|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000135_pilon:77930..88724+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15354 ID=MSTRG.15354|Name=MSTRG.15354|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10795bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:77930..88724+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTAATTTAAACTGACCTTTAAATCGAATTTTCCGAGAAACGCAAATggac
tactttcactttcattttaatcgactcattttctttttatagatgttttc
aataaaaatgacCCATAGATGTAGCTGCatattgttttgtttatatttga
tgaTAACTAGTGTTAAAAGTGTAGAAAAGGTTTTGACATACAAAGTGAAC
ACAAAGACTGATTCTATTTGGGAATATGACGATATAGATGCAGATGGTTG
TGAGAAAATCAAATACAAAAGAGGCTTTCAATTGTTTTGTGTTGATGCAA
GATTTTCATGTACTTTAAAATCCAAACCGTTGATTTTGGATGAAtttaaa
agtgaatttttcaaTATTACAATTGAGAACAGTCTTGGTGGTTCAGACCC
TTGTGTCAGTTGTTCTGGGGAAATAAGTGGAACTGTTGATTTATTTCAAA
CCTATAAAAAAGACAGTGATGGAAAAATTGATTCTACCAGAAGCCACAAT
TTTGCATTAGCAGAATCTGTAACAAAAACGATACAAAAGAAACCTAATCT
TGAATATATAGAGATTTGGTTAACATTGAGTAGAATATGTAAACAATCAT
TGATTGTCAAATTGAGTTCAGCAGCTTGTAAACCAGTGGAATCAATAAAA
AATCTAATAGATGTACCGAAAGATCAGGTTTTTCCAGCACCCTCTAAAGA
ACAAGAAACAAATGATGTTGGATTGAGTTGTGTTGACAATGCTGTCGTGA
AAGAAGAACCTGTTTTGAAATGTATGGCAGACGCCTCATACCAAATTACT
GGTAGTTGCCAATGTAATGTGAGTTACGAAAAATTAGAAGATCGCTGTCA
AAAGTGCTCTGCCAATTCTTTTAAACTTGATATTGGAAATGGAAAATGTG
AACAATGTAAAGCCAATTCGAATTATAGTGAAGCACTACAGATGTGTGTT
TGTCAAGGAGACTATTTGAGAGCCCTTGATGAAAAAACTAACAGAAATGC
ACCATGTTACAgtaagaaaattaataaaattattttattcatttttgttt
gtCCTGACATTGACTTTTGAACTCTGCTATGTTAATTGAAATAACTCAAT
TTGAAACATCCAACATAGCTTTATAACTGTGTCATTTATTTAATTATAGT
CACACATGTCTGGAAGcctattttcagcatttcttgTTTAAGCTAGCGAT
TTCAAACTAACTCCCGCAGAGCATTTATTAGGAGAGATATTAACacgtca
aaaaatttattggaaaatagagaaaaaagcAGTATTACTCGCCAGTACTT
CAACGTACAAAAAACTACTCTTGGTGGTGGGCTATATGGGAAAAAAGTGT
GTTTTCAGTTGGAACTCTCTCGCTGTTTGACTTTCGCAAAATAATCATGG
AAGtgtatatttttagaaaaacctGTCATGCTGTTCTCCAAAGACATTTA
CATTCTAAATAACAAGAACACAAGCGTTACTATACAGATGCTTGATTACG
GTCCATCAACAACGTACATTATCAATTTACCACACAATGTAAGGAAAGTA
GCAAAcaaaccaattttcaaaatcgatCATCTTCGTCCAAATAGTCAATA
CAACATCACAATTGAAGTTCAGAACGATGTGCTGAGCGCGATTGGGGTTG
AAATCAAAGTAACAAAATCATTTTGGACCAATGTCAAAAGTAAGTAGTca
tattccaaaaaataattgaataatatTTTAATCTTGATAAATTAAAAAAG
CAATATAGCTTCCAttaatgttttaaaaagtttcaacagtttgcaacaaa
acatttttatgtttcattatTCAAAAATTATCCCATCTTAGAACCTGGAG
CAGTGAAGAATATTCGACTTGAACGTGAGACAATATTGATTTGGGATCCA
