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Sequence
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gene from alignment at sc0000006_pilon:2663074..2678531+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1387 ID=MSTRG.1387|Name=MSTRG.1387|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=15458bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2663074..2678531+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
caaaattttgagccGGGGTCGACATGGTAAAAGCATGACCGGAATACACT
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CGCTTGGGCCCCGCAGGGTTGCTAGTAACGGCTCGAATTTCAGTCAGGTT
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TACCtcctaacaaaaaatgaaattacattcCAAAGCAATCTCCTTCATAT
CTTCATATTCACTTACAAGGTCAGAAATTATTACGTCCTTCCGTGACATT
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agtgaaaattcgtcggttctgcccccttcgctggacttcaatgggtctaa
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cagccctgtatggagctcagaataagcttaactaagaaTGGAACCACTAC
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ATCGACTTCTCAGAACAAAATATTATAGAGGAGATCGACACCTTATCCTC
CAATGCTGCAGCAGGACCTGACGGCTTCCctgcaattttcttaaaacaag
tcaAGTCACAGATTGCGGcccctctctctctctaatctgGAGAAATATAT
TTGACAAAGGCTACACAcctcaacttttgaaaaccagTTTCATCACACCC
ATCTTTAAAAAAGGCAACCAAGGCCTACCTGAAAACTATCGACCTGTAGC
ATTAACTTCGCATGTAACAAAGATCTTCGAGAAGATTGTCAGAAAACGGC
TACAAAATCATCTAGAACAAAACGACCTCTTTAACGATAATCAACATGGA
TTCAGGTCTGGAAGATCATGTCTTAGCCAACTTCTTTCGCACACAGAACA
ACTCATCCATCACATTGAAAAAGGCCGTAACGTTGACGTTATTTACCTTG
ATTTCAGCAAGGCATTTGACCGTGTAGATCATACAATCTTACTCCATAAA
ATCGAGAGAAATGGTATAACTGGCAAATTACTGCAATGGATCAGATCCTT
CCTTACCGGTAGGACCCAACAAGTATCTGTTGACTACATCCTCTCCAAAA
AAGCAGAAGTCATTTCTGGCGTCCCCCAAGGATCAGTTCTTGGTCCACTT
CTCTTCCTGATAATGATCCAAGATATTGACACTAACATCCTACATTcatt
tctatcttcatttgccgACGATACACGTTTAATGAAGGAGATCTCTAATA
ACACTGATGTTCAATTTCTACAAAACGACCTTGATGTGGTGTATCAATGG
ACATCATTAAACAACATGCAGCTCAATGGCTTGAAGTTTGAACATCTTaa
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CTGGCTCTCCTATCGAAACCAAGATGGACGTGAATGATTTAGGAGTCACT
CTGGATGTTAACATGACATACAGCAAACACATTACAAACCAGAtcgagaa
agtcaaaagtatcaTTGCTTGGATCCATCGAACGTTCAAAACAAGAGATT
GTCAAGTAATGCTAACTCTTTGGAAGTCACTGGTACTACCACACATTGAC
TATTGCTCCCAGCTGTGGTCACCTTCAAAAAAGATATCTGATCCAACAAC
TGGAATCACTTCAAAATCTTACCTGAATAGAATCCCTACACTTCAACATC
TCaactattgggagaagctcaaagaacttaaactatacagcctggagcgg
