|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000112_pilon:139054..149013+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13787 ID=MSTRG.13787|Name=MSTRG.13787|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=9960bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:139054..149013+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATTGAGAAATTTTGTGCTGGTGAAGGAGGAATCTGTAAATTATTGAATAA
CTGAAAAGCATTTTAAACAGTTGGAGATAGTTAGCAAAGATAAACAAGAG
GAGAATCAAATTGAAGACGCAAGAATTTTGGACTTTAAGTAGGTAAgaaa
ttataaatatttttgaaatttcgattggAATAATATGCCTTGATTAAAAG
TCTAAAGCGTAAATGTGAGCCGTTATCTACCCAGTGttcacatatttttt
tattttgctattGACTGTCTTCGACATTTAATGACATGGTTTAAATGTTA
AgatcaatttaagaacagtgccGAGTTAGGTATTGCTGAACGGCTGAACT
CTAACCAAAAGGGTCAAACTAGTAAAGTAAAGTATTGAATCTAAACTATT
CACAGTTTAccccaaaaataagaacaagataagaacaagGCCCATAAGGC
CGAAAAAATAAACAGCCAAGCCTCATCAAAGCCCCAAGCGGTTTTTGTGA
TGACTGATTGGCgttttttcaagttcgtgatttTATGATTTAGGATGTCa
aagtgcgtgattgcgtgatcagaggaACCAACGTGATCGTGATAAGAAAA
TTTAACTCACAAGaacgtgatttggaattttttttgcgtgattgcgtgat
ttgaaaggtgatggggggggggggggaggctcCTCACTTATAAAAGAAAG
CGCACGAGTTAAAATAAGCGATCGTATTTCAACGCACAGATCTAAAATTT
TGTGTATTACTGAATGCAGGgtataaaaaaaggaaagatcttatacacgt
tttctttataataacatctaaaatttttgaagccttgggataatgttaac
tttttgagttttaagttttaaatgttcttattttccccatttcgtgagta
tttttgtccatttttctacgaagtcgggtgttttagagtccccaaacAGC
CCCAAAGCCTAAACATTTTGGCCAAcgtagccttatgttcttatatggtt
tgttcttataaaaaacgtgtagtcgaTGTTGCTTTAGGTTCCCTATTGAA
GCAATCGAGGTgatatttttagaattatttagTTATAGAAGCTGTAAATA
AGTCTTTCAAGGGCATCAAAAATATATGACAGAAAGCAAGGGAATTCAAA
ATAATGCTAGCATTTGACAGAGAATGGaaagattttgattaattaaaatt
ggataaatagcataaaaatttattattaattttattagaaaaaatgcaga
aaattatttgaattattgaaaatttgggtatgaaaaGACGCAGCTTAACG
GCATTCGATAAAATAGCAAGGCATTCAACTAAATGACTAAAAAGGCATCA
AATATGAATTTCATACAACGAAACTTTATTAATAATTGAATTAGGATTTG
TGCAAGAGTATTATGTTAGAATATGTATCTCTAATTTTATAATACTTTAG
TTGACTTTGGAAGCTAGAGTAACACGGACACAAATTTAGGTAAGTTCCAA
GATTTGATAACGTACGCGTAGAGCTTATGACCTTAATGACAGTGAATTAA
TttctctcgctaattcgaatacGAGCGGTAATATTCGAATTGTACagttt
ttcaaatatctttataagaatcaaaagcctaaaattttttgttaaatttc
aggtagaatttttttgtttaaccATGTGACattttctggattttgaattt
ttaaattatagtttgttcttgtttcctttttgttttttttcgcACGTCCG