ATAACTGATGCTGGGCCAGTTGAATATGTCATCGAGATGCAGAATGAAAC
CTTAACTACACcaaataattttcattctttggaaaataatatgaaatttg
tTTCTGGAAAGGTACGTTTTCATATGCGTATGTCATCATCCTCTAGAAAT
TCTCCTAAACTTTCGATCTAAAAATTTTCGTTGTCCATGGTTAATGCTTT
ATTCTATAAAGATTATTTGCAGTTAAGTCTCCCTAATTCggtaattcgaa
tctctatcaCTCGAATGTTTctataatgggcttttccagaaaaaaaccgt
ataccccctgttgaggaggtccatccccctgtggctggaaatgctgtaac
cccctggaattccaggcaatttcaggtttaaacccctctggaattctgaa
ttttaataggatttaaaaagctacccccatggaattccagttatttttga
ccgatttttgtatctccttatggaattccgccacatatcaaaccttaccc
ccttggaacggaaatggacgagggtatacggtttttttctaaaaaagccc
aATTCGagctaaaatattggtcccctcagcatGAAAGTGGTTTAAATGTA
ATTCGAGTTTTAGTCCCTCgaagatcgaataagagagtgTACTGAAAACT
TAAATAACATAAGACCATTTCTAAGAGCACATTGAAGCTTAAACTCAAAA
TCAACTCCACACCTTTTTTCTAATAGATTCATGCTGAAGTCAATGGTCCA
ACAGGCAAAATTAAAGGCTATCCAATTGCTTTTACCTTCACACCAACCAC
accgaaagaaaaaaatgattttcatttaattATTGGAGGTTCCGTTGGAG
GGTTCTTGTTGATTTTGATCATCCTAATGATTGCATTGCTGGTCAAAAAG
CATCGAAAACCAGCACAATTTGAAGTGACAAGAATGGAAGATGGAACAAG
TAAGATATTCTAATGGACTATGTTTGATACAATTTgtagataccttaagg
gaacttattttgccGGGAACTAATCTTGGCGAACTCGGCAAATTTAGACA
ACATTCGCCAAAAGtggttcccgccaaaattaaatatttcgcTCACTCgc
taaaataagttctcgcaaaaattaaatttttttggtattttgcctaaaca
acttcttgagttcacaaaaacgcttcaaataaggcaaaatagaacagatt
tacactgtcattcgccaaaatttgttcccgctaaaattaaagaaattcat
caatcgcaaaaatttgaaaattttaaggatttttgccactcgtcaaaatt
agttcccgccaaaataagttcccttaaggtaattgagttttttttttaga
atataaGTAATTGCCTTATGAGTAAGCAACAGCCTTGGTAATAGGAACAA
CGAACTTGTTTTGACTTTCCTTCAAAAGTATTTATGAAATAAGGTAAGAA
AAGTAATAGAAAATACAACCTATGCCAGAAAAACCTCCCAAATTaaattg
tcttttattttaGTGACTATTCCCCGAATGACATTATTCAAAACAAGTCG
ACTATACGTCGATCCCACAACTTACTCACATGTGGATGAAGCTGTCGAAG
AATTTGCGTTGGAACTTGACCGAAGCTGCTTGACTATGGACCAACTTATT
GGAGGTGGTGAATTTGCAAATGTCTTCAAAGGAATCTTGAGTACTGAGAG
CAGAAACAGTGACGTTGCAATCAAAGTTCTAAAGGTAATACAATCGAGTC
TCAATAATTcaaacctctattactcgaatgaCTATTTAACTCGAATGAGT
TTTCTGGTCCCCAAAATTGATAATGCCTGAAAAACCTTACTCTACACAGC
TCtacaactcgaaatttccttaattcgaataaatttgaTATATGCACAAG
TATAAAAAATCTTGGGAAAACTTAAGCATTCTTTGAATGTACGAGTCTCT
TTAtgatatttcaaaacaaaagcctTCCATATTACAATAAGGCGTGTATC
TAGCGCATTACATGAGCATGGAATAAACATATTACTTAACTTACTTAAGA
TGTATTTGCTAAGAATAATGGGctaaaaaaatattctccaaaagcttatt
taaaaaaacgtgtagttcttGTAGTGTGGTTTTAAGAAAAGGAAGCCATA
ATTTTACTTCCAAAGTATAGAAGACATAACGAATGAACTAGTTGTTTAcc
ttttgatacaatttttcGTCTAACACATAATTTCTTCATTTCCATCAGAG