cgcagagaaagatacaggattatctacacctggagcatcctagaacagct
tgtaccaaattttaactatgctgaaaacaaaggtggcatcttcagttacg
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CTGCTGCCGAATTACTTTCCTCTTAGGAGAGCTGATTCAAATAGCATCAA
AGTCATGGTCTATCATCGGATAtctcaaattggatgattgttgagacgaa
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cagcgctgtaagcttacagcgtaagcccaggcaGCTCTGGAAGCCTAAAA
ACTTTGGTGTTaaaaattttggtgttaaaaaaatttcaagtttttgtctT
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ttCATTTTCCTGCGCTTTTTCATattagttttatttataagaatcagtag
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TCAATATGATGCAgacaaatacaaaaggatacaatTAAATGACCTATATA
TTTAATCTCAAATAACGTTTAAATActgtgagaggtcctaaatccgacac
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gtttacaaacattccctctccaagttgaacgataaactattgctagaact
ctcaaaacaaaacatctaacaagatagctttaatgtcaagatgtcaatta
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CATGTTGTTCATGTTtataaaacgataacagttttgtaataaaagtgact
tgtgcgggaaaaatacaaaacaacttgggctggtttccatcaagatacaa
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tagcacttaatttgaataagAAACAtggaatcaatgaggcggcaactatt
aACGCCCTCTTTACTACCCATACGTCCGGATGTTTATctacggaaggccc
gcaatcaagccaagtgccagtgtaaagtaataaaaaccaggcttgattac
gtaacatttcaaaatgagcacgcttgtacacagacctcttttatattttc
gtgtgctttggaaaatcaaaacattgcattacttttttatgatgctgtta
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ttgttataagaagcaattattgttatttgattcaattggttcagtgtatc
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ATATTTGCACATGTGTTCTTATAATTGAATCAAAGTCATAATGGAGAGAG
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TTATACGaggcgaagaaaatatttactttaatattcaaatattattcttt
tagataacacattccacgaaactaattttcttaGAATATAAATTTCGAAC
AGGCAAATGAGAGCCAGGGCCTggaagttctggtctgtaaagtatccaAA
CGGattaggtagtcagtattaattaagtattaggtataagtattaagtag
taggtattaggcgttttagacctgtTTAGACCTGCCCTGTGAGAAACTGA
CGAGGCAGTGAGAGTGGCTGCTCTACTGACAGTCTGGACCCAAAATCCAT
Ccagaaaatatttctcaaaaattgatcaacacgccaaaaattgatcaaca
cgccaaaaattgatcaacacgccaaaaattGGTGAAATCTTGGGACAAAT
CTAGTAATTAGACCTTTTCTCCTTTGGcggcggcaatcaaaaatatgttg
cgTTCGGGTCGTCCAACAGACTGTTTATTTAAGAAAACCTGATTCGGGAA
ATTCGGTAAATTCAGTAAAATTGTCGGGTTTTTTGGGTGCTGTTCGCAGG
TTCAGATCTTTCCCATAATGGCGGGCACGGAAGTGATCTATCTATCTAGA
ATCTGCGCTCTTTGTTGTTGGTTTATGGAGAATTGGTATCGGCTTCAGAA
CTCCCAATGAGCCCCGGTctggaaatcgccatttttacagattttcattg
