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Sequence
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gene from alignment at sc0000168_pilon:675947..691073+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.17109 ID=MSTRG.17109|Name=MSTRG.17109|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=15127bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000168_pilon:675947..691073+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAACATAATATAAATTAGTTTCCATGGTGTAAatttaggggtcacctaaa
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TTGGATTTAAATTAACAATAACGATACAATAATCTTGTTTTTGTTCATCA
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AGAATGAAAATTATTATTCTGGATTCTCTAATTCTCAAACCTCCATTATG
TTTAAGAGGAGATCGTAATCCTCTGTGTTGAAAATGAGTATTATTATTAG
GTTATTGTAGATTTCACCCCTTTTGGAATGcaatattaagcagatattcg
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atggtttatcGTTCACCAATAAGCAGAAaagcattttaatttttccctat
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taaaaagaactttcttttatctgtttttatatACCGAGtaacccacgaaa
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ttgatatttagaaagtagatatcctaacttaaaatttgagctattacTtt
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gacattaataattaataaaaacacctttgaaagtagtttttgtttaaagc
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cagagaacaagttggtcaaatttaaaaagtgatagctcaaattttaagtt
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tgacaTTGCGTTTTGCCTAGAGGTGGACGATAatataatttataataatt
tatGTAAACTAAATATTACTAGAAGTATCGACTTTTCAGGGTGTAACATT
CCCAAGCATTTATGCAATCTGGAGAAAATGGGCTCCACCTTTAGAAAGAA
GTAAACTTGCAACAATCTCATTTTCAGGTTTGAATTGTgataattaattt
tCgttttttttcaaagtttttgacattGCTTTTAGAATTTTAAAGTCAAC
TTGTGTGAGTATAGTCCAACATACTCCAATGTGGAGTTCtgtttaaaatt
tgaacaaaCATTTTTAGTTTACAACACGTCTAAACAAAGAAATGTACTAG
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ATTCATAATGATTGAAGTAAATTTAATGTTTCAATACGTCCATTTTAACT
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AATGCCACTATCAGGTGTTATTGCTAATTCCTTTGGATGGCCATGGGTCT
TTTATACTTTTGGTAGGTTTGTATAATAACTACTGCAATAATATTTTATA
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ttatatttcttaaaaatctagCTGCTTAGTTGTTGTTTGTCAATGATACT
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GTTTGATTTATTTATCTCATTGCTTCTTTAGGATTGTTTGGTGTGATTTG
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GTCTTTTTGGCAAATAACCGATGTTTCGAGAGTTACAATACAAGTTtaaa
tctacacgttttttttataagaacaaactatataagaacataaggcttcg
