|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000109_pilon:802691..813094+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13635 ID=MSTRG.13635|Name=MSTRG.13635|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=10404bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000109_pilon:802691..813094+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttactttcactttcttttcgTGTTACAGGAATCTGTACACCGCttgcta
acaaattctgattggctgtaagtttTTAGATTCTGATTGGATTATTTGCC
ATGCCACAGCtgaattttgattgattgaaagtTTTTGAGCGTGAATTCTA
ATTGGATGAAtgcctgaaaagtaaacaacagtaagtaagtattttgctta
tcaaaacctaaagatttccagggggttttatttactttgtatgaCGATAA
TTAATAAGCCTACAAAGCACTGAGAtaaaaacccaacatagaacaggtgt
attttgtaatgtagaatatgatagtgtgaatctttttgaaattctatgtt
aggattttttctcaatgccctgtaactatgcccggggtacccgttgctaa
gaccttgTGTTAAAAACAAACCGATTTTAAGGCAAAAATTCctcaaaaat
tgagatttttgtaatacctcaaatattgacTGTACTGTTAGGGGGATCAG
TACAAGAGAATCTCTTTTAACAAAGTTCATTTCATTGAAGTTACCTGTTT
ATTATATACCCTTTCAATGATGTTGTAACGGAGCTGATTCAAGTCACAGA
AAAGTAAATTTGCAAACTTTTGAGTTTAAGTCAGGTTATAAAGATGTAAT
TTTCTGTTCTGTTGGCTTAAAAATCAAATCTCATTATCCCTCTACAATCC
AAGGAGCTTGTCATGCGTAAGCAGCACTCTACTTTTAGGGTGCAACATTG
GGTAAAGGTTTGTGGGTTTATTCTATCAGTTATAATTTTAGTACCttcta
ttttttaagaaaaacccttttcctggaaagattttttttatttttccttt
tttcaatttttgttgaatGGGTGAAGCAAACTTGATGTGtgatagctaaa
aacataatttaggtttttctctttccaataataaaaatttcagatttatt
tacaacataagttttctaaaaaaaaacaaccaaactATCACCCAAACTAT
CACCCTTTTATTAAATACCTTGTagtgtttttttcttgaaacatGGTCAA
AGCCTGCTATAAGCCAATTGTCTTCATGATTCatgatttctatttctatt
atttgattAGCAAAAACTTTATACAAAGTTATTCTCgccaatgtaacaaa
aaatatgattaataaaatgaaaaatattaagaatgtagcctaaatttata
atatataaaaaaatagaaataataaaataatagtaataaatagtaaaaat
CAAAGTTATTATGTACATATAAAGatctagataaaaatattagcCTCTAA
TCTAAAAACACCTCCGTGGCTCAGTATATTGGAAAGGTGTAATCTGGCAT
TGAAGTTAGTCGAAGGAAGTAAAATCGAGAAGTTGAGAAAAGCTGAAGTG
AGTTGTGAATTTGGTTAGAGCTTGACAAAGGTTTATATTCGCAATTGtgg
gtaaaaataaataagataatgtttaaaattttgaatattttaataggatt
aaaaatcgctaattGATTTTAtccatttctttcttaaaaatatcCAGGTC
TTTTTGTTTGTCAATTTTGTTGGTAATTTGTTCCAGAGCCCCACCGTATT
TGGTGTAAAAGAGTTTGCGTATATCTTTATCCTGTCTTTGGATAGGGTTA
AACTTTGTATTAGCACATCTTTGCTTTATTGGTATCATTTCTCTATTTAC
CTGTTATGTTGAATGATATATTTCGTGTAGCATTTTACCGAGCTCTGCAT
CTACGTTCGTCTAGAGTTTCAAGGTCAGCTTTTCTTCTTTACATTGTTGG
