MSTRG.10161.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10161.3.p1
Unique NameMSTRG.10161.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000070_pilon:88632..102211-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10161.3.p1 ID=MSTRG.10161.3.p1|Name=MSTRG.10161.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13580bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000070_pilon:88632..102211- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAAACAATCAAAAGAAATCGACCACCATGTAAATCATCCAAGAGCCAT
TCTTAAAGGTACTAATCTACTCGTAGACAAATTGTACTTTATGCAAGAGT
TTTTTTATTCTTTAGTCGTCATCCAAAACTTTAAATCTAAATCTATAAGT
CGATGAGCCAATTAGAGGTCTTTAACGACCTCATTTAATTCGCCCTTTAA
TAGTATTCCATCCAATTAAAGAATGGGTTTGTCTTGATTTTGTTTTTCTT
TTATTAGTTCGATATTCAAGAGTCCACACATCTGACGAAATTGTACCTTG
TCCGCTGCCGACAAATGATCTAATTAACAATCAACTGAATACTACATGAA
AAGTAAGAACCAGTTAAATTTACATAATTAGCTTTTGAAGACTTAATTGG
ACGTTCATTCATTCCTTCATTCCTTCATTTCACCTTGAACTTATGGATTT
CATCTTTGATAAGGTTTGTGAAAGTTATGAATTTTGCGTATGTAATGGGT
TTGTAGAGAGATGAACTCGGCCATTCCAGAGGAAGGGGTACGTTACGTTA
CGTAATGTCTATTTTGACTGGATACCGCCAGTAGGCACCTAGGGACGTCT
TGACTCATGTACCATTTGTTAGCACTTATAAAGGTGGTTCAATGCATAGA
CTTTCCAATCTTGGTTGAAAACTTCTTGGAATGGCCCTATTTTCTGCAAT
TTTTTTGAAGCCTAGTAATTGTACGATTGCAATTCTCAATATACATGCAT
GTTTTTTTATAAGAACATCCAAACTTTTTAGGCCTTTGGATGTTCTTAAC
ATGTTCCAGTTCTTTTTTTATTAGAATATACTTTATAAGAATATTTATGA
TGAAATTGGCCAAAACATTAAGAATATGGGAAAAATACCACCATCATGGA
ATTTGGCGAGTGAACCTAAGAATGCCATTTTTAGAGCATTTTACCGTTAA
ATTGTCATTTATTACCCAGCAATGCTAAAAGATTCAACAAAAATGCAAAA
GTTTTGATTTAGGTATGTATTACCATGCTAGATTTTGGCTGGGATTGGAT
CAGCACCTAATAGTATATAAGAATACGGTGAGAATATTTCAGGATGATTT
TCCTCAAAAAGTTAAGAATATTCATGATGAATTGAAAAACACGAAAAAAG
CGTGTATTTTCACCATTTTCTATGTAATTCTTTCAATTTTCTTAAGAAAT
TGGCTGTTTTCGAGTCCGTGAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGCTCTTA
ATATTTTGGTCATCACAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTTTTCTTATAAA
TAAACGTGCACGTGATTTGATCATTTCGCAAAACAAACAAACAATTAGCG
GTATTTTGACTAGAAAAACTATAATCTTGTTTCTAAACTGAAAAATTTCC
TTTTACGTTCTCATTTTCTCGCAAAATACCAATGGTATTAGTCCAAGTAT
ATCCAATTTTCAAGTTAGTGAGTTAGAGTGAGGTTGTTTTAGGATTATAA
ACACAAACCCCTTTCTCCCTTTTCAATGGCACGAGGAACATTGGTGATAC
TGGGATCAGAAAGGACTCAAAGTTGATGCTTCCAGTTCAGGCACTCGTAA
TATGTTTTCAACAATGTTTTTTTTGACACAAGATAGTTTGGTTTGAATTC
TCTTTATTTGAGTTTGAAATACATATATAACATCCCTGTCTCAGAGCCCC
GAATTTTTTAGCAAGAGGGGATGGGGAAGATCTTGTTTCCAGTGGTTTTT
TTTTAAAAACAGTTAGCATTTTCAAAATTTCAGTCATAAAACTTCTGTCA
AGTTTGCCAATTTGGAAGAAGTTCCAGGGTATTTTTCCCCTTATGACAAT
TTTTTAGAAAATTTCACCGATGGGTACTTGTGGGTCCCATCGTTTTTTAT
AAAATTTGGTTGAATAATATAATATTATCTTGAAATTTACACCAATAAAT
TTATCCACTTATAACTTGAATGTCTGTCAACATTTACTGAGAAATTAATT
TTACTGGATTATAGGAAAGAATTTTTCTGTATGATGTAGAGATACGGTGT
CTAAGTGAATAATTTATAAAGTAACTGTGTGTTAATACGAAATTCTACGG
GGAAAAGTAGCTATTTAACTAAAAAAGACACACCCTGTATATCTCAATTA
TTAAGGTCTACTTTGAAAGTTTTACAATAAGATTGTATTGCCACACCCTT
CAGTTAAGATCTCATTATTTCAGGCCAGTGATTTTCTTCATAATCAATTA
