MSTRG.10278.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10278.1.p1
Unique NameMSTRG.10278.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000071_pilon:473889..481892+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10278.1.p1 ID=MSTRG.10278.1.p1|Name=MSTRG.10278.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8004bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:473889..481892+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CACAAATCATGCATGGTTCTTCCTGCAGAATAGTAAACCAGTAGAGAATG ACTCCAATTCATGTAAGACGAATTTAAATTCAGAAACGTTGGGTTATCAG TCTCGAAACGTTGTGCGAACAGGAAACGTTGCTTGAAATGAAGGCGTATT CCGATCTAAGAAATGTTCCGTACTTAGACACCTACAGGCCATAACATGGT TTGGCTGAAAAGACTTGTCCTTTCTGGATCTTGTGGTGCAATTGCCAGTA GCTTTTTTAATCTGTCAACGTTGATCGCAAAGGAAGATGAATTCAAAAAG AATCTACAGCTTCGTCAAGTTCAAGTTATATTTAGACATGGTGCAAGAAC TCCAGTTTACAGTCACAAAATTGAAAACACAAGCTTCACTGATGCAATTT GGGATAAGGAAAAACTGAGCAAGACATTAGACCATTCCAATATTCCATTC TCACTAAGGCTAAACAGCGGAAAAATATGTAAAGAGATTTCTTTGGACAA TGTCTATCAAGATAGACCAAAATTAACTGTAAGTTTCTTTATATTATTGT CGCATTAATATTCATGCGGCATGGCCTATGGCATGGGCTATCAGCATGAT GCATTTGGTGGTTGGGGTTTACTTTCTTGTGTCTTGTCCTTGTGGGGAGT GGGGAGTGGTAGGGTTTGTAGTTTCCcaaccaaaaatatttcttgctgGT CCTCTAAGTAAGAAAGTCTTGGCACAGCTTCTTTCTATTCTATTATAATT TTTACAGATTAAAAACAGACTTGCGCAGTGGAGGAGGGGAGGACCCACCC AGCCATGGTACGATGACCCCAGCTTTCTTGGGCCACTTGACAATTTTGAA CATGAACATGTTCTGTCCAGGTTTTCGGAGGTGAAAATCCAAAGTTTTGT GGCCCGAATTTGGGCCATTTTGAAAGGCCCCCTCTCTCaagtttcattta 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AGTTCTTGATGTATTGAGTCTTGTTGTCTATTTTGGAGTTCCGTCATTCA AATTGAACGTAACGTCGAGAAATATTTAACAACTTTCTTGTTGCATCCAA TCACAATTTCTAGTCATATTCGACTGCAGATCCTTTTTGATTCGTTCGGA TTTGCcattaacatttttgaaaacgGAAAGATCATCGTCGTGGTCTCATA CTTATAGGTTATACATTCTTTCGATGGTATTTGCTTCAACTTCAAATGCC CTCCTATATTATTTTCAGGGTACAGAGCACTAATGTGAGGAGAACAATAT TGACAGCAAGAAGTGTTGTTGCTGGAATGTATGGAAAGTCTAATATCAAA GGtatgtaaatatttttgtgtcATACTTTAAGGTGTGGCTCATTTAAATT GGAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000071_pilon:473889..481892+

>MSTRG.10278.1.p1 ID=MSTRG.10278.1.p1|Name=MSTRG.10278.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1665bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:473889..481892+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTGGCTGAAAAGACTTGTCCTTTCTGGATCTTGTGGTGCAATTGC
CAGTAGCTTTTTTAATCTGTCAACGTTGATCGCAAAGGAAGATGAATTCA
AAAAGAATCTACAGCTTCGTCAAGTTCAAGTTATATTTAGACATGGTGCA
AGAACTCCAGTTTACAGTCACAAAATTGAAAACACAAGCTTCACTGATGC
AATTTGGGATAAGGAAAAACTGAGCAAGACATTAGACCATTCCAATATTC
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GATGCAATTTGGGATAAGGAAAAACTGAGCAAGACATTAGACCATTCCAA
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TTGACAGCAAGAAGTGTTGTTGCTGGAATGTATGGAAAGTCTAATATCAA
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GTGCAATTGCCAGTAGCTTTTTTAATCTGTCAACGTTGATCGCAAAGGAA
GATGAATTCAAAAAGAATCTACAGCTTCGTCAAGTTCAAGTTATATTTAG
ACATGGTGCAAGAACTCCAGTTTACAGTCACAAAATTGAAAACACAAGCT
TCACTGATGCAATTTGGGATAAGGAAAAACTGAGCAAGACATTAGACCAT
TCCAATATTCCATTCTCACTAAGGCTAAACAGCGGAAAAATATGTAAAGA
GATTTCTTTGGACAATGTCTATCAAGATAGACCAAAATTAACTGGTGGAA
TGACAGTGGGTCAATTAACAACAGTTGGTCAACAACAAGCTTATGATTTG
GGTCAACTTTTCAACAAAGATTATATCCAGAAATTCCAACTTCTGTCAGA
TCATTATCTCCACAGCGAAGTGAGGGTACAGAGCACTAATGTGAGGAGAA
CAATATTGACAGCAAGAAGTGTTGTTGCTGGAATGTATGGAAAGTCTAAT
ATCAAAGGtatgtaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10278MSTRG.10278Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10278.1.p1MSTRG.10278.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10278.1.p1.exon1MSTRG.10278.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10278.1.p1.exon2MSTRG.10278.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10278.1.p1.exon3MSTRG.10278.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000071_pilongenomesc0000071_pilon:473889..481892 +