TGGAGCAAACCGTAGTGATCGTGATGATTTCTTAAGTGAAGCTGCCATCC
TCGGACAATTCTCCGATCCCAATGTTGTATCTATAGAAGGCGTCGTTCTA
aaaggtaaaattttttcaCTATTGTGGAAAATATGTGTGAACATTTGCTA
GCAATTGTATTTAAAttctcagctggcacacaacgttgtttcaacaccCA
TCTAACGTTATGttgacgttgtgaacgttagataaacgttaaaagaacgt
tgtgtgccagctggatagATTTACCAAGAGTGCTCAGTGATGGTACAATA
CATTTACAGTCATAATAGGGCTTAAGAAAAATGCAAGTGAATCGATTCGG
GGTGGAGCACAGATTTATGACGTTAttggctttttttttttgcatcggtg
cttcaaagatgaagaaaaagtAATGTTATTTCGGTGTCAAAGCATGCCCT
ATGGCGACAAATTATGGGTTTTTGGTCGTTGTTGACAGTGACCAAGAAAA
ATGCGTCAATAcccccccccACCCCAATATAGTACCAATTCAGTAGCCTT
GAAACCAGAGCAATTCGCATATATTTCTTTATGGACGTGGTACGAAGAAT
CTCCGGTTTTCTCATAAGGCATTTCGTATGTGCTTTAACTCAGTTGTTAC
TTTTTAAATCTTATACAACAAACATATATCTACTTTTACTCAACACTGAT
TTGCAATTTATTCTCCAGATTACCCAAGTCTGATTGTATTGGAATATATG
GCAAACGGATCTCTGGACAAGTACCTGGTGGTAAGTGATTCAATAATTAT
GATCACCCTTTTTGGGAAATAGTCATtacaattttcaagaaaaaagccAT
AGGTATTTTGTGGATTTCATCATGGTCCCCTATTTCCTTCCTCttttttt
ACTAACACCAACGTTTAAGTAGAAGAATAGCTAAATAATCCAATAGctat
aaacttttaatgaagtttggtacaaaattaaaaaaaaatcccaatTCTCT
ACCAAAAGGATTAAGTTAGCTGGCATCAGGAAATAATTATTTATTCTTCT
ATTTTTCTATCTTAGAAAAATGATTCACAATTCAGTGTAGCCAAATTATT
GGGTATGGCACGTGGTGTTGCATCAGGGATGAAATATCTGTCAGACCTTG
GATTCATACACAGGGTAAGTGAAATTAAATTGATCCTACTTTACtcggat
taaatttggcgagtaaaaaaaatcgcgaaattttctggatttaatttcgc
gagtcagagttcaaaaaaattttgcgtggattaaatttcgcgagtaagcc
tgaaaacagctgaaaaatagccatttttgccaaaaatggaGACTTTGGAC
TGGTTTCTCCTCAGAAAATGCGATTTTAAAAGCTGGTGGATttagccacg
ataaacttccaaccATGAATAGGGTCGATAAACTTATTTAGATTAATCAA
ACGTTGTATGGATGTTATAGAAAGCGggtattcttttaaaatttatgcCA
GCATTGAAATGACTTCCAGAGCTAAGCATCGTACATCACTACATTAAAGA
GAAACATAACACCGCAAAATGGATGGCTTTTGAGCTTATTAGCCTGGACG
TACGATAAAGTCCTAAggtttcttcaaaatttgatcAAAGATTTGCTAAA
AGATCTTTCGTGCGTGCCGCCATAAATGGCAAATGAAACCTATTTCTGAT
AATTTAAGGTCACTCGAAATCATTTTATGGCTTTAAGAATCATGTCaaaa
gacaaacgaaacgaaacgaaaaagaaagcaaaactaaaTTTCTTCTTTTC
CATTTCTTTGACAGGACTTGGCAGCAAGAAATGTTTTAGTGAACAGTGAA
GATTGCTGTAAGATTGCAGATTTTGGCATGAGTCGTGAACTGAAAACAGA
TGATACCTATGATACAAAGGTAACAaaatttctgtgtttttttttctgta
aacaaGTTGCCAGTATTCTTGGTAAGTGCCacattacaatgtcttcttaC
ATTACGGAACTAACAGCTGATTGTTTGTAAGTggcgtaaaatcagtcaat
atgtcacttgcaaccaatcagctgttggatccgtggaagacattgcaatg
atgcatatcatggATTAAGGAAATGCACTACTAGTATCTCTTCTGATATT
ACGCAGGTTGATGTGCTTagatttttgagcaaatttaaaaaagattaata
GATTAGAGAGATTGAAGAGAGATATCTTGATTTTAAGTTCATTCTCTTGT
