MSTRG.13558 (gene) -

Overview
NameMSTRG.13558
Unique NameMSTRG.13558
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000108_pilon:718102..726660-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13558 ID=MSTRG.13558|Name=MSTRG.13558|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=8559bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:718102..726660- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATACCACAAAGAGAAAATAAACAATGAAATTAAACCCTGTCTCACGTGTA GTATTTCTACTTCTGCTTAACGTTGTCTTCACATATGGCATGCCACCGAT GTATGAGGGAATCCAGCATTTTTCTGAGCATTATAATTTGCCACCGCTGC CATTCAAATTTGGAAGCATGGAACCACAATTTGATGCACCGACAATGAAA ATCCATTACATTGAAGTTCATTCAAATTTCACTAAAAATATGAATAGGTT ACTAAAAGATTGGCGAAAAAAGGTATATGATCCCGGGGGGGGGGGTACTA CCCTTGTCGACCCACGGGGGTGCTCCGCTGAGGTTCGAAAAATGGACCCT ACGTGGGACTCGAAATTTGCGAAAAAAGTGACCCTGAATGGGACTGAAAT TCCAAAATTTTCTCAAATTTTCTACTTTTTCCCCAAATTTTCCAAAAAAA GGCACCCTACGAGGGACTGATTTTTCTGTTTTGGTGTTTTTGCGACCCTA CCTAAAACTTGTGGAGGTTAAAGAAGGTACCCTGACCAGCGGAGCATCCC CGTAACCCATCTTGCCCTAGTACCCCCCCCCCGGGTATATGATTTTGTAA TTTAACGTTTTTACATTTGAGACTCAATCGTTCCAATGTAAACATTTTTC CACTAGCATTGTAACATTTTCGACTCAATTTTTTCAATGTTAATATTTTC CTACTAAACATTGTAACATTTCAAGCTCAATAATTTGGCATTTGTGGTAA CATTTTCTTGATTCTATGTACATTCTATTAGCATTTTTTGTGAAAACTCT GGACAATTGGAAATTTTAAGGTAAAAATTGACATTCATAGGTTCAGTTGC CAAATTCCCTGATGGTGTTATTCTTAGTTTTGCAAATTTTATCATGAATA TTTTTATAAAGTATTTTCTTATTTATTTTTACTGTTTCACCTTCCCCCTG GCTTTCACCAGAATTTTGAAGGTTCCATAACTTCAAACCTTGAAAAATAT ATTTGAACCATCAAGATTGAATCATTTTATAGGACAAAGACAATCCGTTA ACAAAGAAGTCGTTATTGGACGTCATTCGAAACATTGCTCAAGTTCCTCA TCAAATGAAATATGACCTGGAACAACAAATAGGAGGGTAAGAGGAAATCT CTGGCTCAGTATTCCAATAGATCTTATCGGAATTTTTGATTTTTCTAAAA AAAGCAATGCATTGTGGGATTGTTTCGGGAGTATTACAATAGAATTCCCT CAAGGAATTCGTACTAAGAGATTTCTATTGTAATACTTCCGAAACAATCC CACAATACATCGCTTTTTAAGAAAAATAAACTTTGAAAAGGTTTTTCTTA AGGTATGTGTTCACCTTCCTTGACACATTCTCTTTAATTGATCATATCTT TAGAACAACAAATTTTTATATATCAAAAGTATATATTTTCTGAAAGCCAA TAATATTCTCTTTCTAATGGTAAAAGTTTCAGCTGAATTTAAAAAACTGG GCACGATATAATTAAAATCTTAAGAATTTTAACCTTACCTACTTCAAAGA AGTTAAAGTCACCCATAGCTTTTGAAATTTGAAAAAATAATTTCGATACT ATGTTGCCAATAGATTGAACCAAAAAAATGTCTTAGGATTTTTTTTTGGA TCGACTTTAACTCGAGAAAACTTAAAAATTGTTAAAATTTGGAAAAAAAT TATTCATTTCTCGAGTTTTTTCAACTTAACCTGAAATTGTGAAGCTTTAA CTCGATTAGAAAAAAAATCCTAAGACAGTTTTTTAGTTCAATTCTTTGCC GAAAATATCAAAAAAAAATTAAGTTCATAGCTAAATGATATGGGTGACTT TAACCTCGTTAAAACTAGTATGGTGTGGTAAAATTTCGTTTTTTTCTACA