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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000070_pilon:328363..335665+ Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10178.1.p1 ID=MSTRG.10178.1.p1|Name=MSTRG.10178.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7303bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000070_pilon:328363..335665+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAACCTATGATCATATCAGAGACACTGGTTTTCTTCAGCTTCCACACAG
AACCACGCTGAACCAGTACACAGATTTTACAGATATTGGTTGTGGCTATA
ATCCAGATATCATCAAGCGTCTATTGGATGATCACTTGACTAAAGTACCA
TCAGAGAAGCGAATCTGTAGTCTACTTTTCGATGAGATGAAGATTAAATC
TGGTCTGGTATTTAGCAGGAAAACAGGTTACTCCAAGCATCTATTTCTta
tactctcaggtacctaataaacgggggggggggttagaataaacggggtg
ggtggaaaaaatctcaaaacttaataagcgaatgaaaataaataaaaaat
gtcctgggtggaaaatttttaaaaagcagCCTAATATAGAATCAGGGCaa
aaaaaGGAACTATAGAAGAATCAGGGCaaaaaaaggaactttcaaaaaca
tttcccaAAAATTTAATAAGTAGGGggagggttggaataagaatgtcccg
ggtggaaaattttcgaaaaattaattgtGGGGGGACACTTCTTAGGTACC
GGATAGTAATAATTTTAAAGTCACGAGCAAAAGCACACAACAAACAAAGC
AAACTTAGAAACTAATTGTCAATATTTTCTTAGAACGCTTGTTTCCTTGT
GTAGTCGTGACGTGGTTCTCCTATCACACGATGGTTATTACAAACAAATA
GATGGGTTAGCAATGGGGAGCCCTCCAGCTCCGCTGTTGGCAAACGGTTG
GCTTAGCAAATTCGATCAAACTATCAAGGGCGACGCCAAGTTATTTACGA
GATACATGGATGATATTTTGAGAGAAATCGACCATCGCAGTACAAATGAT
AAGTTAAACGAGATTAACAACATCCATCCTTCACTTCAATTTACGATTGA
AAGAGAGAATGATATGTCTTTACCATTTCTTGACATGTTAATCAAACGTA
ATGGAACAAAACTTTCGTCAGAATGGTATACGAAACCGACAGATACAGGG
CTTACCATGAATTATAACGCACTGGCCCCGACCAAGTACAAAAGGTCAGT
CGTGTCAGGCTTAGCTCATAGAATACATCGATCGTGCAGTTCATGGAAAA
GTTTCCACGACAGTCTGGAAAAGGCCAAGACCATGCTTCGAAACAATCAA
TATCCAACGCAGTTCTTCGAACCAATAATATCTAGAACTTTGTCTAACAT
AATTCGAAACGGTAAAAACGAGGAAGATGACAAGAATGACGAAGAAGACA
AAGTGGATGAGAAAATGGTTTTTATCGAATATCGCGGTAAAGTGTCGGAT
AGCTTTGAAAGTTCGctaaagaaattgaaagttccgtgtaaaatcatttt
tacctcgaaaaaacttaaaatggatTTACCAAGTCTGAAACCTCCAGTTG
AAAAGTGTTTCAAAAGTCGCGTGGTTTATAAAATTTGTTGTTCACGATGC
CAATCGTGCTATGTCGGTCAAACGATCCGTCATTTAATCACACGACTTAA
AGAACACAAAAGATCTGGCCCCGTGGGGAATCATTTTAAGGATTGTGGTA
TCGAGCTATCAATTGAGAATGTATCAATTCTTTGTACTACGTCACGTTCa
