|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000146_pilon:790313..800107+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15975 ID=MSTRG.15975|Name=MSTRG.15975|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=9795bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000146_pilon:790313..800107+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCTCCGATGGATTTgtctttttagagaaaaatctTATGGCGATTTTTAA
AGGGAGTTTCAATGTGTATTTCTGAAGTGAATTATTTGttgtcttttttt
gattttttagggAATTGTTGTTATGTATTTCTGAAGGAAAAATATAACGA
AATAAGACAGTAATCAAACTGGGAACTGTtagaaagaatattttgaagat
ttatgatatttattttcaagatttgatAAATGATAAGTCTTCCACGCTAG
TATATAGTGTAAACATAAAATTGTTcataaaagtgttttcattcttAAAT
TTCACTGAGGTGAGGAAAAACTTTTGAGGGgcaaaaacaagtgaaaaaaa
acttgagataaagtgaagaaattgaagatgaaTCCAATATCAGCTCTGGC
AAACATCTTATTGGTGATGTTGATTGCTTCGACATCCTCATTTGCAAGTC
CACCAACATCACAGAAACCTTTTCGACAAAGAATCGAACAGATAGCCTCA
GCTTCTGGTGATGGCAGCGCCGGGTCACAATCGACAGAGTGGTACCCACA
AAATTACACAGTAAACCGTTATAGAACTGGTGATCTAGTCTCTGGTAATT
TCTCAAATGGTTGCCATGAGATATTCGCGTATGATGTTAATGATACTAAT
TGTATTTGTAAGAATGAGACTACGTTTTATTGGAGGGATGGAGCTAATTG
GTGGACGGAGATGTCGTGCTGGCTGACCACCCCATCGGGTATGTCACTGG
CAAATCTTCCTATAATTATATATAAGAACTTTTGGAACCAAAATCTAAAA
CCCTTTTAAGAACCATTCTAAGGACTTCcggatttaaaaaattgcaattt
cttAATGAATTAGCAAACCTTATTACGTATATCACTAAGCTATAATGCAC
CAATATGTCGACCACCGATTATCTTAACATATAAATCACCCCTGCCACAA
TGGCGTAGTGAAAACCTATTATCCGCAATGAGGAGCAAATAGCTAGTATA
TTTTGTTTCGTATAATTGAGCactttaaattttattgtttatccAGGACG
GATTTTCAATTAACCTTCTTTTCATGAGCCTATACCCAGCAGGCACGtaa
cgttattttaacgtttatctaacgctcacaacgtccatataacgttagat
taaccgcgttgaaacaacgttgtgtgccaacctATAGcgtaattttcaaa
atcttctaGCTAGGTTCCAGGGTCCTTTTCTCAGTAGGTGCGATTTCTTT
AACAACTTTTCCAGTGGGTAGCCGTCCTACCTGGTCTGTGCTACTGTGGT
GCAGCAGAGGCTCATAGAGATACTGCCTAAAGGCTTTTGATATTTATAAC
ATTCAATGATGACTGAccttgataaaaaaagtgaaaactagaaatttaat
tttattcattatttgacgtttcggtgtcttctttgcaccatgatcacaag
tatagtaaaaaaacaattcaaaacgaatttcaatttacaatgACTGATCG
TGTCAAATAGCTTGCTCGTGAGCATGTTGAAGGCCTTCAAGTTAAAGGTT
GAATTTTTATTAGTATTCAGGCAATGTGTTACATCCAATATATGTTAACG
TTTCTTAGATTTCCAAGTCCGATTGAAGGGTTCAGTACGCGGTGTCGGTT
TCATCAAACATATGGGTGCTGCGTGGCAAATAGATGGAAATTCAATGATA