TTGTGTAAATTTAGGAACGAAATAAAATATTTGTAAGCTCTTATTCAGAA
ATTTGGTTGAGAAGAAGACGAATGTAATGGTGGGTTTTATTAGTTTTTAT
ATGGCTATCTACTTAAACTGCATAACTCAAAAATAACTTGTTGCGATAGT
GCAAATCGACTTAAGACTTTTTTCTGAGTCGCGATATTGCCTCGGTTTTA
ACAAGGTTCTTTTGTCTCTGTTGCCCGAGATCTTACCTATTTTCTTTACT
TTAATTTTGGAATACACTAAATTTTTTATGTGAACCAGAATCAGAACCAT
TTGTTAATGAGGCTTGGCCCTTCTTATTTTATTGGTACTTTGAGCTTAAA
ATTATGTTTATCCTCTTGTTATTCTTGGGTAAAAACTGAGTTTTGCTTGG
TTTAATACGTCCAATTTTCACTAATTTGGCCCTTGATTTGTTTAAAATTC
AGTCTTTCCAGTCATTTTTCTTGAATTGTTCTTATCGTTCATTTGGCATT
TTTGAGCCTCGTCGTTCTTATGTAATGTCTTTATAAAAAAGTATACAACT
AGCCCGAGTATCTGGATCAACTTGAGGAAAAGGGAAGTATATTATTAGTT
TCGAAAAAAAGGTTGAGAAAAAAACCAGTTGGGATTCTCAAAATTTTTAT
TCAATCAAATTTTTTCATCGGAGGGTAAGATTTAAGGTTTTTCATCGGAG
GGTAAGATTTAAGGTTTTTCATCGGAGGGTAAGATTTAAGGTTTTTCATC
GGAGGGTAAGATTTAAGGTTTTTCATCGGAGGGTAAGATTAAGTTTTCAT
CGGAGGGTAAGATTTAAGGTTTTTCAGAATTCATCGATTAAGGTTTTTCC
TCGGAGGGTTAGATTTAATTTAAGGTTTTTCATCGGAGGGTAAAAGATTA
AGGTTTTTCATCGGAGGGGAGATTAAGGTTTTTCATCGGAGGGTTTAAGG
TTTTTCTTTTTTCGGAGGGTAGATTTAAGGTTTTTCATCGGAGGGTGAGA
TTTAGGTTTTTCATCGGAGGGTTAAGAGTTTTTTCGGAGGGTAAGATTTA
AGGTTTTTCATCGGAGGGTGAGATTTAAGGTTTTTCATCGGAGGGTAAGA
TTTAAGGTTTTTCATCGGAGGGTAAGATTTAAGGTCTTTCTTCTCACCGG
CACCGATTTGGAGGGGTGTCACTGGTCAATCAGTCATAAGTATTTTTATG
TAAATGTTGGTCATCTTTAGGCTAATCCACATTTTTTTCTTTTTACATCT
CTCCTGCGACTTTGTCCAAAACATTGTAGTAAAATTTACTTAGTTTTCTA
TTATGCGAGAGGTCTAAAAGCAAGCCCAGTTAGATTTATAGAATTCCATA
TTAAGAAGACGTTGATCTATTTTATAGACGCTAATCTACAGACTTAAGAC
TCATAGAAAAAAACTGACTTTTCAATTTTTTTTTTCTCCTAAAGGGTGTC
ATTTCAAGAGAATGACCGTTCAAAGTTTGGGTCCTTATACATTGGCCACC
ATATGAGTCAATCGGCCTGAAAATATTGAACAAGAAGTCACCGTTCTGAG
AGAATTCTGCTAGAGACCACCTAGTGAAAAATCAGGTAGTTATACCAATC
ATAATTATATATGAGCAACGCTAAAACTCGAAAATTCAGACTAGCAAGGC
CAAAATTTCACTGGTTCTTATAAAAAAACAGTTAAAGGAAAGTTTGTTCA
CAAGTCTGCTTATCCCTACTAATGTATCTCACTTCAAAAAAGAAGGGTTC
AATTCAATAAAGCAAAAAATATTGGATGTAAAGAGAGTTCTCTATGACGG
AGAGTGTTTGATGTTCACCCATAGTCCTTTTATGGCAGTCGACACCCTCC
ATCTCAAAAATGTTGAATTCTTTTTTACTCAAAACCTGAGTTATAATTTG
ATGTTTATAAACTCGAAATCTTCACATAAAATATAGAAATATAAAAAGAA
TAGAAAGGGAGAAGTAAAAATATTTTTGCCGTGACGCGGATATTTCGCTG
ATCAAAGAGAAAGCCTTGTTCGATTTTTAAGCCTTGTGATAGTGACTAGT
TATTTTAAATTTGGTGACCTTAGTGTACGGTTGATACAAGTTTAGGATTG
GTGAGTCTTCTCTATACTTCGAAAGTTTGGGAATATTCAAATCATAGAGA
ATTCGATTTATGGAGGGCCATTTAAAGAACTTTGGTAACTGGATGAAGAG
GTGTTATCAACAATGAGAGATTCTTTACATTATTAAGATTGAAGTTCTGA
CTTTACAAGTCCATCCGATAGATTTCCGTTGCTTTGGAATACGAAATTAA
CTGCCTTGTCTGTATTACAAGGGTTATATCATGCCACTATACTTAGGAAT
AACACAAAAAGGCCGATACTCAAACTTATTTTAGCCAAAATGAAAAGAAC
ATAAGTTTTTACTTGTAAATTGTACTCCTTGTTAAGAATGAGTTTTTGGT
ACTAAAAGTTTCATGCTGTCCGATATTTAAGTACCAAAAAACTGCATCAT
TCTCCATAACGTAAAAAGCTCTGAGATATCACGGAGCACATTTGACACCT
AGCCTGGGTATCCAGACTCAAAATTTCAGAAAAAAACACCCTTACGTCAA
TATACAAAGTTTCTAAAATTTTAGAGTCTTGTGCAACTAAAAAAATTGAG
TACAGTTTGTTTGATACTGCCTGTGAGTGAACCCTTGTTGACAGACAATC
AAGACTTTGTAAACCCAGGCAGACACACATAATTAACTTACTATAAAACC
