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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000111_pilon:77629..85838+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13719 ID=MSTRG.13719|Name=MSTRG.13719|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=8210bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:77629..85838+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttcagATTAAATACAACATGAACATGGAATAAAaaacaatcaacaaaaa
aatatacaatgacaGAAAAACTTAAACCATGCTTTGGTCAACTTATAATT
GGTCCACTTGGGAGTGGGAAGACTACATACTGTCATgctgtcaaaaattt
tcttactgGAATTGGAAGAAAAGTTGTGATATTTAATTTAGATCCTGCTA
ATGACAACATGCCCTTCATTCCTGATTGGGATTTAGCAGAACTGATTTGC
TTAAAAGACGTCATGAATCTTTTAAAACTTGGCCCAAATGGTGGTCTATT
GTATTGTCTTgaatttttagagaaaaactttgaacatCTGGAAACAAAGT
TaagaaagtttcaaaatgaTGGTTTTTATTTCTTATTCGATTGCCCTGGT
CAAGTCGAGCTTTACACCCACCACACATCTGTACATTCTATAGTAGATCG
CCTTGGTAAACTGGATATTAGGGTTAGTAActaaagttttcaattttttt
catcagaATTCCATAGTTTTTAATGCTGAATAGAACAACTTATTTGATTT
TAATCTTCCAGGATCAAAACAAATGACATCtctgtttgttgtttttcacA
AAGCAGTCATCTTATGGTAGAAGATTAATAGGTGTATCCGTTACCTGAAA
TACTCGCTCTTTTTTAGTTAGTAGCTGTTCACTTGGTAGATTCACATTAT
TGCAGTGATGCTTCAAAATTCATATCTGTTCTGTTAACTTCTCTATCAAC
TATGTTGCGGATTGCTCTTCCACATATCAATGTTCTTTCAAAGATGGACC
TGATCGAGAAGTATGGGAAATTAGGTACCTCctttctttttgaataaaac
aTCGCATTTTATGACCCCTTGTTATAGCTGCAAATTCTCTCATCTCATAT
GGATATAACATGATATCACATATCACAAGCATATCATGAAGATCCACAGA
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tctttcagcttttGACATTGACTATTTTACTGAGGTTTTGGATCTACATT
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CTCCAAACTCCATGTGGAGGTTCTTAATACATTTAATTAACTCTGGACTT
TTTTATTAAGTCACTAGGAAGGGTTGTGTAAGTCAACAATAAATACATTT
CTATTGATCCAATCACAATCACTTTTATTGGTTTAACGATTTTGTCCAAA
ATATATCCCGCAAGCAATAAACAAAATTCCCACCCATTAATTTTTTCAAg
ccatttgccaaattaaatcccctcggaaaaatttcttcttttaaggtaGT
TTTATATATTTAGACTTGAGAAATCAAAGACAGCTTTCCTATAATCAATG
CActaaaatgggcttttccaaaaaagaaatttacccccactgttgaggat
attgatttttcgaagtatcaaaccccctggatatcctctatTAAAAATAT
CCTTAACTCCCTGGATATTCTCTCTTATAAAAATCCTTACCCCTGGATAT
TGTAttctttacttgaaaagacactttaccccctggatatccgctccctt
gtaaaAATTAaactccctggatatccacttttgaacaaaaatcgttaacc
cccctggatatccacaacaggggggcacggactatttctggaaaaaccca
ataattctaaaactttttctttcctattttttttAGTGTGTTTGAAAACT
TTTGTGCTGCAAGTATTGTTGTCCTCACCCGGCTTACTAAATttctttat
tattgttttttaatttcaagaacAAAGAAAGTATGttgaatttgatgaaa
attgtgGACCGTGCAAATGGATATATTTATGGTGGCTTATCCAAAGAGAG
TGATGATGTCATGGAAATGATGTCTGATAAAGTTGGTGCTGATCTAGATT
TTGAGGCGTATCTTTTCCCCTTGTTGTAATTATAGTACATTGTGTCTTTT
GATAGTTTTTTGTGCCAGGTGTTTCTGAAAGGGCCTAAGAACAGAAGATC
TTAAGAAATTGCCTTCtcttatttttggacctaccccggtggggtggagg
tcctataaattaacctttgtccgttcgtccgtccgttcgttcgttcgttc
gttcgttcgttattagctttcctcgtgattggctcattagttttttctga
ttttttgcacaaagatgtgtaactataaaccctcgaatgtgacggagccc
gattttcgaaaaaaaaattttgggggcaaatttgggctaaaaaacggcta
aaaaacggctaaaaaacgggttttttggactttgtgaaaaattggatcat
taactttttctgattttttgcatgaaagtagggtaccatcataggtaaaa
