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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000068_pilon:893256..901333- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.10002.1.p1 ID=MSTRG.10002.1.p1|Name=MSTRG.10002.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8078bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000068_pilon:893256..901333- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATCGAGCAAAGACGTAGATGATCTTCTGAAAGTACGATTCCAATACAAC
GAAAAGGACGGCTCAAAACAAACAAGATTTATTTTACAGAAATTGACCGA
TTTCATTTTCGACGTTTCACAATCTCTAGATGATTTTAACAAAAATGAAG
AGCTATGGCAAAACTATTTCAGGTATAATTTTTCTGTTGAAATATTCAAT
TTTCAATTTTCAATGATCTTTATTATTGCAAAGAGCTCAATGAGAGGATA
TAAGTCATATTTTCCAAAATTAGGTGCCCGCTAATCCTTTAACCAAATAT
ATTCCAGACTAAAAAAATAAATTATTTTTTTTCCTTCAGGATGGCGTTTA
CTCTTTCAACTTCCATTTCATCTTTGGGAACGTAAGTCAATACAGTTGAT
GTCCTCTGATTCGGCATTCTGTTATTCGATAAGCTCCCATTGTCAATCAA
CTAACAGTCATTTGACAAATTTCTCCCTGGGGTTAGGGTAATTAAAATTC
ACGATTTAACGATTTAAGATTCACGATTTGCGATGCACGATTTGCGATCC
ATGTTCCATGCAAATATTATGTTGATTCATGCCCCCCGGGATTCATGCGT
TATCATGTTAATCATGACAAAATATTTGGCAATTTACAAAGTTTCATTCG
CAGAAAACAACGACAAACTCAATTATTTTTAAAAACATAATTTATGTAAG
ATTATACAAATTATATTCAACGAAGCATTCATCGCATTCTCCCGACTGTA
CTATGATCCTTAAAAATAAAGTAAAGCACGTGCAGACATTTTCTCCGCTC
TCTTTGTACATATCTGTTGTTTACTTCGTCCATTGCGGTCCGCAAACCAT
GGTGCCGAATATTGTTCGTCAGTATATTGTGTAGTCTAAGTAATACCCAA
AGGTGGACAAAGGTGGTCTAATAGATTACGACGCCCCTCAAAACAACATC
ACAACTACTGTAGTCTAAGTAAGTCTGCGACCGCAGTCGGAGGCGACCCG
AAGGCTCCTCTTTCGATAGCTATCTACCCGAAGGTAGGGGAGGGCGCCAC
TCTTTCTCCCTGGATTTCTCCACTTACCCTTGATCCTTCTCTTAATTGCT
GAGCATCAAGCAGAGAGGCATCAAGTACCATTTTGGGAATCTTTGGATCT
TTGGTATGACCCGGCTGGGGGTTGAACCCACAACCTTGCGAACCGTAGCC
GGATGCTCTACCACTGTACTACGGTCGCTGTAGTCTAAGTAATACCCTTA
ATTAGTTGTAGCTTTATTACTTACTTATTAGTTTTTCAGCTGTGATGAAG
TTTTTATAAGATGCGCACATAATTGGTTATTCAAAACGATAGAGATAGCG
CGTTCTTTAGAAAAATATAATAAAAGTTTTTGTTTGAATAGTTAATGACC
ATTCCAATGACAAAAATTCTTGTAAAACAAAAACCAGAAAAGATTATGCC