acattttatttaattgcCCTTGAGGCATTAATGATTAATGAGCATAAGCC
ATCTCTTAATACAAAAGACAAGTATAGAAGTAGGGCTTTGGTAATTAAAA
TTTAATTCCCTGAGCGATTTATATACTTGTatgtattttttctaattttt
ccttttattttctgtatcaattcaattttgcttattcatttatAGTGTCT
TATGTGTATGTAGTGAAGGGATGCGTtgcattattttgaaatttacctta
tataatttttaaatctatataactgtttttaactgtttttattcttttag
aCCTGATGATGGATAAATATATCCGAAATATATCGTAAAAATAAATACCT
CGGACGTTCTAGCTTTGGTGCTCTGACGTGCGGAACTGGACGATGTGGAG
CATTCTGGTGGACGCTTCCATGGATTTGGAGGACAATAGCTGCCGCACCG
ATATCAATGTCTTGGGTTGCAAACGTGCAACTCTCAATAGGGCACTCAAG
TATTGGCATAATGGAATGTTCAAAGCCAAGATAAAAATATCACTCTATTG
ATGTCCAAGTGGATTATATTCATGAAGGAAACCTCCTCGTGTTTACTTTT
TGTTAATATATCTTTTACGATGAATATAATCTATAcgataagaaaaataa
agtatATGATAAATGTTAAATGGGGCGACATCTCGTCAATGTTTGACTGT
TTCTAAAGTgtatctcaaaataatttgctgctgagacaaaaatggctgta
actttagatagaatttgaatcaacttgtgagtggaatatcatcaagcacg
aaaaattttgaaaaaagaaaaatgaaaatgaaaaatgaagaagaaaaaaa
tcaacatcttgtagaaatgtggtataattaccattttcacaggagtgatt
ctgcaatcttaaatttatttttttcgttttcacttttctcttttctccaa
ttttgttgccttttacttttatttgcataagcctaaCATTGCAAATATGT
ATGTTATGGGGAAATAACAGTCCACTTCTTCTATAAACTCTGAATGCTTT
GTTAATTTTATAGGAACCTATGATCATATCAGAGACACTGGTTTTCTTCA
GCTTCCACACAGAACCACGCTGAACCAGTACACAGATTTTACAGATATTG
GTTGTGGCTATAATCCAGATATCATCAAGCGTCTATTGGATGATCACTTG
ACTAAAGTACCATCAGAGAAGCGAATCTGTAGTCTACTTTTCGATGAGAT
GAAGATTAAATCTGGTCTGGTATTTAGCAGGAAAACAGGTTACTCCAAGC
ATCTATTTCTtatactctcaggtacctaataaacggggggggggttagaa
taaacggggtgggtggaaaaaatctcaaaacttaataagcgaatgaaaat
aaataaaaaatgtcctgggtggaaaatttttaaaaagcagCCTAATATAG
AATCAGGGCaaaaaaaGGAACTATAGAAGAATCAGGGCaaaaaaaggaac
tttcaaaaacatttcccaAAAATTTAATAAGTAGGGggagggttggaata
agaatgtcccgggtggaaaattttcgaaaaattaattgtGGGGGGACACT
TCTTAGGTACCGGATAGTAATAATTTTAAAGTCACGAGCAAAAGCACACA
ACAAACAAAGCAAACTTAGAAACTAATTGTCAATATTTTCTTAGAACGCT
TGTTTCCTTGTGTAGTCGTGACGTGGTTCTCCTATCACACGATGGTTATT
ACAAACAAATAGATGGGTTAGCAATGGGGAGCCCTCCAGCTCCGCTGTTG
GCAAACGGTTGGCTTAGCAAATTCGATCAAACTATCAAGGGCGACGCCAA
GTTATTTACGAGATACATGGATGATATTTTGAGAGAAATCGACCATCGCA
GTACAAATGATAAGTTAAACGAGATTAACAACATCCATCCTTCACTTCAA
TTTACGATTGAAAGAGAGAATGATATGTCTTTACCATTTCTTGACATGTT