gattttttccttatattcatttctatgttttttacacaaaaatgatgaat
ttattgcgttatgcattttccctaaacgctatatttttttgactgatttt
ttttcatttctctccttgctatctaactttcatcatcaggtaggtccatt
cagcatctagcttgttactTTAGGCATCCACTTGGGGTGACATGATGTGT
TCCCTCCATCTATCTCTGTCGTGCATCAGCCGTATAAGTTCCCTCTCTTC
CAACCCGGTGTCTTAGTATATCAGTGATTTGATCGTTTTGGTTGGTCGAC
CTCTTCGCCTAGGCTTTTCAGGTTCCCAGAACATAATTTTTGTTGCAGGT
CCGTTACCACGTATGATATGGCCAGCTAAGCGGAGACAACGGATTTGAAT
GACTTTGCTGATTGGAGGTCGCCCTCCGTAGAGGACTCTGTTGGTGGTGT
GTGATTGGGGATTGATGTTTTTCACCCTTCTCAGCATCCTTGTGTAGGTC
CCAGCAATTTTTCTCTTGAGAGATTTATTGAGGGACCAGGATTCACATGC
ATATAAAAGGATTGACATGATTGTCGCATCAAAGATCTTTAGTTTTGTTT
TATCAGAGTTTTTGGACTTCCAGCATTTATCAAGCCTGTTGAGAGCAGAC
CAAGCTTGTGCCATTCTCGTATTGACTTCAGTAGATGTTTCAAAGGAGGA
GTATGAGCCGAGGTATTTGAAGTCTTGGACCTTTTCAAGTTCTGATCCAT
CGATGGTTTTGAAGCTTTGGTTACTGTTGAGTTGATATGCaagtatttgt
tttttttgtatattcaAAAACAAGCCAATAGATTGTGATGCTTATTCAAC
TTTTTGGAGAACACGCTCTGCCTCTTTGATGCTTTCGTCAATTAGGGCAA
TATCGTCTGCAAAGTCTAAGTCGGCAAGATGAATTGAAGGGTGACGGCGG
CTTCTTCGTCTGAACAAAGTCAATCCATCAGAACTCTTTATGGCCTTTCT
TAGTGCGTAGTCCAGAACGATGATAAATAAGAAAGGTGCAAGTGGATCGC
CTTGTAATACGCCTGTTTCGATTTTAAAGAACTCAGTTTCAACTATTTAA
TTTAATTAAGATTAGGGATATATTGAGAGTATAGTTGATTTCAGTAcata
actcgagatattgagcttccaaaAGCGCAAAAAGTGGACAAAACAGCtat
ttctggctgaaaaacactgtttttaaggattaatatctcgagttaggtaa
agaaatcacctactTTAACCGGGTTAAATTTCgcaagattaaatttcgcg
agctaaaaaaatcgcgaaattttctggatttaatttcgcgagtgagagtt
ttgaaatattttgcgtagatttaatttcgcgaataagccagaaaacagct
gaaaatagccattttttgccataaatggagacttggaactagtttctccg
ccaaaaatacaattttaaaagttttgtggtggacTTAATTTCGTTGAAGA
Atctgtgtgtttagacaggaaatttgggttgcttggcgtgttttcatgaa
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ggtattagcttttctcgagattggctctttcattctttatgatttattgc
acaaacatgcataactataaaccctcgaatgtaacggagcccgattttcg
aaagaaaatgtttttggccaaatttgggccaaaaaacggctaaaaaaagg
gtttttggaccttgtgaaaaattggatcattaattttttctgattttttg
catgaaagtaggtaaaagatggctgaagcagatttttgtaaaagaagaat
ttttcagcaaaaaaaaacgcatctttatctataagaatcactattaataa
gcatacatcaatgttcttagccaaattactcaattttttgaagagataga
tgtttgtttttgctcacaaagtcttgaatatgaaagaatatttcaagagc
atgaaattttggtttctaaacgttttttttataagaaacaaacgactaat
tttaatagatcgtcactatttgtgttctgaatgattgtttaatggtcacg
tcacgtagatatcaattataaatgtgttaaatgcataagcaggtaggtcc
ataaaagtatcacttgttttttgtttatttaatatttttactgttttaca