TTTTCAGGGTGGAAAGATCCCGATAAAATGGACAGCACCCGAAGCTATCG
AATACAAAAAGTTCACCACAGCCTCTGATGTGTGGTCTTACGGTATCGTA
TGCTGGGAAATCTTCTCTTATGGTGAAAGACCTTACTGGGAATGGAGCAA
TTACGAGGTAGGTTTCAAGGACAGGGCAGAATAGTACCATTAAAGATTCC
ACTGTCTCTTTCGAAATCCTAATGGAGATGgaaattatattgtttcaaga
attttttatcCAGTTGAGATCTTTATGGAGTGAAATATTTTCCATGCACT
TttgaatggggataaaatcaactgtccagtggggctaaaattgtAGCGGA
TTTCTTCCACCGGAAATGAAATTTCGGACAAATTTTACGAGGGTGTCTAA
AGATTAATGCCTCATAGGATGACCCTAATCAAATTTAAATGTATTTGATA
TATTGGCTGGGTCAAAGGCCATCTGAAGGCAAacatttgaaggaaaaaaa
gtccggtgtccactttcgcgcgaagcgcgcgaaacttttcacgttatttg
taacgtcattggttgattggttgattaaaaaaagaagcaattccattggt
caaaattgacgtaacggttgaaaaaagttgaacttccttcaacttttttt
ttattcgcgcgaaacttttttatgacgtaatcttttcttcaggcaaaaac
ggctaagaaaaaatctttcgcgcgcttcgcacgaaagtggacaccggcct
tGAAAAACCATAAATCCCTTTAAAAACCCATTAGAAAAGTGAAGTAGAAA
TCatcttctaaagaaaaaattcaatgagctaataatttatttttattttt
ttgaaggtTATGGAAAGACTTTCGACTGGCTATCGGTTACCTCCACCAAT
ggtaagaaaagaaattttaaatctttgtaATTTTGTAGAACTTATTAAAC
TATTGATATTAAGAAAGAAATAAGAAAGTTAAAAGATTAACCGTGATATT
TTAGGAGAAAAGCTACGATCTTTGAATAATAATTCACGGTAAAAGACTTC
TCATACGATGCAGATTTCAATCGAACCCAAAAGTCTATCTTTTATTCATC
AAATCATTAACCAACACCTCTTTCTTCATAGGAATGTCCTAAAGGAATCC
ATGATCTGATGTTACAATGTTGGCACAAAGATCGTTTGAAGAGACCACGT
TTTTCCAATATTCTACAGAAAGTGGAAGAATGGTTGAAGAATCCTGATCG
ACTGACTGATATCGCATCTGTTATTACCAAAAGGTGAGGTTCTTTTCTCA
TCTGCAATGGGCTTTCCCAGagagggggtggaggatataacatttttttg
gaaatttaccccccccccagacaTTGTGACCTTTAAAACCCTGGACAGCA
TGTCTACTCCCCTCtccggacaagcattagttgaccccctggacacttaA
AATTATCCTCAAACAGAgtaaaattaccctcaaacagagcaagtcccccg
gacaaggcaaattttgtagattttttactACCCCcgggacactatatcct
ccacccccatgtatgaacattttctggaagcgCCCAAtactattattctg
aatctaaGTTTAATGAAGGTCTTATGTTGAGGATTTCTATCTAAAGAGCA
GGGGAGGCAGATTCTTGTCTTTCTTGGTAAAATCATGGTCAGTTTATGCA
TTTCTGTGCATTTTAGCGTTTAGCAgattttaaagttcgggcgagaatga
cattttcaggctttctaCTTTATCTAAtcggatatttcgatttgggagga
gTGTAATGGCTTTTAGGCTATATTCTGCGTAGTCAGACCATTCACAAGCT
TttagatcctcagatcctaagatAACTCTTAGGTCTCGTgttaaactcag
agttaaaactctactttcaaaCCCTAAGTTAAGAAGGCACTTAAAAACTA
ATtgcgattttaaaaattttgcacgGAAAttccttttgtgccaaatatta
tcGCCATAGTTGCCATTAATGGTCTCTAGCTAAATTTTCAAAGGGAATTG
AGTTTCTTATTGACGGTGACGTTCGATCTCTACCTGAAGACTCCGATGAC
TAGCTACCATGGAAACTATTTTAACTTGACAAATAATCagcctcttcttc
ttcttcttcttcttcccaATCGAGAAATTCACTTCAATCTCTGTATACTC
CTCAGTTAAACGAACGATTTTTTACCCATATCCAAAGTACATTCATCTTA