TCTTTTACAAACTCAAAAAACTTTCAAAACTACTTTAAGCTACATCAAAA
CATCAGCCACATTTATAAAGGCGCTTTTCCAGCGGCCATTTTGTTTAGAA
ATGAACCTGCGTTTTCATTTTCATTTGTTTATCTTTTTTTGCCACGTCAG
CTTTTTCCATAAATTATGCCCGCGCATCGAAAAATATCACAAACCCCGCG
AAAATTCTGCTCAGTGACTGGGCGTGTACTGACCAATTAGAGACACTGGC
ATATGCAGGGACAGATATCCTTGCAGACGAGTTACTTGGACCAGACCGTA
AACCAGAGACAAAATATTAAAAAAAAAACTAGACGGTGAAATAGTTTACG
GTCTGGATATCCAGGCTAATTTAAAACCAAGAAGAACTAGATTTGTTATG
AATCTTACTCTATATTGTGCATTTTCTTTATAGGTTGGAGTGCTTGACAT
ACGTAAAAAACGATATCATCATATTGGAGTAATGGGTAACGAAGAACACA
CGACGAGCTTTCAAGGGAAATTAACCAAAACACTTCATTTAGGACAAGCA
GGTGCCATTCTTGGATGTGGAATATCCTACGATGACGAGACAGTCGCCAG
CTGTGCCACAGATAACAAGGTATGGTACTTCTGATTTCACTGGATTTAAA
TTTGAGATCTAAATTAATGCAATTTTAACCGGGGTAAGACAATGAATTTC
CAAGTTTTGACCGGGGGTACTGAATTTCAATAATTTTGACCGGGGGTACA
GAATTTCAATACTTTTGACCGGGTTACTGATTATCCCAACGAAGGTTGAA
ATTAGACCCCTTTTGGGAATCATTTTCACCGAGCTATCCACCGGGCGGAT
TTCGCCGGGTCACTGATACAGATGTTTGTGATTGTCAACTAACGGATATA
GAGCTACAAGCTGCCTGAAAGTGGCCTGTCCAAAAAAAGCAAATCTGTCC
CTTAATAGATAGTTTTGGCAACGAATTTTGGTCGGTTTTAAGCCACATTT
CGATTAAAGATTTTGAGAACAATTAAAGATTGAAAGTTTTTTATTTCTAT
GACATTTAAATGGGAATAAGGTATACACCATTACCACTAACACATACCAT
GTTTCACTCCCAGGGGTTGAACCAAGTTGGATTTTTGTCGCATCATTGAC
AATGACAAACTGATTTTGCGAGCGGGACAGTTTATAACGAGTTTGTGAAT
GTGTGTTTTTTCTACGACGGAGACGGCTAGCATCTCATTTGTCTAAATCC
TGATCAACTGAGGACGACGATAAACAAACACTTTTACTGTCCTTGATTTC
GCGGGTCAAAGCTGCAGTTTATTCCAAATCGCTTCATCACTCTGCCCTCC
TCCAAAGCGCAAATATTCAAAAACTCTCTTGTAATATGATCTATAAGTCG
AAAGGGAATTTTAAATACTGTCTCTCTTTTCTCCTACAGGTCTTACTATG
GGATGTAAATACCGGACAATGTCAAGGGTCATTAGACGGACACGCTTCGG
ACGTAACGCGATGTTCGTTCGGAAAAGAGATTCTAGCTACAGGTTCTCGT
GATGGCACAGTCATCTTGTGGAGATACGCTGACAATAAAAGGTGTTCCAA
AATAAGTAAGTTTAACCAGGCCAGCCAAAATCTTGGATTGGAGTTTTTTT
GAAGTGGTAACCCTAATGGTTGCACTACTCAATAGTTCGGTTCTCTACCC
GTTTCAAATTTTGTTTCACTTTTTAGTTACATTTTTTAGTTTTTGTTGAT
TTACACCAGCCTGTTTCTACTTAGTTGAAGAATATAGAAGCGCGCAAAAG
TATCCTTTTTTTTTTGAGAAAAACTCGAAGTTTGTTTTTAGTTAAGTTGT
CAGTAATTATGATAGTTTTAGAACTTTAAGCCTCTCGTGTTATGAGAAGG
CGTCAAAACTGTCACTTTTTGTTCCATTCAATACGTGACTTTTTAGAAAA
GGTTGCTTGGTCATATTTCTAACTCAACTTTACTTTCTGATGATGCCGAA
TCCATTGGAAATATAAATATACACAGGATTCGCTATTTCAAAACACTTTC
ACTTTGAAAATTTCTACGAAATCTTGTATAGGGTTTTTTCTATCAAATAC
CCAACCTAATAATAGTATTTTCTGACCTTTAAAACCATTCTAATAGTTTA
TATTCAAGGCCTGTATTGGACGAACAGCCGACCCTCGGCTAAAATTGACT
GGACCTCGCAAAATAGCGTGCATCCGACCCTCAGCTAAAATTGACTAGTA
CTCAAATAATAGCGTATATTTGGTCGGCTAAATCGCTTGACTCATTAATT
GCAAAGATTGCCTGGTTCTGCTTTTACCGTGAAATAAAAGGAGTCACTCA
CTTTCTTCGATTTCAAAAACGGCTGTACGTTATCTCTGTATCTCTGTCGA
ATTTCTGCCCTATCCATTCTAATTGTAACAATAGGTAAAAAGTTGGTAGT
TAAAATTTTGCTTGAAAATGATTGAAAAAGTCATTAACTTTAGACAACCA
GCTTTCTGTCTACTTTCATTGACAACCAGGGGAAAGTGGGCCTCAAAACC
ACGAGCTAATATAGCAAGGGGAACTTTTACCCAAAGAATAGAATGAAGCA
TATTAACCAGTGTTTTTTGTCTTTTCCAGCCGTCCACTCAACAGAAATCA
CGTCATGTACCATTTCGCCAAACCACAAATATTTGTTGACGACTTCAGCA
GACACTCACTGTCGTGTTTGGACCATCAGAGGTGGAAATGGTGAATTCAT
