MSTRG.10051.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.10051.2.p2
Unique NameMSTRG.10051.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000069_pilon:73916..112487-

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.10051.2.p2 ID=MSTRG.10051.2.p2|Name=MSTRG.10051.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=38572bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:73916..112487- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCAGACATTGGTACTGCTACTATCCTCCACATCTCTGGTTATCATCCAC CTATCAACTTTTGCATTGATCGCACTCACCAAAAGGTATCAACCGTTTCT TTGTGAAAACTCGGCGTAAAAACAACTTTAAATCAAGCCTAGCCTAAGAT TTCTTAGGGAATGTTTAGAAAGTTTTAACTATTGGGCCCCTTTTGTTGTA ACAATCGAAAAAATGTAAGCATTATTAAAAAGAACGTTAATTCGTATGAT TAGACTCCAGTCATAATTACCTTTCCTGATAGTAAATGTTATAACTTGAA TAATTTCATTGCCAGAGTATAATGAAAATGATAACACTAGTTTAATTTCA TCCGTCTTGAATTTCGTCGGAAAATTTATAATTTACTATGAACCTGACTC ACTTAACCCACAAGTTAATCACAATAATTTGGGAGATTGGCCTTGTCTTT CTGTTTAACTTGGTTGATAGTGATAGGATGCAATATCGGGTGGAAATTGC TCATAAAGGTCTCTCAAAGACTCAAAAGGGTCTTTTTGGACCTACCCCGG CGGAGGTCCTATAAATTAACCGTTGTATGTTCGTTCGTTAGTCTGGTAAC TTTTCTCGAGATTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATG CATAACTATAAACCCTCGAATGTGACGCAGCCCGATTTTTGGGAAAAAAT TTTTTTGGCCAAATTTTAGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGG ACTTTGTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGTAAGAAAC TAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGTAAAAACGAATTTTTCAGCT CAAATAACGCACGTTTATCTATAAGAATCACTATTGATAAGCATACATCA ATTTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTGATGAGATATGTTTTTTTTGC 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AAAGAAACAACATAGAAACACAACTGATAAAAATGGACGAAACACGTTTG ACTTACAATGATTCTTACACAACTGACAAGGATGAACCTTTCATCCAGTC AAAACGACAAAAAGTCTACCAACAACTTGGTCATTTCAACTCTGTTAATC CTGGATCTGCTGATGCATGGGCCAATCATCACCAACAACCCAATACTACT GGATTTAATTATTATCATCATATATCAACTGCTGGTAGTAGACCTTTATC GAGTGGCAGTGGTCTACCTCTTATCACTCCCAGTCTTGTTCCTGTCAGTC TTCATCAAGGTTCTTCCAGTCTTGTTCCCTCGACCATACCCTCTAATCTC GTTCCGTCTGACGGTCATCAAGCAACTATCACAAGACCTCCTGGTCTTCC TACAAATCCAACAACTGTGACACCTAGTACCATCAGACCTAGTCTAGTTC CCAACAGTCACTACATGTCTACACCTGTGCAAGGCTCCCATTCTTTTTCA TTTAATCCAAGAACCGATGATACGGAAACCCTTATTACTCCGAGGGATCA TGACCCTGCTACCACCTCTCCTGATCCTGCACCTATCAGTAGTTATCAAG TTACAGTCGTACCTCCACTGCTCCATTCTTATTCATCATTCAGCATGATC AACCCAACCTCAAGGACACATTCACGATGCCCTAAAATGGAATGGAAGAC TCACGCACAGGATCCACTTTACGCACCAAGTATACCGACCTACAATGAAA CAAGTGGACCAAAGTTTGATATTCCTGAGGACATAACAATCAGAAATTTA GTACAACTTTACCTAACGGATGACCTCCTTGACGAACTAGTACAAAACAC TAATAAGTATGCTGACCGAACAAAAGAGTCGGAAGGAAACAAACCCTCTA GTAGAACAAAACAATGGAAGCCTGTTACCAGATCCGAGATTCTTCAACAT ATAGCGCTTGGTGTACTTATGGGCATGCGCAGCCTACCGGGGATATCTGA TTATTGGAGCAAGGATCCTTTGTTTCATAACCCAGTCTTTGGTGCAGTCA TGAGCCGAAACAGGTATAATTTCTTTAACTTTCTTGTTTCGTGAATGGTA TTGAGGTTGGTTCAGTGTAGTAATTTTATATTTTAGGAATCTTTTATGGC ATTTTCTGTCATTTCCACCATTCCCACTCACGCAAATGGCAGCTTTAACC TTTTATAGTATTGTCCTCAAAGAAAACGGAATTAAACTAAAAAGACTCTT GATCACCAATTTGAGTGACGTTTTAGATACAGGCAAACACAAATCTCTCC