GAAGCTAGAACATTATCTGGTTTAAATCTTTCGAATTGCCAAACACTAAC
TGTGGAGACAGATTCTTTGGTATATATGGGCTACAATGGATGGAATAATT
ACTATAATTCATCAAGCATGTTTGAAGTAACTCAACATGGAACTGGTCAT
TTTAAACTAAAGGTATTtatcacccctgtatcagtgtaATATCATATACA
CACCTGTATCAAGTTCATATGATCCCTTTATCAGTACACTGTGTTTAATA
CACCTATGTTTTTATCCCGCCtaatacatccctgtctctCTCCTCTGTGG
TAAACAGTCTTTTTATCACTTTATCAGTACCCTGTGTTATACACCCATAT
TTTAGCGCCCCACCTAATACATCCCTGTATCACCACCACTCCGTAAAACA
CTCCTGTATCGTCGTCCAGCCTTTTGAGCTCCGTTTTATAACGTTTTTAG
AGTGGCCTGTCACATACACACTGTATTGGTGCTCTCTCTTTTACTTTCCT
TCGTCAGAGCACCCTTGAATCAGTGTTAAGTCTTTTTACACCTCTGTATA
TTAACACCCCTCTTTTTGGATTTCTTTATCACTGCCCATACATAGCTTTG
TATCCTACCTTATACATCCCTGTATCAGTATCCTGCATTAaaacccctgt
atcagtgaggGCGTGAGGGGTCGTCaaaaaaaaaCCTGTTATTATTATTA
AGTTGTTATATCAAAGTGTaatcttaaagggacataacagtactcgctaa
atttgtaaacaaactgtatacagcggatacaaaatcaaaacaaatgtcac
atgtcaaaataaaaaataaaaccaaatatggctaattttcattgttcaat
tgtttcacaagtttgttttggacacatgattttaattgttctctttaatg
acacgtggttcgtgcaatgtttacattttactacttttatgtcccttttg
CTACCATAGCTCATTACACTGAATTTAAGTTACTCAGTTTAACTTTAGTA
CCtccttgaaaatgaaagcttaatcagcacttttactTGACACATCAGAA
AAATTATCGAGCTCAGTTGTGAAAattgttcaatctattcataattttta
aagtgACCTTCTATATTTGACTTTTTCATTGTCTCATAAATTAGTACCTC
GTTGAGTTTCTATTAGAACATTTCCAAAACTtctttcatgatttttattt
gCGAGTCCATGGGGGATTTTGTCTCAATAAACAAACACAGATCTTCTTTA
GTTATTATCGACTTTTGGTGATGAAAAGTATGGTTTGACGAAAGTTGGAT
TCTCGGTTGGATTAAAATTGAAAGCTCTTCTGTATTTGACTGATTATTCT
AGAAAATTGATCACTTTGTTGAGAACTTCATTACCTTGGCTTGATAAATC
TCAATaaaaaaaCTGTCATCTACCATCAATTGTTATTTCATAAAGCTCTA
AAGTGTACTCCCAGCTAAATTTACGACTTTTTGAGGAGTTTAATGCctat
aatatttttaatataCATGTGCCGTCGGGTTGGATGTGGTGGTGTGTATA
TCTCTTGGTCGTGGAACGTGCATATCATTCCCGTTGCCACAGACCTGTTA
TCCAATCAAACTGGATAATCTCCGTCCCCGGTTGATAAAATACCCTGCAG
TAACTTTTGACACACAGGGAAAATACCCTATGATTTTGTCCCGTTTAGAG
ACcgaattgaaataattttaccCCTACCAGTGGAAGAAAATAATAGATAC
GTCAGTCTAATTTTCATTCTCACTGAGGGAACTACTTAGCTCAACttggg
cactgagacagggatgtaatgtAAATTCAATATTATAAGGACGTAATAGA
TGTAAGATCGGtgtttttttacatgaatttttttatctgtctaGATCAAC
TCCAAGGATCATACATTAGCGGGTCACTTGGTGCAATTATCATTTACttg
tttcaagaatttttcatcTGGTGAATTATTCTCCACTGTACTGAAGTTTG
AAGGACAAATGTCGTACCAAAACCGTAAGTGTAAACTCAATCTTGTACCA
