MSTRG.19688 (gene) -

Overview
NameMSTRG.19688
Unique NameMSTRG.19688
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000228_pilon:453179..464689+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.19688 ID=MSTRG.19688|Name=MSTRG.19688|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=11511bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:453179..464689+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCGGCTATAATATTCGCTAGTCTAGCTCCTACACACCCTGGGTCGACCG AAGGCGACCATCTTGTTTTGATACAGAAACAACAGTCAACGGTCAACGAA GGCTGACATCCTCCTTTCTTTTTCTGGTAAAAACTCACTATAACCATGGG TGAATACTATGAACCAATCGCTGATGGAGAAAAGGTAATTGATTTAAACT GACTAGTAGAagctttaaattttattttatcctttaaatATCTCCTGGCA GCAAAACCAGCAGACCAGgcttagttaatcgatataatcgataatcttaa gtaatcgataaataatcaataagtaatcgatGGCCTAGATATCGACTAAC CGacagaatcgataggtaatcagaccttcaaaaaatcttgagtatcgatc agcgaTGGATTTTTTCCAAGCTATCGATTATATACTTATTATAgatcaca tatcgactacatacaagattatcgattacttatcaatcatgtatcgattg ttaacaatcattgattacttatcgttcatgcattgattacttatcaatta tttacttatcttcgatcacgtattgttatcgattatatcacgtgcgtttg cgtagggtaaaatggcgaaatgcgaaaatattttggcaaaatttttttga aaaatgaccctacaagatttgactatatctttttatttcatgaagagatt actttcaaataaaaaatatatttggggtGGGGGTAAAATGGGGCTATCTT CAAATCATGCTGTGCTAGAGtttttttGATGTGTTTCTACTCGAATAACa ataatctgaaaatttttttcaatttcatgcatttttcagGAATTGCCGGA CCAAAAATTGCCAATTTTGGTCCTAAAAccccaaaaatagcaatttttgt cattttactGGTATTTATCCTTACGTTCATGATCCCACATGAAGCCAATT AGTATTCAAAGTTGTTTAAATATAATTTAGAAGTACTTAAAGATATAATT TTGGTGCTTTCAACACCTTTTGGGACCAAAAATTaggcaaatttcagcca aaaactcaaaaaaaggtaattttttatcaattttgccATGTAAAAGTTGC TTAAATGCATGTTATAGGCCTAAAACTTGCCAttcatttcaaagaaataa TTGATGCATCACAGGGAGTCAAGATTAGGGGCCTCTgggtatagaatggg ctttAGAGGCTTAATTAAGCTAAATAAACAAGAAAATCAACtgtattttc tataaaaatgtaaaatataaagTTCAAAGCTGATGccgatttaaatattt tcaaatgaatttttgattcattttgctaaaaattattaagatttaatata tatattatttaaatctataataattCTGATTGAGTCCATCACATTCGTAA AGTGTGTTGATCAAACGCAAACAATCCTGTTTTGCTGTTCATCAAATGAA AAGTCTTTCTGGAATCTGCAGCCATATCCCGATCACCTTCTATTAAGAGT AGATCGTCAaatggcaaagtcaaaaaattcaaagtgtagtatttttttgt gaaaattttaatctattttaagacattttgcgcaatttttaacctcctag gtcaaaaatccagcattccccaaAGGGGTCTTTGATTTgcactaaagcga aaaatgagtaaaaatgacatttttttgcccattttaagactataaaaggc caggaaagggtcaaaatggtttctaaatggtgtcttgtactaatattcaa cacaaaaagagtAAAGAaaccccagcgagatcgctggatgtttcaatttc aggctaaaaaggctgattttctccgactctgggtagcaaaatgcacgaaa gcagcatttttgaggacccacaacttttaaactttttaaggtacaccAGG CTGCATCGTTTGAGGCGTGtgatagcacgcgcacacctccacacacactA AAATCTTTGAGGAGAGTGATTAATCACACGccataaatttggattttact