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atgtttatctataagaatcactattattaagcatacatcaatgttcttag
ttaaattactcaatttttttatgagatatatgttttttttgctcatgagg
gcttacttttgaagaattgtgtgtgtttagacatgaaattttggtttctt
ggcgtgtttttacagaaaaactgaccaaattcgatatttatttataagca
cattatcaattacttaggtattagcttttctcgagattggctctttaatt
ctttatgatttttttgcacaaagatgcataagtatataccctcgaatgtg
acggagcccgactttcgaaaaaaaaattttggggcaaatttgggccaaaa
aacggctaaaaaaagggttttttggactttgtgaaatattggatcattgt
tttttttctgatttttgacatgaaagtagggtgccatcataggtaaaaga
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gtttatctataagaatcactattaataagcatacatcaatgttcttagcc
aaattactcaattttttgatgagatagatgttttttttgctcacaaagtc
ttgaatatgaaagaatatttcaagagcatgaaattttggtttctaaacgt
tttttttataagaaacaaacgactaattttgatagatcgtcactatttgt
gttctgaatgattgttaatggtcacgctcacgtagatatcaattatatat
gtgttaaatgcataactaggtaggtccataaaagtatcacttgttacttt
tttgcttgcaactaaagatttgttttcatttttcaatgatTTGAATCTTG
ATAGAGAATCTTCCATTctaaccagggggggggggcacgcagttacgaaa
agacatgatgtgtagtaagtgctttttcaacactttttttcaggaccacc
accctttgcagttactacaccttggtagtaactgttttcagaaaagattt
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cccccaaacagcagttactacactgtgtagtaactgttttcataacttct
gaatacagtaccaccacggtagtaagtgtcatactgtcttgtagtaactg
cgtgccccccccctgttCTAACATGCCTTTGAGATTGCAGCAACTTTAAA
Acctgttacacgttttttcttttaagaaacacacttttaagaaacatgag
gctcagaatgcctaaaaactaagaaacatctaagaaacatgttgaggctg
agaatgagaaaaaaacattttttaattcggttttttttaaagaaccttcc
aatgaggcccccccagcggttttcgtgatggcgtgattggcgttttttaa
gttcgtgatttcgtgatttgagattttaaaatgcgtgattgcgtgatggg
AGGAACgaacgtgatcgtgatagatAAGAAATTTAACTCGTGATTACGTG
ATTGAGACTGTGTTTCGTGAGcgtgataaacattttttatccaaaaatca
tttttgtttactttataagaatccgaggccgtaaatatacgtttttcgtG
CGGTTTCATCTGTCACTAGCTTGGATAACGACGTCTCTCTACCAATTGCT
GTCAATTACAGCTCGAAAAATGGAAAGTCAGGTGATAACATTAAGAGTTC
GTTCATTAATCAAGTAAGACTGATACAAATGTGTGAAAACTGTGCAAGAA
AAGTAGAAGATCCAGAAATGATATTAGCAAACGATACATTCAACATATGC
GAAAGCTACTGTGACGAGTGCTTCAAAAATGACAACGTGTGCGCTGAGTG
TACATTAAAAGGGCAGACACATGTTGTCCCGTCGCTCAGAGCCTGTGAAA
ATTGTCTCAAGTATGACATAAAATGTATTAAACGGGTAGTACTTGTTATA
ACCGTCGATTGCGAATCTGgtaataaactttgtttgaaacAGCTTCAGCA
AGGAATCACTGACAAATCTATTGATCCGTATCTTTTACTGCTTTCACTTC
TTCCAGACGTACCGCATGTACTTAAAACATGCAAGGCTACTTTCGCAAAT
TGGTATCTACAATTGCTCAATGAACGTGGTTGCCTTTCATTGTTTTATAC
CTTGAGAAACAGGGCTGATCCTGAGGTTCGAAAGCAAATCCAATCTCATC
TCAAAAGTAATGACTTTGTTCGCAACAGGGACCGTCAAAATCCTTCAGCT
GTTCTCGCTCTCTGTAATCAGGCTCTCCTGACATATATTGAAAGTTTAGG
TATGTTATTCCATTCCATCGAACCCAACACCTATAACTATTGGttttttt
CCTTATTAAGGACGACTTTTTTCAAATCAGGACAGGTTTTTCGGAACATG
TTGGAACTCttaagaaagttaaaaacatctaaAGGCTTTTGATATAAAAC
ATATAGCAACAACCTTTTAATAAAGTAGTTTTCACTTAACATGATTCAGA
AATTTTTGACATATATTCTCATTAAAAACTTTCAGACTATGTGACGTACA
CGATAGTCCCAGAAACAATCCGTTACACGCAGCTGAACCGTAAAGAAGCA
TACGCAAATTATCGTCGGTAGCAGTTGGTATGCATGGATATTTATTATTC
TTATGTGCAAATGAATCAGGCTCAACAATATATAAAGCTAAATTGCATCA
