|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000130_pilon:447366..454807+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15053 ID=MSTRG.15053|Name=MSTRG.15053|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=7442bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:447366..454807+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCATTTTGgtCCTGTTTTTCCATATTTCGTGATTTTTACATGCACCCATA
AGGATGGAGGTTCAAGTCGCGGATGGCTAAAAGCACTAAACATCTGCAGA
CCCGTTCGAGGAATAATGCTGGGTGCCGAGcttgtctttttattttacag
GTATATTTTGATCAGTTTGTTATCCTTGGGGATTATTTGTCTGTATTCTC
TAAGTCTTACTATATATGGGTAACCTGTATTCAAATTCTTCAGCCCGGTT
TcccatcttcatttttagataaTTCCATGCCTTATGGTGGCTTTGTTAGG
GTTTGTTTAGTCAGAaagtctgccgtatactatcttcgctttctgatttg
aatgatagcGCTGCGATAGGTCTCTAtttttttccaccatcagattatca
aaggcaaaaaatagttgAGCTCCAGACCCTGGACTAGGGTTTGTTTAGGT
GGCTTGTCACTTGTGATGTGGCCACTTTTCTTCCGGATTCTTTGGCTTCT
GCTTTCACGCACAGCTAATCCAACTTCTTGAGCCTGATGGATGATATTTC
CTTGAGGCTGTCAATGTTAGCTTTCTTAAGAATGAACTACAGTTGTGGGC
AAGCAGTAGTGTGGGTTTGTCCACTGTCAACTGTGTGCTGCGTCAGGAGG
CGTGTACAGGCCATTCATTCAGAGAATTATGATTTCCATTTTCGCCTGTA
CAGTCTGTACCGTGAGATTAGGTATCTTGCATCAGTGGAAGCTAACATGC
ATAGTCCTCAAATGAACAGTGTGTCACAAACAGCTGCAAACAGCAATATT
TCGATCGCACGCAAGCGCTTCAAAACgggggtgggggggTGTGGatgaaa
agtacgtacttaccaggaggtatagccatttgcgtacgcttgcatACTGG
GGGGAGGGAGTCtccattttcaacattttagtgcgtacatACTATGTTGA
CAGCGCCTatagttagggaaaccatccagaaTCCTGCCATTTTAtttata
agccagcaaaaaacaaatgacacttgtaaacttaagtttcttatcatttt
ctattgaaaacaaccaaaaacattgctacttctcaaaacaaattatcttc
catgATTATGGCACCCTtgtggatctattgttaaggccatctaaaatggt
ggaaagagttgcggaaagacactGCACTCCACCGCAACGCACAACGAacg
gtgtttcagtgaatatcaataattataagaatatctgaTGTGCTTAACTT
CAGTAAACTTCCTgtgcttcattgaagatgaagaaggtaagaagatgaaa
aatgcgctggaataatttcattgtaacagtttggtcaatcattgttgaaa
atttgaaaaagtttttccgacgcaaaaaaaaaaaattcagccaattaaaa
gaaCATTGTGCTTaaacttactatgtttgctacattgtCTAGGCTAAAAG
AAAGTGAGAAAAGACACAAAcgccatttttttaaatgagtgttgttatta
tttttttgattgcagCCGTGTACAGGAACTTGCCAAATGCTCCTAACTGC
CCTATGCCAATTTCAACATTAAAGTGAAAACagggaaaaatgaagatgaa
tggggttttctttttttttctatacaAGATTCTTCATTCGTTAATAAAAG
AATGTTGCCAAAcaatatcatactccaggatgctcTGtctcttattttct
cccttttattttctattttcctagatcttcgattcgattttctgactttc
tcaactgtttctaactgtttttcaagtatttttctgaaatttaccCGTAC
TCCTagtttaatgggataaactctcctggggattaaatttcgcggatttg
ggtgtcatccgcgaaattaatcttttttcgatccacaaaaattttaattt
ctatcCTCGTTTTTTCGTCTTGCAAATCAGACTACTCAAACCCCACTTTG
AATTTTGCGGATAGACccattgtgactctcgagctccaaccttaacccta
actgataacaACCGAaccccgtctaggtccgcagattaaaaaatttcact
tgcatcctggagtatgatatcgtttgccaacctgTCCAGAGGTCTgaact
ttttttaagaatggttCTAGAAGATGAGTATCCCaaagttttttctcatt
tatCCCCTCAAAACAGCTATGCTGTGCCTGTTTATACTTCACTGTTAAAT
ATGTAACCAgggggggggTTAGTGTACTAGAAggcatgtatgtgtactac
