MSTRG.10090.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10090.2.p1
Unique NameMSTRG.10090.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:653177..676558-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10090.2.p1 ID=MSTRG.10090.2.p1|Name=MSTRG.10090.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23382bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:653177..676558- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTTCGCTTCTAACGTGCATGGCATGGAGATATGGAGAAAGAGAAGAAGA ATAATTTTCAATTTTCAAAGAATTTACAACAGCAATATTATGGGCAATCA GGTATTCTTTAATCAAGCTTCCTCAAGTTACTATATGTATCCCATTGAGA AAGAGTAGAGTGAAAGTTACAGGCGTGAAACTTGAAAACCTTAAGTTTTA CGTTTCATTTTGCGCAACAACGAATTGAATATCATTATTTCTATCGTGTT CTAGTGGTACATCTCTAGCAGTTTTTTTGGTCCAACGCTGTGCTTAAAAA CGAAGGTACATCTTTGTCTTGTGGCATCAGAGTAGTGGCTTGCATGAGTC TAGTACCAATTAGGATGGAATTTATTCTCTTGATTTTTGTAGTCCGAAAT TCGGATTTCATTCTTTAGATGAACTTTGTTTGCTAATGTAGTTGAAAATA TCAACCCAATGTAGTTTTAACAATCGGGATGACATTAACATTAAGTTTAT TTTTTCTCTATAGGAGCAATATAACACATTTTTCATTGGTATGGGCTCCC AACAACAGGCCGTGACAACGGTCAAGCCTTACCTTAATAGTTTAGGTTTA ATTTTAGTCAAGCTGTATTTGAAAATATTTAACGGGATTCTAGTTCCTTG TGAAAGAACGAAGCTGTTGATGAAAGAGGTTCAAAAGTTGATTGTATTGG TCATTTTTGGTGGTTTGTTGAACTATTAGTTATTGGTTGGTTAGCAATTC TTTTGATGTTACCTATACATCACTCATTCGCTCACGTATTGGTTTTTATC TTAATCACTGGTGCGGTTTGCACTATAAATAGTGCAGATTCGTAAGACAT TTTCATTTTCTTAAAAACAAAAAAATATTTTCACATTCGTTTAAGACGTT TCATGTTCTGAAAGCGAAAAAATTCCCGCAAATCCTGCAAATTTTAAGCT 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ATGCCCCCGGAACCGTTTACGATAACACCAGCAACGTATGTAATAATGTC ACTTCTGACACCGATTGGTTTAATGGCAAACTTATTGATTATAATGACAG TGTTGCGAGCTAAGAAACTCAGAACAACTACTGGGTTCTTCATTTGTCAC CTCGCCATCGCCGATCTGTTATGTATCTTATCTATGATGGCATACGTGAT AGCCCATTCACAAATTGAACTGAAACAAAATTTTAATATTTTGATGATAT TCTCATCATTAGATGTTTTTATCGGTTCAGCTTCATTGCTACACGTGACA GCTGCTAGTGTGGAAAGAGCCATAGCTGTTGCAAAACCCATGGTGTACCC GTTGATATTGTGCAAAGAACGAGCCAAGAAGGTGATTCTACTTATATGGG TTTATTGCATCGTTTTATTTATCGCTTGTGTTGCTAGAGTATTCGTCAAA CCAATTATCTACAATTCAATCATATTTTACATAGCAGTTTGTTTAAGCTT CGGTGTACCGTGCATATTGGTATTAATTTCTTATCTGAACATCTCAATCA GAGCCTTACGGAATTTACAGATGGAGAAAAGAATTGAACGATCATTAATT ATTGTTTCCATGCTGAATGATACTCAAAGGAGAGCGCCGAGATATCATCA TCAGATACGCGAATTAAAGCTAGCTCTCAATTTGACCATTATGACAGCAC CGTTTGTTTTCGGTTGGGGATATTTCATGATCTGTAATGTTTATGAGGAA GTAACAAAGACTACATTGGATGGATTAAAAAATTGGTTCCTCAACATGTT