MSTRG.10122.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10122.4.p1
Unique NameMSTRG.10122.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:1052470..1070431+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.10122.4.p1 ID=MSTRG.10122.4.p1|Name=MSTRG.10122.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17962bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:1052470..1070431+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATGGTTCCCACTGCCAAAAAGACTGGAATAATAAGCTTGGGGACTAATA TATACACGTACTTCTCCTTCGATGGGTTTTCCTCGACTGTTGCCGCCACT GTGACAAGCTAACATATCAAAAAATGCTGGGCTAGGGTTGGGATAATATG ACAACCACATGTTTTTCGGAACAAAAAATGCCAAACCTAAAACCAAAATC ACAAAGTTTGGAATCGTCTTTAATTGGCCATGAAAACACAGACTTAGGAA ATGTTTTCATGTCATGCTCTATCGACGGAGTAATACGTGTAAAAGTCCCG CACTGATCTTTCTTAtgaattaatttattttttattgttaaatttACACA TTCCATTTGACAATGCTGACTATGTTTCTTGTGGTAGATAGTATTGCTGA TTGTTTCAACATTTAATCTTTGTGAGGGATTTGAAAATACGAAACTGCAT GCAATAGAAAGTTTTCTGTGGTTAACTTTGGTATAAattatctttatctt ttttatgaaaagtattTGTCGATCTTATTAAAGCTGATACTAAACGCTCT TTGTTACAAATCAAAGCTTTCCTCCAGAAAAGCATTTAATTAAATGCTAT CGTCTATACTTTCGTATGCAAGATGTCTGGAAAATATTAAGTCCTTGAGA TCATTCAAGAAAGATTTCGGTTTATTGTAACCAACAGTTAAGGCTCCTCA CTTTTCCGAACACACTGTATATTACGAAACCAGTTGGCACAATTACTGTT TGACACGCtaatattttatacattaaattttcaaaataatatagtttttt aaatcaggatatttgcatttttGTTAATTATGATATAGCTTTCAAAGTTt attagaaaaaag

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000069_pilon:1052470..1070431+

>MSTRG.10122.4.p1 ID=MSTRG.10122.4.p1|Name=MSTRG.10122.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3420bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:1052470..1070431+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATCGCTATATCAAAGATCTCAGTATAGTATCGTCTTTTTCTGATTT
AAAAAGGAAACAACAACAAACGACATTCATCAAAGCTATGTACTCAAATG
AGAAAGACTCGTTACTGAAGAATGATAGTAGTCAATCGTACAGTAGCAGT
GATGAGACCCCGGGAACAGTCAACCGACACACACCATCGTTGAATGGTGA
TGATGGCAAAGAACACTTTGTTGGTATTGATGATATTGGAGATtatgaag
aagatgaagataaAGGAGAAGATCATCCATTGACAGTATCAGTGAAATCT
TCAGGATCTGGTAGAAGTCGTACAGCTGTATCAGGTGGTCTGGATACTGG
GGAAAAGGGTACCTCTAATTTGGCAACAATGGTTCACATTTTCAAAGGGA
ATGTTGGTACTGGCATCTTAAGTTTACCAGCAGCTGTCAAACATGCAGGG
GTGGTTGCTGGACCCGTCGGATTGTGTATCATTGCTTTCATAGCAGTACA
TTGTATGCACATGTTGGTCAGGTGTTCCCATTTCTTTTGTAGAAAAACTG
GCAAACAAGCTATGTCTTATGGTGAAGTTGCAGAAGAATGCTCCAAAGGA
ATATTCAAGGATAAAGCATATTGGCCAAAGTCTTGCCGCTGGAGAACGAG
ATGCAGAAGCCAGAAGATTTTGGATGGGTATTGAATGGATCGCTATATCA
AAGATCTCAGTATAGTATCGTCTTTTTCTGATTTAAAAAGGAAACAACAA
CAAACGACATTCATCAAAGCTATGTACTCAAATGAGAAAGACTCGTTACT
GAAGAATGATAGTAGTCAATCGTACAGTAGCAGTGATGAGACCCCGGGAA
CAGTCAACCGACACACACCATCGTTGAATGGTGATGATGGCAAAGAACAC
TTTGTTGGTATTGATGATATTGGAGATtatgaagaagatgaagataaAGG
AGAAGATCATCCATTGACAGTATCAGTGAAATCTTCAGGATCTGGTAGAA
GTCGTACAGCTGTATCAGGTGGTCTGGATACTGGGGAAAAGGGTACCTCT
AATTTGGCAACAATGGTTCACATTTTCAAAGGGAATGTTGGTACTGGCAT
CTTAAGTTTACCAGCAGCTGTCAAACATGCAGGGGTGGTTGCTGGACCCG
TCGGATTGTGTATCATTGCTTTCATAGCAGTACATTGTATGCACATGTTG
GTCAGGTGTTCCCATTTCTTTTGTAGAAAAACTGGCAAACAAGCTATGTC
TTATGGTGAAGTTGCAGAAGAATGCTCCAAAGGAATATTCAAGGATAAAG