AGGCAATACTTGAAGTTagttacacccccttctcataggtAGGATTTTTT
GAGCCAGTGGgtataaaaataacaaaccGAAACTcgatattctcatattt
tttgtgagtggggatttcaattctttttcaagtcagaaaattcagctgGG
ATGGGAAAattagtaaatattttgcaagcgaggattggtttatttgatta
ttttcagttgggATAAAATTTGAGGATTATTTTCCATCGGGGgcgatatt
ttggcaaatttttccagtggatctgtgagaagggggtatttAGTTCGAag
tatagaaagatttgaataatagaaacTCGAATAAACGAGGGTATTAAGAC
TTAATCAAATCAACTCGAGAAATTATCTTTCCTTTCTTGTCATCTAAGTC
TCGTAGCAAAATTGAACAGTCCTAGACCACAAAAACGAAGTTGTTTTTGA
TCAAGAAATTTGCCTGTTATCTGTAAAGGAAGAGGACATACCCAGGAAGG
GGAAaaaagagagactttttcactgTAACACGTTAAAAATAAAGTCGACA
ACAAGTATAAGGTGAAGAATTAAAAAGTAGCgaattcaacttcaaaaaaa
catCTGCTTTTACTTTagtgaaaaatcatcaaattctCAGATTCCCAATT
CATAGCCTATAAGTTTATGAATAGATTTAAATAAGAAACAGCGTGAGCGA
TAGCAAAACCTGTTTAATATTGTGAACTTGGTGTGAAGAACAAATTGGCT
ACACATACTCCATATAGCTCAGTTTTTAGTGAGAATTTCTCATTCAAGAT
AAGGGTATTCCATGTAAAGTCAGTCCAAGACGGTTTTTACAGTCTGATGT
ACACATGAAGGGTTCCAGAACtgtaaaaaaaatcgaatttagcgctgtcc
tcacttactaaaataaaaataagtttaaaaagctaaaagaataacaaaat
ttgattggctgcaTTTTCAACTGTTAACTCATAGCCGTAGTATATGGCAA
GGGTAATACAAGTTTATACAGGCTTTAAGGCCTTACTCTTCGTATATAGG
TGGTGGTTTCACGCTGGAAACAAAGGAAGGTATGGTTTAGCCTAGGGTAT
TCCAATTAAAGTCGGCCTAGAGTGGCTacataaaaagttaaaagattttt
attgaaTTGTTGATAGATTATTAAAAGCGAAAATCACCCAAATGATAGCC
AGACAATTTATTTAGGGAAGTAACCTGGAAcccagatttttccaaaaaag
ggaAATAAATCATTGAAATCAACGAAACAGCAAAAGCATTTTGGATAATC
TAAgcatggcaaacgatagcccttgacccaataagcataaatatagtata
atatcaGGGTTGacctaagaaaattttttataaaaaatgagctagaatgc
taagcagcCCCAGACCTGACCTGAAAATtcaagttgcttataaaaaatgg
gTATTTGACGTAGAAAATCTTGATATGAAGGAAAAGGGGTTGCACTGAAA
AACCAAACTAAAACCAAATCACGACGAGAATTAAATGAAAGATTGAGTTG
AATTTAGAGTTCAAAAGAGGAGTACGATAGCTGCTGCTTATCATGCCAAA
TTCTTTTCAACTAACATTAATAAGTACAGTTAAGCTGATTTAGAATGTTG
CAACTTGTATAATAAAATTGTGTTAAATGTTATGATATTCTGAGAAGAAA
CTTAACGGTTTTTAAAATCTTCTCGTACAAGCGTCTATTTTCTTTCAAct
attttatgcaaaaaaatagtCACCTGCAATTGCCTGTAATTTTAAATAAA
CGGTCACGATTTCGCTTCTTTTCCAGTAAATCAAACGTAACAAAAGTAAC
GGAGGCAAAGGATTATGGGAAAATCAGAAGACAAAGGATTGTTGAATCGT
GGCGGAGGAGAGACGATCAATTTGAGAGAAACAAGTCCTGAAGGAAGTTT
GTGTAAAGATGGCGGCGAAAGTTCGACCTCCTCACTCAATGATAATGCTC
CTTGGTAAGATGACGTCAATTTAACAAAGTTTTCCTCCCCTTTGTGCTAG