ATAGCTTGATCATCTAAGGCTAAATAAGATTCCGAGTTATTGAGAGTCAT CTGAACGATTGACATTTTTTTTAGAAATTTATTTGTTCTAAAGTACTTTG GAAGCCTTGGTCTCTAGGCGAGCTTTTCCTCAAAAAATGTCATGCGTTTT TATCTTTGTATCTTTAGGTATCAGCTGATCTCAAAATTCGTTCATTTTGC TGATGAGAATGGTCCCGTTACTGAATCCACCAAAACGACCAAACTCCACA AGATCTTAGCCGTTTTAAACCATCTAAACCAACGGTTTAAAGATACCTAT AATCCAACAAAGGTTTTAAACATTGGTGAATTTGCTTTAACGTCTGAACG AAGTCGATGCAAGGAGCCTGGGTTTGAGCATAGTGGGAGCTTGAAATTTG TATCGCTACACGACGAAACGGGTTACGTTCTAAACACTAGTATCCACGAA GGGAAACGTCAATTTGATCCACTTACAGAAACAATGACCAAGGTGGAGCC AGAACAAATCACATTACAACTTGTTGGACCGTTTCTCAACAAAGGGCATC AACTTTACGTCAATGATGTCACTGTATCTTTAGCCAGAAACCTGATTGCA AATAACACCGGCATTTGTGGTGAGATAGCTCCCAAACACATACAAACCAC ATTCGTAGACAATTTCACCGAACAAGATTTGAACAAGGGTGAAACGACGC ATTTAACCAATAACAAGATGCTGGCTTTACGATACAATCACCATAAAGAG AAAGACAAATTCTACTTGTCGACAGTACATGCGCCAGAGCTGTCAGCAGC TACTACAAAAAGAGATCGAAATGGAAATTGGGTATCCAGACAAAAACTCG TTTTAGATTACAATAAGAATTCAGTATTAGCCGACAAACAGTATCAATCG ATTCAACAATCATCGATGGTCCGGAACTCTCACAAATGGACTACCAAAGT CGCTTACCATCTTTTTGAAATCGCCTTCTTCAACGCACACGTTCTATACA GCAGCCAACCCAAAAAATCACCAGTTTCTTACTTAGACTTTAAACTTTCT TTCGTTCGTCAAGTCTTAAGTGATTGCCCAAGATTCCTCACGATTATGGA GAACCCAACAGCACCGAATCCATCAAAATCTGGCGAAACACAGCATTTCT TGATGACGGTTCCTACAAAGAATCCTAAATACCCGTTCCCAAGTAAAAGA TGTCAATTATGTCATAAGAAAGGGAAACGTAGGGAATCGAGATACCAGTG TGATACTTGTATTGGAAACCCAGGGTTTTGCGTTGATCCTTGTTTCAAAG AACATCATCAGCAACGACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA CAACAACAACAACAACAACAACATCATCAGCAACAACAACAACAACAACA ACAACAACAACAACAACAACAGAACAATGACATCAAAACACTTCCTCCAG TGTTCGCTAAGGAACCTTTAGAAGAAAACAGCATTTTAGAAGAATGATGT ATGGTTTTCCCATTACTGTATGTCTTGCGTTACCCCGGATTGGTTAACCC TTTGTTACTAATACCTACATGACTAGTTTATTGTTGTTTTTTTGTTTATG CTTTTTTTTTGAAACTTTTCAACTGCATTCTTATATATTTTTTATAGTTA GTATTACTCTTTTGATCAAAAATTTTAAGTACTTTTGGAGACTAGTTCAG TCTATATAAACTTTTTTTACTTTTTTTTTTTTTTTCGACATAACCAATAA AGTTTTTGGTTTGTGCACTGGTGGTATGTGTGGCCCGAAGCTGCACTCCT AAAATTACACTACTTCTTTTACTCTAAAGTGAATTTATATTTGGATGTCT TTTTACAACCTACTCATTGTGATTTATGGTTTATTAGTCTTTTGTTTAAA AGTTTTATTTGCTTTTGACTTTAGACGGCACACAGGGATGGATAACACAC TATTTCAAACAGTCTTTAACTTTCCATTTGCCTATGACCAAGATTAGGCG TAGAAACCAATCAAGTAGTCAGACGACTGAAAATAAGTGGGAGTCGGTAG ATTTAAGTCTGGCATGAAATTATGGTTAATCCTCGAAATAGTAAGTTTTG GGGAAAATTTGTCCCGATAAAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000069_pilon:73916..112487-

>MSTRG.10051.2.p2 ID=MSTRG.10051.2.p2|Name=MSTRG.10051.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2412bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000069_pilon:73916..112487- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATACAATTAACTTTGTATATTGGTGCACTTAGCTGAAGATACAGAGACGA
GTAATATGGTTCGTTTACTTGGTGGTATTCCTATACTGGTATCCTTGTTG
CACCTGCTGAGAAGTGACGCCATGAAGCTTCTCTGGAACATTGGTTGCAT
CCACGCTTTTACGACAGTTATGTACAGTGCAAGAAATCAAGCAACAAATA
CGTATATACCATGGTGTACCAACTTTATTGAGTGACGAAGCAAAGATAGC
AGTCAGTGAATTAAATGTCGTGGAAAGATTACTGCAAATTATTGGTGAAT
TTGACTCGACCTCCAAACACAGACATTGGTACTGCTACTATCCTCCACAT