ACAAGGTACATGTTCTGTTATAAGAAATTAAAGCTTCAAATTATCAAAAT
GTTAAGAATAAGTTAAGAACATTTCAAGCCTTTGCTAACTCTGAAACACC
CGATATTGTAGGAAATTTCACATAAAAATACTTATTGTGGGAACATCTTT
AGGCTTAAAATTCAGAAGGTTATGAAAATCTGAAGACAAAAATTCTTTTG
AAAAAAAAGAATTTTGGATGTTCTTATAAATGGTTTGAGGAATTTTCACC
AACACACTGAGAATAATTTGATTGGGTTTACATACTTTCTTTATGAGCAC
AATTAGCAAAAACCAAAGGGATAGAAAACCACTTTGTTTAGTTGCAAGTT
TAGCTACTGTGATCGGAGGCGACCCTCTAACAGAAGGGCGCCCACTCTTT
CTCCTGGATTGATCCACTTACCCTAGATGCTTCTCTTAATTACTGAGTTT
CAAGCTTAGAGCGACATCAAGTACGTCTTTGGAGTCTTTGGTATGACCCG
TCCAAGAGATATAACCAACGACCTACTATACTGTTCTTTTTGAAATAACC
GGTTTCCTTCAATATTTTTCAGGGCCAAAATTTATCGAGTTGTTTCATGA
AGGAGAGAAATATAAATTTAGTGATGCGTCATTTTCAAGTGATTCATGTG
CCATCGTGACGTCATCAACTGATGGACAAGTCAAATTGTGGGATTCAGAA
AATGGTAAGGTATTTCAATATAAAGTCCCAATAACTCGAACACGCACGGA
GAACGCAAGTTTGTTCAAGTTTTTGAAATTTCGAGTTATATAGAACCTAG
TTTATAAGGCACTGTTAACTGAAGGGACCAGGAAACTTTTTCCAGTTGAA
ACATTCAATTGATACAGTTTCGAGTTACTGCACTGTGCGTCTCTATGCTG
ACAATGAATAGAAAACAGAATAATTTTTCTAAACTTGTGGCTCACGTTGC
TCGGAAAGAGGAGTAAATTGTTCTTTATTTTGTTTAAAAATGCGGTGTAA
ACAAATTGTAAGAAATAAGTTAATGATGATTCTCTTTAAACTCCTATTCC
ATGGCATATATAGTTTTAAAATCTTCTTAACAATTGTTTTTCATATAATA
ATTTTTCAAAAATTTTCTCATTGATAGGCCAAAAGCTTTTAGACTTGTGC
TCAGACGAAGGTGAAATCTTAAGTGCTCGTTTTTCATCGGATGGCAAATA
CTTGATTACCATGGTCAAAAAATGTGTCAAAATATGGAATATCGCCAAGA
AGAAAGTGTCGTGGTCGATCGAAGATGCTAAGGGATTTCAGGTATGACTT
GTAATGATTGAAAAGATAATCGGATGGTATGAGATCTTTGGACTTTTTAT
TCTTTCTATGGTCCTCTGGATATCCTTCTTGCCTGACTATTTTTTTAAGT
TGAGATATTCAAATACCAATTTCAGATTTTCAGCAAGAAAATAATATAAT
TCCAACTTGAAAACTGTTTTAAAGAACCCATTTTGAGAGATTTCAAATTT
TTGGACCTACCTCCGGGTGCCCCGGTGGAGGTCCTATGAATTAACCTCTG
TCTGTTCGTCCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTT
CGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCG
TTCGTTCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCATTAGTTTTTTC
TGATTTTTTGCACAAAGATGCAAAATGGCAATGGCCAAAATGTGACGGAG
CCCGATTTTCGAAAAAAATCATTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCC
GGAAAAACCGGTTTTTTGGCATTTTCTCAAGATTTCATCATTAGTTTTTT
CTGATTTTTTGCACAAAGATGCGTGTTAGCAATGCCCAAAACTTGGCTGA
GTCCGATTTTTGAGAAAAAATTTTTTCCGGCCGGAAATGCCGGAAATATG
CCGGAAATCGCCGTATTTCTGGATTTTCATTGGACTTTTTCCATATAATT
GGTTGTTTTTTTCATTCAAAAACATTATTAATAGCAATGCCCACCATCAA
GCATGTTTCAATTTTCAATAAAATAGATTTTTGAAGCCGGAACTTTCTAA
AAATCGCCGGAACAGCCGATTTTCGCCGGAAAAACGGTATTTCTTGAATT
TCTTGAGCTGTACTTTATATTCTTTCATGAAATTTTGCACAATGATGCAA
AATGTCAATACCTAAATTGTGACGGAGCCTGATTTTCGAAAAACATCTTT
TTCCGGCCAAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACTGTTTTTTTGGCAT
TTTCTCGAGATTTTATCAATAGTTTTTTCTGATTTTTTGCTCAAAGATGC
GTGTTAACAATGCCCTAAACATGGCCGAGTTCGATTTTTCAGAAAATTCT
TTTTCCGGTGGAAAATGCCTGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTCTAG
ATTTTCATTGGACTTTTTCCTTATAATTGGTTGTTTTTTCATTCAGAAAC
ATTATTAATAGCAATGCCCACCATCGAGCATGTTTTAATTTTCAATAAAA
TTGATTTTTGAAGCCGGAACTAATTTAAAAGTCGCCGGAACAACCTATTT