TAACGTGAAAAGCACTGGGttcgaatctcaatcaaatcCTCAGCAGTGGT
CCCCTTTTAAATCTAGTTTGTTGCGTTTTTTCGTGTTGGCAGCTTTTTTA
TGGCCCTTTTCTGGATGAGCTTGTGAAAAGGGTGCTTTCAAAACGTAGAC
TGCTTGCATCCTTTTGGATTCGTGTGGTATGTAGAGGGATGCGATTCAAA
CtaatttaaattgttttaaatcataaatttcAGTGCTTcttggaaaaatt
ttcgaatGCaaaaaaaTATCTCCACAAAACTCCTTGCGTAACTTTTTGAC
TATAGGTACGCTGACAATATTGAAATATGAACTGAAACATGTGATCAAAT
TTAACCCCAATTTTAAAATCCAATCTATATTTTCAGGTATATACGATTCT
GGAGACGCGAGAAGCTGATGATTTTCATCATCATTGGTGTTTGTTTGGGA
TTTCTCGTTGGTATCTCTTGTAATAAACCCATTCAAAACCTCGATCAACC
AATCCGAAAAAATGTTCTCCTCATCTTAGGATTCCCAGGTAAGCGAGACA
TACAGTATTAATGGTTTAGTGGTATAGTAATCATTGTTGAAAATTATGTC
CAATTTTTGAGTGCATCTTCTTTCTTTATTTGAAGGCAATGcacgttttt
aataagaacaaactatataagagtaTGAGgcatggccaaaatattaagaa
catcttaatgCTTCGAGgaatctaaaacacccaatttctaaggaaaatgg
acaaaaatattcaaaaaatggcgaaaataagaacatgttaagaacatttt
ttaaggcttaggactaaaaaagttaaaaccatTTGAGTGCTTCAAAATAT
TTGGatgtacaaaaaaaacaagatcAAAAAGGAATTATTCAGTATAGAAA
CTAAAACAAATACACAAAATGGAAGAATTATTTTCTGAAAGGTGAATCAC
GAAGAATAAACAGAGAAGAGAAGAGAAGTAGAGGAACACAACACACCTCT
ATCGAGCCCTTCACCTAAGCAACTGACGTCAAACATGGAGAGAGTAAAAT
CACTGGGGAATAAAATGAATGACTCATTCAATCTAGAAACTTAATATCAT
CATCTAAGGGAGTTTCTAAGGTCTCTTGATGTTTCATAgagaaaaaaaga
ggaaaaacggaaaaaGTGTTTTCGATTTTTGTTTCCTTATCTCGTGGTTC
AATCTAAATTATTTATTGAATGTCTATTTCGGTACTACTATAGACCCCAT
TCATGGAATTTAacattgcataaattatgctaCTATTGTAGTATTTAACA
TAAATTATTCATGCAAATCATGTGATTCTTTTGAGCTACAGATAGATGAA
TTCATTTAAATCCGCCAGAATTATCGGAAATAAAActccaaaaaaatatt
aaatcatATATAAAATCGTCTAGACAACAAAATTAAAATGATCATacatc
tttttataagaacaaattatataagaatataaggcttcgatggctaaaat
ataatgaacaagttaagaacatttttaagtctTCGCGAACTCTAAGACAG
Ctaatttctaaggaaaatggacaaaaatactaaaaaaatggcgaaaataa
gaacatgttaaaagctcaaaaagttttaagaacacccgaaggcttcaaaa
cttttggatgttcttataaaaagacgtgtagTATACTTTGCTAACTACAA
CGATTTATATGTcctaaaagaattgaaatctcaaatctactttgaaaata
atgaaagttCAGCAGTAGGGACAACTAAAACTAAATCTCAGAAATAAAGC
AATAACTCAAGATTCGAAACATCTCATGTAGGAAGAATCCTAAAAAACAT
CTACCACCAAAcacttgaaaaacaaaaatactctTTACGAAACTTACTGC
ACAATTTTGGACTGATAGTTTCCTCTGGTGAATTTCCATTGCATGTTCAT
GAATATTGGCTCTTTCCAGGTCCCCTTGGTTTGTTACATACTTCAAAATC
ACTGAAATATACGAAAAAGTGTTCGTTCTACTACAACCCCTACAATAATT
TGAAAAGACTTTTGAATTgtcaacaaaaaagtttttcatgttATGTTAAG
