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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000069_pilon:628521..636928+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10089.1.p1 ID=MSTRG.10089.1.p1|Name=MSTRG.10089.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8408bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:628521..636928+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTACAGTAAAAGGCTTCAAAATACAATATTTCCAAGCTTAAGACCGAGC
TGTAGAATGGATATTTGTCCGATCTACAGAAGAATAGTTTGCCGTGGGTT
CTAATGATGTGAACAAAGCAAACAAAAGAAACTTAAAACAATAAACAATG
ATACTCTTGTTTCTTTAAGCTTGGTTGGGCACAATaacattctttatttt
tcacagAAATAGTTCGTTCACGTTATGTTAATTGAAACAGAGACAAAACA
ATGTTGAACTGTGCTTTTGATTACTTTCTAATTAGACATAATTAACTAGA
CGAAGAAGTGAAAATTAAAGTTTGTACAAACAAATTATTGCTTACTGGCA
AATGAACCAAACACCTGTCACGAGCATGCCTAAAGTGTGCTAAATATTAT
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AAGaccaattcaaattttattatttgatacttgagaaaaattttagcgat
taaaattttttctcaatgtgtcggtaatattataaaatatttttgaaaat
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TACCATTTAATGCTAAATATAGATTTGCTAGAGACACTGCAGAAGAATTA
ATCCCTGAAGAAGAGGGAAGTGGAAGTGGTAATTTATATGAACGTGATGC
TATTGCTCAGAATGCTAGTGTATTAGCTGCTCCAGTACCAGGAGGTCATG
CTAATGCTACCAAAGAAGGAGCTAAAGACTCTAAAGCTGCATCTGAGAAA
GCTGAAGCTAAGGAAGAACCAAAAGAGAAAGCTACTAAAGAGCAAAGTAA
ATCTTTCGATGATGGGCAATCGTTGACCAGCAGTGAATTCGCCAATAAAC
CAGCTGCTGATAATAAGGATGTTAAAGAAGCACCTAAAGTTGAAGAGAAG
AAAGCTCAAAGTAAGAGTGATATCAATGAGAATCAAGCTGAGGATGAGGT
GTCAGAACAACAAGAATCACCAGCTGAGGAAACTTCTGAAGAACAACCCG
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GAGGAACAACAAGATAATgaagaaaaccaagaagattctaacgaagaaga
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TCTACCAGACAAATCTTGACTTACCCAGCTAAATCACAAGGATGGGGAAA
CACTCATCAGTTCGGACCATCTCACATTTGGAACAGTGATTACCCATATT
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GGTCACGCTAAGAAATCTGGAGTTGCCAAAGAAGAAGATGCTCAATGCCG
TGATTACGTTTTGATTCCTGCTGCCCCACAAGCATCAGCTGTGTTGTCAC
CTGCTGAAAATGGAGTTGCACGAAATTTTGTCAACAAAGATATCGCATGC
AACGACGGAGATACGGAATGCACACAACGTCAAGTCATCGGTAGCATGGC
AGGTGGATCTATGTTTGGTGATGGAATGGGTGGTTTAGGTCTTGGATTCC
CAGGTGTTCCAGGACTCCACACTGGTATCAGTGGTTACAATATGGCTGGT
GGTTTCGGTGACCATATGGGAAACGGACATGGCGGTCACCATGGAGGTCA
TCGTGGTGCACATGGAGGAGGTGCTGGTGGTGGATACGCTGGTGGTTATG