ACCTTATCTTATCTCATGTTTAAACCCAATCACATATCTACTATTCACAA AGACTTTACGAAAGGAAGCTATTAAATTGGTACTGAAACCATTCAGTAAG TTCCGCTCACTACACCATCGACGCTTCTCATCGACATCGCTCATTTTTAC CTCACGTAATAGTAGCAGACACTCAGACTCGTCCGACGCTCGTATGATGC AAAGGGAGGTCTAAGCTTAAGCTAGATCCCATCATAACGATTAAGCTTTT GACTACTAAAGCTTTATCCGATGGTAGGAGGGATTGTATTGAGTGTATTG ACAAAAGAAGAAGCAACAGGTCATAGCAGGGACACTAATTAAGTAGATAA TAAAAACAATTATAATTCTTGTAAACATTCAGAAGTAATGGAACAAACAC ATTAAAACGGAATTAAAAATGACAAATATTTCAAATCCAAAGGGACGTAA ATTTGAAATAGGAACACGAACCAAAATTTAGAATGTAAAATATTTTTTTT CAACGTATATAAAAAGATTTAGAGCAATATAGCTACGGGAGATGTAAATA GAAAACATGTTTAAAACGACCATTTATCTTTGTAAAATATTATTATCCGT GTAAATTTTTGGCTGATAGTATAGAAAAATATCATATTTATTTGAGAATT AAAAGAAAACAACAAGAAAAGCTGCTTTAATTGATCAGTTTTTAATCCAT TTAATGCTTGGAACGCGTAAAATAATGCAGTGGGTCAAAGGACACGAGTC AAACATTGAGCTACTTATCTTCGGACAACTCAAACTAAATAATAAACGCT TTAGGCGACAATTTTATTGCCTTGAAAGAGAACTTATCAATTCCAGGTCT CAAAAATGTTTTCAATTCGGCGAGAAGTCAAACAAAAGTATTTTACTCTT ATATTAATTAGAATTTCTATTGTTTCACAAAGGGAAAACACATATTTATA TACTTTTGTGTTCTGCATGTCTTCTTTTTGAAAAATAGAAGTTACGCTCA AAATCCGAACAAGATTAATTACTTTGGAAAAGGAGGAAATAACATTTCTG GAATTCACAATTGCCTTTCGCATTGCGTTTGATAAGATTACGGACTGTCA GTTTTTTGCAAGCCTTTAATTTCAATTTGACTCGTCAACAAAAACAGAAT GAGCCTCCAACTACAAGAGAGTCGAAATACGGGCCATGTTTTCGAAGATA ATTAGTGGTTTTGAGGGATAACTACTTCCGTGTGAAGAAGGATGAAAGTT TGTTTTCAATCATAAGCTCGAGATCATAAGAAAATTCCAAAAGAATTTCA TAAGTTAACAATAGCTTTAAAAAGACCTTTGAATCGATAATTTAACGGTC CGTTTAGTGGTTGACCATAGAGTTTTGCAAATTGATGAGGACCTCATTTT AAAGCCTGATTGTAACTGTAAGCACCACCTTTTTCCACTCAAAAGTCGTT TGGACTTCCTTGCATTGTCAGCTAACAATCAGAACTCTTCCATATTTAAT TGTTTCTTTTTCAAAACAAAAAGCAATTTCCCGTAGCTAAAGAGACCACA AAATCAAAATATATGCAATTTACGGGAAGTAATTTATGGGTCGACATCAA TAGCCCCACCAAAACATTCGTGAGCTTCATTTAAATGATTTGTTAGGATA TCTAGTTTGTTCTTGAAAATATATTTTTGTGTGCAAAAATGTTAATTGTA AAAGATCAGCAGCGAGTTAATCACTTACATGAGTATAGCTGGTATTAGTA TAGTGCTGTTCGCAAAGGTTGTCAGGTTGGTTATAGTTAATTTTCAATAG ATTTTTGATCAATTTGCTATGACAGAAGAATTTTCATGGTTCTAGAAATA ACTGAGATCACCTAACTGAATTAAATATTACGTAAACGATAAATCAAAAC AGATTGATTTTTTAATCTTGGACAACCTTCGCTTTTACTTAATATATACT CATCATAGTTCTCCAATGAATAGAAACGATTTATCACTTTTCCGCAAATC TAATTTAATAAAGATCCCACACTCACTGACTAGCTGACGACCTATTTAGA GGTTATCAGACAAAGAAGTTACTATTTTAAGAAAGTTTCTATGGAAACAT GATAATCCAAGCTAAAGAATTCTTTTTTGAAAATAGACATCGAAAAATTC GGTTGAAGATTAAATGCTTGATGAATAAAGTCTTCTCTGTGCATAGATGC TTCATTTTTAATAAAACACCTTCAAAAACACCAGATAAAGAATTATCGAA