tgttattttacataagaaatttacattatgatttaATAATTAGTTAATGA
AACCTAGTacagattcttttaattttttttacttttataacAATTTTACG
TGATTTTGAGCTATGCAAATTTTGAACAACCATACCCACCCACCAGTTGT
CCCTACAGCTGGGCAGAGGGGTATCAAGcccccccTTAAAAACCCACTAT
GTGAGTGCATACCCCCTGATAGTAGTGTCCCATAGTTTGGGGTGAATATT
AGACATTCCAAAGTAGGGACTAGGTGAcctgaaattcaaaataattgtag
TTCTTTTTATGTCACATTTTACGGTCATCTATGATAAATCTTAATTCTCA
TTTAAATCTCAGTTGTAACCATCAAACTATATGAAATACTGTTGCAGCAT
GTGCTTATAAACTTTGCTAATAATGTAGTTTGTGGGTGAATATTAGACAT
TCCAAAGTAGGGACTAGGTGAcctgaaattcaaaataattgtagTTCTTT
TTATGTCACATTTTACGGTCATCTATGATAAAtcttatttctcatttaaa
TCTCAGTTGTAACCATCAAACTATATGAAATACTGTTGCAGCATGTGCTT
ATAAACTTTGCTAATAATCTAGTTTGTGGGTGAATATTAGACATTCCAAA
GTAGGGACTAGGTGAcctgaaattcaaaataattgtagTTCTTTTTATGT
CACATTTTACGGTCATCTATGATAAAtcttatttctcatttaaaTCTCAG
TTGTAACCATCAAACTATATGAAATACTGTTGCAGCATGTGCTTATAAAC
TTTGCTAATATCTAGTTTGTGGGTGAATATTAGACATTCCAAAGTAGGGA
CTAGGTGAcctgaaattcaaaataattgtagTTCTTTTTATGTCACATTT
TACGGTCATCTATGATAAAtcttatttctcatttaaaTCTCAGTTGTAAC
CATCAAACTATATGAAATACTGTTGCAGCATGTGCTTATAAACTTTGCTA
ATAATCTAGTTTGTGGGTGAATATTAGACATTCCAAAGTAGTAGGGACTA
GGTGAcctgaaattcaaaataattgtagTTCTTTTTATGTCACATTTTAC
GGTCATCTATGATAAATCTTATTCTCATTTAAATCTCAGTTGTAACCATC
AAACTATATGAAATACTGTTGCAGCATGTGCTTATAAACTTTGCTAATAA
TCTATGTTATATTTTCATTTACAGGTCTTCTTCGATATGCAAATAATTCA
AACTACAAAAATGATGTCATGATCCGAAAAGAAGTAGGTTAAATTTAAAA
GGGTTTTAAATTTCTGTAATAATTACTTTAATctgcaaaagaaaaagaac
aaccAGGGCAGCTTCTGATAGAGACAGAAAATtagttttcgaaaaaaagg
ctgttttcCCATTTTTGCCACATTCAAGGTGGTCTTGATATATTAATATA
TTGTACCCTTTGAGAGTAAAAATTAATAAtgtaaaataatattataacac
tttttttgaatttttcttcagGTATTTTGTGCAAAGAGGTGTATTGAAGA
AGTTAAAAGAGTTATTGAAGACAGTGAGGTTAGTTGAACTAATTTTAAGA
GAGGCCAAATCTTCCCAAGTAGATCGAACTCTCAGTACATGACGattcaa
agtttttatataaTGTACtggaaaatatttgattttatcaaaGAAACCCA
TTAAAATGACTTTCTTTTTACTTAGCTGCTGAAAGAAGACGATGCCTTAT
GGCCACAACCAGATCGTATTGGTCGCCAGGTAAAAACATGTTTTCTCGTT
TTGTCATGTTGCTCTAATGTAAATTTGGTTTTGGACTTCGATCTCCTTCA
AATTAACCTTACTTAAActaattaaaaaatcatttaaggtaaatcattta
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tgaaatatcttgtaaaaactccaaggcatctcaaatTATGCATATAACGA
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AAAGGATCTGTTAACTTTGATAGCTATGTATTTGGTAATATAGGTCGTGT
TAGATTTATTTCATCTTTAAAGGTAGGTTTCATTAATAAATTCAAGGGAA
ATCCATTcaataaaaatgtaaatatcaaGCTTGTAGAATTTGTTTTTGAT
GTTATATTTTGATGGTTATATTATGTATTTACATGTTCAAGAGGAAATCC