AAAGCCACGTGCACCgacttttgattttacttaattgaaaaacttttctt
gaGCATTATTAGAAAGTGAACTAAGGACTGGGCTTAAGTTTGTCGTaaac
tgtacacgttttttatataagaactaGCAGATTTTGGCTGAGACTTGACT
GTCCTTAAGTGTTCTAATGCGTACACGTTTTATTATGAGAACGTTtagat
ttttaaagcctttggatgttcttaacatgttcttattttcagcattttgt
gagtgtttttgtccaatttcctaAGAGAATAGGGAAATTTCTGGGATTTT
CTTGACTTCTCTGAGGCTCACTCTCTTTTAAAATTGGTTTAGAATTTTAT
TGTCGTCACTTCATTTCATGAATCTTTAGAAAGATTATTGCTCTATTATT
ATTACTTTCCATAACTTGTGCTTCTGAATGTACTCTCCAGAAAAAGCTCA
AGTTAAGACTCGATTAATTCGCATTCTTTGATCTTGCTTAAAAATGTTGA
CTTTTTTCCAAGGCAAAAAAGCATCCTTCACCAATATTTTCCTAAATTTG
TTCAAAGGGCCAGGGTACATAACTGTCACCTGTCCCCTCCTCTTAGTGGT
GTGTAATTCTTTGCTGAAATGGTTTCCACAAGAAAGATTACACACTTAAT
GGACTTTACAGTAGCttttagactagcaaactagtctgttaattaattaa
ttatgtTGTtgagagggcgggaacataaaggtgGTGGGCATTTACTgaaa
taggagctgcgtaggagaacgagaaaaggttggtgagaggctgctgatta
actgctttcagcccttgccaccgacaaaatttcttcttacgcttacctaa
ctcctacgctcacttttcccgcgtgataccgttccaccCCCACTGGTGTG
ACAGTCTAAATAGCTTTTAAAATTCATATTCCTTCGTATATCTTTTATCG
GTATCGTTAAAGGATTCATTTATTAGAGATGATTAGATTATGAACCCTGA
TATTATATaaacttttatttcataaaCTTTAATTCAAAGTCACTTCTTTC
TTTTGTCAAGATTTTGTCAAAGATATATAGACCACAAAGCAGTTATTTTT
AATGCGAATAAGTACAGTTTCATACCCTGCGaaaaaaaCTGcaaggtttt
tttttgcaatacaGTTGATATCCTCTAATTTCTTTTTAAGggaaattaga
ttttcatcaaataaggaaaagatttttttcgaatattggagcgtcgttta
tgagagtttctttgACAGCAATTTTCAATAGCATCAAATAAACGCTCTAT
TATTGAAAATTACTGCAGTTGAATAgtggggatgagctggagtttttaca
agatgcttaactgattggttatttttaaacaatagggatgacgagttctt
tagaaaaagtaataaaatcgtttgtctcaacatttaacgaccaacagagt
catcaaaggacttgtaaaaactccagcttgatagcgtcaactgtagttgt
TGATCATCAAGCAAATCTGTCTGCTtctcaaaattgaaattgtttgaatG
TCTGATTTTTAGTCTCATCAGTCCCACCTCCCACAATGCCACCGACACAA
CCAACCCCTATTGGCAAGGTAGGTTTCTTTAAAGGtttcgtttttaaata
agataGTCAACAACTTTTATAGGACTAAACGCAACctgtttcatttcaaa
tttgaattttttgagaaGAGTCAAATTTAAGGCCCGGGAAAATTTtttgt
gaccaaaatagtgacgccataggcaaaactgcaagggaaaataaggggta
gagaaatagctgattttcaaaaatttgactcttctcaaaaaattctaatt
attaTATATTAAACTTTGAAATGGAACAGGTTTCGTTTAGTCCTATAGAA
GTTGCCACGGGATCTGAGACTTGGACCCCTACTATCCTACTaagaatgat
atcgtttgcttactcatcacttttaattaacaagctttttcacattggat
tgacacggatgtggagcaagattggtcagaaagaggaaaagaaaaacatt