CTCTGGTTATCATCCACCTATCAACTTTTGCATTGATCGCACTCACCAAA
AGATACAATTAACTTTGTATATTGGTGCACTTAGCTGAAGATACAGAGAC
GAGTAATATGGTTCGTTTACTTGGTGGTATTCCTATACTGGTATCCTTGT
TGCACCTGCTGAGAAGTGACGCCATGAAGCTTCTCTGGAACATTGGTTGC
ATCCACGCTTTTACGACAGTTATGTACAGTGCAAGAAATCAAGCAACAAA
TACGTATATACCATGGTGTACCAACTTTATTGAGTGACGAAGCAAAGATA
GCAGTCAGTGAATTAAATGTCGTGGAAAGATTACTGCAAATTATTGGTGA
ATTTGACTCGACCTCCAAACACAGACATTGGTACTGCTACTATCCTCCAC
ATCTCTGGTTATCATCCACCTATCAACTTTTGCATTGATCGCACTCACCA
AAAGATACAATTAACTTTGTATATTGGTGCACTTAGCTGAAGATACAGAG
ACGAGTAATATGGTTCGTTTACTTGGTGGTATTCCTATACTGGTATCCTT
GTTGCACCTGCTGAGAAGTGACGCCATGAAGCTTCTCTGGAACATTGGTT
GCATCCACGCTTTTACGACAGTTATGTACAGTGCAAGAAATCAAGCAACA
AATACGTATATACCATGGTGTACCAACTTTATTGAGTGACGAAGCAAAGA
TAGCAGTCAGTGAATTAAATGTCGTGGAAAGATTACTGCAAATTATTGGT
GAATTTGACTCGACCTCCAAACACAGACATTGGTACTGCTACTATCCTCC
ACATCTCTGGTTATCATCCACCTATCAACTTTTGCATTGATCGCACTCAC
CAAAAGATACAATTAACTTTGTATATTGGTGCACTTAGCTGAAGATACAG
AGACGAGTAATATGGTTCGTTTACTTGGTGGTATTCCTATACTGGTATCC
TTGTTGCACCTGCTGAGAAGTGACGCCATGAAGCTTCTCTGGAACATTGG
TTGCATCCACGCTTTTACGACAGTTATGTACAGTGCAAGAAATCAAGCAA
CAAATACGTATATACCATGGTGTACCAACTTTATTGAGTGACGAAGCAAA
GATAGCAGTCAGTGAATTAAATGTCGTGGAAAGATTACTGCAAATTATTG
GTGAATTTGACTCGACCTCCAAACACAGACATTGGTACTGCTACTATCCT
CCACATCTCTGGTTATCATCCACCTATCAACTTTTGCATTGATCGCACTC
ACCAAAAGATACAATTAACTTTGTATATTGGTGCACTTAGCTGAAGATAC
AGAGACGAGTAATATGGTTCGTTTACTTGGTGGTATTCCTATACTGGTAT
CCTTGTTGCACCTGCTGAGAAGTGACGCCATGAAGCTTCTCTGGAACATT
GGTTGCATCCACGCTTTTACGACAGTTATGTACAGTGCAAGAAATCAAGC
AACAAATACGTATATACCATGGTGTACCAACTTTATTGAGTGACGAAGCA
AAGATAGCAGTCAGTGAATTAAATGTCGTGGAAAGATTACTGCAAATTAT
TGGTGAATTTGACTCGACCTCCAAACACAGACATTGGTACTGCTACTATC
CTCCACATCTCTGGTTATCATCCACCTATCAACTTTTGCATTGATCGCAC
TCACCAAAAGATACAATTAACTTTGTATATTGGTGCACTTAGCTGAAGAT
ACAGAGACGAGTAATATGGTTCGTTTACTTGGTGGTATTCCTATACTGGT
ATCCTTGTTGCACCTGCTGAGAAGTGACGCCATGAAGCTTCTCTGGAACA
TTGGTTGCATCCACGCTTTTACGACAGTTATGTACAGTGCAAGAAATCAA
GCAACAAATACGTATATACCATGGTGTACCAACTTTATTGAGTGACGAAG
CAAAGATAGCAGTCAGTGAATTAAATGTCGTGGAAAGATTACTGCAAATT
ATTGGTGAATTTGACTCGACCTCCAAACACAGACATTGGTACTGCTACTA
TCCTCCACATCTCTGGTTATCATCCACCTATCAACTTTTGCATTGATCGC
ACTCACCAAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10051MSTRG.10051Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10051.2.p2MSTRG.10051.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.10051.2.p2.exon7MSTRG.10051.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10051.2.p2.exon6MSTRG.10051.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10051.2.p2.exon5MSTRG.10051.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10051.2.p2.exon4MSTRG.10051.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10051.2.p2.exon3MSTRG.10051.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10051.2.p2.exon2MSTRG.10051.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.10051.2.p2.exon1MSTRG.10051.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000069_pilongenomesc0000069_pilon:73916..112487 -