MSTRG.10136.3.p3 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10136.3.p3
Unique NameMSTRG.10136.3.p3
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:1265796..1317627-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10136.3.p3 ID=MSTRG.10136.3.p3|Name=MSTRG.10136.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=51832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:1265796..1317627- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTTTGTTCCCAATATGCCACGCCTTATCCCATGCAGAGGCGAGAGTGC CGTTTGGTTTTAGGCCCTTTTTCCTGGAAAAAAGGGGTTCGTGATCGGTG TCAGCAGTTTGTTTTGATTAACAGCTGATACCGCTGACCAGTCATGATAA AAATGAAAGTGGGGTTCCTTGATCGTCGAAGGCGCGAAAATTATGAAAAT TGCTCTCCACTTTTCACGTGCATGCTGTCCTTGCTTTGGCTTTTGTTTTG TTTTTGTCATCCTGAATGTCCATTATAGAGGTCGATAATGTCTAGTTATG CGAGTATATAACCAATGTAAGTAAGTGTTTCTGCATTACTTTCTTTTTTG GAAATGCTAAGACATTTCAATTGAATTTTAGTGAAATGAAAGAAAAAATA CCTTTTTCACAAAACGAAAAAAGTGCCTTAAAATTCAAAATTCTTCCAAA CCATAAAAAGAATCAAGAAAAGTTTGATTTTATTTGTCTTTTGGTGCGGT TTTTTAGAAGTTAGTGGTTTACTGGAGCCCCCCCCCCCAGCGGTTTGTGT GAATGTGTGAATGGGCTTTTTCACTTGCGTGAATGCGTGAAAATTTTTGA AAAAATTACGTGAATGCCAGACCTGCCAACTTGAGATGTCCATTTTGCGT GAGATAAAAATTTCCAAGTGAAATCTGAAATCTTAGCTTGGTTTTCTGAT TTTCCGATGTCGGAAACTGGGGAAACTTTTTCCAAAAATCGTGAAATCGA GGAAACATTTTTCCCGAAATTGGAAAATCTTGGAAATATTTTTTCGGAAA TCAAAAATTAGGGAGACATCCTTTGGCTTCTTTGCCAAAATTTGGAAAAT TTGAGAAAAAAATCAAAAATGTGTGAGATTGCGTGAGACAATGTTGAAAT GCATGAGGCAATGTTGAAATACATGAGTCACACGCTCAATGCGTGAGAGT 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CCACATGCTCCATGTTTCTGGACAGCTAGGGTTAAATCCCGAGATGAGTA
AAGTGATCCGTAAAATTATCAACACCTCATCAGCTCCAAAGGCAATTGGA
CCATACAGTTGGGAAAAGTGGAGATCAAGATGATGGCAATTATTGGAGAT
GTCGATGAACAATAGTTTTCACTGCTCCTTTCCCAGCAAGAGCTGCTTTT
GAATGTGCAAATTTACCAAAGTTGTGGAGACGACCATCTTATTGAGTGAT
ATCAATGATTACAAAGCTGTCAATGATGTTTATGCTACTTGCATTGACAA
ATGCTGGAGAAATTCTTAAAGCAGCTGGCACATCATTTTCCAAAGACAAT
GGATTTTGTGAGCAATGATGTCAGTGAACAAACCAAACAGCCAAGCAGTC
CAAGTGAACCACATGCTCCATGTTTCTGGACAGCTAGGGTTAAATCCCGA
GATGAGTAAAGTGATCCGTAAAATTATCAACACCTCATCAGCTCCAAAGG
CAATTGGACCATACAGTTGGGAAAAGTGGAGATCAAGATGATGGCAATTA
TTGGAGATGTCGATGAACAATAGTTTTCACTGCTCCTTTCCCAGCAAGAG
CTGCTTTTGAATGTGCAAATTTACCAAAGTTGTGGAGACGACCATCTTAT
TGAGTGATATCAATGATTACAAAGCTGTCAATGATGTTTATGCTACTTGC
ATTGACAAATGCTGGAGAAATTCTTAAAGCAGCTGGCACATCATTTTCCA
AAGACAATGGATTTTGTGAGCAATGATGTCAGTGAACAAACCAAACAGCC
AAGCAGTCCAAGTGAACCACATGCTCCATGTTTCTGGACAGCTAGGGTTA
AATCCCGAGATGAGTAAAGTGATCCGTAAAATTATCAACACCTCATCAGC
TCCAAAGGCAATTGGACCATACAGTTGGGAAAAGTGGAGATCAAGATGAT
GGCAATTATTGGAGATGTCGATGAACAATAGTTTTCACTGCTCCTTTCCC
AGCAAGAGCTGCTTTTGAATGTGCAAATTTACCAAAGTTGTGGAGACGAC
CATCTTATTGAGTGATATCAATGATTACAAAGCTGTCAATGATGTTTATG
CTACTTGCATTGACAAATGCTGGAGAAATTCTTAAAGCAGCTGGCACATC
ATTTTCCAAAGACAATGGATTTTGTGAGCAATGATGTCAGTGAACAAACC
AAACAGCCAAGCAGTCCAAGTGAACCACATGCTCCATGTTTCTGGACAGC
TAGGGTTAAATCCCGAGATGAGTAAAGTGATCCGTAAAATTATCAACACC
TCATCAGCTCCAAAGGCAATTGGACCATACAGTTGGGAAAAGTGGAGATC
AAGATGATGGCAATTATTGGAGATGTCGATGAACAATAGTTTTCACTGCT
CCTTTCCCAGCAAGAGCTGCTTTTGAATGTGCAAATTTACCAAAGTTGTG
GAGACGACCATCTTATTGAGTGATATCAATGATTACAAAGCTGTCAATGA
TGTTTATGCTACTTGCATTGACAAATGCTGGAGAAATTCTTAAAGCAGCT
GGCACATCATTTTCCAAAGACAATGGATTTTGTGAGCAATGATGTCAGTG
AACAAACCAAACAGCCAAGCAGTCCAAGTGAACCACATGCTCCATGTTTC
TGGACAGCTAGGGTTAAATCCCGAGATGAGTAAAGTGATCCGTAAAATTA
TCAACACCTCATCAGCTCCAAAGGCAATTGGACCATACAGTTGGGAAAAG
TGGAGATCAAGATGATGGCAATTATTGGAGATGTCGATGAACAATAGTTT
TCACTGCTCCTTTCCCAGCAAGAGCTGCTTTTGAATGTGCAAATTTACCA
AAGTTGTGGAGACGACCATCTTATTGAGTGATATCAATGATTACAAAGCT
GTCAATGATGTTTATGCTACTTGCATTGACAAATGCTGGAGAAATTCTTA
AAGCAGCTGGCACATCATTTTCCAAAGACAATGGATTTTGTGAGCAATGA
