|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000114_pilon:1078676..1089498+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14016 ID=MSTRG.14016|Name=MSTRG.14016|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10823bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:1078676..1089498+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AACTGGAGATTAGAAATTGTTAAGATTAAAGGTATGCATTATTCCCCTTA
CTCACGTGTAAGCATTCGTGCATTCTCATAACTTTGAACTCGTCTTTGAT
ATATCCAATCATGTTGAATTGCTATTTGTATAATCAATCAACCGCTAAAT
TACTTTTTTCCGATGTTAATCAGTCATGACGGAATATCATGTTGAGTGAT
TGAAGTCGTGTAGACATGCATGATCGGATTATATTATTATGGCACATCAT
CACCCACTACAAaacaaattgtttttgttttttttcaatttccagtACTA
ATTGAGTGAGTAGTCATCATAAAGTATACTATTATCACAACTTGATTGAT
TGAAACATAGACCCCCTCCTTTAAATCACGGGATAGTATAAGAGAAACGA
GTTGGAAGTTAATGAAGTTGTTGGTAAATTaacattttgatgatttttat
tttggtaaaatttcgaaaagtttgCCTTAAATTAGTTATCCATCTAGTAG
AATAGAAATCGTTTTTGCTTTTTAgagtttgaattatttttgaatccATC
ATGGAGACTTCAAAGAAGACAGAAGATGAAAACCAACTGCATCCAATAAT
ACCTACCAAAAAATCTGTAACAACCAGCTACCAAGAGTTGATCATCTCTT
CTATTGGCGAAATTGGGCGTTGGCAGTACTTCATCATTTTTACAATAATG
CTCCCGAAATTCCTTATTTGCTGGTCAATGGTTTCTGTTAGTTTTACACT
GGGTAAAACTGAATGGTGGAAAGTAACCACAGGAATAGATCCTAAAAGTA
TGATTGTTTTTCATCCCTAAAAATGCAATGAATTTGCCGACTGATAATGG
CCCAATATCGGCGAAAGTAAACTGCTGcgaaaaatttgttttaggTAATT
AGAACAAATGATTTCCACCGAAACACGATCTCCTTGTTTATTCTAGCATC
AAGCATATggttctaaatgtttttttgattCTTCTTTTCCTAACTTTAGC
TAATGTTTCAACCACAATCCGATTGTTCAAAGACTGTTCACCTCTTGGTG
AAAATGATACGATTGTTTATGGCAATACAAATACCATAACCAGCGAGGTA
ATGTAAGAGTGGAGTGtgttatatttttgttaattgacgaacttaaaggt
tttgttgtttttttaaataagagtgatatcgcatgtcctgatatgaaata
tgtgtcttcagagatttgggaaaagaggataagaattgcGCTATTCAGCT
ATTGTTCTCTAGGCTAGGCaaccttttgttctattgaaataTCTGCGTCT
GATCCATTGTTTTAGTTCTGAACCAATCGGAACGCTTGATTATActatgc
gcacaagactagaagtacaaacaaaaaatggcagccgtggttgatatcga
aagtgaaatatttttaatatcgggtattttggtatttttttataagcatt
tttcattttggacaggGCGGATACAGTGTTAATCGAGCCAAAAACTTTCA
GTTTTAGCCAAAATACTTTCCTCAAGGAATACTCGAACCAATGTCACAGA
TTATattgtagaaatagaaataattactagtgaaaaagaattcaaaattc
attgcattcaaacacaaaacgaagctggtaaaactaataTAGTTTTTCAT
TACTTCTCGGGCTTTTGACAATCATATAAAAAGAGCTAGCTAGGTTGAAT
ATTAAAACAACGAAGGAGAAGGgaaggaaaggaaaaaaaacaggactaaa
acaatggcaattcatgatatcaatgacaaaaaatcaaaaatatcatgaat
tcttttgtaagaactttttgaagtttacacaacaaagcgaaaaataatag
caatataatacaaaaaagtagcacacattaaaaacaaaaattatacaaaa