CCAGCGAGACTAAAATGACTCTAGAAACGTTTCtgaaattacaaaaagaa
ttataTCAATATCTCTCTTTTCTATCATTTTAATAGGGACGAAAATTTGG
ATTATTCAGTACTGGATGATTTAGCAAGCTGGTTAGAAGCAATAAATatg
aaacaatatttgaaaatgtttaccgAGAGTGGTTATATGACACCCAAAGA
TATTCTCTATTTGACCAATGAAGATCTAGAATCGCTTGGTGTTGGTTTGA
TTGGACATCGCAAGAAACTGTTGAAAGCaattaaaaacaccaaaaaccag
GTAAGGtcttaaaattataacattaCCTTGTATCAGTGAAAGGGTTGCCT
AGGATATCTCCTTGTGAccaaaaacaaaccaatcaCTATAAAggatgaaa
attaaaaacttttttgatgaatCTAGCAAAGCTTAAATCTCTTCACCTTC
AATGttaaacattttcttgaaataatcGAAATCAATATTCTTCCAATCAT
GATCTATCTTTTCAGAATTCTGAATTCAGAATTTTTTGAGCAATCACCAA
TTATCAATTccattttcttttccttcttcaGACTGAAAGCACCAACAAAT
CAGATACTGACAGCAAAGCATCCAAAGTGAGTCGAACCAGTAGTTTCGCA
GGATTCGGGAGCTCTCTGAGCAAAAAAGTCTCATTTCTGGCAAGTCCTAA
TTCATCAATATCCTTTAAGAAGACAGTCGGAAAACGAACGTCACTCGGAT
ATCAATTGCAATGATTCTGATTGGCTAGATATTAAGCAGTAgtgaatctg
attggatgaataacGAGAAGTAgcgaatctgattggatgaatatcAAGAA
GTAgtgaatctgattggatgattaTCAAGAAGTAgtgaatctgattggat
gaatatcAAGAAGTAgcgaatctgattggatgaatatcAAGAAGTAgtga
atctgattggatgagtATCAAGAAGTAGTGAATCTGATTGAATGAATATC
AAGAAGTAGCGAATCTGATTAGACGATTATCAAGAAGTagtgaatctgat
tggttggaTAAAGAGCAGTGGATCTGATTGGATAAATATCAAGCAGTagt
gaatctgattggttggaTACAAAGCAGTGCAGTggaaatctgattggtta
aaaatcGACAATAAGCTATGAATCTGATGGttgaatgttaaaaaaaatgc
aGGAATAATGAAGATAACTAATCTGGATGAATGAATATAAACAAAAAGTC
ACGACTCTGATAGGGAGATAATTTACAAAAGATATGAATGAATGAACAAT
GGATAATCAACAGATATTGGGTGAACAATAAACTTCGAGAATGATTGGTT
GATAACAAACAATGGACAGTGTTAATTGATGACGTTCACGAAAGAACCAA
AGTCTCATGATGAACTAATGAaattttttagctaaaatgcaTGCATGTAT
GAATAACAATTAACCTAATCATAGAAAGCGTATAACATATATGAGAACGA
TGTTGCATGTGATCAAAGTCATTTCGTAATCGAATTCtttttttGGCGAT
TGACAACTGTTGGTAGATCCTGaatcaaaatagataaaaatgcaGATAGT
TGTTCctatcaacaaaacaaaaaagctagaaatctttattttataaatga
TATGCACCAACTGTATGACTGTATTTCTTTctttacgtcacttgcaacaa
ATCAGCTGTTTTGAATAAAGTTAGGAGACATTGCAGGGGTGCATTTCTTA
AATTAACGGTTTACGAAAAAGTACAAATGTATGAGCTTCAACATCAAATC
TTCACGAACAGttttttttGTGACGAAACTgatataattttttcaatttt
aacaaaGGAAGGGTCAACTCAATaagttaaattttatttgtaaatatttt
taccacgcaaatcttttttttttgaaaataactaaCGGATGAAATGAAAC
ACACGACTCattttataaatcaattttttatgtttttactatattttttt
atattttgtacataaatccttttataacttttgagaattttttacagtgc
tatttatGAAAACAAACATTTATATTATAACTCTACATAAATCTTGTGCT
TCGATATCGAAATCCTCATTAAGAATATATCAGGAGTAACAAAAG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000135_pilon | genome | sc0000135_pilon:77930..88724 + |
|