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gene from alignment at sc0000108_pilon:339436..357218+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13539 ID=MSTRG.13539|Name=MSTRG.13539|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=17783bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:339436..357218+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAAAAACATTCCAGTTCAGGCATTTTTCaacgaaaatcacaccaaacaT
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gtttcaacaacaagaagaggGGAGAGTGATGTTTCAACAACCAGAAGAGG
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GGTACAGACCCCAACTACCAATCGATACCGACCCCAGCTATCGATTGATA
CCGACCCCAACTACATATCGATACTGACCCTTACTTCCAATAGCTTTTTG
CCTGTATTTGTATCTGATCGATATCGAGTCAAACTTTGctaccaaatttt
attttaaatcaacACCGACCCTATTACTAAAAGATGATGTCACTACACCA
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AGGGGTGGTACTGCCAGATTGAATTACCTCAGCTTGCAATACGTGAACAA
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caagaagagtgcagagtgatgtttcaacaacaagaagaggGCAGAGTGAC
gtttcaacaacaagaagaggGCAGGttgatgtttcaacaacaagaagagg
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GGAGAGTGGTGCttcaacaacaagaagagggaagagtgatgtttcaacaa
caagaagagggcagagtgatgtttcaacaacaagaagaggGGAGAGTGAT
GTTTCAACAACCAGAAGAGGGAAGAgtgatgtttcaacaacaagaagagg
GCAGAGTGGTGTTTCAACACTAAGAGGAGAATTGAATAGTGATTCTCCTA
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GTGATGTTTGAATAGTGATTCTCTCATTTCCAATCAATACCGACCCCTAC
CAATCGATACCAACCCGAAATATCAATCGATACCGACCCCGACTACATAT
CGATATGAACATAACTTCCAATCAATGCCGACTTTAACTTCCAATCATTG
CTGAACCTACCTTCCTATCCTTTcgcatagtttgcagaggggtatgaacc
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AGAGTGATGTTTCAAAACTAAGAGGAGAATTGAATAGTGATTTTCTTATT
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TCGATACCCACCCCAAATATCAATTGATACCAACCCCAACTATCAATCGA
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GACCCCAACTATAAATCGATACCGACCCCAACTATCAATCGATACCGGAC
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GGAAGGAGATGAAAAAGGAGATCAAAGTGACGagtttgaagatgaaaaag
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GGAAGTGACGagtttgaagatgaaaaaggagATCAAAGTAATGAGGAAGA
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ccccatggttgcgaaatggtggctatggctaattcctttgttctttttct
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GATTTTTTAGCAATTgacctttttctgaaaaacagAAATCAAATCCTGTT
GGGATATCTGCATTAATAACTaaacaattttaaagaaagtgtAGGACcag
aaaatgtcataaaaaagCACAAGTCTGAACTGGTCTGAATCAtacttagg
gggggtaggttgtTGtaaaaatgtccccctaaaaacacttattaaaaata
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GGATGTTCTGATGATCTAGCATTGAGATTGAAGAAAACTCTTTACTGCTC
TGAAGATGATGATTGTTATGACGTTTCATCCATTGCACTAACAGGTAGCA
ATATTAATCAAATTCAAATCACTCAATGCAATATCATAGTGATTTTTCAT
ACATGTAAAATATGTGAACTCTGGAAAAGTAGTAATTCAGAAATTCTAGG
AAAGCAGGGACCATTATTAGCTCCATTTAACTGGCTCCATTTAACTGGCT
CTTGTGGGTGCTTTCAAATATTACATGAGTAGTGGGGCTCCTGTTTCCTC
AACGTTGTCAGAATAAAAAATACGGAATCAAAAAGAGTATGATGTTATTT
GAACATACTCGTATCCTTTAGAATCGTGATATAACTTAAATGTCAAGTCT
CTGAAACCCAAGACAGGTTTCACTAtttttttGTAATGACTTACGTTTCA
GATTAATCTATATACTCGTGACTAAAGCATTATTTATTCCTCTCGATTTT
TCTCAGATGTTGCTGTATCTATTCTCAAAGAATCAGCAAGATGTTCTAGA
AGGAAGATAACACATCGCTATGCAAGCTCGTTAACCAGGTAAAATTACAT
CTTTCTTTGTCTTTAATCACTTTGATAATGTCCAAAAATAGATATTAGCT
TGAAAGTTTATCTTATAGGTGACAGTAAAtggtttttttaagtttcttaa
ACTTTCGAAtcctttattattattattattttaggCAGCTTTCCATATCA
CCATGTGCACTTATAATGAGCTTGTTGTACTCAGAAAGACTCCGACAATG
TAATCCAGGTTATTTGGACCGTATCTCGTCCTCTGATTTGTATGTCATCT