ATTGTTTTGGAAATGTGTTACATAATTGCCACCGCAAAAAGCCTAAAGCT
TCCGAGGATGGCATTCATAGCTTCACGCATAATGAAGTTGGGCAAACATC
TCATAATTTTGCGCGCGTTTTTCAGTATTTTAGTTCCGGTTAAATGATGT
ACCGGTAACATTCTTAGCTTGACTGTATTTCTATTGTTTTATCATTATTA
GAAACACTTTTCCGGATTATTTTTAATCTGATTACCCATTTTCAAAGCTC
TATACGTCTTTTTTTATTACCACAGGGAGTCGAATTAAGGGAAATTCCTT
TTTTGTTGGGAAATTCCCTATTTAAACCACAAGTACAATCATGGTCGAAA
TAGAATGAGAATTCCGGTTATTTTAACGTTTTTCAAGATTTAAAGTTCTG
GCGAGAAAGTCGATTTTGGGCTATCTCTTTAACTTAATCGAATATTTCAA
TTTGGGAGGGGTTAGCAGACTTCCAGGCTATATTCTGAGCCTTTTTGGAC
TATTTTTGAACTTTTGGATCATGAGTCTTAAGTCTAGTGTTAAAGCTCAA
AGTTAAAACTCTACCCTTCAAACCTACTTTAGAGCACTTACAAATCGATT
GTGGTTTCAAAACTTCCCGGTGGATTTCCCTTTTTTCTCAAATATTACTA
CCATGATTGTAGTTATTAACCGCTCTGAGCAACGCAAATTAGAAATTTTT
ATCCTTTCAAAAACTTGTCGTTTGACTATTACAGTAAAGTGGCAGTTTAG
AACAGTAGCGTTTAGTATGATAAACAAAGCATAATATACCATTATTTTGG
TAATAAAAGAGATGACAAAAAAATAAACAGATAAATAACTTTACCTTATC
TCTATAAGAAGATATTTATGAGATGGACACAAATTGCTAATATTTGTAGA
CTAAATTTTGCTTCAGATGAGATGCCATTCTAACAGAAGTAACGGCTATA
AGTAACATTTTTTTTTCAAATTCAACAACTTATTTGATCGTTCTTCTGCG
GTGGCACTTTAATGAAAATTATGGCTAGTTTAAGTTTTATGTAAATCGTT
AGATCGTCTATCTTAAATTGCACCCAAAAATAACGCCAATAAGGGCCGGT
GTAAAAAGGGCCGATAACGTAATTCGGAAGGAGATAAATTTGAAAACGGA
GTTTAGTTCGGGAGGTTCGACATTCTTGAAAGATTCCCTATAAAGATCGA
ATGTTCTGCTTCCTCGATTTTGCAATACTATATAAACTTCAAGTGTAGAA
AAAAACAACCCTCGTTCGCAATGCAATGTAGTATTTCAATCTCCATAATT
TTTTTTTTGCCTTTCTGAAAGGTAAAGCTTCTATCGATGATATCTATTAA
TAATTTCTCCTGCATATAGCAACAAACGGGATGGCAAAACCATGGAAAGT
GATGGAACTACGCTCAGTTTTGGTGGTAAGTTTGATTCGAAATTTTGTTT
TAATATACGGTAAATTTTATAAATTTTCCACTATACAATCAAAAGCTCGC
GAGTACCCAAAGCGAAACATCCTTATTTTCTATTTGGTGTTCTATATTCT
CCGAAAAAAAAATTTTGGAATATATGATAATGGTAGGCCAATCTATATCA
TATGATTTGTACATCTGTTACATAATATTTTCTATCCATGATTTAGTTTG
ATTTTATTTCATCATTCATTTGATTCAATGTTCAAATCATAATCTCATTT
CTTTGACAGTAGTGAACAAACAGACGATTAGACACTGCCAGACAACAAAG
GGCTAACCATACGAGATTTTATCTGTTTCAAAAGGTTTGGTAGAGATGCC
TGCTATGCCTGGATACTTTAAAAACTTAAGCATATACGAGCCTGACCAAG