ttttgcttttatcagcacaatataacaataagaagacactgtcctgatat
gaaatatatgtctgatatgaaacacttatgtaaaattaaaacctcacaaa
aagtcacaaaaattcATTAGTATTATttagtacacccctgtctcagtgcc
ccggtggaaccttatCTCACATTTGGGATGAAAATTGTGATCGAAATCCC
AATAGAGATAAAAAATATCTATTGTTTCGATCCTAAAGAAAactagtggg
gatggttttgtgttttaatttttttctatcatatttcaattttggatgAT
ATCAAATGGAGATGAAATTTTAGGGAATATTTTTCACCGGGAATGTTATT
TGGCCAAATTTTACAGTGATTCCGTGATTCAGTACTTTACTAAAGACGGG
TGAAAGATTAGTCATTATTATACCGAATTTTGCTGAAGAGAATGCTTGAT
ACatctatcccagctggcacaaaacgttgtttcaacgtccatctaatgtt
cataacgtctatataacgttagatgaacgttgaaacatatactcactaaa
atttcaaaatctttattttctacaaaaattaaATATCTACTGCTGCTGTA
AATTGtaactatttttctttatttttgcgCTAGTCAACACCCCGTGATGC
GGAGAGCGAAGGGGTCGAAGATACGAACGAAGCGTTGGTTATTGGAATCG
TTGTTGCTGTGGTAGTCATCTTTGTGCTTCTCGTTCTCTTGGTTGTTTTG
TGGAGAAGGtaattcataatatgcaccactgcaatgacttcacaaaTTAT
GCATCTGTGGttttttttccacccaatacgtcactttttctattgtttaa
gtgacgtattgggagGTGTTTTATGAGACCAATCCTACCTTCGAAAAATC
TACAAActaatatattttattatttacaGACGAGGAAAACAAAATACTCC
GACTAATACTAAGCAGGTAAAAATTCTCcatgatatttttttgtttattt
gggCACACTCACTCATTCTCTCGCTCTTTACTCGTTTGATTATTTTGGTT
CACTCGTTTTCTCATACAAGAATACCCGGCAGCCATAAACcatgtacacg
tttttataagaacatgtaagagctatataagagcataaggctttgatgac
caaaatattaagaacaagttaagaacattttaagaattcGTGAACTCTAG
AATACCAAATTTCAAAGggaaaaaatggacaaaaatactcataacacggt
gaaaatattaagaacatttttaggcttaaaactcaaaaagttaagaacac
ccgaaggcttcaaaaattttggatgctcttataaaaaatcatgtGATGTA
TGTAACTGTGTCtttttttGTTGGAACAAAATACTGATTAATTGATTCAT
ATTTTTTCCATAGAATGAAACAGAGTTTTATCAAGCACCATCGTACAATT
ACCCAGACAGTAAGCCAACTTTATTCTGTCACTCGTTTATCCCCACTtga
aaccaaattttgtcatctaGAATTGGCAACATTATTTCAGAGGACATCTT
TAATGATGAATGCTGGGAAAAGATTTGGATGTATTCGTAATGCcaagaat
aacttttttaacatttcaaTCAAACTTGAAAATCTCATTTCCGGTGATAA
AAACGCCCTTAAATTTAGACctcactgagaaattgactttaactttcatc
cccatattaaatttaatggaaaaacgtactccaaaaccatccacaCTGAA
TCTTCAAGATCCAGCTTTTGAGCTGGGATCACCAGTAAGATTACCATAGA
AATTTTCACCCCCATTGTGGAAAGTAGCTCCACAGGGGCACTAAGACAGA
GTCACACTGATTTATTTCaacgatttttcaatttttcttataGACAAACC
TAACCCATTTAGTGGCTCAACAAAGGTAAATCATAATATCCAcatttaaa
ttttctcaaaaccatttttctactttctatgagccttcgggtcgcctcca
actgcggtcgcagacttactacttAGAACTAGTTTGTTAGTAATACTGTT