TCGCCGGAAAGACAGTATTTCTTGAATTTCTCGAGATGTACTTTATATTT
GTTTATGAAATTTTGCACACTGATGCAATATGAGAGTCGGAAAAATCGGT
TTTTTGATATTTTCTCGAATTTTCATTTTTATTTTTTTCTGATTTTTTGC
AGAAAGATGCGTATTCGCAATGCTCAAAACATGGCCGAGTTGTATTTTTG
AGAAAAAATTTTTTCCGGTTTAGTTTACTTATATTTCTATGCTTTTCACA
CAAAAACATTATTCATAACAATGCATGATTCAATTGTCAATAAAACTGAT
TTTTGCGACCAGAACTTCCTATTTATTATTTCTATACAACCCTTCCCTCT
CCCCCCATCAACAATCAATGATGAATTTATTGTGTTGTGTATTTTCGCTA
AACGCTATATTTTCTGACTGATTTTTTTCATTTTTCTTTTCGTATTGCTA
TCTAACTTGAATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATATTGCTTGTTTATAA
CTCAAAGTTCTCTCATCTCCGACTGCTTAGACGTTACAGTTTCGCTCCGG
TACGGTTTTTCGTTACGGAACTTTTTGAGGTAAGAAAACGGAGCAATTCC
GTTCCGATGAAAGTAGGGGGGGGGACAAGTTTCGCATAATGACGTCTCTT
TCCGAAGTTTTTTGTCGACACGGTTTTCGTTTTGGAACGATGTAGAATCA
TATGTATGAGCATGATCTTAACGAGCTTCAAATATATATTTGATGCTCTC
TCTAAGTCGATTCGGGAATTGGATTTCCATCGAATGCAGGAGCATATCGA
ATAATAGGACGTCGAATAAGAGATCTGTTATTTTTACTAACGGTGTTTTC
TTGGTGTTTGCTATTAAAAACTTCGTTAATATCATGGTTTTTATCTTTTT
TTTTCAAGGCATTGGCATCACATTCAACAGAGAATATGTTCATTCTGATT
GCTCAAGACGGCTCCATTTCAGGATATGACATCACTCACAAGCAAGAACT
ATTCAAAAGGTTAGTTTTCTGGTAGACCGTCGTCACGTTTTACTTTTTTT
TTTTTTATTTTTATTTTTATTTTACCCAGGCCAGGTTGTAGCTTGCGCTA
ACTATGCAGTTGAGTTATCACTGATGTGGGCCTGCATTCAGCAATGGCTA
CCTCAGATTTTTAGACGACCGTCTTACATCTACATGACTGAATCACGGTA
ACTGATGACTACTGTGCATCTCATCGCTGTACTCCTTGAGACAACGTTGA
GATGCGCTACTTTCTCATTCATAATCTTCCCAGGAGAACGTTGATGAGAT
TTCAGTAGCAGCCACCAGGGCTCGAACTTGTACCGTGATTCACCCTTGCA
TTGTAAGGCGCACGCCTAACCAACTGAGCCAACCACTCAGCCCACTTAAT
TACAGAAGTTTTTGCATGTGAATCGGCTTAGGAGCCACGTCTGCGGTTTA
ACAATATTTAGGAAAAAGAAAGAAATGGCTGTCTGTCGCAATGAAGTATA
AGCCCGAAGGGCTAGAATCGAATCTCTAGCCTTTCTCAGACAAGAAAAGG
TGAACCCTTAAAATATGCGCCGTATTTGGAGCGATGGCCAAGTGGTCAAA
GGCGTCAGCGTCTCAAACCAGGGATTTGGAGTTCGAATCTCTGCTCCTTC
CAATGTTCTATTCAGTTCATAGATAGCCGAGCTGGCTGGTTGTGCACCCC
GTGAAAACAATCTAAAAGTCCTAGATTACTGGGCTATCCACGTAAAATAT
CGACTCTATCTATCTATTTTTGACGATGGGTTGAATCTTGAATGAAGCAA
CTCCTTTGTTTCGAGTGATATTTTTTTCGAAATCCAGCGGTAAGTTTTAG
TTTCAATCTGTCATTTGTGTATAAACCAGGCGGGTCGCGCTAGGCTGCGC
AACTTTGGTAGGGTTTGTTTGTTTCAAATCCTACCAAGGAGATTCAATTC
TAGCCATTCGGGCTGATACTTCATTGGTCTTTTGCCTCTCATACTCTTCT
AACAGAGTAATTGTACCCGATTCCCCTCACATGGTTTTGCCCCGATGAAG
GTCAATTGAATTGTATGTATCTATAAGAAAACTTTTTCGTGCATTTGATG
ACGTCAATCATTTCTGGCAAACTCTCAACCATGCTCGCTTAACACTTTAT
CCTATTCAACCTAGGCTTTTAGGGGCGGTTCAGAACTAGGGGGGGGGGGC
TTTTCCTGTACGACCCCTTAACTTTTGATATAGGTTGTCTTTTTGGATGA
AATTTGGCACACAAGATCCTTGTCACATAAGGTAACTTTTGACAAAAAAA
TATTTTGATGACGTCACTCATCATGCCCAAAGCGAGCAAAAACCGAAAAT
TTCCTTTGTTCTTATAAATAGCTATTGTATTCTAACAAAGGCTTTAGAAA
AAAGTTGCCTGAGTTTAAAATGCTTATTTTATCCTAAATATTCAATAAAT
TACGGTTTAAACGATATATTTGACATTAAAAATAAATTTGTATTGGAAAA
GTGTCAACTTTTGTGACACCTTTCTGTCAGAAATGTCATCATGCTCAAAG
TGTGAAAATTTTTAGGTGTCAAATTTTTTTTTAATTTGAAGCTAATTAAA
AGTTAGGAATTTACAGAAAATTTCATGGCAAAAGCTCTATTATTTCAGGA
GCTATTACCAATAATTTGACCTCCGAACAGAAACAGCCCCCCCCCTAGGC
CAAATAGGGTTAAGAGTTGATAGGGATAGGTGTATTGTAAACAGGAGAAT