GGGGGACCACAGAGTGTATTGCATACACTTGCTTATAAAAAACATGTATA
TCCACCACGCGTATTTCACTTCATTTCTCAATAGCATTTTCCAATCACTA
GATACAGTATCCTAGGACTGATTTAGTTAAAAGGGCAACTTTGAGCCGGT
CTGTAAAATACACGATACCAGCAGGTCTCAAAAATTGACCCTCTGTGCTG
CCTCAAAAATACTAGACAGGAGACCCGCCCTGTATTTTTATAATCTGATA
TATACAGGACGGGTATGACCTGTGAGACAGATTTCTGCCTCAGAAAAATT
TACAGTGGGAAATTCGAATTTAGCGTTGTCCTCACTTACTAAAATAAAAG
CCAAATTTCGGAAGTTGCGTTTTTTCTAAGAAAGTGTAACCAGTGAAAGA
ATAACAGATTGACTATGTTTTTAACCGTCTTTAAAATCTTGGAAATTCAA
ACTCACAGCCCAAACCATGCTATATTTTTCACCATCAGTATATAAAATAA
GAAATCATAGCATTGATCTCCAGGCTAAAAAAATAAATGTCACTGGACTT
GTCCCACAAAATTTGAGCAAAAAAAAATGAGCAAAATTAGAGGGGGTCCT
ATTTTCGGTATTCTCAGAGACTGATGACGTCACCCCCTCCCTCCAAGATG
CTCAAGTTAAGGTTTAACGTTTTAGAAACAATTTGAGAATATTTTAAGAC
TAGAAATTTAAAATTTACCATTTTACTTTGTAAGATATTTCAATGGCCTC
ACTTGAAAGGATTTTTCTCTTATTACGAAATGGGAGGGACACAAAGACAA
TCAACTGAAGTCATAATAAAAGAAATGTTAATTTCATCCTCAAGGGAACG
ATTTAGTCTTTTTCTTCTCCTGCTAAAAATGAAAGTTTCGTGCGTTTGTT
TCATTTGCTTTTTATATGTGAATGAATAAATTTGAACGAAGAAATTTCTA
GATCCTTTAACCTTTCATTTTCTGAACCTCTAGTGTTGTATAATTTAGTG
AAAGTACCCGTGCAAAATTGAATTTATTCAAGCTAAGATTTTTTTAAATA
AAACTAGTTTAGCTTGCAGCTTTATTTGACAATTTGAGAAACACATTACA
TATTAGCACTTCTATTTTTGTATCTTTTATCACAATTTCGTGATTCTTTT
TAAGAATAAGGAATAATTTTTTCGGATTGCATTTCAAATAGTTCGTGTGT
ACTTTTCTGCGTTATCTTTGCTGTTTGTGTTGGATTAGTTCACGCAAAAT
TTCACTTTTGACAAATAATTCTATTTTAAAAACTTTTTCGACTTTTTCAC
ATTTTGAGAAATTTTTCGTGGAATTTATTTTTTCTCAGAATGCGATCGAG
TTTCGTTTTCTGCATTGAAAAGATTAATTTCCTTCTGAACAAAAACTTTT
CAACAAAACCAAAAAATAATTAGTTCATCAATCTGGAAATAAATTTCCAA
TTCCGTTTCCAATTTTTCAGCTTTGAATCTTCTTTTAGTTTTTGAGATCT
AGATCTTCATTTTTTTCTAACTTCAGTTTTTTTACCGTCACAAATAAAAG
TGATTTCTCGCTGAGCAAAAAGTTTTCATTCAAAATTCAAAATTTTTTCG
CCATCAATTCGGAAATATTTTTCTCGTTCTGTTTTCAAAATTTCAGCTGC
AAAGTATTTTTGGTTCCTGAGATATAACCGTACATCCTGTGCCCAAGTTC
AGGAGTTGCCATAAAGCCATTATGGTAATAACCGGGAGGGCACATTGCTA
TACATTGCATGGTTCCTGAGATATCGAGATTCATTTTTTGTTGAATTTTT
TTATTTACACGCTTTTTTTTTTATAAGAATACACTTTATAAGAATGTCCA
TGATAAAAATGGCCAAAAAATTAAGAATATGGTAAGAATATCACCATCAT