aggcccaaaaatttaagaacattctaagaacattctaaggctttggagac
ttaaaacatgcattttcttaagaaattacatcaaaatgctcaaaaaatgc
tgaaaataagaacattttaagaacatttttaggcttcaaatccaaaaagc
tatttaggcttcaaatccaaaaagctaagaacatccgaaggcttcgaaaa
tttttgacgttcttataaaaaaaaaacgtgtaaacctTTATTAAATCATG
ACATAATGTTTTCACAACTGGTAAAAAAGGAAAGGCCTACCATAATTTGA
GACTTGATATTTATTCacgatgaaaaatttgaaaaaaaacttttttcaca
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GCAAtttttttGtaatgatgaatttgaaaatcctGTTCTCCAAAAATGCC
GTCCATTCGctttcatttttcaaggttgaaaatattaaaaagtctAAAGA
TTGATCTTTACACATTATTATAAAGCGTTTATACAGAATTACCTTTTGTA
TAAATACTACCCTAAATAATCCCCTAATTCTTTAcaattcattcaaattt
tccACATAAAagcatttgtcatttttcttttgataactgACGATCCCATA
AAACTTGAAGTATTATCAtaatagcataccgcagtgattctaaaaataga
catcaaaattactgtttgtctgagttttaatcccatcatcctttgcatta
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tgcacgcattacgaatcaagatgaaaaggattttgggattgaatttcggt
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aactttgttttttttcttgtacataaAGGTTGAAAATATACCTTGGAAAG
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GAAAACTGGGGATGGTACACATTATTGACACAACTTCCAACATATCTGAA
AAGCGTGCTGGATTTTAATCTACAAGCTGTAAGTTCCATTATCGTTGATA
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TTATAAGAGAAATCtcagcctcagatttcagaaatggctaagaaaacatt
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gaagaaaaaaacaattaaaaacattttgttcgtgatgaaaataaaactaa
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ATTTAATTAAACTTATCACTCTTACACAACAGTTTCAGAAGAATTTCCAA
GATTTGCTCAACATTCAGAAAAACTAGTCACATTATAGGCAGATTCAAGG
TTTTAGCTGCAATGAGAAGAAGAAATTTACACCCTTATATAATGGGCGGA
GGTAGTGCAATTATTAGAATCAGATTCTTgtctaatttttctttcatcgt
tattactcttaggtgccaaataaattttccaaccccgtttatttggcacc
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ATGAGCTAATATTAATTTGAATACCGTAAAGTTGGTCTAGTGTCGACATC
CCTCAACTGACTCCCTTTCGAGAGATGGTTGGAATCACTtattgaaaaag
gttttttccctctgaccactaagcaaagaaattaAGTTTCAATCAGGGAT
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gaggtatgtcgacattagaccaacttacagtagcTTATACGTGCCTATTT
TCATTAATATGTTCTTTCAGGCTGGATTTTTAGCTGCATTACCTTACTTG
GCTATGGTGATTGTGGTCCAGTGCGCTGGTCGGTTGGCTGATTTCTTGAG
GAGCAGAAATATGATGAGCACTACCGCTGTCCGAAAGATGTTCAATTCTA
TAGGTTTGTTAGccctagtttagacggcccacttttcgccctgcctattc
taattgtggaTTAAAGTGGGCAGTAGGTTGGCTGTCTAAattcaatgcat
tgccctcttttgacgtcaatgcaatgttttctttcaagcttttccaagca
aagattttaactgccaactttttgCCCTCCttttgcctactctaacaatt