TAAAGTAATTTTCGCCATTATGGAATCAAACGCTCGATTTGCATAAGGGA
TCGCCTCAgcaaattcgaacgtttgcttccataatggcgaataatgcaga
aaaaaatacattttagtgggaattaaatttggcggattttgggtacccaa
atccgccaaattttctttaggccaaatttcttcttttaatgtacacgttt
tttataagaacaaactacataagaacataaggcttggatggccaaaatgt
taagaacaagttaagaacattttatggctttgtggtctcaaaaacaccct
ttttcttaggaaaatggtcaaaaatactcacaaaatggtcaaaataagag
catgctaaaaacatttttaggcttaaaacccaaaaagtttttaagaacat
ccgaaggcttcaaaaattatggatgttcttataaaaaaaactactttttt
tgtaatacttttAATCAGAAAACTTAGTATGATATTATATTGTACCTTAT
TGTCTTTTATTTCCCAGGTGAACTTTTGATGCGaatgttgaaaatgttga
tccTCCCTTTAATTGTCTCCAGCTTGATTGTCGGATTGGCGGAGCTTGAC
CAAAGGGCGTCTGGACGTTTGGGAAAAAGAGCGGTTTTGTATTACATGGG
AACGACAATGTGTGCTGTCATCTTGGGTATCATTCTGGTAGTAGCTATAT
ATCCTGGTGGAAATAAACAAGAGGTATGtatcttttccttttttaagaag
aaatatttatttttcagctgAAAATTGGCTAATataaaacctaagaacaa
attcaGAACAATCCTAAGCCCAAGAAGTTTTTAATTACGATAGCTCAGtg
tattaagaacatcgtaagagcAGATAAGcctgagaatttaaaaaatatta
agaagagccaagcctgagccaaaatttactggttctcataaaaaaagcgC
GTAATGAACATTATCCCAATAACATTCTTTTCGGCTTAATAGGCTGAAGG
TGAGAAAGAAGATAAACGAGTTCGTCCGTTAGATTCGTTCCTCGATCTAA
TTCGCAACATGTTTCCGGACAATCTTGTTAAAGCTTGTATAGCACAACTG
GTGACAGGAGTCAAGTTTGAGAAACATGATGAAAGGACGACTGTTTGGAG
TAGTAATGAGACATTGGCTGACCAAATGAATTGGAATCATTGGGAAGTCA
ACCAAACAGCTTTACAAAATCAAACGAATTCAGAATGGAAATATTTGACT
TACCAGAGTGTACTGTGagtagattttcaaattcaaatccaTATGTTAAA
TCCTTCATTTATCCAAATTTGAGTGACCtgaaaaatccaataaaaaataG
CTTATGCAAGATCAGTACCCAGCTTCAGTATGTGTATACtagtacaatca
aggtcataatatttgagaaaaaagggaaattccccaggaagttttgaaac
cacaatcgatttgtaagtgctctaaagtaggttcgaagggtagattTATA
ACGCTAAACATGGAATCTGaggatttaaaagttcaaaaatagtccaataa
ggctcagaatatagactggaagtctgccaaaccatcccaaattgaaatat
tcgattaaatagaTTTGATAGctcaaaatcgattttttcgccggaacttt
aaatcttgaaaaacgttaaaataaccggaattctcaatatatttcgacca
tgattgtagattggCTTTGAGTTAATGAAATGAACAGAAAAGTCTTACCC
TTTTCCCTCTTTGATTCTAACATAGAAATGGAACAAACGTAACAATGGTT
AAAGAATGGCGTGAAGTCAAGATGCCTGATAAACCATCAGACAAAGGAAG
CACCAATGTTCTCGGTCTCGTAGTTTTCTCCATCGTCGTTGGTCTAATGT
TAGGGAAGATGGGAAAGAAAGGACGCGTCTTCGTTGATTGGATGATTGTG
TTAAATGATATTGTTATGGAGTTGGTTGGTTGGGTCATGTGGTATTCACC
TATTGGTATATGGAGTTTGATTTCAGCTAAATTTGCATCCATGAATGATA
