MSTRG.10122.4.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10122.4.p2
Unique NameMSTRG.10122.4.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:1052470..1070431+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10122.4.p2 ID=MSTRG.10122.4.p2|Name=MSTRG.10122.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17962bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:1052470..1070431+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATAAAACATCATAGTATAAGATCTGAGAGAGTGAAATGTAAGGAATGGAT CGCTATATCAAAGATCTCAGTATAGTATCGTCTTTTTCTGATTTAAAAAG GAAACAACAACAAACGACATTCATCAAAGCTATGTACTCAAATGAGAAAG ACTCGTTACTGAAGAATGATAGTAGTCAATCGTACAGTAGCAGTGATGAG ACCCCGGGAACAGTCAACCGACACACACCATCGTTGAATGGTGATGATGG CAAAGAACACTTTGTTGGTATTGATGATATTGGAGATtatgaagaagatg aagataaAGGAGAAGGTGAATaactttttctgttttgttgcaaggtcaaa atttattcacaaaagattttgctttgtgCACCCTggaatataataaaaat aattttctatcaAGCTTTTTATGGGGACTGGCGACTTTTCCATGATTCAA CTTTCTCAACTCTTATAGAAAAGTTCAATTCCTTTAGTTTTATTAATTGC CCTCTATAAGAATTCTCTCTAAGAGAGTCCTGGAAAGGGGCATCCATCAT TCAGGATCAGCTTGTCACAGTAGATCAACTTGCCCACGACCCTGTGTCAG CGTGTAGACACCTACACGTAGAAATTTTTCTGCAGACAAAATAATCTACT CTACTGTTTCTATATTCATATTTTACTAAATCTCTAAACGAAGGATTTTC ACATCACGTTTGAATCAATGCAAATTTGGACTTTTTAACAACATTTTCTT GTCTTTGTAGCAAATGattaaattttgtaatttcaaaatatttcatgaaC TTCATTTTCAGATCATCCATTGACAGTATCAGTGAAATCTTCAGGATCTG GTAGAAGTCGTACAGCTGTATCAGGTGGTCTGGATACTGGGGAAAAGGGT ACCTCGTAAGTGTCTTTCCCTTTTTGTTGAGACATTTTATATAATCGGTC atggtaaaaaataaaaatggttttaAGAGATTTCCTAAAGGTGGCTTGTA TTTGAGAATGTCagtgtttaaaaaagatatattttaaaCGAAACTAAAAA TCTGGTAGGATATTATGAAAAACTCCCTTTAAAGATGTATTTAAAAGATA ATCAAATGTAATATCCTTTgctattttttaaacaaaagttaCCGTAGTAG GACTGTATTTTGTAAGACTTATATTATGGTATTTTATTTCCACTTTCCAG TAATTTGGCAACAATGGTTCACATTTTCAAAGGGAATGTTGGTACTGGCA TCTTAAGTTTACCAGCAGCTGTCAAACATGCAGGGGTGGTTGCTGGACCC GTCGGATTGTGTATCATTGCTTTCATAGCAGTACATTGTATGCACATGTT GGTCAGGTGTTCCCATTTCTTTTGTAGAAAGTAAGTCTCGGTGTCTGTGT AGTAAAATGTTGTTGACTTCTTAATACAAAAGAGTCAATATATCCTCCTA GGGGTGATCTTATTAAACAGCGACCGTAGTGCCgtggtagagcatccgac tACGATGCACCCCAGccggtcataccaaagattcatAGAAATGGtccttg atgcctctctgcttgatgctcagcaataaagagaaggatcaagggtaatt GAAGCgttccagggagaaagagtggcgccctcccctacctttgggtagat agctatatCGAAAGatgagccttcgggtcgcctctgaCTGCGGTCACAGa ccagggttcagacagaccctggaaaacctggaaatatgataaattttcag aaaaatcagggaaactcagggaaacccagggaaaaattttttttccccca gtctgctcagggaaactcagggaattttattttttgaagaatgaatggaa aaaacagatttaaaagattttttagttttaaagtgtttattcatatgcag tatttgtagctttaatttttaccttaggtttaccatttgatttgtgtgcc ttttgtttaaagatacatctcttttgactctgcttagtttttatggtttg cttgatactcagggaaaaaatagggaaaaaatagctaaaatgaggaattt ctcagggaaaaaacctttgaaaattgattaaaattcagggaaactcaggg aattttattttcgaaggtctgtctgaaccctgcaGACTTACTTATAAATA ATCATCGGAAATGACCCAAAATACTACACGTATCTTGTATTTAGTAAGGG TAacaatttatttaaaaacaaaaccaaaatttctttcGAGTTGACAGATA