catgatatgcaccactgcaatgacttcacgaaattatgcaacttttctgt
gtTGTTCCACCTGATACGTcactttctattgtttaagtgacgtatatggt
ggaaaattttaaaagttctcagaagactctccagtggtgcatatcatgaa
tcagaattcatgatatgcaccattgcaatgtcttccattccacccaatag
ctgattggttgaaagtgacgtattgactgattttacgtcacttacaacca
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tatcatgaattagaataggcaggggagaaagtcggccgtctaaagtAGGC
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TAACGTTTCacttcgaaacaaaatgaaaccattcttttgaattcaatttt
tacgtcacttctaaccaatagaatggctatATTTCTTTTTAGAGCGAAAC
GATAACAAGATCACAAAGTGTCAaagcattttttttccaaaactgagaaa
tttaaaaatcggATGTGTCTttaacatagtgtcctccctcaaaccaattt
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taaaggggggggggggggggggggggggaaggggggggaaacatcgatag
ttggcaaatttggtggggaaagtgtgaaatcacttcaattttatctcagc
aaccaaggtcagtccacatgatatcatgtgattagatcatgattgaaaaa
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ttacgtttgtgccAGGTTgacatttgagaaatttatacgggtatatgggg
ggaactgatattttcagaattttctggggggggaagcaaaaaagaggggg
gaaactaaaaaactgaaaagtcataggggggggagaaggggggggggggg
agatttaaaaaaatcaagaatttggtgggggaacaaaccctggaggacac
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ttcgaatattCAGGAGCACATATATGGTTGCCTCTCTCTAATTATTTCTT
CAAGGAACAAGGgcttttcttttaaataaagaaagattcgaattataaag
tCTCGAATTATAGactgtttttatctttttgtatcgttttaaagttatat
tttgaaatccattaagcctgttttttttggaatttgattATTGTCATGGA
AAAATCTCCTTGTTTGAGAAGTACAACGTTTGCActctttaaatattttg
aaatgtagcGGAATTCTATTGCTATTGTCAATACTCGCAAATATTCAGAA
ATTTAGAAGGTCTTCATCCTAACATTACCAGGGGGTTTGCATTATAatta
aattatcaattaaaatttaaaaaaaatcataaagcatTGTACCTTCTCAA
CAGGGAGTTTTTCTTACTGGCTGGAGGGTTATATTCCTTCAATGGGCTGA
ATGAGTGGTTGATATACTGATCTGTAAATTGACTTTCGCTTGTGATCTTT
TCCACATTTGATCTCTAAAATACGCTTTTGTGTTTTTATGTTGCTGGCAC
AACAAAGTATAAACTTTTGGTCCataaaaaatggtcaaaaacagTGTCTG
CGCAACGGCCAATATGAGCATTTGTATTGCACGTGTGATATTTTTATCAC
TCTGAAGAAAGTATAATGGGAATATAGTAATGTAGGTGAAAGTAACTGTT
AGCGTTGAATATGCGATTGACATCGCTTCATTGAAAGGTCCTGGCAAATT
TCGTCCTCTGTAAGCTTGGACCGCTGAAAATAGATGTTGAATAATGATTA
GCAGGATTTGTGCATTGATATGAAACCCAGTGTTACAATCTAAGGAGATT
TCGTGAATGGAGTGATTGACGGTTTTCGTTATCTCTGGCAATCGGATCAG
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TAGATGATTGAATaatatttgatttctttttatccGAATGCGTTACCACC
GTTTTAGCTCTGAATGCAGCCAATATCTTGTGTGATTTGACTAAAATGAT
GATCGCTGGACATGTAGATAGTAGAAAAATAGATATTGGTCGGAGTTGAC
ATTTCAATAAAGATGGCTCGCCAATGAAAAGCAGAGGGATAAACAGAAAT
TGTAAGCCAGTCACTGCTAAATGCAACAAGCAATTATACGTATTAATTGC