CATTTGATCGTTTTCCTTTTTCAGGTCAACAGACCACCGTGGACCAGTTC
TCTCCTGTAATTTCTCACCCAGTGGCAATCTAGCATGCACCGGTGGTATT
GATGGAAAACTACTTGTCTGGTTATAAACAACATGTGTAAAATATCAAAA
CCCAATAAGAAAATATCACATTTCCAGCTTGACCACAACGTTTTTTCAAG
ATTCGTATTACGTCCATGTTAGATCATTGAAAGAACGTTGTGTGGTAAGT
TGAAGACATCACCATTTGTACAGTATATGAAATAGCTACAAATAGATTGA
GCTGCAATGGGAAAGTTTTTTTAGTTTGGAAACCAAACTTCAGATCAAAC
AGGAGTAAAGCCTTTTTCGATTGGTTATCATGGATCTTTGGTTGGAAACA
AGTGAATATCTAGAACTTAAGTTACTTTTGTGTGAGTTATTTTGTACATA
TGTAAATTCTAATCGTGAAGAATAAAAAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000070_pilon:88632..102211-

>MSTRG.10161.3.p1 ID=MSTRG.10161.3.p1|Name=MSTRG.10161.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6510bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000070_pilon:88632..102211- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCAACAGACCACCGTGGACCAGTTCTCTCCTGTAATTTCTCACCCAGTG
GCAATCTAGCATGCACCGGTGGTATTGATGGAAAACTACTTGTCTGGTTA
TAAGCATTGGCATCACATTCAACAGAGAATATGTTCATTCTGATTGCTCA
AGACGGCTCCATTTCAGGATATGACATCACTCACAAGCAAGAACTATTCA
AAAGGCCAAAAGCTTTTAGACTTGTGCTCAGACGAAGGTGAAATCTTAAG
TGCTCGTTTTTCATCGGATGGCAAATACTTGATTACCATGGTCAAAAAAT
GTGTCAAAATATGGAATATCGCCAAGAAGAAAGTGTCGTGGTCGATCGAA
GATGCTAAGGGATTTCAGGGCCAAAATTTATCGAGTTGTTTCATGAAGGA
GAGAAATATAAATTTAGTGATGCGTCATTTTCAAGTGATTCATGTGCCAT
CGTGACGTCATCAACTGATGGACAAGTCAAATTGTGGGATTCAGAAAATG
CCGTCCACTCAACAGAAATCACGTCATGTACCATTTCGCCAAACCACAAA
TATTTGTTGACGACTTCAGCAGACACTCACTGTCGTGTTTGGACCATCAG
AGGTGGAAATGGTGAATTCATACAAGGTCTTACTATGGGATGTAAATACC
GGACAATGTCAAGGGTCATTAGACGGACACGCTTCGGACGTAACGCGATG
TTCGTTCGGAAAAGAGATTCTAGCTACAGGTTCTCGTGATGGCACAGTCA
TCTTGTGGAGATACGCTGACAATAAAAGGTGTTCCAAAATAAATGGGTAA
CGAAGAACACACGACGAGCTTTCAAGGGAAATTAACCAAAACACTTCATT
TAGGACAAGCAGGTGCCATTCTTGGATGTGGAATATCCTACGATGACGAG
ACAGTCGCCAGCTGTGCCACAGATAACAAGGTCAACAGACCACCGTGGAC
CAGTTCTCTCCTGTAATTTCTCACCCAGTGGCAATCTAGCATGCACCGGT
GGTATTGATGGAAAACTACTTGTCTGGTTATAAGCATTGGCATCACATTC
AACAGAGAATATGTTCATTCTGATTGCTCAAGACGGCTCCATTTCAGGAT
ATGACATCACTCACAAGCAAGAACTATTCAAAAGGCCAAAAGCTTTTAGA
CTTGTGCTCAGACGAAGGTGAAATCTTAAGTGCTCGTTTTTCATCGGATG
GCAAATACTTGATTACCATGGTCAAAAAATGTGTCAAAATATGGAATATC
GCCAAGAAGAAAGTGTCGTGGTCGATCGAAGATGCTAAGGGATTTCAGGG
CCAAAATTTATCGAGTTGTTTCATGAAGGAGAGAAATATAAATTTAGTGA
TGCGTCATTTTCAAGTGATTCATGTGCCATCGTGACGTCATCAACTGATG
GACAAGTCAAATTGTGGGATTCAGAAAATGCCGTCCACTCAACAGAAATC
ACGTCATGTACCATTTCGCCAAACCACAAATATTTGTTGACGACTTCAGC
AGACACTCACTGTCGTGTTTGGACCATCAGAGGTGGAAATGGTGAATTCA
TACAAGGTCTTACTATGGGATGTAAATACCGGACAATGTCAAGGGTCATT
AGACGGACACGCTTCGGACGTAACGCGATGTTCGTTCGGAAAAGAGATTC
TAGCTACAGGTTCTCGTGATGGCACAGTCATCTTGTGGAGATACGCTGAC
AATAAAAGGTGTTCCAAAATAAATGGGTAACGAAGAACACACGACGAGCT
TTCAAGGGAAATTAACCAAAACACTTCATTTAGGACAAGCAGGTGCCATT
CTTGGATGTGGAATATCCTACGATGACGAGACAGTCGCCAGCTGTGCCAC
AGATAACAAGGTCAACAGACCACCGTGGACCAGTTCTCTCCTGTAATTTC
TCACCCAGTGGCAATCTAGCATGCACCGGTGGTATTGATGGAAAACTACT