acttaaagttatgcatagcactccttatcacacgcctaaagtacttttta ggaGTGCGATTGACCACACTcctggaattttcaaatgacaaagcctggac tacacacttgaaattttcagcaatgaaacatttcagagaaagctccagga aaaatcaatcttgagttctcaaaaatttcctataaaatccataatggcgc cctagaaattaagttttcatgctaaatgtcaatatttcaagctaaaattt ggttttcttgggctaaaatctcaaaaatgatttcaaatgatgtcctgaaa tctttggcTCTtcgaagtattctgaaaatactctggaagaatcaaaatgg tttgggtcagagaTTTGCCCAATCTGCCATTAtagtattgcatttcccac tgaaacgcgatatttagagttaaagtctaattttctcaggctaaaatctc aaaaatggtttcaaatggtgtcctgaaattttttggtgttgaaagtattc tgaaaatactctgggagaatcaaattggtttgggtcagaaatttgcccta gtctgccattatggcattgcatttccaactaaaacgcgatatttagagtt aaagtctgattttctcagggtaaaatctcaaaaatggtttcaaatggtat cctgaaatcttttggtgttgaaagtctTCTGGgtatactctgggagaacc aaaatggtttgggttagaaagttgccaaagtccgccattatggaattgca tttcccactaaaacgcaatatttagagctaaactctaattttctcgggct aaaatctcaaaagtggcttcaaatagggtcctgaaatctttcgGTGTtgA aagtattctggaaataatctgggaaaaccaaaatggtttgggtcagaaat ttgccaaagtctgccattatggaattgtatttcattctaaaacacaatgt tttgagtaagcttgagtgttcttcctaaagaaataaataaaaaagCccaT TCTATACCCAGGTCTACCCTGGTCTTGACTCCTGTGATGCATTAATTTCC TTGAAAGGAATGGCAGTTTCAGGCCCTGGCATTTAAGAGCAACTTTTATA TaacaaattgacaaaaaatTAccTTttttgagtttttggcccaaatttgc ctaatttTTGGTCCAATAAGGAGTTGAAAGCACCCAAATTATATCTTAAG TACTTCTAAATTATATTCAGACAACTTTGAATACTAAATGGCTTCATGTG GGATCATAAACAAGGAGAAATATCAGTAAAATGACGAAAATTGCCATTTT TGGGGTTTTGGGACCAAAATCGGCAGTTTTTGGTCCGGCAATTCctgaaa aatgcatgaaattgaaattttttttcagattattgttatttgggtagaaa aacatcaaaaaaactCTAGCATAGCATGATTTGAAGATAGCCCcttaaaa atgttgttttaccCCTACCCCTACGAACAAACAACCAATATAcaaccttt ttgttttattggtgGTGTAGATGGCAGCATACCATCTACCAGTGACTTCA CTCTCTTTTGTTGGCGATGCCAGGCCTTTCCAGCAATTCTTGAGTTTTTG GATATCactttcatcatcagtttcATCTTCGGACATTTCGCTCTCTTCAG ATTCAAATTCCTCCCCTTCCTGATGACGAATCCTCCTCAAACAATCGTTT AGAGATTGAATGTTGTTTGGGTGGTAATGTCATCAGTGGTTTGATTCCAT TAACTTTACAGCTTGCTTTGCTGCAAACTGAACAATAATGCAATAGTGCA ATACTGGGTACTGCTTTAATCCTAAAGCCAAGCATTTTTGTTGCAAACAG GTACATTGAGTTTTGCATTTCATGAATGTTTCCCTGATCTActctctctt ctttgcttcttctttttcagtttccttcttcagtttctcatccctgattt ctttgaccttggttgctacaCCTTTAGCCCTTGTCAAGCCGTGTACCTAA GTCACCCTTTTAGTGGTGGTTGCTTTCTTTTCTTCGTGTGGCTTGACCCT TTTTATTGTCAGAAGGCCAGGAATTTCCTCCAGTTGGATGCTTTTTTCTG CCATCTCCCTTATCAGGGACTGAGCCTGGCCAAATTTAGCCTTCCAATAA TCACGAgaaccttttcttttgtcaGAAGGAGACATGATGAGTCTGGAGTT GATGTAGATGTTGATGGAGGGATTTCTTCTTGTATACATCAGAATCAATT CCAATGACTTTTTGGAAAAGAATAGAataaagagctcataaaaaagtagc tgttttttttcgttttcccattatttattcagagagtttatttcttttcg gctgttttgtttataACTTTCTCATACCGCTTACCTAAATGTTagccaat ttttatttaaagtcgtccTAAAGCGTTATAACACCCCTCTCTCATTGCAT