GTTGGACTTTAATCCATAATCAGCTGATAATTTTAAAAaccacaaaacaa aagaaagtccgaAGATATTCATTCTGAAACcatcaaaaatcttgaagtaA ACAGAGATAAAGAGTAAtctcataaaaatgttttgttgttgGACTTTGCA ACCATTTCCATAGCTTTTAAAAGTATCGAAGTCTTAACATCTCATAACAA TGATGggaatttattttcattacacTTCGTGTTTTAGAACTGGCAAACAA GCTATGTCTTATGGTGAAGTTGCAGAAGAATGCTCCAAAGGAATATTCAA GGATAAAGCATATTGGCCAAAGTAAGTTGTAATTCTTCTTATTCAcagtt ttcaatgattttaacTCTTGGAAGAGATGATGTTACAATGATGGTTAATT TTGACACAGGTCCCTTTTGATCGTTTTAATGTGGTGGCATttaaaatctt tctataatacAGAATTTCAATATTAGAAAATGATATGAGAAAGATGTCTA CAAGTTATTCCTTTTCAATCAGTTTATattaaattttggtcaaattgcga atattttactttatttgacAGGAGGATAGTCAATTTATTTCTGATCGTCA CTCAGTTGGGATTTTGTGCTGTTTACTTTGTCTTTGTGGCGTCTACTATT GTTGAGGTTGCTGGATGGGGAGATAAAGTTGACAAGAGACTGGTCATTAT CATACTAGCGCTTCCTGTTGCTCTCTTATCCTACATTCGAAGCTTAGAGA AGCTGGCTTATCTATCCATTATCGCGAATATTTGTTGTGTAGTGGGTTTA ATTACTATTTATCAATATTTGGCTCGTAATCTGGGTGACCCAACGCGTTT GCCGATGTTTTCTGGTGTTCAGAATCTACCTATGTTCTTTGCGATGGCTC TCTTTTCGTTCGAAGGCATCGGAGTGGTAAGTTACGACGAACTTCCATGC AAAACTGCAATCTCTGTATGAAAAACGCACACCTTCCTATTGAGGAGGTC CATTCTTGTTCAAAGAAAGCAAGGTTCGAAATCTGATGGAATTCCGTTTA AAAGGTATCAAGATTCGGTGGACTTATAAAAGTCCTCTTAAAATGACTAC GAGTCTTCCTAGTAAGGAAATACTACTGAAGTTTCTCAATGCCCTTAATA CACAAGGTGTTATTGTTTTCATGATTAAATCTGTCATCGCGGGAATGTCT TGGCAAACTACGGTCAAGGATTGCTTTGTGCACTTTTAGCTTTTAAAACT ACACTCTGCCATGTCATGTTTAAACtacaacaaaagaaatgacgtcattt ttaaaaaagtattgcATATTTTTCAAGTGACCTTACTAGGCATTTTCAAT CGAAATTTAGAGTGATTTTACTCGATAGGGCCATTGTTATGTAATTTGAT TTCTCTGGATTGCGTGATCGtacaggggggggtcaagcctcAGGGTACTA AAGCATAGCCGGTGGGGTgggtgtttttccaaaaaaaaattgataagtac ccgggtactttttgggtgggtGGGGAGCCAAGTTTGTTTAATCAAACAAG TACCCGGGTACTAATTGGGTGGGTCTTAtgtgaattttctttgtaaaata aGTACCTTGACTCAATTTTGGTGAGTACTGGTGAGTAGtttttttCAAGA CAATTTAAGGGCTTTGAGACTTAAGTATTGTTAAAAACctgtgacatttt tattccatcaTTGGATGGTTAAAAATAAGTTACTTCTAGCATAAAATTTG ACACgaagaacaaataaaaacatgattctgccatataaaaatattatatc gatgaaaagaaagttttaaattgttttatattgttgatgtaatatcaaaa cataaaaagacctgccaagaaaaagaaatttagggaaaagttttgaagtg aaagtgaaagccaAGGtcctgttttgtttgttttgatcgagCTCCATCTG AGTGTTTCCCTTTCCTTCTATTCTATTATGTTTTCATGTGAAATAGTGAT GTAATGAACTCCTTCTGAGTGTTTATTTTCACTGATatattttctctctc tctcttacattttttctttcctaCTACTGCTTTGAGACTTAAGTATTGTT AAAACctgtgacatttttattccatcaTTTTTCTGACTTATTacagcttt tcaaaaaaatattgcgaGATAATGTCACCTAAATTCTGCCAAAATAGTCA CATGGGCCAGATTTCTACACTTTGATACCACCAGGTAAAgtagaaaactc aaaaattctGATTTATATCCTATCTTGGCTTCTTTTATATCTAAAGCTTT CTTACGTTATTACAGTATAGTTGTGGGTTTACTTCTTTATTCagctttat taaaaaaacctgtttagaaactttcttgtttttttagccattttcgtatt atattattttgtttctatttaCCACAATAGGTTGCTTGATTGCATCCTTT GACCTGATAATAACTTCTCTAAGACATTCTGGGTGGGCACTCACAACAAA GCTCAATGAAGTATAACAAATGGAGTTTAGATTAAAAGTGTTACAGATTC TCgtttttaaagtgaattttactTGGGTCTATTGCAACTGgttatattta gtttatattagtttcttattttttgtttagttttgctaatttactctggt