TTGAAGGAACATTTGAGAAACTGGCTCTCTATATGGTGACTGTCATTGTT
GGTTTGATTATCCATTCATTCTTGGTGTTGCCTGCTATATTCGCTGTTGT
CACCAGAAAGAATCCGTTCAGATTCGCTACTGGTCTGATCAAAGCATTAC
TAACGGCCTTCGGTACAAGCTCCAGTTCGGCAACTCTGCCAGTCACGTTT
TCCTGCCTCGAAGATAATCTCCGCGTGGATAAGCGTGTCACACGGTTCGT
GCTCCCTATCGGTGCCACTATCAACATGGATGGAACCGCCTTGTATGAAG
CGGTCGGAGCAATCTTCATTGCTCAAAACTCAGGTCTTGATTTAGATTTT
GGTCAATATGTTGCCGTTAGTTTAACAGCAACTCTAGCCTCAATTGGAGC
TGCCGGAATACCACAGGCTGGCTTGGTGACCATGTTGATTGTATTGCAGA
CGATTGGTCTCCCAGAAGATGCAGTGACCCTCATCTTGGCAGTGGATTGG
TTCTTGGATCGAGTACGAACGACTGTTAATGTTTTAGGTAaggaaagttt
attttattgtttggcTATGATGATAAAAGAACTAAATTACTTTTTGGCCT
GCTATATGCTGCTATTTTAGCTATAATACCAACCTAAATGTGACAAAAAA
TACAAGAGTAAATCAATGACAATTTTCCAGGGAAGTGTTCCTTAACAAAT
GTTGCAAACAACTTTTTCCTGTAAACTATAGAATTTAGTAAACTTAAAGT
GTAAAAACAGCAAATAGATAAAACAGAAATGAAATTTCATGTGATGTTGA
AATTCTCGTCATCTTTTACGTGACTGCGTTAGTATAGGGCAACAAAAATG
TTATGACTTTTATAAAGGAAGCTAAAAATTTAACAATTTCCTAATTATGC
TATTAATTATCAAATAAAACTAAAGGtttttttCATGTTatgttaagtta
cgtaactttcGCCATTCtgaaagcaaacgttcgatttgcgtaagggattG
CTTCTACAGAAGTTAACAAATCATGAATAAACCTTACCATATATTTATTC
ACCAGGTGATGCTTATGGAGCTGGTATCGTTCACCACTTGTCACAACGAG
AACTCCAACAAATGGATGAAGATCAAAAAGCTTTGGATGAAGTGCACCGT
GTTGAAGaaggatttgaaaattttactggaAAACATGATGAAAATCCACC
TAATATGAATATGTATAATGGCCTTACTGCTCTGTAAGAATTTTGAGAAT
TAATGCTCCCTCTTAGAGCTCTTTTAAAAATACTACAAAGCCAAAGAGTA
CTTCCCAATTCATAAAGTCGTTTCAACAGACTTACTGCTCTATAAAAATT
TAGTACCAATATTCcttgttaaaaaaatactacCAATCCAAATAGTACTA
GGCTCTTTCTAATTCATAAAGACGCTTCAATGGCAATGATACAGCTCTGT
AAAGATTTTGAGTATTAATGTTGCTTATTAGAACCCTCCGAGATCTTCCA
AACTCAGTCGCTTAAATGACAATAATTCGACCCGTGAAAACCTTTTTCGA
ATTAGGCGATAGACTTTCCTTAAGTAAATTGGGGTGTATAAGCGCGGTTT
TTAGTCATACAGTAATGGTAGCGGGTTAATATTTCGGTAATTAATTAAAA
CTAAAGTAATTAATGTAATTAATTACCTCAGCGGAGTGATCAAACATTCG
AAAGGGTAACTAACTCCCTTATACTGTAAATATTAGTTTTAACTTATAAT
TTTaatgcgaaaatgaaaatttatgatttttactaattgttataaattaa
aaaaagagatCTTTTGTATATCATGATTCTTTATATGAGTGTAGTAATGA
TTGCGCtttagattttttcttcttgtaaATACTTTTTTCTGTATCTTTaa
tatcaaaaaaagaattaataaacttcagttttaaaaaattaaaaaaaagc
tttcatctcctattcatgatatgcaccactgcaatgacttcacgaaatta
tgcaactttt
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:139054..149013 + |
|