TCCTATCAGTGAGATTATCAAGCTGTTTGATGTTTGCGATGGTGACAGAA
TCCGGTATCAAAGTGGTATTGTTTATTGTTATGGCGGATCCTCGGTTTAC
TTCCATCCTGTCGATAAAGCTTCTGATTCAAAAGTAGCAGTAAATAAAAT
TACTTCTAAGAAAGCTATTTCTGAGAAAATGGCTCTATTCAATCTTCCTT
CTAATGGCACCCTCACATCTTGTAGAGAACGTCTACTGAGACACCAAAAA
GCTGTTTACCAGCATGTGAAATTTATTTCATTATGTTCTATGAAATCTAA
TTCGATTGGTATGGAGGCAAACATTAGCCATAAGATAACTTATCTCTCTG
AATGGAATCAAGTAGTGGAGATTGAAGCAATGGATACTGATCTTATTGTA
TCTCACAACAGAGGTGTATCACTGTTGAACTTGGAGACAAATTTGATCAA
CCAAATTCTTGTGGATCAAAGTCCTAAATGTATCGTTTCATACAAAGATG
GTTTTCTGTTCCCTTCTAAAACTTGCTTGTATTATTGGAACAAAAGTGGT
CTTGAAATCTTTGCTGGaaaaaaaGACACAGAAGGAAGCTGGGATGGTAC
TACCGCGTACTGCAGGTTTTACGAATGCACTGGGATTGCTGTCGAATTTG
ATCACGTCATTTACTGTGCTGACAAGCGTGTTGGGTCAATCAAAATGTTG
ACAACCTTAAAACAAACTGCACAGTTTCTAAGGGGCTTGGGAAAAATTGC
CAATGCATTTTCCGTTCTTGAGAAGCATACAACTCCTTAAAGTCACTAGA
ACAGGCAATATCATTGGTTACGAGCTGTGATGAAATGATTTCTACAAACA
TCGAATCTATTCGGTCTGTGGTCAACCATCAAAAAAGCCTTAATGGTCCA
GAAGGAAGTATTTCAGCAGCAACAACAGAGTCTATTAAGATCTTGCTGTG
GGGATTGAAGAAATTGAAGGAGAATGTTGAAACATACCAGTATCAAAGAA
CCAATCTATTAAGTTGTATGACATTGgctgttgaaaatttgcattccacc
gtcaacaagaaacaagGAACACAAACCATGGTACAATATGCACAATCATT
TTCTTCGTCTATCAAAGAATCTATCAAGGCTATTTCAAACTGGAGCACTC
ACTATTTTACAAGCAGGGAAAGATGGTATCCTGTTTCCGAAACAGCAGTG
AAATTGGAAGATATAACATTTCCAAAACGAGGAAACaataccaaaacaaa
ttatctcgAGATCAAAAGCAAGAAATGAGAGAGTGGGCATCAATTTGCAG
TCGTAAGACAACGGAGTGGAAGGCAAGAAACAACGATGGCTCGAGCAGGC
ACTCTACCCGAAAATGCATATTACGAAGAACTCACTCCCAATTCTGAAAC
AGTTAAAAGAACTACTAAAAATACAAGAGATGATACAAACGAACAAGTAC
AATCAGATGACCGAGATGATATCCCAGAATATGAATCCGAAAGTGATAAT
GATGACAATGAAACAATTGTGAATGGCGATTCAAATCATATTGATTCGAT
TTCAAGTGATGCAACCTTTTTACTTGGACGACCTTCTCGATAGGGCAGAA
GTATTacatttaataaaaaatatattgcttAGGTTTACAAattgtacttt
ttcattttgcaTTTATGTATTTCGAGTCTAACTTTAACCATCGCACGTGG
TTTGCATGAAGCACtgtaaactaaacaaaaattattacaaGGTTACCATC
GAGTTTACATTGCCTTTGTTTTGATACTCTTTTGATAGTAACCGAAGTAA
CAAGTTTGGTGTTAGTTATACTCCCGTTATATCTAGCCATATCaaaaaaa
aaGgttggcgtgatcgtgatttaaagaaaaattttgcgtgataacgtgat
ttggaaattttttttgcgtgattgcgtgatttgagAGGTGACTggggggg
CCTCTCCAATTCaaccttccatgaggctgattatgtcaaaaagtttagaa
acatgtaagaaacatttaaggctcaaaaggccgatttcttaagaaacatt
gaggctgcttggtaaaactaatttcttaaaaaaaaacaacgtgtatttcA
ACTTAACTCACTATATTTTTTACCAATATAGTAACTCTTAGGTTGAACAA
TCAGTCATTCATACAAATGTGGAATTTATGCTAATTGAGGCGGCTTAATA
GCTTCGTCCAGAAATCAACTGGCGTTGTCTTGTCACCAAGAAAGAAACCC
TTTTTTGAATCAAAGAGAATCAATGTTTCGTATGATATCTGATCTCTCTG
CAAGAAATTTTGAGAGACCAGGAACAGCTTTTCAAAACAACTACGTCATC
acaaaaataattgataaaaatactATGATGCCATCAAAAAACAGATGATG
TTAAAAATTGGTTTGAAATGGCATCAAAATGACTTCATGGATATATTATT
CGAAAGAAGAGGAATATTAAAACCAAAGCAAAATACATTTTGTACTGTTA
TTAttaaaatatgtaaataatATTTCTAAAATCGTATaagttttattgtt
tgaagaaATATTGAAGCTCAGTGTCAGTTTGAACAACTGGTGCATGCATC
ATTGATGCTTGAAACCATTGGTATGGTCAAGAATAAGTACTGTTTCTTTT
AATGGAGAAA
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:77629..85838 + |
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