CTTAAATCTTGAGACGAGGGATGTTTTATCCCAACTAACAATTTTAGCCA CGGTTAAACCTCCGTTATCACAATAGAAACAGAAATTTTAGCTCCACTGA TTCTTTTGCAATGAAATGACCGCAACAATCTTAAATCTTAATTCTGAGGG TATGGAAAATACTTACTGGAAAAGCATCATCAGAACAGCTTGGCTGTATA GTAACGACACTTCAGTATATTTTTTCCAAATCAATATAAAATGGTCGCAT ATATTCCCTGTGGGACGGTTAATTGACTAATCCATACCTACAATACAGAA AGATACACGATCAGCCTTCAAAGAGACGAAATAGGATGAATTTTATACTT GTTATCTAGCTCCCTAACTTTTTCCTTTTTCTCTAATGTACCGTTATCGT ACTTTCGTTGTAGGAAAAACAGAAAAGCAAGGCATATAGATAGTCATCTT CAAAGGGACATCAGATATCAAAGACAACAGAAAGTCCACTATCAACGTTA ACGAAAAGTTGAGTGGTGTGAGCGAAGATAAGACAAATTGAACAAAAAGA CGTGATCTACTGCGAGTACATTCATTCGATCGACATCAGTAGAACAAGAA GGGCATTGGGAAGCCTTACATCCCAACTATTGTTAAAATGAACGTGACTT CATGTAATGATATCATGAAAATGGTACAACCTTCCGGAACAGTGTCTGCA GATTTGATTCATGTCATCTTGCCAAATATTTGTGGTATAATTGACAGTAT TAATGCATCTATGGTGACATTCGAGGAGAGAATCTTTTACGATCATTGCT GTGACCCGATACCCTTTATGATCCTCAATAAGACTGTAAATATAAATAAT GAGACGCACCCAGAACAATTGATTAGTGACGTGTGTAATTATATGCACCA TAATCGAAACCAACAAGAAGAAGCTCTCTACCAAGAGATCTGTTTAAATT CTTCAACAAATAATTCTTCCGTTTTAAATCCAGCATGGCGACTATTGACA TTCATCATTCTATCCTTGCTTTCACCGATCGGCTTCTTTGCTAACGTTTT GATCCTTATGACCGTATACAAAATCAAACATCTTCGCAATACCACTGGTT ACTTCATCTGCAATCTGGCTGTTTCTGATCTTCTGGTTATCTTTCAGATG CTACTATTTGTGACCATGTATACGTCTGGTGCAATGTCAGAGGCGAGCCC ACGAGTTCAAAGCTTTTTCTTTCCAACAATCGATGTCGTTATTGGTTCAG CTTCGTTGCTACATGTAACAGCAGTGACTATGGAAAGAGGCATAGCTGTA TCAATGCCTTTGAGATATCCAAGGTACCTTAATGAACGAACAGCGAATCG TACCATTGTTGGAATCTGGATTTATTGTTTGGTGCTCCTCGTCATGGGTT TATTACGAATACCGATTGTCAGCGACGTCTACAATTCAGTGTTTTTCTTC ATCGCTGCTACATTGAGCTTTTTCATCCCTTGTATATTAGTGCTTGTCTC TTACGGTTTTATACTGGTATCCGCGTTAAAGAATATGAAAATGGAAAAGA AAATCAGCAAAGTTATCGTTGTCATATCTATGATGGATCAAGAGAATCTG GAAAAAGTTGCATCAATGAGACCAGCAAGGTTTCGAGAAATCAAGATCGC TTTTAACGTGGCAATAATGACAGTTCCTTTTGTTTGCGGATGGGGTTATT TCATGACGTGTAATACTTACGAAATTGTAGCTGGCAAGGATATTACCGGT TTTCAAAATTGGTTAATCCCTTTCGTACCGTTCGTAATTTCATGTTTAAA TCCATTGACTTATTTAATGTTCACTCGATCCTTGAGGAAGAGTTCATTAA TGCTACTTTCAAGATCAAAATTATGTAAAAAACTGACGCAGTCTTTTATT AGACGCGAGAGTGAATTAACGAGTATGTCTTTCGTGATAAACGATCGGTC AAGCAACAGTATGGTCGAGACAGCTTCGAGAAGACATTCTGAAAATCTAT TAGACGGTGATGGCAAAAAGGAGACCACGAATGAATCTCCAGAGAAACAA ACTTTAATTGAACGTGAAGATTTAGATAAAGGCGTTAATGTATAATGCAC GTAGATTTTATTTCAATTCCAATAATTCTAATATACTACTCTCTGATTCT GAAGGGTAAACTTTGGTGAGTTGAAAAACTTGTAGGGCGTGAGATTAAAA TCTTACGAATTTACTTCTATTATTACCTCTAAGAATTATAGTCATTACTT TATCTACGATCGCGAGTAATTTTCTTTTTAAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000069_pilon:653177..676558-