ttatactttttatatttccagatatttCAGAAACTAgatcttttgttaaa actgttCTAAGATTTTCTAAGATTGTGAAAAAGTGCTTTTACAttgtttt gatgtgttttcatgtttaaaaaataaggcAATCAATGTACCCGAATGTAT TACTGTAAATTACGCCTGGCTTATTAGTTGGGCTAATagtaaaggaaaat taaaattaacagtTATAAGGGTGGGTTTAATTTTGATGAGTGTAGAATTG AGAAAGATTAATGagtaataaatttattttttgtaggtaTAGGGTTTAAG AAGGAAAAGTccttaagtacccgggtactttttgggttggTATGGGGTCT AGAAGAGAAAAGTccttaagtacccgggtactttttgggtgAGTATAGGG TCTAGAAGGGAAAAGTcattaagtacccgggtacttattTGGGTGGGTGG TAtgagtcaaaattttttttagataagtACCCTCTCTAGGCTATGCTTTA GTACCCTGAGGCTTGAcccccccTGGATCGTATGATGAGTTTGACGTTAA GCCTTTATCTTGTACATAATGCAAATAAGAATTTGATACCTTTATGGAAA TCTGATTCTACATCGGTTTCGATGGGCTTAATTTTCTATCAAATGCTCtt tttcccccattttcactttcttttttctgTTAGGCCTAAGAATTATTGTA TTTGGTATTGAAAAATCCTCATTATTCACTTTCGCTTTTATGACCTTTTA TGATGATACACACTGCATCGGTAATAGTTTAGTAATAGTATAGTTCTGAT CTATTAGTAGGGACGAACCCTTAggacccgtgacatcttttatgcgatGC AACCTAAAATATGAAGTAATTTTCGCgagagattttttttgctcatgtaT GTTATGACATTTTAAAGACAAACCATGAAAGGATTTTTCATAACAGATTT TTCTTTTCTCCCTTTCATGAGTTTCTCAATGACGTCTCTCCATAACGCAG GTCTTGAACAAATGTTTgtcttttttcttatttcaccGATGAATACCAAC AATGATTTATCTTCAAAATTGTTTACAAACGTTTACTCCACACCCCTATA TAGCCTCACTTATGTAAAAAATTGCGCCTAATTGCGTTTCTACTAAATTT GTcccatttttcaagtttttgccTTATGCCTAAAAATGGCTCttttagat gacgtcatcatttttcaggATACGGTTAAGCTTTTGGTTCACACAGTTCT AAAGGCTGTCGATTCGTATATTCTGTAGTAAAATCTTAGTAATAATAAGC TAAACTAGTATGATTGACAAAAGAatttgtcattttgtcaattTCCCATA TTCCTTTAGGTCTTGCCGCTGGAGAACGAGATGCAGAAGCCAGAAGATTT TGGATGGGTATTGAACGTTGGCATGGGAATCATTTCCTGCATGTTTGTTT CCATGGGGCTGCTAGGATACGTTGCTTTTGGTGACAAAATAGAAGGATCT GTCAGTTTGAATTTACCAGATAATTAGTAAGgatagtttttcttttcatc gcttttttcctgtgagttcctattttctttgtgcgtggtaaaccttttcG AAATTTATAATATATTCAATCCGGTGTTGGTATAAAAACTACGCGGGTAC TCGCTTTTGATAGGAATAAATAACATTTCCCACTCATGAGATCTCTTTTA GTCTCTTCAGGGCTATAAATTCAATTCTCTCATCtttattttctctattt tttctttattcagttTATATGATGGTGTCAAAATCTGTTACGCCATAGCA ATGTTTCTAACGTATTTCCTGCAGTTTTATGTACCCATTAATATTCTGTT ACCACCACTATTAAATAAATGGCAGAAAAGACATGGTTCATGTTTCGAAT ACACTTTTCGAACAGTTCTCGTGCTGTTTACAGGTATGTACCatgatttt attttcgtttttttttttttgctacttggtttttttttcattcaaaaaca ttattaatagcaatgcccactatcaagcatgttcaaactttcattaaaat tgatttttgaagccggaactatttaaaaatcgctggataacaacctattt tcgccggaaagacagtatttcttgaattgcTCGAGCTgtacttcatattt ttttattaaattttgcacactgatgtaaaatgacaatacctaaaaagtga tggagctcgattttcgaaaacatttttttccggccgaaaatgccggaaat atgccggaaaaactgtttttttgggattttctcgagattttatcattagt tttttctgattttttgctcagaaatgcgtattaacaatgcccaaaacatg gccgagtccgatttttgagaaaaatttttttccggccgaaaatgccggaa atcgccgttttctggattttcattggactcttttcttaaaaaaaaaaaaa aacattattaattacaatgcccaccatcaagcatgttttaatttttgaag ccggaactattgactgactgatttttttcatttttcttctcgcattgcta tctaactttcatcatcaggtaggtccattcagcatgttgcttgttttttt tttgttttttctttaatcaTCCGgtatcaaaacttttcccttGCACCCAA TTATGATGTTGTTTAAATTAATTCTATGATTAATCTTGtccatttttaat