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GTGATACCAGGAAGCCTATACTGCAAACAGATACGGTAAGTATTGGTAAT
AATTGATGAAATTTGATATACTCTTTATAGTAAGGGCTGTAACAATGGCT
TCGATCCTTTGATGATACCATCATTTCTGGACAACTCTGGCAGCTTTGAT
TTGATGCTGGTTTATCATtgtaataatttaaaaaacatttccgACAACTG
TGTCCATACCTCGTGATCCAAGGTTGtgattggttgattttgccGAAGAA
TGGCTCATAACCTGTCGCACAGGTAGACAAGAGACATTTGTTAGCTCCAG
GATAGCCTAGTTTGTTTTGTGATAGGTCGTAAGCACGAAGTAGAAATTCT
CTTCTCCTGCTTTTTAAGCCGTTTAGGATATCAGCTAATTTTCTTTGACc
gtttgtgaaatatttaaatttCCCAATGTTTGCGTGCTTGAAATCTTTAA
ACGTAAAAAAGGACAAGACGCCCATGTTTTTCCGAAATTCTATTATAGCC
ATGATTCGTGAAACTTCAGTTTGGTATGAATCATAACAGTACTTCGCCAA
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CAACATATCTGAGAGATGGCAAATAATATGAGTACAAATTCCAATACTCG
AAGTCATACCATTCTGTGTTATAGTCGAAATCGTAAGAAATCCAAGTTCT
TTTTGTACCTTCGGTGTAGTTTTTAGCATATAATCTGAATAGCGTATTTT
GACTTTGTGAATCTCCAATAACTATAAAAATCTTAAGCTGGGTGTTTCGG
TTGACTTCTTTTACAAGACTCTTAAGGGCTGTAGCGTTTGAAGAATCGAT
TTTATATAGTGTATGGCAAAGCTTCAATTCTTGGTACTTTGAcattaact
ttttataaaaatgttcaatAGCTACATCATAAATTGTTGTCCGGTCCTTT
TCATCCAAATGAATAATACCAATATTGTCAACCTTAGATGTGACGAGTTT
GTGCAATAAATCTTCAGTATTTGATTGTAAGACATTGCTGTAAGAAGCAA
GATTGTGATCAACCAGAGATGAAGTGACATCGAAATCCATATTCAAGAAA
CTAACAACATACTCTTCACTGTATAAGAAATACTCCAAGAAATGCGAAAC
CTCTTTAGATGCATAAACCAAGATGTGGATTATCTTGGACATTTGTTGCC
AATCACGGAGACGATTCTTATTCCAATGTGGAATTCCCTGCACCTTATCT
GATACGTAAAAACTTTGGTTTAGTTTTAATTGAACTCCAAGTTCGACAAT
TTCGGAATACGTACAGAAAATATAGTTCTTGAACTCCATATCGTTGGGGT
TGATAGTATCTTTGAGATCAAATTTCGAAGTTTTGAGGACATGGTTCCAA
TAGCTTTGTCTCCTATTGTAAGCCTTGTCTATTGCGGTTCTACATATACT
AGCGTTTGTGTAAGATGTTTGTAACGAGTGGTCCGTAGGAAATGTTTGGG
GGTCCGTAGGAACGCAGTCTTGGAATAAGCCTACAAAGAGCATGTGTTCA
TTACCAGGCCGCATAGATTGATGGGCGagtttgatgatgataaaaaagAT
TACAAGAGTTAAGATtgtcttgaacattttcttctGGTAGAGTCTTGATT
ATTTGTTTGTAGTTTGTTTCTTACCAATCCAGATTTTTCCAGTTTATCTA
AGCCAATAAGTATGGGGATTAAATTGTAGTAGCTATTTgatcaaagtttg
aacTAACATTCCCAATTCTGcatcatttttagatttttttacgTTTTCTG
TGTGGATTATTCGCCATTCAAGAGTGTGATGTTCTACGAGAAGTATGTTT
CGTTGGAACTAATATTGATTTTGAACTTCGATTTCTTTGTTTGAATAAGA
ACTGTGAGATTGTTGAATTAACCAGAAGGTGTATACGGTAGCTCAAAAAT
ATGTAGATAGGATGAATAGTATTATTTAGCACAATACGTTTTTTCACTAT
CCAGTGATTAGATTagaatctaaacatagaattctaaaattaaaaaaaga
taaagatatcTGAGATATCATAATTCCAAACAAAATccattgaaattttt
aattaaagtTTGACTGTTCGTGACATCTCCAAATTCAATTTACGTCTCTT
TTTTGTggagaaaaacatttaattgaAAAAGACACGTAAGAGGTCGAAAT
ATcgttaaagaaaaatgtgttatgttttatttaaattttgaatgagggtt
