MSTRG.10280.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10280.1.p2
Unique NameMSTRG.10280.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000071_pilon:492363..523814-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10280.1.p2 ID=MSTRG.10280.1.p2|Name=MSTRG.10280.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=31452bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:492363..523814- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATCATCTACCAAATTATTTACATCTCTCTTTATCAAATATACGTTCTAT ATAGTAAGCTGTAAATGAATAATTAGGAGGACAATTATTGTTGTTTTAAA GCTTGTCAGTGCATGTCTCATTTTTCATATTTCTTCATTTTTAGTGAAAG CTGATCTTAATGTCCAAAACATCATTCAACAGATTATCATGTACCAAATC TTCAACACTGCAAATCTATCCAAGACAAGCAACAACAGTGACCCTGTCAT TCCTATCCCTCCAACTTCAGCAGTCACTTGGAACCAAGATTCAATGGACC CGTCAAGAGCTGACATCACAGACAAAGTTCATGATCTGTCAAATTTACCA CTACAAAAGGCTCCTATTGATTTGTCAATTGAGGAGAGAAGAATTGCAGT GCTTCGATTTCTTCTACAGTGTTTCACACGCGTTCTTGATGAGCGTTCCT CAAACCCAAATGTAAGATTTTACGATTAATTTCTATTTTGGGGAGAAACA CAAAACACAAATCTCTATTTTTGCTCCTTATGAATTATGTGTAATCTATT TTGGTTTAGTGGGTATTTGTGTTTTTTACTTGGAAAGTAAGCATTCTGTG GTGCTTCTTATCTACTTTGTCTTTTAATGAAGGAATGTCTTCGCCTTCCG AATTGAATTTTCTTTGAGCTTTTGTCCTGATTATGTTTGGGTTTTGTTCT TCTTATAAATTTTGATATAATGTAATACTTAGACGTACTAATTCTAACGT TCCTTCTTTCTATTCAGCGCCTCTCAGATGACAAATGGAAAGACTCTTTA ACCAATGCCAAGACCCTCATCATCCAATACGCATTACTACTGATCACAGG AAAACTCACTAACAAAAGGTGTGTTCACAGTTCTTAGTTATTTTCTGATT TTATGCTTTTTAGTTAATCTTCATTTTTGAAATACTCCGACACTACTTCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000071_pilon:492363..523814-

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GTCGTGTCGGAAGACGTGTTTTGAACCATGTTGGACAGGCTGTCAGGATG
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TTCTGACAACCAGTGTTATGTGAAGGTGGAACAGACGTACTCCATTGGAG
AGATGGATGGACTGTCGTCACCAAGGACGGGAAAAGTTCGATCGCGCATG
CTCACGGGTACACAGTATGTCCACATTACGTCGGTCACGGCATTGGAGAA
GAGTTTCATGAGATGCCACAAATCCTGCACCATGACAACGATTACCCTGG
AAACATGGTCCCAGGAATGGTGTTTACCATCGGTTTTCTTGGACGGTGTG
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GAAGAAATTGGTTGAAGTGACAAAGCAGTGTTTACACGAAGCAATTTCTA
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AAACTTGAAGAGGGAGATATTATCAACATTGATATCTCGCCAGGAGTATC
GACAGACGATTTAGACTTCGTTGCACATCACTTGATCTGTGAAGAAGATG
CTTACCCTTCGCCCCTTCGTTATCAATTCTTTCCCAAGTCTATTTGCACG
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GTTCCAATCCATATCACTAAACCACACTATGCACAGACTGACCATCCTCA