aaggtatttttcaaaacttgacacccacccacccctgaagtacaccatac
tacatggaaaaatcccaaTACCACCCCATAGCCCCTATTTACTACCGGGT
AGTacctggaaaaaaaacaaaaccaccccatacccccccccccccattta
ctaCCGGGCACTacctagaaaaaatttttctcgacAATCAGAAAATCggg
taaacatttttccaaaaattgggaaatcaggaaaactttttttcggaaaa
tcaggaaatcaggaaattgggaaaacttttttccaaaaatcagaaaaaca
ggaaaaatttttctcaaaaatccaaaatgcgtgagaaatcgaactttgca
aaaattacgcgagaccatgtggaaatgcatgagtctcacacccaatgcgt
gagagttggcaccaatgttgaatgtttgaattcaaatgttggaatgttta
cattgactcgatAAACCTTCATCTCAGTGGGATCTATtaggatttcaatt
cattccaagaagtttggaagaatgatcttggacaaacttggcttgatcaa
attataatagaacaactttacatttctattttagcagataatttcGGATC
CTTTTTGTTTcccagggctcgaaataacggtcggacatcggacattgtcc
gacccaattgctgaaatgtccgacccaaatcgattctagtcggacatcat
gtccgacccaattactttcggtgccttcaaaaaatttgtcagatgcgttg
tgaaatttccaaaagtaATTATAATTAACATAGAATTGGTAACctcttta
tttacacacaaaaactcccaaagttgcgatcattagtgttagatattcat
tttgtgtgatgctttttctcaacaaatgaaagcatgctTCAAGTAAAAAC
CATAAGCTTCTGACCATTAATTGgcatttgtttagcttctttgtaatcaa
tgtgaaattctatcagaagcttgtgTTAGACTTGAAGTATATAGATTTGG
AAGTAAGTGCAGTCTGTCAGGTGTATTTTCATTCAAGTAAAGATTACTCA
AgctcacaaaaataaaataggGCACctgcttttttcctttttcactcAAA
TAAATCGTGAtcgtttgtttgattttcactATAAGGAAATTTAGTATTTC
AAGCATTCTTGAGTATTTATATGATCACGATCATTGTTTTTGGAGATAGA
GGCTTAAATTCAATTATGCCTGAGATGATTCATTATACTAGCTACGTACA
GAAACCTTTTGCTTTTTTAAGTTGAAAGACGAATGTCCGACCCCGCATAA
AAAtcaatcggacatgtccgacccaatttactttaaaagccttaggacat
gtccgacccaaatcaatttttgatcggacaatgtgtccgaccacctaaat
attgttatttcgagccctggtTTCCACACTTTTAACATCGTTTTTGGCCT
CAACACCAcaattatagtacacaggtagtacatgacaaatttttttctca
aacacccacccaccccaggatacatgccaccttctggtacactgaccccc
ctgCTGATGTAACAACCAATTTGAATTATCAGGGCTAGAATTAAATTATA
AATTCTCTGCAAAAaatgtgagtatttttgacaTTTACATCAACTCTTGG
ATCtattatatttttatccaatttgatattataaaaattatttagacatt
tttagttgttttttatcaaaattttcctccattttttgggtttttgctGT
TGATTCTCTAGGACGATGTTGATTGTTGTTCATCCAATCTATAATTTAac
tatttttaaatatatactTTAAAACCTTTCAgttttgacaggttttgaac
TATTTTTACTCTCATAACCAGATAAAGTCTTACTTTAAAAATGGACAAGC
TACCTTTAAAACATGTTGTTACCGTAAATGAGAGGGGTAGCGCCATCAGA
GCTGTGCGTTTTAATTTTGATGGTGAGTATTGTATGACATGTGGAAGTGA
CAAATCTGTTAAATTATGGAATCCCTATAAAAACATTCTATTGAAGACAT
ACTCTGGACATGGCTATGAAGTTTTGGATTGTGCTTCTTCGACTGATAAT
AGTAGACTGGCTAGTTGTAGTGCAGATAAAACAGTTGTTCTCTGGGATGT
TGCAACTGGTCAAGTTGTTAGGAAGTACAGAGGTCATCTTGGTGTATGTA
TGCttttatttaagttttcgttgttctttgataatttattttttatattg
attctatttcttcagtaaatattttttaaagtacAATCGTATGGATTTTG
AAAGTACTATTTTGCCGTAGTGTgtcccaccttatcctaaaattcccacc
ttcagcccagactcccagatcccagctaaaaacaaaaaaaatatactaat
tcgaggaacaaaacaaaattctcGCACTCATTTTACCCGCATACTTTTAC
TTGACtagttatataagtgtaataaggtaagtaaaagtaaaaaaaatctt
cttaaagatatttatttaaacatcaaataacctgtaataataaaaagaaa
agtttagcatggtaaaaaattatttatgaaatatataaaaaaaatatatt
ataaaatctgaaaataagaaattttactttaactttttccaaaacaccca