CATATTGGCCAAAGTCTTGCCGCTGGAGAACGAGATGCAGAAGCCAGAAG
ATTTTGGATGGGTATTGAATGGATCGCTATATCAAAGATCTCAGTATAGT
ATCGTCTTTTTCTGATTTAAAAAGGAAACAACAACAAACGACATTCATCA
AAGCTATGTACTCAAATGAGAAAGACTCGTTACTGAAGAATGATAGTAGT
CAATCGTACAGTAGCAGTGATGAGACCCCGGGAACAGTCAACCGACACAC
ACCATCGTTGAATGGTGATGATGGCAAAGAACACTTTGTTGGTATTGATG
ATATTGGAGATtatgaagaagatgaagataaAGGAGAAGATCATCCATTG
ACAGTATCAGTGAAATCTTCAGGATCTGGTAGAAGTCGTACAGCTGTATC
AGGTGGTCTGGATACTGGGGAAAAGGGTACCTCTAATTTGGCAACAATGG
TTCACATTTTCAAAGGGAATGTTGGTACTGGCATCTTAAGTTTACCAGCA
GCTGTCAAACATGCAGGGGTGGTTGCTGGACCCGTCGGATTGTGTATCAT
TGCTTTCATAGCAGTACATTGTATGCACATGTTGGTCAGGTGTTCCCATT
TCTTTTGTAGAAAAACTGGCAAACAAGCTATGTCTTATGGTGAAGTTGCA
GAAGAATGCTCCAAAGGAATATTCAAGGATAAAGCATATTGGCCAAAGTC
TTGCCGCTGGAGAACGAGATGCAGAAGCCAGAAGATTTTGGATGGGTATT
GAATGGATCGCTATATCAAAGATCTCAGTATAGTATCGTCTTTTTCTGAT
TTAAAAAGGAAACAACAACAAACGACATTCATCAAAGCTATGTACTCAAA
TGAGAAAGACTCGTTACTGAAGAATGATAGTAGTCAATCGTACAGTAGCA
GTGATGAGACCCCGGGAACAGTCAACCGACACACACCATCGTTGAATGGT
GATGATGGCAAAGAACACTTTGTTGGTATTGATGATATTGGAGATtatga
agaagatgaagataaAGGAGAAGATCATCCATTGACAGTATCAGTGAAAT
CTTCAGGATCTGGTAGAAGTCGTACAGCTGTATCAGGTGGTCTGGATACT
GGGGAAAAGGGTACCTCTAATTTGGCAACAATGGTTCACATTTTCAAAGG
GAATGTTGGTACTGGCATCTTAAGTTTACCAGCAGCTGTCAAACATGCAG
GGGTGGTTGCTGGACCCGTCGGATTGTGTATCATTGCTTTCATAGCAGTA
CATTGTATGCACATGTTGGTCAGGTGTTCCCATTTCTTTTGTAGAAAAAC
TGGCAAACAAGCTATGTCTTATGGTGAAGTTGCAGAAGAATGCTCCAAAG
GAATATTCAAGGATAAAGCATATTGGCCAAAGTCTTGCCGCTGGAGAACG
AGATGCAGAAGCCAGAAGATTTTGGATGGGTATTGAATGGATCGCTATAT
CAAAGATCTCAGTATAGTATCGTCTTTTTCTGATTTAAAAAGGAAACAAC
AACAAACGACATTCATCAAAGCTATGTACTCAAATGAGAAAGACTCGTTA
CTGAAGAATGATAGTAGTCAATCGTACAGTAGCAGTGATGAGACCCCGGG
AACAGTCAACCGACACACACCATCGTTGAATGGTGATGATGGCAAAGAAC
ACTTTGTTGGTATTGATGATATTGGAGATtatgaagaagatgaagataaA
GGAGAAGATCATCCATTGACAGTATCAGTGAAATCTTCAGGATCTGGTAG
AAGTCGTACAGCTGTATCAGGTGGTCTGGATACTGGGGAAAAGGGTACCT
CTAATTTGGCAACAATGGTTCACATTTTCAAAGGGAATGTTGGTACTGGC
ATCTTAAGTTTACCAGCAGCTGTCAAACATGCAGGGGTGGTTGCTGGACC
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TGGTCAGGTGTTCCCATTTCTTTTGTAGAAAAACTGGCAAACAAGCTATG
TCTTATGGTGAAGTTGCAGAAGAATGCTCCAAAGGAATATTCAAGGATAA
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AGATTTTGGATGGGTATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10122MSTRG.10122Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10122.4.p1MSTRG.10122.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10122.4.p1.exon1MSTRG.10122.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p1.exon2MSTRG.10122.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p1.exon3MSTRG.10122.4.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p1.exon4MSTRG.10122.4.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p1.exon5MSTRG.10122.4.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p1.exon6MSTRG.10122.4.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10122.4.p1.exon7MSTRG.10122.4.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000069_pilongenomesc0000069_pilon:1052470..1070431 +