ATAGCGTCGTCCAAGTTGTTGGAATCAAACAATGCGTCACTCTCTTCATC
AAGGATGTTTTTCGATGAAGAGGGGCCGAAAATATCGGCTGCCGTGATTT
TCTCTTGTTTAGATTCACCAGTTAATGGTTTTGATGGGATTTTGTTCAGC
TTTGGTAAAGAGTTGTTCCGTTTTGGCAATTGTTGTGGAATTGTCTTGAT
TGGATGGTATTCAGGGATGTTTTTCGTAAGACTTTTCGAACAGGAGCTGG
CTTTAGTTTGCTGTTATCTGAACCAAAGATTTTCGAGGTTTCGCTGTTTG
GTGCCTTGAGAATGTCAACATACTCTTTGTTCTTGGTCAGTGGAGTGTTC
TGTTCATCAAAGTATTGCAAATCGACTTTTTGGTCGAAGGAGACTGATTT
CTTTGTTCCGTTCAATGGAGAGATTTTTCGCTTCAAGTTAGATGATTTCT
TTGGTGTTAATCTTGCCAAACTGTCATCAACGCtttgtttgatttcattt
tCTGATGCAGCGAGAATCTTTTGCGGTGGCTTTACGTCAATTTTTGATTC
ATGGTCGAATTTCTTCGGGATATCGTTTGTACCGTTTGAGGTGTCATCTT
GTAATTGAGCTGCAACATATTGTGGCAACTCACTTCTGATAACATCTCGT
GGTGAACCAGCTTCATCAACGACACTCAAGGAAGTGTCGGCTTCGGTTTG
TTCAACGAAACTTTCTGATCTTGGAGATGTTTTGTCGTCAGTAGTAACAA
TCTTGGTAGAATCGCCAGAGCTTGCTGAACTAACACATGATTCACAGCCA
GAGTTGATGGTAGAAGGTTTTTGTTCACCAGATACCTCTTCAGAAATACT
TGTTGCTGTCGAAGAAGAATTTTCACTGTGGCTCGCCTCTTCGAAATCAT
CTTCATAGTCTTTGTTCATGTTTTGCTCGACTCCCTCCTCTGATTTAACT
TTCGGTTCAGAGGTAtcgtctttgtgtttttcaaCATCTTCGATTGGCAA
AATAACTTCATctgtgttttgttttgaattttgttgaattgaACATTCAA
AAATAAGATCTTTAACAGCTTTGATGTACCAATCAGGTCGTttgctaaaa
aaaaattagacaaTTCCTTGCACATTTTGTTTTCTGGAACTGAGGTTAAG
ttttttaatcatttaaacTTGATAAAATAAACTGGTATCTAACTTTCTCT
AGATTGACATGAACCCAGCTAAAAAATGATGCTTACCTCAGTTTGAATTT
ATGTTGCAATTCTTCCATTGCTTGTAAACAGAAAACTCCTGATTCCCTAT
GAATGAAGATGAGAATTTTGTTGGAGAAAGTACAGTTTAAAGGGTTTAGG
TCGGGTGCTAGCTCTAATAAATAATAATCTTATATAGAATGATCAGGGGG
TGGTTGTTATACTCACGTTTTGCGGAAGGGTGTTGATTTGTTTGTTTGCT
CGCTTTCGCCTTTTAACTGTCGAATAATTTCATTCTTCAATTCTAACTTT
TGTTCGAAGTTCAAAACTTCGAGACGAAAGCCAGCCCAAGCTTCATCGAA
CCATTCTTCGATGTTTTGGATTCTTGATGTCAATGTTACATTTTCTTCGA
TGACTTCTTGATGGGTGGTATCGAGGAGAAGCAAGCTCTCATATTTGTTG
TTACTTTGTGATAAAGACTTTCTCAATCTTTGATTCTCCAGCTCAAGTGA
TTCCACTCGTCTAATCATTCCAACATACTCAGGTCGCTCCTTGTTGAAAG
TGTCTTTATATTTCTGCTCCAATCTTTCATACAGATTTTTTAACGCGTCG
AAGTTTTGATGGTGCTTTCGTTCTCTTTCCTTGAATTTCTCAACTTTCGC
TTGACAAGCAGTCAAAAGGTCTCCTTTCTGAGCATGATCTTTCAAAAGGA
CTTTCAAATCTTCTTCACATTTCTGTTTCTCACTTTCCCACTCAAATCGT
TCACTGTTCATTTTCTGAACCCTAGCCTCATAATCCTCAATCTCCTTTCT
CATTAGCCTGACTTCttcattatatttctttttgactAGCTTAAGTTCTT
CGTCATTAGCAACAGACTGTGTACCGTTCTTCAAGGCTTTCAGTTTCTTA
CGCAACATCAGCTGCATCTAAAATAATAAACgttgtttttaaagaaagtc
gCTCGGaaatacagtggaacctctaattagcggacaccatcggggaaagg