>MSTRG.10090.2.p1 ID=MSTRG.10090.2.p1|Name=MSTRG.10090.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1458bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:653177..676558- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACGTGACTTCATGTAATGATATCATGAAAATGGTACAACCTTCCGG
AACAGTGTCTGCAGATTTGATTCATGTCATCTTGCCAAATATTTGTGGTA
TAATTGACAGTATTAATGCATCTATGGTGACATTCGAGGAGAGAATCTTT
TACGATCATTGCTGTGACCCGATACCCTTTATGATCCTCAATAAGACTGT
AAATATAAATAATGAGACGCACCCAGAACAATTGATTAGTGACGTGTGTA
ATTATATGCACCATAATCGAAACCAACAAGAAGAAGCTCTCTACCAAGAG
ATCTGTTTAAATTCTTCAACAAATAATTCTTCCGTTTTAAATCCAGCATG
GCGACTATTGACATTCATCATTCTATCCTTGCTTTCACCGATCGGCTTCT
TTGCTAACGTTTTGATCCTTATGACCGTATACAAAATCAAACATCTTCGC
AATACCACTGGTTACTTCATCTGCAATCTGGCTGTTTCTGATCTTCTGGT
TATCTTTCAGATGCTACTATTTGTGACCATGTATACGTCTGGTGCAATGT
CAGAGGCGAGCCCACGAGTTCAAAGCTTTTTCTTTCCAACAATCGATGTC
GTTATTGGTTCAGCTTCGTTGCTACATGTAACAGCAGTGACTATGGAAAG
AGGCATAGCTGTATCAATGCCTTTGAGATATCCAAGGTACCTTAATGAAC
GAACAGCGAATCGTACCATTGTTGGAATCTGGATTTATTGTTTGGTGCTC
CTCGTCATGGGTTTATTACGAATACCGATTGTCAGCGACGTCTACAATTC
AGTGTTTTTCTTCATCGCTGCTACATTGAGCTTTTTCATCCCTTGTATAT
TAGTGCTTGTCTCTTACGGTTTTATACTGGTATCCGCGTTAAAGAATATG
AAAATGGAAAAGAAAATCAGCAAAGTTATCGTTGTCATATCTATGATGGA
TCAAGAGAATCTGGAAAAAGTTGCATCAATGAGACCAGCAAGGTTTCGAG
AAATCAAGATCGCTTTTAACGTGGCAATAATGACAGTTCCTTTTGTTTGC
GGATGGGGTTATTTCATGACGTGTAATACTTACGAAATTGTAGCTGGCAA
GGATATTACCGGTTTTCAAAATTGGTTAATCCCTTTCGTACCGTTCGTAA
TTTCATGTTTAAATCCATTGACTTATTTAATGTTCACTCGATCCTTGAGG
AAGAGTTCATTAATGCTACTTTCAAGATCAAAATTATGTAAAAAACTGAC
GCAGTCTTTTATTAGACGCGAGAGTGAATTAACGAGTATGTCTTTCGTGA
TAAACGATCGGTCAAGCAACAGTATGGTCGAGACAGCTTCGAGAAGACAT
TCTGAAAATCTATTAGACGGTGATGGCAAAAAGGAGACCACGAATGAATC
TCCAGAGAAACAAACTTTAATTGAACGTGAAGATTTAGATAAAGGCGTTA
ATGTATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10090MSTRG.10090Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10090.2.p1MSTRG.10090.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10090.2.p1.exon2MSTRG.10090.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10090.2.p1.exon1MSTRG.10090.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000069_pilongenomesc0000069_pilon:653177..676558 -