|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000101_pilon:1105628..1114417+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13062 ID=MSTRG.13062|Name=MSTRG.13062|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=gene|length=8790bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:1105628..1114417+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTTTCGACCGATACAATGGTGCACAACTTTTTGATGATTCGACAAGAAA
CAATAAAGCAACATTGGAAAATGGGGCAACAATTACAAAGACGGATGGCA
GCTGTGGAATGTGTGTTCAACTTACAAACGGTGAAGTTGTTTTCAATGGA
AAAGATTTCAAAGGTAAGATTGTTACACTGAAACCTCTACCAATCACACA
CTTACAATGGCTAATTTTACTCTTAAATACAGTGATTGATAAACTAAGAA
AGTCGAAACAAATAAAATGTGTATTCTCACATCAATAGTACCGTAGTTGA
ACTGCAATGTAATCATATTAGATGTGGCAACCCAGACCACCATACGAGTA
TCCacctttttacagaaaaacACAATAGTGTAGTGAAAGGATATAGATCC
TTAGCAGGTGGGCTGCTCCAGAAACTTAATTGAGGGGATGGATATGGATC
AAATACAAAGGTAGATTAGCAGAGCCTATCATGGTATTTTTTCTCGGGGA
AAAGTTCACCGTTAGCGGGGTCCATACTTCATCGAAGCTAAAAAACAACG
CGCCCACCTAACAAACATCAAGCCCAAACAACATTGTGTGAACTTTTAAA
GAACACTAATGTCCAATTCTGATAACAGGTTTACCGAAGGAAGGAATCAC
GATTGCATTAATGATCTATTTGGACAACACCATTGGATCACACGAAATCT
TCCAAACAGTTGGTGATCATTCTGAGCATAACGAAGGTAAAGAGACTTTC
GATGATATTTCTTGTTACACCCCGGTATCATTCGCATAAGCGAGTTTacg
tattcgagataaatcgaaggaaacggtataaagcaaagttggcatgtctc
caaaatcaccgtctactttgctcgacgacggtaaaaacaccaaaatacag
ccgtctgtttaggtgagtaaggcgatatagagccgtacatcaattAACGA
CttttttttGCGTcgacttcacttaccgtcgccctcgatatcctccgata
cataaacttgctattaTGAGCCCCTGAGAGGaaaaaaaGCAATGGGGGGA
AACTTATACTGGACAAACAATGAAATCTTGAGGAATCTCTAATGAATTAT
TAGCATAAGAATTAGAAATCTCAGCATTTGAAATCTGAAAACAGATTAGG
TAATCACTGGGTtactgacacaggggtgtattttctTTATGAGTAACCTG
CGGTCACTAATTGCAGCCTTTATATTTTACACCGACAAAAAATAGCTCGA
AATCCCAGATTTCGAGTTGAGGCTAATCATTTAGAAATCAGTAACATTAT
AACAGTTTTTCTATAAtctttggattttaaacatacATCAACGGCCCTGA
TAGCATGTATCTGCGTTCAACAAATTTCAAACGATTTTAAATACATCTGA
CTTGATCCGACTTTCAATTGCTTTTTCCTTTAAAGGTCAATATCACTTGG
AAATCATTGACGGGAAAATCCGTTGGTTCCATCGAAACGAAAAAGGCGAA
ACTGTATTTTCGGTGGAAACAGTTCAAGGTGTAATCAAGCAGAAAACTTG
GTATGAAGTTGGTGTGACATACAGTTCAGAAGGTGTCagtagaatctttt
gtaatggTGATTTGCTGAAAGAAGAGATTTCAGATAAAATGACTTTATCA
CAAGATTGGGGAGCATTTGCAGGTAAAATGAACAATCATCATTTTTAAAT
GTTAAACGCAGACTTCCTGAGGTTTTTCCATACAAATGAGCGTTTCATAA
ATACCATAAAGGTACAAAGGAGGATCTCTATTTAGTGAACTTTGACTATA
ACAACCATGTTTCTTTATATCCCTCAATCTTTTCGTCCGATCTAGAGATA
TATGAGAATTTCAACGCATAGTGGGCAATACTTCCCAAGCCCCCACACAA
AAAGTCACCCAACCTaattcaaaaatctgaaaactcTCAATCGCCCATGA