ttcgcttagcgaaagtattacgatagcctttctgcggcggtgtcatcgga aaaaaaattagaaaacgaaagtactcgaaaCGGTGGATGAACTCACTAAG TTTAATTTAAAGTTGCACGTGCACGCTCCGTTTAACCACGgcaattttcg cgggttttttaaagattacgtcatatcTTTCATATTAGCTCATACTAGTT CGGTATTGTGGAGGTAATGAGATGATCAGGTTCATTCTCTCTATTGTGTC ATTAGCTCCACAGTCTGACGCGTAAGGCACCATACTTCTGGAAGGCAAGg aggaatttcatttttagaagcGTTTGCAGGTTTGCATCCATCGATTTTTA GCAAATTCATTGTGTTTACACTTCTTCTCAAAGCAAAAATTATTAACTCA AAAGAAATAGTAAGTATATAGACTTTCAACTTTGCTTTTCCAGTTCCACA TAGAGTTATTTTTCTAGTGGATCTGTTTAAAGCACCTTTTTTGCCCCTTC ACCTAAAAAGTGATTGAggcgtcttttctttttttttgccactttttttc agattcatcATTCACTGCACTGAATCTGATTGTGGttttttttCCCGCCC TTCAGATTCAAGGTCGAGACTCACCTGTGAATCTGATTGCGGCAACCCGT GGCCAGGACAGGTGTGGATTCTGTGCCTGCGACCGATCGAGCTTGTGCGT ATCGACAGCTCATAAAGAATTCAACTGCGTTGTCAGTTAAGAAATACACA AAGCTGCGTTGTcagctcaaaaataattcaacTGCGTTGTCAGTTATCAA ATACATAAAGCTGCATTGTCAGCAATTATTAGTATATATTTAATTTATCC TCAcaagaatattttattttaccaGATATACTTTGTCATATATTTAGTTA GAGTTAGTTTTTCTATCTGTGACTGTACTCTGTACTTAATTGAAGATGAT ATCTGTTGCATTATATCGTGCACGCATAGGAAGTTTTGCTTTTACAGCTC AGAGAAACGTTAAATGTGTCGCTAAATCTATTATTGTTGGTTCCGACCTT TCCAATAATGCattctcaaaactttttaaacctGTACGTTTCATAGCACT TTTTACCCTCCTATGTTTTGCAATTCCAAAATCGTTTGAGCTAACAGAGC TTTACACACCTCTAGAATTTCtcaatctttcaagaaatgGAATTTTCGTT CAATATCCCAATGTAGCGGGAGATCCAAACcttacttttttcaaagttaA TTACACACTCTTATTATCAGGCGATGTAGAACTTAACCCAGGCCCAACTG TTCAAGGTTCATTTCACCAGGGCAACAGTAAATTTGGCAAGACGGCAGGT ATACAATGTtcctcaaattgtttttttgctatttgctATGCTTAGTTGAG AAAATTATCGCTATGGAAGACTCATGATTTGGATTATGTTTTAGATCAAG gcgatttgaatttcaaaaagttggGAATCACAGGACAGTCTCCATTTGTT GAAGAGTTTTCTAAGACAATTGACATAGGGGGTAGCACTTGTGCAttgaa tttcaacatttttgaaggctATTTTGAGACTGGTAATATTTCAGTAAATT TTGTTCAGGAGGAACTCTTATTACAACATTCTGGTGCAGTATTAGTGATA GCTGGAAATTGCTTAGCTGTGATGCActataacaaaaattactttttttt tgactcgcATAGCAGAGACTCCGAAGGCCATCAAGTTGAAGGCAGTATTG GAACTtcagttcttttaaaatttgacaacTTACAAGAAATTAAACAGTAT ATAAGATCTGagtataagaacataaatctTTTCAATATCATTTATCTCAA AACTGATTTTCATGATCAGGAAAAGTAAATAGTATGTGTCAAGGCAAGTA tcacgcagacaaaaaaattgttcacAAAAGAGATCAGTTGAAAAGATTAA AGGTACTGATCAATATAAAGATTTATTGGAAAAACAAAACGCTGCTCAGA AAAGGTCACGTGAAAAAATCCAAGGTACGGATAAGCATGAACAGGTAAAG AAGAACAAACGTAAGCATCGGGAATTaaataaaggatcagaaaaacatga gcaagaaaaagaattaaaacGTGTACGTCGGGCATTGaataaaggatcag aaaaaaCATGTGCAAGAAAAGGAAGCAAAGCGCCAAAgctgcaaaaatct gcttatattatcaacaaaaaacttgatttaGGAAAAAGGGTTGACAACTT CAGGCAGAAAAAACATGAGGGCCCTTCCTACATCTGTGTAATGTGTAACC GGTGTATGTTTAAAAAATCAGTGTTTGGTTTTGATGAACAAAAGTTCTCA TTGATCaactttgaagaaatagaaaattttaatcctACAACCTCGTTTGA TGGTAATTTCTACGTATGCACAACCTGTCATAGAAAATTAATGAAGGGAG AAATCCCATGCCAGTCTGTTTCTaacaaacttcaaattttttatctccCA GATCATCTAAGTGATATAAGAAAATTGGAAAGAATTTTAGTGgctcaaag aattttattttcaaaagtcatgATCATGCGTAAAGGTGAATTCCCCAAAT TGCAAGGTGCAATATGCAATGTTCCTATTGAAACACCAGGTGTATGTAAA