AATCAAACGTAATGGAACAAAACTTTCGTCAGAATGGTATACGAAACCGA
CAGATACAGGGCTTACCATGAATTATAACGCACTGGCCCCGACCAAGTAC
AAAAGGTCAGTCGTGTCAGGCTTAGCTCATAGAATACATCGATCGTGCAG
TTCATGGAAAAGTTTCCACGACAGTCTGGAAAAGGCCAAGACCATGCTTC
GAAACAATCAATATCCAACGCAGTTCTTCGAACCAATAATATCTAGAACT
TTGTCTAACATAATTCGAAACGGTAAAAACGAGGAAGATGACAAGAATGA
CGAAGAAGACAAAGTGGATGAGAAAATGGTTTTTATCGAATATCGCGGTA
AAGTGTCGGATAGCTTTGAAAGTTCGctaaagaaattgaaagttccgtgt
aaaatcatttttacctcgaaaaaacttaaaatggatTTACCAAGTCTGAA
ACCTCCAGTTGAAAAGTGTTTCAAAAGTCGCGTGGTTTATAAAATTTGTT
GTTCACGATGCCAATCGTGCTATGTCGGTCAAACGATCCGTCATTTAATC
ACACGACTTAAAGAACACAAAAGATCTGGCCCCGTGGGGAATCATTTTAA
GGATTGTGGTATCGAGCTATCAATTGAGAATGTATCAATTCTTTGTACTA
CGTCACGTTCaacattttatttaattgcCCTTGAGGCATTAATGATTAAT
GAGCATAAGCCATCTCTTAATACAAAAGACAAGTATAGAAGTAGGGCTTT
GGTAATTAAAATTTAATTCCCTGAGCGATTTATATACTTGTatgtatttt
ttctaatttttccttttattttctgtatcaattcaattttgcttattcat
ttatAGTGTCTTATGTGTATGTAGTGAAGGGATGCGTtgcattattttga
aatttaccttatataatttttaaatctatataactgtttttaactgtttt
tattcttttagaCCTGATGATGGATAAATATATCCGAAATATAtcgtaaa
aataaatattgattgttgttggtACCAGTTTATCACAATATTACAAATTG
CCACAATGTTTCTTCcgtataaaatattttcttaattgATATAGAAAATT
GTGATAATcttgaaataattctttttaaCAGGCAAAATGGTTGGTTTCAC
TTCGTTAGGAAACATCAACGACGAAATCAATCTTCTTGAACAGCAGATGT
CAAAGGAAAACATCACTGAACCACCTGAAATCGCTACACATGTTTTAGCT
GTCATGGCCAGGGGTATTGTGAAGTACTTTAATTATCCTATTGCATACTT
TGCAACTACTTCAGTAAACTCTGGACAGCTTTACATCATCATTTGGGATG
GAGTTGCTGCACTTGAAATGCGTGGTGTGAAGGTTCTTGCATTTATCTCT
GATGGCGCCTCAGCCAATAGAGGtttttttGCGCTACACAAGTTAGCTGA
TGGTTCAAATGTTTCAGAGGATGGGGTAGTGTTTTGGACACCAAACCGTT
TTGACAAAGCAAGGCGAATATATTTCTTCAGCGATGTGCCCCACCTTATA
AAGACACTGTGGAATAACCTaaaaaaaTCGTCTGTCAACAGGACAAGGAA
TCTCATGGTAAGTattatttaagtttttttttaagtttttcaacAGGGCT
TTGTTTTGACACATTTTGCCATCATTATGACAACCTTCAAAACTATTTAA
TCTTCAGTATTTTGATGGGATACAACACAAGATAAAtatattttggtatt
ttagcaTTCTTGAATAGGTTTGCTGTCTGAAATAGTCCATCTCCATCTCA
AAACATCCTCTctatgacaaaatatttttgttgaattttttatatCAGAA
ATCCCACATACTCCCTAAATCGTGAGtattgtttttatcaattttaggTT
GGCGGAAAAGAAATACGCTGGGCACATATTCGAAATGCTTATGAGATGGA
TCTGAATAAGAACAGCCTTGCACCTGGTCTACGAAAGCTTCACAAAATCA
