MSTRG.10136.3.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10136.3.p2
Unique NameMSTRG.10136.3.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:1265796..1317627-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10136.3.p2 ID=MSTRG.10136.3.p2|Name=MSTRG.10136.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=51832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:1265796..1317627- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTTTGTTCCCAATATGCCACGCCTTATCCCATGCAGAGGCGAGAGTGC CGTTTGGTTTTAGGCCCTTTTTCCTGGAAAAAAGGGGTTCGTGATCGGTG TCAGCAGTTTGTTTTGATTAACAGCTGATACCGCTGACCAGTCATGATAA AAATGAAAGTGGGGTTCCTTGATCGTCGAAGGCGCGAAAATTATGAAAAT TGCTCTCCACTTTTCACGTGCATGCTGTCCTTGCTTTGGCTTTTGTTTTG TTTTTGTCATCCTGAATGTCCATTATAGAGGTCGATAATGTCTAGTTATG CGAGTATATAACCAATGTAAGTAAGTGTTTCTGCATTACTTTCTTTTTTG GAAATGCTAAGACATTTCAATTGAATTTTAGTGAAATGAAAGAAAAAATA CCTTTTTCACAAAACGAAAAAAGTGCCTTAAAATTCAAAATTCTTCCAAA CCATAAAAAGAATCAAGAAAAGTTTGATTTTATTTGTCTTTTGGTGCGGT TTTTTAGAAGTTAGTGGTTTACTGGAGCCCCCCCCCCCAGCGGTTTGTGT GAATGTGTGAATGGGCTTTTTCACTTGCGTGAATGCGTGAAAATTTTTGA AAAAATTACGTGAATGCCAGACCTGCCAACTTGAGATGTCCATTTTGCGT GAGATAAAAATTTCCAAGTGAAATCTGAAATCTTAGCTTGGTTTTCTGAT TTTCCGATGTCGGAAACTGGGGAAACTTTTTCCAAAAATCGTGAAATCGA GGAAACATTTTTCCCGAAATTGGAAAATCTTGGAAATATTTTTTCGGAAA TCAAAAATTAGGGAGACATCCTTTGGCTTCTTTGCCAAAATTTGGAAAAT TTGAGAAAAAAATCAAAAATGTGTGAGATTGCGTGAGACAATGTTGAAAT GCATGAGGCAATGTTGAAATACATGAGTCACACGCTCAATGCGTGAGAGT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000069_pilon:1265796..1317627-

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TGACCGATTACTTTCCTGCTGAGAACATTTATTCTGCCAACAAAGACGAT
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GAAAGTTAGCTTTCCGTTATCGACGCATCAAGGAAATGTATAACGCATAT
CGAAATAATATTGACGGAGTGTGACCAAGTTCACGTCGATGATATCTCCA
CTGATGACACTGGTCAAGACTTGAAGACCCGTCTACAGCATCAACAATCG
GTTTTCGACTGGAAGAAATGATTTATCATATTGCTTCTTCGCATTTATTC
TTCAGTGACCTTGAGCGAGTCTTCATTTGGGACTTGGACGAAACTATCCT
CGTTTTTCATTCTTTGATCACTGGTGAATTTGCATCCAAATTCGGAAAGA
GCGATTCGAGTTACAATTCCTACTTGGAAATGGAACACGGAACACCTATC
AATTACAACAGTCCAACGGAAAAATATTCTACACGATCAAATCGAAAATC
AAAACTACAAAATGGCGTAAAGAAAGCATCCAAGTCAAAGAAATCTTTAC
AATCAGATCCTGAACACTCTTATGATCTTCACCATTTTCACCAACAATAC
CTTTGATGGGTAATTCAACTCATAACAATCAATTAAACTCAAGTTCATCC
TCCAATTTTGAAACCAGAATGAATTTCCCATAAAAAACCTACACCTGAAG
ATCTCTCGCCTCAAAGGGCCCAATATGGTTATCAAGGATCAACTGCTAGG
CAAACACCAGAAAGAACATATTCAACAAATAGTTCAAATGGATCAGAAAT
TGCTAAACAGGAAATACCAAGTAGTAACCTACCAAATATATTCAATGTTA
GCTGTTCAGCTAGTACAATGCCATCAATTGTGAATACACCCACAACAGGA
CAATCTTCATATCCTTCTACCATGGATACTTTAATTGATTATAATAGTTT
AACAAAACAATACCACAGTGCTAGTAATTTATTACAGAATATTACAAAAA
CACCTTATTTTGATAGTAGTACCGGCAAATATACAGAAAACAATGTTGCA
AATAATACCAGTAATAGCCCACCAGCTGGAGGAAAATATTTTGATAATAA
ATATAATTTTACGGGAAGTCAATCTGAATTTAATGGACGTAGTAGTGTGA