GTACTTCCTAGAGGAAGTGATAGTAGTGGTGTAATAAATGttgaattaaa aaggaaaatatgctACAAAAACCCTGTTATTTCGCAGCAAGTAAGAcgac aaaaaatttttgaaactttggactttttagtgaataataatccttTGTAT CATGATATACATATTGATATGTCAATCATCGACCAAGTAACTAATGATGA ATATGTTGAAAGGGTTTTATCAAATAATGATTCCGTATCAAGCGCTTCTT CCAATGATATAAGATTTGTAGATGATACAACAGTTACTTTAATTAAGCCT TTTGAAGAGCAATTAGAGAATGAATTTGATTCTGATGATCCACTCAGTGC GTATCGGACACCACATGTGAACAGTTATTGTATCAGAAGTGCCAAACTTA ttttagatgatgaaaatgcaattttagctcCAGGTGAAGGTCAAACCCCC AATTCATTAACACAAGATGAGTTCTGTGAAGAGCTAGCCCATCCTCATCT TTTTTCCTACTGGGAAATTTGGTTATAACGTAGAGCGAGATATAAAATTG TCGCCCAACAAAGTACTTTAATCAGCGTCTTTTAAATTACACTCAAAGTT TGCTTCGGATTcagattacatttttttttgctcacaaaactTTATCCAGC TTAACCTTAGAAGTAAGATCAATATCgcaatgagaatttcaaattccaAC TTGACTGCGGGATTATTAGCAAATAATTTTAATGAGACAATCAAAAATTT GTAGCATCTGATAATGCATACAGTTTATGAGTACTATTAAAGGAACCCCT GCATACTGGCAACATATGTATCTGATGTTCTTGCAATGGTAAACAACTTG GTGTCCGACATACTTTATGACTCTCTCTTGTGCAGATTTACGGTGGGAGG AATTTGTTACCATTATCAGACAATTAAGCGGGGATGCTGATACTGATCAT GAACTCCTTGATTACCAATCTAGATGTGCCCTAATTAATAGCAAATCCTA TTGTGCTTGTGCGTCAATATCAATTAGAAAAGAGTTGGTTTTTCAAAGAG AAATAATGGATGGCCAACTTGGAAAATTACATACTATGCTCTCAGAGTAG AATTTACTTTCAGGGGGTAGTCCACATGATCATTGTTTGCTTTGGGCTAA AGATGTCCCAAAACTTGAagatggaaaagaaaagtatattgAACACATAG ATAGTGTTATTTCTGCTAATGTTCCTGATAGGGAAGAAAGTCCCGAATTA tggaatttagtcactaagtATCAAATACACTCCCATTCAAGAACGTGTAG TAAATATCGCAAAATGAATGCCGATTTcatttggaaaacttttctgCAAG CGTACTATTTTGTCTGAACCGCTCCCTGAAGGGTTACCTGAAACTGAAAA ACATGATATTTTGGTTGCTAGAAATATGTGATCCAAACTGTTTCAAGAGT ATATAGATACAAATTTGCATcctaaaaagagaaacattCTGGATCCTGAT AAGCCTGAGTATATGAAATTGGATCTATTGATACAATTTTGGATTCTTTA GGGTTAAATATGAAACATATGATATTACTTATCAATCTCACCAGACAAAG ATCAGCATTTGTTCTAAAACGTGACCATATTCTTGTTTGTCAACAATTAT TTTCAGGCCTCTAGCATGGGAGGCCAATATCGATATTCGCCAGTTTTTAA TGCATACAAGGCAGTTACATACATGTgtgcctatttttcaaaaagtgaga TAAGTGTTCAACTGCAATGCAAGAAGCATTAAAAAAGGccaaagattcaa atgacagtcagtttgagaaaaaaggtCTAAAATTGCAAGTTTACAACTCT AATAGAGACTGCTCAATCCAGGAAGCGTTTACTTAACAATGCCTGAACTG TGGCTTAGAAAAGCCTTTCCTgctatttcattttttaacacTAACTACCT GATCAAGGTACAGGATTTTCCGTCAAAAAGAAATGCGGAATTGCCTGCGG ATTCTGATgatcttttcaaacgaaatatgTTAAACAGATATATTGACCGC CCAAACACAGGGCAATTCAATACTATGTGTTATGCCCCTTCTGTGCAAAT ACATTagacacaaaaaaaaatacaaatgatgGAAATGGTTGGCGCCTACT GTACTAGATGATTCAACAAGTGCAGTGAATCATCAAGAACCCCAAAACCT TCCGAAatcagccaaattactcaacagTTAAGAAAAACTTAAGCTCGAAA GTTCCAAAAGTTTGAGGGTACTACACCCTAACAAAAACAACATCCCGAAA AATTTTCCCCCATATTCTAATGTTGTTTACCCATTTCGATCAACGAGAAT GATTTGAAACTTGATGGTTCCTATGTGCTGAAGCTCAATTTAGATGAAGT TCAAGAGTTGTTAACGAGACAAGCAATTCTTTGAACCTGATGGTCCTTGT TGATTTAGTACTTCAAAACTATCTAATGCCCTTATGCATAATCAAGATGC CTTTGCTCAACAAGAAAATGCTGAAGTGCAAGACCTAATGAGCAAACTCa tccagtgaaaatgatgatgaaagtcatgaaatcgaacaaaatttgcCCAT TTACTCAAACAGTTCATGGCTTGCAAACTGATGACCAATCAATACCCATA TAAGATCTTTAAATTCTATCAAGAGATAGTTTGATCTAGTTACTAAATGG