GGAATTTAGCAACTGAACCTAAGAATGCCATTTTTAATGCATTTTAACCT
GTAGATTGCCAACTTCGATCTTAACATAAGAATACCGTAAGAATTTTTTG
GATGATTTTCTCCAAAAAGTTAAGAATATCCATGATGAAATAAAAAAAAA
CCATTCTTATAAAAAAAAAAGCGTGTACTCCGTGAAAAGTTTGAGTTTCT
TCTTTTTTTCTTCAGATGTTTGGAAAATTTTGCTCGAAAAGAAATTCGCG
AAATTCGAAGAAATTTTCCACCAAAAACCGAACATCGTCAACTCGTTGCG
TGGTATTTATGATCGGACACTTCTCATGACGGCTGTTAATGATGATCGTT
TCGACGTTTTTGTTCACTTGATGAAGTATCCTCAAGATTTTTCACTCGTG
AGCAAACAGGGTTACAACGTTCTTCATTTTGTTGGTTGGTATGGAAAAGT
TCGTCCTTTGGAAATGTTTGATCAACAAACAATCGAAAAGTTGATCGATG
GAAGAGACGAAGAAAACAACACACCGTTGTATGTTGCAGCATTTTTCAAC
AATCATGACGTCATCAGATGGTTGTTGGCCAAAGGAGCGGATCATGAATT
GAAAAACAAATTTGGTCAACGCCCTGATGAAATGGATGAATGTGATGATG
TTACCAAAGAAATCTTTCGATCGTTTCGTTTGTCTTGGTAAGTAAAATAT
CAACTTTTTCATGATTTTTAAGGATTGAAATATTTTCGATATCAACTTTT
TCATGATTTTTAAGGATTGAATTATTTTCGGAGTTTAAAAATTTTTATTC
TATTATTGCGAGAAGTGTTGAAACTTTTTTTTTATTTTTTAAATAGAAGT
GAAAAGTCTTTAAATTGTTCAATCGAATAAATTTTATCTTTTCGGAGTTC
GAATGAATGACACGGATGAATTTTCGTTGCATTGGAGCAGACATATTTTG
GAGATGGTTGAAATTTGCAAATAGATGGTTGTTTGTGGAATGTTTCTCAA
GTTGTCATGAATTTATTTTTTGGTGAAGAAAGAAATTGTCGTTTTTTGAG
TTTATCGATCATTGTTCATGTGCTTCAAATGTTTTTCATTCGATTATTTA
TTTTTCAGATTGATTGATTGTTTCCATTGTTTGTTTCATCGTTTCCAATG
ACGTCATCGGTTCCAAATTATTTCCACGTAAGTATATTTAATCATGTACT
TGGTTTCCGGCTGATGTGAAATTGCCTGCAGCTTAAATGTTTCTGCATAC
CGGAATTGTTTGAACAAATGAACCTATTCTAAAACTTAGAAATGAGGGCT
TGGTTAGCCTGTACCAAACTCTTCTTGGTGGTATAATATGTACAGTTCGG
GCTTTTATGTGACTGAGAAGAATCCACTCAAGTCTCGGTTGTATAGAGTT
AAAAGATTTTTAGAATTTAAGCTTCTTTAATTAGGCGAGACCAATTAATT
TGTTGTTCTGCGGGCCCGACCGACCCTATTTTTGCTAAAATCAAAAAAAT
GATAATATTGAATTTCCACTACAATATATTTTACACACTAGTTATTTGTA
AGAATTAACCTTGAATAAAACTGAAAATTTATTCAAGAAATTGAAAAATC
ATAAAAAGCATTCCATACACTAAAATTTTATTATGATCTTCATCGAAGTA
AAAAACAAAGTGAATTTTTGATCCAGATACTTTTTGGAAAATTTTCTCGG
TACCTTACCGACCTTACCAACCCTGATAAATGAAAAATTTATTCTTATTT
TGCCGACCGACCCATACTTCTCCAACGATCTGTCCGTAGAACAATAAATT
AAATTGCTCTCGCCTTAGTCGAATAAATGCAATTGTTTTTGTACTCGGTG
