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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000069_pilon:593821..602582+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10083.39.p1 ID=MSTRG.10083.39.p1|Name=MSTRG.10083.39.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8762bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:593821..602582+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGCAAAATGTATAAGATTTCAATAGTATTtctgattttggctgctgcgaT
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aaaTTGATCTATAGATAAAAGTATTCATCGATGGGAATCTATTTTCAAAT
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AGGTTGGGGTGCTCCTTACTGGTACAAGTAAGTCCTCCATTTACTCtaac
aaaatcaataaacacCGTCACTCTAATACTGTTCAGTTTCATTACTGTTG
AAAAATATTACCCCTTACTATTACTATTTAGTAATGGTAATGGAAATAAA
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GGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTACAAGTAAGTCCTCCATTTACTCttaca
aaatcaataaacacCGTCACTCTAATACTGTTCAGTTTCATTACTGTTGA
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TCCCTTAGAGCTCAAAtttatttcaacaaaaatcatTGATAATCATTAAC
TGATAAACAACCATCTTTAGAGATCTTCCCCTTGACGTGAAACGAATTTT
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caaatttttgaagaatattttttataaaattgattttctgcCTTATAGAA
AACGAACTCACACTCCACAAGTCAGACAATTAGTACCAACACATTATTAT
GGCCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccacccaggacatacTGGCGG
AGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTATAAGTAAGATAATATCTATGATAAAA
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TGTGCGTCAGAACTATGGGTTGTTCCTAATCGTTTCAGTTACTCCGACGT
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TGAAATAGATTCACCGGCTACAATAGAATAAAGCGTACTTGAGTGCATCT
ATTTTGAGTTACTTTCATTATTATGTACACTTTTAGGAAAAGCGATACGA
AGAATCCTGAAAAGACTCACTCTGCAAAACAATTAGTTCCAACACATTAT
TATGGCCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccacccaggacatacTGG
CGGAGGTTGGGGTTCCCCTTATTGGTACAAGTAAGTTAATATTTGTGatg
taaagcaaaaaaaagtttaactttCGCTGCTATCAAAAGCTAACAAAGTC
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TTCGGTGTTGCAGAAATCAATCGTTTTTACTCGGAATTCGGGTAATATTA
CGGAATCCTAAAATTGGTTCGGTATCTGAAATAGACGTATTTGTACGTCA
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GATggctcaaaaacaaaatttttcggtttttcgaaaatcagaaCCCTCGT
ACGCCCCGCCCCCTATACTACACTAAGAAGTATTTCCAgagattttgaca
ttttagaaAATAGATTTAAGTACTAGAGACGCCTACCCATTACGTCCTAT
GTATGGTCGATTGAGATTTCTTAAGCATTTTCCAATTGCTTATATcccat
ttttttagaaaagacGATGTATCACCAAAGCAGCTAGTACCAACACATTA
TTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGCGGTTTCCACCCAGGACACACTG
GTGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTATAAGTAAGTTTGAACGAACATA
CTTTGATTTCCTCGGCTATTTCGATGTTTAAACTTGCGCACAGCTTTCTT
GAAGAATCCTCTAAACATGTTAGAGCTTTTGCATATACTGGTAATGTGAG
GAAAAGCATTGCCAAAATAATGCAATGCTTTAATAAAATACGATTGGGAG
ATATTCTCTTTATATCTTTAGGTTATAATGTTTTTCTATTCGAGTTGTAG