TGTCTGGTTATAAGCATTGGCATCACATTCAACAGAGAATATGTTCATTC
TGATTGCTCAAGACGGCTCCATTTCAGGATATGACATCACTCACAAGCAA
GAACTATTCAAAAGGCCAAAAGCTTTTAGACTTGTGCTCAGACGAAGGTG
AAATCTTAAGTGCTCGTTTTTCATCGGATGGCAAATACTTGATTACCATG
GTCAAAAAATGTGTCAAAATATGGAATATCGCCAAGAAGAAAGTGTCGTG
GTCGATCGAAGATGCTAAGGGATTTCAGGGCCAAAATTTATCGAGTTGTT
TCATGAAGGAGAGAAATATAAATTTAGTGATGCGTCATTTTCAAGTGATT
CATGTGCCATCGTGACGTCATCAACTGATGGACAAGTCAAATTGTGGGAT
TCAGAAAATGCCGTCCACTCAACAGAAATCACGTCATGTACCATTTCGCC
AAACCACAAATATTTGTTGACGACTTCAGCAGACACTCACTGTCGTGTTT
GGACCATCAGAGGTGGAAATGGTGAATTCATACAAGGTCTTACTATGGGA
TGTAAATACCGGACAATGTCAAGGGTCATTAGACGGACACGCTTCGGACG
TAACGCGATGTTCGTTCGGAAAAGAGATTCTAGCTACAGGTTCTCGTGAT
GGCACAGTCATCTTGTGGAGATACGCTGACAATAAAAGGTGTTCCAAAAT
AAATGGGTAACGAAGAACACACGACGAGCTTTCAAGGGAAATTAACCAAA
ACACTTCATTTAGGACAAGCAGGTGCCATTCTTGGATGTGGAATATCCTA
CGATGACGAGACAGTCGCCAGCTGTGCCACAGATAACAAGGTCAACAGAC
CACCGTGGACCAGTTCTCTCCTGTAATTTCTCACCCAGTGGCAATCTAGC
ATGCACCGGTGGTATTGATGGAAAACTACTTGTCTGGTTATAAGCATTGG
CATCACATTCAACAGAGAATATGTTCATTCTGATTGCTCAAGACGGCTCC
ATTTCAGGATATGACATCACTCACAAGCAAGAACTATTCAAAAGGCCAAA
AGCTTTTAGACTTGTGCTCAGACGAAGGTGAAATCTTAAGTGCTCGTTTT
TCATCGGATGGCAAATACTTGATTACCATGGTCAAAAAATGTGTCAAAAT
ATGGAATATCGCCAAGAAGAAAGTGTCGTGGTCGATCGAAGATGCTAAGG
GATTTCAGGGCCAAAATTTATCGAGTTGTTTCATGAAGGAGAGAAATATA
AATTTAGTGATGCGTCATTTTCAAGTGATTCATGTGCCATCGTGACGTCA
TCAACTGATGGACAAGTCAAATTGTGGGATTCAGAAAATGCCGTCCACTC
AACAGAAATCACGTCATGTACCATTTCGCCAAACCACAAATATTTGTTGA
CGACTTCAGCAGACACTCACTGTCGTGTTTGGACCATCAGAGGTGGAAAT
GGTGAATTCATACAAGGTCTTACTATGGGATGTAAATACCGGACAATGTC
AAGGGTCATTAGACGGACACGCTTCGGACGTAACGCGATGTTCGTTCGGA
AAAGAGATTCTAGCTACAGGTTCTCGTGATGGCACAGTCATCTTGTGGAG
ATACGCTGACAATAAAAGGTGTTCCAAAATAAATGGGTAACGAAGAACAC
ACGACGAGCTTTCAAGGGAAATTAACCAAAACACTTCATTTAGGACAAGC
AGGTGCCATTCTTGGATGTGGAATATCCTACGATGACGAGACAGTCGCCA
GCTGTGCCACAGATAACAAGGTCAACAGACCACCGTGGACCAGTTCTCTC
CTGTAATTTCTCACCCAGTGGCAATCTAGCATGCACCGGTGGTATTGATG
GAAAACTACTTGTCTGGTTATAAGCATTGGCATCACATTCAACAGAGAAT
ATGTTCATTCTGATTGCTCAAGACGGCTCCATTTCAGGATATGACATCAC
TCACAAGCAAGAACTATTCAAAAGGCCAAAAGCTTTTAGACTTGTGCTCA
GACGAAGGTGAAATCTTAAGTGCTCGTTTTTCATCGGATGGCAAATACTT
GATTACCATGGTCAAAAAATGTGTCAAAATATGGAATATCGCCAAGAAGA
AAGTGTCGTGGTCGATCGAAGATGCTAAGGGATTTCAGGGCCAAAATTTA
TCGAGTTGTTTCATGAAGGAGAGAAATATAAATTTAGTGATGCGTCATTT
TCAAGTGATTCATGTGCCATCGTGACGTCATCAACTGATGGACAAGTCAA
ATTGTGGGATTCAGAAAATGCCGTCCACTCAACAGAAATCACGTCATGTA
CCATTTCGCCAAACCACAAATATTTGTTGACGACTTCAGCAGACACTCAC
TGTCGTGTTTGGACCATCAGAGGTGGAAATGGTGAATTCATACAAGGTCT
TACTATGGGATGTAAATACCGGACAATGTCAAGGGTCATTAGACGGACAC
GCTTCGGACGTAACGCGATGTTCGTTCGGAAAAGAGATTCTAGCTACAGG
TTCTCGTGATGGCACAGTCATCTTGTGGAGATACGCTGACAATAAAAGGT
GTTCCAAAATAAATGGGTAACGAAGAACACACGACGAGCTTTCAAGGGAA
ATTAACCAAAACACTTCATTTAGGACAAGCAGGTGCCATTCTTGGATGTG
GAATATCCTACGATGACGAGACAGTCGCCAGCTGTGCCACAGATAACAAG
GTCAACAGACCACCGTGGACCAGTTCTCTCCTGTAATTTCTCACCCAGTG