TGTCAGTGAACAAACCAAACAGCCAAGCAGTCCAAGTGAACCACATGCTC
CATGTTTCTGGACAGCTAGGGTTAAATCCCGAGATGAGTAAAGTGATCCG
TAAAATTATCAACACCTCATCAGCTCCAAAGGCAATTGGACCATACAGTT
GGGAAAAGTGGAGATCAAGATGATGGCAATTATTGGAGATGTCGATGAAC
AATAGTTTTCACTGCTCCTTTCCCAGCAAGAGCTGCTTTTGAATGTGCAA
ATTTACCAAAGTTGTGGAGACGACCATCTTATTGAGTGATATCAATGATT
ACAAAGCTGTCAATGATGTTTATGCTACTTGCATTGACAAATGCTGGAGA
AATTCTTAAAGCAGCTGGCACATCATTTTCCAAAGACAATGGATTTTGTG
AGCAATGATGTCAGTGAACAAACCAAACAGCCAAGCAGTCCAAGTGAACC
ACATGCTCCATGTTTCTGGACAGCTAGGGTTAAATCCCGAGATGAGTAAA
GTGATCCGTAAAATTATCAACACCTCATCAGCTCCAAAGGCAATTGGACC
ATACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10136MSTRG.10136Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10136.3.p3MSTRG.10136.3.p3-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.10136.3.p3.exon36MSTRG.10136.3.p3.exon36Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon35MSTRG.10136.3.p3.exon35Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon34MSTRG.10136.3.p3.exon34Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon33MSTRG.10136.3.p3.exon33Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon32MSTRG.10136.3.p3.exon32Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon31MSTRG.10136.3.p3.exon31Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon30MSTRG.10136.3.p3.exon30Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon29MSTRG.10136.3.p3.exon29Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon28MSTRG.10136.3.p3.exon28Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon27MSTRG.10136.3.p3.exon27Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon26MSTRG.10136.3.p3.exon26Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon25MSTRG.10136.3.p3.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon24MSTRG.10136.3.p3.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon23MSTRG.10136.3.p3.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon22MSTRG.10136.3.p3.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon21MSTRG.10136.3.p3.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon20MSTRG.10136.3.p3.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon19MSTRG.10136.3.p3.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon18MSTRG.10136.3.p3.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon17MSTRG.10136.3.p3.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon16MSTRG.10136.3.p3.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon15MSTRG.10136.3.p3.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon14MSTRG.10136.3.p3.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon13MSTRG.10136.3.p3.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon12MSTRG.10136.3.p3.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon11MSTRG.10136.3.p3.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon10MSTRG.10136.3.p3.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon9MSTRG.10136.3.p3.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon8MSTRG.10136.3.p3.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon7MSTRG.10136.3.p3.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon6MSTRG.10136.3.p3.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon5MSTRG.10136.3.p3.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon4MSTRG.10136.3.p3.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon3MSTRG.10136.3.p3.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon2MSTRG.10136.3.p3.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p3.exon1MSTRG.10136.3.p3.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000069_pilongenomesc0000069_pilon:1265796..1317627 -