aaatcccacctaaagaaattaactcccacctcaacttgtttctcccacct
aaaacctggaaaaaccccaaatcccacctgaaagttttcgacccaaatca
gcAAAACCCTCCCTCACTATTCTGAGGTGGGGGCGTGCACACTATGTTTG
CTATTACTTTATGCAAATCCATTAATTTATTGAAAGAATGAATCTTTCTT
TTGGAttgttttttttacagtatactgtttgaaaaaatcttactATTTAC
ACTTtggtacatttttatttttatcacatttttCAGTCATATTATATTGC
AATTCTAATATTTCCCTGTCTTACTTTTAGAGGGTGAATTGTGTCAAATT
CAATTCTCCTGACAGTAGTGTCATTTTGTCTGGATCATATGATGCTACTG
TACGTTGTTGGGATTGCAGATCAAGGAGTCTGGAACCCATTCAAATTATT
GATGACGCTAAGGACAGTATATCCTCATTGCAAGTtacagaaaatgaaat
tttaacagGGTATGTATAAATCTAGTAAAATTATTTATCATGAATTAAGA
CTAAGTATTTTATAGGTTTATTCTTTGTTTGgtcaaattatttatttttg
gcTGATGAAGATTatgaagattttttgtttttgaaattgagGGTGGattc
cttttaacttatgttcatttaattattttcaattattttgttcatttatt
ttcattttagttcagtggattcttattcaAGGATCTATGATATCCGTAAA
GGACAACTAAGAGAGGATTGTATGGGAGAATCAATCACTTCGATATCTAT
AACAAATGATGGACAATGTATACTGGCATCTTTGCTAGCCAGCTCAATTA
AATTGATTGATAAAGATAATGGATCAGTATTAAATTCATTTGAAGGACAT
GTAAATAAAGAGTATAAAGTTGAcagttgtgtttcaagcaatgATACCCA
TGTTATGAGCGGCTCTGAGGATGGTTGTATTTACTTTTGGGATCTGATTG
AAGCAAAAGTTGTTACGAAAACAGTTGATGCACATAAAGGTGTTGTGTAC
TCTATGTCAAAACACCCTGAAAAGAATAGTATTTTGACTGCTGCAACAGA
TGGAGTCAAATTATGGACATGTAATGAAGATGAAATTAAAGACGATGAAC
AGCAAGGCATAAAATCAACCTGATTAGTTGACTATTTATGCCCAAATAAT
TTCTTGATCTTCACCTTTATACACTTTTATCTGATAATACATTATTTATT
TTCTCTTGATATTGCACACTAGGTAACCAAATAGGTTACAGTTTCTAGTT
CAATAGATAAAATATTGTAATTCTCACATTTTTGTCATGTTGATATAACA
CAACGCTGAATTATTGTAATGTATGCACACCTTGTGTTTTTCAGATGAAA
TATTGTGAAAGATGATAAACAAAcgataataaaaaatcaaaatgagtgAA
AGCACAGATTGTTATGCTGATGTGGAAAAAGGGTTGAAGAAAACTATCAA
CATTATTCTCTCTGAAGAAACTGAAGATAAGTCCAAAGAGAAAAATAACA
ATTTACAACATGCTGTAGAAGATTTTGAACAATCTatacaaaaattgcaa
aactttTTCACAGAGTCTCTCTTGACGTTCAATTATTTGAATCCAGCAAA
GAAGGAGGAAGATGAGATACAACAAATGAAAGAAGAACTTGCTCGTAAAG
ATACTTTGATTAAAGATCAGATGAAAAAGCTTTCGAGATACAGGATTGAA
CTTGAAGTCATTCAAGAATTACAAATGCAAGCTCGTACTAAAAcattata
aaaattaatttctttgatCCATGACAAAAACATTTATGCTGTAAATCAAC
TTGGATTATCTTGAATTCAAAATGAACTTTAACACAGAGCATTTAATATC
ACCTTATCTTGGCTGGTAAGTCACGTGCATCTCCTGTGATCCAAAATCGT
GATGTATAGTACCATTTACTTGGTAAATGATACCAAGCTATGTCTATGCT
ATTTGGAGCTGGAAAAAATGTATTCTTGTTGGAACGAGtatatcaaattt
ctattgcTTTACTACAGTTTAATTTTGAAGCATTAGAGCTTTGTCATCAT
TTAACAGTAAACAATTTTGTGGTGGTTACACTATATTCGCTTCGATATAA
CAAGATTGATATACACTGTTTTCAGTGGTCCCTATAGTGCCCTCAATTTG
TATAATTTCTTTATCTAAAAGTTTGAGTTTTCCCAACTCATCCACTCATG
GCGCAGTACTCATTGCGCTTTTCTACAGATAAGTAGGTTTTATTTCGTAG
AATTTTTAGTAGGATAGAGTGAAGTCCCCAAATGTACTAAATGCTGAAAA
TCCTCTAGAAATTATGGGAAGGGAAGTAGCTACAGTGAGAAATGTGAGGA
ATATACGAGTACTGAATAactgaatatttaaaaaaatttaatagcttaaa
atttgaataactcagccaaaaaaaaaggattttttattCGATCACTTTTT
ATTCATCGTATGCATCTTCtgtaaaaaaatggtaaaataata
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:447366..454807 + |
|
