|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000111_pilon:85849..94474+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13720 ID=MSTRG.13720|Name=MSTRG.13720|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=8626bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:85849..94474+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATGTTTTAAGCTAATGTAGATATGGAGATTAATTTTCTATTGCATTATT
CCGATGAAATTAGGGTTGGTTTTTAAGGCATTtgtgttcttttattttta
gggCTAAAAAATCACAATTATAAAACATATTAAATAATAGTAATACCATT
TGGCATACCAAGAATATAATAATGGCATCGTAAGTACTCTTGATTGATCC
AATATTTATTTATTGGCTGGTTTTTTATTCGCTAGCTGAATTTCTTCCAG
TCACATTTTAAACTTTGCTAGTTTGTCTTCTTTTTATCCATctcaaaatt
tgcattttttttagcTTCGATAACCAATATAAATTGTCAGTAACCAATAT
AATTTGTCAGGCATTGTCAGTTTTAGTTTTGATTAACGGTAATGTAACAA
TGATGCGGATCTCGTGATATTAAcgaattaaaatttaatttccaGTCACT
TTAAAAGTTAGTTTTGTCTTTCGCAGGAAACCGAAGACACAACGCGGAAA
ACGATTCTTGGCGAACAGAGAATCCAAAATTGACGAGAACACAAAACAGG
TGATGTTCATCCAAGGAGGGAAAACAAGTGATATTGTTAATCAAGCCCTA
CGTGATATAGTAAGCATTTCATTAACTTCTAAAATGCTAATACAGTCgag
tttctataactcgaacacgcacggggagtACAAATTCGTTCGaattattg
aaatttcgaactatggagattggtttataaggcattgtttactgaagaaa
ccaaaataattattCAAGTTCAGGAGACATTCAAGTAATAGGAGATCGAG
TTAAGAAGACTCCATTGTATTTTAGCTTGGAATTTTAAGGCCAATAGTAA
GTGGCTATTTTTTAGCGCCTGTAACAACGTTTCCGAGGTTGATATTTTGT
TTCAGTCGAAAAGAGAATGTATTTAGAGACTTTTTGAGAGGGAAAACAAA
TTAGACGCAGCAAAGTTTCATATCACCAAAACACTGACGTATGTTACAGG
CAAAGTGGCAGGAAATAAGTGCGTATAAAATCAACGATTTTCAAAAGTCG
AAATCCACAAAAAGATAAGTACCATGCATGGTATTGAGTAACGTATCACT
TACTCAAACATACACCGAAAATACGGAAAACACTTTGAAGCTCATCCTGT
CAGTTTaactacaaaattttcaaaatttcgttaAATTTCACTGGAGATCG
GAggtgatttttttcagaatttcatgATCTATCCAATGGTATCAAGAATT
CTTTGTCAAATCCCACTTTTGAAAatcgtttgattttttatacTGTACAT
CAGTCCATTAGCAATAAAAACATTTCTCGGGCCTAATTCGCGTGCCTCCT
TAAATTAGAAGTTATGATTCTGGATGGCATCGttcgttttgaaaatttgc
aatttGCAATTTGTGTCTAGATAAAATGTCCCCAAAGGTTTATTTGTTTG
CTTATCACAACGATTTTataaatttgttgaatttttatGCCTCAATCTAT
TAATCTAGATGATAGCTcatatcaattctttttttgattctAGAACACAT
TGAAAAAGCCTAATTCACACTTATTTCGAAGGTAACTACTGTTTTAATTT
TATTCCAATAAGTTTTTAAAGCAATGATAGTttcttttaacatgttcttt
tcCTTTGAAATGTGAAGAGATATTAGATTTGTAAATTTAACAAAGtggtt
tttaaatttcttttccaGGAAGAATATATTACGGCCATTTGAAGATCAAA
CGTCCATTGTAAGTTACTTATCCTCTGATTGCAGAAGGCTTAAAGACCCT
TATTCTTAAGGACACCAATCAGCTACTTTTTAGCAaataatcaaacaatt
tttccttcaaaatcaattattctgtttcatttaaatcaaaaaaattccac