TGTTTTAAACTTTTCCACCACATCAGCATTCTCATTAGCCGCTTCTTTAA
AAAAACCATTTATTCACCTTCGAGTTAACAAGTTTCGTTGTGCAATTAAC
CTCCAAAATTTTCATTTTTTTTATTCTTAGATTCCCAACATGACAGCACG
CATGAGAAGTTACACCCGTCATTTTTGACGCCGTTTCTACGATTACGTTA
TTTATTCATTCCGTCTCTACAGTTCTGTTTGCGTTCAAACATTACTACCT
TCATTTTGGCTTGTTTTTAGATGTATTTTTACCACTTCACTAACTTGACT
ATTATTACGTCAACCGTCACTAGTTTTGGTGGTGTTTATTCTTACGCCCT
AGCGTTTTCACCTTATGGGTTACCTTGGATGAATATGAAAAAGAGTGCAG
TGCTAAAACTCATGTCGCTATTGATTTCGATTGGATCATTTTCCTTGTAA
ATATCCGACTCCACTCGGTGAAATTTTGTTCAGTCAGTCAGGGAAAAAAA
TTACTATTTAAAAAATACTATTTTTAGTGGAAACCCTGTCAACAGTGGCC
TCCGCGAAAATATCAATTTTTCTAACCTTTGCTCCCAGGATTTCTTTGTA
TGGTTTACATTTGACACCTCTACGGGTGACGCAATCAAGGTTAAGTTATC
TAAGTGGCAGTCAAAGCTTTTACGGTCTTTTTCGGAAGAGCCTCATGGGT
GGTAAATATTTGAAGGTTTTAATTTTAAAATTTCGGGGTTTTAATTAGTC
GGGGAAAAATTTCGTCACCTAGAGGCATTTTCGTCACTTTTCCCCGACCA
AAATTTCAAATTCATCACTTTTCCCCGAACAAATTTACAATTTAGTCACT
TCCACCCGACTGAATTGCCCAAATGAAATGGAAACCATTAGTTCGAAAAT
ATTTCTCATAATTCGACGTTTAAAGCACTAATTTAGGTTATTAAAGGCGT
AAAACATTTGGATTTGAATTTTGGTTGGGGAAAAAAAATCGACTAAAAGT
TTTGGTCGGGGATAAAAAATTCGGGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000068_pilon:893256..901333- >MSTRG.10002.1.p1 ID=MSTRG.10002.1.p1|Name=MSTRG.10002.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2232bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000068_pilon:893256..901333- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATGTTTGGAAAATTTTGCTCGAAAAGAAATTCGCGAAATTCGAAGAAAT
TTTCCACCAAAAACCGAACATCGTCAACTCGTTGCGTGGTATTTATGATC
GGACACTTCTCATGACGGCTGTTAATGATGATCGTTTCGACGTTTTTGTT
CACTTGATGAAGTATCCTCAAGATTTTTCACTCGTGAGCAAACAGGGTTA
CAACGTTCTTCATTTTGTTGGTTGGTATGGAAAAGTTCGTCCTTTGGAAA
TGTTTGATCAACAAACAATCGAAAAGTTGATCGATGGAAGAGACGAAGAA
AACAACACACCGTTGTATGTTGCAGCATTTTTCAACAATCATGACGTCAT
CAGATGGTTGTTGGCCAAAGGAGCGGATCATGAATTGAAAAACAAATTTG
GTCAACGCCCTGATGAAATGGATGAATGTGATGATGTTACCAAAGAAATC
TTTCGATCGTTTCGTTTGTCTTGGATGGCGTTTACTCTTTCAACTTCCAT
