|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000119_pilon:81693..89519+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14338 ID=MSTRG.14338|Name=MSTRG.14338|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=7827bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:81693..89519+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGCAATAACTTTGTAACAAACTTCTACTGTTCTATCACTCTTGTCTATG
CGTGTCTTGaaactcaaattttgccaaaatatttttcatagcCCGTCATA
AGTGGTGAAAAATGATGTTGTTGACAAAATTTAGAGTGAGTGCATTACag
aaacactgtttttaagaaGTTAGATAAACTTTCATTTTACTGACTGGAAG
ACATATTAGAAAAAGGGAAATCACAAAAATGTTTGCTGTGTGATTACTGT
CTTATCggaaaaaaaagttacaaatcaCGATGAAGATTACGCTTTTACCG
TTTCAAATTTACTTGCATTGTCTATTAGTTTTGAAAACGACATCAGATCC
TAGTATAGTGCGGATTCAAAGAACACTTATCAGTCGAGATCCATCAGCAT
cttacaaacttttttataactCACAAGATACTTTTGATAATCCTTACAAG
AACAgaagattttgtaaaagtttaAATGGAAGATGTGCTTCAGTGTATTG
TGGGAAGTGCGAATGTAAAAATACAGATGACACCTTTTTATCTTACAACC
ATGGTTGTTTGGTGAAAAACGATTTATATCAAGCTACCAATGGTATGAAT
ATTCATTTCTCATCCAATAAATTATGACACCTCTGTTTCAATCCTCcctt
acccagctggcacaaaacgttgttttaacgttcatctaacgttatattga
cgttgtgaacgttaaacgttgcaacaacgttgtgtgtcagctggatATAT
AGATATTATGGATCATATGCAGTTAACAGTGTCCATGGTCAAATTGTGGA
CCAGTGGGTTTCACTTAAGTCCAtttgtacacccctgtctcagtgccggc
ggtagaactttttccctcaatGGGGACGaagatttctatcaaaatgccaa
gggggatagaaaatctattgtttccagctcgaaaattccagtggggatgg
ttttggagtgcaattttttacattcagttttcaatggggataaaatcata
gagcaatttcgcagtggggttgaaattgtaggatattttttccaccgggg
acgattttttggcctatttttccaccggggtggggggtccaccgggtctg
tgacacaggggtgtagttGTAATCAAAGTCTGTAATTTTTGAGCGATTTC
TAATTCTGAAGACTGGAATATCTCAGTTTGGATTAAAATCTAACACAATT
ACAAAAGGGTTATAAAATCTAAAGATTTCAGCTGAAAAGATAAGCCATCA
GGTTTAGTTTTAGACCACATATCTTTTAgagttttaaagtatttttctaA
TCGGGGATGATATTTCAGTTCAGTTTCCTAGCGAAAAAGGTTCAACATGA
TGTACtaaaaaaccccaaaaatgtgtacgaagaaaattttttgtttaaat
taaaGCTGATAGGTCCTATTCTAAGGTCCTGAGTAGTAGTGTGGAGGAGG
GTCCGGATAACGAGGtccgaaatattttcaaaatctgataaaaacggggg
aggggggTTCCGGGTAAAAGGGAGGGGTCCAAAATAGTACCTCTAAAccc
ccccGAAATAAGGTAATTATACATGGTTACTTAGAGCAATTGCACGTGTG
ATAGCggaaagtatttcaaaaataaataaattggaGGATATTAATAAGAA
CAGAAGTGGGAGGTTCtccaaaaaattctcgaaaattaATAATCAGATGG
AAATGTTGATTCAAGACCTTAGAGAACTTTAACCTTTATCTTTATTGTTT