TTTTGTTAATAATGACTTTCAATTCACTTTTAggaatttttctctcaaaa
atcaGATGCATCATTGATGGTTTTTGGCTCACATTCTAAAAAGCGTCCAC
ATAACTTGGTTTTCGGTAAGCTTATTTGATTATCAACTAATGTGAATGAT
ATCGCCTTCGAAAAGAACCAATTATGGCCTGAAGTTATTTTGACGAGCAG
ATATAAGTTCTAAAAGATCtggcaattttaaaatttgccaACATAAGGTA
TAAATTCTGAAGTGTCCGTGGATCTTTTCGGTGTGATTTCCGAAAACCTA
AAGTTACATCTctagttttgaaaacaattcgTGGATTTGGTTATAGATCA
TCCTGACACATGGCTCGCACACCCCCTCCTCCCCCGCCTGAGCGggggga
gctacacctaaaatttgccatataagaggtgggagctgcttgtttttttc
gacaggcggggggagctctatcttaggggggacctgcattagtttatgta
actctgggggctaaataacacttcctaaatatttttctttactgttggtt
tttaatttctctaaacctttatgttttaatgcaaagtgtgatctgatcct
taaaatgcaaaaatgaagacattctattgcattctctaaaagtgcacaca
catgtaaatagagctttgtgaatgccataaaattGTTCCCCTAAACtagg
acctaaaattttatcaggctgtggggaccttgttctcaggggggCCTAAA
TTTGGCGgcggacctagaaccccagtcggagccatgtGGCACCAAGTGTA
GAAATTTTCTACATCTGGGTAGTTTGGATTATTAAGGgagagaactaatt
ttgacaaatttagcGACTTTgggtgaaatttttcaaaattagcttagcaa
aaattttaagttttatctCGCATTTTTCATATGAACCCCTGATTTTTGAC
GAAAACctttaggcaaaaaaaaacaatttacccCGTCCTCCGCCTAAATT
ACTTTTCGTCAAAATTATTTCCCTAAAGTTAGTACGATCTATAACGTGAG
ACAGCGTACATAGTCTTGTTAAGAGTGATTTTAAATATTCATAACTCTGG
TACAGAGTCTAGTTAAGATTGATTTTGATCTCGTATACAGGCTCGTTCTT
CGACCACCACATCTTGGACATGTTTGAACTTGGTATCGATCGATTCGCAC
CTATACAagattttaaggtattttactAATTTGTCTATTAGTTCACTATG
CTCAACTTCTTTTGAGCTAgagtctgtctgtctgtctgtctgtttgCCTG
TTCCTGTCGGGAACTAAGTACATCATGTTGAATGATCGGGTTTGGCTGAG
ATTTTAATTTGCACAATAGTTGGATTTGACGGCAAGTTTGAACCCTTTCG
GGTTCAGATTTTTGGACTGGAAAAAGTTTTACACTTTAGCCAAACAAGGT
CTTACGTAGTTAAGAGGAAAAGCTAAGCTCTGTACAGTTCGTCCGTTTGC
CTTTTGATAGTAGAATGTGTGGCTTCAAtggagttctttaaaaagaaaat
aattcaatGAATTTCTCAGAATAAAATGACAAGAGTGACGGCCAATCATT
CCTTAAAACAGGGCGCTGTGCAACTAAAATTATCTCTATAATGCGGTCTA
AAGGGAATCTTCAATTAAAACCCCTCGAAATTTGGTATAGACATATTGTA
TTCATTTTGATGCATTTAGTTTTGGATAGATTTTAGGAGCAAATAACACG
TAAAGGATACAACTTGATCGAATTTTAATTCCCTTTTAGACAGCAAAAGT
GGCGTTGGGTACGAAACCTTGTATCATGTTTTCGGGAGAAGAGTTCGAAA
ATAAATTGGAATACAGAAGATTGAAAACCTATTTCACAGGTATTGtactt
caaattttcttaactgGGGTTATCGtcatcatgaaaaatatgagaaatct
gattggctaaaaacgagGGAAAGAGGAGAGGGGGGAAATAAAACAGAAGA
CACAAATggaatgaaaaaagtttgttgatatttttccagttgatgataaa
ccagttatcacacttCTACTCGAGTGTAATAtaggatatatttttctcgt
tgagagttttctttattttctatatgataaaaaaattgaactcgaaaaat
ataccCCAAAAATATACCCCAAATTGTACTCGGTGTCGTGCGATAACTAT
TATTATTTAGTGATAAATGATATTCAGACAATCGAGTTTTTGTActtacc
ccggtggggtggaggtcctataaattaacctgtgtttgtttgTCCGTcgg