ctttaaaaaataataattttacagtgaaattgaagattttcattttcatt
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GATTTTATggattctaaaacacccaatttcttagaagttgcacaaaaata
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aactcaaaaaggtaaGAGCACCCATAGGCTTCAAAATGTTGGGTGTTTTC
CACTACACACCTTTTTATAAGATCATCGGACAGGAAGACATTCAGGATAG
ATTCAGCCtttgtttacgttttttgctGACAATGTATTTTAATTCTTGAA
ATGTTCGATTTGTTTTCAATTTGAGACATTTTGATAGCGGAAAAGTTgga
ttttctcaactttttattttccgCCGAGAAAACTTCAAATTCCGCCTTGC
TTATAGATCGAACATGCGCAGATGAACCAATGTAGGCGGAAAGCACTTTG
CGTTTTCCGCCGAATGGAAAACGGCCTTTAGATATCTTTAAAGTCAAGGA
AAAAACGTTTTAAGTCAATAAGTGAACAGAGTAAACATATCAAGAATATT
GAAGAATATTTAACCCTTCGATTATCTTGGGGAAgggggggAGCTCAGTC
TGAGGCTGAATAAAAcgaaattttttgATAagttttgaaatatttctccG
ATTGACTTGAAACTTTGCAAGTGTGCGCAAATATGAATTGGCATCTTTGA
CATcattgatgatgtcatcatatTTTAAAATGCTCAAAGTAGAACCCCCT
CTAACTTCTTTTAAGTTAAAttgtttttgctcaaattttgcaagGAACTC
CACATAAAAtgtattttaaatttcaaactcataAGCACTTGTCAATATTG
AGATGTTCAGGGGAGcctccccctccccccaagAAGCTTCCCCTCGtaaa
aaaataggaagatgctcgaagggttaagcTTGAAAATCGCAAATAATAAG
ACAAACCAAGCCTCGGTCTAATTCTTATGACTTTTAActtccttttctat
ttttccacaCACAGGTTTCTTCTCACAGGCTTTATTCATGGTCATCGTTG
GTTACACCAAGAATAAGGACTTGGCAATCATTGGATTGACCTTAGCTGTT
GGATTAGGTGGTTTTGCATGGACGGGTTTTCCAATCAATCACTTGGATAT
CGCACCACGTTATGCCTCCATTTTGTTTGGTATTAGTAATTGTTTTGCAA
CGCTACCTGGTATTATAAGTCCATTGGTCGTCGGGTTGATTACTCCACAT
GAGgtttgtacacgcttttttgtatgaaaacaatttttatcaGAAAAGGA
GTTATTAGCATGATAGCATAATTTTCATTGGCGCTTTTAAGCAAAGTGTG
TACTTCCGTATCTACTTGACGGTACTTTGAACTTGCGCTTTATCGAGATT
TTATGATTTATAGATACTTCTATAAAATGAGCTAGTTCTCTGTCCCTGTC
AAGAGAATATCATTGAAATGCTTTTTTAATCCGAGTCCCTCTGTATTAGA
TGTGGCGTCGATACCTTGCCTTGATAGTTTCAACCGAAAGACAGTGGGAA
ATCGAACTATTTATTCAACACGGCCCTCGTTATTCCatatttcttaaaag
aaataTGTAAATAAAACTCGTATTGTGTTTTCGTACATTTCAGACACAAG
AAGAATGGCGAGTTGTTTTCTTCATTGCTGCTTCAATCTACTTATTTGGT
TTATTGTTTTACTGTATCTTTGCGTCTGGTGAGAAACAAGAATGGGCTGA
TGGCAATCAATACTTCAACCATACCAATGATGATGGTGAAGAGGGTCATG
AATTGCTGGCTAACAAGAGTGGCGTTGACGAGGAGGATGAGTAAATATGG
TTGGTTTGTGAATGGTTTTCTGTTATTTGGTTGGTTTTCTGTCCTTTCTT
TTCGTCAACACTTAAGATGTTGAGCCACTCATTGAGTGGAAAATGGTATT
GGCGAGGGGCTATAAACTGCTGCTCAAAAGCTGTTTGGTCGAGGATGAAT
AaatatttgcttttttatttggtttggcCGAGTGCATGACCTTTTTTCTG
CTCTGCCTTTCTaactaaattattttgaattctaTTAAGTCTCAGCTCTG
TGCTTTGACATAGTATGAGCCGTACTAAGGGGTCTTATTAGGCCCAGAGA
ACGGCGAATTTCGCCGGTCCAAGGCACGAGAAAAATTACAATTCGCCGTT
CGAAAAGTTCGGTTCGCCGCTtcaagtacatatttacgctaatcaatGCA