TCAATTTGAAATTTTTAACGAGATGATTGTTGTTAATTTGCGTAATCAGT GAAATGTGTCAAAAATATTACTATTCAATAGAGGTGAGAATAAACATCAG CTGAATTCTCTCTTTTGTCTTTGTTGTTTCCGAAAGAGACAATTATTTGA GTAAATAATCCATCATAAGACGAACTTTGTTTTGAAATTTAAATGGTTAT AACTCTGGATCTAAAAAAGATTTTAAGATCGCGATTTTACCAAAATGAAA TCCAGTAACTTTTCTTCCACTTTGACTGAAAATTTTTTTTTTGACAAAAA ATCGGAAAAAAGGTGTACACATACCTTAAAGAGAAATGAAAAAAAAACTA ATTTTGTAGTGGTGATATTGAACTTTAACAATCACGTACCCAGAGCCGCT TGCGTCTCTTTTTAATTTTACTGATGACTTGATACAACCGTGGTCGCTAT CAGAATCGTAAAAATGTTAACTAAGGGAAGTTAACTAAGGGACTGCGCTC AAGTTTGAAACTTCAATTAAATCTTTGTTCGATTGTTTTTTAGCTTTAAA ATCTAATTTTTCTAATTTGATCAATTTTTAGTCACTTGAACCATCTGTTC TACTTTGCTACACTTCGAGCGAACCCAAAGAACGAAACAATGGAAATACC GAAAAAATTACAAAGAGCTTTCAAACGATCTTTTGTCAATATGACTTTAT TTGAGACACAATTTAAAGAATCGATAGATAAAGTATCGAGTGTCGGTTTT GTTTGGTTATGCCGTGTACCGAAACGAGACTACCTAACAGTGTAAGAATG ATGCATTGGGATTTTCCAGAAAAAAACCGTGCACCCCCTATTGAGCAGTA TATTTCCATTCTTAGGGGGTATGGTTTGAAATGCAGTGGAATTCCATAGC AGTAGACAAAAGCCCGTCATAAATAAGTGGAATTCCATGGGGGTAATGAA TGAAAATCTGTAAAAATTCGGAATTCCAGAGGGGTATGATCCTAAAATTG CCTGGAATTCCAAGGGGGTAATTCACAAAAGGTTGGAGCTCCTCAACAGG GGGTGTTCGATGTTTTTCTGGAAAAGCCCATTTTTGAACATTTTGAAAAT AGACCTTTTTGACCGTAGTCGCGCGGGCATTTTTTCGTCCGCTTTATCCC ACTAAAACCGTCCAAACTCTTTTTTGACGCATTCTTATAATGTCTTTTGG TGCGAAAAAAGGACTGGGACGGTTTTAATGGGATAAAGCGGACAAAAAAA TGCCCACGCAGCAATTGGTGGCTACGGTCGAAAAGATGTATAGACCCTGG TGAAAGGAGGCGGTAACTTCAATTTATTATTGTACGGGAGGCAGTAGGAG GCGCAGCCATCAAGGTTTGCACGGATGGGAAAATTTTAAGCATTTACTGA TGGGCTATTGTTGAATGCGTTATCAATACTTTCTGTATTTTGTATCTCTC TTTGTCAGTCGGAGCCACTTCATAGAAATGGCAACTATTGCCTTAACGGG AAGTATTTCCCGAAGGGGGAGGTGAAAAACTTTCCGAAATGGATAGAGTT TCTGAATTAGGAAGTTAACCAGTTTTCCGATCGGGAATGTGACCTCTGCG CACTCCGGAAATGGTTGGTGGGTAAATAACTGATGCCTATTGTAAAAGAG GGTAAATAAATACCTTTCACCAGGTAGTTAAGAAATCCACCGGGTGATCG CTTCTTAATTCTACTTTCCCCATTCCCAATTAAAAACTTTCCTATTTGGA AGCTTCTTCTCGATCGGGAAACAAAAATCTGCTTTGTTTACAAAAATTCA ACTTCCCGTTCGGAAACAATGAAAAGTTCTTGACCAAGGCGGTGGTTACA CGTAGCCGGGGTGAAATTCACCCCGGGGTGAAATAGAAAAATAATTCACC CCGGGGTGAAAATCATTTTGGGATACACGTCAACGAAAGGCGGGGTGAAA ACCCTTTTTTTCAGTCCGGGGTGAAAATTTTAACTTATTTTCACCCCGGC GTGAAAACGTAAAGTCTGTTCACGATAAGTGTGCACTCTTTTTTCTTTTA CCTATAACTTTTGAAGGAATTCTTCAATCTTTATAAATTTGGTATCGTTA GAGAGATATTTGTGAGTGGAACAATTTGAAATAAAAAAATCTTTAAAAAA ATTCTAAAAATGAAGATGAAAATAAAGAAGATGAAGATCTTGTAGAAAAT TGCTATAACTTTCTTATTGCCGACCCAAAAAAATATCAGCGTTTTGATTG GTCGAGAGCATCGAGATATTTGCGATATTTCATATTTCTTTAGTCTGGAA