ttcgttcgttcgtctgttaccaacttttctcaagattgaatgatagaaat
cttttgatttttggtacaaaggtgcaaaatgtgacggaatccgatttttg
aaaaaaaaaattttgggtaaatttcagccaaaaaacggctaaaaaaaggg
tttttaagacattgtgaaaaattggatcatttatttttctgatttctgta
agacattgtgaaaaattggatcttttttttcttctgatttctggcatgaa
agtaggctaacatcattggtaaaagatggctgaacctgattttcacaaaa
aaaaatttcggctcaaaaaacgaatctttatctataagaatcgctattta
taagcataaatcAATATTCTTGTagtcatattattatttttattagtttt
tttttaagatgaaaatgtcacggtggagggcaatggtttgagttttctag
aaacatttattatttttttggctgaaaaacgaatcttcatctataagaat
cactatttataggCATAGATGAATGTTCTTAggcaaattattatttttat
ttttattttttctaaaagaagaaaatgtcactcttatatttttatttttg
ccttttaagtttGAGATTAGCAAGTCAAGCAATTATATCAGCTTCAAACc
aacattttctatttttaatttaAGGATTTCAGCTACAGACTTTAGCATCT
GTTGTTCGCgaaattaaagtcttttgatcTAATAAACCAAAGttgataaa
tgacccctcaaaattaaAGTTCATTCTTCTTAGCTTTTTAATGGAAAAGG
ATTCGTTCATTTAAAATTTATAGTTACCGAACAATTTTTCCCATTCATGT
GTATTCGATGACATAAAGTCTAATTTATAATGGCAATCCCATTCTTTAGA
CTTTTGGCGTGGTGAAAAGACGACCAACGTACGCTTAGAGGGCTTGGAAC
ACGTCGTACAGATCACAAGTGTGgatgataaaatatatttaagaAGTTAC
AGGTATGACTTTTCTCCTGATTTTTCTCCTGATTTTTCTCATCACGTTTT
ATATATTATtgtactaaagtctgttcacgataagtgtgcactcttttttc
ttatacctataacttttgaaggaattattcaatctttataaatttggtat
cgttggagagatatttgtgagtggaacaattttaaatttaaaaaaaatct
aaaaaattctaaaaatgaagatgaaaatgaaaaagaaaaaaattaagatc
ttaaaagtgctataacttttttttcacattaacTTAAAATTAATAAGTGA
TTGAtaaaaacatcagaaaacagcgtttttagacgtcaatcagcttataa
ctttgtttgatatcttttgaatggatgattatttttgagaaattttttca
cattgacGACTTTTGATGATCAagaattcacttcagtgaaaatgatagtt
atagcacttttctacaagatcttcattttttggacctacctccgggtact
cCGGTGgtggtcctataaattaacctgtgttcgtccgtccgtccgttcgt
tcgtctgttaccagcttttctcgagattggctcattagttttttctaatt
tttggcacaaagatgcaaaatggcaatggccaaaatgtgacggagcccga
ttttcgagaaaaagttttttgcggCCGacaatgccggaaatatgcctgga
aaactgtttttttggcattttctcgagattttatcattagttttttctga
ttttttgctcaaagatgcgtattaacaatgcccgaaacatggccgagtct
gatttttgagaaaacatttttccggccgaaaataccggttttttcattca
agaacattattaatagcaatgcccaccatcaagcatgtttcaatttgcaa
taaaattgacttttgataccggaactatttaaaaatcgccggaacaacct
attttcgcgggaaagacagtattttttgaatttctcgagctgtactttat
attttttatgaaattttgcacactgatgcaaaatgacaatacctaaaatg
tgacggagccatagtgtcctcccccccctttataaagggggggggattct
gattttggccctttttttaaagtatgggggaaaatgaaaaatttgaaatt
tgctgggggaaaataaagaggggggaaaaccataaatttaggagattttg
actggggggacttcactgatctcaaggtgatcttgttgcaaaacctgttt
