MSTRG.10280.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10280.1.p1
Unique NameMSTRG.10280.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000071_pilon:492363..523814-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10280.1.p1 ID=MSTRG.10280.1.p1|Name=MSTRG.10280.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=31452bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:492363..523814- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATCATCTACCAAATTATTTACATCTCTCTTTATCAAATATACGTTCTAT ATAGTAAGCTGTAAATGAATAATTAGGAGGACAATTATTGTTGTTTTAAA GCTTGTCAGTGCATGTCTCATTTTTCATATTTCTTCATTTTTAGTGAAAG CTGATCTTAATGTCCAAAACATCATTCAACAGATTATCATGTACCAAATC TTCAACACTGCAAATCTATCCAAGACAAGCAACAACAGTGACCCTGTCAT TCCTATCCCTCCAACTTCAGCAGTCACTTGGAACCAAGATTCAATGGACC CGTCAAGAGCTGACATCACAGACAAAGTTCATGATCTGTCAAATTTACCA CTACAAAAGGCTCCTATTGATTTGTCAATTGAGGAGAGAAGAATTGCAGT GCTTCGATTTCTTCTACAGTGTTTCACACGCGTTCTTGATGAGCGTTCCT CAAACCCAAATGTAAGATTTTACGATTAATTTCTATTTTGGGGAGAAACA CAAAACACAAATCTCTATTTTTGCTCCTTATGAATTATGTGTAATCTATT TTGGTTTAGTGGGTATTTGTGTTTTTTACTTGGAAAGTAAGCATTCTGTG GTGCTTCTTATCTACTTTGTCTTTTAATGAAGGAATGTCTTCGCCTTCCG AATTGAATTTTCTTTGAGCTTTTGTCCTGATTATGTTTGGGTTTTGTTCT TCTTATAAATTTTGATATAATGTAATACTTAGACGTACTAATTCTAACGT TCCTTCTTTCTATTCAGCGCCTCTCAGATGACAAATGGAAAGACTCTTTA ACCAATGCCAAGACCCTCATCATCCAATACGCATTACTACTGATCACAGG AAAACTCACTAACAAAAGGTGTGTTCACAGTTCTTAGTTATTTTCTGATT TTATGCTTTTTAGTTAATCTTCATTTTTGAAATACTCCGACACTACTTCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000071_pilon:492363..523814-

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CGTGAGGGTAGAACGTCCCGGCAACGGCAACTTGCGACCGACGAACGGCA
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TCCATCATATTGAAAGGTTTATGGAAACGTCCCATCCATAGACAAGCATT
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TGTAATTACAACTACATCGCCAACCCTTACTTGGTGGCCAAATTGGTGGA
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AACTCATGAGAAGATGTTTAAGATTTTACAGCAGTTCTGCCAGATGGTTA
GTCGACATCCTAACGCAGGGTCGAGGACAAAATGCGGAATTCCCGCTACC
CGAAGATGTTCCGGTAGTTTTCGGTGCATTACCGGATTTCTTTATTGAAG
ATATTGTGGAGTTCCTACTCTTCATTGATATATGAAAAAAAGGAACTTTC
CGAGTTGAGTTTCTCCACCGAATGTTTTTACTTCACCTACTTTTGTCACC
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ATGGAAGCATACTTCACTCAGTGCACGAAACACGATGCTACTCAAGAAGT
GGAAAGCTCAACTCAAGATTGACAGAACGTACGTCGTTAATCCACAAAGT
CGCTTAAACATGTCACAATTTTCCACTATCAAATCTTCCAAAGAAGAAAT
GGCTCAATGGAAGGATTCACTGGATGATTAATGTTCTTACCATACTACAA
AATCTCTTTCGAAAAGTTAAACTCGAAAAGAGTAGACCCTCTCATGGATA
CAGTAATGTTGGATCCAGTCCTTTTGCCCAGCGGTACCATTATGGATCGG