CATTTGACCACATTCATCTCACTCCACGATTAAGAATGAGAGTCAATTTA
GCTGCACAGGTCAGTATCACTATACACGTTTCTTGTGACTACTAACTGTG
AGTTTGTTCAAGAAGGTTTGAGACATTTTGTAATTCTATAAAACCCTTTA
AAATTATAGAACACCATCTGATCCATGAAATATGATCTTTTTATTTGCAT
AATTTTCTTAATTGGTACACTTTAAGGTCTTGAGCAAAACTATGGCAGAT
TATTTGGAGTTGCAAGGTCATGAACATACCAAACAACAGAATATTTCATT
CGAGTGGTTGACAGGTTCTTTGATTGTTTAAATGGTGGCCATGTTTGTAA
AGCGCAAACAAAGTTGAAGCATAATTTAAAGCCTTATTATCAAGCTGAGA
TCGAAAAGACAGATCCTGAAGAGAACCGACTCAAGGTTagtataattttt
gtttatccAACGCAAAGTTTGGACATTTGGATAGAACACgcttttgaata
aatttttccaaattaatGATTAGCCAGTTATGCAAattttattgattatt
tttatttttttaatcaataatCTAAGAGGAAATATTATGTGTTCGTTTTA
GTGGCTTAAAGACGTGTTCCTCAATCAAGTATTTCAATGATTGGAAATCA
GAAACACAAACACTTAACATGGAAAAGGAGGATCAGGCAAAGTGCTGCAT
AAGTCATCAGACTTTGGAAGGACTCAGGATAACgggtaaaattattttct
agTGAAAGCTTTATAGATAAAACTTTCCTGTTCCATTTGCAAGATATGGG
GTCTTTGATAGGAAAAATTGTTTCCTATGGAAGTACAATGTTACTGAAAG
TACACAATCCTGAGCAGAAAATGAAggctaccttcgggtagatagctagg
TAGGaacctccgactgcggtcgcagacttacttacaacattatgaattta
ttttttaattagaaactttttctttctacTTAGTCAATTCAATCATTCAC
ATTATACCGGAAATACTATCGATTGAACGAATCAAATACGTTCTAACGGA
CAAATTCAACCAAGACCCGATCGAAGAGCACTTCGGAAAGCAAAGGTGAT
GCATTTTTGATTACATGGACTTATACAGATGAACTATTATCAATGTTTTA
AGAGATACTCTCTAACGTACAGCccagcaatttttttttcaaaaatttcc
actcAGAACGTTCTAATTTTAACCCATCCCTGACCCCGCTCACTTAATTC
TTGAAGAAATGTGCTGCTTAAAATTAGCCGATGGTGGTAAGTGCTATTTT
TGGAGTCAACGATATTTCGAAGTTTTTCACTCTCTTTTTTACCTTATAGA
TCGAAAGGTGGTGTTGACAATCCTTCGTTGGAACAGTACATGTacactga
aagaaaaatattcgtTTCGAAGTCGGATATGATAATAAAAGGGAGCAATA
CAAGAGGAAGGAAGGATAAGAAAATCGTGATCGATGTGAATGATACCAGT
aaacttccgaaaagaccaaagctaacacaaactgttaaaaaacctaaagc
tgcgaaaaagaaaactgctaaaaccaccaaagcgaaaagGACAGGCGTTT
AAACTTTAATTTAGATTTTCATAGACTAAGTATTTTAAATATATTCACTT
TAGGATAGGTTATTTCATTCTCATTGTACTAAATTTTTAGCAGGCCTCCC
AAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000070_pilon:328363..335665+ >MSTRG.10178.1.p1 ID=MSTRG.10178.1.p1|Name=MSTRG.10178.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3876bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000070_pilon:328363..335665+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAACCTATGATCATATCAGAGACACTGGTTTTCTTCAGCTTCCACACAG