ATCTAGGCGGCACTGTACAACGTTTATATCTTCGATCAATATTATTTGTT
AAGAAGTCAGCAATATTACACATTACATAtaacattcttaaaaaaaaaaa
ggtatTGGAAACTTCAAAGGTGACCGAGAGCTGAAAGGATACTTAGATGA
ATTTTACATCTTCAATCGAACACTGAATGCAACAGAGATTCAAGATATAC
ATGAACATTGTAAAGGGTTAAAGTCTGCTAAAGTGATGGCAATGAGTTTT
GAATCAATCAAAGGAAATGTAACGTATGACCAGTGTTACCAAGGAAATGA
TGGATATTTTACTGGTGAATTCATCAAAGGTGAGAAAGTGGTGTGAATCG
AATGTTCTATTATCCCAACTGTTTTATTTGTCTAAAGCTAGAGTTCATAC
TGAATAGAAATTGTATTCAAAGATCCAATGATTTTATTCCCACCGGCTAA
AGCATTTTAGCTTGGTCACTGAGACAAGGGTGTTACCTTGGATccctttt
tcttcaaaataacaGATAAGTTACTTTTCTTACCAAAAGATAGGTACAAA
CCATCCAATTAGAGAACGAATGGAttttaataataaaattcaATCAATCA
GGCTAAAAGGGTAATAAATAAGCACCAAGTTATATTATTCCAATATTAGG
AAACAATGGAACTTGTGGAAATGATGTTGGATTGCCATCATCTACCGAAC
AAAACCTCAATGTCATGTCGGTGAGAGGATCAAAGTTTCGTAATAAGCCA
ACAGATGCTTGCACCATATTGATGTGGACCAAACTTGAAGATAATAAAGG
AGTTCATAAACTATTTTATACAACAGGTAAGTCATTTTCTCAGATTTTCT
ATCTATGAAAACGAGAATTGATGTTCAGAGAATGAGGCTCTTAGAAATGA
GACGTTATTCCCACTTTGATGACACTGATGTGGAAAAATTGAGATTAGAT
AATTTCGAACAACTCTAAATGGTAAATGATTCAATAACCAAATCTACCTA
CTCagccaaaatacaataaaagaTGACTAGGTAATGAAGTTTGTAGGTTC
AGAGCTTTTTAACGACCTTTCACCTCCTTCTTCTTCTTGACATTAGGTGG
TCATTCAATGCATACGCACGAGCAATATGATTTGAGCGTACACGATGGAG
CACTGCATTGGATACACCGAAATGAATATGATCAACAAATATTCAATGTT
CATACTGAACCCATCGTCGTTAAAGGTAATCATTCTTGTATTTCATTCAG
AACTATGTTACCAACTTCCTTCTCTAAGTTTTAGTTCGGGAATATGCTCA
TGGGGCGAAAACACTACCATGTAGcgacttaaaaagatttttgtcacTTT
CTACGAGatgtttaaactttaaactttctACAGGGTTCTCTATGAGtgtc
ttttttaggaaaatatcAAAGGGCGTTTGTCTCGTAGTCCattttaactt
gaaaaaaatccatCGAACTTTCGCTGAAGTAAATTGTCAATCATTTTAAC
AATACCTTATCTGTAGGTGAATGGACGCACATTGCAGCCACTTATAATTC
CACAAAACAAATCGCTGTTATTTACGTCAATGGTGAGATTAAAGAAGGGA
AGAACGGTGTCGGTGCCCTCTCGGAGGACTGGGACGGAATAGCGGCATTC
GGACAACATGGCGTCTCAAGTGGAATAAAAACTTTGGATTATTTGGATGA
GATTGAAATGTATGACCGTGAATTGTCACCTTTGGAAATTCGACAAATAT
TCATGAAATGTAGCGACGTTCTCGTTTATGGTAAGTGCTATTCGTTCAAT
GCTATGTGTTCAAATAGCAATTCTTTTTAGGTTCTCTCTCAATTCAATTG
ACCAAAACAACAAGTATCAGCTCTTCATTTCTAACATTTTGCAAACATAT
TTTAACATTAATTCTCATTTACTTTTAACGATTAAATCATCCAGCCAGGT
TCTATGAGAATTTTTTCCTTATGCTTTGTTTGGTATCACTAGGAATGCGA
AGTACTATACCGTCAAAGAGGATAACTAGACCAACCTTCGTGCGAGTCAA
AAGAGGTAATACTCAATCTGATACATTCGTGCTACTTAGTTTTACTGTTT
GTTAGACTCTGTCTGCGGCAAGATATTATGTGCAATTATAGCAGCTGGAA
CTTAATTCAAGCACGTCTAGAATGTAAGAGCTAAGAAGCTGTACATTTCA
CCTCATTACACTCGTGATATTGCTGAACAGAGGGTCGTCGTTAAATTCAT
AcatatttattaaaaaattacaacCACTAGATCTTGAGCATCAAGCACAG