TCAGTCATCGACCGTCATTTACTAAATTCAAATACCGATCCTTTCAGTCG
GCAAAAGTTGACCGAGGATATGTTAAAACCAGATGAAGTTATATCAACTG
AGAGGATTTACAGACATGGTGGAGGAAATATACATTGAGAACAGTAAAAT
GGCTCTCGATCTGGACGATGCGCCTGATGAGTACAGAGCGTTCATACCGG
AAAGAGCTGTTCGATGACTGTATCAGCTTGCTACAAAGAACTGGGTTAAA
AAGTGATGTGAAGAAACCAGAGAAATATGGTTTTCAACCGAAGATTCTGT
TGGATAAGATCACAGACATCTACATTCATCTCGATTCCAAACCCTTTGCC
AATGCAGTGGCTTCTGATGAGAAATTAGCTGAAAGGTTATCAGTGATGTT
GAATTACAATGTCAAACAATTTACTGGTGAAAAATATCGAGATTTAAAGT
GGCGATCATTTCACACGCTTCATCAACATGTTAATTAACGATACCACATT
CCTTCTCGATGAATCTGTGGACACGCTCAAAAACATTCGAGACACACAAG
AACTGATGGCCAACACGACCGAATGGGAGAAGTTACCGCGTGAGGGTAGA
ACGTCCCGGCAACGGCAACTTGCGACCGACGAACGGCAGTGTAAATCATA
CCTTACACTAGCCTCTGAGACGGTAGATATGCTGCATTATTTGACACTGG
AAATCAAAGAACCTTTCTTACAGGAGATGTTGAGTCAACTGGAAGTTCGA
ATGAATTTTACGACAAATTTGGTATTCGCTACCATATTTCCATCATATTG
AAAGGTTTATGGAAACGTCCCATCCATAGACAAGCATTTATTTTGGAAAC
AAATTGTTATTCGCAATGGATCCAGCCCTACAACCACGCGCAAGAAACTT
ATACGAAAAATTCGCCAACAATACGATCGCTGAAAATCATTTGATGAAAG
CACTCATTAAGTTTTATGTTGACATTTACCACAGATATTGGACGATCCAG
CGATGGACGACTTCGTTCCGTTGATTGTCATCCTCTTGTGTAATTACAAC
TACATCGCCAACCCTTACTTGGTGGCCAAATTGGTGGAGCAACTTGTTGA
ACAAGACGTTTGCGCTGTAGCTGGACTGATCGACGAAGAACTCATGAGAA
GATGTTTAAGATTTTACAGCAGTTCTGCCAGATGGTTAGTCGACATCCTA
ACGCAGGGTCGAGGACAAAATGCGGAATTCCCGCTACCCGAAGATGTTCC
GGTAGTTTTCGGTGCATTACCGGATTTCTTTATTGAAGATATTGTGGAGT
TCCTACTCTTCATTGATATATGAAAAAAAGGAACTTTCCGAGTTGAGTTT
CTCCACCGAATGTTTTTACTTCACCTACTTTTGTCACCACATTTCCGTCA
TTCCCGCAATGCGGAAATACATCCAACGAATGCGGGCCATCCGGGATATG
AACAAACTGATCACGGAGATCGAATCACACGAATCTGAATGGAAGCATAC
TTCACTCAGTGCACGAAACACGATGCTACTCAAGAAGTGGAAAGCTCAAC
TCAAGATTGACAGAACGTACGTCGTTAATCCACAAAGTCGCTTAAACATG
TCACAATTTTCCACTATCAAATCTTCCAAAGAAGAAATGGCTCAATGGAA
GGATTCACTGGATGATTAATGTTCTTACCATACTACAAAATCTCTTTCGA
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ATCCAGTCCTTTTGCCCAGCGGTACCATTATGGATCGGTCAGTCATCGAC
CGTCATTTACTAAATTCAAATACCGATCCTTTCAGTCGGCAAAAGTTGAC
CGAGGATATGTTAAAACCAGATGAAGTTATATCAACTGAGAGGATTTACA
GACATGGTGGAGGAAATATACATTGAGAACAGTAAAATGGCTCTCGATCT
GGACGATGCGCCTGATGAGTACAGAGCGTTCATACCGGAAAGAGCTGTTC
GATGACTGTATCAGCTTGCTACAAAGAACTGGGTTAAAAAGTGATGTGAA
GAAACCAGAGAAATATGGTTTTCAACCGAAGATTCTGTTGGATAAGATCA
CAGACATCTACATTCATCTCGATTCCAAACCCTTTGCCAATGCAGTGGCT
TCTGATGAGAAATTAGCTGAAAGGTTATCAGTGATGTTGAATTACAATGT
CAAACAATTTACTGGTGAAAAATATCGAGATTTAAAGTGGCGATCATTTC
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ATCTGTGGACACGCTCAAAAACATTCGAGACACACAAGAACTGATGGCCA