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TATTTTACTTAAACCAACAGAAAACGAACTCACACTCCACAAGTTAGACA
ATTAGTACCAACACACTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTT
TCCAGCCAGGACATACTGGTGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTACAAG
TAAGTTGTTTAGATTTCAAAGGCGTAGTCAGATagtttgagatatttggt
cTTTAGATTCCTCTTAATATTTCTGAGCAAACTTTTTTGTAAGCAATAGA
TCTCTCAACGTGGAAACCCTGTGTGAACCCATCTTCAACGTTTTCAAAAC
ATCGTTTTTCAAACTTACAAAATCATTTTAGCAAAAAGAATTGGGGGTTT
ACCgccaaactaaaaaaaatatacagaCCAAAAGTCTTTTACCGTCTGGT
AAGCCCTTCTAAAAAGGATCTACAAATGGCTAATAGACCTTTGTTGCCTT
TATCATAAAAGTCTAATATCAAAGTTTCAAGTCTAATATTTACCGTTGTT
TTCATATAAATAGAAAAAGCGAAACGAAAAATCCTGAAAAGACTCACTCT
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GGGTggtttccacccaggacatacTGGCGGAGGATGGGGTGCTCCTTATT
GGTACAAGTAAGTTGAACATTTTGATCATCTTTGCATGGTAACCCAAATC
AAAGTTACTGCAAACATAGTTACCTAAAAGCTTCCTTTTCGAAGATTTTG
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TCTACTGTATTTTCAAGTGGTCGTTGTAATTCGTGTCTTCACTTCGTCAT
TTGTCTTTACAGAAAAAGCGAGACAAAGAATCCAGGAAAAACTCACTCTA
CAAAACAATTAGTACCAACGCATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGG
GGTGGTTTCCATCCAGGACATACTGGTGGAGGATGGGGCGCTCCTTATTG
GTACAAGTAAGTATACTGATACCTTTTGGTAGCCATTTACGACAATGATG
ACGAAAATGTTTTCAGTCTCGTCAAAATTTGCCATTTCTTAGAAAGTGAT
GAGAAACTCATGTATCTAGTGATGTAGTATATAAGCTCAAGTAGACTGAT
CTGTATTAAGGAATAAGaattataattattttgaaaGAGGATTTGccaca
atacacctttccccttgatttcaattaaaaacgtttatattttttaccat
tttaattttttcagaaaaagtgaGACCAAGAATCCAGGAAAAACACACTC
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GGGGTggtttccacccaggacatacTGGCGGTGGATGGGGCGCTCCTTAT
TGGTATAAGTaagtcaattttaaaagttattttttgtgttttagcgATCC
TTAGCAAGCTTAAGTATCGATAgataaatcacgacgacggaagTTTTTCC
TCTATCCTTGTTCATTAACGCTGCGGATTTTTTCTTCAGGCTAACCTGAA
AGCAAGGTAGATTTGCCCCGTGTAGTACATACAGTACATACAAGCGGAGC
TTCATTGTATAAACAATAACATAAGTTGATTTCTTTGAATGGTAAGTCTA
AGTTATGCTCTCAGGTTAGCCTGTAGAAAAGTTCCGCAGCGCGAAAGAAC
AAGGCTAATGGAAAtccgtccgtcgtcgtgattcaTCTATCGTTATTTAA
CCTCATTGTTGtgctcaaataaaaaaagaaggtCAGCTTCCATATAAAAG
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CTTGAACCTGCTTTGGAATATTACACACTAGAGTCCGTCGTACAGGCTAA
CTATCTTTGTCATGGTAATAAGTTATAACTAGTCCTCCTTTACCTTACCT
CAGAAAAAGCGAAACGAAGAATCCTGAAAAGACTCACTCTGCAAAACAAT
TAGTACCAACACATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTTTC
CATCCAGGACATACTGGCGGAGGATGGGGCGCTCCTTATTGGTATAAGTA
AGTGATTTATACCTAGTTTAgtgtatttttgtaaatttgaaaatttgtta
gaataaattcttaaaaaaataatcactttgtattattaattttgttgtgT