GGAAAAATGTATGNTATGGCACCTATTCAAACTAGCTGAATTAGATGAGA TTATGCGTCAAAAGGATGACTCTGACTTCATTGATCTCTTGAACAATGTA AGAGTAGGTGAATTGAATAGTAATGATGAAAGTATGATTAAATCTAGACT GATAACACGAGAGCACCCTGATTATCCAATAGAATCATTGCATTTGTTTG CAGAAAATGCTTCAGTCCATCTTCACAATATTCAAAGATTAGATACTCTG CCCTCGGAAACATAAATAAATGTAGAAGCTATGGACGTTTATCCAAGGGG TTTTACTGAATCTCAAATTACCAAGGTTAAGAACCTGCCACTTAACGATA CAGGTGGCTTATCAGttctatttgatttgaaaatagggGCAAGAGTAATG CTAATTAGTAATATTGATATAGAGGATAGGTTGATCAATGGTCAACTTGG AACCGTCACTGACGtaaaaattcagaaacaataaAGCAGAGCTAATTTAT GTTAAACTAGACGATAAGACGGCTGGAATAAAAGCTCAAAGTAAAGACCA ATATGCTAAGGCCACTGAAACTGTTCCCATTGAAAAGAGTGAGgtgaatt ttccctttgacaaaaaaaacccaTACACTTCACCTATCATTTCTCGGACA CAATTTCCTCTTAAGCTAGCTTATGCTTGTACAGTGCACAAAGTTCAAGG ATTGACTTTGGATTCAGTAGTCGTTAGTTTTGACCTTGCAAGGCAAAGAA AGTTCAATGCTGGTCAAATGTATGTTGCAATGAGcagagtgaaaaattta aatggtttgtaCTTTACTGGTCAATATCGACGTAGTGCTTTTGTCTGTAG TGATAAAGTTAGTGAAGAATACACACGATTGCGTCAGAACAAAGTTGAAA GAGTTGCAGATATTATGAGGTGCAGTTCTAATTTAAATGTTTGCCTATTG AATGTAAGATCTTTAAAACGACATGCAGTTGATATTCAAaaggacagatt tttgtatgaaaatgatttgttatgTTTGACAGAGACACAGATGAGTTATG AGCATTCTGAGGAAGACAAACAAAGTATTCATGAAAAGCTTCCTTATTAT ATTCTTAGTCATAATATTGACCAGCATAAATTCAACAGTGTTACTGTCTG TCATTCTCCTTCTTTTATTGACATTGATGAGTATGATCATTCATCATGCT TTTCtcttgtaaaatttagaaaagctgaatttactgaaaaggaattttgt gttttggttctctataaaagttcaagaattCAACGTGATGTGTTCTGTTA CAATCTTGCtcaatttattgaaagataCACAATTGATATCATTTTAGGAG ACTTCAACATGGACGGCTTTGAAATGGAGCATGATCAATTGTTGGCTGAC ATTCTCAAAGATTATGATTTAGTTCCGAACTTTCCAACACATATCGATGG GAAAATGCTTGATCAAATTTGGACACATAAGGAATTGGGGCACGAGTATG GTATTGAAGTTATTCGTAAATGTGTGAACTTATCCGATCATGATGGAATC AAATTATCGCTGACTTTGCTATCTTAGAATACCCGTCAGAGGCGATTCCC GGCGggacaaggggggggggggtggaaactGGGGTGGGGTGGATGGATGA TCTCAACTTTCTGATGATTAGTTTTGAGTGGTCAAAATTGcaggaagtaa aaaaaattatctcaaatAAAAAGGGTATAGTATCCCTTTTCTCCTATAGC AAATTCTACCTAACTTAAAAATTCATCATCAGAAAATTAGCCAACGATTT AGAAACATTTGCTTATGTTGTCATAGGTGCTTCTTTATGAACAGTTTGAA TtgatcaaaggaaattttttgtgatagaTTGAGTAAACTAGGAATACTCT TTAAAGCAATGATGTTATCGAAAATCTGTTAATATGATATCAGTCTGTAT CAGTACAGGTTTGATTCTGGATAAAATGAACTTTGTAATTAAGGATTGAA GCTTAACTTTGTTGGAAATATGCAATTAAGGTCATCCCACCACCCCGTCC ATTCTTATGTAAGTTTTCTGACGTTTAAAGACTATTCTTAAAAGACATTT ATTCTTTGGGGAGGAAGGCTTTTTTCTGCATTAACCAAAAGGAGGGCTCT GTTGAATTTGACATTTGCAGATGAAGTTGGGGAGGGTGTGAGAAATGGGT CAAATATGTgtgagtgtcttttatggatggTCTATGGTAGaaaaaaaTCT ATAGACAAAGGACAATTAGTTTAAAGATGCCtttcattaattcatttttg attactatCTCGTCAGGAAACTTACATACCTATGGATATGGCatttaatg tattattttatttattgtattatttattcctatttttatattatttattc ctattttttatatttatcatttttcttctgtttttcataattattagatt tttttaaattattatattcaaaacaaagtaatatttctaccattttttaa taggtttttgttaattgttttattattttcttgtattctttttgttattc atttgcctactcaaaaatcaaaaagactgtcacagagtttaaaaaataga caatatggaaaaatatggaatgaaaaaatatggaagTGCATTGCAAGTGA