTGTATGGAATACCCCAATAGCCCAACTTATATC
ACATTCGGTCCTGTTACTACACCAAAGTCGACCGGCTTCTGCGGTGATAA
ACTCGCCTTTATTCGAGAACCCAAACGAATCAAGAACAGAAATCGTGGCT
TATGTTTTGATGTTGAGTCGGGGACAGAGTACGTCAAAATCTCATCAAGA
TGTCGGGATTCTTTTTATTTGGCGCCCGATGAACCCTTCCTCATCCACGC
ACAGTCCGGAAAGGGGGTTCGTGTACACAAGTGGCATTCCAGACATCGCG
TGGTCATCTCACAAAAAGTCAATCGATACAACAAACGAAAAAAGGCTTGA
TTGATGAATGCGTTTGTTTACTTGGCTTCAACCGGCCACATGATGTATGA
TGAACAAGCACAGCCGCACAGCTTTATGGATGTCAATTACTGCAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10446MSTRG.10446Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10446.3.p1MSTRG.10446.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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MSTRG.10446.3.p1.exon1MSTRG.10446.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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