GCAATCTAGCATGCACCGGTGGTATTGATGGAAAACTACTTGTCTGGTTA
TAAGCATTGGCATCACATTCAACAGAGAATATGTTCATTCTGATTGCTCA
AGACGGCTCCATTTCAGGATATGACATCACTCACAAGCAAGAACTATTCA
AAAGGCCAAAAGCTTTTAGACTTGTGCTCAGACGAAGGTGAAATCTTAAG
TGCTCGTTTTTCATCGGATGGCAAATACTTGATTACCATGGTCAAAAAAT
GTGTCAAAATATGGAATATCGCCAAGAAGAAAGTGTCGTGGTCGATCGAA
GATGCTAAGGGATTTCAGGGCCAAAATTTATCGAGTTGTTTCATGAAGGA
GAGAAATATAAATTTAGTGATGCGTCATTTTCAAGTGATTCATGTGCCAT
CGTGACGTCATCAACTGATGGACAAGTCAAATTGTGGGATTCAGAAAATG
CCGTCCACTCAACAGAAATCACGTCATGTACCATTTCGCCAAACCACAAA
TATTTGTTGACGACTTCAGCAGACACTCACTGTCGTGTTTGGACCATCAG
AGGTGGAAATGGTGAATTCATACAAGGTCTTACTATGGGATGTAAATACC
GGACAATGTCAAGGGTCATTAGACGGACACGCTTCGGACGTAACGCGATG
TTCGTTCGGAAAAGAGATTCTAGCTACAGGTTCTCGTGATGGCACAGTCA
TCTTGTGGAGATACGCTGACAATAAAAGGTGTTCCAAAATAAATGGGTAA
CGAAGAACACACGACGAGCTTTCAAGGGAAATTAACCAAAACACTTCATT
TAGGACAAGCAGGTGCCATTCTTGGATGTGGAATATCCTACGATGACGAG
ACAGTCGCCAGCTGTGCCACAGATAACAAGGTCAACAGACCACCGTGGAC
CAGTTCTCTCCTGTAATTTCTCACCCAGTGGCAATCTAGCATGCACCGGT
GGTATTGATGGAAAACTACTTGTCTGGTTATAAGCATTGGCATCACATTC
AACAGAGAATATGTTCATTCTGATTGCTCAAGACGGCTCCATTTCAGGAT
ATGACATCACTCACAAGCAAGAACTATTCAAAAGGCCAAAAGCTTTTAGA
CTTGTGCTCAGACGAAGGTGAAATCTTAAGTGCTCGTTTTTCATCGGATG
GCAAATACTTGATTACCATGGTCAAAAAATGTGTCAAAATATGGAATATC
GCCAAGAAGAAAGTGTCGTGGTCGATCGAAGATGCTAAGGGATTTCAGGG
CCAAAATTTATCGAGTTGTTTCATGAAGGAGAGAAATATAAATTTAGTGA
TGCGTCATTTTCAAGTGATTCATGTGCCATCGTGACGTCATCAACTGATG
GACAAGTCAAATTGTGGGATTCAGAAAATGCCGTCCACTCAACAGAAATC
ACGTCATGTACCATTTCGCCAAACCACAAATATTTGTTGACGACTTCAGC
AGACACTCACTGTCGTGTTTGGACCATCAGAGGTGGAAATGGTGAATTCA
TACAAGGTCTTACTATGGGATGTAAATACCGGACAATGTCAAGGGTCATT
AGACGGACACGCTTCGGACGTAACGCGATGTTCGTTCGGAAAAGAGATTC
TAGCTACAGGTTCTCGTGATGGCACAGTCATCTTGTGGAGATACGCTGAC
AATAAAAGGTGTTCCAAAATAAATGGGTAACGAAGAACACACGACGAGCT
TTCAAGGGAAATTAACCAAAACACTTCATTTAGGACAAGCAGGTGCCATT
CTTGGATGTGGAATATCCTACGATGACGAGACAGTCGCCAGCTGTGCCAC
AGATAACAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10161MSTRG.10161Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10161.3.p1.exon9MSTRG.10161.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10161.3.p1.exon8MSTRG.10161.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10161.3.p1.exon7MSTRG.10161.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10161.3.p1.exon6MSTRG.10161.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10161.3.p1.exon5MSTRG.10161.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10161.3.p1.exon4MSTRG.10161.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10161.3.p1.exon3MSTRG.10161.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10161.3.p1.exon2MSTRG.10161.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10161.3.p1.exon1MSTRG.10161.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10161.3.p1MSTRG.10161.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000070_pilongenomesc0000070_pilon:88632..102211 -