GTGCTCATTTCTTCAAAGCTGAAGAGCATGGAATCCCAAGCTACTGGAAC
GCACGTGCTGATATTCCAAAAGGAGACGTCAAAGGATTCTTCGGTGGACG
TGGAGCTGCCTTCTTCCACGGTGAAGACATTTTACCTATCCATGAAGCAG
CTAACGGCATTGGATCAGGAAGCAGCTATGGCGTCGGTAGTGCACAATAC
TGGGACAAAACACCAAACTTTGGTGCCATTCATTCCGGATTCTTCGGTGG
ACGTGGTGGATTTGGAGGATACGGTGGAGTCGGTTATGGAGGACGTGGTG
GTTTCGGAGGATATGGTGGACGCGGTTATGGATTaggagggtgggattct
tccggatggtggtggatggtgtcatggaggaggtgatgggtggtggatac
ggctggtggtTTTTCTCTTCAAAGCTGAAGGGCATCCAAGCTACTGGGGT
GGAGAAGTTGAGACTGTGGAGGTACTGGATGTGGTGGTCTCGGCTTGGGA
ggtcttggtggtggtctcggcatgggaggccttggtggtggttgtgctgg
tgctggctgtggtgtcggtgttgcacatgctggtcttggtgcAGGATGCA
TCGGCGATGGTTGCGGTGCTGGTATTGGGCACGCAGGAGCTGGCTGTGTC
GGAGATGCTTGCGGTCTTGGAGATGGCTGTGTTGGTGACGGTTGCGGTGC
CGAACTTGGTGCCAGACTTGGTGCCGGACTTGGTGCTGGATGTGTTGGAG
ACGGTTGCGGTGCTCGGCTGAGAGCTCTACGCCATTGATCAGAGAAACGG
CATTTTCTTAGTGCGTATTAGTGCACAAATACTAACACCAACAAACAAGC
CATTGGTTGATTTCCGGATTGATTGGTGCGTGGTGGTTTGGCGGGATGGA
GTGGCGTTGGTTAGGACGTGGTGGTTTAAAGGATATATGGTGGACGCTTG
GTTATGGGAGGAGGGGAGGTGTTACTGGTGGTGGACgggggggTCTCGGG
TGGGAGGCATGGGAGGCTTAtggggttgacttggtggtggttcggtggtg
cactgtgggtgcggtgctggtgatgatggtAAGCTGGATTGGACACGGGT
CCGCTGGTATTTTGTGCTTTGCTTTGGAGATGGCTGCGGGGTTAAATGGC
GGTGTTGGTGGTTGTGGCGGTGCCGATGTGGGAGATTTTGCGGCTGGGCT
GAGCTGTGTCTACACCAAATGGCTAAATTGGtaaattattaatttttggt
caaaaaagaatttcagcTTGCATCGAATCCAACATTTGTCCTTtaactat
ttttgaaagaataattTTGACAGAGAATGCCTTACGACTCATAGTGTTGG
TCAATCAAAGGACTAAGATCGAGTCAGCCTGATTACTATCCGTGTCCCcc
acagattttagattttctgatAATTCGGAAAAATACGCTTTTACCAGTTT
TATATTACTCAGGTTTAACCCCCCTCTTTCATTAGTACTTGAAGAATGCG
AACATAGTTCCAGAACCCGGTAGAACTATTCTTTTGTAATTGATTTTCTT
GTTTTCCAATGCTTCATCATATTCTCTTCGTTGAAGAGTGATTTTACCCg
catattttttgcaaaaaaaactaaacgatTTTACGGAGAAATTTCGGATC
tactttcttttttaataacGGATACTCCCACAACGCTGTTCAATACGCCA
ACGGTGGATTCCCTGGTCGTGCAACCACCCAATACACCTCAGTCCACCAT
CAGTCAATCTCACATGACGATGGAGATGCTGATGGCTACGTTGATGGAGG
CGCAGGATACGTAGGTGGCGCCGCCGCTGCCGTCCCTGCTGTCAGTGCCG
GATACGTCACCGGAGGTGCTGTCCCAGCTGCTGGCTACCTCGGAGGAGCC
AGTGTTGTTGGTAGTAGATATGCAGGATCAGGATATTTGGCACGCTCTTA
CCACCCACGACATGTCCATGTTGGTGTCGGTACCCCAGGTGTCAAAGTCG
AGGTTGAAACTGCCAAATCTGTCATCACCTCAAAACCAGTTCATGTCACT
GGACAGGTATGGTcaaatcaaattatttcattcaCCAAAAATGACGATAT
AAAAACGTTTTAAATGAATGCGCACTTAAAGTTCAATAACTACCCCCATC