TCTCGATAAATTTTTTCGATCCAAAGAGGGGTTCgccatttccaaactcc tttccaacctcgagttatcgcattctttttgttttgtttttgtcgcatca gctgaaaatggctaaaaattcagccaaatttaaaagtccttttcaagcct tataaaccctcccatctcattccccataaaattcccgatctaaagagggg tcaacgacctctcaACTCTTCTTCAAACTTGAAGTTTCTCCCAAACCCAT GACGTCAATGGGTCCCTTTACCCGTAATgttatcaacggtcaattcgcga attttggaattttgaaattttgaaattttgaaaaataccttatgccccaa gggtcccaaaaaataaaaaaacgtcaattttttccaaggggaAGTGggtt ttaaatttgcgaaagattgacactgcaacgacttcgtcttaaaaaaagct aattttcacgaaattttcaaagttgaaacattccagaggctaaacacAGA GGAGTAGCgacgaaaaaaatcgtgaaaaataaaaactgaatttcattttt tgggcCTGCAtattattgtaaattttgtaaattttgcttacacgcatgcg tttgccaaaagagtcgcactccaCTCGCttacgctcgctccgtgcgcaat aatgagttttaaagctagtttgttttgctacaaCCGGGCCTTTGAATAAT CTGaagctactgaagttgagcccagtgcgctgcgcacgttcgactatgcA GGACTAATATACATCACTCAAATATTGGTTGGTTATTTCTTTAAatcttc tttaatttttttatttctggtcCATTTTAATCGATAACCAACCGCCGTCT TCATCTTTCTATATGTTTTTGATGTAATTATTACTAACAAATAGATTATA CAATTGTTAAATTCTTTCTTGCTGCACTTTTGAGATGGAACTCTTAACAT CTTTTAAAGGTTGATGAAGAGATTGgtaacattatttttttcagctGAGG ATATGTTCCAGTTTTATCAAGCATGCACCTCCAGGAGAATTTAATGAAGT TTTTAATGGTAAGATAATTAATTATAGCAGTAGTTATATGCTAAGCTGCT AAGGAGGGTTTTTTGAATCACATTACATTCAAAACCAACCTGAATGATTT AAACCACTGATGATATCTCCAGATGATAATGGGTAAAACCGTACTGTACC TTAGACTGCACGCATCCcctttgatatgttttgatataggggatgctaaT TGTGTATGAAATTCCCATCAATAATCCAATAATTGTTTTAACCTAGGGCC ATTCAAATTTTGGattaaattcaatgaaatttaaagatcaCTCATATAAA ACATACTAACCAAGCTAATCAAAAGCACAAAGACAGGTGTAAATCTTGGA CGGTAATTTTATACATGAcgcgcatcccctatatcaaaacatatcagagg gtgTACCTTAGCTAGCATTTAAGAGGAAAGACCAGTCTACAATCATGTAT ATATACATGTTACTTTTCATATAATACAACCCAAGTTTATAGGGGTGTAA TGCTCTCCCCCTGTAGTAATTGTTTGCTACATGTCATCCATTTATTTTTT GGTTACAGACCTTCCATTTATTGTAGAAAGAAGAATTAGAGAAACTGAAA TTGTGActtgaattttcatttaaataaaATACTCATCTTAATCTTTTCTC TTATAGATGTTCGAGTTTTATTGGACAATGATCAACTACTTAAAGAACAA GCTTCTAGGTTTGAGAAAATATTTCTAatgatttattaattttctgTCTG ATATTGATTATAAGTGCAGAGTTTCTATTCAGGTGCTATTTCCATCcctt ttctttgaaatgaaggaTTATTGGTTAGATTTGTTCTATAggttttaaac ttaaaaaaaaggtATATATTTTTTGCCTTTCAATCGTTGTTATAGATAAA TTGATTCTCTTATTCTGTTAATCCGTGTGAACTAATTGTTACCTTTTATC AAAATGAGTCATTTCTTTGGAATAAGGGCCAATTAACTAAACTTTGGCAA ATTCGTTGTAAATTCTACGATTCTTTTGGTTACTTCGACTAGCTTATAGT CTGAATCTGTAAGAAATTCAATTCAAGTGGGGGgtgtacggtatttcgga atcgCGGAAATTGACCCGTTTTTCttcggaaattttggaaatcaagtaaa attccttcggtattttggAATGCTTAAAtcgtttcggtatcggaaatcca tgaatttttgcttcagaatttCTTCAGAATTTCTTCAGAATTTCTTCAGA ACTTCAGTATTTATTACGGAATCTcggaaatttttgcaaaattattcggt atttcggaaatcgcaaaccccgtacgccccccccccattCAACGATTTGA