CAATGGTAAGTTTAAACCCTTTTATTATTGGTGGTAGTGCTAGTGGTTCC
TATTAGAAAATTATATAGTggcaaaaaattaggatttaCTCTTAGGGACC
TGAAGTAACAAACTGTTGGCCCTCATTAACAACAGGACGGAATATCAACT
AATTGTCAAATACAATAAACAGGGATAGTTGGTGGAAAGTTTGCAAAAAT
TAGCAAATGATAGGTTGATTATAAGGCACCAGTAATgatgataatatttt
aataaCAGCTATTAAAAACACTTGTCACTCTCTCCTCAGTTGGTGGCTAC
AAAATTTTTACACGATGAAGGAGAACAAGAAGAAATCTACAATGACGAAT
GGGCTGAAGctggtaattattttttttaattgtaggTTTTCTATTTCCTA
CCCTAGGCTAAGATTTGCACACCTGCTTAGTTCCACCTTAACTGGAATAT
TTTGAATTGCTTGATCACATTTTGTGTCAAACTTAACTTTGAAGAAActa
atttttcccttttttacaGTTTTCACCAAAACCATATTAAAAATCACTTc
caagggggggggtttcaaaATATTCTCCATAGATGGGTTGAGAACATCGC
TCTTTTACTTTCAGCTGGACTAGCAGTTTCAACTGTCAACCGTTTGGAAA
GAGAATTCCTGGACGCCATCGtaagttttcaataaaatatctaatttttt
aatatttatcgTATTAAACCATGTAAATAAATAATCCCGGCGGGTTCTAG
GTTCACATTGCCCGACCTACCACCCTCGGATACTTAGCAGGACTAAgaaa
gaggataaataggaaaAACCTCTAAGAAACTTCGTTGGGAATGAGTTGAC
ATTGCATTACACTTCGCAAACGAGACACGAGTGGCCAATGACGTGATTTA
TTAAAAGGATTATTGTATTTTTGTGTCTGTTGTCtctatattttaatttt
ttttaaggaTTGGAATATTTACGTTAAACCGGCCGATTTCCTTGACTATT
GCTCGAAAATTGAAACCAAGATAGCTTTAAAGTATGGATTGCAACGCGGA
TGGTTTTCATACACCGACCTCGCACAATTCTTACACGCCATACAATACCA
GACTGTTTTGAAAGACGTCATCGAAAAGACGGTCACTGTAAGTGTTCATT
GATTTATCTTCGAATCAGTTCGAATGTTTATTTTCGTAACAGCTTtaaaa
ttccaaaaccttaaaaattaaaagttgttgaatgtcaaaagaatcttgaa
gataaaaagATCTAGTTTTAAGGTTATGTAATCGTCGCACATAGTTTGAT
ATTATCTAAAACTActataaaatatcaaatatctcGATAAAGTTATCTAA
TGAAAAAGTAAACTCGTAATAATACTCGACTGTATGAGGTGAAATTAATC
AAAGAGGatcttttaaaaaacatgtTTCTGTTTGGTTTAATATAATATTT
GCATAAAATTTGCTAGCCATGACGTAAGTTTAGAATTCCGTAAATTtcat
aatgttttcaaaacttttttttttatttgacaggTCATCTGTGGTTGTGC
TTTGGTTTATGGTATGTCACTCAGCATTCTCGTTTCCACCGCCCTCACTT
ACGCCTCTCAAACAAGCCACCGCATTCAAACGATCACCCAAACATCGACC
AATCACACCCGTGTAAATGATTTCACGCCTTTATCAATGTTGCCTTCTTC
AAGCATATTCGCCAGTTTCTCCGACCGTCGACTGACCCGTAGACGAGGCT
TCAGAAGCCATCGCAAAACAACAGATATGAACGCCAACCAACCCGAAGCA
AATCTCGAAGAAATAAGCGATCTTGCTCTTGAACGCTTACAGGAAAATGT
AACCGCCTCACGCCCAACACTGCCTTGCACGGCAGATTCCCAAACACACG
CCTTACGCTTTGAATCGCAACTCCAACACAGGGCACGGCAAACACGGCTT
TCAATCACGTTCGACTTGACAGATCGCCGATTCATGGCATTCGACGAGGT
TGGATATCACgaagaattttcgaaaaacgtTGCAAAATGTTATGGTTATG
CGGCTACAAATGTAAAGAAGAAGATTGACCCTATTGGAAGCATTTTACGT
CGGAACGCAAAGAAGTTTATGTATGATCCTCGTATCCTAGGAATGACTGT
TATTTAATTGATCGTTTTTCTCACTACTATTTTTTCACTACAGTATTCTT
AATTCAACCTTCCTATCTCATAACCCAAAATTCACCATTTTATGTGtttg
tttatttgaaattgCCTGCCTGTTTAGTCCAACAAATCTGTTCTTTTGTA
CGCATTTTCTTCCTGTAAACTTAACAACTATGCCATATTAGTACATAGGC
TTAGAATTGTGCTTTGTTTCGATACTGTATAAATGATTTAATCAATATGT
AATACATTATCATAATACAAGGTGTCCCGGaaaaaaaGCACTATATCAAA
CCCTGACACAGTAATTTTTTCGAGACACACCATATTCTTCGTATTTctaa
ttttcattaaagctcTCTAGTGTTTCTGTTTTTTATGGGTAATATCACTC
CCGAAGTAGCCAATTCTTTAGACTTAGACCACTATAAACAGCTCCAGGCT
CCAAGCTCCAACTTAGTCTATGAGCACTcttataggcggccactagtgac
ccccctAACCGGAAACTTGTGCGGAGCGAAAGaagataaattaaaatttt
gctcaTCCCTTATTAAACATCGTGTCTTTTGAGACCACGTTCACACACTA
CGGTtctgtttcgctccgaaacgaaaagaagtcattctattggttaagTT
CAAGTCTTACGTCAATTCTAACCAATAAAATGGCTTCGTTTCGGAGGGAA
ACGGAACAGTTACGTGCGAACACAGTCTCAGCTTTAGGAAATAAGCAATC
ATATTATGTACATGTCTATGTCGTTTGAAGAAGTTTCCTTAAAATTGAGA
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TCCCCTCCTTTTGtagttgtcatttttttgtaaaagattttttacagtat
TGAATATTTGTAGTATATTAGCTAGCCATGTACCTATACCGTATGGATAT
AATCACTTTCAATAAATGTGTTTATATAGCAATGAAactaatgttttttt
attcagtgCTTTCCTACCTACAAGATTTGATCAACCTTCTACTCAAATAT
AGTATTTTATAAGAAGAACCAAATAAActttga
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000108_pilon | genome | sc0000108_pilon:339436..357218 + |
|