ACAATCAACGTTCGATTTAGATTTATTGGAATCTGTagcaattcttttaa
aattcattttcattttaaaattcacAGAAAATGAGTGAAATCAAGAACAT
CGTCAAGGATGTTACAGCTTCATTGGCTAAAACCAGCAAGAAATTGAAGT
CCTTGAAAACTGGTGCCAAACGTCAAATCACACCAGCTTTTACTCCAGTC
GTTTCTGAGCCAGTCGGTGTCCCATCAAACAGATACCCAGTCCCAGCTGC
CGACAGATACCCATTAGGAGCTGGGTAAGCTATTTTCTCTTTTCAAGGTT
ATACATATCAAAGTTATGCAGACAGTCCCTGTAAAATACAGTCAATATAT
TTTTACCTCTACATATTTTTATGGAGAAGATAAAGGGTCAGTCGATGAAA
GAGTCATATACTGTATCATCCTTTTTACAGATTACAATTACAggtgagtc
tccataactcgaacacccACGAGTGTTTGCTCGAGTTAAgtaaatttcga
gttatagagtaagaTTAATAGGGCATTCTTAACTGGAGGGACGAAAAACT
TGTTCGGAGGAGAAattcaagttatagaggttcgagttaaagagattctA
TTATACTGGAATTATTTTACGGGTTTTCACGGAGGGCACATGAAAATTTA
CTCTACTGAGAAACATTTAATTCTCTTTTGTCCTTCAGATACATCTGGCC
ATCAGCTAACTACGGCCATCAATACGGAGGTCCATACTCATGGAGCAAAT
CTCACACACCAAAAGCTGCCCCAGCTGTTGCTGCAAAACCAAGCACTGCC
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AtgaatttattttgatgtgTTAAGCCTCGGGGATTGTACAGTCTATCCGT
TGATCTCTTTTGCATTTACACTTGGCATGTATTTTTCCTTCGGGCTTGGT
AAAGGAGATTTTTATCCCTGCAGTATAGTAAATTATCTGATGAATTTTAT
TACGATTTTGTTGATGTTATTGTATTGTACAGGTGAAAAAGCTAAGCGTT
CAGTATCTGTGAAAACACCAACGGTCGTAGTTGCCAAGAAAGGAGTCAAC
AAGAAAGGTTCCAAACGTCAGTTTATCCAACGTGGTTACGGAGGTCAGTT
CCTTTACAACAGCGATAAGGAATGATTTGCAAATTTCTCCCTGAAATTTT
GTTACACTACATACACACATAATAAAAACATTCACTCATACCATTTATAG
GCATACAAAAACCTAGaaagtaaaatttggacaaaaaaaaacgaaaaatt
tgatttataaaataatgaaatttcatCAAGAATTCGCATTTCATTTCTTG
GGctatcattttatttatttaatgtCAAAATTGATCTTTTGAGTATCATT
ATTtaaacaaaactttaaaaaaagattcgaaaacgaatagcaacaaaatc
aaaacgaaaaacaaaTCCTGAATTCGAATTTTTTGTCCGTTCTAGGTATG
CCTATATATGGTATGGGAGGAGAAGGAGGAGAGGTCATGCCATCACCAAG
GTCATTCGGATATGGTGGTATCAGAGGTTATGGTAGTCATCATCTCATGG
AAGGAGGTTTCGATGGATTCGGTGTCCCTGGAGGACATATGGGGTACGGT
CATGTTGGTTATGGTCATCATGGGGGTTACCCAATGAGTGTATTGTCAAA
CCACGGTGACTTTGGTGCTGGATACGCAGGTCCACTCGGTGGTAACTTTG
ATGCAGGACACCATGAATATGGAGTTGAAGGTGATATTGGTTTCGGTGGA
CATGGTTATggtgcaggtttaggaggtgcagggttaggaggtgcaggatt
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ATGGTGGTAGATATGCTGGTCATGCCGGTATCTTTGGAGGTAGCTTCCAT
CATTTGGGAGGTCCTGGAATTGTTGGTGATTATGAAGGAGATCGCGGTGC
ATTGGTTATGTCTGACCATGCTGGGTTTGGTGCACATGGATATGGAGGAC
CTGCATTATTAGGTGGACGTGTTGGATTTGCTGGTGATCACGGTTACGGC
TATGAAGGCCGCGCTGGTTTAGGATATGGCCATGGATTCGGTGGATATGG