atctggtcgcgttgtaataacaaataataataataaactggTTAAATTTC
TGGACTAATTTGATTCTTGTtatgtcaattttatttgtcTTATTGCTTCC
AAAAGGTTACTTAAATAAttgcaagaaaattaattacaataaaaaaactt
tgacttgaTTTTTGCTCACTAAAAGCACTTTAGAAAATAAACATATATAT
TGTGAAACACTCTTGGATTTAGGGGGGCTCACTAATTCCAATAGAGGTGT
GACTCAAAGATAAAAAGCAAATTACcctttcaaatgaaattttagagaaa
aagagcatAAATACAACCAGACTGAAgatgaataattatataatgtGATG
CATGAAAATAGTTCAGTGTCCAAACTGGAATTTCTATTAAAGCATTTTGA
TATCTCTATGTTTGGTTCATATCTTGTAATTGTAGTCTACCCGCATTCTG
GTGTCTTGTTTGGGGCTATTTGCGTAATCAAGCAGGAAATCCTGGTAAAA
CAGGGGaaaaaaaGCCCTCAATCCAACTGCAAACAAACCATGACATCAGC
AATGtcatcagaaaaaaactgaTTTGTACATAATGCAGCATGTTTTGGTA
TCGAAATTCAGTtgccattaaaaaataaatttcatatatATACTACATAC
ATTATATACACATAAGAACTCATTTTCATTGGCAATTACAGCCAttacat
atcaaaatcaagTCAAAATGTACTTTCCAGAGAGGATTTATATGATACAA
ATTGATATTCAGTTTACAGggaaaaatttgaatccaaaaacaTCCAAGAT
AGAAACAAATTGTTAGGTACACATAATGCACATAATCAATTTGATAGAAT
TATTCCATTGTTGTTTCCATTGAGTTAAATATGGTTTCCACTCATCCATC
TTATTAGCAAAGTTTGTTGGTGTTTACAAAGATATTGAGCCTTGTACATG
ACAAATTCagacaaattttaagccaattctCATTGTATACCAGCCACGTG
AAGGTACAAAATAATTCATGGATCTAGGTTATTGGGCAGTATGATGgtaa
ctaacctgaaagtatataataatgaaaatgggAATTAGGATCTTTGCAGC
AAGCTATCATgaacaaatagaccttttttcaaagaggccaccttgttgaa
taattatgtagtccagcagaaaaacaatgataaaaccatgcataattatt
acaatatgcatgatacagtatggctctatcattgtttttatagctggaca
acataattattcaacaggacgtcctctttgaaaaaaggtctatacagaAC
ACAAACAACAAATCTTAATTCCACCGACCACCGACAACAACCGGTGAAAT
AAATCTTATATATAACTGGATAACGGTCAATACTTCATGAGCCAAtccaa
tctattaaccggtcagagccaatctactaaccggtcagagccaatctact
aaccggtcagagccaatctactaaccggttaGAGCCACCCTTTCAGAATC
ATAGTTTTTTAAATTACATAATGTAAAAATATTAGAGCCTGATTGCAATT
TTCTGTTacgaaaacttgaaatttcaatcctaaaaaaatgtttttcctca
gTAGAAGGTAAGAAGGCATCAAGGATAATTTAACGTGTACTTACCAAATC
TCAAATCCATTGCCATCAAGCAAGTTTTGCtaggaaaacattattttttc
atctaaaactaggaaaaaaatacaacatttttagtcgattttgcccatct
tcaatcaaaatgctaagaaagttTGAGGATGTGTCATGTAAAACTAAGCT
ATAGGTTGTCACTTAATCAACCTTACTGCTACCCATAAAAATTCTAtttg
caacacaaaaaaaataattttattcaacttaacaaacaaaaaatacactt
tttcatataatttttcagctatctTTGAAGGATGTGCCAAAAAGATCTAG
AAGGTGCCAATAAAAACCAAAGCTAGGCTAGTCACCTACAACCTTTTGCC
AACCCAAACCACTTTATTTTGACTCTGAAAGACTTTCCAGTAAGGCAAac
tagctaaaaataaaaaggtcccATTTCACATCCAATTTTAGCATGCCTGC
TTCCaccatctttttctcaaaaaataaagcatgcaacagcagattttttt
gtcagTGGAAACCCCAAAAGATCGTTATTTGCTTTTCAGTTGTTTATATA
AGTAGGAAACCCCTCCAAAGGAGTAAATTCAGACAGTTTTTCTTGAACTG