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CGGCAACTTGCGACCGACGAACGGCAGTGTAAATCATACCTTACACTAGC
CTCTGAGACGGTAGATATGCTGCATTATTTGACACTGGAAATCAAAGAAC
CTTTCTTACAGGAGATGTTGAGTCAACTGGAAGTTCGAATGAATTTTACG
ACAAATTTGGTATTCGCTACCATATTTCCATCATATTGAAAGGTTTATGG
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GCAATGGATCCAGCCCTACAACCACGCGCAAGAAACTTATACGAAAAATT
CGCCAACAATACGATCGCTGAAAATCATTTGATGAAAGCACTCATTAAGT
TTTATGTTGACATTTACCACAGATATTGGACGATCCAGCGATGGACGACT
TCGTTCCGTTGATTGTCATCCTCTTGTGTAATTACAACTACATCGCCAAC
CCTTACTTGGTGGCCAAATTGGTGGAGCAACTTGTTGAACAAGACGTTTG
CGCTGTAGCTGGACTGATCGACGAAGAACTCATGAGAAGATGTTTAAGAT
TTTACAGCAGTTCTGCCAGATGGTTAGTCGACATCCTAACGCAGGGTCGA
GGACAAAATGCGGAATTCCCGCTACCCGAAGATGTTCCGGTAGTTTTCGG
TGCATTACCGGATTTCTTTATTGAAGATATTGTGGAGTTCCTACTCTTCA
TTGATATATGAAAAAAAGGAACTTTCCGAGTTGAGTTTCTCCACCGAATG
TTTTTACTTCACCTACTTTTGTCACCACATTTCCGTCATTCCCGCAATGC
GGAAATACATCCAACGAATGCGGGCCATCCGGGATATGAACAAACTGATC
ACGGAGATCGAATCACACGAATCTGAATGGAAGCATACTTCACTCAGTGC
ACGAAACACGATGCTACTCAAGAAGTGGAAAGCTCAACTCAAGATTGACA
GAACGTACGTCGTTAATCCACAAAGTCGCTTAAACATGTCACAATTTTCC
ACTATCAAATCTTCCAAAGAAGAAATGGCTCAATGGAAGGATTCACTGGA
TGATTAATGTTCTTACCATACTACAAAATCTCTTTCGAAAAGTTAAACTC
GAAAAGAGTAGACCCTCTCATGGATACAGTAATGTTGGATCCAGTCCTTT
TGCCCAGCGGTACCATTATGGATCGGTCAGTCATCGACCGTCATTTACTA
AATTCAAATACCGATCCTTTCAGTCGGCAAAAGTTGACCGAGGATATGTT
AAAACCAGATGAAGTTATATCAACTGAGAGGATTTACAGACATGGTGGAG
GAAATATACATTGAGAACAGTAAAATGGCTCTCGATCTGGACGATGCGCC
TGATGAGTACAGAGCGTTCATACCGGAAAGAGCTGTTCGATGACTGTATC
AGCTTGCTACAAAGAACTGGGTTAAAAAGTGATGTGAAGAAACCAGAGAA
ATATGGTTTTCAACCGAAGATTCTGTTGGATAAGATCACAGACATCTACA
TTCATCTCGATTCCAAACCCTTTGCCAATGCAGTGGCTTCTGATGAGAAA
TTAGCTGAAAGGTTATCAGTGATGTTGAATTACAATGTCAAACAATTTAC
TGGTGAAAAATATCGAGATTTAAAGTGGCGATCATTTCACACGCTTCATC
AACATGTTAATTAACGATACCACATTCCTTCTCGATGAATCTGTGGACAC
GCTCAAAAACATTCGAGACACACAAGAACTGATGGCCAACACGACCGAAT
GGGAGAAGTTACCGCGTGAGGGTAGAACGTCCCGGCAACGGCAACTTGCG
ACCGACGAACGGCAGTGTAAATCATACCTTACACTAGCCTCTGAGACGGT
AGATATGCTGCATTATTTGACACTGGAAATCAAAGAACCTTTCTTACAGG
AGATGTTGAGTCAACTGGAAGTTCGAATGAATTTTACGACAAATTTGGTA
TTCGCTACCATATTTCCATCATATTGAAAGGTTTATGGAAACGTCCCATC
CATAGACAAGCATTTATTTTGGAAACAAATTGTTATTCGCAATGGATCCA
GCCCTACAACCACGCGCAAGAAACTTATACGAAAAATTCGCCAACAATAC
GATCGCTGAAAATCATTTGATGAAAGCACTCATTAAGTTTTATGTTGACA
TTTACCACAGATATTGGACGATCCAGCGATGGACGACTTCGTTCCGTTGA
TTGTCATCCTCTTGTGTAATTACAACTACATCGCCAACCCTTACTTGGTG
GCCAAATTGGTGGAGCAACTTGTTGAACAAGACGTTTGCGCTGTAGCTGG
ACTGATCGACGAAGAACTCATGAGAAGATGTTTAAGATTTTACAGCAGTT
CTGCCAGATGGTTAGTCGACATCCTAACGCAGGGTCGAGGACAAAATGCG