ACATGGTATTGGTTACGGACATGCTGGAGTCATGGACGGTCATTTAGGCT
ATGGTCATACCAGTTTTGATGCTGGAGTACACGGTGGTCTAGGACTTGAT
ATTGGTGCTCATGGTATTGAAGGACACAGTGGATATGGTGGTATGCACGG
CTTTGTAGGTCTTCCTCATGCTGCTGGTGCTGGATTTCCAGGCTATGCTA
GAGAAAGTAAGCATCCTTTAGATATAAAGCTACACAGTAAAAGCTATCAA
CAAAATAAGTTACACTTTAAAGTTTAGATCTTTTTTGTTAAGGACAGAGA
ATTTACTCAACAAAATGTTATATTGTACCGAACGTGTAGCGAACAGTCCA
ACATcagaaatgtttaaaaatgttaGGACGCGTCATCCACTCGAAACCGT
TGTAGAAATAGCACTTCCTCCGCCGCGCGATATCGGTTTAGTGCCCACCC
TCTCCAATAAGAGATGATATATATTCCATTATAATAGCTTTCATCAACGA
TAATCAAGAAATCTGCTACGAAACACTGATCTTCCGAAGCCTGTAAAATA
ATTCTTTCGGAATTTTAGTATTATTTTTACTGTAAAAGATATGATCTTAG
GTTAAGTTAAAATCAGTAACGATATTTGAAAATTCTCTATTTTCTGCTCT
GTCACtaatcttttattttcattattttctctTACCAGACATCGAACAAG
CATCAGAagagcaacaacaacaacaatatgCACCAAGCAGCCGTTCAATG
ATGCCAGATCCTATGTACAGCAACGAACAAGAACAATATGCACCAGTAAG
TCCATTGTCTTACTTCACACAACTCTGAGTGACATCATATCTTTCATATG
ATCCTAGAATCGGCGTTGCAACTTTTCCTTttgtagacgaaaatccgtcc
aGGGgacttttttttagaatttctgTCTTAATTGTAAGCTTCTGACTAAG
GGCCGTTTTTCCCTTTCGCTGCAAGTCCCAGTTAGGGCTGCAAATACACA
AATTTGCAAGATTCATTTTTCTTAGGGTGCCATTTTTGGTAACAATTGAT
AAGAATTAGGAATCAGTTTCTATTAATCGGCAACCAaaagtttctaattt
tttattggATACTTTTCTTTCAGGAGAGCCAGTACGAGATGCAACAACGT
ATGCAACCTGAATATATGTCAGCCAAAAAATCATCCGTACCAAAGAAAGC
TAACCACTAAAGGAGAGAAAGGTATGGGGAGGACTCTACTTTCTATGTTT
GGCAAAGTTTCTATGGCATCCACTACCTTAACATTTTTCCTTGATTGGCT
TAACAAAGTCCCGCTAACCTTTCTACCTGATATTAAAAGTTTTGTAACTC
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TGTTAAATAATTATCATTAATTGACTTTTTACCTCGTTTCTAGAGCATTC
AAGGATGGCTTTACAATCGCCAATATTGATGACTGGGTATTGAAGAACCA
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ATCGTACATACACTGCTTCGCTACCATATTGCTTCAAAATAGATCAAATA
TGTGTCCATTattattcatttaaaaaatttgtgttttattttatttgtta
cTAACCATGTCATACTATATAGGAGccttgtaaattttttaaaaattata
tgtGTTCGGCTCAGGTTATACTTTATTTAGGGTCGatcatgttgttgttt
tttctgttaGAAAGCTAATAGGCATAATGCCAGGGAAAGTAAaagatcaa
tgttttttttgctcaagccttacattttgtctttagtttttatttgaatt
ttttgtttttgtctgtttgtttCAACGATCTTTAAGCAATTTGGAAGCAC
TGTGAAGTTGAAAGttagaaaaaagtgtaactCTTAGATAATTATATACA
TATATTTTTGTCCTCGCATTTATTTAATTGTCTAATTAATTTGTTAGAGT
ATTTATTGCAAAATATAAATATAGTTTTTTACAAATAATcgaaaaagttg
atatttgaATTCATGTCGTTCTCCCAAAAACAACTGGATAAATTTTCGTT
TGAAAATTACTGTGAAATTTTGTTCTCGTTTGTGAGAGTAACACCGGTGG
TCATGGGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000069_pilon:628521..636928+ >MSTRG.10089.1.p1 ID=MSTRG.10089.1.p1|Name=MSTRG.10089.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1653bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:628521..636928+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGTTGCCGGTCAAAGGCAATTTACTTGTGTtatcacttgtggttttttg
TGTGGCTGTTAATGGCTTACCATTTAATGCTAAATATAGATTTGCTAGAG
ACACTGCAGAAGAATTAATCCCTGAAGAAGAGGGAAGTGGAAGTGGTAAT
TTATATGAACGTGATGCTATTGCTCAGAATGCTAGTGTATTAGCTGCTCC
AGTACCAGGAGGTCATGCTAATGCTACCAAAGAAGGAGCTAAAGACTCTA
AAGCTGCATCTGAGAAAGCTGAAGCTAAGGAAGAACCAAAAGAGAAAGCT
ACTAAAGAGCAAAGTAAATCTTTCGATGATGGGCAATCGTTGACCAGCAG
TGAATTCGCCAATAAACCAGCTGCTGATAATAAGGATGTTAAAGAAGCAC
CTAAAGTTGAAGAGAAGAAAGCTCAAAGTAAGAGTGATATCAATGAGAAT
CAAGCTGAGGATGAGGTGTCAGAACAACAAGAATCACCAGCTGAGGAAAC
TTCTGAAGAACAACCCGCTCAAGAAGGTGAAAGTGAAGAGGAACCAAGTG
AAGAAGACGGAGGAAATGAGGAACAACAAGATAATgaagaaaaccaagaa
gattctaacgaagaagatagtggtaacaatgaagaagagaagaagaaaga
tcaagTTGCATCaaacctcaaaatgttcttcatTTCACCATACCAAAAGA
ACGGTGAAGAAGATCCATCTACCAGACAAATCTTGACTTACCCAGCTAAA
TCACAAGGATGGGGAAACACTCATCAGTTCGGACCATCTCACATTTGGAA
CAGTGATTACCCATATTTTGCATATGGATACAGTTGGGGCTGTGGACACC
ACGGCTATGGAGGTATCGGTCACGCTAAGAAATCTGGAGTTGCCAAAGAA
GAAGATGCTCAATGCCGTGATTACGTTTTGATTCCTGCTGCCCCACAAGC
ATCAGCTGTGTTGTCACCTGCTGAAAATGGAGTTGCACGAAATTTTGTCA
ACAAAGATATCGCATGCAACGACGGAGATACGGAATGCACACAACGTCAA
GTCATCGGTAGCATGGCAGGTGGATCTATGTTTGGTGATGGAATGGGTGG
TTTAGGTCTTGGATTCCCAGGTGTTCCAGGACTCCACACTGGTATCAGTG
GTTACAATATGGCTGGTGGTTTCGGTGACCATATGGGAAACGGACATGGC
GGTCACCATGGAGGTCATCGTGGTGCACATGGAGGAGGTGCTGGTGGTGG
ATACGCTGGTGGTTATGGTGCTCATTTCTTCAAAGCTGAAGAGCATGGAA
TCCCAAGCTACTGGAACGCACGTGCTGATATTCCAAAAGGAGACGTCAAA
GGATTCTTCGGTGGACGTGGAGCTGCCTTCTTCCACGGTGAAGACATTTT
ACCTATCCATGAAGCAGCTAACGGCATTGGATCAGGAAGCAGCTATGGCG
TCGGTAGTGCACAATACTGGGACAAAACACCAAACTTTGGTGCCATTCAT
TCCGGATTCTTCGGTGGACGTGGTGGATTTGGAGGATACGGTGGAGTCGG
TTATGGAGGACGTGGTGGTTTCGGAGGATATGGTGGACGCGGTTATGGAT
Taggagggtgggattcttccggatggtggtggatggtgtcatggaggagg
tga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000069_pilon | genome | sc0000069_pilon:628521..636928 + |
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