TTAGTGTATATGACCTTCGATCGAATCGCTGGCGACAAAGTTTTTGATGA
TTCTGGATATGGCAATGTAGGCCATTTGATTGGAATGGCCAAACTTGCAA
GAGATGTTGGAAAGTGTGGCCATGGATTACGATTCCAAGGAGGTAAGACT
GGCTAAGGGCTCTGAGAAAAAAGGTTTTCATTTAATCAACAAAACAACTA
CCAGAAATTGGTTAACCGACAGTGAGTATGTTTTAGAATAAGAACACGAA
TTTATTAGAGGATTTATTATCAAACACTCTATGCTCATTTTAACAGGCAA
TCTTCTCCTTAATGGCCACCTCATGAAGAATATTCCCAAGAAAGGAAtca
caattgcattatgggtcTACATGGATACAGTTGCTGGGCAacaagagatt
tttcaaacaattGATCCTAAAGCTTCGGTCAATAAACATGGCATGTATTA
TTTGGAAGCTGATGATGGCCACATGAGATGGTTTCATAGGAATGAGAAAT
CCGAGGTAGAAGACATTCTTTTTCCATTTCAAAAGTGACTGAGtatatcc
aaaattttaaaatattaaaaagcaAACTGGTCTGTGTTTGAAATAAACTT
CTTAATATTAGTATCATAAGGACGTTGTAATCGGGTCAAATACAAAGTCA
ATGCATTCCATTCTGATTGGGCTGTAAGAAAACTTGACCGAGCTAAGTTC
AAACTCGATTCAGAAATCGATTCTCGCTCAAACATAGGTCCTGGTGTTTG
CTAGGGTTGAAATCAGGCAAGGTACGTGATTTCCAATTTCTTGTCGATTG
TCAGATTGTAGTTTTGTGACGTGACATTTATCACATAAGCACAACCTTTT
TCTTAACTCCAATATTTCAGACGATCTTCAGTATTGAGATCAAAGAAAAG
ATCATTCAGCCAGAAGTCTGGATTCATATCGGAGTGACATATGATGTAGA
GAGTAAAAAAGCCTGTTTCTACGCCAACGGTCACCTCATCCAATCAGATG
AAGGGACTGGTGCCCTTTCAGGAGTAAGTTTCTTTGGAACCTCAGACGAT
TACAAGTAATTCTACATAACTCAAACCCTTTGTTAATGATGACTCCGTAA
CACATTTTCGTTTCTCCCATTCTCGCAATTTCCTAACGTTTCCTTATAAG
CAACTCCCCGTTAATCAGAAATCTTTTTAAATCGAAGGACAAAGTGTTTG
AAAGATTATGGGGGCTATAGACAAGATTCACAGATAAAGAATTACATCTG
TTTTTCATCTCTTCTTTGTGTTTCCAGGACTGGGAAGGTCGTGTCAGCAT
TGGCAAGTTCTATGATACAGCTGAAAATGGAGATTACCTTGAGGGTCGAT
CGTTCCAAGGGATCCTTGATGAACTTTTCATATACAATAGAGCATTGTCT
CAAATTGAAATTAGTCGGCTTAGCCAAATTTGTGATTTTCGTCGAGTAGA
TTTATACTACACTTTTGACAACATAAAAGGTGATAAACTATATGACCAAT
CAGGTCTAgcgaattttggaaaaattaccaAGACTTTGGACACAGTTCCA
GGTTATTGTGGGAACGCGTTGAACTTCACTTCCGAGAGTTATATTGAATT
GAGTGGGGATGAGTTTCGACAAAAACCAGCAAATGCGATTTCCATTGCTG
TATGGATCCGTCTTAACACGAATAGGTAAGACTACTACTGTAAACAACGT
CCCCGGTTGATATTTCTGTAAAACCGGGTCTAAGCAtgacttttaaattt
cattcctcagcaatgttttgttgatttagTCAGCTTTCTAtcataatttc
aaatttgtgcAAAAGGCAATCAGAATGATTAGAATTGCTCCGTCCAGAGG
agattttgctgaaaataaTCACGGCATGGACTACAGAAAGAAAATCGTAA
TGTAATGCTAATGGTCCCAGATTTCAAAAAGGATGTACAGTGgggtctcc
ataactcgaacacgcacggggaattGAAATTTGTTCGAGACTGATTTGTA
GGGCACTGTAATctcatgggccccggcgagccattttgagtgagtgggcc
aacattttagaaaaaaatgtcgcccaccatggttgggcgacgaagaaaat
ttttcactttttacacccccAAAACACCTTAAACGATATCTatttgggga
gaataatagtttttgtggtttgatttggtcttaaaccagcttaaaatagt
aacttttaaaaacgtatgacatggtctaccaaaaagtggaGGGGGCCATG
GAcccccggcccccccgttgacggggcccatgTAACTTAAGGGACAAGAA
AACTTCAAAGTAATCAGACATTAGAGTAATAAAGGTTCGAGTTCTGAAGA