AACCACGCTGAACCAGTACACAGATTTTACAGATATTGGTTGTGGCTATA
ATCCAGATATCATCAAGCGTCTATTGGATGATCACTTGACTAAAGTACCA
TCAGAGAAGCGAATCTGTAGTCTACTTTTCGATGAGATGAAGATTAAATC
TGGTCTGGTATTTAGCAGGAAAACAGGCAAAATGGTTGGTTTCACTTCGT
TAGGAAACATCAACGACGAAATCAATCTTCTTGAACAGCAGATGTCAAAG
GAAAACATCACTGAACCACCTGAAATCGCTACACATGTTTTAGCTGTCAT
GGCCAGGGGTATTGTGAAGTACTTTAATTATCCTATTGCATACTTTGCAA
CTACTTCAGTAAACTCTGGACAGCTTTACATCATCATTTGGGATGGAGTT
GCTGCACTTGAAATGCGTGGTGTGAAGGTTCTTGCATTTATCTCTGATGG
CGCCTCAGCCAATAGAGGtttttttGCGCTACACAAGTTAGCTGATGGTT
CAAATGTTTCAGAGGATGGGGTAGTGTTTTGGACACCAAACCGTTTTGAC
AAAGCAAGGCGAATATATTTCTTCAGCGATGTGCCCCACCTTATAAAGAC
ACTGTGGAATAACCTaaaaaaaTCGTCTGTCAACAGGACAAGGAATCTCA
TGgTTGGCGGAAAAGAAATACGCTGGGCACATATTCGAAATGCTTATGAG
ATGGATCTGAATAAGAACAGCCTTGCACCTGGTCTACGAAAGCTTCACAA
AATCACATTTGACCACATTCATCTCACTCCACGATTAAGAATGAGAGTCA
ATTTAGCTGCACAGGTCTTGAGCAAAACTATGGCAGATTATTTGGAGTTG
CAAGGTCATGAACATACCAAACAACAGAATATTTCATTCGAGTGGTTGAC
AGGTTCTTTGATTGTTTAAGGAACCTATGATCATATCAGAGACACTGGTT
TTCTTCAGCTTCCACACAGAACCACGCTGAACCAGTACACAGATTTTACA
GATATTGGTTGTGGCTATAATCCAGATATCATCAAGCGTCTATTGGATGA
TCACTTGACTAAAGTACCATCAGAGAAGCGAATCTGTAGTCTACTTTTCG
ATGAGATGAAGATTAAATCTGGTCTGGTATTTAGCAGGAAAACAGGCAAA
ATGGTTGGTTTCACTTCGTTAGGAAACATCAACGACGAAATCAATCTTCT
TGAACAGCAGATGTCAAAGGAAAACATCACTGAACCACCTGAAATCGCTA
CACATGTTTTAGCTGTCATGGCCAGGGGTATTGTGAAGTACTTTAATTAT
CCTATTGCATACTTTGCAACTACTTCAGTAAACTCTGGACAGCTTTACAT
CATCATTTGGGATGGAGTTGCTGCACTTGAAATGCGTGGTGTGAAGGTTC
TTGCATTTATCTCTGATGGCGCCTCAGCCAATAGAGGtttttttGCGCTA
CACAAGTTAGCTGATGGTTCAAATGTTTCAGAGGATGGGGTAGTGTTTTG
GACACCAAACCGTTTTGACAAAGCAAGGCGAATATATTTCTTCAGCGATG
TGCCCCACCTTATAAAGACACTGTGGAATAACCTaaaaaaaTCGTCTGTC
AACAGGACAAGGAATCTCATGgTTGGCGGAAAAGAAATACGCTGGGCACA
TATTCGAAATGCTTATGAGATGGATCTGAATAAGAACAGCCTTGCACCTG
GTCTACGAAAGCTTCACAAAATCACATTTGACCACATTCATCTCACTCCA
CGATTAAGAATGAGAGTCAATTTAGCTGCACAGGTCTTGAGCAAAACTAT
GGCAGATTATTTGGAGTTGCAAGGTCATGAACATACCAAACAACAGAATA
TTTCATTCGAGTGGTTGACAGGTTCTTTGATTGTTTAAGGAACCTATGAT
CATATCAGAGACACTGGTTTTCTTCAGCTTCCACACAGAACCACGCTGAA