GCTTACAGTCTGTTGCCACGAGCTGTAGATCCAGCGCAAACTCTTTCTCT
GaaccatttcaattttagcTTTTAAAGTTTCATTTCCAGCTGGGTCCCAA
ACAGTTGATGCATACTCTAATGTTGGTcttatgaagattttaaagcattt
aagcCGCATTTCTGGGTTACTCTTGACAAGATTTCTGGTATTGAACCAGT
ATTGTTTGCTTTTGCACAGATATTTGATACATGTGTATTCCACAACAGGC
CTTTTTGCAATGTCACACCAAGGTATTTCGCTTTATCAACTTTCTCAATC
TCTTTTCCATGGATTTGATAATCAGCGTTGATGATCTTACGTTTGTTTGT
TATCCTCAGCAGCTAGCAGCACTTTTCTGGATGAAATTCCATTGACCATT
TTTGCTCCCAAAGAACGAGTTTATTTAAATCATTTTGCAGTTGTTTTGCG
TCTTTGGATGACATTATTTTCCGGTACAGGTAAGAATCGTCAGCGAATAA
AGCAAGTTTTGAATTCGTTTCTAATGGCATATCATTGATATAGGCGAGAA
ACAGGAGGGGGCCGAGAACGGTACCTTGGGGACACCTGAAATGACTGCTG
AATGTTTAGATGAAGTACCTCGAACAACGTCACATTGAGTTCTATCATGG
AGAAAGTCTGATATCCAGTTTAGAATGTCACCGTTTATACcgtaatgttt
caatttcagtatGAGTTTCCTATCACTAAAATATGTttacttttcagaaa
aaattaaagtccttttgaaaatgaacaatTATTACCATGCAAGTGGatac
aacaaaaatatttgaggTCAGTATCTTTTTTGTTTAGTTCTTGTTACaag
ttttgaataatattttgTTGTTGTCTTGTTATACTGGTCAATAAACcaaa
ttcaaaaatcattcACGTTGATCCCACCAaagctttatttttgttttttc
ttaaacatAGAACTTTTCTTCCCATCATCAGTAAAATATTCATAGATAAa
aacaaattcataaaactGATAAATCTGCTCACaatttaaaatcagtactt
taaGTGTGTCAATTCTTGAGTAAAGATTTAAGGAAATAACCTCCTCAGCT
TTTCAATTATGTTTCAAGGTTGAACGCATAGTTTGCCATCGAGCTCACAA
AGGGAAAGAAGAATTTTTAGTGTATTGGAAAGGATTTGAAAATCCTACTT
GGGAACCAGTGGAAAATCTTCTTTCTTGTGGAGACCTGATTGAACAATTT
CATAGACAGGCCAAGCCCATACCAGGTAAGCAATGTTATTAGAATGAGAG
CCAGTTATTCTGCCTTGGGGAGAGAGGATGAATTTAAATGTTTGAAATCT
CAAAATatatgacattttttaaaattatctttaagGTGCCAATCCACATC
AGCTTATACGAACAGCTAAAGCAAAGACAGTCCATGTTAAAATGTTATTG
ACACGCAAGAATAAACACAAACGTAAACTGACACCATCCTCGTCTGAACC
AGATACTAATGATAAATCAATTACACCTCCATTCAAAAGAAAAGGATTAA
GTGAAAGTGAAAAACTAATCCGAGATACACTTCTACACGAATCAAAGACA
ATGAACCTGAAAATACTTGTCTGAATAAGATAAATGGACTTTTTGATTGT
TATGataataacctcaataataatgatataaaaccaatggacaataatgt
accaaataaaaaattgaatggGCGTAGGACAGTTTCAGATAGTTATTATA
GAGGGAGAAACGAACCATCAAAATTGGTATTATGTGAAATAGATAAAGGT
TATATGACGATCACTTTGAATAATGCCAGGAgacacaatatattgacaac
TGATGTGAGTATACAAAAAGTTTGAGCCAACAAGTTACCAAATGCTTTAT
TTTATTCAGCAAATAGATGGAAGGTATTATTGCTTAAGGAAAATAAATAC
AAACTACTATTTTTTCGGCCCCATACATTTCCTCCCGCTTTCAATTTCAT
ACTGATTTGAAATCACAATAGAATAATAATGGTATCCTCgcactcttttt
tttaaattgtttttccaTTAGATTTAAATATGCTTCTGGGATTTAAAATC
AGAACTACAAAAATATTCCAGAAATTATAAGATGTGACACTATTTAAGCC
ATGatcttttgcaattttgttGTTTCAGATGCTGGATGCAATCAGAAATC