CTTCTTCAAATTATTCTTTCGGACCATCGAACATGCTGCAATCTGGATTT
CCACCACCGCAAAGTATTATCTCCAAATCTCTCACACAATTTGCTGGATC
CGGATATTTACCACCAACAACAAGCTATCCATCTCTTGGATCAAACCCTG
CATCATTCAATGCACCTTACTTCAACCAAAAATTTGCTTCTACCGATAAT
AACAATTACTTATACCCTAATTTATTTAGTTCAAGCACTAAGTTACCAGC
ATATTCAACCTCTCAAGGATCAACACAAATTTTCCCTCCTCCTTTCGGAA
ACAATGGACTTTTCCCTTCAAGTGGTATGAATTCACCTTTACTACCTGGA
AGTAATAATGTTCCTGAAAGCCCTACAAATGGTTCATCTTATAATCAAAA
CCCTATTGTTGGGAATAATTCTGCAGGCTCACAAGCACCCACTACAGGAA
AAGAAACCGAAGATAGAAAAAGATTTAGACGATGTATTCCTTGAAAAATG
ACCATGACTGAAGTTATCAGTGAAAGATCTTCTTCAGTTCCTGGTGAAAG
TGAAGATGATGAACTACTTACACCAAGGCTTGGGATACCATTTTGGAGGG
TGACAAATCATGGTGATTTAGTCAACCTACATCACGCATTAGAGCTTGGA
CATTTGTGAGTAAAGAAGCATGTTTCCAAAGGGTACAAAGTCGTTTTGGT
AGAAAGTGCACGTACGTTGTGGTCGGTAACGGTCGAGCGGAAGAAATACC
CAGCAAACAGAGCAAGTTGTCTAAACGTTTTGGTCACTTCAAGCCATCTG
ATACCAACATTAGCCAAATGTATGCTGTTTGGTTTGACCGATTACTTTCC
TGCTGAGAACATTTATTCTGCCAACAAAGACGATTTACTTGGACCTGGCA
AACGTGAACAATGGTTACCCTTAAGAATGGAAATGGAAAACCTGTCTGAT
TCCTGGCATACTTTGGCTTCAAAATGTATTTACACAATCAAGAAAAGTGA
TTACAATTTTGAAAGTGATGGTTTCTGTAATAGCTCGTCTTCAAGCGTTC
TTCAATTCCCGGTTGCTGGGCGACGCGGTGTGGACTGGAACCGAAAGTTA
GCTTTCCGTTATCGACGCATCAAGGAAATGTATAACGCATATCGAAATAA
TATTGACGGAGTGTGACCAAGTTCACGTCGATGATATCTCCACTGATGAC
ACTGGTCAAGACTTGAAGACCCGTCTACAGCATCAACAATCGGTTTTCGA
CTGGAAGAAATGATTTATCATATTGCTTCTTCGCATTTATTCTTCAGTGA
CCTTGAGCGAGTCTTCATTTGGGACTTGGACGAAACTATCCTCGTTTTTC
ATTCTTTGATCACTGGTGAATTTGCATCCAAATTCGGAAAGAGCGATTCG
AGTTACAATTCCTACTTGGAAATGGAACACGGAACACCTATCAATTACAA
CAGTCCAACGGAAAAATATTCTACACGATCAAATCGAAAATCAAAACTAC
AAAATGGCGTAAAGAAAGCATCCAAGTCAAAGAAATCTTTACAATCAGAT
CCTGAACACTCTTATGATCTTCACCATTTTCACCAACAATACCTTTGATG
GGTAATTCAACTCATAACAATCAATTAAACTCAAGTTCATCCTCCAATTT
TGAAACCAGAATGAATTTCCCATAAAAAACCTACACCTGAAGATCTCTCG
CCTCAAAGGGCCCAATATGGTTATCAAGGATCAACTGCTAGGCAAACACC
AGAAAGAACATATTCAACAAATAGTTCAAATGGATCAGAAATTGCTAAAC
AGGAAATACCAAGTAGTAACCTACCAAATATATTCAATGTTAGCTGTTCA
GCTAGTACAATGCCATCAATTGTGAATACACCCACAACAGGACAATCTTC
ATATCCTTCTACCATGGATACTTTAATTGATTATAATAGTTTAACAAAAC
AATACCACAGTGCTAGTAATTTATTACAGAATATTACAAAAACACCTTAT
TTTGATAGTAGTACCGGCAAATATACAGAAAACAATGTTGCAAATAATAC
CAGTAATAGCCCACCAGCTGGAGGAAAATATTTTGATAATAAATATAATT
TTACGGGAAGTCAATCTGAATTTAATGGACGTAGTAGTGTGACTTCTTCA
AATTATTCTTTCGGACCATCGAACATGCTGCAATCTGGATTTCCACCACC
GCAAAGTATTATCTCCAAATCTCTCACACAATTTGCTGGATCCGGATATT
TACCACCAACAACAAGCTATCCATCTCTTGGATCAAACCCTGCATCATTC
AATGCACCTTACTTCAACCAAAAATTTGCTTCTACCGATAATAACAATTA
CTTATACCCTAATTTATTTAGTTCAAGCACTAAGTTACCAGCATATTCAA
CCTCTCAAGGATCAACACAAATTTTCCCTCCTCCTTTCGGAAACAATGGA
CTTTTCCCTTCAAGTGGTATGAATTCACCTTTACTACCTGGAAGTAATAA
TGTTCCTGAAAGCCCTACAAATGGTTCATCTTATAATCAAAACCCTATTG
TTGGGAATAATTCTGCAGGCTCACAAGCACCCACTACAGGAAAAGAAACC
GAAGATAGAAAAAGATTTAGACGATGTATTCCTTGAAAAATGACCATGAC