AGGATTCTTGAGTAGTCTCTTTCAAAGTCGCAGTAAGAACCAGGCGAATG
GTTTTGTCAAGAATGAAGCATTAGTGTCGAAAATCAAACAAGCCTGTCGT
GTCGGAAGACGTGTTTTGAACCATGTTGGACAGGCTGTCAGGATGATCAT
TTGCAAGACTAACCCTCAACGTCAATTGAGGACTTCTTACAGCCCAATGA
AGTAAGAATGAAGAAAGTTGAAAGTTTGTTAACGTCGAGAACTCAAGACA
ATCAAGTCAATACCATGTTCCAATAAAGCCGCTCAATTCGAACATACAAT
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ACAACCAGTGTTATGTGAAGGTGGAACAGACGTACTCCATTGGAGAGATG
GATGGACTGTCGTCACCAAGGACGGGAAAAGTTCGATCGCGCATGCTCAC
GGGTACACAGTATGTCCACATTACGTCGGTCACGGCATTGGAGAAGAGTT
TCATGAGATGCCACAAATCCTGCACCATGACAACGATTACCCTGGAAACA
TGGTCCCAGGAATGGTGTTTACCATCGGTTTTCTTGGACGGTGTGCACGG
GGACTTATCCGAGACCTACTTGGTGGGAGACGTGGAAAAGAAAGGGAAGA
AATTGGTTGAAGTGACAAAGCAGTGTTTACACGAAGCAATTTCTATTTGC
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ACGATTTAGACTTCGTTGCACATCACTTGATCTGTGAAGAAGATGCTTAC
CCTTCGCCCCTTCGTTATCAATTCTTTCCCAAGTCTATTTGCACGTCCGT
AAATAACGTCGTCGTTCACGGTATCCCGGACAGGTACTTATTGCAAGCGT
TACCATGTACACATAGCAACAACAAACGAAGAAATCGAAGAGCATTTTCT
TTGGTAGTTGAAACCCCTACAAACATCATCACACAAAGTTGTGACGTTCC
AATCCATATCACTAAACCACACTATGCACAGACTGACCATCCTCAAGGAT
TCTTGAGTAGTCTCTTTCAAAGTCGCAGTAAGAACCAGGCGAATGGTTTT
GTCAAGAATGAAGCATTAGTGTCGAAAATCAAACAAGCCTGTCGTGTCGG
AAGACGTGTTTTGAACCATGTTGGACAGGCTGTCAGGATGATCATTTGCA
AGACTAACCCTCAACGTCAATTGAGGACTTCTTACAGCCCAATGAAGTAA
GAATGAAGAAAGTTGAAAGTTTGTTAACGTCGAGAACTCAAGACAATCAA
GTCAATACCATGTTCCAATAAAGCCGCTCAATTCGAACATACAATCCATA
TCACAGACAGTGGTTTTGAAGTATTGACAAAAGATGATCTTTCTGACAAC
CAGTGTTATGTGAAGGTGGAACAGACGTACTCCATTGGAGAGATGGATGG
ACTGTCGTCACCAAGGACGGGAAAAGTTCGATCGCGCATGCTCACGGGTA
CACAGTATGTCCACATTACGTCGGTCACGGCATTGGAGAAGAGTTTCATG
AGATGCCACAAATCCTGCACCATGACAACGATTACCCTGGAAACATGGTC
CCAGGAATGGTGTTTACCATCGGTTTTCTTGGACGGTGTGCACGGGGACT
TATCCGAGACCTACTTGGTGGGAGACGTGGAAAAGAAAGGGAAGAAATTG
GTTGAAGTGACAAAGCAGTGTTTACACGAAGCAATTTCTATTTGCGGGCC
TGGTCAACACCTTCAAAAGATTGGACAGAGTATAAGCCGTAAACTTGAAG
AGGGAGATATTATCAACATTGATATCTCGCCAGGAGTATCGACAGACGAT
TTAGACTTCGTTGCACATCACTTGATCTGTGAAGAAGATGCTTACCCTTC
GCCCCTTCGTTATCAATTCTTTCCCAAGTCTATTTGCACGTCCGTAAATA
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TTGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10280MSTRG.10280Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10280.1.p2MSTRG.10280.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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