ATATgataaaagcaaagaaaaatgatACCATCAAGGCAGTTCTTTTTTGT
AGTAGTGGAGATTATTTTTGCTCTGGTATTGACTACAGTGAATTCGTGGA
GTGCTCTGATGACAAAACTTATAAAATACTTGTCAACGATCTGATATCTT
GTTTAAGGTAAagtaaaactttttcaatgtctttgttgtttgttcTGCTC
TCTTACCAAACTAAGTAGCATATTCTACTACCTTTAGTAACTCTCCAAAG
GAAATTTTCAGTACTCTAGGGAAGAAACTTTTTCTGaatggaaatttttg
cttttcGTGACGATTAACTTTCATGGATTGTGCTCTTCAGAATATGGGAA
GAAACGcaatttgtcaaaatatctCTTTCAACTCTGTTTTTATCCCAGAT
AATTATACCAAAATAGAACTATTTTCAACCTAAAATGTTTCCTGAAAtaa
ctttaatttaaaatttttatattggagggtaaaatttaaggaaaactAGG
CTTCTacgagatgaaaaatcttaTTGACTTTCTTATTTCTTATTGACTTA
CATCTGTCATCAAAATAAGCAATAAAAACACCTTGTGAAGCAGATATTTA
ATTTTCAGAGCctaaattttgtcaaaataaaagagGAAGATTAGCATGAT
GACTGAAAGACTAGTTCTTGTTCTTTTCTAGGAATTTCTTTACAACCTGG
TTCAGCTTCACAAAGCCTATTGTATGTGCTGTCAATGGGCCAGCTTTCGA
ATTCGGAGCGAGTCTGGTGGTTGGATCAGATTTCTCTTACTCTTCTGCCA
aggtatgttttattttatatttttaaaaatatgtattattaaaaacctaa
aaatcttagtaatatttaaGGAGACACCAGCAAGATGAATACTTTAGAAG
TATCTTTTAGAATTTAATTAATATAACTATAATGATATTATGATATGATA
AAAAGGATTAGTTTAACTGAGGATATTTTGTGTATTTCCATAAGAAAACT
ATTTATGTTTTCAAAGCAAAGTAATTTTTGCCAAGAAAGAATTAATGAAT
GTATTTCTAAATGAAGTTTTAAGCCTTTGTAAAGTGCATTTTCCAAGAAA
Cagatttatatttttcaaggaactgtcttttattttcaagcgaaatgttt
tttttcaaagaaattatctTGTATTTTTAATGGGAAATGACTCGTATTTT
CCAAGGACTATATCCTgtgtttctcaaaaaaaatatcttgtattttctga
ggaaaatatcTTGCCTTTCTCAAGGATTATATTTTTAACGAAGATTTTCA
ACAAAGATAttctgtatttctcaaggaaaatgtcatgtatttttcaaata
aaatatttctcaagaaaatatccgtgtttcttaaaaaaatgtcaatgaaa
aaaaatttttttttcgttgaaGAGACGCAGAATATTTCTTAAGGAAAATG
TCTTGTATTTGTCAAGGAAATTATCTTctgtttcttaagaaaaatgtctt
gtatttgtcaaggaaaatattttgtgtttctaaagaaaaatGTCTTGTAT
TTGTCAAGGAAAAATGtcttgtatttctcaaggaaaatatCTTATGTTTC
TCAAGAAAAATGTCTTGTCTTTTCCATGGAAAATATCTTGAGATTTGCAA
GGAAAAtgtcttatatttttcaagtagaGTATCCTGTGTTTCTCAAGAga
aatgtcttgtatttttcatggaaaatatcCTGCTTTTGCAAGGAAAATGT
CTTGTATTTCTCAACcacaatacatgttttttcttttataagcataacgt
ttataagcatatgcaggctcagtttttggtacctaaacaatggctctatt
gtttgagaacaatagaatgctaagcataatgcgagcttgatgtaggggca
gacacttgcttataaaaagaaaaacatgtattctgtgtttctcaaagaaa
atttcttgtatttttcaagtaaaatgtcttgtatttgtcaaagaaaatat
CTTGTATTTGTCAAGGAAAATATCTTgtgtttctaaagaaaaatatcttg
tatttttcaaggaaaaatgtcttgtatttttcaaggaaaaatgtcttgta
tttctcaaggaaaatatCTTGTGTTTCTCATCTCAAGAgaaatgtcttgt