GAATTCCCGCTACCCGAAGATGTTCCGGTAGTTTTCGGTGCATTACCGGA
TTTCTTTATTGAAGATATTGTGGAGTTCCTACTCTTCATTGATATATGAA
AAAAAGGAACTTTCCGAGTTGAGTTTCTCCACCGAATGTTTTTACTTCAC
CTACTTTTGTCACCACATTTCCGTCATTCCCGCAATGCGGAAATACATCC
AACGAATGCGGGCCATCCGGGATATGAACAAACTGATCACGGAGATCGAA
TCACACGAATCTGAATGGAAGCATACTTCACTCAGTGCACGAAACACGAT
GCTACTCAAGAAGTGGAAAGCTCAACTCAAGATTGACAGAACGTACGTCG
TTAATCCACAAAGTCGCTTAAACATGTCACAATTTTCCACTATCAAATCT
TCCAAAGAAGAAATGGCTCAATGGAAGGATTCACTGGATGATTAATGTTC
TTACCATACTACAAAATCTCTTTCGAAAAGTTAAACTCGAAAAGAGTAGA
CCCTCTCATGGATACAGTAATGTTGGATCCAGTCCTTTTGCCCAGCGGTA
CCATTATGGATCGGTCAGTCATCGACCGTCATTTACTAAATTCAAATACC
GATCCTTTCAGTCGGCAAAAGTTGACCGAGGATATGTTAAAACCAGATGA
AGTTATATCAACTGAGAGGATTTACAGACATGGTGGAGGAAATATACATT
GAGAACAGTAAAATGGCTCTCGATCTGGACGATGCGCCTGATGAGTACAG
AGCGTTCATACCGGAAAGAGCTGTTCGATGACTGTATCAGCTTGCTACAA
AGAACTGGGTTAAAAAGTGATGTGAAGAAACCAGAGAAATATGGTTTTCA
ACCGAAGATTCTGTTGGATAAGATCACAGACATCTACATTCATCTCGATT
CCAAACCCTTTGCCAATGCAGTGGCTTCTGATGAGAAATTAGCTGAAAGG
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TCGAGATTTAAAGTGGCGATCATTTCACACGCTTCATCAACATGTTAATT
AACGATACCACATTCCTTCTCGATGAATCTGTGGACACGCTCAAAAACAT
TCGAGACACACAAGAACTGATGGCCAACACGACCGAATGGGAGAAGTTAC
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AACTGGAAGTTCGAATGAATTTTACGACAAATTTGGTATTCGCTACCATA
TTTCCATCATATTGAAAGGTTTATGGAAACGTCCCATCCATAGACAAGCA
TTTATTTTGGAAACAAATTGTTATTCGCAATGGATCCAGCCCTACAACCA
CGCGCAAGAAACTTATACGAAAAATTCGCCAACAATACGATCGCTGAAAA
TCATTTGATGAAAGCACTCATTAAGTTTTATGTTGACATTTACCACAGAT
ATTGGACGATCCAGCGATGGACGACTTCGTTCCGTTGATTGTCATCCTCT
TGTGTAATTACAACTACATCGCCAACCCTTACTTGGTGGCCAAATTGGTG
GAGCAACTTGTTGAACAAGACGTTTGCGCTGTAGCTGGACTGATCGACGA
AGAACTCATGAGAAGATGTTTAAGATTTTACAGCAGTTCTGCCAGATGGT
TAGTCGACATCCTAACGCAGGGTCGAGGACAAAATGCGGAATTCCCGCTA
CCCGAAGATGTTCCGGTAGTTTTCGGTGCATTACCGGATTTCTTTATTGA
AGATATTGTGGAGTTCCTACTCTTCATTGATATATGAAAAAAAGGAACTT
TCCGAGTTGAGTTTCTCCACCGAATGTTTTTACTTCACCTACTTTTGTCA
CCACATTTCCGTCATTCCCGCAATGCGGAAATACATCCAACGAATGCGGG
CCATCCGGGATATGAACAAACTGATCACGGAGATCGAATCACACGAATCT
GAATGGAAGCATACTTCACTCAGTGCACGAAACACGATGCTACTCAAGAA
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ATGGCTCAATGGAAGGATTCACTGGATGATTAATGTTCTTACCATACTAC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10280MSTRG.10280Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10280.1.p1MSTRG.10280.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.10280.1.p1.exon28MSTRG.10280.1.p1.exon28Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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