ggttagtgtccgctaattagaagtgtccgccttttagaaacttttttatg
aggatttgactaggaaacggccggggaaaatgaaattgtctgctcatcag
aggtgtccgccttttagagtgtctgtgaattagaggttttactgtactTT
CCTTTGCTGGTTTTAACTGAATTTTACTGTAATTAAAATTGTTATGGgaa
attatctttctttctgTCACAAGCTTTACAgcttatcaaaaaaagaaaat
tacagaGAATTACAAAAGATCCTTGTACGTTAGGAATGTTTTCGATAAAG
TAtctttcagtcttttcttacctctttttctttcttgatgaaatcttctt
gttctttttgtttcttggtCAAAACCTTATCAAAGATTTTGACACGTTTC
TTTAAACTTCGAATCATTTTATTCTTCTCATCTGCTTTCGCTTTCAAATC
ATCCAAATCCTTCGAATTGTTTTGATCTGACAGCTCCTCGATGAGAATTC
GACGTTTGTCAAGTTCGTTCTTCAATAtttggattttgtttttttcactg
attttcatATCAGCGATTGTCTGTTGAAGCTTATCTGCTtcattctcttt
ttctttcaatttcaactCACATGCATTCCGTTTGGTTGATTCTTGTTCAA
CTTTCTTCACTAAACTAGCAATCTTTCCTTTCGattcttcatcttctttt
tgTAGAAGATCAACAGCTTTTTCAAATCCTTTTTGGACTTCAGCAAAAGC
TGCGATTGATGGGGCTTTATCCTCCATCTtcgtactgtaatttttttctt
tttatcaactATTAATTCCCAATTTCTCTCGAAAATTATTCGTTAACTAT
CGCAAAACGCCAGAGTGAAACTTTTCCACTCAAAGTTTTGCGTTTCAATG
ATCATTTCATCTGTTCGTTCAATAATAAActttgaatattgaatatttga
cgtcaaaaagtcataaaaatttgACGTCGACAATATTCTAACTCGTAGTG
ACGTCAATTTTCGAAATGCCTTTCATGTATTTCATTTTAGCTCTACCTAT
ATCGGGAATATAATTGCCGAAAGGTaaagtttgatttgaaaatttcagct
ttgcTTAGGGTTTGTTTTCCCGAATTTATCTCGCGTTTCATGTTTTTCCA
TCGccaaacaaaagattttcttcttAACTTCAGGAATTGGAGATCGTGAT
GGGAGACGAACATATTTCATTCACAACCTCCAAGATTGGATCCCTCATCG
ATGTCAACAACTGCAAGTAAGTCTCACATCATGCAATTTTACACTTCACA
TAGCGCTGTTATAAACTACAATCTTATGTACACAGTCTGTAGTTTCCTTC
CATAGTCCTGAGCCTCCAAATCTTTTTACCAAACGTTTTTTACAAAATCG
AGAAATGaccatttgaaatttctaagAATTGTTTCTTGCACGGTTCTTAC
GTTAGAATTCTTTTGTCTTCTTGTTAAAAGTTGTTAAAAGTTATTAAAAC
TTGAATATCTTGACTTTGAGAAAGAGTAAGGCAAAACGATCTCAAGCCAT
TTGGGCAAAAAGATCTCAAATCATTTGGGCATAAAAGATCTCATACCATT
TTGGCAAAAatgtctcaaaccatctgattatccctttaatctAAAAATGG
CGCTCGATGGCTCAAGAACTCTTCAGTTCCATGAAATTCGAATCAAACAG
TTCTTTACTGATGACCTCCcatctttcttttatttgtagagaccctgaag
gattgaaatgtttttattacttGGTTCAAGACTTAAAATGCCTCGTCTTT
TCGCTGATCGGGCTTCACTTCAAAATTAAACCCATTTAAAACCTATGGTT
CGTCGGGAGAAACTTATATAACGAACATTACACCGTACCGCTGACGTCAC
GTCATGTTGTTTATTCCTAATGGAATGATGACATTTTGAAATTACTGGAC
ATTGCGTTTATTCATATCgttgaaaaacattaaaacagACTATAAATGGT
CATTACTATTATCATTATTGACCTATTTGGATGCTTTGTAAATATGTCAC
AATTATGTAGCTTCTAAAACGCAAACAtaagttggtcaaattttaaatta
aaatgcattttgcattgcatttttttcttaattacACTTCGTCTCGATTG
TGAGCCTT
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:2663074..2678531 + |
|