atttttcatggaaaatatcCTGCGTTTGCAAGGAAAATGTCTTGTATTTC
TCGACCATAATATTCTAtgtttctcaaagaaaatttcttgtatttttcaa
ggaaaatatcCTCTGCTTTGCAAggaaaatgtcctgtttttctaaagcaa
aataaatgtcttgtatttttcaaggaaaacgTCTTGtagttttcaaggaa
aatttctggtatctttcaaagaaaatttcctGTATCCtccaaaaaaatag
aaatttcaatgCCCCATTCAGATATGCTCATCGGCGAAAATGTTAAATCA
GTATTCAGTGGCATCTTGTTAATTGACCATGCTTAACAGAAACGAGTCCT
TTAAGATAAAAAGGTATGAGAGTGAGTATGCTAGGTTGGCagtaaaaacg
tcaaaatatttttggtttatttttttcaggcaTCGTTTGACTTGATGTTC
AACAAACTAGATTTGACGCCGATTGGATGTGTGACACATCTCCTTCCCAA
GATAGTGGGTAGAGGGCTTGTAAGTCActtaatttgaaatctttgtTTTG
CTCCTTCCAACAAAATCTTTGAATTAAATTTCGACCCGCTGAACTCGATT
GAAAAACACTTGAGAATATTCAACAGAAGACTCCTGGTAAGAAAAAGGAA
CTGAGAATGAAAATGTCCAGGGTAGAAAGACAGTTATATTGGGAATTAAC
CAATTATTTGTTTTGCGACCGTGATTTTTGTTCTCTTTAGGCCCATTCAA
TGATGTATTTAGGAGGTCACTATTCTGCAGCAACCAGCTTTGATCGTGGT
TTGGTACTGGACATGTATGGTGTCAATTCTTTCAGTGAAGATATCGAAAA
ACGAATGTTACAACTGGCTACAAACTCGACCCATGTAAGTTTAGAATTTT
TACCCATCCTACATTTGTACCCAACCTTCATTTGTACCCATCCTTCGCAT
GTACCCATTCTTACgcacccttctcacagacccactgggaccccttccca
ctggaaaaattggccaaaatatcgtcctcgGTAGAAAATCATCCCCCAAT
TTtgtcccactgaaaataatcaaataaaccaatcctcactgcaaaatatt
atactATTTTCTCATCCCCACTTAATTGTCTgactgaaaacaaaagaatt
gacatccccagccataaaacatgtgggaatatcaatccccatcgagtttc
agtccgttatttttatccccactggctgaaaaaatcctaccgggtctgtg
agaagggggtgtattctTCTTATGTACCCATTCTTCATTTGTACCCATCC
TTCATTTGTACCCATCATTCATATGTATCATTCCTAATTTGCCTCCATCA
TTCATTTATACCTATCTGTCTCATGTACCCATTCCTCATTTACACCTATC
CTTCATATGTATTCATCCGTCTCATGTACCTATCCTTCATACGTACCCAT
CCCACATTTGTACCCATCCTTCTTTTGTACCATATATACCCATCGTTCTC
ATGTACCCATATCTCATTTGTACCATATTTACTCATTATATGGGTACATA
TGAAGGATGGGTACATAAGATAGATGAGTGCATATGAATTTTGCCCAAAC
TTAGCTCTATGTGGATTAAGAACCACTCCGAACAACTAAAATCGGAAATT
TTATTAGTTGAGTAAGCAAACCCAAGGAGAATCTCATCTTCATAGCTCTC
CCTTTTCAATAAGGGGAAtgccaattttttggggggCCTTTGTAGGGGAG
GGGGTAGATTTAACTTAAAAACTGGGGGAATGGGAGTGTAGGCGGGATTC
AAATAAGAAAGGATGGGTGTTGGAAATTTGGTTaattttatcattaaaaa
aaggtcgCAGTCTGTAAAGAATACGTACCACCAAACTACGAAACTCTATC
ATGTGTATAAAGCTAGTTATATTattattttgtgaaatttttggcTTGTG
ACTAAATAGtttttttACTCTTTGATCACTTAGGTGGTGCATAGAGCGAG
TTTTCTTCGAAACGAATTTTCTGTAAAACAagggggataagatttcatta
caaaagttGGGGTGAATAAACCTAGGGAGCTCATACgcttcggggggggg
ggggggggggggataccCCTGTACAAACTATGCATTCTACTTGAAATGAC
CGAGAGTTTTGAGGAAGGGTTGCTCGAATAACCTGGAGTCTTCTACGCCA