ATATGACCGCGTTGACTTTGGGGGACTGGGTAAGCGGCGGGAGAAAAATC AAAACAAAACAGGACTTGGCTGGGAATCAAAGGGAAAAACGCAACAAAAA TATGTTCAGATTAACTTTTACTTTGGAGTTCTTCCATAAAAGACACTAAA ATCAAATCTGATGAACAAAGAATTAATTATAAAACTACTTGACCCGACCC AAATATTTTCAACTTTTGGCAAATTTGTCCGTGTGATAACCAAACAGTTT TTATCAATGCATACAAAAAAACTTGAGATTCTTCAATATTTGTCAATAAA ATTTCTCATAACATAACAAGGAAAGTGTAATGTCTTGTATTAAACCAAAT GACGAGTGATTTTTATAAAAGTTCTCTCCTAATTCTCGTTCTCCACAACA ACGTACGTCATTGACTTTTCAACTCAACAATCATTACAGTACATCTTTCT TCTAAAATTCGAAACATTAAGAGCTTGACGATAATCAAGAAAGCATCCAA ATTGTTTTGCTGTTGAAAAAATGTTGTTCTTTAACCATTATTACAAGCAT ACATTTCCATCGTGGGACTTCCTTTCCTCTGCTATTCTTTCCCATGGCCA TGTCATCGAGACAAAAACATAGAAAAAGACTGAATGTTATCAATCTGATT AATCCAATGATGGAGGGTTTTCTCTCTATCGAAACAATACTGTACGTCAT CTGCATTTTGAATTATCAATCTAGAAACTTTCAAATACATTTCTGAAAAA TCTGCAACTCTTCAAAACAAAACTTCTGGATCGAAGATGATCGAAAAATG TTTCTCTATTTTGTTTTTGTGTGAACATTTTCAGCGGGAAGTTATCGAAT GTTTTTGTTCGAATCTAACGTTCGAATTAGATTTTCGAATAAAAACATTC GAATCTACACAGAAGCAGAAGAAGGCGGAAGTAATTTTTGAAACAAAAAG AGGACAATTTTTTTGAGTCGACAATAAATTAGTTATCACATGACTTCTCG TGCAATACTCAATATTTTACTCGTTCCGAGATTTTACCGATATTTTTCCT CGCCTAAAGGCTCGGAAAAATATTACGGAAAAATCTCGGAACTCGTAAAA TATTTCTCGTATTGCACTCGAAGTCATGCGATAACTAGTACATATTCACT GGAGAGATTGTTTGATCTTAGGAGGTCATCACTGTGAAGAAATTTCACTA AAATATTTATTCAATATAAAGTTATGATGCAAAGTTAATAAGTGATTGAC CTCAAAAAACAATAGAAAACAGCAGAAAACAAAGTTTTTAGACGTCAATC AGCTTATAACTTTGTTTGATATCTTTTGACTGAATGATTATTTTGAGAAA ATTTTCCACAGTGATGATCAAGGATTCACTTCAGTGAAAATCATAGTTAC AGCACTTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTTCTTTTTCATTTTCATCTTCA TTTTTAGAATTTTTTTAAAGATTTTTTTATTTTAAATTTTTTCCACTCAC TGATATCTTTCTAATGATACCAAATTTATAAAGATTGAAGAATTCCTTCA AAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAAGAGTGCACACTTATCGTGAACAGACT TTAATCGTGCATAATTTTTAGATTCAACCCGGGGTGAAAAAGAAATTGTG TATACATGTAAAAATCTGCAAAAATTTGCAAAAAAAATCCTCAAAAAGAT TTTCACTCCGGTCCTCAGGACCGGGGTGAAATCAACCCCGGGGTGAGTTC TACCCGCCTAAAAACGATTTCACCCCGCCTAAATACGTGTATACAGAAAC AGTGTTTTCTTTATAGACCGGAGTGAATTTCACCCCGGGGTGAAATATTT TTTTATTTCACCCCGGGGTGAATTTCACCCCGGCTACGTGTAACCACCGC CAGACGGGAAACAGAAAAGTTATGAAATTTTCAATCTGGAAACAGTTTCC TTTTGGGTTGTTTTCACCTTCCCGTTCGGAAAATATTTCTCGTTAAAGCA TAAGTTGCCACTTCTATGAAGTGGCTCCAACTGTTTGTTGTGTTATCTTT TCACTGGGACAGATTGGACTATGTCACTGATGCAATATTGTTTGAAAATT ACTCAGCACAAAAAATAGGCAGACACGGTCCTGATATGAAATATGTGACT GATATGAAATGGGGACACTTAAACAAAAATAAAACCAAACTTCTGACTTG TTAATTTCAGATACCAGACAGTGGAGAACACGACCCCGTTAACATTAGCT GGTGGACTTCAACCTGTTCTTGGGATTGACTTATGGGAGCACGCGTACTG