CTGCATTTGCTAAGAGTTTGTCAGCCTAGAATGTAGAATCTAAATATcgc
cagagttaatttttcatttgtcagtctaccaaaaacaaagcaaaaccccg
GAGTACTAGTATGAGTCATTATGCAAACTTGTCATTGTTATTCTTCTTGT
TTTGTATGGTTGATGTAAtcttttctattcattttctttcttttttttgg
ctAAGCCAACCACAAAGGACGGTCTCAACTTGTGcacgctgcgatcgcac
ttttttcgagcaaagcttcaaCGCTAtcggtcaaaagaaaaattaaacaa
ttccattggtgcgatctgacgtaacggttgaagaaatttgaaatgtattc
aacttttttttcgagcgcgcgctgcatttttatgacgtaatctttttcca
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ACCGACCTTAACAAGCTTTTCTATTAAACCATGTTTTAAGTTAGGCGGTG
ACGATCTTATCAGTTTTTTACCTTGATAAAGTACAACAAAGAAAGCTGCT
TATAGGTGTTTTCTCCCTAGCATCCTTGATGGCCTAaatatttgcatttt
ttgatttttttctgttcggggtcatagaattatttagatgagatttattt
tatttttaaatttttattttgttcacaTCAACTGCACTTAGATAAGTATT
TATTGACAGTTTTTGTAGTGGATGAAGACCATATTGTACTAATTTCCGTA
CATACCTGCATTGATCCCTAATTTCAACAAGATATCATTAGATTTGATGC
GTACCTTTTAGAGAAATTATTATGTTGGTAGAGTAAATGGTTTtgatcta
aaattaaaaaaaaacttgaagaatCATCAAACCTCAAATGTTGTTATCTG
ATATTTCGATTGCGGACTGGCGGCCGCCCgcactaaagctctaaaggagt
gtTGCATCCCCAGccgggttcaactacccttgcgGGTAAACCTTTGTAAA
ATCTCGTAATCCTAACCTTCcagatgtttaaaaattttcccaacCTTCAG
AGCGTTAAATCAACGTTCTTCATCTTGCTGCTATAGATAACAATTGttgt
tgaatatttttggtgattTCTATTTTCATAGATTCTCTGTTTATAGAAAC
AAGGATAATGAATATATCAAGGATTTTTAAAGTTTCGAAATTATAAAACA
CATTATAATTTTTTGCACTTAAATTAATGCACCATTctatagatttttaa
attagtGTTATATTTATTGACAAGTCGTACATATTTTTCGTGTATTATAG
ATGGGGACGTATTTTCCAAATAATTGGATTGAACTAAGCTATTAATAATT
TAGTTTGTAAAACTAGTTGACTATATTTATATGTAGAATATTCATTTTTG
TAGTAAAATTATACTATTAAATTTGAATGAGGGgctatatatttttttgg
ggTGTGACGAGAAACGACCTTGTACAAATAAAAGATGGGTTTAATTTATC
TACAGAATTACACTTAATATGGGGCCAAGTAAAAACTGAATGCAAGGGTA
TCTAGACGACATCCATTAGAGGGTCAGTAATCACGGGAAAATACAagagt
cagggcgtcagggcgtTTTACGGGGAAAAAAGTGttggtagagtttggaa
cactgtaaacacctccgccacttTTTACTCCACCCCGCCCTATCCGTCGT
TTTTAAATTTACCCCGTCTCCtaaactatttcttttttcagtgaTCTTTT
GTAGATGTTAGGATCGTCTAAAGggtatcttacatttttcacGAGAGCAC
TCCTACACTTGTATTTTCAATACCGTCGTCATGAAAAATGTCCTTTTATT
TTAGTTACCAGTCTCTTCCACGTCGCTAAGGGTTGATAGTTGTATTAATG
AGGATATCATCAATGATAGTATTTTTAGCATTTGTAgggaatagaaaaaa
attttaatttcgagtaacgaaaagaatatttttttattttcatttttagt
atcCATAGAGAAGGCTATCATTGTTTATGTAcaattttcagttatttttt
gGAAACCAAACAATATTTAGGTAAATCTAGAGaattaattaaattgggga
aataaatattttgaactgtaattcaaa
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000168_pilon | genome | sc0000168_pilon:675947..691073 + |
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