TTATAATACTGCACAACGCCAtttttttCGCAGTACCTTCTTGGCCAAGT
TGTTCCCTAGCCTAGCGACTTCAAACAACGCCGAATTCAATGATCAACAA
tgagaaaacagcgagcggcagcggcgattcttatcctcttttcccaaatc
tctggtgtcttatatgaaacgggaacacttatgtaaaaataaaaccttta
attttttaCTACGTTAGTTTATTAATACTAGAAATGCCTTCAAGTGTTAT
AAGTCCAGTTCCTAACTTTTTCTCTCAGTAAGCCTATCTCATCCTTCCAG
AAGTACTATTTATTAATCCACGGGAAACTGAatatattttgtccatgatt
gcagcttctttttttttagttcgGTTTGATATGTGACAAAGCAGCGATTC
CGACGTTAATAAAAACAATGCAAATGGTTGGCCTGGTTATTGGCTCTGCT
ATCAATGGACAATTGGGTAAGGAAAATATTTCCTTAATAAAAAGGCTATA
CCTTATAATTCGAACTACATAGcagttgaaaagatatttagaATAAGAGT
GGAATATcataaaatagataaaaaatagaaacatCAACTTCTTGAAAGAA
GTGTGCTGTTATTTTCAATTGCAATTATCACTAAACCTTACTTTGCAGAT
TATTTTGATGCAGACTTTAATTTCATATGTAAGATGAAAAGgtaaaatat
caatcaaatatagaaatatgaaaaaaacatataattaTTTGATTTCTTAC
TTAGGTGACTGGATTGGTCGTCGAAAATGTATAATTGGTTCCTTCTTGTT
AAACATTTCAGCAATTTTCATTGAATCTTTTTCTACAAGTTGGCAAATGG
TTGTTGTTTTGAGGTTTTTGGTTGGATTAGGAATGGGAGGTTGGTATAAC
ATTGCTTTCATTAAAACTTAATTACTTTTACTACTGGAtttttttCCGAA
TATTCTTACTCTGTTAcacgcatttttttataagatgatAGTattttgga
tgagggtcaagtattcttaagaaagtgccataattgagggtgaaatattc
ttaacgttttcttacttttttggacctaccccggtggaggtcctataaat
taacctttgtccgttcgtccgttcgttagttattagctttcctcatgatt
ggctcgttagtttttctgattttttgcgcaaagatgcataattataaacc
ctcgaatgtgacagagcccgattttcaacaaaaaaaattggggggcaaat
ttgggccaaaaaacggctaaaaaacaggttttttggactttgtgaaaaat
taggtcgttaattttttctgattttttgcatgaaagtagggtaccatcgt
aggtaaaaattggcttaagcagatttttgcaaaaaaaatttgttgggtca
aaaaacgcatgtttatctttaagaatcactattaataagcatacatcaat
gttcttagtcaaattactcaatttttctatgagatagatgtttttttgct
caggagggcttacttttgaagaatatgtgtgtttagacatgaaattttgg
ttgcttggcgtgtttttatagaaaaactggccaaattcgatattttttta
taagcacattatcaattacttaggtattagcttttctcgagattggctct
ttcattctttacgattttttgcacaaagatgcatttaactataaaccctc
gaatgtgacggagcccgatttttggaaaataatttttgggcaaatttggg
ccaaaaaacggctaaaaaatttgtttttttggactttgtgaaaaattgga
tcatttattttttctgattttttgcaggaaagtaaggtaccatcataggt
aaaagatggttcaaactgatttttgcaaaaaaattttgttggctcaaaaa
acgcatgtttatctataagaatcactattaataagcatacatcaatgttc
ttaaaattactgaattttttaatgagatatgttttttttctctcgaactc
ttgaatatgaaagaatatttcaagagaatgaaactttggtttctaaacgt
gtttttttataagaaacaaacaactaattttaatagatcgtcactatttg
tgttctgaatgattgtttaatggtcacgcttatgtagatatcaattatat
atgtgttaatgcataaccaggtaggtccataaaagtatcacttgttaaac
TTGAAtgttttacaaacatgagaaaatGATCAATGCGAGAgctttggact