ATTGATTCATCTATATATGTATGCATTTTGGTTGATATTATAAGGATAAT TATGGAAACGTTGAATAGTGGTATAAGTGgatatatatttatattttggA ATTATTACAATTGATGTAATCGCTTATCCTAATGCAGCTTAAATTCattg aatctcaaaatatcctaaatcgtcgtcattttcagtctttattaacaaag agtcgaatggcttcgaaaattttcattacaatcaCCAACATTCGATACAA TCGCCAACATCGATACTGCAAAATATGCGCTTAAAGTCATTGTATCATAA TCGTTTCATCCGATTTTCACAATATGCTGTATTTGCTCATaggaaacata aaattttatgattttcagcaTTTCTATAGTAAATCAACTGTCACACTCAA CCACCAACCGACCATTGttaatacaaaaataacaattcttATCGCGATTT CCATGATTCCACTGTGACTTCTTCGACGTACGTATCCAGACTTAACCTCA ATCTTCGAAATATCTGGTGATTTGTtcctgttggaaaaaaaaaaacgttt tggtatgtaaactttgtatggtttgattactcgaaatgtgacatttatgt aaacgaaacactgaaaactaatttttattattttggaagccggaaatcca ccggatgtgaaaaaaagccaaatttgcacaatacttttaaatttgtaaat tgCTAGCTATTTTCTATGAACTATGTACCAACAAATTTTTGGAATACGAA TActtggaaatataatttttagattcatgAAATCCAAACTCAAGTTACCC GTTTTTGCCCCTGTACCAACCTGTATTTTCCTGTtcatttaaaaacgaaa gcagaTTTTCGGCTAGAATGAAAGAACTTTTCTACGAATTGCTTGGAATC TCGAATCTTgtcttttcaagttcaaaatattggatattttcgaccggaaa tTACGTAAAATTTTAGCTTGCTTTTCGATCTAAACTCACTCAATATAGGT TTATCTTATTAATTTTCCGCATTCctcttcaagttttaattgtgtGTATT GTTCTCCAAGAATTTTAATGTTCTTTTATTCTTCGTCTTATttaaggcga aattttcgacttctagtcgtcttgtatattttattttagcTGCTCTTGCT GCCGGTATTCCATTATTGGACGATTTCATCGCACTTATCGGTGCTCTCGC CAGCGCTGGTCTGGCCATCATATTTCCACCTCTTATTCATACATTAACAT TCTGGCACCATGGACTTCATCCGATGGCATTTgttaaaaatctcattttg aTATGTATCGGTGTATTGGGTTTTGCTCTGGGAACTTTCGAATCAATTAT GACCATTGTTACAGACTTTCATAAGAGAACTCCCAAACATGTACACGTTA ATCAAACACTTATTAATGGAACCATGGGGTTCACACACCACCCGTTATTC AAAACACACCCTATAGTTTAACCATGCAATTATGCATGGTATATAATATG AATGGTTCCCACTGCCAAAAAGACTGGAATAATAAGCTTGGGGACTAATA TATACACGTACTTCTCCTTCGATGGGTTTTCCTCGACTGTTGCCGCCACT GTGACAAGCTAACATATCAAAAAATGCTGGGCTAGGGTTGGGATAATATG ACAACCACATGTTTTTCGGAACAAAAAATGCCAAACCTAAAACCAAAATC ACAAAGTTTGGAATCGTCTTTAATTGGCCATGAAAACACAGACTTAGGAA ATGTTTTCATGTCATGCTCTATCGACGGAGTAATACGTGTAAAAGTCCCG CACTGATCTTTCTTAtgaattaatttattttttattgttaaatttACACA TTCCATTTGACAATGCTGACTATGTTTCTTGTGGTAGATAGTATTGCTGA TTGTTTCAACATTTAATCTTTGTGAGGGATTTGAAAATACGAAACTGCAT GCAATAGAAAGTTTTCTGTGGTTAACTTTGGTATAAattatctttatctt ttttatgaaaagtattTGTCGATCTTATTAAAGCTGATACTAAACGCTCT TTGTTACAAATCAAAGCTTTCCTCCAGAAAAGCATTTAATTAAATGCTAT CGTCTATACTTTCGTATGCAAGATGTCTGGAAAATATTAAGTCCTTGAGA TCATTCAAGAAAGATTTCGGTTTATTGTAACCAACAGTTAAGGCTCCTCA CTTTTCCGAACACACTGTATATTACGAAACCAGTTGGCACAATTACTGTT TGACACGCtaatattttatacattaaattttcaaaataatatagtttttt aaatcaggatatttgcatttttGTTAATTATGATATAGCTTTCAAAGTTt attagaaaaaag

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000069_pilon:1052470..1070431+

>MSTRG.10122.4.p2 ID=MSTRG.10122.4.p2|Name=MSTRG.10122.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1944bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:1052470..1070431+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAGAAGCCAGAAGATTTTGGATGGGTATTGAACGTTGGCATGGGAAT