CCCTTATAAATT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000069_pilon:593821..602582+ >MSTRG.10083.39.p1 ID=MSTRG.10083.39.p1|Name=MSTRG.10083.39.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=21492bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:593821..602582+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGCAAAATGTATAAGATTTCAATAGTATTtctgattttggctgctgcgaT TTTCCAAGTACTTCATTGTGATGATACGATTGACCCCGATGCTGTAAAAT CAACCGATAAAGATCCTTGGGAGAAATGGAGTAAATTACCGTCATCTGGT AGCAAAAGTCAAGGTAACCATAACAACGATAGTGATGATGATGGTGGTGA AGTTGACGTGACCGAAACAACAACCACTGAGGTCCACACTAAGACCAACA TCAAGAAGAAACCTTCTTCAAAGCAACCCCAAGTTTCTTCAGTTGATAAA GAAACTAAAGACCAGTTCAATGATGCTGTCGATGAAACAGACCCAGTCTC CGTTTTGAATCCAACAAAAAAGCCATCCAAAAAGAAACAACAGCACAAGA AGAAGCACCATAAGAAAACTCAACGAAAACACAATGTTGCTGAAAAGAAA CAATTCAACTATCATGGTGATTTCTATCCAGGAAGTTTGTGGCAATATCC TTACCCGTATTATCACCCATTATATGGGTGTGGAATGTCTCCTGACTGCC CTTGTGGAGGAGCACCAGAGCCGCCATGTGCACCACCACCAACAGAAGCT AAAGAAGATAAACCTCCCACAGAAGCTAAAGACGATGGAGATAAACCTCC ACCGAAGAAACCGGCAACAAAGAAAGTTGACATCGAAGCTTTAGAAGACG CCGAAACTCCAAAGTCGAGACATAGACGACAATTAGTACCAACACATTAT TATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccacccaggacatacTGG CGGTGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTACAAAAAACGAACTCACACTCCAC AAGTCAGACAATTAGTACCAACACATTATTATGGCCCACCAAGTGCAGGA TGGGGTggtttccacccaggacatacTGGCGGAGGTTGGGGTGCTCCTTA TTGGTATAAaaaagacGATGTATCACCAAAGCAGCTAGTACCAACACATT ATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGCGGTTTCCACCCAGGACACACT GGTGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTATAAAAAACGAACTCACACTCC ACAAGTTAGACAATTAGTACCAACACACTATTATGGTCCACCAAGTGCAG GATGGGGTGGTTTCCAGCCAGGACATACTGGTGGAGGTTGGGGTGCTCCT TATTGGTACAAAAAAAGCGAAACGAAAAATCCTGAAAAGACTCACTCTGC AAAACAATTAGTGCCAACGCATTATTATGGTCCACCAAGTGCGGGATGGG GTggtttccacccaggacatacTGGCGGAGGATGGGGTGCTCCTTATTGG TACAAAAAAAGCGAGACAAAGAATCCAGGAAAAACTCACTCTACAAAACA ATTAGTACCAACGCATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTT TCCATCCAGGACATACTGGTGGAGGATGGGGCGCTCCTTATTGGTACAAa aaaagtgaGACCAAGAATCCAGGAAAAACACACTCTACAAAACAATTAGT ACCAACACATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccacc caggacatacTGGCGGTGGATGGGGCGCTCCTTATTGGTATAAAAAAAGC GAAACGAAGAATCCTGAAAAGACTCACTCTGCAAAACAATTAGTACCAAC ACATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTTTCCATCCAGGAC ATACTGGCGGAGGATGGGGCGCTCCTTATTGGTATAAGTAAAGCAAAATG TATAAGATTTCAATAGTATTtctgattttggctgctgcgaTTTTCCAAGT ACTTCATTGTGATGATACGATTGACCCCGATGCTGTAAAATCAACCGATA AAGATCCTTGGGAGAAATGGAGTAAATTACCGTCATCTGGTAGCAAAAGT CAAGGTAACCATAACAACGATAGTGATGATGATGGTGGTGAAGTTGACGT GACCGAAACAACAACCACTGAGGTCCACACTAAGACCAACATCAAGAAGA AACCTTCTTCAAAGCAACCCCAAGTTTCTTCAGTTGATAAAGAAACTAAA GACCAGTTCAATGATGCTGTCGATGAAACAGACCCAGTCTCCGTTTTGAA TCCAACAAAAAAGCCATCCAAAAAGAAACAACAGCACAAGAAGAAGCACC ATAAGAAAACTCAACGAAAACACAATGTTGCTGAAAAGAAACAATTCAAC TATCATGGTGATTTCTATCCAGGAAGTTTGTGGCAATATCCTTACCCGTA TTATCACCCATTATATGGGTGTGGAATGTCTCCTGACTGCCCTTGTGGAG GAGCACCAGAGCCGCCATGTGCACCACCACCAACAGAAGCTAAAGAAGAT AAACCTCCCACAGAAGCTAAAGACGATGGAGATAAACCTCCACCGAAGAA ACCGGCAACAAAGAAAGTTGACATCGAAGCTTTAGAAGACGCCGAAACTC CAAAGTCGAGACATAGACGACAATTAGTACCAACACATTATTATGGTCCA CCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccacccaggacatacTGGCGGTGGTTG GGGTGCTCCTTATTGGTACAAAAAACGAACTCACACTCCACAAGTCAGAC AATTAGTACCAACACATTATTATGGCCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggt ttccacccaggacatacTGGCGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTATAA aaaagacGATGTATCACCAAAGCAGCTAGTACCAACACATTATTATGGTC CACCAAGTGCAGGATGGGGCGGTTTCCACCCAGGACACACTGGTGGAGGT TGGGGTGCTCCTTATTGGTATAAAAAACGAACTCACACTCCACAAGTTAG ACAATTAGTACCAACACACTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTG GTTTCCAGCCAGGACATACTGGTGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTAC AAAAAAAGCGAAACGAAAAATCCTGAAAAGACTCACTCTGCAAAACAATT AGTGCCAACGCATTATTATGGTCCACCAAGTGCGGGATGGGGTggtttcc acccaggacatacTGGCGGAGGATGGGGTGCTCCTTATTGGTACAAAAAA AGCGAGACAAAGAATCCAGGAAAAACTCACTCTACAAAACAATTAGTACC AACGCATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTTTCCATCCAG GACATACTGGTGGAGGATGGGGCGCTCCTTATTGGTACAAaaaaagtgaG ACCAAGAATCCAGGAAAAACACACTCTACAAAACAATTAGTACCAACACA TTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccacccaggacata cTGGCGGTGGATGGGGCGCTCCTTATTGGTATAAAAAAAGCGAAACGAAG AATCCTGAAAAGACTCACTCTGCAAAACAATTAGTACCAACACATTATTA TGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTTTCCATCCAGGACATACTGGCG GAGGATGGGGCGCTCCTTATTGGTATAAGTAAAGCAAAATGTATAAGATT TCAATAGTATTtctgattttggctgctgcgaTTTTCCAAGTACTTCATTG TGATGATACGATTGACCCCGATGCTGTAAAATCAACCGATAAAGATCCTT GGGAGAAATGGAGTAAATTACCGTCATCTGGTAGCAAAAGTCAAGGTAAC CATAACAACGATAGTGATGATGATGGTGGTGAAGTTGACGTGACCGAAAC AACAACCACTGAGGTCCACACTAAGACCAACATCAAGAAGAAACCTTCTT CAAAGCAACCCCAAGTTTCTTCAGTTGATAAAGAAACTAAAGACCAGTTC AATGATGCTGTCGATGAAACAGACCCAGTCTCCGTTTTGAATCCAACAAA AAAGCCATCCAAAAAGAAACAACAGCACAAGAAGAAGCACCATAAGAAAA CTCAACGAAAACACAATGTTGCTGAAAAGAAACAATTCAACTATCATGGT GATTTCTATCCAGGAAGTTTGTGGCAATATCCTTACCCGTATTATCACCC ATTATATGGGTGTGGAATGTCTCCTGACTGCCCTTGTGGAGGAGCACCAG AGCCGCCATGTGCACCACCACCAACAGAAGCTAAAGAAGATAAACCTCCC ACAGAAGCTAAAGACGATGGAGATAAACCTCCACCGAAGAAACCGGCAAC AAAGAAAGTTGACATCGAAGCTTTAGAAGACGCCGAAACTCCAAAGTCGA GACATAGACGACAATTAGTACCAACACATTATTATGGTCCACCAAGTGCA GGATGGGGTggtttccacccaggacatacTGGCGGTGGTTGGGGTGCTCC TTATTGGTACAAAAAACGAACTCACACTCCACAAGTCAGACAATTAGTAC CAACACATTATTATGGCCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccaccca ggacatacTGGCGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTATAAaaaagacGA TGTATCACCAAAGCAGCTAGTACCAACACATTATTATGGTCCACCAAGTG CAGGATGGGGCGGTTTCCACCCAGGACACACTGGTGGAGGTTGGGGTGCT CCTTATTGGTATAAAAAACGAACTCACACTCCACAAGTTAGACAATTAGT ACCAACACACTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTTTCCAGC CAGGACATACTGGTGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTACAAAAAAAGC GAAACGAAAAATCCTGAAAAGACTCACTCTGCAAAACAATTAGTGCCAAC GCATTATTATGGTCCACCAAGTGCGGGATGGGGTggtttccacccaggac atacTGGCGGAGGATGGGGTGCTCCTTATTGGTACAAAAAAAGCGAGACA