ATGGTACTATTTAAGGAAGCACGGCCATTCGGTTTATTTGGTAACTTTCC
GTGTTTATCAGTTCATTatcttttattttaataaaactcCTTCCAACCGA
TAAAAGATTGCTATCGGCTCGttttttcttgctttgaggtttctgtttcg
accttgatttttttctttaagcttttAGTTAATGTCTAGGTCACTGTAAT
CTCATAAAAGATCAAGCATTCATTCTGCGTACACAACGCTCTGCTATAAA
GAGATATGGCGGGTGTGATAATCGGACttggttgttcagccaaaacattc
aaaaccgcCCTGCCTTTTTCCGCGACAGCGACTGCGTGTCTATTGCTTAT
GTTTACGATTGCGTCCTGTTTAGATGCGATTGTTTTACTTCAACTAATCA
CGGCTCTCAAAAGTGTACTTAATATTTATTCCAATCtggatgaaaaattt
aaaatgccaTAGCCTTTGTTAGAGTGAATATGTGCTTTGCGTGGAGTTAT
CAGGATCTGTTCGAAGATATAGGATACTGTCGTTTCCGTAATCcacaaaa
agagaatttttatggcAGTTTACCAAATACCGAATGCTCTGTTACAATCA
TTCAAATGGTTTAGGGATAAAACTTTGTTGGTTTGGTATTAAAAATGCCT
CTGGATCTCGAGAATTCAAACTAGTTAGTTAAAGTGAAGTTTTTCTCGAT
TTGATTCAATCGCGAATTTTATTAGGCTGCACGTATCCCttgtatcgtgt
ataaaattcctgtCCGAGTCTTGGtagttttttagtttcaaaaACTTAAT
TAGCTTAATTCCTGAatccgaccgacgggggtgctccgctgaggtttgaa
aaatggaccctacgtgggactcgttttttcaaaaattttcttgaaaaagg
gGATTCTATTAGgccggaacaccggattcttccagtcatTTATACAAACT
AGATCCCGTAACAATAaatgtattatcatataacgcctatactactgtat
tacacacaTTATAAACGAcggcgcatccccgtaacccattttgctcTAGT
ACCCCTCGggcttgattagtaagttttatatgagaggtctttaaatttat
taaaaatttgaatggctagaggtTAATACATTCATTGGACTGAAAATTTT
GGTAACTCTCGAACGGGGATTTTATACACGCTACGCTAacacatccccta
tatcaaaatataatatgTGGAGGCGTGCAGCCTAGAGTTTTATTAGATGT
ATTATTATGGGGAACGAGGAGCAACTGAAACAATTTGGAAAACAGCAGTT
TTTACTTGTTTAATTATGGACGGAAAAATGCTGATTTATGGTGTTCCTCG
AGTGGATCTAGACATGAAAACTTGCGGTAATCTGCTGCAGAAAATACGTC
ATTCATAAACCCGCCAATATCAAAAGATTTAGGGGTTTAAGAAGTTTAAT
AATTGGTAgttctaatttttcttcattaaacAAACCTTCTGTCCCATTTT
CCTTATACAGTGTTTACAAGCGACGAAGCGAATTGTTCAATTCCTACAAG
ACGATACTATTGAAGATATCTACAGTGAAGAATTGAAATTGTATCAGCAA
TCTCTTTTGTCCAAAGAAACGAGAAAGAAGATGAAAGATGATTGGGCGAT
GAGGATCAATCTCTACTCTGATATCTAGAGAAGTGGACGATTGGTAGGAT
GGTATTGGATCAGATGTCAGTGGCCAATGGTTTGACATTGTTTGTTCCAA
TAGCTAGATGAGACTTAAAGGGACGATTTATTGCTTCATGGAGAACAAGC
TACAGTACAGGTTTTTCTCAACGCGATGGAATACGCTTAACGCAATATTG
TGAATTTGAGCCGTTATATTCTATCTAGGAGTGgatgatagaccttttca
taaattacgttacgaacatcacttgcctctttttgaaaatatcgccatgg
tgattaactcccagcggactTTAATAAAACTACtttatattcataaaaaa
aatcatttaatccctcaggggggggggtaccaagtcagtgtactggacca
tagg
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000109_pilon | genome | sc0000109_pilon:802691..813094 + |
|