CCAGTACACAGATTTTACAGATATTGGTTGTGGCTATAATCCAGATATCA
TCAAGCGTCTATTGGATGATCACTTGACTAAAGTACCATCAGAGAAGCGA
ATCTGTAGTCTACTTTTCGATGAGATGAAGATTAAATCTGGTCTGGTATT
TAGCAGGAAAACAGGCAAAATGGTTGGTTTCACTTCGTTAGGAAACATCA
ACGACGAAATCAATCTTCTTGAACAGCAGATGTCAAAGGAAAACATCACT
GAACCACCTGAAATCGCTACACATGTTTTAGCTGTCATGGCCAGGGGTAT
TGTGAAGTACTTTAATTATCCTATTGCATACTTTGCAACTACTTCAGTAA
ACTCTGGACAGCTTTACATCATCATTTGGGATGGAGTTGCTGCACTTGAA
ATGCGTGGTGTGAAGGTTCTTGCATTTATCTCTGATGGCGCCTCAGCCAA
TAGAGGtttttttGCGCTACACAAGTTAGCTGATGGTTCAAATGTTTCAG
AGGATGGGGTAGTGTTTTGGACACCAAACCGTTTTGACAAAGCAAGGCGA
ATATATTTCTTCAGCGATGTGCCCCACCTTATAAAGACACTGTGGAATAA
CCTaaaaaaaTCGTCTGTCAACAGGACAAGGAATCTCATGgTTGGCGGAA
AAGAAATACGCTGGGCACATATTCGAAATGCTTATGAGATGGATCTGAAT
AAGAACAGCCTTGCACCTGGTCTACGAAAGCTTCACAAAATCACATTTGA
CCACATTCATCTCACTCCACGATTAAGAATGAGAGTCAATTTAGCTGCAC
AGGTCTTGAGCAAAACTATGGCAGATTATTTGGAGTTGCAAGGTCATGAA
CATACCAAACAACAGAATATTTCATTCGAGTGGTTGACAGGTTCTTTGAT
TGTTTAAGGAACCTATGATCATATCAGAGACACTGGTTTTCTTCAGCTTC
CACACAGAACCACGCTGAACCAGTACACAGATTTTACAGATATTGGTTGT
GGCTATAATCCAGATATCATCAAGCGTCTATTGGATGATCACTTGACTAA
AGTACCATCAGAGAAGCGAATCTGTAGTCTACTTTTCGATGAGATGAAGA
TTAAATCTGGTCTGGTATTTAGCAGGAAAACAGGCAAAATGGTTGGTTTC
ACTTCGTTAGGAAACATCAACGACGAAATCAATCTTCTTGAACAGCAGAT
GTCAAAGGAAAACATCACTGAACCACCTGAAATCGCTACACATGTTTTAG
CTGTCATGGCCAGGGGTATTGTGAAGTACTTTAATTATCCTATTGCATAC
TTTGCAACTACTTCAGTAAACTCTGGACAGCTTTACATCATCATTTGGGA
TGGAGTTGCTGCACTTGAAATGCGTGGTGTGAAGGTTCTTGCATTTATCT
CTGATGGCGCCTCAGCCAATAGAGGtttttttGCGCTACACAAGTTAGCT
GATGGTTCAAATGTTTCAGAGGATGGGGTAGTGTTTTGGACACCAAACCG
TTTTGACAAAGCAAGGCGAATATATTTCTTCAGCGATGTGCCCCACCTTA
TAAAGACACTGTGGAATAACCTaaaaaaaTCGTCTGTCAACAGGACAAGG
AATCTCATGgTTGGCGGAAAAGAAATACGCTGGGCACATATTCGAAATGC
TTATGAGATGGATCTGAATAAGAACAGCCTTGCACCTGGTCTACGAAAGC
TTCACAAAATCACATTTGACCACATTCATCTCACTCCACGATTAAGAATG
AGAGTCAATTTAGCTGCACAGGTCTTGAGCAAAACTATGGCAGATTATTT
GGAGTTGCAAGGTCATGAACATACCAAACAACAGAATATTTCATTCGAGT
GGTTGACAGGTTCTTTGATTGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000070_pilon | genome | sc0000070_pilon:328363..335665 + |
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