GACATTTGACGTCAAGCTTTCCTTGTAGAAGAAGGAGAAAAACAAGCCTA CTCTAACCTTGTCCTAAGGACAAAGATCACAGAGCTTTCCTTGTAGACTC GGTTTTTTACGCTTTAAGGGATGGCAGGTGTATAGAAATTTTGCTGAACA ACAAAGAAACAATGTTTGAGAATTTGAATTGTCATGGGATAAATGATCAA TTATCATGGGATGATTGATCAATTATCACATGCCAGTTTTGAATTCTTAC AACTGgcgtttgaaaatttgagctcattcTTTGAGTTGAGTTGATATAGA GAGTATTTGACGTGTAAATACTGAAGttttttagcaagcagttttactgt ttttaacttttatctttatttattttttagacctgatgatgatacaaaag tatcgaaatatattgtcaagtaaaataaaaataaaatgaagttacATCGT TGATATTTCACttctggtttttcttttttgcagtGCTTTTTCACAGTACA ACATGGAACAATTCACACCTTGTAAATTGAATAGTGGTGACAACGTACTG ATCACCAAACACGGAGCTTTGGACAACAATACATTCTATGATCcaaaaac caaacaaaagtTCAAATATGACCATTTGAGAAAGGTAAGTTCGTTGATTT GTTGTTAATTATTTGTGCCCGGTAAGACAATTCATGCCAGACAGGCCAAT ACATTCCATTGCACATACATTTTCCAGCACACAGGCAAGAAGGTAAGATA TTTAATGCTAAATATTATTGTATGttataaatttaaaaaccaAATATCAA AACCAGTAATGCAATGTTCCGTGTTTTGATGGTTGCAAGTGTCATTATGA CACACACCCTTTTTCACAGTAAGGACTGCCAGTTGATAGTGCCAAGGACA TCAGATTCTATTAATGAAACCTAGTTTTAATTCGACTAAGTCAAAAaccc atggcgttctaaagaCTTGAAAATTGAGCCCTATAAAATCGAAGTTGCTG CACACTTGCCAGACCTGTAGATTTGGAACGCCATTGAACAACTCTAACAA ATCCATCActgttttttctcaatttttttgcaaaattgatttatttgaaa gcattgtcttgaaattttatattttctgctttttttccTTTAGGAAGCCA CTGATTTAGAAGCTCACGACACAGGAGATGCATCAGAATCGTGGAGAAGT GCTGTTGAAAGTGCTGTCGCAAATTATGTCAAAGATCATTATCCACATGG TGTTTTAACAGTAAGAAAATTCACCAAAACTATCGAAATCCTCACTAGAC CTTGCTACAGAAATTcatttatgaaaatgaaaatcatagCACTATTCTCT aggaagttgattttcttcctCTTTATTTCACATCTtctcttttttctgtt ttgatagTATTCCACTCAGGAACTTTTTAACGAGAAATAAAACAGCTACC TAatttgaattctatcaaaagttatagcctttttTATCTTCGCGACAGAT TATATtgggacagactttagtatatAGTAGGTCTATTGACTTTTACGGAG TTTTCAAGTCTTTGCCCTCTTTCTTGCACATCAGCTGTTCAAAATTGGTA TCAGTGCaaatatgttttgatttagaAATAAATTTGAGGGTAAACGTTCC ATTTTGAAATGTTACAGGTTTATGGTAAATCTAGTGGTTCTGACATCACC ATCACAGCATGCGTGGAAGACCATCAATTTCAACCACAAAACTTCTGGTA TGTTACTGAAAAATCTATACCGTTATTATTTCTCTTTCTTTCCGCACACT ATATAAAGTAACaagccttttttattttacttgatCGGAACActgaaaat actttaaaattCAATACAAACCTTGATCAATGttttaaataatataaaat tttataaaatttttatttgaaaaaacgCTAGCGCCCTACTTAACGGGATT AATGtttgcgggaattaaatttAGCGGTTGAGCTCATCATCAAGATTTCA CTGGGACTTTGTGATGGGTAGCTGTTTTTCGCGGATAACTCTATTGTGAA ATAATTTTGTgctatttttgttattttactaCGTTAAACTATGCATGTTT GTTGTGAAAAACTCGTTAGTAACGCTTCTCTAATGGCGGTAAAGATGTTA AAACTGgtctttgaacatttttttggaattaaTTCATGATGGAaacgcga aatccgcgaaattttgatccccgcgaaaattaatcccatttaAGTAttat gtttttagtttttttgacctttttaattttGTAGGAATGGTAGATGGCGA TCAGAATGGTCGGTGACTTTCAACTCAAGTGGTGGTAATGCAGAACTAAA AGGATTGTTAAAACTACAGGTACTCATCACTCAAAGTCTCTCTTCATCAG