TGAAGTTATCAGTGAAAGATCTTCTTCAGTTCCTGGTGAAAGTGAAGATG
ATGAACTACTTACACCAAGGCTTGGGATACCATTTTGGAGGGTGACAAAT
CATGGTGATTTAGTCAACCTACATCACGCATTAGAGCTTGGACATTTGTG
AGTAAAGAAGCATGTTTCCAAAGGGTACAAAGTCGTTTTGGTAGAAAGTG
CACGTACGTTGTGGTCGGTAACGGTCGAGCGGAAGAAATACCCAGCAAAC
AGAGCAAGTTGTCTAAACGTTTTGGTCACTTCAAGCCATCTGATACCAAC
ATTAGCCAAATGTATGCTGTTTGGTTTGACCGATTACTTTCCTGCTGAGA
ACATTTATTCTGCCAACAAAGACGATTTACTTGGACCTGGCAAACGTGAA
CAATGGTTACCCTTAAGAATGGAAATGGAAAACCTGTCTGATTCCTGGCA
TACTTTGGCTTCAAAATGTATTTACACAATCAAGAAAAGTGATTACAATT
TTGAAAGTGATGGTTTCTGTAATAGCTCGTCTTCAAGCGTTCTTCAATTC
CCGGTTGCTGGGCGACGCGGTGTGGACTGGAACCGAAAGTTAGCTTTCCG
TTATCGACGCATCAAGGAAATGTATAACGCATATCGAAATAATATTGACG
GAGTGTGACCAAGTTCACGTCGATGATATCTCCACTGATGACACTGGTCA
AGACTTGAAGACCCGTCTACAGCATCAACAATCGGTTTTCGACTGGAAGA
AATGATTTATCATATTGCTTCTTCGCATTTATTCTTCAGTGACCTTGAGC
GAGTCTTCATTTGGGACTTGGACGAAACTATCCTCGTTTTTCATTCTTTG
ATCACTGGTGAATTTGCATCCAAATTCGGAAAGAGCGATTCGAGTTACAA
TTCCTACTTGGAAATGGAACACGGAACACCTATCAATTACAACAGTCCAA
CGGAAAAATATTCTACACGATCAAATCGAAAATCAAAACTACAAAATGGC
GTAAAGAAAGCATCCAAGTCAAAGAAATCTTTACAATCAGATCCTGAACA
CTCTTATGATCTTCACCATTTTCACCAACAATACCTTTGATGGGTAATTC
AACTCATAACAATCAATTAAACTCAAGTTCATCCTCCAATTTTGAAACCA
GAATGAATTTCCCATAAAAAACCTACACCTGAAGATCTCTCGCCTCAAAG
GGCCCAATATGGTTATCAAGGATCAACTGCTAGGCAAACACCAGAAAGAA
CATATTCAACAAATAGTTCAAATGGATCAGAAATTGCTAAACAGGAAATA
CCAAGTAGTAACCTACCAAATATATTCAATGTTAGCTGTTCAGCTAGTAC
AATGCCATCAATTGTGAATACACCCACAACAGGACAATCTTCATATCCTT
CTACCATGGATACTTTAATTGATTATAATAGTTTAACAAAACAATACCAC
AGTGCTAGTAATTTATTACAGAATATTACAAAAACACCTTATTTTGATAG
TAGTACCGGCAAATATACAGAAAACAATGTTGCAAATAATACCAGTAATA
GCCCACCAGCTGGAGGAAAATATTTTGATAATAAATATAATTTTACGGGA
AGTCAATCTGAATTTAATGGACGTAGTAGTGTGACTTCTTCAAATTATTC
TTTCGGACCATCGAACATGCTGCAATCTGGATTTCCACCACCGCAAAGTA
TTATCTCCAAATCTCTCACACAATTTGCTGGATCCGGATATTTACCACCA
ACAACAAGCTATCCATCTCTTGGATCAAACCCTGCATCATTCAATGCACC
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GGATCAACACAAATTTTCCCTCCTCCTTTCGGAAACAATGGACTTTTCCC
TTCAAGTGGTATGAATTCACCTTTACTACCTGGAAGTAATAATGTTCCTG
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AATTCTGCAGGCTCACAAGCACCCACTACAGGAAAAGAAACCGAAGATAG
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TTAGACGATGTATTCCTTGAAAAATGACCATGACTGAAGTTATCAGTGAA
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ACAGAAAACAATGTTGCAAATAATACCAGTAATAGCCCACCAGCTGGAGG
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ATGGACGTAGTAGTGTGACTTCTTCAAATTATTCTTTCGGACCATCGAAC
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TTCATCTTATAATCAAAACCCTATTGTTGGGAATAATTCTGCAGGCTCAC
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TGTATTCCTTGAAAAATGACCATGACTGAAGTTATCAGTGAAAGATCTTC