CATTTCCTGCATGTTTGTTTCCATGGGGCTGCTAGGATACGTTGCTTTTG
GTGACAAAATAGAAGGATCTGTCAGTTTGAATTTACCAGATAATTAttTA
TATGATGGTGTCAAAATCTGTTACGCCATAGCAATGTTTCTAACGTATTT
CCTGCAGTTTTATGTACCCATTAATATTCTGTTACCACCACTATTAAATA
AATGGCAGAAAAGACATGGTTCATGTTTCGAATACACTTTTCGAACAGTT
CTCGTGCTGTTTACAGcTGCTCTTGCTGCCGGTATTCCATTATTGGACGA
TTTCATCGCACTTATCGGTGCTCTCGCCAGCGCTGGTCTGGCCATCATAT
TTCCACCTCTTATTCATACATTAACATTCTGGCACCATGGACTTCATCCG
ATGGCATTTgttaaaaatctcattttgaTATGTATCGGTGTATTGGGTTT
TGCTCTGGGAACTTTCGAATCAATTATGACCATTGTTACAGACTTTCATA
AGAGAACTCCCAAACATGTACACGTTAATCAAACACTTATTAATGGAACC
ATGGGGTTCACACACCACCCGTTATTCAAAACACACCCTATAGTTTAAAT
GCAGAAGCCAGAAGATTTTGGATGGGTATTGAACGTTGGCATGGGAATCA
TTTCCTGCATGTTTGTTTCCATGGGGCTGCTAGGATACGTTGCTTTTGGT
GACAAAATAGAAGGATCTGTCAGTTTGAATTTACCAGATAATTAttTATA
TGATGGTGTCAAAATCTGTTACGCCATAGCAATGTTTCTAACGTATTTCC
TGCAGTTTTATGTACCCATTAATATTCTGTTACCACCACTATTAAATAAA
TGGCAGAAAAGACATGGTTCATGTTTCGAATACACTTTTCGAACAGTTCT
CGTGCTGTTTACAGcTGCTCTTGCTGCCGGTATTCCATTATTGGACGATT
TCATCGCACTTATCGGTGCTCTCGCCAGCGCTGGTCTGGCCATCATATTT
CCACCTCTTATTCATACATTAACATTCTGGCACCATGGACTTCATCCGAT
GGCATTTgttaaaaatctcattttgaTATGTATCGGTGTATTGGGTTTTG
CTCTGGGAACTTTCGAATCAATTATGACCATTGTTACAGACTTTCATAAG
AGAACTCCCAAACATGTACACGTTAATCAAACACTTATTAATGGAACCAT
GGGGTTCACACACCACCCGTTATTCAAAACACACCCTATAGTTTAAATGC
AGAAGCCAGAAGATTTTGGATGGGTATTGAACGTTGGCATGGGAATCATT
TCCTGCATGTTTGTTTCCATGGGGCTGCTAGGATACGTTGCTTTTGGTGA
CAAAATAGAAGGATCTGTCAGTTTGAATTTACCAGATAATTAttTATATG
ATGGTGTCAAAATCTGTTACGCCATAGCAATGTTTCTAACGTATTTCCTG
CAGTTTTATGTACCCATTAATATTCTGTTACCACCACTATTAAATAAATG
GCAGAAAAGACATGGTTCATGTTTCGAATACACTTTTCGAACAGTTCTCG
TGCTGTTTACAGcTGCTCTTGCTGCCGGTATTCCATTATTGGACGATTTC
ATCGCACTTATCGGTGCTCTCGCCAGCGCTGGTCTGGCCATCATATTTCC
ACCTCTTATTCATACATTAACATTCTGGCACCATGGACTTCATCCGATGG
CATTTgttaaaaatctcattttgaTATGTATCGGTGTATTGGGTTTTGCT
CTGGGAACTTTCGAATCAATTATGACCATTGTTACAGACTTTCATAAGAG
AACTCCCAAACATGTACACGTTAATCAAACACTTATTAATGGAACCATGG
GGTTCACACACCACCCGTTATTCAAAACACACCCTATAGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10122MSTRG.10122Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10122.4.p2.exon1MSTRG.10122.4.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p2.exon2MSTRG.10122.4.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p2.exon3MSTRG.10122.4.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p2.exon4MSTRG.10122.4.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p2.exon5MSTRG.10122.4.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p2.exon6MSTRG.10122.4.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p2.exon7MSTRG.10122.4.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10122.4.p2MSTRG.10122.4.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000069_pilongenomesc0000069_pilon:1052470..1070431 +