GATCAAACACCCAAACAGAAGGTGATTCATTAACCTGTACCAACTTTCTA GGATCCACTGACCCATACATACCTGGACCAATTTTCTATATCCCAGCCAG GGAAAACCTTTTGATTTGATGAGTTTTTTTAACCCTAATGGTAGCACTAT TCGATAGTGGTGCAAACCAAATGCGTCCAGGGTGCTAGATCTACTTTTGG TGATATAGCACCGTTAGATCTTAATATTTTAACACTGTAATGGCTTTTTT TCGGGTGCCGCTTTTAAAAAAAATTGAGGATGGTCCAGGGTGTAAAAATT TCAGTGCTTGCATCGGTTCAAGAAAATTAACGATAACTAAATTGACCTCG CGTTTGTATGTAGACTATGCTATAGTCTAAGACAAATCACTATCTAAGAA ATAAGATCAAAGTCGAAGATAATTCGCAAACGGGCTTTTTTGCCTAAAAG AGTTTACCAGTCTTCGAAACTCCACAGCTGTATTTTCTCCCGTATACAGC CATTGCACCATACGGCCATATTTTCCTGCCTTTACTATGATTGTAACGGA CGATAACATCATCTAGTTTGTATACTACAGTTTTATGTATTAGCTACAGT TTTATGTATCTTGAGTTTTACAGACTGTTCACAACCCAGTTGGCACACAA CATTGTTTCAACGTCCATGTGATATTCACAACGTCCAAATAACATTGTAT GAACGTTAGAACAACGTTATGTGCCAGCTGGGAAAAAAATTATTCAAATC TCTTTAAATAAATTTCAAGGTTTTAGCCCCTTCTTCACAATTCTAGGTAC AGTAAAACCTCAAACTAGCGGACACTCTAAAAGGCGGACACCTCTGATTA ACGGACAAAATATTTTTCCCCGGCTTTTTCCTAGTTCAAATCCTTATGAA AATGTCTCCAAAAGGCAGACACTCAATTAGCGGTCAACTCTATTTAGCGG ACAAACATTTTTGCACGGAATGTTCAAAAACCTGTTTTTTCCCTCCAATT AGCGGACACCGAGGAAAACACAATTTCAGACATTAAGATACAAGTAATAA GTGATTTTAAACCATTTATTTCAAGCATATTTTTGTTTGTTTTTTCCAAA TTTTGTTTACAAAGATTCAGTTTTTCCTTTACCCAGTTGACAAGTTTTCC TGGGCCAGTAAAATAGTAAATAACTGACACTTCAAGTCCAAACAGACTTG AGGTTGTTAAAATCAACAACAAAAAACAAAAAACAATCAAGCATTTTTTT AGATAATGGAAGTAACGATTACAGCTCTTCAAGCTCTTTCTCAACCCTGA AGTTGACTTTGCTATTTTTAGTATAATTTTTAGACTTTTCTATAACGATT GAAAAAAAGTAGTTTGCCGGTGTTTAAATAACTTTTCTCGAGTCTTTTCA TGTTCCTATGTCTTTAGGGAAATGCTTAAAACCATAATTTCATGATCGCG ACCCCCTAAGTACGGTTTAATTTTGAAATTTGAGCCTGAAACTCAAAACC CTCCAAAAGGCAGACACCTCTAATTAGCGGACACTAATCCGATTCCCCCA ATGGTGTCCGCTAATCAGAGGTTTCACTGTATTCCCCTCTTATATGATGG ATCAAGAATATGTAGAGAAGTTCAGTGGCACTCTCCTCTACTTTCTCGTC GACTGCGGTCAAGAACTTACTCACTTTTTACGCAATCAAATAAATCTTTA TGTACATTTTCTCTATATAGAGATGACTACTACAAAGCGTGGTGGTCAAC TATTGATTGGAATAAAGTTGAACAACTCTACCAATGGTGGAAGAATATGG AACCACGTGATGAACTATAAGCCAATCAGATCACCTTATTTGTATCACAT GAACGGCTACCATACAATCAAATGAACGGATTTATCGGATTAAAGAAAAA TGTTAAAATTTGGTCATAAAGAAAAATCGATGATGTCTAAAGACATGATA TTTCCTTTGTCTGATGAAAAACTAAAAAACGAATATCCAGTAAAAATTCT ACCCTTTTCAACCGGGAATAATTTCAATTCCGATTTTAAACCCCTGTCTC GCAGCCCCG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13558.1.p1MSTRG.13558.1.p1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonmRNA
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000108_pilongenomesc0000108_pilon:718102..726660 -