TAGGTACTGACAATTTAGAGTATCACAAATTTGCTGCCATCATACCTACT
GCCACAACAGCTactttttcacaaaacaaaTGCGTCTATCTCTTCATTCC
TCCACTCCTTCAACAACATCTTCAGTTTTGTTCGGCTGCATCGATATGGA
AAAATAATCCATTGAATGGAAATATGGAATTGTATAGTGATCAAACAGCC
GGCAATATCCTCAGAGCTAATCATGACGATAAAGGAGTTTGTATTACGGT
GAGACTTTgtgatacactttttttataagaacaattttataagaactatg
aggctcaaaatcgccaaaaataagaacaatttaagaacaatgctgagcct
gaaattactcaaattcAATGAATTGTAGGGgttaaaatagtaaatattGG
ATTTAACGCCTAAAATTCCTCAATTACAccttataaataagaacaggata
agaacaatttgaggctcaaagtgacaaaaaaaataagaacagcttagcct
cagcaaaattttattgtttcttataaaaaagtgtactaGAGCCCTATTTC
ATTTTAAGTTAGTATATGCGTTAAATCTCTTCAATTTATAGTTCTCGTAG
GAACAGATTTCACTGTCTAGTCAAATTTTATCTGCAAATTTGATGTCctt
aaaatcaatattttcaaatattttagtgtCAAGCTTTCAACTGTTTTGGA
CTTGATAGTTTGAGAGGTTCAGTTATCAAGTTAGATTTGCATTGTCAAAG
CATATATGGGAGTAAAGTTACGCAAACAAATGCTTGCTTTGTTTTCAAAA
TGGAAGGGAGTCGATCTTTGTTATGTAAGTAATTTCTAAGTTAATGATAT
TCCCCATAGCGAACCCCGATTACACCATCAAGTCAAAAATTCCTTTATTG
ATCACccattacattttttgaaaccaTAAAATCAAACCATAACGCCATCA
CGCCCAAGGTCCTATCATTCCATTAGCTGAACTGCTTAACGCCTTGATAA
AAGATGGTCAGAATAAGTTCTGCCAAGTTTATCTCAAAGATTTTAAATAT
CGTTTGTACGCAGCATGTAGAAAGCgttcttttaaacaaaatatttcaat
aatgccccggctggcacacaacgttgtttcaacgtttatttaacgttcac
aacgtccatataacgttaggtgaacgttgaaaaaacgttgtgtgccagct
ggattaaggctttttcaaatattttgataacaAATCTAAGAGTATAATTT
AATTTCAtaatagaaaataattttaatgacaattatttgttttaaaactt
aatcTTTTCCAGACAGCTACAATTCTACTACATCAGCTCCTCAAACTGGG
GcaacatcaacaacaacaacaaccacaacgtcaacaacgacaaAGACGAG
TACATCAACAGCACCATCGACCACAGATACAACTCCTCCACATACAACAC
CATTTATAACATCTCATCGGCCAGCAACAACTGTCAAACACACTACCAAT
TCTCCCACAACAGCTGGAAAACCTTTCACGATAGCCACGATGACGACACA
CGAATCAATACAAACCACTCGCGAAACAGAACCTCTAATTACAGAACCCA
TCACTTCAACACAGgtaagaagatgaaaaaagtaCAAGTTGCAATGACTG
TTCCTGCAAGctttattttaaaggttttatttttacataagtgttcccgt
ttatTATCAGACACAcattttatatcaggacagtgtctgcctatttttct
gttatgctgatataaagcAAAAATTGAACGGtattcttttcctctttctg
atcaatcttgccccacatccgtgtcaattcattGTGAAAAGCTTGTAGac
taaaattgatgagtaagcaaacgataacacttttatttaagaacaaaacc
tttaatatatTGTATTATTTCATAGGAATATACACTGAAAATcggcaaaa
aataaataaaagaatatgCTTAGAACATCAGCATCACGAGATTTGACCTT
TAAACTTAAGAATGCcgtttttactttaaattgccaattatacCCTGGTA