TTCATCTTTGGGAACATGATTTTAACAAAAATGAAGAGCTATGGCAAAAC
TATTTCAGAATGTTTGGAAAATTTTGCTCGAAAAGAAATTCGCGAAATTC
GAAGAAATTTTCCACCAAAAACCGAACATCGTCAACTCGTTGCGTGGTAT
TTATGATCGGACACTTCTCATGACGGCTGTTAATGATGATCGTTTCGACG
TTTTTGTTCACTTGATGAAGTATCCTCAAGATTTTTCACTCGTGAGCAAA
CAGGGTTACAACGTTCTTCATTTTGTTGGTTGGTATGGAAAAGTTCGTCC
TTTGGAAATGTTTGATCAACAAACAATCGAAAAGTTGATCGATGGAAGAG
ACGAAGAAAACAACACACCGTTGTATGTTGCAGCATTTTTCAACAATCAT
GACGTCATCAGATGGTTGTTGGCCAAAGGAGCGGATCATGAATTGAAAAA
CAAATTTGGTCAACGCCCTGATGAAATGGATGAATGTGATGATGTTACCA
AAGAAATCTTTCGATCGTTTCGTTTGTCTTGGATGGCGTTTACTCTTTCA
ACTTCCATTTCATCTTTGGGAACATGATTTTAACAAAAATGAAGAGCTAT
GGCAAAACTATTTCAGAATGTTTGGAAAATTTTGCTCGAAAAGAAATTCG
CGAAATTCGAAGAAATTTTCCACCAAAAACCGAACATCGTCAACTCGTTG
CGTGGTATTTATGATCGGACACTTCTCATGACGGCTGTTAATGATGATCG
TTTCGACGTTTTTGTTCACTTGATGAAGTATCCTCAAGATTTTTCACTCG
TGAGCAAACAGGGTTACAACGTTCTTCATTTTGTTGGTTGGTATGGAAAA
GTTCGTCCTTTGGAAATGTTTGATCAACAAACAATCGAAAAGTTGATCGA
TGGAAGAGACGAAGAAAACAACACACCGTTGTATGTTGCAGCATTTTTCA
ACAATCATGACGTCATCAGATGGTTGTTGGCCAAAGGAGCGGATCATGAA
TTGAAAAACAAATTTGGTCAACGCCCTGATGAAATGGATGAATGTGATGA
TGTTACCAAAGAAATCTTTCGATCGTTTCGTTTGTCTTGGATGGCGTTTA
CTCTTTCAACTTCCATTTCATCTTTGGGAACATGATTTTAACAAAAATGA
AGAGCTATGGCAAAACTATTTCAGAATGTTTGGAAAATTTTGCTCGAAAA
GAAATTCGCGAAATTCGAAGAAATTTTCCACCAAAAACCGAACATCGTCA
ACTCGTTGCGTGGTATTTATGATCGGACACTTCTCATGACGGCTGTTAAT
GATGATCGTTTCGACGTTTTTGTTCACTTGATGAAGTATCCTCAAGATTT
TTCACTCGTGAGCAAACAGGGTTACAACGTTCTTCATTTTGTTGGTTGGT
ATGGAAAAGTTCGTCCTTTGGAAATGTTTGATCAACAAACAATCGAAAAG
TTGATCGATGGAAGAGACGAAGAAAACAACACACCGTTGTATGTTGCAGC
ATTTTTCAACAATCATGACGTCATCAGATGGTTGTTGGCCAAAGGAGCGG
ATCATGAATTGAAAAACAAATTTGGTCAACGCCCTGATGAAATGGATGAA
TGTGATGATGTTACCAAAGAAATCTTTCGATCGTTTCGTTTGTCTTGGAT
GGCGTTTACTCTTTCAACTTCCATTTCATCTTTGGGAACATGATTTTAAC
AAAAATGAAGAGCTATGGCAAAACTATTTCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000068_pilon | genome | sc0000068_pilon:893256..901333 - |
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