TTGCAGTGTATTTCAATTTCAGTGTTTTCAGAAAAACGAATAGATATTTA
ATAGGTCAacgtttgaaaacgaaagtaaaggTTAGAAAAAGAAACAGAAC
CACTGTCGTGGGTTTGTGTATACGAATTTATGGCTTGGATTCACACTTGT
GCCAATAACGGTTTTATTAGTAATATGGTAGGAACTTAACCttgttatat
tattttttaagtgaATTAAGTGACGTGACAAGAGGCATGTATGAAATTTG
ATAACCGGATATTTAGGAATTAGAAAACCTTTGACAGGTTGAGAGAAAGC
TGAGAGTGTATCAAGTGTCACCTGATGCGCAAACTCCTACAAAACCGCAA
GTAGGTTAAGAAGCTCGGATCTGTTTGAGGATGCCAGAAGTCTATTAAGC
CTGGAAACGTACGTGAGTATGTAGCTCTTGCATGGATTTTCAGATCACGT
AGTCATAATTCCAAAATTAACTATTTGACAGATATCGtcataaaaagata
atttaacTTCAAGCAAGAAACCATTACAAACAAAATGACTTCCGCAGTTT
aaaaaaaGTACTGCAGATAATAAGTATTCAGTCGATATTTTGCCTTATTC
AAGCCTACAATTCGATTATTTCTGTACTTTGAACTGGAATAATCGTCCCT
TGAGAGACAAAAACCTTATATAATTCTGCATAATTTAAAGCCTtttctaa
ttcgaaaaaaaaggcaaaaagaaaaTCGGAAATCACTTACTTCGACTCCT
TTGTTGATGAAGTTGACGTTAGCaaccaaaaaacaattttgtcaTTCCCT
CTTAGCAACCAAAACAATGTGCCGGCATCTGtcttataattataattttc
ttGCCAATGATTACGGTTGTGGTTTTATTCAATTTCCTGTTTCATTAATT
AATAGCactggaaaaaaaaatgaaagaaaattgagTCAAATGACAAAGGC
GTTCTGTGGGAACATTTTGATTACTTTTGTGTCTTTCATCGTGGATTTGT
CATTGTGTAATTATTCGAATAAactcgtgatattcatgacacATTGATTA
CAATATGGAGGCACGTCGGAAAAAACCCACTAGACCATGCTTACTCTAGA
GATCTTCTTGGGATGTTTCAGTATAAAACGTTATGTTATTAATATAATGA
ATTCTACTTTATCTGTTAGGAAAAGAGGACaaaaaaaGTCCCTTCACCAA
GTAGTATGTAAAGAGTAAATACATTCCAGATTCAAACATTTGTTAATGAC
TGTATTACAACATCTGATATACAGTAGAGTTTCTTTAAACATgaatcttc
ataactcgaacaagttttacaatcccttcagttaacaatgtctaCAAAAC
TTACCCCacaactcgaacaaatttgtgttgtCCGTGCGTGTTCGAATTAT
TGCGACTCCACTGTATTTAATAAAGtgactgaaatattttttcatttttt
ttagggATCGACACCAGCTTTTCAACACAATCGGAAGTCGCTCGTTGCAC
AAGCATGATCAGTACGATTTCTCAGTCATCAATGGTCAAATTAAATGGTT
TCATCGTGATCACTTAGGGAAAATCGTATTCGACATCGATACTTTTGCTG
TAGTGAAACCAAGACAATGGGTACACTTAATAGCGACTTATGATTCGCAA
GAGAATAAAGCACAAGTATACTTAGATGGACATTTGGTGAAAGAAATAGA
CGGTACTGGCTATTTGTCACAAGATTGGGGCCATTTTGCCGGTATCGGAA
AACACTATTATGAGAATAGATATTTTTCAGGAGCTATTGATGAGTTGATG
ATGTTTAATTATGCATTACCATTTGATGAGGTTGGGtatgtttataaaaa
acaatgtgctgtaaaataaaagaagaagtagTGAACAGGTGATGAGTGCC
GAAAGAGTCATTTCAATGGAGCATTTGTTTTACGGAGCTAGCTTTCAAag
aggaaataaaataaaagagagcAAAAGACAAATCGTACTGATATTCCCGA
TTAAAAGTTTTACATATTGTGAGTACCAAATTAGCATATGAGATTCTGGA
AATACCGCCATATCAGCTTCTATGGCATACATGACAAAAGAGAATGGAGA
CGCGAAAGAATATGGCAGTGCACAAACAATACAGGAATGTTTTAAGTTTG
GCGGTGACGATGGTTCATCAAGATTGAGCCGTAATATCAT
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000101_pilon | genome | sc0000101_pilon:1105628..1114417 + |
|