AAGGCaaaaaaaCATACATCgtaaattttataaattgaaCGGAGGTTGGA
AACATCATTACATGTTAGAAATTTCGGCCAGGGCTGTATTCaaggtactt
taatgggataaattttcgcggggattaaatttcgcggttgagctcatccg
cgaaattttaagatttcgcgggattaattttcgcggatgagggatttcct
gatttttcgcggggatttaatttcgcggattggggtacaaattaaaattt
ttgaaaagggtcaaaacattgaaataaaaattttccaggaaatttaagaa
tttgtttttcaagtaataagagggtgttttggaatagggcgaggagatat
gtattacaaagAACACTGTTTGCAAATGCTGCTGCCAAAACAAAGCGTCC
GAGTAAACCAGAAAACCCATCTGTTATCCCGAAGACATCTAATGGGCCTA
TTTTGTTAGATTAGGAAGTTTTTTAACTTGTTAAAAGAAGCAAAAGAGAG
ATaaataaaatgacttaaaattgttgtttcgttattttcactctttctta
tcattgaaaataaattcttttgatttccgttttccctccttttcttacat
atccttttaaatgtttaatttcaagccagttggattaccctcttgcattg
aaaagcttttaacaataagcgatcactttagataaaaaaatttccaatac
ctcttccaagtttgtaaatttgtgaagaaaattttgaggaaaacgatttt
ttgctaacaagcatatcgaggatttgacctttttcgagggttgcgtgccc
tcatgtagaaaaaaaataaaaaaagatAaaaatagaaatttcgcggattg
caaaaaaaattcaaatttttcgcggaaactaattttcgcggatgggcctt
tttcagaTTTCCAatggaacttattttcgcggatgacacccaaatccgcg
aaatccgcgaaaattaatccccgcgaaaatttatcccattaagaTTTTGG
GTTATAGCTTTAAGAATATCATAAAAATACTTTAAgcatgatttttctaa
aaagttaaaGATACCCATGGTGAAAAGTGATAAAAACCACTTATACAAAG
AACTTAGTAGTACTAATTAACATGCgacaaaaattatataaaatatttct
GATTGTTTTTCATAGAAAACTTATGCTGGAAACCCATCGAAAATCAAACA
AGAGGAGAAACCAAATACATTGCTGTATATAACAGTCCCGTGTGTCGTTG
CGCTTCTTGCcattgtcgtCGTTGTTGTTTTCATTAACCGAAGGAGAAGA
TCAAGGTAATACTAGACTGGAGTCATTTATAATACGCGCAGTACACCATT
GAGTTTAAAGCCCGAAGGTTTAGAGTAGAATCTGTAACCTTTCCCAGGTT
AGAAAAAGAGAAGCCACTTATTTCCCATCCAGAACGCGCCTAGAGCGCAC
CGCAATCCTGAGGACGGATTGTATCTAGCGGTTCCTTTGTTTTTGAGGAC
TGAATTTTATTATTTTGTGTAAAATCCACGTGTATGACTTCTGGATGGGA
actaagtggtttcatttcccatgcatccaggagtctcgataAACTAGTcc
tcgggcttggaagtcaatgtgCAATACATTAATATTGTTATCATATGATA
ATACAATAATCGTAATAGGATGATATCAGTTTGtattatccaaatttttt
ttcttgttctgCTCGGTTCTgcttatgtctgaattagttaCTTTCTCCTA
AAATGATCGattttatgtatcggaggatatcgtgGGCGACAGTATGTGAA
GTCGACTCAAAACAAAGTTGATTGTTGATgaacggctctatatcgccttt
gctcacccaAACAGAGGGCGGtactttggtgtttttaccatcttaagcaa
agtggacggcggTTTTAatgacatgtcaactttgctttatatcgtctcct
tcgatttatcaaatacataaactctctATTATTCTAGGAAAACTGGAGGT
GGTGATGTGTCTTGGCATCATAATTCAAGCACATCTTCAAGAGCGCGAAT