aagcaataaaatcagcaaatcttttgggataaaccaacttttcaatacaa
tttcatttttccagcactttcaaggctattttttcaagctttccaaaatt
tcaaacttgatttaaggcatttttatgttaaccatatggggaaccgcaaa
atcttcaaatagccgggggaattcaaaaaagagggggaaccgaaaaattt
tgaaatatggtgggggaaataaaagaggggggaatggagaaaaattttga
tttttagtggggggaaccaacccaggaggacactatgcggagcccgattt
tcaaaaaaaaaaatttttgtgactgatttttgcgaccaaatctttctatt
tatttttccctacaacccttccctctccccccatcaacaatcaatgatga
tttaatgcgttatgcattttcgcttaacgctatattttctgactgatttt
ttttttcatttttctcctcgcattgctatctaactttcatcatcaggtag
gtccattcagcatctagcttgtttctttttcgttttcatcttcattttta
gaattaaaaaaaaaattatttcaaattgttccactcgctACTATATTTCC
AATGACAACTAATTTATagagattgaagaattccttcgaaagttataggt
aaaagaaaaaagaatgcgcatttatcgtgaatagactttagtatgCCAAA
AGTTGAAATAGGTGAATAAATATAGGCTGTTGGATTCAATCTTACAATTT
TGAACTTATAAGATGCGTGTGTGCCCAAAATTTGTCAACATAAACCACGG
GATGGGATGGGGGCAGCCTACTTTACACTACGGCCTACGTCCCTCAAATC
CTATTATACTAACTAACCATCACAATATTATATAACTTTCAGGATCGTAT
TAAAGAAGTCTGGTTTGAAGACACCTCGCTTGGAGGTTGAAGAGATCGGA
CCTTCGATTGATTTCTCAGTACGAAGGAGTCATTTGGCTTCTGAAAGTTT
ATACAAAGATTCGTTGAAGAAACCCAAATCCAATAAGGTATAACAAAGTT
TCGTAATAATGggcatttccagaaaaaaaactgaatttggAGGTGGAGAA
TATAACGCATTTTGGAAATTGCCCCGGAACTTGTGATTTATGACCCCCCA
GGAAAACAGATCTAATGCctcggacaagcatcagttgaccccctggacat
ttaTTATTACCCCTAATCAGAGGagcccccccaaaaaaaaaaaaaaacaa
ggcaaattttgtagatttttcactgccCGGACAACATATCCAATATAATC
CTCAACGAGGGGGGCCCCCTCCGTGTACAAAAATCTTTTGGAAGAGCCTA
ATGTTTGCTATTCTCTCCATTTTGTTTTATTCGAGCTTATCCAGAGCTTA
CCTTCGAGGCTACATCAGTAGTATATTTATAGTGTCAGTGCGAACTACGT
AGGTTGAATACCGCTGAAGACAGTATAAAAATAAATCCTGATAGATTTGT
TGCAGGTTAAGCTAAATGAAAATGCTTTTACTTTGATCAAGTCATCCCTG
TCTCAAAGTCCTGTTGGAACTTCTTCCACTGCCATGATAAAAACTTCTAT
GGAAATCCCAATTGAGatagaaattctttttgttccatgctcaaaaattc
cagtggggatggttttagagCGCCATTTTATATATTGAATTTCGATTGGG
ATgagatcaaagtcaattttccagtggggctgaaattgaaCGGTATTTCT
CCCAAAAGAGACTAATTTGGCGAGATTTTCCAGTGAGGCTTGGGGtccca
gtggatctgtgagGCACACGGCCTGTATCAAGATCTGATTTGAAATTCCG
TGTTTTTTCCATTGCAgccaaagaagaagaagaatatcGAACACGATGTA
TTCAAGACAAAAACAGCTCGAATTCATATGCAGAAACAAGATCTAGACAC
GATGCAAACACGAAAAATGAAAGGgttaaaacgtcaaaaagaaccTAAGA
GTGATGCGAATAGTGAAGGAAGCAAACGTCAAAAACAAACTGCCGATTGA
ACAagctaattgatttttttataggatgcgatattttttacaaacgaaaa
tatatatatttttgacgCTTAAAGAGACTTTGTGACTAATTGAGAAGTTT
TGGATTCATCTGATTTTCTCATTCAG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:85849..94474 + |
|