CTAAATTAGGTCTAGTCATAAATTTCCTCGTTTAAATCACttttttttCA CGAAAGGGTAatataaaaaaccttttttcctaAACATTGATGCTGAGATC AATGATTTCACTGCTGATGGTAGTGATAATGGTCGAAacgtttgaaataa ttttttatgttttaaaaaaaacatgaagcTTCTgtcttttaagttttttt ttgggaTCAATCTTTGTTAATTATTTTCCGAATTATGACCCTGAAATACT TGAGAACCGTAAACCTTTATTTAACCAACTTCTTCACTTTTTCTCAGGTA CATTATTATGAAGATGGTAATGTTCAATTGGTTTCACATAAAGATGTCAC CAAAGAAATCAACGTCTCTGTAAGAATTTTTATCATTTACATTGGCTATT TTTACGTTGACTATTAGGGAAGGACGGTTTCATCAGTCTTAATAGAAAAA ATAGCGGAATTTCGGCGTTGCCGCTATTAATGagcctttctttgtttttc tgacAGGCTTCATATACtgtaaacaatttttgaagtgttGTTTATGCTTT CCTCTGTAGGATTTTTAATCAGGATTTTCAGTCAGGCAGTTGAGCATAGA AGCTTGATCAAAATTTGTATGCTTCGTCTTTGCTCATGGATATGTTTTTG ATGCTTTCTAGGATGCAAATTCACTGGGAAGAGATTTAGCAAAACATATA GACGATTCAGAAACTGAATACCAGGTaaagtttcaatattttttttaata tcggTTTTTACATTGTTGAATACACATACGTTGGTACTTTCAATACATGT GATTATATTATTGAGCTGCGTAACCTTTTAATTATAAATTAATTATAAAC GAGCCCCATTTATTGCTGTCCATCTATGTCTTATCGTTCTCTCTCATGTT TGCCTGATCTCTGAttctttgtcattttttatcccATCTAACTCTCACCC TTATTATACATTTATCTGTCATCAAAAGAACCAAgcaatatttttcattg tttactctttcaaagcgggctacacggctttttgtgCAAACGCAATTGGT TATTtttgcatgacgacgggcctacactgccaGATTTACctgtcgttagg aaaattcattgtgacgtcactttttcaaaagaaaatgactcattttttat ttctgacttcagaaattataacttttttttatctcttttcgcttgttttt ttcgctttatttcgctatttttcctggataaagcgctaaaaatcaatcga agctgaaggaaacggttaacaaataaaataataaccgtttttttcgggct gtactgaaaatattgccctcggtcaacgcaacaacctcgcaagctcggtc gttacttgacctcgggcaatatttctcagtacagccctcactaaccagTC GTTATTGtattaatgtttattttttgaaaatgaacaatgaagagaatttt tttaaatgttttttctattttgacatttACAGAGAGCCATTGGTGAAAAC TACCAAATGATGTCTGACACAACATTCAAAGCACTCAGGAGACAACTACC CATCACAAGAACCAAGATTGATTGGAACAAGATTGTTTCATACCGAATTG GTGCTGAATTGAAAAGCTAAGGAAAGGTGTTGAATACTTGTAGGTttatc aagaaaagaaaaaccacCCACTTCCAAATTTGAAGATTAATTTTTGTAGA GAAGTATTAGAAATAAAAGTAAAaccaaacattttgaaaaggaTAAGTTT TTAAATGCCCCAGAAAAATGCTTCTAGGGTATAGATTCTGTTTTAGGTGt tatttttgggatttttctattaaaaaaagcttaatattattataattaaa aaaattttccttttgaattttagtgattttttaaataatttttttgttat attatttttGTCAGTCATGGTATATAGTTAGTTCTTCAATACCATTTGCG TTCACTCACGATTCTTCTACTGTTTTCAAGATATTATTTCAATATACAAT TTTTGACCCTCTACATTGGCTTCTTCAGAAACTTGGCTTCAACTAAGATT TGTTGTAAATTGTTGATTTTATATTTCCAGCTGTATTGTTCTCAAAAATG CTTAGAACATTTTCACCCATTACcaataattttttatgttttttcttttt gtttataatttaaTTATTTGTGAAGATGTTCTTAAATAATAAGATTTAGA CCAGTTTTTTACCAGTAATTTTAAATTTGCTCTGCATCCAGATTGCTGTA ATTCATCTTTG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.19688.1.p1MSTRG.19688.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000228_pilongenomesc0000228_pilon:453179..464689 +