tttgagtgaacatttgggttaaaattacatttcttcctcaaagttTTAAT
TTGTCTCTAACAAAGGaggcagtttttttctgttaaccaaatacaaaatg
actgtattcttatcaaattctgtaaaattcaccctagagggtattcttag
ggtattctaaAAAAGAGCGTGTACATTAAAACTCGTTGATTGTTATACCT
TATATCAGGTTATCAGGCAATTACAACTGTTTATGCGTTGGAATTTGTCG
GTACTTCATGGCGAACAATCATTGGTAGTTTTCCTTACTGGGGCTTCGGG
ACCATTTCACTTGGTGGGTTGTATTATGTGGCACCATATTGGAGAAATAT
GTACCTAGTTACTGGGCTAGTTGGACTGCCTTTTCTTATCTTAATGTTGT
AAGTAAACGAATTatacgctttttcttttataagaaaatctttgaCTGAG
GCTTGGCTAACAttatttttcgtgattttcagGCTTGTGTTAtaatgttc
ttttaaagttgtttttttttatgtatgttattttaatcattcttCTGTAC
GATGGTTTCACGAAAATAAAATCCTTTTCCAAAAAGAGCCTCTAAGAACT
TGGCATACGTGTTAATGAAAGCTGTTCTTTATACTATGGTGTGGGAAATA
TTCTGAGGTTGAGCAGAAGCCAGCGCCTAGTCCCGTTAACACCTGGCGGC
TACATTTTTTAACCTACCCCGGAAGTCCTATTAATTAACcgatgttcgtt
cgttcgatgGTCTGTTACCAGCCTCACTCGGGATtcgctcattagttttt
tttctgatttttttgcacaataatgTAAAACGGTAATGTTTAAAGTCTGA
AGcccgattttagaaaaaataattttttgaacaaatttggACCAATAAGT
GCCTAAAATGGGGTTTTTGTTGTCATgccatttttttctatattCTTATT
ACATTGGCCTTAGGTCCATCCAGCGTTTGGCTTGTCTATGTATACTAATT
CTACTATTACTTAATTTTTAAGGTTTACAACAGAAAGTGTGCGCTGGCTT
TTGATTCACGGAAAAACTGACGAAGCCATAACATCGATCAATAAaatcgc
caaatttaacaaaagacGAAAACCTGATGTTTCTCAGTTCGAAGAAGCTG
CAAAGAGGGAAGAAAGCGAAATGAAATTGAACGCAATGAAATATAATTAT
GCAACCTTGTTCCGAATGAAATCGACACGGATGAAGACTGTTTTGTTCGG
GTTTTGCTGGTaggataaaataatattttattacccctccccccccccaa
aaaaatagTATTATATTACCTTCACTTCACTTTATGTGAAACATTTAATA
AAACTCagctaaaatcaaaatttaaaaaatgctgataaCTTCTAGCAATC
GTTTTGAAATTTGACACCTAATAATTGGAAGTTATgcgaatatttttgaa
aatgatgacaaattttgaaaattttacatatttttaacattgaaaacaca
aaaaccggcaaaaaaTAGGACCAATCTACTTCTTTTATTACCAAGTTAat
attctcgccaaaatttctcaACAGGAAAATTTCACCCATTACTTGATCTC
TGAGTAACATAATTATTTTCTCAGGTTGACGCTTGGCTTCTCCTATTATG
TTTTCATCTTTGGAGTGACGTTGCTTAGCGGTCATCCAGCGCTGAATATG
GCTTTGACCGGTCTTGGTAATACCTTGATTTCAGTCTTAGTGTGGGGCCT
TAACAAAAAGTAAGTTTAATATCATATTACAGTATAGTAGTAGACTCTCT
CTTATAATACcgaacttttattattcgaatctttctataatttgaactaa
TTCCCAATCCCTGTCAAGGAGAAATCTACttaatatactttctataattc
gaatctctctgtaattcgaacaaataacattccccgtttgagttcgaatt
agtgagaCTCAACTGTACATTAAACTCGCAACTTGAACTAAGTTaaactt
ttctgatttttgcgaacCTTAGAGAACCAGTATACGTATACATACAAGTA
CGTACAATGATATTTCAATGAAATAAATTATGTGTCCTGAATACACCCCC
ACCCTGGCCCCTTCTCACAcatccggtaggattttttcagccagtgggga
taaaaataacggactgaaactcgattgggattgatattccaaagtttgtt
atggctgtacaattcttttgttttcaagtcagaaaattcagtggcgTTGA
GAAAAGTAGAATAgaatttgcagtgaggattggtttatttgattattttc