AAATGCACCAGAAAACCAAAGTCATTAcgaaattgaagatgaagataCTT
TGAGAAATGGAAACCGATATAATACGTATCCTAATGATTTAGGACACACT
GTAAGTTACGAAGTCAATTTAATCAAATCCACAATGAACAGATCCTTGTT
TTGAAACAGTTTTAAGAAAGACATTACGTAATAGTGAACTTATTTTTCGC
TAAAATACTACTATAGGTTATTTAACTCAATTTGTTAATCAATACGCCAC
TTTCCTTGAAGATGGTGACTGAGAAAGGTTTGAGCCCCGGTTTGTGCCCC
GGTGCTTTCTactgaaattgtattgaaatcTGTTCTTCTtagaggaggag
gaggaggaggggaggaggaggagaggaggaggaggaggaggaggaggagg
aggaggaggaggactGTCAGCATTTCAGTGTGTTAAGCCAATTTGATAAT
GTTTTGGCCAGTAGCCATCAATTGTAGTAATGAAAGATGTGGGTTAAATT
TTAAGCTAAACTCTTGGCTTGGGCTACGTAGAACTGCTTCGATGATTATC
TCTGATTATCTCTTTTCTTACACATTTTTGTAGAACGGAGGATATCGAGA
CAGCAACATTTACCAAGATCCAAATGCCGTGCTGACAAGAGAAAACGATT
TGTATGGACTATCAAGCTCACCAAAGAATGCTTATGATGAACCAAATTTG
GTAAATTTACCACCAGAAAATTCAGACAATGATTATAAAAACTTGACTTT
ACCGTATAAGGAAAGTTATTACGAAGGCATAGGCGGGGGTTCCTCAAATC
AAAGAGGAAGTACCTTGAAGAGGGCGCAGAATGATTATTATAATATGTGA
TAGTCTAAAATGACTGGTCTTGAGCATTTGTGGTAtatatatttaaaatg
aaaaatctagatgattacaccttttcgactgtagttGCCAATCACCACGC
GAGTATTCTTGTGTCCGTTTTACCAAcctaaaaccatcccagtcaTTTTT
TCGCActtatagacaatagaaaaaggtgtaaaataaGTGGATTGAGTTTA
GGGGAGTAATTAAATAAAAGAGTGGCACGCGCCTAAcagcgcgactacgg
tcgaaaaggtgttttGGAATGTAATTGTACCGGGCAACTCacaaattttt
ggatattctgAAAACCCAATAACGATCAAAGTTTTGTTTGAGCCTAATAA
ATTTTATTCCTAGattcatttcaatttcgatttgTTGTATTCAGCCCAGT
AGTTTGACTGTAGACTAAGGGTAAGGTCTTGGGGTGGTTCCCAAGCTTCC
AGATTTTTTGAGCCGCCCAGTATTATCTTCTTAAAATATTACTAACAATT
TCAGGGACCCCTTaaaaaccttagaaaatatgattgactttgataaaaaa
gaatttatgaaatattgtaaaataaaagtaattactaaaaggcaataaaa
attttgaaaaaatattctttctaaaaatgttaaaaatgaaattaaaaata
aattctcctcgtagaaaaactgaattgtttttttttggaaaacgatgttt
ttattttagcccTGACCAGCAGCCACCAAAAATACCGTTAAAAATCACTT
AAGAAATATGCATCCTCTATGTAGAAGGAAAGCTTCCGTACTTCCGAAAT
GGAAATCTTCTAGAAAACATGTTCGTCTTGATTCATCCTTACGTATAATA
TTTACAGGTTGTCTATATCATTTGCACAATTGCGATCTAATTTACATCAC
GAAGTTCGAATTCTTCTTGTCCAAATCTGACATTTCTGACATCTAGataa
aatcaaagcaaaaatattCAAGCACAATTTGATGTAGTATCGTGtttaaa
attcccgtccgagagttacccctgTCTTTGTGTTTTGGAGTTTTAGAAGC
TTGGTTAGTAAGATTCGTGTGAGAAATCTTTAAATATCATAAGATTTAAA
TTATGAATGGCTAGATGTTCATACAAT
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000119_pilon | genome | sc0000119_pilon:81693..89519 + |
|