TTACTTTCTATATGAAATATTATTCTTTCAATCGTTAAGTGTTACACTTA
ACGATATTGAGTAAGTCTaagaccgcagtcggaggcgacccgaaggctcc
tctttcgatagctatctaccggAAGGCAGGGGAGGGCGCCTCTTTCTggc
tggattgctccacttacccttgatccttctcttaatggatgagcatcaag
cagagaggcatcaagtaccatttctTTGTGAATGTTTGGTATGACACGGC
TGGGGGTTGAAACACacaaccttgcacaccgtagccggatgctctaccac
tgcactacggtcgctactAGTACTAATACAGTATTTAGGAAAGTTTTCAG
gataaattttttacaaattccAATCTGCTCTCAAATGATTAAtcactttc
ttttcatttctagGCCTTGTTCAATCAAACTAATCACCCTGGTAACCTAC
ATATAAACAACAACGGTGGAAATAGCCCAGCGCCGCCCGTTCCTCGATCG
CCAAGACCAAATAGCCGCCCAGTCTCAGCTGCATTCAATAACGGTTATAT
AGATATGGCGAATGATAACCCACAACAATATACAGCCTTAAATTCAAACA
CAAGGGTCGATCAGCAGTATCAGCCTATTAATTCACCAAAAGACAAAATA
CCAACCTTGTCAGAACAGGATGAATATCTAGATTTAACAGACCCTAAAAA
TAATAAGCAGCAGACTACACCAGGAGAGATATATACAGATCTAGACTATC
AACCAGGAAATATATACGAAGGGGTTGCTCAACCTGGTCATAAAAATAAT
CCTCGAAATTACAATGGGTCTAATAATCCTTCAAAAACATCAGAGACATA
TGCGGATTTACAGGGAGCTCAAAGGACCCCAGAGACGTACCAAGACTTGA
ATACCGCGCGTCTGCCTGTCAATGGAACTTATGAGGATATAACAAACGGG
ACAGATTATGATAATCCAACGGCGGAATCTAAGTGAACAGACAATATCTT
GAATTCAATGGTTGAGTTTACTCTAGTTTACTTCCAAAAGAAGATCGTAA
GTGGCCTATATGGTAAACTATCATCTACTgtgaaacacccccttctcaca
aaccagTGGAAGGggttcccaccgggtctgtgagaaggaggtgtctCTAA
GAACCAACGTATTTCTTCAAGTAAACTATTTAATGATGTGGTTTAAAAAG
CAATGTTAGAGCAATTGAAAATTCTGTTCAAACTGATATGACACAttaat
tttagttgagaattttacatatttttatatattaatcttaaattatacat
aaattattaaaataacagctttaaaGACAATTCGAATTCAAAAATTACTC
AAAGCTACCCAAAGcaacattttgcaaaaaacttttgttttgaatcaTCG
GGGGCTTTCTAGAGTTTGATTTTTATATCATAAATATAATAACTGAATAG
TATGTTTATAATCCGATGTAATGACGATGTAATGTATTATACGGAAGCAT
CCGAAATAGCTCGGGCGTTTGTatgcttctgctcatcctctagcgaaaaa
gtttcttatagaagagaggaagtatatctatagaggtctgcgattcagaa
tAGGGCGTTTGACATTAGTTTCATTGCTCCAAATTCAAAGTTAGTGGCaa
aaaaaCTGGTCTATTATGGGTGCTTCTGTATAAAACGTTACGtcacaaat
atcaaaaatataacgTCATTATTAATGAGTGGCTTCCATACAATTGAAAG
CATTGAGAGAACATGTGTAGCGCAACATAGGGATGAATGAAGGCATTGCT
CTTTCGCAACGCAACGCATCATGCACACACTAGAAATAAAGAAGTTGAGT
TACAGTAATGTCAATTatatatttaaaggttttgtttttaaataagagtg
atatcgtttgctttactcatcaattttgaattacaagctttttca
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000146_pilon | genome | sc0000146_pilon:790313..800107 + |
|