TTCAGTTCCTGGTGAAAGTGAAGATGATGAACTACTTACACCAAGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10136MSTRG.10136Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10136.3.p2MSTRG.10136.3.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10136.3.p2.exon37MSTRG.10136.3.p2.exon37Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon36MSTRG.10136.3.p2.exon36Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon35MSTRG.10136.3.p2.exon35Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon34MSTRG.10136.3.p2.exon34Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon33MSTRG.10136.3.p2.exon33Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon32MSTRG.10136.3.p2.exon32Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon31MSTRG.10136.3.p2.exon31Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon30MSTRG.10136.3.p2.exon30Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon29MSTRG.10136.3.p2.exon29Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon28MSTRG.10136.3.p2.exon28Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon27MSTRG.10136.3.p2.exon27Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon26MSTRG.10136.3.p2.exon26Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon25MSTRG.10136.3.p2.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon24MSTRG.10136.3.p2.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon23MSTRG.10136.3.p2.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.10136.3.p2.exon21MSTRG.10136.3.p2.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon20MSTRG.10136.3.p2.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon19MSTRG.10136.3.p2.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon18MSTRG.10136.3.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon17MSTRG.10136.3.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon16MSTRG.10136.3.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon15MSTRG.10136.3.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon14MSTRG.10136.3.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon13MSTRG.10136.3.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.10136.3.p2.exon10MSTRG.10136.3.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon9MSTRG.10136.3.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon8MSTRG.10136.3.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon7MSTRG.10136.3.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon6MSTRG.10136.3.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon5MSTRG.10136.3.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon4MSTRG.10136.3.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10136.3.p2.exon3MSTRG.10136.3.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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Position
The following features are aligned
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