AAGAATCCAGGAAAAACTCACTCTACAAAACAATTAGTACCAACGCATTA TTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTTTCCATCCAGGACATACTG GTGGAGGATGGGGCGCTCCTTATTGGTACAAaaaaagtgaGACCAAGAAT CCAGGAAAAACACACTCTACAAAACAATTAGTACCAACACATTATTATGG TCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccacccaggacatacTGGCGGTG GATGGGGCGCTCCTTATTGGTATAAAAAAAGCGAAACGAAGAATCCTGAA AAGACTCACTCTGCAAAACAATTAGTACCAACACATTATTATGGTCCACC AAGTGCAGGATGGGGTGGTTTCCATCCAGGACATACTGGCGGAGGATGGG GCGCTCCTTATTGGTATAAGTAAAGCAAAATGTATAAGATTTCAATAGTA TTtctgattttggctgctgcgaTTTTCCAAGTACTTCATTGTGATGATAC GATTGACCCCGATGCTGTAAAATCAACCGATAAAGATCCTTGGGAGAAAT GGAGTAAATTACCGTCATCTGGTAGCAAAAGTCAAGGTAACCATAACAAC GATAGTGATGATGATGGTGGTGAAGTTGACGTGACCGAAACAACAACCAC TGAGGTCCACACTAAGACCAACATCAAGAAGAAACCTTCTTCAAAGCAAC CCCAAGTTTCTTCAGTTGATAAAGAAACTAAAGACCAGTTCAATGATGCT GTCGATGAAACAGACCCAGTCTCCGTTTTGAATCCAACAAAAAAGCCATC CAAAAAGAAACAACAGCACAAGAAGAAGCACCATAAGAAAACTCAACGAA AACACAATGTTGCTGAAAAGAAACAATTCAACTATCATGGTGATTTCTAT CCAGGAAGTTTGTGGCAATATCCTTACCCGTATTATCACCCATTATATGG GTGTGGAATGTCTCCTGACTGCCCTTGTGGAGGAGCACCAGAGCCGCCAT GTGCACCACCACCAACAGAAGCTAAAGAAGATAAACCTCCCACAGAAGCT AAAGACGATGGAGATAAACCTCCACCGAAGAAACCGGCAACAAAGAAAGT TGACATCGAAGCTTTAGAAGACGCCGAAACTCCAAAGTCGAGACATAGAC GACAATTAGTACCAACACATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGT ggtttccacccaggacatacTGGCGGTGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTA CAAAAAACGAACTCACACTCCACAAGTCAGACAATTAGTACCAACACATT ATTATGGCCCACCAAGTGCAGGATGGGGTggtttccacccaggacatacT GGCGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTATAAaaaagacGATGTATCACC AAAGCAGCTAGTACCAACACATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGG GCGGTTTCCACCCAGGACACACTGGTGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGG TATAAAAAACGAACTCACACTCCACAAGTTAGACAATTAGTACCAACACA CTATTATGGTCCACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTTTCCAGCCAGGACATA CTGGTGGAGGTTGGGGTGCTCCTTATTGGTACAAAAAAAGCGAAACGAAA AATCCTGAAAAGACTCACTCTGCAAAACAATTAGTGCCAACGCATTATTA TGGTCCACCAAGTGCGGGATGGGGTggtttccacccaggacatacTGGCG GAGGATGGGGTGCTCCTTATTGGTACAAAAAAAGCGAGACAAAGAATCCA GGAAAAACTCACTCTACAAAACAATTAGTACCAACGCATTATTATGGTCC ACCAAGTGCAGGATGGGGTGGTTTCCATCCAGGACATACTGGTGGAGGAT GGGGCGCTCCTTATTGGTACAAaaaaagtgaGACCAAGAATCCAGGAAAA ACACACTCTACAAAACAATTAGTACCAACACATTATTATGGTCCACCAAG TGCAGGATGGGGTggtttccacccaggacatacTGGCGGTGGATGGGGCG CTCCTTATTGGTATAAAAAAAGCGAAACGAAGAATCCTGAAAAGACTCAC TCTGCAAAACAATTAGTACCAACACATTATTATGGTCCACCAAGTGCAGG ATGGGGTGGTTTCCATCCAGGACATACTGGCGGAGGATGGGGCGCTCCTT ATTGGTATAAGTAAAGCAAAATGTATAAGATTTCAATAGTATTtctgatt ttggctgctgcgaTTTTCCAAGTACTTCATTGTGATGATACGATTGACCC CGATGCTGTAAAATCAACCGATAAAGATCCTTGGGAGAAATGGAGTAAAT 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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|