agtggggacaaaaattggaggatgatttcccaccggggacgatatttagG
CCAATTTCTACAGTGGGAAGGgctcccagtgggtctgtgagaaggggatg
tatgAATAAAgtggaacaaattttagttaaCTCCTTGATGATGGCTTATT
ATTTCATTGAAGGGTAGAATGGAGATTGAGATGGAATTACTTGTCCAACC
AATAGATATTCTTTTAGCACGTATTTCGGTCATGCAAATTCATTATGTAG
ATTATGTTACACTCTTTCCGTGCTTACTATTTTATAGTTTGCTTTTATCT
TAGCTGGTTCGCATAAACTTGAAGGCCTCCTCAAATCTAATGCCTCTTTG
AAGTGTTTCTTCGAACGGTGAATCGAGATCTGTTATATTATACAATAAAC
TTTCTTCTTAGGTTTGGAAGACGGAGAGCAACAATGGTAGGTTACATGGC
GACTGTAACTTTTTCCTTgctgtttgttatttttcgccTAGCAACAGTTT
CAATGGGAAGTGCGATGACTGGCTTAGCCATTGCCTCGGTTTGGTGTTTT
AGTATTACTTGGCCTTCAATTGCAATATTTACAGTTGAAATATTTCCGAC
CACAGTCAGGTATAGTGATTTAACACATTTCTCTAATTTTATTATTTGGG
GTTAATATTTGGGGCggcttttttctgttttgccaaaatttgccACGACC
ATTGAGATTGGTTCTCTGAGTAGGTGGAAAGCAACAAAGTCGCGATCAGT
CGTCCAATTTATTGATAATCGAGATGAAAGCCGAGTGaaagaaagaattt
tcaaagattgttggAATTGTAATTAATTTTGTCTTTGAATCCCAAAGAAA
TGTTACCTAAAGGTTTTTTCAAGAATTATCACCCATCttagttttaaaat
tgttttccgATAACTTATTTCTAGGTCGTCAGCATATGGGTTCGTCTCAA
TAATGGCTCGCATCGGAGGTGTTGTCGCGGCGCAGTCAGATTTCATTTAT
GCTGTTGCAATTTATTTCCCATATCTGATTGTTGGTGTTTTATGCATCAT
TTGTACCATTGGTGTATTTCAACTACCAGAGACTATCAATGAAGACTTGC
AAGATATTCTTCACTCTGAAAGCGATGGGTAAGACTTTGAAGTGTTTGGG
AATTACTCCGTTCTTTCCATTCTCTATacaattcttatgaaaaagatcGT
TCTtagaggttttgtttttaagtaagagtgatatcgtttgctaactcaat
tttaattcacaagtttttcacattgaattgacacggatgtggagcaagat
tggatagaaagaagaaaaaaaacaatagacagacactgtcctgatatgaa
atatatgtATGATGAAACGTGGACAATTatgtaaaataaaacctttaaga
atgaAACCATAGTAGAGATACCTATTATGAATCTGCTAAGAATATTTTTC
CTTATCTataaaattatttaattatgCTGACTAATTAACTTTgggctttg
aaaaatttcggATAGTCCATCTCAAATTACCTTTTCCCTAGAACCTTAAA
ACTCCTTTAGATTCTGCTTTTCATTGCCAAACGACCCCTCTTTGTTGTAT
ACTTAATGCActggaattcatgatattcatgacgtaatgttttctacgga
aagacctaGGTTTTTTCCAGTAGtgacaaattttatacaacttttatcta
gtttaaatttgccactactggctaagaccggggtatttccgtagaaaata
ttacgtcatgaaaatCATGAATCAACTCTTTATTTTCTCCTTTCCGAAGG
GTTTCAACGGACGAATCATCAGCTAGTGAACAATACGAAGAAGATACCAA
GAACAATGAGAAATCAGAGATACTAAAAGTTTGAAGAACGCACCACCAGC
TATATTAATGGGACGAACGATTCCGAATGATCCCTTTTGTATTAATTGCT
ATGATGAGATTTATCCAAGGGCTGCAATTGACGCTTTGCTTAAAATCCTA
TCGAGATGGGAATTCCCATAGAGTTATGATTGTCATAGACAAAAATGGCA
TTGGAAAATCAATCGAAAAATAAAGGACACCATGTCAGATTTAGTTTTTG
TGTATGAAACCATTACATGGTTA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000114_pilon | genome | sc0000114_pilon:1078676..1089498 + |
|